Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia, Florianópolis, 2009. / Made available in DSpace on 2012-10-24T16:33:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 273860.pdf: 2877096 bytes, checksum: 3f6283aa90114783b89e2a4000ab45e8 (MD5) / O vírus da Síndrome da Mancha Branca (WSSV) é uma doença que afeta várias espécies de crustáceos, causando grandes mortalidades e perdas econômicas em regiões produtoras de camarão. Este trabalho teve como objetivo padronizar a metodologia de PCR em Tempo Real para a detecção do WSSV, genotipar isolados geográficos do vírus e isolar genes diferencialmente expressos em camarões de cultivo infectados com WSSV. Amostras positivas e negativas por PCR nested foram analisadas através de PCR em Tempo Real. A carga viral das amostras foi determinada e algumas amostras negativas por PCR nested foram positivas por PCR em Tempo Real, com baixa carga viral. Vírus isolados de camarões coletados em Santa Catarina e na Bahia foram comparados quanto ao padrão de três minissatélites, à presença de uma grande deleção e uma transposase. Todas as amostras de Santa Catarina tiveram o mesmo padrão para os minissatélites analisados.As amostras da Bahia apresentaram um padrão diferente para os loci analisados, indicando que existem dois genótipos de WSSV diferentes no Brasil. Os isolados brasileiros tem uma deleção de 10,780 bp na ORF 23/24 e não possuem a seqüência da transposase. O padrão de repetições para os três minissatélites analisados foi diferente entre os isolados brasileiros e de outros países da América. Entretanto, ao analisar apenas a ORF 94, Santa Catarina, México, Nicarágua, Honduras e Panamá têm mais de nove repetições, enquanto a Bahia e os EUA têm menos de nove repetições. Esta similaridade pode estar relacionada a uma similaridade em virulência. Aparentemente, os WSSVs encontrados na Bahia e em Santa Catarina originaram-se de diferentes fontes de contaminação ou o vírus sofreu mutações ao longo do tempo. mRNA foi extraído das brânquias de camarões infectados e não-infectados com o WSSV, reversamente transcrito e uma hibridização subtrativa (SSH) foi realizada. A Biblioteca 1 (genes induzidos) tem 300 clones dos quais foram formados 36 contigs e 36 singlets. Destas seqüências, 69 (88,4%) são similares a seqüências no GeneBank. Na Biblioteca 2 (genes reprimidos), de 403 clones, foram formados 23 contigs e 36 singlets e 40 (75,5%) são similares a seqüências conhecidas. Estes genes foram organizados em grupos, de acordo com a sua função. Dentre os genes induzidos há genes envolvidos na síntese de ATP, citoesqueleto, adesão celular, metabolismo e transporte de moléculas. Dentre os genes reprimidos, há genes envolvidos na defesa contra bactérias, transdução de sinal e biossíntese de ácidos nucléicos. A infecção pelo WSSV parece alterar várias rotas metabólicas diferentes. / White Spot Syndrome Virus (WSSV) is a disease that affects several species of crustaceans, causing high mortality rates, which has been causing great economical losses in shrimp farming regions. The aims of this study were to standardize the Real Time PCR methodology for WSSV detection, to genotype geographical isolates of the virus and to isolate differentially expressed genes in farmed shrimps infected with WSSV. Samples positives and negatives by nested PCR were analyzed by Real Time PCR. The viral load of the samples was determined and some samples negative by nested PCR were positive by Real Time PCR, with low viral load. The pattern of three minisatellite regions, the presence of a deletion and a transposase were compared in virus isolated from shrimp collected in Santa Catarina and Bahia. All Santa Catarina samples had the same pattern for the minisatellites analyzed. Bahia samples showed a different pattern for the loci, indicating that there are two different ORF 23/24 and do not have a transposase sequence. The repeat number pattern for the three minisatellite analyzed was different between the Brazilian isolates and isolates from America#s countries. However, when analyzing only ORF 94, South Brazil, Mexico, Nicaragua, Honduras and Panama have all more than nine repeats, while Northeast Brazil and USA samples have less than nine repeats. This similarity of repeats could be related to a similarity in virulence. Our results show that WSSV found in Bahia and Santa Catarina States have originated from different sources of contamination or the virus have undergone mutations during time. mRNA was extracted from gills of shrimps infected and non-infected with WSSV, reverse transcribed and a suppression subtractive hybridization (SSH) was performed. Library 1 (induced genes) has 300 clones, which formed 36 contigs and 36 singlets. Of these sequences, 69 (88,4%) are similar to sequences in GeneBank. Library 2 (repressed genes), has 403 clones, which formed 23 contigs and 36 singlets, and 40 sequences (75,5%) are similar to known sequences. These genes were organized in groups, according to their functions. Among the induced genes there are genes involved in ATP synthesis, cytoskeleton, cell adhesion, metabolism and molecule transport. Among the repressed genes, there are genes involved in antibacterial defence, signal transduction and nucleic acids biosynthesis. WSSV infection seems to alter several metabolic routes.