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Aplicação de estratégias híbridas em algoritmos de alinhamento múltiplo de sequências para ambientes de computação paralela e distribuída. / Application of hybrid strategies in multiple sequence alignments for parallel and distributed computing environments.Zafalon, Geraldo Francisco Donegá 11 November 2014 (has links)
A Bioinformática tem se desenvolvido de forma intensa nos últimos anos. A necessidade de se processar os grandes conjuntos de sequências, sejam de nucleotídeos ou de aminoácidos, tem estimulado o desenvolvimento de diversas técnicas algorítmicas, de modo a tratar este problema de maneira factível. Os algoritmos de alinhamento de alinhamento múltiplo de sequências assumiram um papel primordial, tornando a execução de alinhamentos de conjuntos com mais de duas sequencias uma tarefa viável computacionalmente. No entanto, com o aumento vertiginoso tanto da quantidade de sequencias em um determinado conjunto, quanto do comprimento dessas sequencias, a utilização desses algoritmos de alinhamento múltiplo, sem o acoplamento de novas estratégias, tornou-se algo impraticável. Consequentemente, a computação de alto desempenho despontou como um dos recursos a serem utilizados, através da paralelização de diversas estratégias para sua execução em grandes sistemas computacionais. Além disso, com a contínua expansão dos conjuntos de sequências, outras estratégias de otimização passaram a ser agregadas aos algoritmos de alinhamento múltiplo paralelos. Com isso, o desenvolvimento de ferramentas para alinhamento múltiplo de sequencias baseadas em abordagens híbridas destaca-se, atualmente, como a solução com melhor aceitação. Assim, no presente trabalho, pode-se verificar o desenvolvimento de uma estratégia híbrida para os algoritmos de alinhamento múltiplo progressivos, cuja utilização e amplamente difundida, em Bioinformática. Nesta abordagem, conjugou-se a paralelização e o particionamento dos conjuntos de sequências, na fase de construção da matriz de pontuação, e a otimização das fases de construção da árvore filogenética e de alinhamento múltiplo, através dos algoritmos de colônia de formigas e simulated annealling paralelo, respectivamente. / Bioinformatics has been developed in a fast way in the last years. The need for processing large sequences sets, either nucleotides or aminoacids, has stimulated the development of many algorithmic techniques, to solve this problem in a feasible way. Multiple sequence alignment algorithms have played an important role, because with the reduced computational complexity provided by them, it is possible to perform alignments with more than two sequences. However, with the fast growing of the amount and length of sequences in a set, the use of multiple alignment algorithms without new optimization strategies became almost impossible. Therefore, high performance computing has emerged as one of the features being used, through the parallelization of many strategies for execution in large computational systems. Moreover, with the continued expansion of sequences sets, other optimization strategies have been coupled with parallel multiple sequence alignments. Thus, the development of multiple sequences alignment tools based on hybrid strategies has been considered the solution with the best results. In this work, we present the development of a hybrid strategy to progressive multiple sequence alignment, where its using is widespread in Bioinformatics. In this approach, we have aggregated the parallelization and the partitioning of sequences sets in the score matrix calculation stage, and the optimization of the stages of the phylogenetic tree reconstruction and multiple alignment through ant colony and parallel simulated annealing algorithms, respectively.
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Preditores independentes de mortalidade em pacientes politraumatizados: estudo longitudinal, prospectivo, observacional / Independent predictors of mortality in polytrauma patients: a prospective, observational, longitudinal studyCosta, Luiz Guilherme Villares da 03 August 2015 (has links)
O trauma constitui importante problema de saúde pública, com grande impacto sócio-econômico e muitas mortes. Visto que poucos pesquisadores traçam perfil epidemiológico e fatores preditores de óbito de forma integrada e prospectiva, este estudo foi idealizado com o objetivo de identificar preditores independentes de mortalidade em trauma e seu mapeamento populacional, visando melhorar o atendimento a politraumatizados graves. Após aprovação da comissão de ética em pesquisa institucional, estudo longitudinal, prospectivo e observacional foi conduzido entre 2010 e 2013 na região metropolitana da Grande São Paulo/Brasil com vítimas de politrauma grave (Injury Severity Score >15). A coleta de dados clínico-laboratoriais foi realizada em 4 momentos: 1- pré-hospitalar, 2- sala de emergência, 3- após 3 horas da admissão e 4- após 24 hs da admissão. O desfecho principal foi mortalidade em 30 dias. Os dados foram analisados com teste t de Student ou Mann-Whitney, ANOVA não paramétrica, e Equações de Estimação Generalizadas (EEG) para medidas repetidas (p < 0,05). A população total do estudo foi de 334 pacientes, sendo excluídos 124 por não adequação ao protocolo e incluídos 200 indivíduos na análise final. Os preditores independentes de mortalidade encontrados foram: