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Estudo microanatômico e bioquímico de ovários de Farfantepenaeus paulensis (Pérez FarfanteNazari, Evelise Maria January 2000 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Aquicultura / Made available in DSpace on 2012-10-17T15:55:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Os aspectos microanatômicos e bioquímicos do processo de maturação de Farfantepenaeus paulensis, foram caracterizadas nos ovários e plasma de 48 fêmeas ablacionadas. Para os estudos microanatômicos, os ovários foram fixados e submetidos aos procedimentos básicos para microscopia óptica, sendo posteriormente realizada a análise estereológica e a determinação do diâmetro das células germinativas, para a descrição dos estágios de maturação ovariana. A caracterização bioquímica desses estágios foi feita através de técnicas de imunohistoquímica de cortes histológicos de ovários e de western blots de proteínas ovarianas e plasmáticas. Os ovários foram classificados em cinco estágios de maturação, baseados na proliferação das ovogônias, no crescimento e o acúmulo de vitelo nos ovócitos, bem como as variações no número de células germinativas e somáticas durante a maturação. Técnicas imunohistoquímicas revelaram a presença de vitelina, principalmente a partir do estágio de maturação inicial. Foi detectada a presença de uma proteína reativa ao anticorpo anti-vitelina, de 87 kDa, supostamente a vitelogenina, no plasma das fêmeas em todos os estágios de maturação ovariana, enquanto nos ovários encontra-se vitelina (25, 75 e 105 kDa). A maturação ovariana de F. paulensis, pode ser definida como um processo cíclico, onde são evidenciadas mudanças estruturais e bioquímicas dos ovários.
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Avaliação de parâmetros hemato-imunológicos, em fêmeas abladas de camarão Litopenaeus vannamei, em associação a uma dieta com diferentes superdosagens de ácido ascórbicoMaggioni, Daniela Gonçalves Soares January 2002 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Aqüicultura. / Made available in DSpace on 2012-10-19T13:34:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1
196096.pdf: 2813523 bytes, checksum: abc29ba321120a59cff4652c44a266b1 (MD5) / O objetivo do presente trabalho foi o de avaliar alguns parâmetros hemato-imunológicos em fêmeas reprodutoras da espécie de camarão Litopenaeus vannamei, submetidas ao processo de ablação unilateral e cuja dieta foi suplementada com superdosagens de vitamina C, como forma de imunoestimulação. Os parâmetros analisados foram: contagem total de hemócitos (THC), concentração de proteínas plasmáticas, níveis de glicose e lactato, atividade aglutinante e atividade da enzima fenoloxidase. As fêmeas foram analisadas no dia anterior à ablação e nos dias 1, 3, 7 e 14 após à ablação. A suplementação com superdosagens de vitamina C foi oferecida às fêmeas (1x ao dia) juntamente com alimento fresco, durante duas semanas antes e duas semanas após a ablação, sob a forma de ácido ascórbico polifosfatado (ApP). As fêmeas foram divididas em um grupo controle (NS), não suplementado com superdosagens de ApP (200 mg/kg = dose recomendada) e dois grupos (S1 e S2) suplementados com doses de 10 e 20 vezes maiores que a dose recomendada, respectivamente. Surpreendentemente, a grande maioria dos parâmetros hemato-imunológicos analisados não mostrou alteração estatisticamente significativa no grupo NS. Houve apenas uma redução significativa do título aglutinante do soro no terceiro dia subseqüente à ablação. As fêmeas suplementadas com superdosagens de vitamina C (S1 e S2) também não apresentaram alterações significativas na maioria dos parâmetros analisados, com exceção do título aglutinante e dos níveis de glicose da hemolinfa. Não houve declínio da atividade aglutinante nos grupos S1 e S2 no terceiro dia da ablação como verificado no grupo NS, sugerindo talvez uma eventual imunoestimulação pela vitamina C. Por outro lado, os grupos S1 e S2 mostraram uma hipoglicemia no primeiro dia após ablação. Esta hipoglicemia decorreu provavelmente de uma diminuição transitória dos níveis do hormônio hiperglicemiante como conseqüência do processo da ablação peduncular que remove o complexo glândula do seio - órgão X, responsável pela produção e liberação desse hormônio, entre outros. A ausência de alterações significativas nos parâmetros hemato-imunológicos analisados parece sugerir a ocorrência de um mecanismo compensatório desencadeado pelo pedúnculo ocular não ablado, uma vez que a apedunculação foi apenas unilateral. Pode-se ainda especular que os parâmetros hemato-imunológicos selecionados para este estudo não sejam os mais favoráveis para avaliar esta condição de estresse ou ainda que o L. vannamei seja efetivamente uma espécie muito resistente capaz de manter sua homeostase, mesmo quando submetida a um estresse fisiológico severo.