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aquicultura, Florianópolis, 2010 / Made available in DSpace on 2012-10-25T00:48:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 279589.pdf: 892949 bytes, checksum: cbd88e9c44bb9ea284c521be963e43dc (MD5) / Este estudo teve como objetivo principal selecionar individualmente por Nested-PCR reprodutores de L. vannamei livres de WSSV e de IHHNV e a partir destes produzir pós-larvas livres destes patógenos virais por meio da prevenção da sua transmissão vertical. A partir de 2.650 camarões, foram selecionados fenotipicamente 1.600, destes 800 machos e 800 fêmeas. Os camarões foram marcados individualmente com anel numerado (487 fêmeas e 231 machos). As análises por Nested-PCR mostraram que 307 fêmeas (63%) e 127 machos (55%) estavam infectados com IHHNV. Os animais livres de IHHNV foram analisados para WSSV, os animais livres dos dois vírus, foram destinados a reprodução. As pós-larvas produzidas foram estocadas em 9 tanques berçário,para análise. Das 45 replicas analisadas apenas 2 estavam positivas para IHHNV e nenhuma positiva para WSSV, e os animais foram encaminhados posteriormente para fazendas. Ainda foi realizada uma análise comparativa em viveiros de engorda entre pós-larvas livres, produzidas localmente e pós-larvas do Nordeste provenientes da região de Canguaretama (RN) Os juvenis analisados, de pós-larvas locais, em fazenda apresentaram 1,25% de WSSV e IHHNV em 80 animais examinados. Por outro lado, as análises de juvenis do Nordeste revelaram que 10% dos examinados estavam infectados com WSSV e IHHNV. Além de juvenis de L. vannamei, foram examinados caranguejos (Chasmagnathus granulata), aplísias (Aplysia brasiliana) e siris (Callinectes sapidus) sendo 50% das aplísias e 67% dos siris infectados por WSSV. A comparação de sobrevivências em 3 fazendas mostrou sobrevivência média de 55% para pós-larvas locais contra 23,4% e para pós-larvas do Nordeste.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aquicultura, Florianópolis, 2010 / Made available in DSpace on 2012-10-25T11:58:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 281559.pdf: 724745 bytes, checksum: 0263af8e3fa1aa4b1340292bd1b2db90 (MD5) / A proteção antiviral específica contra o vírus da síndrome da mancha branca (WSSV) induzida via RNA de interferência (RNAi) e sua influência na expressão de alguns genes imunológicos foram avaliados em Litopenaeus vannamei. Os animais foram injetados com dsRNA de sequência específica (vp28 do envelope viral), e posteriormente desafiados com o WSSV. Camarões tratados com dsRNA vp28 tiveram a infecção viral limitada, uma alta taxa de sobrevivência (73%) e ausência do vírus em 80% dos sobreviventes, confirmando a ativação do mecanismo antiviral específico via RNAi. Animais desafiados e não tratados com dsRNA vp28 tiveram uma queda significativa no hemograma (85%) e depleção gênica da argonauta, caspase-3, fator antilipopolissacarídeo (ALF), pró-fenoloxidase (proPO) e transglutaminase (TGase). Uma superexpressão gênica da proteína que reconhece LPS e ?-1,3-glicanas (LGBP) e do inibidor de proteases ?2-macroglobulina (?2M) foi verificada nesses animais, indicando o envolvimento destas proteínas na fase aguda da infecção por WSSV. O tratamento com dsRNA vp28 limitou a infecção e restabeleceu as condições imunológicas gerais dos animais através do aumento do hemograma e da modulação positiva dos genes argonauta, ALF, proPO e TGase, sugerindo a participação destas proteínas na defesa do organismo contra o WSSV. Os resultados deste estudo apontam para uma potencial utilização do dsRNA vp28 como agente terapêutico anti-WSSV e confirmam que a técnica de RNAi é uma abordagem preventiva promissora e efetiva para o controle das viroses de crustáceos.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Aquicultura. / Made available in DSpace on 2012-10-24T00:18:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 262533.pdf: 987968 bytes, checksum: 513ec97a854807d0eadaec8588845db4 (MD5)

