Submitted by Marlene Santos (marlene.bc.ufg@gmail.com) on 2016-09-08T17:28:17Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Raíza Cavalcante Fonseca - 2015.pdf: 1824882 bytes, checksum: 29667e889a40dc94517acb650bb67891 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-09-09T14:42:06Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Raíza Cavalcante Fonseca - 2015.pdf: 1824882 bytes, checksum: 29667e889a40dc94517acb650bb67891 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-09T14:42:06Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Raíza Cavalcante Fonseca - 2015.pdf: 1824882 bytes, checksum: 29667e889a40dc94517acb650bb67891 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-09-29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The factors that control the rice cooking behavior are related to the physicochemical characteristics of the grain. The information of these traits is important to understanding the changes undergone by food during the cooking process. The objective of this work was to understand culinary behavior of upland rice genotypes with different levels of amylose through the characterization of physical, physicochemical, genetic and cooking quality of grain, as well as linking these factors to each other in order to point out reliable and reproducible indicators. We have analyzed eleven upland rice genotypes from the 2013 crop season at Embrapa Rice and Beans regarding the physical grain quality traits (head rice yield, grain size, percentage of chalk, milling degree), starch granule properties (morphology of the starch granules, swelling power, apparent amylose and absolute gelatinization temperature by alkaline dispersion, thermal properties by differential scanning calorimetry, pasting properties, the size distribution of amylopectin branched chains) and cooking quality (texture: hardness and stickiness of cooked grains (by cooking and instrumental tests) and of rice RVA gel). For genomic analysis, eight molecular markers associated to the cooking quality profile and described in the international literature were used. This study resulted in reliable and reproducible indicators of food quality for upland rice, to predict the culinary behavior profile were identified as key: the amylose content, gelatinization temperature, paste properties, instrumental texture properties and sensory of grains. In relation to validation markers for grain quality, it is concluded that the information derived from the analysis of association was possible to identify markers associated with cooking and technological attributes as well as to these favorable alleles. The final considerations involved in this study indicate that for different stages of breeding programs to launch on the market are cultivars of different analyzes displayed until the last assay which involves growing and use value. / Os fatores que controlam o comportamento culinário do arroz estão relacionados às características físico-químicas do grão. A informação dessas características é importante para a compreensão das modificações pelas quais passa o alimento durante o processo de cozimento. O objetivo deste trabalho foi compreender o comportamento culinário de genótipos de arroz de terras altas com diferentes teores de amilose por meio da caracterização dos parâmetros físicos, físico-químicos, genéticos e culinários da qualidade de grãos, bem como, associar esses fatores entre si de forma a apontar indicadores confiáveis. Foram analisados onze genótipos de plantio de terras altas provenientes da safra 2013 da Embrapa Arroz e Feijão quanto à qualidade física dos grãos (renda, rendimento, dimensão, porcentagem de gessados, grau de polimento), propriedades do grânulo de amido (morfologia dos grânulos de amido, poder de inchamento, teor de amilose aparente e absoluto, temperatura de gelatinização por dispersão alcalina, propriedades térmicas por calorimetria diferencial, propriedades de pasta, distribuição dos comprimentos de cadeias ramificadas da amilopectina) e qualidade culinária (textura: dureza e pegajosidade dos grãos cozidos (teste de cocção e instrumental) e do gel das pastas de arroz). Para a análise genômica, foram utilizados oito marcadores moleculares relacionados ao comportamento da qualidade culinária descritos na literatura internacional. Este estudo resultou em indicadores confiáveis e reprodutíveis da qualidade culinária para arroz de terras altas, para predizer o perfil de comportamento culinário foram apontados como principais: o teor de amilose, a temperatura de gelatinização, propriedades de pasta, propriedades de textura instrumental e sensorial dos grãos. Em relação à validação de marcadores para qualidade de grãos, conclui-se que a partir das informações derivadas da análise de associação foi possível a identificação de marcadores associados a atributos culinários e tecnológicos, assim como alelos favoráveis a estes. As considerações finais envolvidas neste estudo indicam que para diferentes etapas de programas de cruzamentos para o lançamento de cultivares no mercado são indicadas diferentes análises até o último ensaio que envolve o valor de cultivo e uso.