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Efeito da adição do probiótico sobre a digestibilidade aparente da proteina, energia e matéria seca em ração comercial para Litopenaeus vannameiBuglione Neto, Celso Carlos 24 October 2012 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-graduação em Aquicultura, Florianópolis, 2009 / Made available in DSpace on 2012-10-24T18:32:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1
270042.pdf: 658219 bytes, checksum: d763c19d4ea302f82a4d07bfbbc6a684 (MD5) / O cultivo de camarão requer o fornecimento de nutrientes através da suplementação de dietas balanceadas. A otimização nutricional é importante por razões biológicas, ambientais, sanitárias e econômicas, sendo necessária para o desenvolvimento de uma aqüicultura sustentável. Este projeto pretendeu avaliar se, o uso de uma ração comercial, suplementada com um bactéria ácido lática L. plantarum isoladas de camarões, melhorou o coeficiente de digestibilidade aparente de proteína (CDAPB) e energia (CDAE) aumentando seu valor nutricional. Para avaliação do CDAPB e CDAE, foi utilizado um marcador inerte (0,5% Cr2O3), sendo quantificados os teores de proteína e energia na ração e nas fezes dos animais alimentados com as rações suplementadas com BAL. Para a determinação do CDAPB e CDAE foram inicialmente testados dois sistemas de coleta de fezes: sistema de coleta por decantação (SCD) e sistema de coleta por sifonamento (SCS) e comparados com a coleta de fezes por dissecação (DISS). Para a determinação in vivo do coeficiente de digestibilidade aparente da proteína bruta e energia de dietas e nutrientes para camarões marinhos foi utilizado o sistema de coleta por decantação, pois apresentou baixo grau de lixiviação da proteína e matéria seca das fezes e foi de fácil manipulação. Nas dietas contendo L. plantarum foi observado um ganho de 2% no CDAPB que foi de 84,18 ± 0,35% e 82,73 ± 1,012 para dieta controle (p<0,05), para o CDAE o ganho foi de 2,63% sendo 81,28 ± 0,16% para dieta contendo L. plantarum e 78,63 ± 0,93% para a dieta controle (p<0,05). A suplementação com L. plantarum aumentou o CDAPB e o CDAE na dieta testada demonstrando efeitos nutricionais positivos para o uso na nutrição de camarões marinhos.
