Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-03-24Bitstream added on 2014-06-13T19:21:42Z : No. of bitstreams: 1 batistini_ap_dr_jabo.pdf: 647626 bytes, checksum: 4539039c5222292b6b064ca5d3f95e8a (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Unaerp / Anemopaegma arvense é uma planta medicinal endêmica do cerrado com princípios ativos contra o câncer, a malária e a AIDS. O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade morfológica, genética e química de sete populações naturais coletadas no cerrado remanescente do estado de São Paulo nos municípios de Itatinga, Bauru, Brotas, Iaras, Pedregulho, Estação Experimental de Paraguaçú Paulista e Reserva Biológica de Moji-Guaçú. As metodologias realizadas foram: a identificação taxonômica com uma chave de identificação; análise genética, com a técnica de Polimorfismo de DNA Amplificado ao Acaso (RAPD) e análise química com os marcadores triterpenos betulina, ácido betulínico, ácido oleanólico e ácido ursólico. Na identificação taxonômica foram registradas as quatro variedades: arvense, pubera, latifolia e petiolata, sendo que as variedades pubera e arvense predominaram nos locais de coleta à leste do estado, a variedade latifolia predominou no oeste, e no centro do estado há uma ocorrência de todas as variedades indistintamente. Na análise genética, a maior parte da variação foi encontrada dentro de populações, e a alta estruturação populacional encontrada segue o modelo de ilhas. Os indivíduos coletados apresentaram quimiotipos distintos que foram separados em 4 grupos. Trinta e sete dos 106 indivíduos coletados (cerca de 1/3 do total) foram selecionados para serem conservados em banco de germoplasma in vitro. Assim, a conservação da diversidade genética de A. arvense pode ser garantida e disponibilizada como matéria-prima na indústria farmacêutica brasileira. / Anemopaegma arvense is an endemic species native to Brazilian cerrado regions with bioactive agents effective on the treatment of cancer, malaria and HIV. The objective of this work was to evaluate to morphologic, genetic and chemical diversity of seven natural populations of A. arvense collected in remaining areas of cerrado in the state of São Paulo more specifically in the localities of Itatinga, Bauru, Brotas, Iaras, Pedregulho, Experimental Station of Paraguaçú Paulista and Biological Reserve of Moji-Guaçú. Taxonomic identification was developed using an identification key; RAPD genetic analysis and chemical analysis using the triterpenoid markers betulin, betulinic acid, oleanolic acid and ursolic acid. Based on the taxonomic identification four varieties were recorded: arvense, pubera, latifolia and petiolata. The varieties pubera and arvense occur mainly in the East of the state, the variety latifolia happens in the West and the four varieties were found indistinctly in the interior of the state. Genetic analysis demonstrated great variability inside populations and that the populational structure found follows the model of islands. The accessions collected, presented different chemotypes and were divided in 4 groups. Among the 106 individuals collected, 37 were selected (about 1/3 of the total) and were introduced in the in vitro germplasm bank to assure the genetic diversity preservation of A. arvense and permit supplying pharmaceutical industry with crude material.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:26Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-07-17Bitstream added on 2014-06-13T21:04:20Z : No. of bitstreams: 1 araujo_fp_dr_botfca.pdf: 860426 bytes, checksum: e6646af0ab59a2403e60928f75194d0c (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O presente trabalho foi desenvolvido com a finalidade de avaliar a variabilidade morfoagronômica de Passiflora cincinnata Mast., distribuída em diferentes regiões agroecológicas do Nordeste brasileiro. Foram utilizadas 32 características obtidas em experimento conduzido na Embrapa Semi-Árido, em Petrolina-PE, em delineamento de blocos ao acaso com quatro repetições. O desempenho dos acessos foi avaliado pela análise univariada e os estudos relativos à divergência genética foram realizados com base nos procedimentos multivariados, utilizando-se a distância generalizada de Mahalanobis (D2) e a técnica de agrupamento por variáveis