Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:08Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-02-24Bitstream added on 2014-06-13T20:14:42Z : No. of bitstreams: 1 buchweitz_ed_me_jabo.pdf: 457129 bytes, checksum: fa6a9d6b3e092340a34ec3de2d5161cc (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A baixa freqüência de genes recessivos deletérios e letais e a grande proporção de locos favoráveis já fixados nos híbridos comerciais, associado a uma seleção fenotípica eficiente entre e dentro de linhagens pode permitir a obtenção de híbridos promissores. Em média, são gastos de 8 a 10 anos para que um novo híbrido chegue ao mercado, o que implica diretamente no custo final das sementes. Para reduzir esse tempo é interessante viabilizar a utilização de linhagens parcialmente endogâmicas nos cruzamentos para agilizar o processo de obtenção de híbridos superiores e reduzir os custos da produção de sementes híbridas. Diante da necessidade de identificar híbridos de destaque e de encontrar alternativas que conduzam à redução dos custos e do tempo para a obtenção de sementes híbridas, o objetivo desse trabalho foi avaliar o potencial de linhagens parcialmente endogâmicas de milho com três (S3) e quatro (S4) gerações de autofecundação, obtidas de híbridos simples comerciais, com relação à heterose dos híbridos resultantes / The low frequency of deleterious recessive and lethal genes and the large proportion of favorable loci already set in commercial hybrids combined with an efficient phenotypic selection among and within strains may allow the achievement of promising lines. On average, spending 8 to 10 years for a new hybrid to reach the market, which directly implies the final cost of the seeds. To reduce this time it is interesting to enable the use of partly inbred lines at intersections to expedite the process of obtaining superior hybrids and reduce the costs of producing hybrid seeds. Faced with the need to identify hybrids highlighted and to find alternatives that lead to the reduction of costs and time required for the production of hybrid seeds, the purpose of this study was to evaluate the potential of partly inbred lines of maize with three (S3) and four (S4) generations of selfing, obtained from commercial single cross hybrids, with respect to the follow-on hybrid heterosis

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:54:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 284176 bytes, checksum: db85d780c7737cd4a4acbb868602d9d7 (MD5) Previous issue date: 2006-10-02 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / This study aimed to evaluate the Inbreeding trends on Holstein breed and study it s effect on milk yield. The pedigree data contained 248.141 Holstein animals born between 1960 e 2002. Data set was edited to maintain cows with age of calving between 18 and 24 months, year of born between 1981 and 2002, year of calving between 1984 and 2004, breed composition with purebred and grade bred resulting in 98.524 observations of first lactation. Inbreeding coefficient was calculated by using MTDFREML software. In addition, effective size population (Ne) and generation interval were calculated. To study the Inbreeding trend, a superposition of generations is frequent on cattle being necessary infer to which generation the individual belongs by calculating the generation coefficient. A model was proposed considered fixed effects of herd-year, breed grade and season of calving; and Inbreeding and age of calving as covariables. Solutions of fixed effects were obtained by software BLUPf90. After verifying significance on Inbreeding effect, a regression analysis was made to milk yield on first lactation including linear and quadratic effects of the Inbreeding coefficients. Results indicate that out of 320.712 animals with 0,38% Inbreeding coefficient (F), 53.411 showed positive F values with 1,30% of average F varying from 0,01% to 31,20%. F has decreased considering just inbred animals when analyzed by year or generation. Only 16,65 % of the animals (53.411) in population were inbred. There was an increasing on inbred animals when evaluating the evolution on number of inbred animals in relation to total population by year or generation. By year of born, the higher percentage of inbred animals (43,50%) appeared in 1998 trending to reduce until 31% in 2002. Ne was higher than recommended (40 per generation) on first four generations. Sire son generation interval was higher than the others (Sire daughter, Dams son, Dams daughter). A higher average F was found (6,23%) when only animals with yield data were analyzed. Only quadratic effect on Inbreeding grades was not significant from all the sources of variation used on the proposed model. A linear coefficient of 22,60 kg was found for each 1% of increasing on Inbreeding. The average Inbreeding for Holstein animals in Brazil can be considered low for the total population and inbred animals. Although current levels of Inbreeding are considered low, milk yield on first lactation was significantly affected. / A realização deste trabalho teve como objetivo avaliar as tendências da endogamia na raça Holandesa e estudar os seus efeitos sobre a produção de leite. O arquivo de pedigree utilizado nas análises era composto por 248.141 animais da raça Holandesa nascidos entre 1960 e 2002. 