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Identificação e caracterização de sequências codificadoras de peptídeos antimicrobianos (PAM) nas células da hemolinfa de espécies nativas de peneídeos marinhosRosa, Rafael Diego da January 2007 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia / Made available in DSpace on 2012-10-23T14:25:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1
240357.pdf: 949085 bytes, checksum: a290070c83642822d8d3f48b81b9f0c1 (MD5) / Proteínas ou peptídeos antimicrobianos (PAM) são componentes essenciais do sistema imune inato e encontram-se amplamente distribuídos entre vertebrados, invertebrados e plantas. São moléculas relativamente pequenas, de caráter anfipático e catiônico, podendo apresentar uma atividade microbicida rápida e potente contra um amplo espectro de microrganismos. Em camarões peneídeos, três classes de PAM foram isoladas e caracterizadas molecular e funcionalmente, a partir de suas células sangüíneas ou hemócitos: peneidinas (PEN), crustinas (CRUS) e os fatores anti-lipopolissacarídeos (ALF). O objetivo desse estudo foi o de detectar, clonar e caracterizar molecularmente seqüências semelhantes a PEN, CRUS e ALF nos hemócitos de três espécies nativas de camarões peneídeos Farfantepenaeus paulensis, F. subtilis e Litopenaeus schmitti, além de elaborar filogramas a partir das seqüências obtidas. Através da utilização de iniciadores desenhados a partir de regiões de consenso de seqüências disponíveis em bancos gênicos públicos, foi possível amplificar fragmentos de cDNA correspondentes às três classes de PAM acima mencionadas nos diferentes peneídeos. Em F. subtilis foi clonada uma seqüência semelhante à PEN do subgrupo 2 denominada de Farsub PEN2-1 (GenBank: EF450742), codificando para um peptídeo maduro de 54 aminoácidos, altamente catiônico e com alta identidade aminoacídica com as PEN2 de F. paulensis (91-93%). Em L. schmitti, mas não nos outros peneídeos, foi possível obter um produto de amplificação correspondendo a uma seqüência de ALF, cujo peptídeo maduro consiste de 98 aminoácidos, com similaridades aminoacídicas de 93 e 95% com F. chinensis e L. vannamei, respectivamente. Esta seqüência, denominada Litsch ALF (GenBank: DQ991357) codifica para uma molécula altamente catiônica e contém, assim como outras seqüências de ALF, uma região anfipática entre dois resíduos conservados de cisteína. Já, seqüências similares a CRUS foram obtidas nas três espécies de peneídeos analisados, sendo denominadas de Farsub CRUS (127 aminoácidos, GenBank: EF450744), Farpau CRUS (150 aminoácidos, GenBank: EF182747) e Litsch CRUS (148 aminoácidos, GenBank: EF182748). As três seqüências codificam para peptídeos contendo uma região N-terminal hidrofóbica rica em resíduos de glicina e uma região C-terminal com doze resíduos conservados de cisteína, onde se encontra um domínio WAP. Todas as seqüências de CRUS obtidas apresentaram alta similaridade aminoacídica com as diferentes isoformas de CRUS do camarão L. vannamei (em torno de 85%). Este foi o primeiro relato da presença de ALF e CRUS em camarões peneídeos nativos brasileiros. A PEN já havia sido detectada em F. paulensis e L. schmitti. Atualmente, alguns dos PAM identificados estão em fase de expressão em sistema recombinante, para posteriormente determinar seu espectro de ação frente a diferentes grupos de microrganismos e verificar seu potencial como agente terapêutico em saúde humana, veterinária e aqüicultura.
Antimicrobial proteins or peptides (AMP) are major components of the immune system, which are widely distributed among vertebrates, invertebrates and plants. They are small cationic and amphipatic molecules that exhibit a rapid and potent activity against a broad range of microorganisms. In penaeid shrimp, three different classes of AMP have been isolated and molecular and functionally characterized from the blood cells or hemocytes: penaeidins (PEN), crustins (CRUS) and anti-lipopolysaccharide factors (ALF). The main purpose of this study was to detect, clone and molecularly characterize, gene sequences similar to PEN, CRUS and ALF from the hemocytes of the indigenous penaeid shrimp Farfantepenaeus paulensis, F. subtilis and Litopenaeus schmitti and also construct philograms from the obtained sequences It was possible to amplify cDNA sequences of the three AMP classes mentioned above, using primers based on consensus regions of corresponding sequences available at the GenBank. In F. subtilis, a PEN-like sequence, belonging to the subgroup 2, was cloned and named Farsub PEN2-1 (GenBank: EF450742). It coded for a mature peptide composed of 54 amino acids, highly cationic, and exhibited a high amino acidic identity with PEN2 isoforms of F. paulensis (91-93%). In L. schmitti, but not in other penaeids, one amplification product corresponding to an ALF-like sequence was obtained and called Litsch ALF (GenBank: DQ991357). It coded for a mature peptide of 98 amino acids exhibiting 93 and 95% of amino acid similarity with the ALF of F. chinensis and L. vannamei respectively. On the other hand, CRUS-like sequences were obtained in all three penaeid species, and were named Farsub CRUS (127 amino acids, GenBank: EF450744), Farpau CRUS (150 amino acids, GenBank: EF182747) and Litsch CRUS (148 amino acids, GenBank: EF182748). The three CRUS sequences coded for peptides containing a hydrophobic N-terminal sequence rich in glycine residues and a C-terminal sequence with twelve conserved cysteine residues and a WAP domain. All obtained CRUS sequences had amino acid similarity with different isoforms of L. vannamei CRUS (about 85%). This is the first report of ALF and CRUS sequences in indigenous Brazilian penaeid shrimp. PEN sequences were already described in F. paulensis e L. schmitti. Some of the cloned AMP are presently under expression through recombinant system, for further evaluate their antimicrobial activity spectra and their potential use as therapeutic agents for human and veterinary health and also aquaculture.