canônicas. A dispersão gráfica dos acessos teve como eixos as primeiras variáveis canônicas. A estratégia de coleta de acessos de P. cincinnata mostrou-se efetiva porque os acessos coletados apresentaram variabilidade genética para todos os descritores utilizados na avaliação. Os caracteres mais importantes para discriminação entre acessos foram: diâmetro das hastes (DH), número de glândulas foliares (NGF), número de glândulas por bráctea (NGB), viabilidade de pólen (VP), massa do fruto (PF), massa da semente (MS) e massa total de frutos (MTF). Contudo, por serem caracteres influenciados pelo ambiente, os acessos devem ser avaliados em mais de um ambiente. O agrupamento dos acessos com base em suas variabilidades genéticas não foi correlacionado com sua origem geográfica. Foram obtidos acessos que, pela alta produtividade de frutos, podem ser recomendados para cultivos experimentais em áreas de produtores. / The present work was developed aiming at evaluating the morphoagronomic variability of Passiflora cincinnata Mast., which is distributed in different agroecological regions in Northeast Brazil. Data from 32 characters were used in experiments, carried out at Embrapa Tropical Semi-Arid, Petrolina-PE, Brazil, in a randomized complete block design with four replications. The behaviour of accesses was evaluated by univariate analysis and the studies related to the genetic diversity were done based on the multivariate procedures, using the general distance of Mahalanobis (Dø) and the grouping technique by canonic variables. The graphic dispersion of the accesses used the first canonic variables as axis. The strategies for collecting the accesses of P. cincinnata proved to be effective because the collected accesses showed genetic variability for all the descriptors used in the evaluation. The most important characters for the discrimination among accesses were: stem diameter (SD), number of leaf glands (NLG), number of glands per bract (NGB), pollen viability (PV), fruit mass (FM), seed mass (SM) and total fruit mass (TFM). However, as the environment influences the characters, the accesses must be evaluated in more than one environment. Grouping of accesses based on their genetic variability was not correlated with their geographic origin. Since some accesses showed high fruit productivity, they can be recommended to farmers for experimental growing.

Made available in DSpace on 2015-04-09T12:28:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-07-18Bitstream added on 2015-04-09T12:47:50Z : No. of bitstreams: 1 000817675.pdf: 435803 bytes, checksum: 9790ca90cd43e847593a2eb809ac5ab5 (MD5) / A soja destaca-se como a oleaginosa de maior importância no mundo, tendo em vista sua relevância nutricional e econômica. Devido ao aumento da área cultivada e, consequentemente da produtividade, o Brasil atualmente, é considerado o maior exportador de soja. No entanto, observa-se que a base genética da soja é restrita, devido à indisponibilidade de alelos capazes de enfrentar estresses bióticos e abióticos de forma totalmente eficiente. Desta forma, os programas de melhoramento visam aumentar a variabilidade genética para o desenvolvimento de cultivares mais produtivas e adaptadas. Estudos a respeito de novas fontes de germoplasma, como as Plant Introductions – PIs, tornam-se necessários para a identificação de características agronômicas de interesse para os melhoristas. Sendo assim, o presente trabalho possui como objetivo geral a avaliação do desempenho agronômico e a divergência genética de 93 acessos de soja, pertencentes a um painel de diversidade visando a obtenção de dados que possam ser utilizados no incremento de programas de melhoramento de soja brasileiros / Soybean stands out as the most important oilseed in the world, given its nutritional and economic importance. Due to increased acreage and hence productivity, today, Brazil is the largest exporter of soybeans. However, it is observed that the genetic basis of soybean is restricted due to the unavailability of alleles able to cope with biotic and abiotic stresses fully efficiently. Thus, breeding programs aimed at increasing the genetic variability for the development of more productive and adapted cultivars. Studies regarding new sources of germplasm, such as Plant Introductions - PIs, become necessary for the identification of agronomic traits of interest to breeders. Therefore, the present work has as main objective the evaluation of agronomic performance and the genetic diversity of 93 accesses of soybean, belonging to a panel of diversity in order to obtain data that can be used in the growth of Brazilian soybean breeding programs