98.524 observações de primeira lactação. O arquivo de lactações foi editado para manter animais com idade ao parto entre 18 e 24 meses, ano de nascimento entre 1981 e 2002, ano de parto entre 1984 e 2004, composição racial puras de origem e puras por cruza resultando em 98.524 observações de primeira lactação. O coeficiente de endogamia foi calculado para cada animal utilizando-se o programa MTDFREML. Adicionalmente foram calculados Tamanho Efetivo de População (Ne) e intervalo de geração. A sobreposição de gerações é freqüente em bovinos, tornando-se necessário inferir a que geração os indivíduos pertencem para estudar a tendência da endogamia. Para isso, utilizou-se o coeficiente de geração. O modelo utilizado na análise considerou os efeitos fixos rebanho-ano, grupo genético e estação de parto; e as covariáveis endogamia e idade ao parto. Para obter as soluções dos efeitos fixos foi utilizado o programa BLUPf90. Constatada a significância do efeito da endogamia, foi feita análise de regressão da característica produção de leite na primeira lactação incluindo efeitos linear e quadrático dos coeficientes de endogamia. Os resultados indicam que 320.712 animais com um coeficiente de endogamia (F) de 0,38%, dos quais 53.411 apresentaram valores positivos de F, e o F médio foi de 2,30% com variação de 0,01% a 31,20%. O F considerando apenas os animais endogâmicos decresceu tanto quando analisado por ano quanto por geração. Apenas 16,65% dos animais da população eram endogâmicos (53.411 animais). Quando analisado a evolução do número de animais endogâmicos em relação à população total, tanto por ano como por geração, houve uma tendência de aumento na quantidade de animais endogâmicos. Por ano de nascimento, a maior percentagem de animais endogâmicos foi 43,50% foi em 1998, depois houve uma tendência de redução até o ano de 2002, quando foram observados 31% de animais endogâmicos. Os valores do Ne foram acima do recomendado (40 por geração) nas quatro primeiras gerações. O intervalo de geração Touro Filho foi maior em relação aos demais (Touro Filha, Vacas Filho, Vacas Filha). Analisando somente os animais que possuíam dados de produção, foi encontrado valores de F acima da média da população (6,23%). De todas as fontes de variação utilizadas no modelo estatístico proposto, somente o efeito quadrático das classes de endogamia não foi significativo. O coeficiente de regressão linear encontrado foi - 22,60 kg para cada 1% de aumento no coeficiente de endogamia com coeficiente de determinação de 55,24%. As médias de endogamia para a população de animais da raça Holandesa no Brasil podem ser consideradas baixas, tanto para a população total quanto a de animais endogâmicos. Apesar dos níveis atuais serem baixos, a endogamia afetou de forma significativa a produção de leite na primeira lactação.

Resumo: A baixa freqüência de genes recessivos deletérios e letais e a grande proporção de locos favoráveis já fixados nos híbridos comerciais, associado a uma seleção fenotípica eficiente entre e dentro de linhagens pode permitir a obtenção de híbridos promissores. Em média, são gastos de 8 a 10 anos para que um novo híbrido chegue ao mercado, o que implica diretamente no custo final das sementes. Para reduzir esse tempo é interessante viabilizar a utilização de linhagens parcialmente endogâmicas nos cruzamentos para agilizar o processo de obtenção de híbridos superiores e reduzir os custos da produção de sementes híbridas. Diante da necessidade de identificar híbridos de destaque e de encontrar alternativas que conduzam à redução dos custos e do tempo para a obtenção de sementes híbridas, o objetivo desse trabalho foi avaliar o potencial de linhagens parcialmente endogâmicas de milho com três (S3) e quatro (S4) gerações de autofecundação, obtidas de híbridos simples comerciais, com relação à heterose dos híbridos resultantes / Abstract: The low frequency of deleterious recessive and lethal genes and the large proportion of favorable loci already set in commercial hybrids combined with an efficient phenotypic selection among and within strains may allow the achievement of promising lines. On average, spending 8 to 10 years for a new hybrid to reach the market, which directly implies the final cost of the seeds. To reduce this time it is interesting to enable the use of partly inbred lines at intersections to expedite the process of obtaining superior hybrids and reduce the costs of producing hybrid seeds. Faced with the need to identify hybrids highlighted and to find alternatives that lead to the reduction of costs and time required for the production of hybrid seeds, the purpose of this study was to evaluate the potential of partly inbred lines of maize with three (S3) and four (S4) generations of selfing, obtained from commercial single cross hybrids, with respect to the follow-on hybrid heterosis / Orientador: José Roberto Moro / Coorientador: Flávio Trevizoli Silveira / Banca: Herberte Pereira da Silva / Banca: Sandra Helena Unêda-Trevisoli / Mestre