Submitted by Maria Beatriz Vieira (mbeatriz.vieira@gmail.com) on 2016-08-03T13:55:47Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) tese_pablo_cadore.pdf: 5773635 bytes, checksum: 63fadc0a8749af862e0e0b7a9b075c0c (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-03T13:55:47Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) tese_pablo_cadore.pdf: 5773635 bytes, checksum: 63fadc0a8749af862e0e0b7a9b075c0c (MD5) Previous issue date: 2015-09-28 / Sem bolsa / O arroz é uma cultura de origem tropical amplamente cultivada em uma diversidade de áreas, atualmente é o segundo cereal mais produzido no mundo. A ocorrência de baixas temperaturas é um estresse comum na cultura do arroz em regiões temperadas, portanto a tolerância a baixas temperaturas é uma característica desejável em genótipos brasileiros de arroz cultivados no sul do país, onde as temperaturas baixas prejudicam a germinação, o estabelecimento da lavoura e diminuem o rendimento de grãos. Portanto, este trabalho tem como objetivo estudar o comportamento de cruzamentos de arroz tolerantes e sensíveis para o caráter de tolerância ao frio no estádio de germinação e identificar genes diferencialmente expressos através do transcriptoma. Foram realizados cruzamentos controlados com 5 genitores contrastantes. Os genitores e as populações segregantes em F3 e F4 foram submetidos a tratamentos com diferentes temperaturas (13C e 25C) e comparados quanto ao seu desempenho relativo, medido pela germinação, índice de velocidade de germinação em laboratório e em campo, comprimento do coleóptilo e comprimento da raiz. A análise do transcriptoma foi realizada através do RNAseq de dois genótipos BRS SCS Tio Taka e Oro, submetidos a tratamentos com diferentes temperaturas (13C e 25C). Os resultados indicam que o índice de velocidade de germinação obtido em laboratório, apresenta maior eficiência em identificar genótipos e populações comparado com a avaliação em campo. O comprimento do coleóptilo e o índice de velocidade de germinação são as metodologias mais adequadas pela elevada associação com a germinação em baixas temperaturas. Os resultados das correlações na geração F3 diferem dos resultados apresentados na geração F4, devido a segregação das populações. Na cultivar tolerante Oro, poucos genes tiveram expressão gênica aumentada significativamente. Uma lista de 55 genes com diferença na expressão comuns as duas cultivares e uma lista com 17 genes com diferença na expressão únicos para a cultivar tolerante Oro, foram selecionados devido a respostas desses genes à tolerância ao frio na germinação de arroz. / Rice is a tropical crop widely grown in a variety of areas, is currently the second most-produced cereal in the world. The presence of low temperatures is a common stress in rice crops in temperate regions, so the tolerance to low temperatures is a desirable characteristic in Brazilian rice genotypes cultivated in the south, where low temperatures damage germination, establishment of the crop and decrease grain yield. Therefore, this paper aims to study the behavior of rice crossings tolerant and sensitive to cold tolerance at the germination stage and identify differentially expressed genes through the transcriptome. Controlled crosses with 5 contrasting genotypes were performed. The parents and segregating populations in F3 and F4 were subjected to treatments with different temperatures (13C e 25C) and compared for their relative performance, as measured by germination, germination speed index in the laboratory and in the field, length coleoptile length and root. The transcriptome analysis was performed through the RNAseq two genotypes BRS SCS Tio Taka and Oro, submitted to treatment with different temperatures (13C e 25C). The results show that the germination speed index obtained in the laboratory, has higher efficiency and populations to identify genotypes compared with the field evaluation. The length of the coleoptile and the germination speed index are the most appropriate methodologies due the high association with germination at low temperatures. The results of the correlations in the generation F3 differed from the results shown in the F4 generation due to segregation populations. In tolerant cultivar Oro, few genes have increased gene expression significantly. A list of 55 genes with common expression difference in the two cultivars and a list of 17 genes with only difference in the expression for the tolerant cultivar Oro, were selected due to responses of these genes to cold tolerance in rice germination.

Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2016-09-14T17:13:51Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Mariana_Kruger.pdf: 976408 bytes, checksum: 6bfde814984b8524fba2bd3708136696 (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2016-09-14T18:28:25Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Mariana_Kruger.pdf: 976408 bytes, checksum: 6bfde814984b8524fba2bd3708136696 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-14T18:28:25Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Mariana_Kruger.pdf: 976408 bytes, checksum: 6bfde814984b8524fba2bd3708136696 (MD5) Previous issue date: 2013-12-19 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / O arroz (Oryza sativa L.) é uma cultura que possui grande importância alimentar e econômica, sendo largamente cultivado em ecossistemas de terras baixas, o qual apresenta condições de drenagem deficiente. Nessas condições, o baixo potencial redox do meio leva a redução do ferro presente na solução do solo o qual torna-se prontamente disponível, podendo se tornar tóxico à planta quando absorvido em excesso. A toxidez por ferro é um dos mais importantes estresses abióticos a limitar a produção de arroz irrigado em nível mundial. Em áreas de cultivo de arroz do Rio Grande do Sul, o ferro tem causado problemas de toxidez e o uso de cultivares tolerantes torna-se uma importante estratégia para solucionar o problema, sendo necessário a identificação de genes frente aos diferentes mecanismos que conferem essa tolerância às plantas para aplicação em programas de melhoramento. Estudos recentes descobriram a importância de alguns fatores de transcrição responsivos ao etileno (ERFs) na resposta vegetal a diferentes estresses. Dessa forma o objetivo deste trabalho foi avaliar o perfil de expressão diferencial de 32 ERFs em arroz submetidos a condições de estresse por ferro, em três cultivares, Nipponbare, Epagri 108 (tolerante à toxidez por