saturação arterial de oxigênio de hemoglobina (OR=0,989; IC 95% 0,982-0,995- p < 0,001), pressão arterial diastólica (OR=0,998; IC 95% 0,995-0,998- p < 0,001), nível sérico de lactato (OR=1,046; IC 95% 1,012-1,082- p < 0,004), pontuação na escala de coma de Glasgow (OR=0,973;IC 95% 0,965-0,982-p < 0,001), quantidade de cristalóides infundidos (OR=1,013; IC 95% 1,000-1,025- p < 0,023 - a cada 1000 ml). Através das análises realizadas neste estudo foi possível concluir que os preditores independentes de mortalidade foram: hipoxemia, hipotensão arterial diastólica, hiperlactatemia, baixa pontuação na escala de coma de Glasgow e aumento de volume de cristalóides infundidos / Trauma is an important public health problem, with high socioeconomic impact and major adverse clinical outcomes. The epidemiological profile and predictors of death in trauma patients have not been addressed in an integrated and prospective way. Therefore, the present study was designed to identify independent predictors of mortality in trauma patients and their populational mapping to improve the care of severe polytrauma patients. After approval by the ethics in institutional research committee, the present longitudinal, prospective and observational study was conducted between 2010 and 2013 in the metropolitan area of São Paulo/Brazil with victims of severe polytrauma (Injury Severity Score >15). The collection of clinical and laboratory data was performed at 4 different time points: 1, pre-hospital; 2, in the emergency room; 3, at 3 hours after admission; and 4, at 24 hours after admission. The primary outcome was mortality within 30 days. The data were analyzed with Student\'s t-test or the Mann-Whitney test, nonparametric ANOVA and Generalized Estimating Equations (GEE) for repeated measures (p < 0.05). The total study population consisted of 334 patients. In total, 124 patients were excluded for not fitting the protocol, and 200 individuals were included in the final analysis. The independent predictors of mortality were as follows: arterial hemoglobin oxygen saturation (OR=0.989, 95% CI 0.982-0.995, p < 0.001); diastolic blood pressure (OR=0.998, 95% CI 0.995-0.998, p < 0.001); serum lactate level (OR=1.046, 95% CI 1.012- 1.082, p < 0.004); score on the Glasgow coma scale (OR=0.973, 95% CI 0.965-0.982, p < 0.001); and the amount of infused crystalloid (OR=1.013, 95% CI 1.000-1.025, p < 0.023 - each 1000 ml). Through the analyses performed in this study, it was concluded that the independent predictors of mortality at any given time were as follows: hypoxemia; diastolic arterial hypotension; hyperlactatemia; a low score on the Glasgow coma scale; and volume of infused crystalloid
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Epidemiologia dos traumas em países desenvolvidos e em desenvolvimento / Epidemiology of trauma in developed and developing countriesImamura, Janete Honda 05 July 2012 (has links)
Objetivos: Estudo sobre mortalidade por causas externas não intencionais divulgadas na literatura médica mundial em crianças e adolescentes, com verificação das principais causas externas fatais não intencionais e identificação de diferenças de causas externas de óbito entre países de diferentes desempenhos econômico-sociais. Método: Revisão sistemática da literatura mundial sobre mortalidade por causas externas não intencionais em crianças e adolescentes de julho de 2001 a junho de 2011, através das bases de dados de periódicos eletrônicos científicos PubMed, LILACS, EMBASE e pesquisa manual com dados de âmbito nacional de órgãos oficiais. Resultados: Selecionados 15 artigos de periódicos, um livro e os dados estatísticos de 2010 da base de dados do Ministério da Saúde do Brasil. A maioria de países envolvidos nas divulgações de dados apresentavam alto desempenho econômico-social, com preponderância de países de alta e média renda econômica e índice de desenvolvimento econômico muito alto. Dos óbitos por causas externas, as principais causas foram as não intencionais. Verificou-se predominância dos acidentes de transporte como principal causa de óbito nos países estudados, em especial a partir da idade pré-escolar. A seguir os afogamentos e submersões se sobressaem, seguidos pelas quedas, queimaduras e as intoxicações. As maiores taxas de mortalidade por causas externas não intencionais por faixa etária foram observadas nas crianças menores de um ano de idade, principalmente pelos riscos acidentais à respiração excluindo os afogamentos e as submersões. Foi identificado ainda um número expressivo de óbitos por causas externas de intenção indeterminada. No Brasil, esses fatos também se repetiram e observou-se que praticamente metade dos óbitos em crianças por acidentes de transporte ocorreram na própria via pública. Conclusões: O acidente de transporte foi identificado como causa predominante de óbito por causas externas não intencionais na infância nos países estudados, principalmente a partir da idade pré-escolar. A faixa etária dos lactentes foi especialmente susceptível aos riscos acidentais à respiração que excluem os afogamentos e as submersões acidentais. Investigações mais detalhadas dos óbitos por causas externas para reduzir o número de eventos por intenções indeterminadas devem ser consideradas. Mais divulgações de dados sobre a ocorrência de mortes por causas não intencionais em países com menor desenvolvimento econômico e social são necessárias