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Modelagem da adequabilidade de h?bitat de Corbicula fluminea (Bivalvia, Corbiculidae), Pimelodus pintado e Parapimelodus nigribarbis (Siluriformes, Pimelodidae) e Loricariichthys anus (Siluriformes, Loricariidae) em rela??o a preditores ambientais no Lago Gua?ba, RS, Brasil

Silveira, Thiago Cesar Lima 27 March 2015 (has links)
Submitted by Setor de Tratamento da Informa??o - BC/PUCRS (tede2@pucrs.br) on 2015-06-22T11:38:19Z No. of bitstreams: 1 470920 - Texto Completo.pdf: 7438655 bytes, checksum: 1f769194e7be6d12d47277b9005a61f6 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-06-22T11:38:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 470920 - Texto Completo.pdf: 7438655 bytes, checksum: 1f769194e7be6d12d47277b9005a61f6 (MD5) Previous issue date: 2015-03-27 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico - CNPq / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / The objective of this study was to model the habitat suitability for the bivalve Corbicula fluminea, and the fishes Pimelodus pintado, Parapimelodus nigribarbis and Loricariichthys anus in relation to environmental variables in Gua?ba Lake, Rio Grande do Sul, Brazil. Gua?ba Lake, a large water body beside Porto Alegre city with approximately 50 km long and 19 km wide at the widest point. It has north to south pollution gradient, different sediment characteristics and habitat configurations in its margins. Samples (n = 54) of C. fluminea were collected with Ekman dredge (10 subsamples, sampled area=2225 cm2) and the fish sampled with gill nets with different mesh sizes exposed during 20 hours at the same sampling points. We used Generalized Additive Models (GAM) to fit a model for C. fluminea abundances. The variables evaluated for the model fitting comprise the distance from streams and channels, the distance in meters from north to south, depth, water velocity, amount of thermotolerant coliform (TC) and sediment characteristics. The model selected for C. fluminea (r2 = 0.55) used depth (p = 2-16) and the diversity sand grain sizes (p = 2.52-15) as predictors. For fish modeling, three approaches were evaluated (GAM), Boosted Regression Trees (BRT) and Generalized Linear Modeling (GLM). GLM was the method more accurately among the three methodologies for the three species: P. pintado, r2 = 0.60, Root Mean Squared Error (RMSE) = 4.71; P. nigribarbis, r2 = 0.84, RMSE = 6.77; and L. anus, r2 = 0.72, RMSE = 2.40. The most important predictors in the model for P. pintado were related to the sediment and current speed. The model selected for P. nigribarbis had the most important variables: depth, distance from margins and CT. The adjusted model for L. anus had the most important predictors CT and distance from margins. The results suggest that the distribution of C. fluminea, P. pintado, P. nigribarbis and L. anus is not random, though structural and environmental predictors influence the habitat occupation of these organisms. Furthermore, the results show the spatial distribution of species assessed on a small-scale, concerning the majority of spatial distribution studies. Thus, the findings contribute to a better understanding of the autoecology for those species, allowing the prediction to future scenarios in Lake Gua?ba, constituting as a tool for environmental management and conservation actions. / O objetivo deste estudo foi modelar a adequabilidade de h?bitat para o bivalve Corbicula fluminea e os peixes Pimelodus pintado (pintado), Parapimelodus nigribarbis (mandi) e Loricariichthys anus (viola) em rela??o a vari?veis ambientais no Lago Gua?ba, Rio Grande do Sul,, Brasil. O Lago Gua?ba ? um grande corpo h?drico que banha a cidade de Porto Alegre com aproximadamente 50 km de comprimento e 19 km de largura no ponto mais largo, apresenta um gradiente de polui??o de norte ao sul e diferentes caracter?sticas de sedimento e configura??es de h?bitat nas margens. As amostras (n=54) de C. fluminea foram coletadas com draga Ekman (10 sub-amostras, ?rea total amostrada = 2,225 cm2) e os peixes amostrados com redes com diferentes tamanhos de malha por 20 horas nos mesmos pontos de amostragem. As vari?veis avaliadas para o ajuste do modelo compreenderam medidas de dist?ncia da margem, dist?ncia de arroios e canais, dist?ncia em metros de norte a sul, profundidade, velocidade da ?gua, quantidade de coliformes termo-tolerantes (CT) e caracter?sticas do sedimento. O modelo de distribui??o usado para C. fluminea foi um Generalized Additive Models (GAM). O modelo selecionado para C. fluminea (r2 = 0.55) usou profundidade (p = 2e-16) e a diversidade dos tamanhos dos gr?os de areia (p = 2.52- 15) como preditores. Para a modelagem dos peixes, tr?s metodologias foram avaliadas (GAM), Boosted Regression Trees (BRT) e Generalized Linear Modeling (GLM). GLM foi o m?todo com maior acur?cia dentre as tr?s metodologias para as tr?s esp?cies: P. pintado, r2 = 0.60, Root Mean Squared Error (RMSE) = 4,71; P. nigribarbis, r2 = 0,84, RMSE = 6.77; e L. anus, r2 = 0,72, RMSE = 2,40. Os preditores mais importantes no modelo para P. pintado foram relacionados a profundidade, caracter?sticas do sedimento e velocidade de corrente.. O modelo selecionado para P. nigribarbis teve como vari?veis mais importantes: profundidade, dist?ncia dos tribut?rios e CT. O modelo ajustado para L. anus teve como preditores mais importantes CT e dist?ncia das margens. Os resultados apresentados sugerem que a distribui??o de C. fluminea, P. pintado, P. nigribarbis e L. anus n?o ? aleat?ria e preditores estruturais e ambientais influenciam a ocupa??o de h?bitat destes organismos. Al?m disso, os resultados apresentam a distribui??o espacial para as esp?cies avaliadas em pequena escala, considerando a maioria dos estudos de distribui??o espacial. Desta maneira, os achados contribuem para um melhor entendimento da autoecologia das esp?cies, permitindo a previs?o de cen?rios futuros no Lago Gua?ba, al?m de constituir uma ferramenta para gestores ambientais e a??es conservacionistas.