Doctor of Philosophy / Genetics Interdepartmental Program / Jesse A. Poland / Wheat is perhaps the most important component in human diet introduced since the conception of modern agriculture, which provides about 20% of the daily protein and calorie intake to billions of people. Adaptable to wide range of climates, wheat is grown worldwide, lending it the potential to mitigate the imminent risk of food security for future population of 9.5 billion people. For developing improved crop varieties in the future, genetic diversity is a key factor in plant breeding. Constraints in wheat evolution and artificial selection practices have resulted in erosion of this ingredient in elite germplasm. However, wheat wild relatives, such as Ae. tauschii, D-genome donor of wheat, are a storehouse for unexploited genetic diversity that can be used for improving wheat for disease and insect resistance, yield, quality, and tolerance to abiotic stresses. More than 1700 genebanks around the world hold over 7 million accessions of these wild relatives. These genebanks are expensive to maintain, therefore, efficient curation is necessary. We developed and implemented a protocol to identify duplicate accessions using genomic tools. Implementing this approach with three genebanks, we identified over 50% duplicated accessions across genebanks. There are over a million Triticeae accessions held collectively, and it is likely as more number of genebanks are tested, there will be decreasing number of unique accessions. Selecting and utilizing the wild genetic diversity is no easy task. Historically, breeders and geneticists have chosen the accessions primarily based on associated phenotypic data. Unless focusing on a targeted trait, this practice is imperfect in capturing the genetic diversity with some other limitations, such as confounding phenotypic data with the testing environment. Utilizing next-generation sequencing methods, we selected a MiniCore consisting of only 40 accessions out of 574 capturing more than 95% of the allelic diversity. This MiniCore will facilitate the use of genetic diversity present in Ae. tauschii for wheat improvement including resistance to leaf rust, stem rust, Hessian fly, and tolerance to abiotic stresses. Hessian fly is an important insect pest of wheat worldwide. Out of 34 known resistance genes, only six have been mapped on the D sub-genome. With swift HF evolution, we need to rapidly map and deploy the resistance genes. Some of the undefeated HF resistance genes, such as H26 and H32, were introgressed from Ae. tauschii. In this study, we mapped three previously known genes, and a new gene from Ae. tauschii accession KU2147. Genes were mapped on chromosomes 6B, 3D, and 6D. Further, identification and cloning of resistance genes will enhance our understanding about its function and mode of action. In conclusion, wild wheat relatives are genetically diverse species, and utilizing the novel genetic diversity in Ae. tauschii will be fruitful for wheat improvement in the wake of climate change to ensure future food security to expected 2 billion newcomers by 2050.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 543911 bytes, checksum: ca6b1ec9421af89b1154b235d7101304 (MD5) Previous issue date: 2008-10-03 / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais / This study was carried out to develop some protocols for cryopreservation of sugarcane germplasm in liquid nitrogen at -196°C. The exposure time of the shoot tips encapsulated in the laminar flow chamber for obtaining the moisture contents of 30, 20 and 10% was determined in an assay. The results were analyzed and interpreted, by using the free R software. The medium points of each time under evaluation were united by straight line segments, as drawing a tendency line for the moisture loss. Then, with the aid of horizontal lines referring to moisture contents of 30, 20 and 10%, the drying times were directly identified in