Submitted by Jean Medeiros (jeanletras@uepb.edu.br) on 2017-11-27T12:08:46Z No. of bitstreams: 1 PDF - Karolline Souza Monteiro.pdf: 24348787 bytes, checksum: 89420de2cfe204c1a7769d54b4d7e350 (MD5) / Approved for entry into archive by Secta BC (secta.csu.bc@uepb.edu.br) on 2017-12-06T18:43:10Z (GMT) No. of bitstreams: 1 PDF - Karolline Souza Monteiro.pdf: 24348787 bytes, checksum: 89420de2cfe204c1a7769d54b4d7e350 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-06T18:43:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PDF - Karolline Souza Monteiro.pdf: 24348787 bytes, checksum: 89420de2cfe204c1a7769d54b4d7e350 (MD5) Previous issue date: 2015-07-06 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Introduction: The states of Northeastern Brazil have high frequency of consanguineous marriages, which contributes to the increased frequency of physical disabilities associated with genetic diseases of recessive inheritance. Objective: The aim of this study was to develop tools to investigate the etiologic factors associated with physical disability and perform the clinical, genetic, as necessary, and functional diagnosis of individuals with physical disabilities in two municipalities. Methodology: The first descriptive and quantitative study developed an information collection instrument on people with disabilities and compared data collected by 37 community health agents with those obtained by researchers to evaluate the reliability of information. Data were analyzed using the SPSS 22.0 software. Frequency distribution tables were constructed for categorical variables and means for numeric variables. The inter-observer simple agreement percentage for records groups and Kappa (κ) were used to calculate the inter-observer agreement of etiological approach groups. In the second population-based study, a sample of 139 people with physical disabilities was assessed from the clinical-genetic and functional point of view to assess the contribution of different etiological factors in its determination. Data were analyzed using the SPSS 22.0 software adopting significance level of 5%. Frequency, prevalence and prevalence ratio of data were calculated. Results: Health agents underestimated the prevalence of physical disability in relation to researchers, although the information agreement for the classification categories has been above 80%, with Kappa of 0.582 (p <0.001). Related couples are 3.26 more likely to have children with physical disability compared to unrelated couples. Environmental or acquired factors cause 47.40% of disabilit ies and external causes are the most prevalent; genetic etiology disabilit ies accounted for 16.50% of the sample, and genetic syndromes and congenital malformations are the most prevalent; 22.30% had multifactorial origin such as stroke and kyphoscoliosis, and 13.66% remained undiagnosed. Most individuals with disabilities were independent and could perform activities of daily living in a modified form. As for the demand for assistive technology and rehabilitation services, only 7.20% received physiotherapy care, 70.50% needed equipment; however, only 41.00% had it at the time of interview. Conclusion: The results show that it is possible to qualify the information collected about people with physical disabilities by improving current strategies and information systems in primary care. Due to consanguineous marriages, populations from northeastern Brazil have higher prevalence of this type of disability and need genetic counseling services and greater coverage by rehabilitation services and assistive technology. / Introdução: Os estados do Nordeste brasileiro possuem elevada frequência de casamentos consanguíneos, o que contribui para o aumento da frequência de deficiências físicas associadas às doenças genéticas de herança recessiva. Objetivo: O objetivo deste trabalho foi desenvolver instrumentos para investigar os fatores etiológicos associados à deficiência física e realizar o diagnóstico clínico, genético, quando necessário, e funcional de indivíduos com deficiência física em dois municípios da região. Metodologia: No primeiro estudo, descritivo e de abordagem quantitativa, foi desenvolvido um instrumento de coleta de informação sobre pessoas com deficiência física e foram comparados os dados colhidos por 37 Agentes Comunitários de Saúde em relação aos obtidos por pesquisadores para avaliação de confiabilidade dessa informação. Os dados foram analisados no software SPSS 22.0. Foram construídas tabelas de distribuição de frequência para as variáveis categóricas e médias para as numéricas. Utilizou-se o percentual simples de concordância inter observador para os grupos da ficha, e a estatística Kappa (κ) para cálculo da concordância inter observadores dos grupos de aproximação etiológica. No segundo estudo, de base populacional, uma amostra de 139 pessoas com deficiência física foi avaliada sob o ponto de vista clínico-genético e funcional para avaliar a contribuição de diferentes fatores etiológicos na sua determinação. Os dados foram analisados no software SPSS 22.0, adotando-se o nível de significância de 5%. Calculou-se a freqüência, prevalência e a razão de prevalência dos dados. Resultados: Os agentes subestimaram a prevalência de deficiência física em relação aos pesquisadores, embora a concordância da informação para as categorias de classificação tenha sido superior a 80%, com Kappa de 0,582 (p<0,001). Os casais aparentados possuem 3,26 vezes mais filhos com algum tipo de deficiência em comparação aos casais não consanguíneos. Os fatores ambientais ou adquiridos causam 47,40% das deficiências, sendo as causas externas as mais prevalentes; as deficiências de etiologia genética corresponderam a 16,50% da amostra, sendo as mais prevalentes as síndromes