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Sistem?tica filogen?tica dos bagres Auchenipteridae (Ostariophysi: Siluriformes) : uma abordagem combinando dados morfol?gicos e moleculares.

Calegari, B?rbara Borges 27 August 2015 (has links)
Submitted by Setor de Tratamento da Informa??o - BC/PUCRS (tede2@pucrs.br) on 2016-02-12T10:25:45Z No. of bitstreams: 1 TES_BARBARA_BORGES_CALEGARI_PARCIAL.pdf: 201037 bytes, checksum: 842e14f9326d662b1b590ec126cc0e5f (MD5) / Made available in DSpace on 2016-02-12T10:25:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TES_BARBARA_BORGES_CALEGARI_PARCIAL.pdf: 201037 bytes, checksum: 842e14f9326d662b1b590ec126cc0e5f (MD5) Previous issue date: 2015-08-27 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico - CNPq / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / The Auchenipteridae have an extensive and confusing taxonomic and phylogenetic history. Several studies developed since 1766 involving descriptions of species generated controversial results about the composition of the family and their interrelationships. The weakness of the systematic knowledge and diversity of the family hinders the understanding about the evolutionary history since the informative potential of morphology, molecules and biogeography was not yet fully explored. A comprehensive and densely sampled phylogenetic study of the species relationships of the Auchenipteridae, a Neotropical family of inseminating catfishes, is here documented based on combined datasets, morphological and molecular. The present study aimed to include most species of Auchenipteridae (109 species), as well as several members of other siluriform families representing the outgroup (28 species comprising Mochokidae, Aspredinidae, Doradidae, Ariidae, Pimelodidae, Cetopsidae, and Diplomystidae) to embrace the greater diversity of forms existing within Siluriformes, providing a robust comparison between the taxa and providing therefore a series of information from different sources including morphology (261 characters) and molecular data (2814 characters based on four genes: COI, 16S, RAG2, and MyH6). The parsimony analysis based on combined data yielded 1691 maximally parsimonious trees and the strict consensus corroborated the monophyly of the superfamily Doradoidea, the family Auchenipteridae and its two subfamilies, Centromochlinae and Auchenipterinae as well. The new classificatory proposal also raises the number of tribes within Auchenipteridae from two to nine, evidencing the following major groups within Auchenipterinae: Liosomadoradini, Trachelyopterini, Asterophysini, Auchenipterini, and Ageneiosini; and in Centromochlinae: Gelanoglanini, Gephyromochlini, Centromochlini, and Glanidini. Additionally, most of auchenipterid genera were recovered as monophyletic, except for Centromochlus and Tatia. Centromochlus is restricted to only three species while Tatia is recovered as the most specious centromochline genus including the currently Centromochlus simplex, C. reticulatus and Pseudotatia parva, herein reallocated. To address the paraphyly of Centromochlus and Tatia, two new genera of Centromochlinae were proposed and a nomenclatural reorganization of the species in these genera was conducted. Furthermore, Glanidium and Trachycorystes resulted as paraphyletic, and a new combination for Glanidium leopardum, resurrecting Gephyromochlus, to allocate this taxa and a new genus of Auchenipterinae to allocate Trachycorystes menezesi were proposed. Notwithstanding, Ageneiosus was recovered as paraphyletic since Ageneiosus militaris was recovered as sister group to Ageneiosus and Tympanopleura. The paraphyly of Ageneiosus seems to be an artifact of morphological missing data for A. militaris and until these data are included in the analysis to readily test the position of this species, both genera are maintained as valid. A synapomorphy list and the diagnosis for each clade are presented under a new classification proposal. Furthermore, the interrelationship and monophyly of the genera and major groups are discussed and compared to previous propositions. / Auchenipteridae possui uma extensa e confusa hist?ria taxon?mica e filogen?tica. Diversos estudos desenvolvidos desde 1766 envolvendo descri??es de esp?cies geraram resultados controversos a cerca da composi??o da fam?lia e suas rela??es de parentesco. A defici?ncia no conhecimento da sistem?tica e diversidade da fam?lia tem dificultado a compreens?o sobre a hist?ria evolutiva, uma vez que o potencial informativo morfol?gico, molecular, e biogeogr?fico ainda n?o foi totalmente explorado. Um estudo filogen?tico compreensivo