the graph at 5.7; 7.45 and 10.1 hours, respectively. To induce the tolerance of the shoot tips to drying process, the preculture was accomplished in liquid culture medium enriched with 0.3; 0.5 and 0.75M sucrose for one and two days. The entirely randomized experimental design was used under a factorial scheme 3X2X4 (sucrose concentrations, preculture time and drying time) with three replicates. The survival index data were analyzed and interpreted, by using the free R software. The variance analysis was performed and the averages were compared by the Tukey test at 5% significance, when necessary. According to the results, the following conclusions were drawn: independently of the preculture time to be one or two days, the preculture in the culture medium enriched with 0.3M sucrose was ideal to induce the tolerance of the tissues to drying; the shoot tips were sensitive to the concentration of 0.75M sucrose in the preculture solution. The 12h culture of the shoot tips in the basic culture medium resulted into reactivation of their metabolism through accumulation of the starch grain, besides the recovery of the stress generated by its extraction. The intensity of the starch synthesis was increased, when the shoot tips were precultured in the liquid culture medium containing sucrose at concentrations 0.30; 0.50 and 0.75M. In the cryopreservation of the encapsulated shoot tips, the effect of the sucrose concentration, drying time and defrosting method were studied under a factorial 3X4X3 (three sucrose concentrations, four drying times and three defrosting methods). Independently of the combination adopted when the shoot tips were cryopreserved, a null survival index was obtained. The histological analyses revealed that both cells and cellular walls of the cryopreserved explants were severely damaged. / O objetivo deste trabalho foi o desenvolvimento de protocolos para criopreservação, em nitrogênio líquido a -196°C, de germoplasma de cana-de-açúcar. O tempo de exposição dos ápices caulinares encapsulados a câmara de fluxo laminar para a obtenção dos teores de umidade de 30, 20 e 10% foi determinado através de um ensaio e os resultados obtidos foram analisados e interpretados utilizando o software livre R. Os pontos médios de cada tempo avaliado foram unidos por segmentos de reta traçando uma linha de tendência de perda de umidade. Posteriormente, com o auxílio de linhas horizontais referentes aos teores de umidade de 30, 20 e 10%, os tempos de secagem foram identificados diretamente no gráfico em 5,7; 7,45 e 10,1 horas, respectivamente. Para induzir a tolerância dos ápices caulinares à secagem foi realizado o pré-cultivo em meio de cultura líquido enriquecido com 0,3; 0,5 e 0,75 M de sacarose por um e dois dias. O experimento foi organizado em um esquema fatorial 3X2X4 (concentrações de sacarose, tempo de pré-cultivo e tempo de secagem) segundo o delineamento inteiramente casualizado com três repetições. Os dados do índice de sobrevivência obtidos foram analisados e interpretados utilizando o software livre R. Foi realizada a análise de variância e quando necessário as médias foram comparadas pelo teste de Tukey a 5% de significância. Os resultados indicaram que o pré-cultivo em meio de cultura enriquecido com 0,3 M de sacarose, independentemente se por um ou dois dias, foi ideal para induzir a tolerância dos tecidos à secagem. Os ápices caulinares foram sensíveis à concentração de 0,75 M de sacarose na solução de pré- cultivo. O cultivo por 12 horas dos ápices caulinares em meio básico de cultura resultou além da recuperação do estresse gerado pela sua extração, a reativação do seu metabolismo através do acúmulo de grão de amido. A síntese de amido aumentou em intensidade quando os ápices foram pré- cultivados em meio de cultura líquido contendo sacarose nas concentrações de 0,30; 0,50 e 0,75 M. Na criopreservação dos ápices caulinares encapsulados, estudou-se o efeito de três fatores, concentração de sacarose, tempo de secagem e o método de descongelamento, em um fatorial 3X4X3. Independentemente da combinação adotada quando os ápices caulinares foram criopreservados o índice de sobrevivência obtido foi nulo. As análises histológicas revelaram que as células e a parede celular dos explantes criopreservados foram severamente danificadas.