para um maior conhecimento e conscientização desses eventos passíveis de prevenção / Objective: Report on the mortality rate of children and youths due to non-intentional external causes disclosed in the world medical literature, with analysis of the principal non-intentional external deadly causes and identification of differences related to the external causes of death in countries with different economic and social performances. Method: This was a systematic review of the literature on mortality from accidental injury in children and adolescents. We searched the PubMed, Latin-American and Caribbean Health Sciences Literature, and Excerpta Medica databases for articles published between July of 2001 and June of 2011. National data from official agencies, retrieved by hand searches, were also reviewed. Results: We reviewed 15 journal articles and 1 book, as well as 2010 statistical data from the Brazilian National Ministry of Health Mortality Database. Most of the data relate to countries with high economic and social performance, with predominance of countries with high and middle economic income and very high economic development rates. Deaths due to external causes were primarily the result of non-intentional causes. There was a predominance of transportation accidents as the principal cause of death in the countries surveyed, especially as from preschool age. Accidental drowning and submersion rank second, followed by falls, burns and poisoning. The highest rates of death from non-intentional external causes by age grade were observed in children below 1 year old, principally due to accidental threats to breathing, excluding drowning and submersion. A significant number of deaths due to undetermined external causes was also identified. This situation was also registered in Brazil, and nearly half of all childhood deaths from traffic accidents occurred at the scene. Conclusions: Traffic accidents were found to constitute the leading external cause of accidental death among children in the countries under study, principally among those of preschool age or older. Infants were found to be particularly vulnerable to accidental non-drowning threats to breathing. A detailed investigation about deaths due to external causes must be considered in order to reduce the number of deaths due to undetermined causes. Further studies investigating the occurrence of accidental deaths in countries with low social and economic development are needed in order to improve the understanding of these preventable events
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Dinâmica e controle de um sistema de cristalização por evaporação múltiplo-efeito. / Dynamic and control of a crystallization system by multiple-effect evaporation.Silva, André Luiz Nunis da 26 September 2012 (has links)
O desenvolvimento de métodos que aumentem a eficiência de controle de processos de cristalização ganhou importância devido à necessidade de melhoras nas taxas de produção, minimizando os custos de energia e mantendo a qualidade das partículas. Neste trabalho os autores estudaram a aplicação de um controlador preditivo (MPC) a um processo de cristalização de cloreto de sódio por evaporação múltiplo-efeito, com alimentação paralela, permitindo que a planta busque, em tempo real, o melhor ponto de operação respeitando os limites definidos. Primeiramente, foi criado um modelo fenomenológico não linear através de balanços de massa, energia e momento considerando a cinética de cristalização, de forma que se possa simular a dinâmica de operação dos cinco efeitos operando dependentemente. O modelo físico possibilitou a aplicação de um controlador do tipo MPC com zona de controle permitindo que as principais variáveis de saída encontrem, dentro de uma faixa de operação aceitável, o ponto ótimo do processo nas condições atuais. Ao mesmo sistema foi aplicado um controlador clássico do tipo PID para avaliação dos ganhos adquiridos pela técnica de controle por predição do estado futuro da planta, observando uma melhor estabilidade e queda no consumo energético. / The development of methods to increase the efficiency of the crystallization process control has gained importance due to the need to improve production rates, to minimize energy costs and to improve the quality of particulate products. In this work the author has applied a model predictive control (MPC) to a continuous forced circulation five-stage evaporative sodium chloride crystallizer with parallel feed, providing the real time search of the best operating point inside the defined set of constraints. First, a non-linear phenomenological model was developed by mass, energy and moment balances coupled to the crystallization kinetics, to simulate the dynamic operation of the five effects working dependently. The physical model enabled the study of the implementation of a model predictive control MPC with zone control that allows the main output variables to be controlled in acceptable operating ranges and the detection of the optimum operating point of the process corresponding to current economic conditions. To evaluate the benefits of the advanced control strategy, a classical PID control system was also implemented in the crystallization system and the two strategies were compared to evaluate the benefit of the model based predictive strategy that provides a better stability and a decrease in the energy consumption.