Submitted by Pós graduação Engenharia Civil (ppec@ufba.br) on 2017-08-11T17:53:53Z No. of bitstreams: 1 _DISSERTACAO_SANTIAGO_APENDICES_FINAL.pdf: 14347630 bytes, checksum: 0679653add68682948963ed2dbd27231 (MD5) / Approved for entry into archive by Vanessa Reis (vanessa.jamile@ufba.br) on 2017-08-18T15:26:29Z (GMT) No. of bitstreams: 1 _DISSERTACAO_SANTIAGO_APENDICES_FINAL.pdf: 14347630 bytes, checksum: 0679653add68682948963ed2dbd27231 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-18T15:26:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 _DISSERTACAO_SANTIAGO_APENDICES_FINAL.pdf: 14347630 bytes, checksum: 0679653add68682948963ed2dbd27231 (MD5) / no Rio Saracura-Ba foi balizada na comparação entre as alturas do nível d’água medidas em campo e as simuladas, os resultados mostram que a variação em área assemelha-se a uma progressão aritmética, alternando em média 4.000m² com a modificação do coeficiente; para uma vazão de 183,61 (m3/s) a maior diferença em área chega a 17.382,35 m². A maior diferença na área encontrada na mancha de inundação utilizando o MDT-SRTM e o MDT-GNSS na modelagem hidráulica foi 16.347,75m² (19,11%), já utilizando o MDT-VANT e o MDT-GNSS foi 13.706,61m² (24,70%). A simulação da mancha de inundação ocorrida em 2013 com dados de posicionamento GNSS (mais precisa) quando comparada com a área da poligonal gerada pela equipe da UFBA através da interpolação dos pontos coletados em campo, apresenta diferença em área de valores que chegam a 22.694,25m² (22,08%) e em perímetro 75.84m (2.90%). Apesar do canal não ter sido apresentado com detalhamento de projeto, é possível observar que o mesmo não comporta a vazão de cheia do tempo de recorrência estudado, mostrando-se insuficiente para confinar o escoamento em sua calha, assim como, existem trechos do canal que não estão localizados no ponto de altitude mais baixa. Constata-se que atualmente ainda há residências em áreas de risco com a necessidade de serem relocadas. / O Brasil encontra-se entre os países do mundo mais atingidos por inundações e enchentes. Com o intuito de priorizar a redução dos riscos de desastres naturais, existe a necessidade de reorientar os esforços sobre o desenvolvimento de estratégias e ações para a redução do risco hidrológico investindo na evolução tecnológica com o intuito de aumentar a resiliência das comunidades mais susceptíveis ao risco. A pesquisa concentra seu estudo no canal do Rio Saracura onde a cidade de Lajedinho está localizada, esta, que em dezembro de 2013 foi atingida por uma inundação, onde as margens do rio foram ocupadas, ocasionando a destruição de casas e equipamentos urbanos, causando irreparáveis danos sociais, econômicos e naturais, assim como, dezessete vítimas fatais. A proposta deste trabalho baseia-se na utilização e análise dos Modelos Digitais de Terreno (MDT) derivados de imagens SRTM, de levantamento GNSS e por imageamento com Veículo Aéreo não Tripulado (VANT) aplicado a uma modelagem hidráulica para definição de áreas de risco de inundação. O escoamento no canal do rio Saracura foi modelado utilizando a equação da Energia, considerando o fluxo unidimensional e o regime permanente implementado no software HEC-RAS 5.0.3. Realizou-se a simulação da mancha de inundação da cheia de dezembro de 2013 observada em Lajedinho-Ba, comparando com dados de relatórios da época. Foram realizadas comparações entre as manchas de inundação geradas por MDT obtido por diferentes métodos de aquisição referentes às vazões máximas associadas aos períodos de retorno de 100, 300, 650, 1000 anos. A análise das discrepâncias das coordenadas do MDT-GNSS e MDT-SRTM atingiram resultados melhores que os esperados nesta pesquisa, a média das discrepâncias analisadas foi de 2.60m sendo menores que as discrepâncias utilizando o MDT-VANT de 4.12m. A calibração do coeficiente de Manning (n)

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-04-26T17:14:04Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1563780 bytes, checksum: 6d7bfb0f3753694df6bc43773053fdf8 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-26T17:14:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1563780 bytes, checksum: 6d7bfb0f3753694df6bc43773053fdf8 (MD5) Previous issue date: 2003-11-06 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Estudou-se a etiologia da mancha bacteriana do eucalipto a partir de amostras de folhas de plantas, coletadas em condições de viveiro e campo nos Estados do Rio Grande do Sul, São Paulo, Minas Gerais, Bahia, Mato Grosso do Sul, Amapá e Pará. Os sintomas da doença são caracterizados por anasarca, lesões internervurais no limbo, perfurações no centro das lesões, lesões no pecíolo e nos ramos, concentração de lesões ao longo da nervura principal e