ferro) e BR-IRGA 409 (sensível à toxidez por ferro) e identificar elementos cis na região promotora de genes ERFs em arroz. Os resultados obtidos relatam que em arroz, a maioria dos membros da família ERF demonstram perfil diferencial nas cultivares Nipponbare, BR -IRGA 409 e Epagri 108, em condições de excesso de ferro. Os ERFs expressos na cultivar tolerante (Epagri 108) podem ser potencialmente importantes na indução da tolerância, enquanto que os que foram altamente induzidos na cultivar sensível (BR – IRGA 409) pertencem a um mecanismo de resposta o qual não é eficiente. Análises de elementos cis demonstram que a regulação da expressão de todos os ERFs analisados se dá de forma complexa e que existe uma associação entre a presença de determinado elemento cis com o perfil de expressão. / Rice (Oryza sativa L.) is a crop of high nourishment and financial importance, largely grown in flat and flooded ecosystems which present deficient drainage conditions. Under such conditions, the low redox potential of the environment leads to the reduction of iron present in the soil solution, which becomes readily available and can become toxic to the plant when absorbed in excess. Iron toxicity is one of the most important types of abiotic stress, limiting the production of irrigated rice worldwide. In rice growth areas of Rio Grande do Sul, Brazil, iron has caused toxicity problems and the use of tolerant cultivars becomes an important strategy in solving the problem, where the identification of genes is necessary in face of the different mechanisms which confer this tolerance to the plants for application in improvement programs. Recent studies discovered the importance of some transcription factors responsive to ethylene (ERFs) in vegetable response to different kinds of stress. Thus, the aim of this study was to evaluate the differential expression profile of 32 ERFs in rice subjected to iron stress conditions in three cultivars; Nipponbare, Epagri 108 (tolerant to iron toxicity) and Br-Irga 409 (sensitive to iron toxicity) and to identify cis elements in the ERF gene promotion region in rice. The results obtained demonstrate that in rice, most members of the ERF family showed differential profiles in the cultivars Npponbare, Epagri 108 and Br-Irga 409, under iron stress conditions. ERFs expressed in the tolerant cultivar (Epagri 108) may be potentially important in the induction of tolerance while those which were more highly induced in the sensitive cultivar (Br-IRGA 409) belong to a response mechanism which is not efficient. Analyses of cis elements demonstrate that the regulation of expression of all analyzed ERFs takes place in complex form and that there exists an association between the presence of a specific cis element and the expression profile.

Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2016-09-14T18:11:08Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) UNIVERSIDADE FEDERAL DE PELOTAS - TESE.pdf: 3121320 bytes, checksum: 5a704b24078eca8a2b35513ec2a606f6 (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2016-09-15T19:42:11Z (GMT) No. of bitstreams: 2 UNIVERSIDADE FEDERAL DE PELOTAS - TESE.pdf: 3121320 bytes, checksum: 5a704b24078eca8a2b35513ec2a606f6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-15T19:42:11Z (GMT). No. of bitstreams: 2 UNIVERSIDADE FEDERAL DE PELOTAS - TESE.pdf: 3121320 bytes, checksum: 5a704b24078eca8a2b35513ec2a606f6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2012-09-17 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Estresses ambientais representam grandes ameaças à agricultura e, por consequência, à segurança alimentar, uma vez que limitam a produtividade da maioria das plantas cultivadas. Buscando identificar as respostas das plantas frente a estresses abióticos e suas relações com a tolerância sob diferentes condições ambientais, conceitos e técnicas de biologia molecular, biologia celular e genética vêm sendo continuamente utilizadas. A identificação de genes responsivos a estresses pode ser utilizada na obtenção de plantas tolerantes a condições ambientais adversas através de manipulação genética ou cruzamentos direcionados entre diferentes genótipos. Desta forma, este estudo teve como objetivo estabelecer o perfil de expressão de genes pertencentes às famílias ERF, HSP, HSF, TIM/TOM e TIC/TOC, em arroz e tomate sob condições de estresse por deficiência de O2. Além disso, buscou-se estabelecer o perfil transcricional de pêssegos sob condição de estresse por frio. Os resultados obtidos demonstram que em arroz, alguns membros da família ERF apresentam expressão específica de acordo com o agente estressor, enquanto que outros apresentam sobreposição de expressão entre os estresses, além disso, dentro da família ERF alguns genes apresentam regulação complexa e outros regulação simples. Em arroz, alguns genes codificadores de proteínas pertencentes aos complexos TIM/TOM e TIC/TOC apresentaram altos níveis de expressão 24 horas após estresse por anoxia. Entretanto, após 72 horas sob condições de anoxia, ocorreu a inibição da expressão da maioria dos genes pertencentes a estes complexos, sugerindo que possa haver uma interrupção no transporte de proteínas para a mitocôndria e cloroplasto durante este período de estresse. Ao comparar cultivares de arroz tolerante e sensível ao alagamento, verificou-se que houve um acúmulo de transcritos dos genes codificadores de HSPs em ambas as cultivares. Entretanto, a maioria dos genes avaliados foi mais responsiva ao estresse por anoxia na cultivar sensível, do que na cultivar tolerante, sugerindo que genes HSPs têm relação importante na resposta ao estresse por anoxia, mas não estão diretamente envolvidos na tolerância. Em frutos de tomate armazenados sob hipoxia dois genes codificadores de sHSPs foram altamente induzidos por baixos níveis de oxigênio, indicando uma ação primária destes genes na manutenção da homeostase celular após este estresse. Em pêssegos, a aplicação de ácido giberélico atua na prevenção de danos ocasionados pelo frio através da indução de genes associados ao metabolismo de lipídios, à degradação da parede celular e à síntese de trealose. / Abiotic stresses represent large threats to agriculture and food security, since they limit the productivity of the majority of cultivated plants. In order to identify the responses of plants to abiotic stresses and their associations with tolerance under different environmental conditions, concepts and techniques in