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Extensões multimodal e multiusuário de interface gráfica e interface de voz baseadas em tecnologias de fala e modelos de interação.Elizabete Munzlinger 31 March 2009 (has links)
A extensão de uma interface Monomodal para Multimodal de um sistema deve ocorrer de modo que o mesmo continue apresentando um funcionamento satisfatório no processo de interação. Esta migração pode ser impulsionada quando um sistema necessita oferecer um canal alternativo de interação, como nas situações em que o usuário não pode usufruir dos movimentos dos membros superiores ou da visão, ou ainda quando não se dispõe de espaço para uma interface gráfica. Oferecer interface com uso da fala como meio de interação nesses casos, pode permitir o acesso a informações e serviços que afetam significativamente o cotidiano das pessoas. O propósito da pesquisa é identificar um modo reutilizável de estender sistemas novos ou pré-existentes com Interface Monomodal tornando-as Multimodais e Multiusuário, visando melhorar ou manter sua capacidade de interação e oferecendo maior usabilidade aos sistemas. Para tal, essa dissertação propõe um modelo de arquitetura de componentes baseado em Tecnologias de Fala e Modelos de Interação e de projeto de uma estrutura de gramática. Esses modelos foram aplicados na extensão de dois protótipos de sistema para testar sua reusabilidade. O modelo de arquitetura de componentes foi identificado e a estrutura de gramática foi concebida através do re-projeto do protótipo de sistema DomoVox: aplicativo pré-existente de automação residencial para controle dos dispositivos de um ambiente doméstico. Neste processo, sistema DomoVox teve sua Interface de Voz estendida para Interface Gráfica de modo a tornar-se Multimodal e somar capacidade Multiusuário baseada na tecnologia de voz de Reconhecimento Automático de Fala e nos modelos de interação 'Linguagens de Comandos' e 'Menus'. O modelo e a estrutura de gramática, foram então reutilizados na implementação do protótipo de sistema BrowserVox: navegador para visitação de sites na Internet. O sistema BrowserVox teve sua Interface Gráfica estendida para Interface de Voz de modo a tornar-se Multimodal e Multiusuário, baseada nas tecnologias de fala de Reconhecimento Automático de Fala e Síntese de Texto e nos modelos de interação 'Linguagens de Comandos' e 'Hipertexto'. Ao final, foram realizados testes de acurácia para o sistema DomoVox com reconhecimento de alguns conjuntos de comandos, e avaliação de usabilidade para o sistema BrowserVox. O modelo de extensão gerado durante o trabalho mostrou-se aplicável e reutilizável, inicialmente projetado para atender um sistema de conteúdo de interação estático, e atendendo ainda assim, um sistema de conteúdo dinâmico.
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Mortalidade diferencial por causas, São Paulo, 1970: tábuas de vida de múltiplo decremento / Differential mortality causes, São Paulo, 1970: life tables of multiple decrementGotlieb, Sabina Lea Davidson 14 March 1977 (has links)
Considerações sobre tábua de vida e tábua de vida de múltiplo decremento foram feitas, dado que o objetivo deste trabalho foi avaliar a magnitude da atuação de alguns grupos de agravos à saúde (doenças infecciosas e parasitárias, tumores malignos, incluindo as neoplasias malignas do tecido linfático e dos órgãos hematopoéticos, doenças cardiovasculares e acidentes, envenenamentos e violêcias) nas probabilidades de morte, de sobrevivência e nas esperanças de vida dos residentes no município de são Paulo em 1970. A esperança de vida ao nascer foi igual a 60,12 anos, no sexo masculino e 67,12 anos no sexo feminino. Foi detectado o importante papel das doenças infecciosas e parasitárias, em menores de 4 anos, pois caso não tivessem sido fator de risco de morte a probabilidade de morrer, nestas idades, teria sido reduzida em até 35 por cento , permitindo que a esperança de vida ao nascer tivesse acréscimos de 2,52 anos (4,19 por cento a mais) e 2,24 anos (3.33 por cento a mais) respectivamante para os homens e mulheres. Os tumores malilnos se não tivessem sido fator de risco de morte teriam reduzido a probabi1idade de morrer dos homens de 50 a 70 anos, em torno de 16 por cento e em 25 por cento , a das mulheres de 40 a 60 