lesões lineares nas bordas e no ápice da folha. Identificaram-se vinte e cinco isolados incitadores de reação de hipersensibilidade (HR) em plantas não-hospedeiras e patogênicos a Eucalyptus spp., quando inoculados nas folhas por injeção. Baseado em testes bioquímicos, utilização de fontes de carbono (MicroLog BIOLOG), análise filogenética de rDNA16S e perfil de ácidos graxos, identificaram-se dez isolados de Xanthomonas axonopodis, quatro de X. campestris, quatro de Pseudomonas syringae, dois de Pseudomonas putida, dois de Pseudomonas cichorii, dois de Rhizobium sp. e um de Erwinia sp. Apenas os isolados de P. syringae e Erwinia sp. não foram patogênicos a Eucalyptus spp. quando inoculados, por atomização de suspensão de inóculo (10 8 ufc/mL), em mudas. Tendo em vista a maior freqüência de isolados de X. axonopodis, avaliou-se sua gama de hospedeiros por meio de inoculações por atomização de inóculo (10 8 ufc/mL) em mudas de espécies ou clones pertencentes às seguintes famílias botânicas: Myrtaceae (Corymbia maculata, Eugenia jambolana, E. camaldulensis, E. cloeziana, E. grandis, E. robusta, E. saligna, E. urophylla, E. urophylla x E. maidenii, E. globulus, Myrciaria jaboticaba e Psidium guajava), Caricaceae (Carica papaya), Fabaceae (Phaseolus vulgaris e Pisum sativum), Rosaceae (Prunus persicae), Rutaceae (Citrus limon) e Solanaceae (Lycopersicon esculentum). Apenas as plantas da família Myrtaceae foram suscetíveis, e dentre essas, apenas espécies de Corymbia e Eucalyptus apresentaram sintomas. A freqüência de plantas com sintomas variou com a espécie, sendo que E. cloeziana e o clone de E. urophylla x E. maidenii foram os materiais mais suscetíveis. Para embasar a quantificação da doença em eucalipto, desenvolveu-se uma escala diagramática contendo oito níveis de severidade. Na validação da escala por três grupos de avaliadores inexperientes, concluiu-se que não houve acurácia nas estimativas com ou sem a escala, mas houve tendência de maior precisão para avaliadores com a escala sem treinamento prévio. / The etiology of Eucalyptus bacterial leaf blight was studied on plants in nurseries and plantations in the states of Rio Grande do Sul, São Paulo, Minas Gerais, Bahia, Mato Grosso do Sul, Amapá and Pará. The disease is characterized by water soaked, angular and interveinal spots on the leaf limb followed by shot holes and lesions in petioles and branches. The lesions can be found along the main vein, at the leave edge and at the upper portion of the limb. Of the several isolates obtained during isolations, 25 induced hypersensitive reaction in non-host plants, and were pathogenic to Eucalyptus spp.. Identification of these isolates by biochemical tests using carbon sources (MicroLog BIOLOG), filogenetic analysis of rDNA16S and FAME profile, revealed that 10 isolates belonged to Xanthomonas axonopodis, four each to X. campestris and Pseudomonas syringae, two each to P. putida, P. cichorii, and Rhizobium sp., and one to Erwinia sp.. When the Eucalyptus seedlings were inoculated by spraying the bacterial suspension (10 8 ufc/ml) of any isolate, only P. syringae e Erwinia sp. did not produce typical disease symptoms. Because of the higher frequency of X. axonopodis isolates, it was evaluated for its host range. Plants from the botanical families Myrtaceae (Corymbia maculata, Eugenia jambolana, E. camaldulensis, E. cloeziana, E. grandis, E. robusta, E. saligna, E. urophylla, E. urophylla x E. maidenii, E. globulus, Myrciaria jaboticaba and Psidium guajava), Caricaceae (Carica papaya), Fabaceae (Phaseolus vulgaris and Pisum sativum), Rosaceae (Prunus persicae), Rutaceae (Citrus limon) and Solanaceae (Lycopersicon esculentum) were spray inoculated with the bacterial suspension (10 8 ufc/ml). Only plants of Myrtaceae family showed susceptibility, but the symptoms developed only seedlings of Eucalyptus and Corymbia. The frequency of symptomatic plants varied among the species with E. urophylla x E. maidenii clones and E. cloeziana being the more susceptible hosts. A diagrammatic scale of eight disease severity levels was developed for disease quantification on eucalyptus leaves. The validation of the scale by three groups of inexperienced evaluators showed that although there was no accuracy in disease estimation with or without the scale, the group of untrained evaluators using the scale had higher precision. / Tese importada do Alexandria