Cunila spicata Benth. é uma planta aromática e medicinal utilizada popularmente no sul do Brasil como béquica, peitoral e sudorífera, e que apresenta comprovada atividade antiviral e anticonvulsiva. C. spicata é uma das 12 espécies sul-americanas do gênero Cunila (Lamiaceae) sendo encontrada em banhados e borda de mata de galeria no sul do Brasil, Argentina e Uruguai. Dentro deste contexto, no presente trabalho foi avaliada a variabilidade genética e química de populações de C. spicata coletadas nas regiões nordeste e sudeste do Rio Grande do Sul, com vistas a formação de bancos de germoplasma, determinação de estratégias de preservação e uso sustentável. Os marcadores ISSR e RAPD mostraram-se eficientes na determinação de variabilidade genética desta espécie, permitindo a identificação de todas as populações e indivíduos avaliados. As populações de C. spicata caracterizam-se como grupos geneticamente estruturados. Entretanto, não foi constatada formação de agrupamentos dentro da espécie, nem relação entre as distâncias genéticas e geográficas, ou entre as populações originarias das duas regiões geográficas amostradas. Por outro lado, a análise da composição dos óleos essenciais das 10 populações permitiu separar as mesmas em dois quimiotipos caracterizados por elevada concentração de α-terpineol/limoneno, e linalol, respectivamente. As populações da região sudeste enquadraram-se dentro do quimiotipo linalol, enquanto as da região nordeste no quimiotipo α-terpineol/limoneno. A relação geográfica e química é indicativa da existência de pressão de seleção quanto ao tipo de óleo essencial da região de ocorrência. / Submitted by Ana Guimarães Pereira (agpereir@ucs.br) on 2016-12-01T16:00:30Z No. of bitstreams: 1 Dissertacao Marcos Roberto Albuquerque.pdf: 1631570 bytes, checksum: d32cbb1d10de9a5f37eb7dd664ddc20d (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-01T16:00:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Marcos Roberto Albuquerque.pdf: 1631570 bytes, checksum: d32cbb1d10de9a5f37eb7dd664ddc20d (MD5) Previous issue date: 2016-12-01 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq. / Cunila spicata Benth. is a medicinal and aromatic plant popularly used in South Brazil as bequic, expectorant and sudiriferous, and that has confirmed antiviral and anti-convulsive activities. C. spicata is one of the 12 South-American species of the genus Cunila( Lamiaceae) been currently found in swamps and borders of gallery forests in South Brazil, North Argentina and Uruguay. In this context, the present work aimed to evaluate the genetic and chemical variability of C. spicata populations collected at the northeast and southeast regions of Rio Grande do Sul, to subside the construction of a germplasm bank, to determine conservation strategies, and to develop a sustainable use of this species. ISSR and RAPD markers proved to be efficients for the determination of the genetic variability of this species, allowing the identification of all the populations and individuals. C. spicata populations were characterized as genetically structured groups. However, clusters within the species were not evident, and no relations were detected between geographic and genetic distances, or between populations of the two regions. Conversely, the analysis of essential oil composition allowed the populations in two chemotypes, characterized by high concentration of α-terpineol/limonene, and linalool, respectively. The populations of the southeast region belong to the linalool chemotype, and those from the northeast region to the a-terpineol/limonene chemotype. This geographical and chemical relation is indicative of different selection pressures in the two regions.