molecular biology, cell biology and genetics have been used. The identification of genes responsive to stresses can be used to obtain plants tolerant to adverse environmental conditions by genetic transformation or directed crosses. Thus, this study had the objective the establishing of expression profiles of gene belonging to the ERF, HSP, HSF, TIM/TOM and TIC/TOC families in rice and tomato under low O2 stress. Also, the transcriptional profile of peaches under cold stress as obtained. The results indicate that in rice, some members of the ERF family present specific expression according to the stressing agent, while others have overlapping expression among different stresses. Besides, within the ERF family, some genes do present a complex regulation and others a simple regulation. In rice, some genes encode proteins belonging to the TIM/TOM and TIC/TOC complexes present high expression levels 24 hours after anoxia stress. However, after 72 hours under anoxia, the majority of genes were inhibited, suggesting an interruption on the transport of proteins to the mitochondria and chloroplast during the stress period. When the HSP expression profiles of flooding tolerant and sensitive rice cultivars were compared, transcript accumulation occurred for both cultivar types. However, the majority of genes evaluated were more responsive in the sensitive cultivar than in the tolerant, indicating that HSPs have an important association in the response to anoxia stress but are not directly involved in the tolerance. In tomato fruits stored under hypoxia, two sHSPs genes were highly induced by low oxygen levels, indicating a primary action of these genes on keeping cell homeostasis after the stress. In peaches, the application of gibberellic acid acts on preventing the damaged caused by cold by the induction of genes associated to lipid metabolism, cell wall degradation and trehalose synthesis.

Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2016-09-23T16:24:14Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) dissertacao_Vairton.pdf: 1287042 bytes, checksum: 8a7c8e181d568edeb081a1ada6a0d1f3 (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2016-09-23T19:30:14Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) dissertacao_Vairton.pdf: 1287042 bytes, checksum: 8a7c8e181d568edeb081a1ada6a0d1f3 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-23T19:30:14Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) dissertacao_Vairton.pdf: 1287042 bytes, checksum: 8a7c8e181d568edeb081a1ada6a0d1f3 (MD5) Previous issue date: 2011-02-28 / Ao longo tempo de cultivo de arroz de terras altas na região sul do Estado do Amazonas constata-se baixas produtividades atribuídas a vários fatores, dentre os quais, atributos químicos de solo limitantes. No entanto, poucos estudos têm sido realizados relacionados ao nível de fertilidade dos solos cultivados com arroz. O presente estudo tem por objetivo avaliar os principais atributos químicos de 72 amostras de solos dos campos naturais cultivados, identificando as possíveis limitações químicas bem como estabelecer relações entre os atributos do solo. Para isto, foram coletadas 72 amostras de solos em campos naturais cultivados com arroz, na profundidade de 0 a 20 cm (camada arável) abrangendo os municípios de Humaitá, Manicoré, Novo Aripuanã e Canutama e determinados os teores de areia, silte, argila, carbono orgânico, fósforo, potássio, sódio, cálcio, magnésio, alumínio, cobre, manganês, zinco, ferro, acidez ativa e potencial, capacidade de troca de cátions, saturação por bases e saturação por alumínio. Os resultados foram submetidos a análise estatística descritiva e análise de regressão. Em geral, os solos de campos naturais cultivados apresentam texturas areia, franco-siltosa e franco-argilo-siltosa. São baixos os teores de potássio, cálcio, cobre, manganês e zinco, altos teores de ferro, baixos e adequados teores de magnésio, teores de fósforo muito baixo. Os teores são médios e adequados de matéria orgânica, baixo e médio pH em CaCl2 e médio e adequado pH em água, capacidade de troca de cátions com nível médio, adequado e alto, saturação por bases baixa e médio e a saturação por alumínio alta e muito alta. O pH SMP foi eficiente para estimar a acidez potencial e os teores de argila e carbono orgânico total são eficientes para estimar a capacidade de troca de cátions dos solos de campos naturais cultivados no sul do estado do Amazonas. As principais limitações químicas para o cultivo dos solos são: elevada acidez potencial, baixa e média saturação por bases e muito baixa disponibilidade de fósforo. / Over time Upland rice cultivation in southern Amazonas State has shown low productivity attributed to several factors, among which chemical attributes of limiting soils. However few studies about soil fertility under rice crop have been conducted. This study aims to evaluate the main chemical attributes of 72 soil samples of cultivated grasslands, identify possible chemical limitations, as well as establish relationship between these soil attributes. Seventy-two soil samples at depth of 0 to 20 cm (top soil) were collected in grasslands planted with rice, including the municipalities of Humaitá, Manicoré, Novo Aripuanã e Canutama. Distribution of sand, silt, clay, organic carbon, phosphorous, potassium, sodium, calcium, magnesium, aluminum, copper, manganese, zinc, iron contents were determined. Active and potential acidity, cation exchange capacity, base saturation and aluminum saturation were also established. The results were submitted to descriptive statistical analysis and to regression analysis. As a general rule, soils of cultivated grasslands have sandy, loamy silt and silt clay loam texture low potassium, calcium, copper, manganese, and zinc content, high iron content, low and appropriate magnesium content, very low phosphorous content. It was also achieved on that soils, medium and appropriate organic matter content. Low and medium pH in CaCl2 and medium and appropriate pH in water, cation exchange capacity in medium, to high levels, low and medium base saturation, high and very high aluminum saturation. SMP pH was efficient for estimating potential acidity; clay and total organic carbon are efficient for estimating soil cation exchange capacity in grasslands planted in southern Amazonas State. The main chemical limitations for soil cultivation are: high potential acidity, low and medium base saturation and very low phosphorous availability.

Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2016-10-10T17:31:26Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese - Cláudia Militz da Costa.pdf.pdf: 2514954 bytes, checksum: 6ff53df6aea30c61f0946c80d9ddf869 (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2016-10-11T20:51:12Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Cláudia Militz da Costa.pdf.pdf: 2514954 bytes, checksum: 6ff53df6aea30c61f0946c80d9ddf869 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-11T20:51:12Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Cláudia Militz da Costa.pdf.pdf: 2514954 bytes, checksum: 6ff53df6aea30c61f0946c80d9ddf869 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2014-12-18 / Sem bolsa / Em grãos de arroz de duas cultivares híbridas e duas variedades, beneficiadas logo após a colheita e após 6 meses de armazenamento dos grãos em casca na temperatura de 20ºC, foram analisados teores de 18 aminoácidos, proteínas totais, amilose, umidade, temperatura de gelatinização (estimativa), mais os parâmetros de qualidade industrial, de cocção, de textura, de viscosidade e sensorial, preferência e aceitação. Os resultados permitiram concluir que: (a) o aumento do tempo de armazenamento provoca reduções no conteúdo e alterações no perfil de aminoácidos, não havendo diferenças de comportamento entre variedades e híbridos; (b) o conteúdo de proteínas totais do endosperma não define o grau soltabilidade (ou de empapamento) dos grãos e nem está relacionado com a preferência do consumidor pelo arroz após a cocção; (c) a elevação do conteúdo de cisteína provoca aumento na soltabilidade do arroz cozido ao longo do armazenamento; (d) os parâmetros de avaliações texturométricas e reológicas refletem os resultados da análise sensorial e da aceitação do arroz após a cocção; e, (e) o aumento do tempo de armazenamento provoca aumento inicial no rendimento industrial e reduções na brancura e no grau de polimento, mas não altera a transparência do arroz. / In rice grains from two hybrids cultivars and two varieties, milled immediately after harvest and after 6 months of storage of grains with husk at the temperature of 20°C, were analyzed levels of 18 amino acids, total protein, amylose, moisture, gelatinization temperature (estimation), plus the parameters of industrial quality, cooking, texture, viscosity and sensory attributes, also preference and acceptance. The results allowed to conclude that: (a) the increase of storage time causes reductions in the amino acid content and changes in amino acid profile, with no significant differences among varieties and hybrids; (b) total protein content from endosperm does not define the degree of loose cooked grains (or of grain stickiness) and it is not associated with the consumer preference for the rice after cooking, (c) elevation in cysteine content causes an increase in loose cooked grain (reduction of stickiness) during storage; (d) parameters of texturometric and rheological evaluations reflect the results from sensory analysis and acceptance of the rice after cooking; and (e) the increase of storage time causes an initial increasing in industrial yield and leads to reductions in whiteness and polishing degree (milling degree), but does not change the transparency of rice .