e densamente amostrado das rela??es de parentesco das esp?cies de Auchenipteridae, uma fam?lia de bagres Neotropical inseminadores, ? aqui documentado atrav?s de um conjunto de dados combinados, morfol?gicos e moleculares. O presente estudo objetivou incluir a maioria das esp?cies de Auchenipteridae (109 esp?cies), bem como diversos membros de outras fam?lias de Siluriformes representando o grupo externo (28 esp?cies de Mochokidae, Aspredinidae, Doradidae, Ariidae, Pimelodidae, Cetopsidae, e Diplomystidae) para contemplar a grande diversidade de formas existente dentro de Siluriformes, fornecendo uma robusta compara??o entre os t?xons al?m de uma s?rie de informa??es de diferentes fontes incluindo dados morfol?gicos (261 caracteres) e moleculares (2814 caracteres de quatro genes: COI, 16S, RAG2 e MYh6). A an?lise de parcim?nia baseada em dados combinados produziu 1691 ?rvores maximamente parcimoniosas e o consenso estrito corroborou a monofilia da superfam?lia Doradoidea e de Auchenipteridae e, tamb?m, de suas duas subfam?lias Centromochlinae e Auchenipterinae. A nova proposta de classifica??o aumenta o n?mero de tribos em Auchenipteridae, de duas para nove, evidenciando os seguintes grandes grupos dentro de Auchenipterinae: Liosomadoradini, Trachelyopterini, Asterophysini, Auchenipterini, and Ageneiosini; e quatro novas tribos em Centromochlinae: Gelanoglanini, Gephyromochlini, Centromochlini, e Glanidini. Adicionalmente, a maioria dos g?neros de auchenipter?deos foi recuperada como monofil?tica, exceto por Centromochlus e Tatia. Centromochlus ? restringido a somente tr?s esp?cies, enquanto que Tatia ? recuperado como g?nero mais diverso incluindo as atuais esp?cies Centromochlus simplex, C. reticulatus e Pseudotatia parva, aqui realocadas. Para resolver a parafilia de Centromochlus e Tatia, dois novos g?neros de Centromochlinae s?o propostos e uma reorganiza??o nomenclatural destes g?neros ? feita. Adicionalmente, Glanidium e Trachycorystes resultaram como parafil?ticos, e uma nova combina??o ? proposta para Glanidium leopardum, revalidando Gephyromochlus para alocar este t?xon e tamb?m um novo g?nero de Auchenipterinae para alocar Trachycorystes menezesi. N?o obstante, Ageneiosus foi recuperado como parafil?tico, uma vez que A. militaris foi recuperado como grupo irm?o do clado Ageneiosus e Tympanopleura. A parafilia de Ageneiosus parece ser um artefato de dados morfol?gicos faltantes para A. militaris e at? os mesmos serem inclu?dos na an?lise para realmente testar a posi??o desta esp?cie, os dois g?neros s?o mantidos como v?lidos. Uma lista de sinapomorfias e as diagnoses dos clados s?o apresentadas sob uma nova proposta de classifica??o. Ainda, as rela??es de parentesco e a monofilia dos g?neros e grandes grupos s?o discutidas e comparadas ? proposi??es pr?vias.
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Diversidade gen?tica de Hoplias Malabaricus (Block, 1794) (Ostariophysi, Characiformes, Erythrinidae) no Rio Grande do Sul (Brasil)

Maria, Luciane 17 January 2007 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-14T13:08:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 397838.pdf: 1192704 bytes, checksum: 7ccf2868b7a0051ab601e134c300c5e9 (MD5) Previous issue date: 2007-01-17 / Embora a regi?o neotropical seja considerada como a mais rica em n?mero de esp?cies de peixes de ?gua doce do mundo, poucos estudos objetivaram a compreens?o da diversidade gen?tica em esp?cies de ampla distribui??o. Analisadas sob uma perspectiva de varia??o gen?tica, estas esp?cies podem ser ?timos modelos para compreens?o da rela??o hist?rica entre as bacias hidrogr?ficas. Com o objetivo de determinar os padr?es caracter?sticos da varia??o gen?tica nas popula??es de H. malabaricus nas bacias hidrogr?ficas do Rio Grande do Sul e bacias vizinhas, foram utilizados marcadores gen?ticos moleculares (RAPD=136 amostras e Seq?enciamento SNPs= 48 amostras) e definidos tr?s clados entre as popula??es: o primeiro com animais da Bacia Hidrogr?fica do Rio Uruguai -BHRU (exceto Alto Uruguai) e um ponto da Argentina; o segundo, com animais da Bacia Hidrogr?fica da Lagoa dos Patos-BHLP e Bacia Hidrogr?fica do Rio Tramanda?-BHRT e o terceiro clado com os animais do Alto Uruguai, BHLP e BHRT. As amostras do litoral brasileiro, que foram inclu?das com o intuito de estabelecer compara??es, fizeram um grupo ? parte, com exce??o das amostras de S?o Paulo e Paran? que constitu?ram o segundo clado. Em rela??o ? metodologia utilizada, verificou-se que ambas mostraram uma semelhan?a nos resultados obtidos, por?m o Seq?enciamento mostrou-se mais sens?vel na elabora??o dos agrupamentos.