anos. Os ganhos nas esperanças de vida ao nascer seriam de 1,87 anos (3,11 por cento a mais) e 2,02 anos (3,01 por cento a mais) nos sexos masculino e feminino, respectivamente. As doenças cardiovasculares, principal grupo de causas de morte, reduziriam em até 60 por cento a probabilidade de morrer dos residentes no municipio de são Paulo, em 1970, e propiciariam ganhos de 9,14 anos e 11,44 anos, respectivamente na esperança de vida ao nascer, masculina e feminina, caso não tivessem sido fator de risco de morte. Os acidentes, envenenamentos e violências, segundo grupo de causas de morte para os homens, caso não tivessem sido fator de risco de morte, teriam reduzido de 27,83 por cento até 65,17 por cento a probabilidade de morrer entre 4 e 40 anos, com isso a probabilidade de sobreviver dos 15 aos 65 anos, faixa de população economicamente ativa, seria de 66,87 por cento , em vez de 61,87 por cento . O ganho na esperança de vida ao nascer seria de 2,36 anos (3,93 por cento a mais). Após a análise de cada um dos grupos de causas pôde-se ordenar os principais grupos de doenças em função dos ganhos que propiciariam à esperança de vida ao nascer, caso não tivessem sido fator de risco de morte: no SEXO MASCULINO - cardiovasculares, infecciosas e parasitárias, acidentes, envenenamentos e violências e os tumores malignos; no sexo FEMININO - cardiovasculares, infecciosas e parasitárias, tumores malignos e os acidentes, envenenamentos e violências. Finalizando, levantou-se a hipótese de que o padrão de mortalidade no município de São Paulo, em 1970, refletiria a existência de problemas de saúde de uma população formada por setores distintos onde coexistiriam condições adversas a saúde típicas, ora de regiões consideradas desenvolvidas, ora de regiões em desenvolvimento. / General considerations about life tables and multiple decrement tables were made, since the objective of this work was to evaluate the impact of some diseases (Infective and Parasitic diseases, Neoplasms, Cardiovascular diseases and Accidents, Poisonings and Violence) on the probabilities of dying, survival, and on the expectation of life of the inhabitants of the City of são Paulo in 1970. The calculated male life expectancy was 60.12 years and the female was 67.12 years. The main role of the Infective diseases was detected among children bellow age 4. The reduction in their probability of dying, if the effect of these diseases was removed, would be near 35 per cent ; and these diseases cause a loss of 2.52 years(4.19 per cent ) and 2.24 years (3.33 per cent ) for the male and female life expectancies, respectively. If the effect of the Neoplasms was removed, it would reduce the probability of dying for males in 16 per cent , in the age interval 50 to 70 years, and 25 per cent for wómen in the age interval 40 to 60 years. This disease causes a loss of 1.87 years (3.11 per cent ) in the expectation of life for males and 2.02 years (3.01 per cent ) for females. The Cardiovascular diseases, the main group of causes of death, would reduce as much as 60 per cent the probability of dying, if their effect were removed. The \"gain\" in life expectancy would be 9.14 years and 14.44 years for men and women, respectively. Removing the effect of Accidents, Poisonings and Violence, the second main group of causes of death for men, the probability of dying for men, aged 4 to 40 years would be reduced between 27.83 per cent and 65.17 per cent . The probability of survival for the population at the economically productive ages (15 to 65 years) would be 66.87 per cent instead of 61.87 per cent . The loss for the life expectancy in this case, is 2.36 years (3.93 per cent ). After this analysis the main grbups of causes of death were ranked as: FOR MALES: Cardiovascular diseases, Infective and Parasitic diseases, Accidents, Poisonings and Violence and Neoplasms; FOR FEMALES: Cardiovascular diseases, Infective and Parasitic diseases, Neoplasms and Accidents, Poisonings and Violence. An apparently dichotomous population could be considered as an explanatory hypothesis for the pattern of mortality prevailing in 1970, in the City of são Paulo: health problem effects on the mortality as those of developed countries were found, coexisting with typical health problems of the underdeveloped countries.