Submitted by Maria Beatriz Vieira (mbeatriz.vieira@gmail.com) on 2016-10-10T12:43:48Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) dissertacao_andre_oliveira_de_mendonca.pdf: 877706 bytes, checksum: 5195daa6c5633db563a5c8c76ae4574d (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2016-10-11T21:02:14Z (GMT) No. of bitstreams: 2 dissertacao_andre_oliveira_de_mendonca.pdf: 877706 bytes, checksum: 5195daa6c5633db563a5c8c76ae4574d (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2016-10-11T21:02:27Z (GMT) No. of bitstreams: 2 dissertacao_andre_oliveira_de_mendonca.pdf: 877706 bytes, checksum: 5195daa6c5633db563a5c8c76ae4574d (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-11T21:03:26Z (GMT). No. of bitstreams: 2 dissertacao_andre_oliveira_de_mendonca.pdf: 877706 bytes, checksum: 5195daa6c5633db563a5c8c76ae4574d (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2013-09-02 / Sem bolsa / O objetivo do trabalho foi desenvolver metodologia rápida e eficiente para identificação de sementes de arroz-vermelho resistente aos herbicidas inibidores da enzima acetolactato sintase e avaliar o tempo para superação da dormência de sementes de arroz-vermelho. Utilizaram-se dois biótipos de arroz-vermelho, sendo um resistente (General Câmara, RS) e outro suscetível (Cachoeirinha, RS) a imazapir + imazapic (Kifix®), herbicida inibidor da acetolactato sintase, e duas cultivares de arroz, Puitá INTA CL e IRGA 417, resistente e suscetível, respectivamente. Para a avaliação da dormência, as sementes de arroz-vermelho foram obtidas no Centro Agropecuário da Palma (CAP), UFPel, Capão do Leão. Os resultados demonstraram que o substrato papel mata-borrão é o mais eficiente para a diferenciação de biótipos quanto a suscetibilidade. A utilização de óleo mineral promove incremento na eficácia do herbicida, independente do biótipo. A dose de 60% da dose comercial é a mais indicada a ser utilizada. As sementes de arroz-vermelho suscetível e a cultivar IRGA 417 apresentaram suscetibilidade ao herbicida do grupo químico das imidazolinonas, enquanto os biótipos arroz-vermelho resistente e Puitá INTA CL demonstraram alta resistência a essa classe de herbicida. A utilização de herbicida diminuiu a porcentagem de plântulas normais de todos os biótipos utilizados. O biótipo de arroz-vermelho resistente apresentou maior germinação e vigor que os demais, seguido do Puitá INTA CL. Variações na temperatura de germinação, abaixo da considerada ótima, reduzem a germinação de sementes de arroz e arroz-vermelho. As sementes de arroz-vermelho coletadas no Centro Agropecuário da Palma apresentaram alta dormência, sendo que 60 dias após a coleta não foram suficientes para a superação total desta condição. / The objective was to develop a methodology for quick and efficient identification of red rice seeds resistant to herbicides inhibiting acetolactate synthase and time to break dormancy of seeds of red rice. Used two biotypes of red rice, one resistant (General Câmara, RS) and a susceptible (Cachoeirinha, RS) to imazapic + imazapyr (Kifix®), acetolactate synthase-inhibiting herbicide, and two rice cultivars, Puitá INTA CL and IRGA 417, resistant and susceptible, respectively. For the evaluation of dormancy, the seeds of red rice were obtained from the Agricultural Center of Palma (CAP), UFPel, Capão do Leão. The results showed that the substrate blotter paper is the most efficient for the differentiation of susceptibility biotypes. The use of mineral oil promotes an increase in the effectiveness of the herbicide, regardless of the biotype. The dose of commercial 60% of the dose is more appropriate to be used. The seeds of red rice and susceptible cultivar IRGA 417 showed susceptibility to the herbicide of the imidazolinone chemical group, while biotypes resistant red rice and Puitá INTA CL showed high resistance to this class of herbicide. The use of herbicide decreased the percentage of normal seedlings of all cultivars. The biotype resistant red rice showed higher germination and vigor than the others, followed by the Puitá INTA CL. Variations in germination temperature below the considered optimal, reduce germination of rice and red rice. The seeds of red rice collected in the Agricultural Center of Palma showed high numbness, and 60 days after collection were not enough to overcome this condition overall.

Submitted by Ubirajara Cruz (ubirajara.cruz@gmail.com) on 2017-02-07T15:48:12Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) resumo_priscila_auler.pdf: 168347 bytes, checksum: c8f9e110c53e5890f4252ecafc4a1a0a (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2017-03-20T17:30:41Z (GMT) No. of bitstreams: 2 resumo_priscila_auler.pdf: 168347 bytes, checksum: c8f9e110c53e5890f4252ecafc4a1a0a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-20T17:30:41Z (GMT). No. of bitstreams: 2 resumo_priscila_auler.pdf: 168347 bytes, checksum: c8f9e110c53e5890f4252ecafc4a1a0a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-08-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / O arroz (Oryza sativa L.) é um cereal cultivado e consumido em todos os continentes, sendo caracterizado como o principal alimento para mais da metade da população mundial. O déficit hídrico representa uma grande ameaça à segurança alimentar nos dias de hoje devido a grande necessidade de água para a produtividade das lavouras. O objetivo deste estudo foi avaliar a estabilidade de nove genes de referência tradicionais, de modo a identificar os mais adequados para a normalização da transcrição em genótipos de arroz cultivados, historicamente, em solos com diferentes disponibilidades hídricas BRS Querência (solo irrigado) e AN Cambará (solo de sequeiro), além de, verificar o comportamento destes materiais identificando significativas alterações que poderão distinguir a eficiência de sinalização ao déficit hídrico para melhor compreender a dinâmica das respostas. Para atingir este objetivo foram realizados dois estudos: No primeiro, foram testados nove gene candidatos à referência quanto a estabilidade de expressão para estudos de RT-qPCR em folhas de arroz submetidas a diferentes condições hídricas de solo (20 % e 10 % de água no solo, e após 24h de recuperação) nos estádios de desenvolvimento vegetativo e reprodutivo. Estes demonstraram que UBC-E2 e UBQ5 podem ser usados como genes normalizadores em todos os tratamentos testados. Por outro lado, os genes β tubulina, eIF-4α e GAPDH, não apresentam estabilidade de expressão, não sendo indicados. Realizou-se