genéticas e as malformações congênitas; 22,30% tiveram origem multifatorial, como o acidente vascular encefálico e a cifoescoliose, e13,66% permaneceram sem diagnóstico. A maior parte das pessoas com deficiência avaliadas era independente e conseguiam realiza, ainda de forma modificada, as atividades da vida diária. Quanto às demandas por tecnologia assistiva e serviços de reabilitação, apenas 7,20% recebiam atendimento fisioterapeutico, 70,50% necessitavam de equipamentos, no entanto, só 41,00% possuíam no momento da entrevista. Conclusão: Os resultados desta pesquisa mostram que é possível qualificar a informação colhida sobre pessoas com deficiência física melhorando e aperfeiçoando as estratégias e sistemas de informação já existentes na Atenção Básica. As populações do nordeste brasileiro, devido à consanguinidade, possuem maior prevalência desse tipo de deficiência e necessitam de serviços de aconselhamento genético e maior número de serviços de reabilitação e de tecnologia assistiva.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-04-12T13:15:03Z No. of bitstreams: 1 Eulalia Alves Barros.pdf: 779730 bytes, checksum: 49d9a5e87b3827c9b66d4a4bc1496324 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-12T13:15:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Eulalia Alves Barros.pdf: 779730 bytes, checksum: 49d9a5e87b3827c9b66d4a4bc1496324 (MD5) Previous issue date: 2012-12-27 / The goals of this thesis were to verify the conservation genetic status of the Segureño Spanish sheep breed and to evaluate the principal factors involved in the determination of growth traits in this breed. The data used n this study was provided by the Asociación Nacional de Criadores de Ovino Segureño – ANCOS, located in Granada province, Spain. The information about genetic variability and population structure were obtained using genealogical records from 37.459 animals registered between the years 1984 – 2007. To evaluate the inbreeding effects on growth traits, weight measurements taken between the years 1992 – 2007 were considered. The traits evaluated were: birth weight (BW), weight at 30 (W30), 45 (W45) and 75 (W75) days of age and also the average daily gains between 0-45 (ADG0-45), 0-75 (ADG0-75) and 45-75 (ADG45-75) days of age. The parameters used to evaluate the genetic diversity were: effective number of founders , effective number of ancestors , effective population size , inbreeding coefficient , average relatedness coefficient , generation interval , and the fixation indexes . To analyze the effect of the inbreeding on growth traits, were considered the individual inbreeding estimates and the environmental effects of sex, year-season-herd, birth type and age of the ewe. For the herds studied, a significant loss of genetic variability was not observed. The fixation indexes suggest that there is no population subdivision within the breed and the inbreeding level can be considered satisfactory for growth traits. Nucleus herds were not observed which may have contributed for the absence of within breed substructure. Among the environmental factors considered, the contemporary group (formed by individuals born in the same year-season-herd), the birth type and the sex of the lamb were the most important factors affecting the weights and average weight gains studied. / Objetivou-se, com esse trabalho, verificar o estado de conservação genética da raça espanhola de ovinos Segureño e avaliar os principais fatores envolvidos na determinação das características de crescimento em cordeiros da raça. Os dados usados neste estudo são provenientes da Asociación Nacional de Criadores de Ovino Segureño- ANCOS, sediada na província de Granada-Espanha. As informações sobre a variabilidade genética e a estrutura populacional foram obtidas utilizando as informações genealógicas de 37.459 animais registrados entre os anos de 1984 a 2007. Para avaliação dos efeitos da endogamia sobre o crescimento dos cordeiros, foram utilizadas as informações de pesagens de cordeiros, entre os anos de 1992 a 2007, e avaliados os pesos ao nascer (PN), aos 30 dias (P30), aos 45 dias (P45) e aos 75 dias (P75) de idade, além dos ganhos médios medidos entre 0-45, 0-75, e 45-75 dias de idade. Os parâmetros utilizados na avaliação da diversidade genética foram: número efetivo de fundadores , número efetivo de ancestrais , tamanho efetivo (Ne), coeficiente de consanguinidade (F), coeficiente de parentesco médio (AR), intervalo de gerações (IG) e índices de fixação ou estatística-F . Para análise dos efeitos dos níveis de endogamia sobre as características de crescimento, foram considerados os valores de endogamia individual e os fatores ambientais de sexo, ano-estação-rebanho, tipo de nascimento e idade da ovelha. Não foram observadas perdas de variabilidade genética significativas nos rebanhos estudados. Os índices de fixação indicam que não está ocorrendo subdivisão dentro da raça e os níveis de endogamia para as características de crescimento são considerados satisfatórios. Não foram identificados rebanhos núcleo, fato que pode ter contribuído para ausência de subestruturação dentro da raça. Entre os fatores ambientais considerados, o grupo de contemporâneos, formado por animais nascidos no mesmo ano-estação-rebanho, o tipo de nascimento e o sexo do cordeiro foram os que mais influenciaram os pesos e os ganhos médios de peso estudados.