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Revis?o taxon?mica da fam?lia Myxinidae Rafinesque, 1815 (myxiniformes)

Mincarone, Michael Maia 21 December 2007 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-14T13:08:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 398604.pdf: 11571612 bytes, checksum: 5daf16bb95ffcb098498d92af708d644 (MD5) Previous issue date: 2007-12-21 / Este trabalho contem informa??es extensivamente revisadas sobre a taxonomia e distribui??o dos peixes-bruxa. Ele inclui todas as esp?cies nominais da fam?lia Myxinidae, a qual compreende 2 subfam?lias, 6 g?neros e 69 esp?cies. Informa??es sobre cada esp?cies incluem: nomes v?lidos e descri??es originais; sin?nimos; material examinado; caracter?sticas diagn?sticas; tamanho m?ximo; distribui??o e habitat; interesse pesqueiro; observa??es (quando necess?rio); e nomes vernaculares. Pela primeira vez s?o apresentadas chaves de identifica??o e mapas de distribui??o para todos os g?neros e esp?cies, observando-se amplia??es na distribui??o de muitas delas. As subfam?lia Paramyxininae Berg, 1947 e Quadratinae Wisner, 1999 s?o consideradas sin?nimos j?nior de Eptatretinae Bonaparte, 1850. O g?nero Quadratus Wisner, 1999 ? considerado sin?nimo j?nior de Paramyxine Dean, 1904. Uma esp?cie de Eptatretus e duas de Myxine s?o sinonimizadas. Duas novas esp?cies s?o descritas: Eptatretus lakeside Mincarone & McCosker, 2004, do Arquip?lago de Gal?pagos, e Eptatretus goliath Mincarone & Stewart, 2006, da Nova Zel?ndia. A inclina??o da curva acumulativa de diversidade temporal indica que o n?mero de esp?cies de Myxinidae ainda est? longe de ser conhecido. Cruzeiros de pesquisa direcionados a regi?es pouco exploradas e o uso de novas tecnologias de coleta poder?o revelar esp?cies ainda n?o descritas.
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Filogenia de hypoptopomatinae com ?nfase em Microlepidogaster, Pseudotocinclus e Otothyropsis (Siluriformes: Loricariidae), e descri??es de duas novas esp?cies

Calegari, B?rbara 17 August 2010 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 427068.pdf: 8347716 bytes, checksum: 26c36c058e667deb23fc44a8707abd13 (MD5) Previous issue date: 2010-08-17 / Loricariidae ? a fam?lia mais diversa da Ordem Siluriformes, contendo 716 esp?cies v?lidas distribu?das em 96 g?neros. Por este motivo, Loricariidae ? tamb?m uma das fam?lias de maior complexidade taxon?mica e filogen?tica dentro da ordem. Hypoptopomatinae ? uma subfam?lia que inclui mais de 100 esp?cies agrupadas em 19 g?neros. Estes peixes s?o geralmente conhecidos por cascudinhos e a maioria ? caracterizada pelo tamanho reduzido. Al?m das esp?cies v?lidas conhecidas, Hypoptopomatinae possui um n?mero significativo de esp?cies ainda n?o descritas, que vem sendo descobertas ao longo dos ?ltimos anos. A maioria dessas esp?cies s?o fenotipicamente similares a Microlepidogaster, Pseudotocinclus e Otothyropsis. Foi analisada uma matriz de dados, baseada em estudos filogen?ticos de autores pr?vios, com a inclus?o de um total de 58 t?xons terminais, sendo 52 considerados como grupo interno e seis como grupo externo. A an?lise filogen?tica utilizou o m?todo de busca heur?stica atrav?s de m?ltiplos Random Addition Sequences (RAS) seguida de rearranjos dos ramos "Tree Bissection and Reconnection (TBR)". Tamb?m foi realizada uma an?lise com pesagem impl?cita de caracteres, implementada com Parsimony Ratchet, no programa TNT com uma constante de concavidade igual a 3 (K = 3). A an?lise de 60 caracteres morfol?gicos implementada com o algoritmo heur?stico de m?ltiplo TBR + TBR resultou em seis ?rvores maximamente parcimoniosas com 319 passos, ?ndice de consist?ncia (CI) de 24 e ?ndice de reten??o (RI) de 64. Na segunda an?lise realizada com pesagem impl?cita foi encontrada uma ?rvore com fit = 25.91063. A ?rvore resultante gerada na an?lise com pesagem impl?cita mostrou maior resolu??o do que aquela obtida na an?lise com pesos iguais. Os resultados obtidos das duas diferentes an?lises corroboram a monofilia da subfam?lia Hypoptopomatinae e da tribo Hypoptopomatini. Al?m disso, a an?lise com pesagem impl?cita encontrou suporte tamb?m para tribo Otothyrini. As esp?cies do g?nero Microlepidogaster, apesar de n?o apresentarem-se como um clado, ocuparam posi??es sempre pr?ximas entre elas, o que indica a necessidade de uma maior amostragem de caracteres. As esp?cies Otothyropsis "LG2", O. "Canoinhas", "Rio Verde" e "Tibaji" foram recuperadas agrupadas em um clado com Otothyropsis marapoama, indicando a aloca??o destas esp?cies tamb?m dentro desse g?nero. Pseudotocinclus ficou agrupado juntamente aos g?neros Pseudotothyris e Otothyris, sendo Pseudotocinclus parahybae mais proximamente relacionado ao clado formado por Pseudotohyris + Otothyris do que as demais esp?cies de Pseudotocinclus. S?o reconhecidas e descritas duas novas esp?cies pertencentes aos g?neros Microlepidogaster e Otothyropsis.