Resumo: Anemopaegma arvense é uma planta medicinal endêmica do cerrado com princípios ativos contra o câncer, a malária e a AIDS. O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade morfológica, genética e química de sete populações naturais coletadas no cerrado remanescente do estado de São Paulo nos municípios de Itatinga, Bauru, Brotas, Iaras, Pedregulho, Estação Experimental de Paraguaçú Paulista e Reserva Biológica de Moji-Guaçú. As metodologias realizadas foram: a identificação taxonômica com uma chave de identificação; análise genética, com a técnica de Polimorfismo de DNA Amplificado ao Acaso (RAPD) e análise química com os marcadores triterpenos betulina, ácido betulínico, ácido oleanólico e ácido ursólico. Na identificação taxonômica foram registradas as quatro variedades: arvense, pubera, latifolia e petiolata, sendo que as variedades pubera e arvense predominaram nos locais de coleta à leste do estado, a variedade latifolia predominou no oeste, e no centro do estado há uma ocorrência de todas as variedades indistintamente. Na análise genética, a maior parte da variação foi encontrada dentro de populações, e a alta estruturação populacional encontrada segue o modelo de ilhas. Os indivíduos coletados apresentaram quimiotipos distintos que foram separados em 4 grupos. Trinta e sete dos 106 indivíduos coletados (cerca de 1/3 do total) foram selecionados para serem conservados em banco de germoplasma "in vitro". Assim, a conservação da diversidade genética de A. arvense pode ser garantida e disponibilizada como matéria-prima na indústria farmacêutica brasileira. / Abstract: Anemopaegma arvense is an endemic species native to Brazilian cerrado regions with bioactive agents effective on the treatment of cancer, malaria and HIV. The objective of this work was to evaluate to morphologic, genetic and chemical diversity of seven natural populations of A. arvense collected in remaining areas of cerrado in the state of São Paulo more specifically in the localities of Itatinga, Bauru, Brotas, Iaras, Pedregulho, Experimental Station of Paraguaçú Paulista and Biological Reserve of Moji-Guaçú. Taxonomic identification was developed using an identification key; RAPD genetic analysis and chemical analysis using the triterpenoid markers betulin, betulinic acid, oleanolic acid and ursolic acid. Based on the taxonomic identification four varieties were recorded: arvense, pubera, latifolia and petiolata. The varieties pubera and arvense occur mainly in the East of the state, the variety latifolia happens in the West and the four varieties were found indistinctly in the interior of the state. Genetic analysis demonstrated great variability inside populations and that the populational structure found follows the model of islands. The accessions collected, presented different chemotypes and were divided in 4 groups. Among the 106 individuals collected, 37 were selected (about 1/3 of the total) and were introduced in the in vitro germplasm bank to assure the genetic diversity preservation of A. arvense and permit supplying pharmaceutical industry with crude material. / Orientador: Fabíola Vitti Môro / Coorientador: Ana Maria Soares Pereira / Banca: Bianca Waléria Bertoni / Banca: Paulo Sérgio Pereira / Banca: Janete Apparecida Desidério Sena / Banca: Maria do Carmo Morelli Damasceno Pavani / Doutor

Cunila spicata Benth. é uma planta aromática e medicinal utilizada popularmente no sul do Brasil como béquica, peitoral e sudorífera, e que apresenta comprovada atividade antiviral e anticonvulsiva. C. spicata é uma das 12 espécies sul-americanas do gênero Cunila (Lamiaceae) sendo encontrada em banhados e borda de mata de galeria no sul do Brasil, Argentina e Uruguai. Dentro deste contexto, no presente trabalho foi avaliada a variabilidade genética e química de populações de C. spicata coletadas nas regiões nordeste e sudeste do Rio Grande do Sul, com vistas a formação de bancos de germoplasma, determinação de estratégias de preservação e uso sustentável. Os marcadores ISSR e RAPD mostraram-se eficientes na determinação de variabilidade genética desta espécie, permitindo a identificação de todas as populações e indivíduos avaliados. As populações de C. spicata caracterizam-se como grupos geneticamente estruturados. Entretanto, não foi constatada formação de agrupamentos dentro da espécie, nem relação entre as distâncias genéticas e geográficas, ou entre as populações originarias das duas regiões geográficas amostradas. Por outro lado, a