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Manifestações orais na síndrome de Cowden: variabilidade clínico-patológica / Oral manifestations in Cowden\'s syndrome: clinico-pathological variabilityDepicolli, Mariana Hammerschmidt 31 October 2017 (has links)
Introdução: A síndrome de Cowden é um distúrbio multissistêmico de predisposição a diversos tipos de câncer e padrão de herança autossômica dominante. As lesões cutâneas e viscerais são consideradas proliferações hamartomatosas ou tumores malignos. As lesões mucocutâneas estão presentes em quase 100% dos indivíduos afetados. No entanto, alguns autores consideram que as manifestações mucocutâneas da síndrome de Cowden são, na realidade, verrugas virais em diferentes estágios de evolução. Há poucos estudos sobre manifestações orais da síndrome de Cowden. Objetivos: Estudar as manifestações orais da síndrome de Cowden em 9 pacientes, clínica e histopatologicamente. Métodos: As lesões orais presentes em 9 pacientes com diagnóstico de síndrome de Cowden foram estudadas através de revisão de prontuário, fotografias e biopsias em seus distintos aspectos. Resultados: Todas as lesões biopsiadas mostraram aspectos histopatológicos característico de verrugas virais em diferentes estágios de evolução. Conclusão: Nossos achados parecem reforçar a hipótese de que as manifestações mucocutâneas da síndrome de Cowden representam, na realidade, verrugas virais. Estudos adicionais são necessários para explicar porque esta síndrome, causada por uma mutação de um gene supressor tumoral, poderia causar propensão a verrugas / Background: Cowden disease is a multisystemic cancer predisposition disorder, inherited in a autosomal dominant pattern. Cutaneous and visceral lesions are either malignant tumors or are believed to represent hamartomatous growths. Mucocutaneos lesions are present on almost 100% of affected individuals. Nonetheless, some authors consider that the mucocutaneous manifestations of Cowden disease are, in reality, viral warts at distinct steps of evolution. There are only a few studies regarding the oral manifestation of Cowden disease. Objectives: To study the oral manifestation of Cowden disease in nine patients clinically and histopathologically. Methods: The oral mucosal aspects of nine patients with clinical diagnosis of Cowden disease were studied by reviewing medical charts, photographs and biopsies in their different aspects. Results: All biopsied lesions depicted histopathological aspects suggestive of viral warts at distinct steps of development. Conclusion: Our findings seem to reinforce the poorly understood hypothesis that the mucocutaneous manifestations of Cowden disease are in reality viral warts. Additional studies are needed to explain why a syndrome caused by the mutation of a tumor suppression gene may cause propensity to warts
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Anormalidades citogenéticas e sua relação com a proliferação e a apoptose celular em portadores de mieloma múltiplo / Cytogenetic abnormalities and their relation to cell proliferation and apoptosis in multiple myeloma patientsLinardi, Camila da Cruz Gouveia 14 January 2011 (has links)
Anormalidades citogenéticas recorrentes são encontradas nas células tumorais de portadores de mieloma múltiplo. No momento do diagnóstico a t(4;14)(p16;q32) e a del(17p13) ocorrem em 10-20% e 5-10% dos casos, respectivamente, e são associadas à evolução clínica desfavorável. A del(13q14), por sua vez, ocorre em cerca de metade dos pacientes, porém não apresenta valor prognóstico importante. Entretanto, há evidências na literatura de que a del(13q14) seja um pré requisito para a expansão tumoral. O objetivo deste trabalho foi determinar a prevalência destas anormalidades cromossômicas em portadores de mieloma múltiplo recém diagnosticado e correlacioná-las com as taxas de proliferação e apoptose celular na medula óssea e a quantificação de plasmócitos em sangue. Amostras de aspirado de medula óssea provenientes de 84 portadores de mieloma múltiplo recém diagnosticado foram avaliadas quanto à presença de del(13q14), t(4;14)(p16;q32) e del(17p13) pela técnica de marcação fluorescente dos plasmócitos seguida pela hibridação in situ por fluorescência (cIg-FISH). Desta forma, foi realizada a correlação entre estas alterações e a quantificação de plasmócitos em sangue periférico, a proporção de plasmócitos positivos para o marcador de proliferação celular Ki-67 e para o marcador de apoptose anexina V, obtidos pela técnica de citometria de fluxo. Concomitantemente, foram avaliados parâmetros clínicos e laboratoriais e realizada a análise de sobrevida global (SG) e sobrevida livre de eventos (SLE). Os pacientes foram divididos em quatro grupos de acordo com a anormalidade citogenética presente: (1) grupo com t(4;14)(p16;q32), (2) grupo com del(17p13), (3) grupo com del(13q14) e sem nenhuma das outras alterações e (4) grupo sem nenhuma das anormalidades pesquisadas. Foi possível realizar a pesquisa de todas as anormalidades cromossômicas em 76 pacientes dos quais: vinte nove (38,1%) possuíam somente del(13q14), seis (7,89%) possuíam t(4;14)(p16;q32) e seis (7,89%) possuíam del(17p13). Não foi observada diferença estatisticamente significante entre os diferentes grupos de anormalidades citogenéticas quanto à mediana de expressão de Ki-67 em plasmócitos (p=0,7), a mediana de marcação dos plasmócitos com anexina V (p=0,94), a razão entre expressão de Ki-67 e marcação com anexina V (p=0,57) e a quantidade de plasmócitos em sangue periférico (p=0,07). Entretanto, observou-se tendência à correlação entre porcentagem