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Extração de pigmentos carotenóides a partir de resíduos do processamento de camarões (Farfantepenaeus paulensis)Hosang, Karla January 2001 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Curso de Pós-graduação em Ciência dos Alimentos. / Made available in DSpace on 2012-10-19T04:21:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Diferentes processos de extração, em óleo vegetal com e sem antioxidantes, em óleo vegetal com pré tratamento enzimático e com diferentes sistemas de solventes, de pigmentos carotenóides presentes nos resíduos de cascas de camarão Farfantepenaeus paulensis, constituídos basicamente de astaxantina, foram avaliados. O efeito dos antioxidantes, principalmente BHT e a-tocoferol durante a extração em óleo vegetal foi de prevenir a degradação do pigmento causada pelo efeito da temperatura do processo, aumentando o rendimento do produto. As proteases comerciais utilizadas para hidrolisar o resíduo antes da extração em óleo, apresentaram diferentes efeitos no processo, Brauzyn e Papaína foram as enzimas mais eficientes, aumentando significativamente a liberação do pigmento para o óleo. O sistema de solvente acetona e álcool isopropílico (1:3) usado para extração, obteve o resultado mais expressivo no rendimento final da extração, recuperando 74,82% da astaxantina contida no resíduo.
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Estudo do sistema imune do camarão branco Litopenaeus schmitti (Crustacea: Decapoda) com ênfase nas aglutininas plasmáticas /Cominetti, Márcia Regina January 2000 (has links)
Dissertação (Mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. / Made available in DSpace on 2012-10-17T11:37:54Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Este trabalho teve como objetivo o estudo do sistema imune do camarão branco Litopenaeus schmitti, enfatizando as aglutininas/lectinas plasmáticas. O soro apresentou atividade aglutinante contra uma variedade de eritrócitos. Esta atividade caracterizou-se por ser parcialmente dependente de cálcio, termosensível e pouco estável a pH abaixo de 7. A atividade aglutinante não mostrou afinidade por hexoses simples, mas revelarou-se específica para açúcares N-acetilados, em especial o AcNeu. A atividade aglutinante do soro foi também inibida por glicoproteínas contendo ácido siálico, como a fetuína e a BSM. O potencial envolvimento das lectinas no reconhecimento de microorganismos foi investigado, incubando-se o soro com diferentes tipos de LPS e com b-1,3-glicanas. Os LPS de Pseudomonas aeruginosa e de duas diferentes cepas de Escherichia coli (0128:B12 e 0111:B4) foram capazes de inibir a atividade aglutinante do soro. Contudo, as b-1,3-glicanas não causaram nenhuma inibição desta atividade. A atividade aglutinante do plasma de L. schmitti foi isolada através de uma coluna de fetuína-agarose e resultou na purificação parcial de uma lectina presente na hemolinfa (LPP), com massa molecular aparente estimada em 153 kDa, por gel filtração. Sob condições redutoras, LPP par mostrou duas subunidades com massa molecular de 31 e 34 kDa em SDS/PAGE. A atividade aglutinante, cálcio-dependência e especificidade da LPP foram testadas e resultaram num padrão muito semelhante ao obtido para o soro.