FundaÃÃo Cearense de Apoio ao Desenvolvimento Cientifico e TecnolÃgico / O presente trabalho teve como objetivo avaliar a estrutura de uma populaÃÃo de ovinos da raÃa Morada Nova variedade branca no Estado do CearÃ. Os dados foram provenientes do fichÃrio de controle zootÃcnico do Projeto de Melhoramento de Ovinos da RaÃa Morada Nova variedade branca, do Departamento de Zootecnia, no perÃodo de 1970 a 1987, referentes a registros de 2403 animais, sendo 922 machos e 1481 fÃmeas. Foram estimados o tamanho efetivo (Ne), coeficiente de consanguinidade (F) e parentesco mÃdio (AR) dos indivÃduos, tamanho efetivo de fundadores e de ancestrais (fa e fe), intervalo de geraÃÃes (IEG), integridade dos pedigrees e estatÃsticas F de Wright. Os resultados obtidos evidenciaram que houve ocorrÃncia de perdas do material genÃtico de origem e o uso intensivo de animais aparentados dentro do rebanho no perÃodo estudado. Para os machos, a mÃdia estimada do intervalo de geraÃÃo foi satisfatÃria e, para as fÃmeas, apresentou mÃdia inferior. JÃ, os valores mÃdios estimados de AR sofreram pequenas variaÃÃes na populaÃÃo, com exceÃÃo dos primeiros cinco anos de registro. TambÃm, observou-se subdivisÃo na populaÃÃo, devido ao uso mais intenso de alguns reprodutores, proporcionando, assim, isolamento genÃtico no rebanho. Portanto, concluiu-se que este rebanho de ovinos da raÃa Morada Nova variedade branca encontrava-se em estado crÃtico no perÃodo estudado, necessitando de gestÃo que possibilitasse a sua preservaÃÃo e conservaÃÃo / The present work has the purpose of evaluating the structure of a population of Morada Nova sheep breed from State of CearÃ. Data were collected from the file to control the breeding of Sheep Improvement Project for the Morada Nova Breed white variety, of the Department of Animal Science in the period from 1970 to 1987 for records of 2,403 animals, (922 males and 1,481 females). The effective size (Ne), coefficient of consanguinity (F) and average relatedness coefficient (AR) individuals, effective size of founders and ancestors (fa and fe), generation interval (IEG), integrity of pedigrees and Wrightâs F statistics have been estimated. We could observe the occurrence of loss of original genetic material and the intensive use of related animals among the sheep. The obtained generation interval average for males was satisfactory, although for females the averages had lower magnitudes. The estimated AR medium rates had few variations in population, except for the first five years of record. We could observe subdivision in population due to the more intense use of some breeding animals causing genetic isolation among flock. Therefore, we came to the conclusion that this flock was in a critical situation during the period of this study, and it needs a focused administration in preservation and conservation

Conselho Nacional de Desenvolvimento CientÃfico e TecnolÃgico / O presente trabalho teve como objetivo avaliar a estrutura populacional de um rebanho bovino da raca Pardo-Suica no Estado do Ceara. Os dados foram provenientes do fichario de controle zootecnico da Fazenda Experimental Vale do Curu (FEVC), da Universidade Federal do Ceara, no periodo de 1988 a 2009, referentes a registros de 431 animais (149 machos e 282 femeas). Foram estimados o tamanho efetivo (Ne), o coeficiente de consanguinidade (F) parentesco medio (AR) dos individuos, o tamanho efetivo de fundadores e de ancestrais (fa e fe), o intervalo de geracoes (IG), a integridade dos pedigrees e as estatisticas F de Wright. Os coeficientes de F e AR medios da populacao foram de 0,0037 e 0,0139 respectivamente. Ja o intervalo de geracoes (IG) total foi de 5,40 anos, sendo maior para mae-filha. O numero efetivo de animais fundadores (fe) e de ancestrais (fa) foi 50 e 39 respectivamente, sendo que de todos os ancestrais apenas, metade foi responsavel pela variabilidade genetica da populacao, o que indica perda de genes de origem. Observa-se