a validação de expressão em bZIP23 e bZIP72 e estes confirmaram a importância de validar genes de referência para atingir os resultados adequados. No segundo estudo, foram avaliados, em quatro condições experimentais distintas, com aplicação ou não de pré-tratamento, parâmetros fisiológicos e expressão de nove fatores de transcrição relacionados à desidratação nos dois genótipos, no estádio reprodutivo, na fase de alarme do estresse, quando o solo atingiu 10 % de umidade e após 24h de recuperação. Além disso, foram realizadas a atividade enzimática e expressão de genes codificadores das isoformas das enzimas do sistema antioxidante, conteúdo de prolina e expressão de genes envolvidos no seu metabolismo, no estádio reprodutivo, na fase de alarme do estresse. A partir dos resultados podemos concluir que plantas que passaram por pré-tratamento apresentam maior eficiência de sinalização perante as variáveis analisadas, tanto a nível fisiológico, bioquímico e molecular, sendo que, devido a maior quantidade de O2●-, H2O2, prolina e alta expressão nos FTs no genótipo de várzea, BRS Querência. Assim, podemos inferir que a sinalização está ocorrendo de forma mais intensa neste material. Entretanto, no AN Cambará, a metaloenzima SOD teve maior atividade, assim como a expressão dos genes envolvidos, indicando que o sistema antioxidante estava se intensificando, principalmente nas plantas que foram expostas a pré-tratamento e estresse posterior, sobressaíndo os efeitos de memória. / The rice (Oryza sativa L.) is a...

Made available in DSpace on 2014-08-20T13:59:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_gabriela_peres_moraes.pdf: 2721394 bytes, checksum: 37931b48d7259651d911f5ce19c45303 (MD5) Previous issue date: 2013-08-16 / On the production of rice, the salinization of the soil and the water of irrigation, during the establishment phases its closely related to the variation in the levels of production. Among the main damages caused by saline stress at cellular level, are the disturbances in the plasmatic membrane, being its effects manifested by alterations on the permeability, lipid composition, electrical potential and activity of proteins linked to it. The proteins LTPs ("Lipid Transfer Proteins") are related to the transfer and connection of fatty acids and phospholipids between membranes, in addition to being involved in the modification of the lipid composition and their biogenesis. On this note, the objective of this work was to analyze the expression of ten candidate genes to normalizing for studies of genetic expression and verify the differential expression of eleven genes LTPs in rice seedlings. The genotypes BRS Bojuru (tolerant) and BRS Ligeirinho (sensitive) were exposed to 150mM of NaCl in times 0, 24, 48, 72 and 96 hours. The normalizing gene UBQ10 was the most stable for these experimental conditions tested, while the least stable were IF-4a, Tip41-Like and Cyclophilin, being, therefore not in, the least indicated. Among the analyzed LTPs genes, LTP10 presented a high expression value (70 times more) in the 96 hour of stress, when compared to the control in sensitive genotype. For the BRS Bojuru this same gene kept the expression standards while exposed in different times to the stress. The gene LTP14 showed similar patterns of expression between the genotypes studied. In the beginning of the stress, the level of expression practically unaltered, followed by increase and successive decrease after 72 hrs of salt exposure. After the correlation analysis, it was observed that LTP7 and 14 showed a positive correlation, while LTPs 10,26 and 23 showed negative correlation among genotypes. The phylogenetic tree showed a grouping tendency similar to the nucleotides and amino acids sequences analyzed. Based on the results of this study, it was concluded that the gene UBQ10 is the best normalizing for the experimental conditions tested and the genes LTP10, 23 and 26 can be used as a marker for the assisted selection of rice plants for the saline stress for showing contrasting response of expression between genotypes. / Na orizicultura, a salinização do solo e da água de irrigação, durante as fases de estabelecimento e reprodutiva está intimamente relacionada com a variação nos níveis de produção. Dentre os principais danos causados pelo estresse salino em nível celular, estão os distúrbios na membrana plasmática, sendo seus efeitos manifestados por alterações na permeabilidade, na composição lipídica, potencial elétrico e atividade de enzimas e proteínas ligadas a ela. As proteínas LTPs ( Lipid Transfer Proteins ) estão relacionadas com a transferência e ligação de ácidos graxos e fosfolipídios entre as membranas, além de estarem envolvidas na modificação da composição lipídica e biogênese destas. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi analisar a expressão de dez genes candidatos a normalizadores para estudos de expressão gênica e verificar a expressão diferencial de 11 genes LTPs em plântulas de arroz. Os genótipos BRS Bojuru (tolerante) e BRS Ligeirinho (sensível) foram expostos a 150 mM de NaCl nos tempos 0, 24, 48, 72 e 96 horas. O gene normalizador UBQ10 foi o mais estável para estas condições experimentais testadas, enquanto que os menos estáveis foram IF-4α, TIP41-LIKE e Cyclophilin, sendo, portanto, os menos indicados. Dentre os genes LTPs avaliados, LTP10 apresentou alto valor de expressão (70 vezes mais) nas 96 horas de estresse, quando comparado ao controle no genótipo sensível. Para BRS Bojuru esse mesmo gene manteve o padrão de expressão durante os tempos de exposição ao estresse. O gene LTP14 apresentou padrão de expressão semelhante entre os genótipos estudados. No início do estresse, o nível de expressão manteve-se praticamente inalterado, seguido de aumento e sucessiva diminuição a partir das 72 h de exposição ao sal. A partir da análise de correlação observou-se que LTP7 e 14 apresentaram correlação positiva, enquanto que LTPs 10, 26 e 23 apresentaram correlação negativa entre os genótipos. As árvores filogenéticas mostraram uma tendência de agrupamento semelhante entre as sequências de nucleotídeos e aminoácidos analisadas. Com base nos resultados obtidos, conclui-se que o gene UBQ10 é o melhor normalizador para as condições experimentais testadas e os genes LTP10, 23 e 26 poderão ser utilizados como possíveis marcadores para a seleção assistida de plantas de arroz para o estresse salino por apresentarem resposta de expressão contrastante entre os genótipos.