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-02T14:11:46Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1066933 bytes, checksum: dd7d7c73c5b9ed09f2f70bc684d1ff87 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T14:11:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1066933 bytes, checksum: dd7d7c73c5b9ed09f2f70bc684d1ff87 (MD5) Previous issue date: 2004-02-05 / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais / A mancha-angular do feijoeiro comum, causada pelo fungo Phaeoisariopsis griseola, encontra-se distribuída em todas as regiões do mundo onde se cultiva esta leguminosa. No Brasil, apresenta distribuição generalizada e ocorrência freqüente, afetando, com maior ou menor intensidade, todos os cultivares recomendados para plantio. As perdas no rendimento são maiores quanto mais precoce for o aparecimento da doença. As perdas podem variar de 7 a 70%, dependendo da suscetibilidade dos cultivares. O cultivar Jalo EEP 558, freqüentemente citado como resistente a esta enfermidade, foi caracterizado no capítulo I deste trabalho. Este cultivar mostrou-se moderadamente resistente a oito de doze isolados de P. griseola testados, apresentando poucas pústulas de pequeno tamanho, típicas de resistência quantitativa. Contudo, uma vez que Jalo EEP 558 é de origem andina e freqüentemente estes cultivares são incompatíveis em cruzamento com cultivares mesoamericanos, foram estudadas nos capítulos II e III alternativas para a transferência destes genes de resistência andinos para cultivares mesoamericanos, que são de maior interesse no mercado consumidor brasileiro. No capítulo II, foi testado o cultivar Milionário como ponte no cruzamento entre Jalo EEP 558 e o cultivar Rudá (grão carioca e origem mesoamericana). Milionário já havia sido citado como ponte em outros trabalhos, no entanto, os resultados aqui obtidos demonstraram que este cultivar não foi eficiente como ponte, apresentando incompatibilidade quando cruzado com Jalo EEP 558. Sendo assim, no capítulo III foram investigados cultivares alternativos a serem utilizados como ponte, no cruzamento entre Jalo EEP 558 e Rudá. Pela avaliação dos híbridos resultantes, os cultivares andinos Diacol Calima, AND 277 e Novo Jalo apresentaram plantas normais em cruzamento com o cultivar Rudá, o mesmo foi observado para os cultivares mesoamericanos CNF10, CNF261, Small White, KW765 e KW780 em cruzamento com cultivar Jalo EEP 558. Entretanto, o modelo atualmente aceito para explicar a herança da incompatibilidade não foi adequado para justificar os dados deste trabalho. Desta forma um novo modelo foi proposto com a presença de um terceiro gene de incompatibilidade. No último capítulo deste trabalho, foi investigada a herança quantitativa da resistência do cultivar Jalo EEP 558 à mancha-angular. Locos de herança quantitativa (QTL) foram identificados e mapeados. Marcadores moleculares ligados a genes de resistência à ferrugem e antracnose também foram mapeados e mostraram uma organização em “cluster”. Estes dados geram importantes implicações que devem ser consideradas em programas de melhoramento de feijoeiro que visam à obtenção de cultivares com resistência múltipla. O último capítulo deste trabalho foi submetido à revista Euphytica, portanto encontra-se formatado para tal. / Common bean angular leaf spot (ALS), caused by the fungus Phaeoisariopsis griseola, is distributed in all bean growing regions of the world. In Brazil, it is widely distributed affecting all cultivars presently recommended for cultivation. Yield losses are greater if the symptoms appear early during the growing season. They can range from 7 to 70% depending on the susceptibility of the cultivars used. Jalo EEP 558, frequently cited as resistant to ALS was evaluated. It was moderately resistant to eight out of 12 P. griseola isolates tested, presenting few and small sized pustules which characterize quantitative resistance. However, Jalo EEP 558 is an andean cultivar and these cultivars are often incompatible with those of mesoamerican origin. ‘Milionário’ was tested as a bridge cultivar in the cross between ‘Jalo EEP 558’ and ‘Rudá’ (mesoamerican with carioca type grain). ‘Milionário’ had already been mentioned as an effective bridge cultivar in other studies, however, our results demonstrate that this cultivar was not effective for the cross we tested. It presented incompatibility in the cross with Jalo EEP 558. Other cultivars were also tested as bridge cultivars. Andean cultivars Diacol Calima, AND 277 and Novo Jalo produced normal plants in crosses with ‘Rudá’. The same was observed for crosses involving mesoamerican cultivars CNF10, CNF261, Small xiiWhite, KW765 and KW780, and andean cultivar Jalo EEP 558. However, the present model proposed to explain the inheritance of incompatibility in crosses between andean and mesoamerican cultivars was not adequate to justify the results in our work. For this reason, we propose a new model involving a third incompatibility gene. In this work, we investigated the quantitative inheritance of ALS resistance present in ‘Jalo EEP 558’. Quantitative trait loci (QTLs) were identified and mapped. Molecular markers linked to resistance genes for rust and anthracnose were also mapped. The data showed that the disease resistance genes were organized in clusters. Our results have important implications and should be considered in bean breeding programs aimed to develop cultivars with multiple disease resistance.