de células acometidas pela del(13q14) e expressão de Ki-67 (p=0,06). A maior expressão de Ki-67 e a maior quantidade de plasmócitos circulantes se associaram a características clínicas e laboratoriais de mau prognóstico. Em análise multivariada somente níveis séricos elevados de desidrogenase lática (DHL) (p=0,002) se associaram à SLE e DHL elevado (p=0,013), a não realização de quimioterapia em altas doses com resgate de células tronco hematopoéticas (p=0,016), sistema de estadiamento internacional (ISS) III (p=0,001) e t(4;14)(p16;q32) (p=0,04) se associaram à pior SG / Recurrent cytogenetic abnormalities are found in multiple myeloma tumour cells. Among them, t(4;14)(p16;q32) e a del(17p13) occur respectively in 10-20% and 5-10% cases in the moment of diagnosis, and are associated with unfavorable clinical outcome. Del(13q14) occurs in half of patients, although, it has no important prognostic value. However, there are evidence in literature that del(13q14) is a pre requisite for tumour expansion. The purpose of this work was to determine the prevalence of chromosomal abnormalities in newly diagnosed multiple myeloma patients and correlate these abnormalities with the quantification of plasmocytes in blood and the rates of cellular proliferation and apoptosis. Bone marrow samples from eighty four newly diagnosed multiple myeloma patients were evaluated for the presence of del(13q14), t(4;14)(p16;q32) and del(17p13) by fluorescent in situ hybridization coupled to cytoplasmic staining of specific imunoglobulin (clg-FISH). Therefore, a correlation between these alterations and the proportion of plasmocytes positive for the proliferation antigen Ki-67 and for the apoptosis marker annexin V, measured by flow cytometry, was done. The quantification of plasmocytes in peripheral blood by flow cytometry was also made. Concurrently, clinical and laboratorial parameters, overall survival (OS) and event free survival (EFS) were also evaluated. Patients were divided in four groups accordingly to the cytogenetical abnormality present (1) t(4;14)(p16;q32), (2) del(17p13), (3) del(13q14) and none of the other alterations and (4) group with no researched abnormality. The research of all chromosomal abnormalities was possible in 76 patients: 29 (38,1%) had only del(13q14), six (7,89%) had t(4;14)(p16;q32) and six (7,89%) had del(17p13). No significant statistical difference was observed between different groups comparing the median expression of Ki-67 in plasmocytes (p=0,7), the median plasmocytes positive for annexin V (0,94), the ratio between Ki-67 and annexin V (p=0,57), and the quantity of plasmocytes in peripheral blood (p=0,07). However, there was a tendency for a correlation between proportion of cells with del(13q14) and Ki-67 expression (p=0,06). Higher Ki-67 expression and higher number of blood plasmocytes correlated to clinical and laboratorial features associated with unfavorable outcome. In multivariate analyses, only elevated lactate dehydrogenase (p=0,002) was associated to inferior EFS, and elevated lactate dehydrogenase (p=0,013), treatment without high dose chemotherapy with stem cell support (p=0,016), International Staging System III (p=0,001) and presence of t(4;14)(p16;q32) (p=0,04) were associated to inferior OS
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Gestão de riscos baseada no conhecimento : modelo conceitual para empresas de desenvolvimento de software /Neves, Sandra Miranda. January 2013 (has links)
Orientador: Carlos Eduardo Sanches da Silva / Coorientador: Valério Antonio Pamplona Salomon / Banca: Jorge Muniz Junior / Banca: Eduardo Gomes Salgado / Banca: David Noboru Narano / Banca: José Hamilton Chaves Gorgulho Junior / Resumo: Uma GestãodeRiscos eficaz conduz os projetos de desenvolvimento de software ao sucesso e pode influenciaros resultados da organização. A Gestão do Conhecimento participa desseprocesso como forma de auxílioà tomada de decisão. O objetivo deste trabalho é,pois, estruturarum modeloconceitualpara o processo de Gestão de Riscos Baseada noConhecimento (GRBC) que seja aplicável a empresas de desenvolvimento de software incubadas. A pesquisa adota umaabordagem metodológicaqualiquantitativa. Assim, empregou-se o método de pesquisa da modelagem matemática pormeio da utilizaçãode métodos de tomada de decisão multicritério para a estruturação eordenaçãodos Fatores de Sucessoem iniciativas de Gestão do Conhecimento. Também foram avaliadas quais técnicas de Gestão do Conhecimento são utilizadas para a análise dos riscos de projetos de desenvolvimento desoftware. Osresultados serviram de base para compor o modelo conceitual para a GRBC. A utilização do Analytic Hierarchy Process(AHP) e do Decision MakingTrialEvaluation Laboratory (Dematel), determinou, em parte, que o trabalho atingisse o objetivo geralestabelecido tendo comobase umaabordagem estruturada / Abstract: An effective Risk Managementleadsthe software development projects to success and caninfluencethe organizational results. The Knowledge Management participates as an aidto decision-making. Theaim of this paper is to outlinea conceptual model toward the Knowledge-Based Risk Management (KBRM) process, applicable at Incubated Software Development companies. The research adopts a quali-quantitative methodological approach. Thus, it hasbeen employedthe mathematical modeling researchmethod through theuse of multi-criteriadecision-making process for the structuring and coordinating the successes factor in Knowledge Management initiatives. They can alsoassess which Knowledge Management techniques are usedforthe software development risks projects analysis. The results formedthe basis for composingtheKBRM conceptual model. The use of Analytic Hierarchy Process (AHP) and of DecisionMaking Trial Evaluation Laboratory (Dematel) has determined, in part, the work to accomplish the overall established objectives, based on a structured approach / Doutor