baixa contribuicao dos animais fundadores ao longo das geracoes. Quanto a integridade dos pedigrees foram identificados 53,13% animais como pais (reprodutores) e 50,81% como maes. Para subdivisao da populacao os valores obtidos para FIS, FST e FIT foram -1,00, 0,498 e -0,003 respectivamente, indicando perda de heterozigosidade causada pela divisao da populacao. / This study aimed to evaluate the population structu re of a cattle herd of Brown Swiss cattle in the state of CearÃ. Data were from Binder Animal Co ntrol Experimental Farm Valley Curu (FEVC), Federal University of CearÃ, from 1988 to 2 009, relating to records of 431 animals (149 males and 282 females). We estimated the effec tive size (Ne), the inbreeding coefficient (F) average kinship (AR) of individuals, the effective size of founders and ancestors (fa and fe), the generation interval (GI), the integrity of the pedigrees and Wright's F statistics. The coefficients of F and AR average population were 0.0037 and 0.0139 respecti vely. Since the generation interval (GI) total was 5.40 years, higher for motherdaughter. T he actual number of animals founders (fe) and ancestors ( fa) was 50 and 39 respectively, and all the ancestors only, was responsible for half the population genet ic variability, indicating loss of genes of origin. Found to be low contribution of founding an imals over generations. The integrity of the pedigrees were identified 53.13% animals as par ents (breeders) and 50.81% as mothers. For subdivision of the values obtained for F IS , F ST , and F IT were 1.00, 0.003 and 0.498 respectively, indicating loss of heterozygosi ty caused by the division of the population.

O composto GN-04 foi utilizado no presente trabalho, tendo por objetivo: a) avaliar o efeito do processo dispersivo em subpopulações de milho com diferentes tamanhos efetivos, e submetidas previamente à seleção divergente para alta e baixa produção; b) avaliar a capacidade de combinação e o potencial heterótico dessas subpopulações e c) estimar componentes da variância genética no composto GN-04, usando o esquema de cruzamento em cadeia. Um lote do referido composto foi plantado visando à obtenção de três diferentes progênies: S1, por autofecundação; irmãos germanos, cruzamento planta a planta e cruzamentos em cadeia, seguindo o esquema 1 x 2, 2 x 3 e 3 x 1. Foram obtidas 77 progênies S1, 75 de irmãos germanos e 72 cadeias, contituidas de três cruzamentos. As progênies de cada tipo foram avaliadas em ensaios distintos, em dois locais, de acordo com o delineamento em blocos casualizados, com três repetições. Os caracteres avaliados foram: altura da planta (AP), altura da espiga (AE), comprimento da espiga (CE), diâmetro da espiga (DE), peso de espigas (PE) e prolificidade (PR). Com base nos valores médios do caráter PE, foram selecionadas 10 progênies de irmãos germanos,10 de S1 e 10 cadeias, sendo cada grupo de materiais constituído das cinco progênies ou cadeias mais produtivas, e das cinco menos produtivas. A recombinação das progênies selecionadas ou cadeias ensejou a obtenção de subpopulações com diferentes tamanhos efetivos: N1, N2 e N3, que correspondem a taxas de endogamia de 50%, 25% e 17%, para S1’s, irmãos germanos e cadeias, respectivamente. Essas subpopulações foram avaliadas posteriormente com base no seu desempenho per se e em cruzamentos ‘topcrosses’ e dialélicos. Os resultados desta avaliação mostraram que o tamanho reduzido das subpopulações provocou o surgimento de valores médios inferiores ou superiores à média estimada da população original, em conseqüência da deriva genética. Os valores médios de todos os caracteres foram afetados pela redução no tamanho efetivo das subpopulações, em conseqüência da depressão por endogamia, a qual se expressou com mais intensidade no caráter PE: em subpopulações com N3 e N1, no nível de seleção positiva, o efeito da depressão foi de 5,20% e 20,07%, respectivamente, e no nível de seleção negativa, 15,98% e 55,76%, respectivamente. A seleção divergente entre subpopulações resultou em diferenciação genética suficiente para expressar heterose em cruzamentos entre subpopulações com o mesmo tamanho efetivo. As estimativas da variância aditiva do composto GN-04, com base na análise da variância conjunta dos experimentos com progênies de cruzamentos em cadeia, para os caracteres PE, CE, DE, PR, AP e AE foram, respectivamente: 128,00 (g/pl)², 1,490 (cm/esp.)