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-10-13T16:56:04Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2314447 bytes, checksum: b6cee64fefe5a8dfb721b036640f5309 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-13T16:56:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2314447 bytes, checksum: b6cee64fefe5a8dfb721b036640f5309 (MD5) Previous issue date: 2004-02-20 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Lantana camara L. é conhecida mundialmente como uma planta daninha extremamente agressiva. Originária da América tropical e subtropical, sua dispersão pelo mundo é devido, principalmente, a sua utilização como planta ornamental. A distribuição pantropical desta invasora e sua reconhecida nocividade estimularam a busca por inimigos naturais no seu centro de origem. Estudos da micobiota associada a L. camara L. revelaram a presença de Corynespora cassiicola f. sp. lantanae como um patógeno severo desta planta, o qual é capaz de provocar desfolhas e debilitação das plantas atacadas. Estudos anteriores indicaram a presença de uma fitotoxina envolvida na patogenicidade do fungo. Com o objetivo de isolar, identificar e testar a atividade fitotóxica de compostos produzidos pelo fungo foram feitos estudos fitoquímicos dos extratos obtidos a partir de grãos de arroz colonizados pelo fungo. A interação hospedeiro-patógeno foi investigada por observações feitas com microscopia de luz e eletrônica de varredura. Os testes biológicos dos extratos do fungo C. cassiicola isolado do tomateiro, revelaram fitotoxidez que foi atribuída à presença de ácidos graxos e do esteróide isolado, ergostatetra4,6,8(14),22-en-3-ona, nas frações estudadas. Os extratos, ao serem submetidos a ensaios biológicos, apresentaram atividades fitotóxicas em teste preliminares de inibição do desenvolvimento radicular de alface; germinação, crescimento de parte aérea e crescimento de raízes de espécies de plantas daninhas e plantas cultivadas; e sobre a síntese de ATP. O extrato CE também mostrou conter substâncias tóxicas, em teste de inibição do desenvolvimento radicular de alface e síntese de ATP. Este estudo foi uma investigação para o entendimento da interação C. cassiicola/L. camara L. Não foram observadas alterações estruturais, após a aplicação do filtrado sem conídios e da emulsão preparada a partir do extrato CAE. O surgimento de necrose foi verificado, após 24 horas da inoculação, com a suspensão de conídios e a via de penetração preferencial do fungo é intercelular. Outros sítios de penetração do fungo observadas foram: pelo complexo estomático, entre a lateral da célula-guarda e a célula epidérmica subsidiária, através do complexo epidérmico, o qual inclui a penetração através do tricoma (glandular ou tector). A planta demonstrou reação de hipersensibilidade ao patógeno através de espessamento das paredes da epiderme, granulação do citoplasma e formação de um tecido de cicatrização. A epiderme da face abaxial e o parênquima lacunoso foram os tecidos mais afetados. As células dos tecidos onde se observou a presença de hifas sofreram desorganização, algumas apresentaram hiperplasia, outras se tornaram amorfas e plasmolizadas. Observou-se a formação de almofadas apressoriais. Os testes histoquímicos para lipídeos, proteínas e compostos fenólicos não revelaram diferenças entre fragmentos foliares referentes ao controle e ao tratamento. / Lantana camara L. is known worldwide as an extremely aggressive weed. Originated from tropical and subtropical America, its global dispersion is mainly due to its use as an ornamental plant. Its pantropical distribution and recognized harmfulness have stimulated the search for natural enemies in its center of origin. Studies on the micobiota associated to L. camara L. have revealed the presence of Corynespora cassiicola f. sp. lantanae as a severe pathogen of this plant, capable of causing severe defoliation and weakening of the attacked plants. Previous studies indicated the presence of a phytotoxin involved in the pathogenicity of the fungus. Aiming to isolate, identify and test the phytotoxic activity of compounds produced by the fungus, phytochemical studies were carried out of the extracts