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Aspectos do crescimento de Penaeus (Farfantepenaeus) Paulensis Perez Farfante, 1967 (crutacea decapoda Penaeidae) em instalações de larviculturaPereira, Alitiene Moura Lemos January 1996 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciencias Agrarias / Made available in DSpace on 2012-10-16T11:03:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / As pós-larvas do camarão Penaeus paulensis produzidas no LCM - Departamento de Aqüicultura - -UFSC, realizaram de cinco a sete mudas após dez dias de cultivo. O crescimento dos segmentos abdominais em relação a carapaça (CC), demonstrou que a alometria negativa típica do sexto segmento abdominal (C6), não é a única responsável pela aquisição da forma jovem, pois foram verificadas alometrias positivas como na relação quinto segmento abdominal (C5) e carapaça. Foi possível determinar uma isometria entre o C6 e o restante do corpo, permitindo que a predição do comprimento total (CT), seja realizada pelo modelo linear CT = 0,12 + 3,95 C6 CT e C6 em milímetros). A distribuição de frequências da proporção C6 / CC abrangem o intervalo conhecido para a espécie (cultivadas e selvagens) sugerindo que os procedimentos do laboratório não influem na seleção do fenótipo da espécie. Recomenda-se o uso desta relação para verificar a manutenção da variabilidade das pós-larvas utilizadas em repovoamentos.
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Avaliação espaço temporal da ictiofauna acompanhante de pescarias artesanais dirigidas ao camarão-branco (Litopenaeus schimitti) na plataforma rasa do litoral do Paraná, sul do Brasil.Loose, Robin Hilbert January 2016 (has links)
Orientador : Prof. Dr. Henry Louis Spach / Coorientadores : Prof. Dr. André Pereira Cattani, Prof. Dr. Maurício de Castro Robert / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências da Terra, Programa de Pós-Graduação em Sistemas Costeiros e Oceânicos. Defesa: Pontal do Paraná, 28/04/2016 / Inclui referências : f. 77-86 / Resumo: As capturas voltadas às espécies de camarões geram uma grande quantidade de ictiofauna acompanhante. Todavia, devido à importância econômica desse recurso, há uma intensificação na captura, elevando os impactos ecológicos. Neste sentido, o objetivo do trabalho foi avaliar o impacto da captura do camarão-branco (Litopenaeus schimitti) por meio do arrasto de fundo e do caceio redondo na ictiofauna. A avaliação foi realizada, em cada estação do ano e em três profundidades, por meio de pescarias experimentais, com o auxílio dos pescadores artesanais através de arrasto de rede de manga redonda e de rede de caceio redondo. De um total de 9175 indivíduos capturados com os arrastos foram registradas 60 espécies, distribuídas em 23 famílias. As famílias que apresentaram maior riqueza de espécies nas amostras do arrasto foram Sciaenidae (12 espécies), Carangidae (5), Engraulidae (4), Gerreidae (4) e Paralichthydae (4), predominando nas amostras dessa rede as espécies Pellona harroweri, Stellifer rastrifer, Umbrina canosai, Chirocentrodon bleekerianus, Stellifer brasiliensis, Larimus breviceps e com um rendimento de captura média em número e peso variando com a estação e profundidade. De um total de 1203 indivíduos capturados com o caceio foram registradas 46 espécies distribuídos em 18 famílias. As famílias mais abundantes no caceio foram Sciaenidae e Carangidae, que representaram mais de 80% das capturas, com maior diversidade de espécies em Sciaenidae (13), Carangidae (8), Engraulidae (4) e dominância numérica de Paralonchurus brasiliensis, Chloroscombrus chrysurus, Macrodon atricauda e S. rastrifer, com as médias em número e peso variando somente entre as estações do ano. Conclui-se que as variações abióticas atuaram na seleção adaptativa enquanto que as interações biológicas promoveram ajustes de menor escala nos padrões de distribuição das espécies dentro da comunidade, além disso é evidente diferenças nas abundâncias e diversidades das espécies de peixes entre as diferentes artes de pesca, com maiores abundâncias e padrões de diversidades na pesca de arrasto. Dados inéditos foram gerados provando que o caceio redondo é uma arte de pesca alternativa altamente criativa, adaptada de uma técnica passiva