², 0,1704 (cm/esp.)², 0,0200 (esp./pl)², 256,55 (cm/pl)² e 136,80 (cm/pl)². Estimativas negativas da variância aditiva foram obtidas para os caracteres CE, DE, AP e AE; para os caracteres PE e PR as estimativas foram 185,00 (g/pl)² e 0,0188 (esp./pl)², respectivamente. O delineamento de cruzamentos em cadeia de tamanho 3, tendo em vista a facilidade de execução, pode ser uma alternativa a delineamentos de execução mais complexa para estimar componentes da variância. / The composite GN-04 was used in the present work with the objetives: a) evaluation of the effect of the dispersive process in subpopulations of maize with different effective sizes, and submitted to divergent selection for higth and low yield; b) evaluation of the combining ability and heterotic potential of the subpopulations; and c) to estimate components of the genetic variance in the composite GN-04, using chain crosses. A pollination block of the base population was planted for the development of three different progenies: S1 progenies obtained by selfing, full-sib progenies obtained by plant-to-plant crosses, and chain crosses following the scheme: 1 x 2, 2 x 3 e 3 x 1. The numbers of progenies were: 77 S1´s, 75 full-sibs and 72 chains represented by three crosses in each chain. The progenies from each type were evaluated in different experiments in two locations following the randomized complete block design with three replications. The following traits were analysed: plant height (AP), ear height (AE), ear length (CE), ear diameter (DE), ear weight (PE) and prolificacy (PR). Observed means of PE were used for selection of 10 full-sib progenies, 10 S1´s progenies and 10 complete chains, each group being represented by five high yielding and five low yielding progenies or chains. The recombination of the selected progenies or chains, individually, led to the development of subpopulations with different effective sizes: N1, N2 and N3, corresponding to inbreeding rates of 50%, 25% and 17% for S1´s, full-sibs and chain crosses, respectively. The subpopulations were later evaluated based on their performance per se, in the topcrosses and in diallel crosses. Results showed that the reduced size of the subpopulations led to changes in the means of the evaluated traits, which were smaller or higher than the original means as a consequence of genetic drift. On the average, all traits showed a decrease in the mean as a consequence of inbreeding depression. The most depressive trait was PE and the depression effects in subpopulations with N3 and N1 were 7.17% and 22.94% in the positive selection and 16.85% and 55.91% in the negative selection. The divergent selection among subpopulations led to a genetic differentiation sufficient for the expression of heterosis in crosses between subpopulations in the same level of effective size. The estimates of the additive genetic variance in the composite GN-04 were obtained from the analysis of chain crosses. The estimates for the traits PE, CE, DE, PR, AP and AE were, respectively: 128.00 (g/pl)², 1.490 (cm/esp.)², 0.1704 (cm/esp.)², 0.0200 (esp./pl)², 256.55 (cm/pl)² and 136.80 (cm/pl)². Negative estimates of the dominance variance were obtained for the traits CE, DE, AP and AE; for the traits PE and PR, the estimates were 185.00 (g/pl)² and 0.0188 (esp./pl)², respectively. The mating design based on chain crosses with size 3 was considered feasible and easy to be used and can be a reliable alternative as compared with other more complex designs.