obtained from rice grains colonized by the fungus. The host-pathogen interaction was investigated through observations made under light and scanning electronic microscopy. The biological tests of the extracts of the fungus C. cassiicola isolated from tomato revealed phytotoxicity which was attributed to the presence of fatty acids and the isolated steroid, ergosta-4,6,8(14),22-tetraen-3-ona in the fractions studied. When submitted to biological assays, the extracts presented phytotoxic activities in preliminary tests on lettuce root development inhibition; germination, aerial part growth and root growth of weeds and cultivated plant species as well as on ATP synthesis. The CE extract was also found to contain toxic substances that inhibited lettuce root development and ATP synthesis. This study aimed to investigate and understand C. cassiicola/L. camara L. interaction. No structural alterations were observed after application of the filtrate without conidia and the emulsion prepared from the extract CAE. Necrosis was verified after 24 hours of inoculation, following the suspension of conidia, with the preferable penetration channel of the fungus being intercellular. Other sites were fungus penetration ocurred were: the stomata complex, between the guard cell lateral and the subsidiary epidermis cell, the epidermis complex, which includes penetration through the trichome (glandular or non-glandular). The plant showed a hipersensitivity reaction to the pathogen through thickening of the epidermis walls, cytoplasm granulation and formation of a cicatrization tissue. The abaxial face epidermis and the lacunary parenthema were the most affected tissues. The tissue cells where the presence of hyphae was observed underwent disorganization, with some presenting hiperplasia and others becoming amorphous and plasmolysed. The formation of appressorial pads was also observed. The histochemical tests for lipids, proteins, and phenolic compounds did not reveal differences among the foliar fragments related to the control and treatment. / Dissertação importada do Alexandria

Com o objetivo de verificar a ocorrência de bactérias fitopatogênicas em plantas de arroz, bactérias fluorescentes (Bf1, Bf2, Bf3) foram isoladas de sementes em meio B de King semi-seletivo. Os isolados que induziram reação de hipersensibilidade em fume foram inoculados em arroz. Nas folhas e colmos de arroz, os isolados induziram lesões necróticas, de coloraçao cinza, alongadas, com bordas de cor castanha-escura. O efeito destes isolados bacterianos em plantas de sete cultivares de arroz foi testado através da inoculação de colmos e folhas, 21 dias apos a emergência, em casa-de-vegetação. Independente da cultivar ou do ponto da inoculação, todos os isolados induziram a formação de lesões. Baseado no comprimento de lesão e percentagem de plantas com sintomas, o isolado Bf1 foi considerado o mais virulento. Não houve diferença nas reações entre as cultivares. A campo, oito cultivares de arroz foram semeadas em outubro e dezembro de 1992. A inoculação do colma com suspensão bacteriana (isolado Bf1) aumentou espiguetas estéreis e manchas nas glumas, reduziu poder germinativo, peso de mil sementes e numero de grãos inteiros. Plantas das cultivares BR-IRGA 414 e El Paso 144 apresentaram maior grau de manchamento das glumas do que as plantas das cultivares El Paso 48 e Bluebelle, quando colhidas das parcelas semeadas em outubro. / In order to verify the occurrence of phytopathogenic bacteria in rice plants, fluorescent bacteria (Bf1, Bf2, Bf3) were isolated from seeds in semiselective King'B medium. Isolates that induced tobacco hypersensitivity reaction were inoculated in rice. In rice leaves and stems, the isolates caused elongated gray blotches and necrosis lesions sourrounded by an brownish-black border. The effect of this bacterial isolates in plants of seven rice cultivars was tested through the stems and leaves inoculation, 21 days after the emergence, in greenhouse. Regardless of cultivar or inoculation site, all isolates induced lesions formation. Based on lesion lenght and percentage of plants with symptoms, the isolate Bfl was considered the most virulent. No differences of reaction were found among cultivars. In the field, eight rice cuI ti vars were sowed in October and December, 1992. Stem inoculation with bacterial suspension (isolate Bf1) increased sterile spike lets and blotch on the glumes, decreased seed viability, lOOO-seed weight and number of whole grains. Plants of the cultivars BR-IRGA 414 and El Paso 144 showed higher blotching grade of glumes than plants of the cultivars El Paso 48 and Bluebelle, when harvested from plots sowed in October.