análise da composição dos óleos essenciais das 10 populações permitiu separar as mesmas em dois quimiotipos caracterizados por elevada concentração de α-terpineol/limoneno, e linalol, respectivamente. As populações da região sudeste enquadraram-se dentro do quimiotipo linalol, enquanto as da região nordeste no quimiotipo α-terpineol/limoneno. A relação geográfica e química é indicativa da existência de pressão de seleção quanto ao tipo de óleo essencial da região de ocorrência. / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq. / Cunila spicata Benth. is a medicinal and aromatic plant popularly used in South Brazil as bequic, expectorant and sudiriferous, and that has confirmed antiviral and anti-convulsive activities. C. spicata is one of the 12 South-American species of the genus Cunila( Lamiaceae) been currently found in swamps and borders of gallery forests in South Brazil, North Argentina and Uruguay. In this context, the present work aimed to evaluate the genetic and chemical variability of C. spicata populations collected at the northeast and southeast regions of Rio Grande do Sul, to subside the construction of a germplasm bank, to determine conservation strategies, and to develop a sustainable use of this species. ISSR and RAPD markers proved to be efficients for the determination of the genetic variability of this species, allowing the identification of all the populations and individuals. C. spicata populations were characterized as genetically structured groups. However, clusters within the species were not evident, and no relations were detected between geographic and genetic distances, or between populations of the two regions. Conversely, the analysis of essential oil composition allowed the populations in two chemotypes, characterized by high concentration of α-terpineol/limonene, and linalool, respectively. The populations of the southeast region belong to the linalool chemotype, and those from the northeast region to the a-terpineol/limonene chemotype. This geographical and chemical relation is indicative of different selection pressures in the two regions.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Jatropha curcas L. is an oilseed crop species with potential for biodiesel production, however, lacks basic information for conducting commercial plantations. This study aimed to evaluate the floral phenology, molecular and agronomic characterization of accessions of physic nut (Jatropha curcas L.). The study was carried out in the Active Germplasm Bank of the Federal University of Sergipe, it was evaluate the main phenophases of plants (leaf falling, flushing, flowering and fruiting), the characterization of floral morphology, molecular characterization by RAPD molecular tool and seed biometry and oil content. Jatropha curcas L. enter dormant during the dry season, budding and flowering begin immediately after leaf falling and fruiting occurs during the period of highest rainfall. The physic nut plant is monoecious, with the occurrence of hermaphroditic flowers. There is genetic average similarity of the 52,6% among accessions of Jatropha curcas L. in UFS ABG. The oil content ranged from 18.50 to 34.00%. These accessions are potential genotypes to be used in breeding program of the species. / O Jatropha curcas L. é uma espécie oleaginosa com potencial para a produção de biodiesel, no entanto, faltam informações básicas para condução de plantios comerciais. Assim, este trabalho teve como objetivo avaliar o comportamento fenológico e a caracterização floral, molecular e agronômica de acessos de pinhão-manso (Jatropha curcas L.). O trabalho foi realizado no Banco Ativo de Germoplasma da Universidade Federal de Sergipe, foram avaliadas as principais fenofases das plantas (queda da folha, brotação, floração e frutificação), a caracterização da morfologia floral, a caracterização molecular por meio da ferramenta RAPD e a biometria e teor de óleo em sementes de pinhão-manso. A Jatropha curcas L. entra em repouso vegetativo no período seco, a brotação e floração iniciam logo após a queda das folhas e a frutificação ocorre no período de maior precipitação pluviométrica. O pinhão-manso é uma planta monóica, com ocorrência de flores hermafroditas. Há variabilidade genética média de 52,6% de similaridade entre os acessos de Jatropha curcas L. do BAG da UFS. O teor de óleo variou de 18,50 a 34,00%. Os acessos estudados são genótipos potenciais para serem utilizados em programa de melhoramento genético da espécie.