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Epidemiologia dos traumas em países desenvolvidos e em desenvolvimento / Epidemiology of trauma in developed and developing countriesJanete Honda Imamura 05 July 2012 (has links)
Objetivos: Estudo sobre mortalidade por causas externas não intencionais divulgadas na literatura médica mundial em crianças e adolescentes, com verificação das principais causas externas fatais não intencionais e identificação de diferenças de causas externas de óbito entre países de diferentes desempenhos econômico-sociais. Método: Revisão sistemática da literatura mundial sobre mortalidade por causas externas não intencionais em crianças e adolescentes de julho de 2001 a junho de 2011, através das bases de dados de periódicos eletrônicos científicos PubMed, LILACS, EMBASE e pesquisa manual com dados de âmbito nacional de órgãos oficiais. Resultados: Selecionados 15 artigos de periódicos, um livro e os dados estatísticos de 2010 da base de dados do Ministério da Saúde do Brasil. A maioria de países envolvidos nas divulgações de dados apresentavam alto desempenho econômico-social, com preponderância de países de alta e média renda econômica e índice de desenvolvimento econômico muito alto. Dos óbitos por causas externas, as principais causas foram as não intencionais. Verificou-se predominância dos acidentes de transporte como principal causa de óbito nos países estudados, em especial a partir da idade pré-escolar. A seguir os afogamentos e submersões se sobressaem, seguidos pelas quedas, queimaduras e as intoxicações. As maiores taxas de mortalidade por causas externas não intencionais por faixa etária foram observadas nas crianças menores de um ano de idade, principalmente pelos riscos acidentais à respiração excluindo os afogamentos e as submersões. Foi identificado ainda um número expressivo de óbitos por causas externas de intenção indeterminada. No Brasil, esses fatos também se repetiram e observou-se que praticamente metade dos óbitos em crianças por acidentes de transporte ocorreram na própria via pública. Conclusões: O acidente de transporte foi identificado como causa predominante de óbito por causas externas não intencionais na infância nos países estudados, principalmente a partir da idade pré-escolar. A faixa etária dos lactentes foi especialmente susceptível aos riscos acidentais à respiração que excluem os afogamentos e as submersões acidentais. Investigações mais detalhadas dos óbitos por causas externas para reduzir o número de eventos por intenções indeterminadas devem ser consideradas. Mais divulgações de dados sobre a ocorrência de mortes por causas não intencionais em países com menor desenvolvimento econômico e social são necessárias para um maior conhecimento e conscientização desses eventos passíveis de prevenção / Objective: Report on the mortality rate of children and youths due to non-intentional external causes disclosed in the world medical literature, with analysis of the principal non-intentional external deadly causes and identification of differences related to the external causes of death in countries with different economic and social performances. Method: This was a systematic review of the literature on mortality from accidental injury in children and adolescents. We searched the PubMed, Latin-American and Caribbean Health Sciences Literature, and Excerpta Medica databases for articles published between July of 2001 and June of 2011. National data from official agencies, retrieved by hand searches, were also reviewed. Results: We reviewed 15 journal articles and 1 book, as well as 2010 statistical data from the Brazilian National Ministry of Health Mortality Database. Most of the data relate to countries with high economic and social performance, with predominance of countries with high and middle economic income and very high economic development rates. Deaths due to external causes were primarily the result of non-intentional causes. There was a predominance of transportation accidents as the principal cause of death in the countries surveyed, especially as from preschool age. Accidental drowning and submersion rank second, followed by falls, burns and poisoning. The highest rates of death from non-intentional external causes by age grade were observed in children below 1 year old, principally due to accidental threats to breathing, excluding drowning and submersion. A significant number of deaths due to undetermined external causes was also identified. This situation was also registered in Brazil, and nearly half of all childhood deaths from traffic accidents occurred at the scene. Conclusions: Traffic accidents were found to constitute the leading external cause of accidental death among children in the countries under study, principally among those of preschool age or older. Infants were found to be particularly vulnerable to accidental non-drowning threats to breathing. A detailed investigation about deaths due to external causes must be considered in order to reduce the number of deaths due to undetermined causes. Further studies investigating the occurrence of accidental deaths in countries with low social and economic development are needed in order to improve the understanding of these preventable events
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