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Taxonomia e filogenia das esp?cies de Dasyloricaria Isbr?cker & Nijssen, 1979 (Siluriformes: loricariidae)

Burbano, Alejandro Londo?o 24 February 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 438126.pdf: 8216166 bytes, checksum: 09a1819f75864391af4634c2bb50e051 (MD5) Previous issue date: 2012-02-24 / A taxonomic revision and phylogenetic analysis of the genus Dasyloricaria were performed. This group belongs to the catfish family Loricariidae, subfamily Loricariinae and its distribution is strictly Trans Andean. Within the loricariines, individuais in Das yloricar?a can reach more than 20 cm of Standard Length. The taxonomic revision was based on 142 specimens of the main river basins of Colombia, Venezuela and Panama, from which were obtained rneasurements and counts. In this study are proposed as valid the species Dasylor?car?a jilarnentosa (Steindachner) from the upper, middie and lower Magdaiena River, lower Cauca River and Sin? River basin in Colombia, and the Maracaibo Lake basin m Venezuela, and Dasyloricaria latiura (Eigenmann & Vance) from the Atrato River basin in Colombia and Tuyra River basin m Panama, as well as a description of a new species, Dasyloricaria n. sp., from the middie and upper portions of the Magdaiena River, Coiombia. Redescriptions of the previousiy described species and the description of the new species are presented, including diagnosis, color in alcohol, distribution, sexual dimorphism, comments on each species, and an identification key of the species. After the taxonomic revision, a phylogenetic analysis was conducted based on 187 morphological characters (osteology and extemal morphology) and 23 terminal taxa. Species belonging to five subfamilies of the Loricariidae were included: Dasyloricaria filarnentosa, D. latiura, Dasyloricaria n. sp, Rineloricaria strigilata, R. microlepidogaster, Spatuloricaria sp. Tocantins, Spatuloricaria sp. Xingu, Ixinandria steinbachi, Loricaria cataphracta, L. clavipinna, Pseudoloricaria sp., Pseudoherniodon sp., Loricariichthys anus, Hemiodontichthys acipenserinus, Harttia loricarformis, Siurisorna rostratum, S. robustum (Loricariinae), Hypostomus pyrineusi, Ancistrus reisi (Hypostominae), Eurycheilichthys pantherinus, Otocinclus xakriaba (Hypoptopomatmae), Neoplecostomus microps (Neoplecostominae), and Delturus brevis (Delturinae). Were obtained three equaily most parsimonious trees of 1006 steps each, consistency index of 0.34 and retention index of 0.52. Dasyloricaria was recovered as a monophyletic unit, presenting nine unique synapomorphies. Spatuloricaria is proposed as the sister group of Dasyioricaria. This ciade is supported by tbree unique synapomorphies, and was observed to be the most derived clade within the analysis. Rineloricariina sensu Isbr?cker was not recovered as inonophyletic. Relationships between Rineloricaria and (Spatuloricaria + Dasyloricaria) vere not resolved, even when they were found related within the analysis. Harttiini is found as monophyletic, including the genera Harttia and Sturisoma. Also, both Loricariini and Loricariinae are recovered as monophyletic. / Foram realizadas a revis?o taxon?mica e uma an?lise filogen?tica do g?nero Dasyloricaria. Este grupo de cascudos pertence ? fam?lia Loricariidae, subfam?lia Loricariinae e a sua distribui??o ? estritamente Transandina. Dentro dos loricarineos, em Das yloricaria se encontram indiv?duos que podem atingir mais de 20 cm de Comprimento Padr?o. A revis?o taxon?mica foi baseada em 142 exemplares das principais bacias da Col?mbia, Venezuela e Panam?, dos quais foram obtidas medidas e contagens. S?o propostas como v?lidas as esp?cies Dasyioncaria Jilamentosa (Steindachner) das por??es alta, m?dia e baixa do rio Magdalena, baixo rio Cauca e bacia do rio Sin? na Col?mbia, e bacia do lago de Maracaibo na Venezuela, e Dasyloricaria latiura (Eigenmann & Vance) da bacia do rio Atrato na Col?mbia e bacia do rio Tuira no Panam?, al?m da descri??o de urna nova esp?cie, Dasyloricaria sp, nov., da por??o m?dia e alta do rio Magdalena, na Col?mbia. Foram realizadas as redescri??es das esp?cies previamente descritas e a descri??o da nova esp?cie, assim como diagnoses, colora??o no ?lcool, distribui??o, dimorfismo sexual, coment?rios em cada uma delas e uma chave de identifica??o das esp?cies. Posterior ? revis?o taxon?mica, uma an?lise filogen?tica foi realizada. Esta an?lise foi conduzida a partir de 187 caracteres morfol?gicos (osteologia e morfologia externa) e 23 t?xons terminais. Foram incluidas esp?cies pertencentes a cinco subfam?lias de Loricariidae: Das loricaria filarnentosa, D. latiura, Dasyloricaria sp. nov., Rineloricaria strigilata, R. microlepidogaster, Spatuloricaria sp. Tocantins, Spatu?oricaria sp. Xingu, Ixinandria steinbachi, Loricaria cataphracta, L. ciavipinna, Pseudo?oricaria sp., Pseudoherniodon sp., Loricariichthys anus, Hemiodontichthys acipenserinus, Harttia loricarfrmis, Sturisoma rostratum, S. robustum (Loricariinae), Hypostornus pyrineusi, Ancistrus reisi (Hypostorninae), Eurycheilichthys pantherinus, Otocinclus xakriaba (Hypoptopomat?nae), Neoplecostomus rnicrops (Neoplecostominae) e Delturus brevis (Delturinae). Foram obtidas tr?s ?rvores igualmente parcimoniosas de 1006 passos, ?ndice de consist?ncia de 0,34 e ?ndice de reten??o de 0,52. Dasyloricaria foi recuperado corno um grupo monofiletico apresentando nove s?napomorfias exclusivas. Spatuloricaria ? proposto ser o grupo irm?o de Dasyloricaria. Este dado ? suportado por tr?s smapomorfias exclusivas, e ? observado ser o agrupamento mais derivado dentro da an?lise. Rineloricarima sensu Isbr?cker n?o foi recuperado como monofil?tico. As rela??es entre Rineloricaria e (Spatuloricaria + Dasylor?caria) n?o foram resolvidas, ainda quando foram achados pr?ximos na an?lise. Harttiini foi encontrada monofiletica, incluindo os g?neros Harttia e Sturisoma. Igualmente, tanto Loricariini, como Loricariinae s?o recuperadas como monofil?ticas.