Submitted by Inês Marinho (bele_ballet@hotmail.com) on 2016-06-17T13:49:11Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Elizangela Farias da Silva.pdf: 725923 bytes, checksum: 334a610c50bdeda8b5392f39f6dc8ef9 (MD5) Ficha Catalografica - Elisangela Farias da Silva.pdf: 1668 bytes, checksum: 348f03e4b80e3cc81c27a3851b251ad0 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-06-23T20:43:00Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Elizangela Farias da Silva.pdf: 725923 bytes, checksum: 334a610c50bdeda8b5392f39f6dc8ef9 (MD5) Ficha Catalografica - Elisangela Farias da Silva.pdf: 1668 bytes, checksum: 348f03e4b80e3cc81c27a3851b251ad0 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-06-23T20:45:40Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Elizangela Farias da Silva.pdf: 725923 bytes, checksum: 334a610c50bdeda8b5392f39f6dc8ef9 (MD5) Ficha Catalografica - Elisangela Farias da Silva.pdf: 1668 bytes, checksum: 348f03e4b80e3cc81c27a3851b251ad0 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-23T20:45:40Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Elizangela Farias da Silva.pdf: 725923 bytes, checksum: 334a610c50bdeda8b5392f39f6dc8ef9 (MD5) Ficha Catalografica - Elisangela Farias da Silva.pdf: 1668 bytes, checksum: 348f03e4b80e3cc81c27a3851b251ad0 (MD5) Previous issue date: 2014-03-28 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The guarana (Paullinia cupana var. Sorbilis (Mart.) Ducke) is a native species from the Amazon region rich in natural caffeine. Embrapa Western Amazon develops guarana breeding program based on clonal selection and recurrent selection to obtain cultivars and progenies with desirable agronomic characteristics. The use of molecular markers has been successfully applied in breeding programs to monitor genetic diversity and assist in marker-assisted selection. Thus, the present study aims to evaluate the genetic diversity of guarana improvement program, using TRAP (Target Region Amplification Polymorphism) and the SRAP (Sequence-Related Amplification Polymorphism). The work was divided into two parts: the first to test the potential of TRAP and SRAP markers, using subsamples of 60 BAG (Active Germplasm Bank) and the second to analyze the genetic diversity six progenies of half brothers guarana. In the BAG a polymorphism observed percentage of 79% (TRAP) and 74.5% (SRAP). The Dice coefficient ranged from 0.64 to 0.87, forming four groups in the dendrogram, where one concentrated 82% of the studied material. In the progenies of half brothers, polymorphism percentage was 85% for the TRAP and 76% for SRAP. The genetic diversity of Nei (H) was 0.20 and the Shannon index (I) of 0.30. The AMOVA showed that the highest percentage of variation is within the progenies (54%). With these results, the TRAP and SRAP markers showed potential genetic diversity studies in guarana breeding program. / O guaranazeiro (Paullinia cupana var. sorbilis (Mart.) Ducke) é uma espécie nativa da região amazônica rica em cafeína natural. A Embrapa Amazônia Ocidental desenvolve programa de melhoramento de guaranazeiro baseado em seleção clonal e seleção recorrente para obtenção de cultivares e progênies com características agronômicas desejáveis. O uso de marcadores moleculares tem sido aplicado com sucesso em programas de melhoramento para monitorar a diversidade genética e auxiliar na seleção assistida por marcadores. Com isso, a presente pesquisa visa avaliar a diversidade genética do programa de melhoramento do guaranazeiro, usando TRAP (Target Region Amplification Polymorphism) (Sequence - Related e o SRAP Amplification Polymorphism). O trabalho foi dividido em duas partes: a primeira para testar o potencial dos marcadores TRAP e SRAP, usando 60 subamostras do BAG (Banco Ativo do Germoplasma) e a segunda para análise da diversidade genética de seis progênies de meios-irmãos de guaranazeiro. No BAG observou-se um percentual de polimorfismo de 79% (TRAP) e 74,5% (SRAP). O coeficiente de Dice variou de 0,64 a 0,87, formando quatro grupos no dendrograma, onde um deles concentrou 82% do material estudado. Nas progênies de meios irmãos, o percentual de polimorfismo foi 85% para o TRAP e 76% para SRAP. A diversidade genética de Nei (H) foi de 0,20 e o índice de Shannon (I) de 0.30. A AMOVA mostrou que o maior percentual de variação se encontra dentro das progênies (54%). Com estes resultados, os marcadores TRAP e SRAP mostraram potencial em estudos de diversidade genética no programa de melhoramento de guaranazeiro.