e altamente seletiva em conjunto com uma pesca ativa com baixa seletividade (arrasto). Palavras - chaves: ictiofauna acompanhante, arrasto de fundo, caceio redondo. / Abstract: Shrimp trawlling fisheries generate a lot of bycatch ichthyofauna. However, due to the economic importance of this feature, there is an intensification in the capture, raising ecological impacts. In this sense, the objective of this study was to evaluate the impact of bottom trawling capture and driftnet round in fish populations. The evaluation was performed in every season and at three depths, through experimental fisheries, with the help of artisanal fisherman through round sleeve bottom trawling and of driftnet round network. A total of 9175 individuals caught with bottom trawling were recorded 60 species belonging to 23 families. The families with the highest species richness in the trawling samples were Sciaenidae (12 species), Carangidae (5), Engraulidae (4), Gerreidae (4) and Paralichthydae (4), predominantly in the samples that network the species Pellona harroweri, Stellifer rastrifer, Umbrina canosai, Chirocentrodon bleekerianus, Stellifer brasiliensis, Larimus breviceps and with an average catch yield in numbers and weight vary with the season and depth. A total of 1203 individuals caught with driftnet were recorded 46 species distributed in 18 families. The most abundant families in driftnet were Sciaenidae and Carangidae, which represented more than 80% of the catch, with the greatest diversity of species in Sciaenidae (13), Carangidae (8), Engraulidae (4) and numerical dominance Paralonchurus brasiliensis, Chloroscombrus chrysurus, Macrodon atricauda and S. rastrifer, with the average in number and weighing only between the seasons. It is concluded that the abiotic variations acted in adaptive selection while the biological interactions promoted small-scale adjustments in the distribution patterns of species within the community, also is evident differences in the abundance and diversity of fish species between different fishing gear, with higher abundances and patterns of diversity in trawling. Unpublished data were generated proving that driftnet round is a highly creative alternative fishing gear, adapted from a passive and highly selective technique together with an active fishing with low selectivity (bottom trawling). Keywords: bycatch ichthyofauna, bottom trawling, driftnet round.
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Genes diferencialmente expressos em camarões de cultivo Litopennaeus vannamei infectados pelo vírus da Síndrome da Mancha Branca e genotipagem de isolados geográficos brasileiros do vírusMüller, Isabel Cristina 24 October 2012 (has links)
Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia, Florianópolis, 2009. / Made available in DSpace on 2012-10-24T16:33:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1
273860.pdf: 2877096 bytes, checksum: 3f6283aa90114783b89e2a4000ab45e8 (MD5) / O vírus da Síndrome da Mancha Branca (WSSV) é uma doença que afeta várias espécies de crustáceos, causando grandes mortalidades e perdas econômicas em regiões produtoras de camarão. Este trabalho teve como objetivo padronizar a metodologia de PCR em Tempo Real para a detecção do WSSV, genotipar isolados geográficos do vírus e isolar genes diferencialmente expressos em camarões de cultivo infectados com WSSV. Amostras positivas e negativas por PCR nested foram analisadas através de PCR em Tempo Real. A carga viral das amostras foi determinada e algumas amostras negativas por PCR nested foram positivas por PCR em Tempo Real, com baixa carga viral. Vírus isolados de camarões coletados em Santa Catarina e na Bahia foram comparados quanto ao padrão de três minissatélites, à presença de uma grande deleção e uma transposase. Todas as amostras de Santa Catarina tiveram o mesmo padrão para os minissatélites analisados.As amostras da Bahia apresentaram um padrão diferente para os loci analisados, indicando que existem dois genótipos de WSSV diferentes no Brasil. Os isolados brasileiros tem uma deleção de 10,780 bp na ORF 23/24 e não possuem a seqüência da transposase. O padrão de repetições para os três minissatélites analisados foi diferente entre os isolados brasileiros e de outros países da