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Filogenia e filogeografia g?nero Eurycheilichthys (Siluriformes: Loricariidae)

Liedke, Ana Maria Rubini 13 March 2007 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 388533.pdf: 1663288 bytes, checksum: a5e772faa45de50473359445af45907f (MD5) Previous issue date: 2007-03-13 / A fauna de peixes de ?gua doce da Am?rica do Sul ? uma das mais ricas e, ao mesmo tempo, uma das menos conhecidas do mundo. O g?nero Eurycheilichthys ? end?mico do sul do Brasil, possuindo apenas duas esp?cies descritas na literatura. Eurycheilichthys pantherinus ocorre na Bacia do Uruguai, enquanto E. limulus ocorre somente na microbacia do alto Jacu?, na bacia do Gua?ba. Atualmente, sete novas esp?cies est?o sendo descritas com base na morfologia, as quais ocorrem na microbacia do Taquari- Antas, tamb?m na bacia do Gua?ba. A ?rea de ocorr?ncia ? restrita ao plat? dos estados do Rio Grande do Sul e Santa Catarina, acima de 600 m de altitude. O presente trabalho estuda a filogenia e a filogeografia das esp?cies de Eurycheilichthys utilizando evid?ncias moleculares. Foram seq?enciados os genes mitocondriais COI e ND2 de 126 indiv?duos sendo os dados concatenados para as an?lises, totalizando 1208pb. A filogenia sugere estrutura??o entre as bacias hidrogr?ficas, assim como para as microbacias. Das esp?cies novas, notadamente ficaram monofil?ticas apenas aquelas tr?s com distribui??o restrita a pequenos rios, enquanto as esp?cies de ampla ocorr?ncia ficaram n?o-monofil?ticas. Quando estimado o tempo de diverg?ncia entre as esp?cies, utilizando duas taxas evolutivas (0,9% e 1,8% por milh?o de anos), percebe-se que o processo de diferencia??o das novas esp?cies foi recente (entre 0.5-1.0 Mya), sugerindo que a n?o-monofilia das esp?cies pode ser causada por compartilhamento de linhagens ancestrais, uma vez que ? poss?vel notar que existe uma expans?o quase simult?nea de todas esp?cies novas. A distribui??o do g?nero nessas bacias hidrogr?ficas deve ter sido modulada por vicari?ncia, com a forma??o da bacia do Uruguai, datada do Plioceno.
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Revis?o taxon?mica de Schizolecis Britski & Garavello, 1984 : (Loricariidae: Hypoptopomatinae)

Kusma, Camila Munareto 14 February 2013 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 448697.pdf: 1821163 bytes, checksum: 8ebb362c20f003840cd87e504cc220af (MD5) Previous issue date: 2013-02-14 / The genus monotypical Schizolecis was proposed by Britski & Garavello (1984), being Microlepidogaster guntheri Miranda Ribeiro, 1918 the type species. Its distribution occurs from the north of the state of Santa Catarina until the north of the state of Rio de Janeiro, Brazil, comprising several coastal river basins. Due to the act that the genus is widely distributed in such isolated river basins, it was suggested the possibility of more than one species being included in what today we know as Schizolecis guntheri. To test this hypothesis, the following morphometric analysis were performed: tradition biometry and comparision of the interval of proportions; multivariate analyses of Principal Components and Canonical Variables and multivariate analyses of geometric morphometry using Relative Warps. Perceptible differences were not found among the individuals of the populations analyzed of Schizolecis guntheri, being only detected a gender dimorphism among the samples from Ba?a da Ilha Grande, in the state of Rio de Janeiro. A taxonomic revision was performed, together with a redescription of the genus and species. According to the results, it is concluded that all populations in differents coastal river basins of the state of Santa Catarina until the state of Rio de Janeiro, are a single species Schizolecis guntheri. / O g?nero monot?pico Schizolecis foi proposto por Britski & Garavello (1984), com Microlepidogaster guntheri Miranda Ribeiro, 1918 a esp?cie-tipo. Sua distribui??o ocorre do norte do estado de Santa Catarina at? o norte do estado do Rio de Janeiro, Brasil, compreendendo diversas bacias hidrogr?ficas costeiras. Devido ao fato do g?nero estar amplamente distribu?do em bacias hidrogr?ficas isoladas, sugeriu-se que haveria a possibilidade de mais de uma esp?cie estar inclu?da no que hoje conhecemos como Schizolecis guntheri. Para testar essa hip?tese, foram realizadas as seguintes an?lises morfom?tricas: biometria tradicional e compara??o de intervalo de propor??es; an?lises multivariadas de Componentes Principais e Vari?veis Can?nicas e an?lises multivariadas de morfometria geom?trica utilizando Relative Warps. N?o foram encontradas diferen?as significativas entre os indiv?duos das popula??es analisadas de Schizolecis guntheri, sendo detectado apenas um dimorfismo sexual entre os exemplares pertencentes ? Ba?a da Ilha Grande, no estado do Rio de Janeiro. Foi realizada uma revis?o taxon?mica, juntamente com a redescri??o de g?nero e esp?cie. Conforme resultados, conclui-se que todas as popula??es nas diversas bacias hidrogr?ficas costeiras, de Santa Catarina ao Rio de Janeiro, s?o uma ?nica esp?cie, Schizolecis guntheri.