Submitted by Amanda Silva (amanda.osilva2@ufpe.br) on 2015-03-05T13:59:07Z No. of bitstreams: 2 TESE Fábia de Oliveira Luna.pdf: 6070926 bytes, checksum: 5c0233b17f6af6c3a2f420f1d6eb3248 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-05T13:59:07Z (GMT). No. of bitstreams: 2 TESE Fábia de Oliveira Luna.pdf: 6070926 bytes, checksum: 5c0233b17f6af6c3a2f420f1d6eb3248 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2013 / The West Indian manatee (Trichechus manatus) and the Amazonian manatee (Trichechus inunguis) belong to the mammalian Order Sirenia, classified respectively as critically endangered and as vulnerable in Brazil. Both species have been hunted commercially since the sixteenth century, resulting in a drastic reduction or elimination of manatees in some places. This hunting pressure may have caused isolation of the populations resulting in geographic genetic isolation, with a reduction of their genetic diversity. The objective of this study is to understand the genetic diversity and population structure of the West Indian manatee (T. manatus) in Brazil; verify the existence of hybridization between the manatees T. manatus and T. inungus; define the degree of relatedness of individuals in captivity; and provide strategies for the conservation of the species. In northeastern Brazil, a large number of dependent calves strand on beaches. Many of these calves have been rescued alive and rehabilitated for future release. Previously, the identification of release sites did not take into account the genetic issues. Through this study, it has been possible to identify suitable release sites based on phylogenetic traits of the manatees. The genetic structure of the population was studied using nuclear DNA in the program STRUCTURE, and comparing FST and RST values. On the Northeast coast one population was identified, which is subdivided in two subpopulations. A different genetic population was found in the Northwest of the Amazon River estuary (extreme north of Brazil, Guyana and Venezuelan). Manatees from the Estuary of the Amazon River grouped with Amazonian manatees from the Santarém region to form a third population. A total of four manatee Management Units were identified along the Brazilian coast, which should be treated separately for management and conservation needs. Using a combination of molecular markers (mtDNA and nDNA) and cytogenetic analyses the existence of hybridization between T. manatus and T inunguis was confirmed, although this does not appear to be a frequent occurrence. Some of the dependent calves rescued, and other individuals transferred from irregular captive conditions to the CMA/ICMBio, were kept together and breeding occurred. Maintaining related manatees together can lead to inbreeding. It was possible 29 to establish the degree of relatedness between individuals kept at CMA/ICMBio and verify the extistence of inbreeding. To avoid inbreeding, hybridization, and overpopulation in captivity, it is necessary that males and females be separated immediately, thereby preventing reproduction ex-situ. The present study allows us to establish actions for the conservation of the West Indian manatee. Actions that should be prioritized include: protection and restoration of habitat with the creation and implementation of specific protected areas; creation and maintenance of travel corridors that allow gene flow; reduction and elimination of anthropogenic pressures on the species; stopping pointless reproduction in captivity; designing further studies in the north of Brazil to better understand the hybridization and implement the action plan.

Abstract Plant reproductive success is affected by a number of factors, such as climatic conditions and plant resource status during flowering and fruiting, and pollen origin in fertilization. In the present thesis project, different aspects of plant reproductive ecology were investigated in order to identify constraints on sexual reproduction and seed set in two clonal dwarf shrubs (Vaccinium myrtillus and V. vitis-idaea) and one long-lived perennial herb (Campanula rotundifolia). The work comprised phenological observations and experiments with the clonal shrubs at natural boreal forest sites in the Oulanka National Park in northern Finland. The impact of mycorrhiza on C. rotundifolia fitness traits was tested in hand pollinations in a greenhouse experiment. Pollen origin had some effect on fruit set, and had strong effects on the number of matured seeds in all three species. Seed yield reductions upon hand self-pollination as compared with hand cross-pollination were attributed to inbreeding depression in V. myrtillus, and presumably to partial self-incompatibility in C. rotundifolia. V. myrtillus and V. vitis-idaea showed a population structure where the number of matured seeds per fruit increased with increasing distance between pollen donor and pollen recipient. Clonal growth in concert with the foraging behaviour of bumblebee pollinators is thought to cause the possibility of either uniparental or biparental inbreeding, with a strong effect on the number of matured seeds per berry. In a flower-removal experiment lasting three years, costs of fruiting to future fecundity and vegetative traits were observed, but not to future survival in V. vitis-idaea and V. myrtillus. The response was more pronounced in the evergreen than in the deciduous species. In Campanula rotundifolia, mycorrhiza was associated with a cost to the plants' reproductive effort, as plant biomass and the number of flowers produced per plant were decreased in mycorrhizal plants in comparison with non-mycorrhizal plants. There was no difference in seed number, seed weight or germination between the seeds of mycorrhizal and non-mycorrhizal plants. However, the offspring of mycorrhizal plants had a higher relative growth rate, while also having a higher seed phosphorus concentration. In summary, sexual reproduction was variably constrained by previous reproduction in Vaccinium, and contrary to expectations, by mycorrhiza in Campanula. However, mycorrhiza had positive effects on some measures of offspring fitness. In all three species, self-pollination limited seed production.