América. Entretanto, ao analisar apenas a ORF 94, Santa Catarina, México, Nicarágua, Honduras e Panamá têm mais de nove repetições, enquanto a Bahia e os EUA têm menos de nove repetições. Esta similaridade pode estar relacionada a uma similaridade em virulência. Aparentemente, os WSSVs encontrados na Bahia e em Santa Catarina originaram-se de diferentes fontes de contaminação ou o vírus sofreu mutações ao longo do tempo. mRNA foi extraído das brânquias de camarões infectados e não-infectados com o WSSV, reversamente transcrito e uma hibridização subtrativa (SSH) foi realizada. A Biblioteca 1 (genes induzidos) tem 300 clones dos quais foram formados 36 contigs e 36 singlets. Destas seqüências, 69 (88,4%) são similares a seqüências no GeneBank. Na Biblioteca 2 (genes reprimidos), de 403 clones, foram formados 23 contigs e 36 singlets e 40 (75,5%) são similares a seqüências conhecidas. Estes genes foram organizados em grupos, de acordo com a sua função. Dentre os genes induzidos há genes envolvidos na síntese de ATP, citoesqueleto, adesão celular, metabolismo e transporte de moléculas. Dentre os genes reprimidos, há genes envolvidos na defesa contra bactérias, transdução de sinal e biossíntese de ácidos nucléicos. A infecção pelo WSSV parece alterar várias rotas metabólicas diferentes. / White Spot Syndrome Virus (WSSV) is a disease that affects several species of crustaceans, causing high mortality rates, which has been causing great economical losses in shrimp farming regions. The aims of this study were to standardize the Real Time PCR methodology for WSSV detection, to genotype geographical isolates of the virus and to isolate differentially expressed genes in farmed shrimps infected with WSSV. Samples positives and negatives by nested PCR were analyzed by Real Time PCR. The viral load of the samples was determined and some samples negative by nested PCR were positive by Real Time PCR, with low viral load. The pattern of three minisatellite regions, the presence of a deletion and a transposase were compared in virus isolated from shrimp collected in Santa Catarina and Bahia. All Santa Catarina samples had the same pattern for the minisatellites analyzed. Bahia samples showed a different pattern for the loci, indicating that there are two different ORF 23/24 and do not have a transposase sequence. The repeat number pattern for the three minisatellite analyzed was different between the Brazilian isolates and isolates from America#s countries. However, when analyzing only ORF 94, South Brazil, Mexico, Nicaragua, Honduras and Panama have all more than nine repeats, while Northeast Brazil and USA samples have less than nine repeats. This similarity of repeats could be related to a similarity in virulence. Our results show that WSSV found in Bahia and Santa Catarina States have originated from different sources of contamination or the virus have undergone mutations during time. mRNA was extracted from gills of shrimps infected and non-infected with WSSV, reverse transcribed and a suppression subtractive hybridization (SSH) was performed. Library 1 (induced genes) has 300 clones, which formed 36 contigs and 36 singlets. Of these sequences, 69 (88,4%) are similar to sequences in GeneBank. Library 2 (repressed genes), has 403 clones, which formed 23 contigs and 36 singlets, and 40 sequences (75,5%) are similar to known sequences. These genes were organized in groups, according to their functions. Among the induced genes there are genes involved in ATP synthesis, cytoskeleton, cell adhesion, metabolism and molecule transport. Among the repressed genes, there are genes involved in antibacterial defence, signal transduction and nucleic acids biosynthesis. WSSV infection seems to alter several metabolic routes.
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Produção em cativeiro de larvas de camarão marinho Litopenaeus vannameiManso, Paulo Roberto Jardim January 2007 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. Programa de Pós-graduação em Engenharia de Produção / Made available in DSpace on 2012-10-23T07:12:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1
247679.pdf: 3134769 bytes, checksum: 8262475f37b0ea3e4df075a0ba6efe43 (MD5)
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