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Rela??es filogen?ticas das esp?cies da fam?lia Callichthyidae : (Ostariophysi, Siluriformes)

Vera-alcaraz, H?ctor Samuel 28 August 2013 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 451889.pdf: 4456883 bytes, checksum: e742e45558fe54b9dfa42a4657b631fb (MD5) Previous issue date: 2013-08-28 / The phylogeny of the family Callichthyidae (Siluriformes) was investigated performing a Cladistic parsimony analysis under a Total Evidence approach. Characters explored are mainly based in osteology and molecular data of nuclear and mitochondrial genes. The ingroup included 131 terminals representing 111 species, the outgroup included 13 terminals representing 13 species including Copionodon as the rooting taxa. The phylogenetic analysis resulted in 89 most parsimonious trees which are summarized in a strict consensus cladogram; a new phylogenetic classification and the discussion of this paper are addressed based in this topology. The Total Evidence phylogenetic analysis corroborated the monophyly of the family Callichthyidae, subfamilies Callichthyinae and Corydoradinae, genera Callichthys, Dianema, Lepthoplosternum, Megalechis, and Scleromystax. However, the genera Aspidoras, Corydoras, and Hoplosternum are recovered nonmonophyletic. To reconcile this situation, a revalidation of the genera Hoplisoma and Gastrodermus is proposed to accommodate most species currently recognized in Corydoras. Aspidoras virgulatus and Corydoras lacerdai are transferred to Scleromystax to conceive their currently containing genera monophyletic. On the other hand, Hoplosternum is recovered paraphyletic. However, it was decided to hold making taxonomic changes at this moment until molecular dataset is completed for this genus, which is referred temporarily as Hoplosternum . Synapomorphies for each clade recovered and ranked in the phylogenetic classification are reported here, emphasizing their morphological diagnoses. Interrelationships between species and clades are discussed and compared with previous taxonomic and phylogenetic hypotheses. In addition, the taxonomy of Hoplisoma nattereri was reviewed in order to elucidate its synonymy and investigate the presence of cryptic diversity under this name. Hoplisoma nattereri and H. triseriatus are considered valid species. Geographic distribution for each species is also reported. Corydoras juquiaae is removed from the synonymy of Hoplisoma nattereri and transferred to Scleromystax juquiaae, new combination. Scleromystax prionotos is considered a junior synonym of S. juquiaae. All these species are illustrated in this paper. In addition, the original figure of S. juquiaae prepared but never published by Rudolph von Ihering is reproduced here. Phylogenetic relationships of Hoplisoma nattereri and H. triseriatus are discussed and also the morphometric and genetic distance of some of the populations sampled. / A filogenia da fam?lia Callichthyidae (Siluriformes) foi estudada realizando uma an?lise de Parcim?nia Clad?stica sob uma abordagem de Evid?ncia Total. Caracteres explorados foram principalmente baseados em osteologia e dados moleculares de genes nucleares e mitocondriais. O grupo interno incluiu 131 terminais representando 111 esp?cies; o grupo externo incluiu 13 terminais representando 13 esp?cies e incluindo Copionodon como o terminal de enraizamento da topologia. A an?lise filogen?tica resultou em 89 ?rvores mais parcimoniosas que foram resumidas em um cladograma de consenso estrito; com base nessa topologia, se prop?e e discute uma nova classifica??o filogen?tica para Callichthyidae. A an?lise filogen?tica de Evid?ncia Total corroborou o monofiletismo da fam?lia Callichthyidae, subfam?lias Callichthyinae e Corydoradinae, g?neros Callichthys, Dianema, Lepthoplosternum, Megalechis e Scleromystax. No entanto, os g?neros Aspidoras, Corydoras e Hoplosternum foram recuperados n?omonofil?ticos. Para conciliar esta situa??o, se prop?e a revalida??o dos g?neros Hoplisoma e Gastrodermus para acomodar a maioria das esp?cies atualmente reconhecidas em Corydoras. Aspidoras virgulatus e Corydoras lacerdai foram transferidas para Scleromystax e assim conceber esses g?neros como monofil?ticos. Por outro lado, as esp?cies de Hoplosternum foram recuperadas como parafil?ticas. No entanto, decidiu-se n?o fazer mudan?as taxon?micas no momento at? concluir a coleta de dados moleculares para este grupo, o qual ? reconhecido temporariamente como Hoplosternum. Sinapomorfias para cada clado recuperado e proposto na classifica??o filogen?tica s?o aqui mostrados, enfatizando seus caracteres morfol?gicos diagn?sticos. Inter-rela??es entre as esp?cies e clados s?o discutidas e comparadas com estudos taxon?micos e hip?teses filogen?ticas anteriores. Adicionalmente, a taxonomia de Hoplisoma nattereri foi revisada a fim de elucidar sua sinon?mia e investigar a presen?a de diversidade cr?ptica sob este nome. Hoplisoma nattereri e H. triseriatus s?o consideradas esp?cies v?lidas. A distribui??o geogr?fica para cada esp?cie ? reportada. Corydoras juquiaae ? removida da sinon?mia de Hoplisoma nattereri e transferida para Scleromystax juquiaae, nova combina??o. Scleromystax prionotos ? considerada um sin?nimo j?nior de S. juquiaae. Todas estas esp?cies s?o ilustradas neste artigo. Tamb?m, a figura original de Corydoras juquiaae preparada, mas nunca publicada, por Rudolph von Ihering ? aqui reproduzida. As rela??es filogen?ticas de Hoplisoma nattereri e H. triseriatus foram discutidas como assim a sua morfometr?a e a dist?ncia gen?tica de algumas das popula??es amostradas.