A citricultura está entre as principais atividades agrícolas do Brasil e do Rio Grande do Sul. Porém, diversos problemas fitossanitários acometem os cultivos sendo que a mancha ou pinta preta dos citros (Phyllosticta citricarpa) é uma das doenças fúngicas que tem causado preocupação e tem sido responsável pelo aumento do custo de produção. O fungo pode infectar os frutos ainda na fase inicial de desenvolvimento e os sintomas aparecem durante a maturação quando a casca muda de cor ou ainda podem manifestar-se em pós-colheita, geralmente na face exposta ao sol e ficam restritos ao flavedo comprometendo a aparência dos frutos e a sua comercialização para o mercado in natura. Assim, os objetivos desse trabalho foram caracterizar o início e progresso da doença nas tangerinas no RS e estudar a aplicação de películas fotoprotetoras e o uso de revestimentos comestíveis como formas alternativas para reduzir os sintomas de mancha preta dos citros em pós-colheita de tangerinas. Realizou-se um estudo nas condições da Depressão Central do Rio Grande do Sul, através da exposição de tangerinas em diferentes períodos durante dois ciclos para determinar períodos favoráveis à infecção. Películas fotoprotetoras à base de emulsão de cera de carnaúba ou com a adição de óxido de zinco (ZnO) e dióxido de titânio (TiO2) foram avaliadas em três experimentos. Em pós-colheita, foram testados revestimentos comestíveis à base de quitosana ou emulsão de carnaúba e, também, com a adição de sais com ação antimicrobiana: bicarbonato de sódio e metassilicato de sódio, em tangerinas ‘Caí’, ‘Rainha’ e ‘Montenegrina’. Do estudo observacional conclui-se que não houve correlação entre a incidência da doença e a precipitação e temperatura e os frutos foram suscetíveis à infecção durante todo o seu desenvolvimento. Constatou-se que a aplicação de películas fotoprotetoras à base cera de carnaúba a 20% em tangerinas pode reduzir a incidência de mancha preta dos citros nas cvs. Montenegrina e Rainha, mas a adição de TiO2 pode causar danos à casca de frutos e redução da atividade fotossintética. Assim, será necessário aprimorar as formulações e uso desses produtos para viabilizar essa técnica em diferentes cultivares. O uso de revestimentos comestíveis inibiu o aparecimento de lesões em pós-colheita de tangerinas ‘Caí’, porém não teve o mesmo efeito em ‘Rainha’ e ‘Montenegrina’. Indicando que é importante integrar essa prática a outras medidas de controle. / The citrus industry is an eminent agribusiness in Brazil and in the state of Rio Grande do Sul. Yet, several phytosanitary problems affect the groves and citrus black spot (Phyllosticta citricarpa) is a disease that causes concern and is responsible for raising production costs. The fungus is capable to infect the fruit in the early stages of development, though symptoms may appear during ripening when peel color starts to change or only after harvest along handling procedures. The lesions befall the fruit peel, most commonly, at the sun-exposed side but are restricted to the flavedo compromising fruit appearance and, thus, rendering the fruit unattractive for fresh consumption markets. Therefore, the objectives of the present work were to characterize the starting point and the evolution of infection and to evaluate the application of photoprotective films and the use of edible coatings as alternatives to reduce the after harvest incidence of citrus black spot symptoms on tangerines. Under the conditions of the Depressão Central in the state of Rio Grande do Sul were conducted field studies along two harvesting seasons to settle on most likely disease infection periods. Field applications of photoprotective films based on carnauba wax emulsions complemented with zinc oxide (ZnO) or titanium dioxide (TiO2) were evaluated in three experiments. In the postharvest trials, the application of edible coatings based on chitosan or carnauba wax emulsion complemented with antimicrobial salts such as sodium bicarbonate or sodium metassilicate were evaluated on fruits of the cultivars Caí, Rainha and Montenegrina. From the observational study, it was possible to conclude that the prevailing period of P. citricarpa infection is during physiological small fruit drop, but there was no correlation with the temperature and precipitation. The application of photoprotective films may reduce the incidence of citrus black spot symptoms, however, when titanium dioxide is added to the spray solution a reduction in photosynthetic activity of the plants was determined and fruit evidenced peel damages. Therefore, it is imperative to improve the formulations and its use headed to the usefulness of the application to different cultivars. The postharvest application of edible coatings inhibited the appearance of citrus black spot symptoms on cv. Caí fruit, but did not have the same effect on ´Rainha´ and ´Montenegrina´ fruit indicating that is important to integrate that technique with other control practices.