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Filogenia de Hypoptopomatini : (Loricariidae: Hypoptopomatinae)

Delapieve, Maria Laura de Souza 21 February 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 459709.pdf: 3714065 bytes, checksum: 4fcd0f5d0579f7b7f442276742c97b5f (MD5) Previous issue date: 2014-02-21 / Previous phylogenetic analyses and the discovery of five new taxa of Hypoptotopomatini raised doubts concerning the relationships of the tribe. Therefore, in order to elucidate the phylogenetic relationships and to test the monophyly of Hypoptopoma and Nannoptopoma, and to test the position of Niobichthys and Otocinclus, the present study aims to provide an encompassing hypothesis of relationships among the Hypoptopomatini, comprising most species of Hypoptopoma, five new taxa and the other genera of the tribe. We analyzed a data matrix of 101 morphological characters, 82 of which from the literature and 19 new characters are suggested, with the inclusion of 65 terminals. The analyses were conducted using the heuristic searching algorithm of multiple Random Addition Sequence (RAS) followed by branch swapping with the algorithm Tree Bissection and Reconnection (TBR) . The analysis resulted in 64 maximally parsimonious trees of 443 steps, consistency index of 0.34 and retention index of 0.81. The 64 primary cladograms were then summarized in a strict consensus tree. The result confirms the monophyly of Hypoptopomatinae and Hypoptopomatini. The tribe comprises six known genera: Acestridium, Hypoptopoma, Nannoptopoma, Niobichthys, Otocinclus and Oxyropsis and two new taxa. Additionally, Otocinclus is found to be the most basal member of the tribe; Acestridium and Niobichthys are sister to each other and closely related to a group formed by Nannoptopoma + New Taxa A , and New Taxa B + Oxyropsis + Hypoptopoma. Based on this framework on, changes to the classification and the taxonomy of the Hypoptopomatini are suggested / A partir das diferentes an?lises filogen?ticas previamente propostas e do conhecimento de cinco novos t?xons pertencentes ? Hypoptopomatini, surgiram questionamentos a respeito das rela??es de parentesco dentro da tribo. Assim, a fim de esclarecer as rela??es filogen?ticas e testar o monofiletismo de Hypoptopoma, testar a hip?tese de sinon?mia de Nannoptopoma e Hypoptopoma, e testar as posi??es de Niobichthys e de Otocinclus, o estudo tem como objetivo apresentar uma hip?tese de rela??es para Hypoptopomatini, incluindo a maioria das esp?cies de Hypoptopoma, cinco poss?veis novos t?xons e os demais g?neros da tribo. Foi constru?da uma matriz de 101 caracteres morfol?gicos, do quais 82 foram retirados da literatura e 19 novos propostos, analisados em 65 t?xons terminais. Foram realizadas buscas heur?sticas com o programa TNT atrav?s de m?ltiplos Random Addition Sequences seguida de rearranjos dos ramos Tree Bissection and Reconnection. Ao encontrar 64 ?rvores maximamente parcimoniosas com 443 passos, ?ndice de consist?ncia 0.34 e ?ndice de reten??o 0.81, essas ?rvores foram sumarizadas em um cladograma de consenso estrito. Os resultados encontrados corroboram a monofilia de Hypoptopomatinae e de Hypoptopomatini. A tribo ? formada por seis g?neros j? descritos: Acestridium, Hypoptopoma, Nannoptopoma, Niobichthys, Otocinclus e Oxyropsis; e por dois g?neros novos. Adicionalmente, demonstra-se que Otocinclus ? o g?nero mais basal da tribo; Acestridium e Niobichthys s?o grupos-irm?os, mais relacionados com um clado formado por dois grupos monofil?ticos: Nannoptopoma + Novo T?xon A, e Novo T?xon B + Oxyropsis + Hypoptopoma. O conhecimento acerca das rela??es filogen?ticas, da classifica??o e da taxonomia de Hypoptopomatini muda, sendo feitas sugest?es para futuras mudan?as nomenclaturais.

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