Made available in DSpace on 2014-08-20T13:59:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_maria_da_graca_de_souza_lima.pdf: 4326568 bytes, checksum: 1e4f3676ef163392730daec1cb217796 (MD5) Previous issue date: 2008-07-18 / In Rio Grande do Sul State, the main system for irrigation of rice cultivation is by flooding, can lead to the salinization of soils with inadequate drainage, especially at the coastal region where crops using water from the Laguna dos Patos, which is subject to the salinization by sea water. This is a major environmental problem in the rice production. This survey aimed to examine the expression of enzyme in Oryza sativa L. ssp. indica S. Kato e Oryza sativa L. ssp. japonica S. Kato, grown in different levels of salinity, in order to identify genes involved in tolerance to salinity, based on the assumption that the second subspecies show greater tolerance to salinity. In the experiment were used Oryza sativa L. ssp. japonica S. Kato (BRS Bojuru, IAS 12-9 Formosa and Goyakuman) and Oryza sativa L. ssp. indica S. Kato (BRS-7 Taim, BRS Querência and BRS Atalanta). The seedling was done in plastic trays, containing sand washed as substrate. The seedlings were transferred to greenhouse with 10 days of emergency under temperature 25 °C and humidity 85 % controlled and placed in basins of 15 L containing nutrient solution of Hoagland half strength increased of 0, 25, 50, 75 and 100 mM NaCl. Seedlings were collected at 14, 28, 42 and 56 days after the transfer and immediately stored in ultrafreezer to -70 °C to subsequent analyses. The plant tissues were macerated and placed in tubes eppendorf with extractor solution of Scandálios. The electrophoresis was performed in 7% of polyacrylamide gels placed in vertical vats. The bands were revealed for several enzymes systems: superoxide dismutase, peroxidase, catalase, esterase, xvi glutamate dehydrogenase, alcohol dehydrogenase, fosfoglucose isomerase, malate dehydrogenase, málica enzyme, alpha amylase and glucose-6-phosphate dehydrogenase. Through the search in silico, conducted with the National Center for Biotechnology Information identified the genes AY785147 - SOS and AF319481 - CK1 involved in the salinity tolerance. The detection of the gene was the extraction of DNA using the method CTAB 2%, followed by reactions of PCR thermocycler held on through the use of primers also drawn in silico. The products of amplification were detected by agarose gel electrophoresis of 1.5%. The view of the DNA stained with bromide etídio was made on ultraviolet light and scanned images. The expression of enzymes involved in the mechanisms of tolerance to salt stress is greater in O. sativa ssp. japonica. Fragment of SOS1 gene was found in all cultivars, except for BRS Atalanta. CK1 gene is present in all cultivars evaluated. It allows to conclude that enzyme systems were more expressed in cultivars O. sativa ssp. japonica, in the leaves and the 14 DAT, featuring bands more intense as the increase of salinity. The expression of enzymes involved in the mechanisms of tolerance to salt stress is greater in O. sativa ssp. japonica and the genes studied are present in both subspecies. / No Rio Grande do Sul, o principal sistema de irrigação da cultura do arroz é por inundação, podendo conduzir à salinização os solos com drenagem inadequada, especialmente as lavouras da região litorânea que utilizam a água da Laguna dos Patos, que está sujeita à salinização pela entrada do mar quando é baixo o nível da referida Laguna, tornando-se uma das maiores limitações ambientais na produção de arroz. Esta pesquisa teve como objetivos analisar a expressão enzimática de cultivares de Oryza sativa L. ssp. indica S. Kato e Oryza sativa L. ssp. japonica S. Kato, crescidas em diferentes níveis de salinidade e detectar genes envolvidos com a tolerância à salinidade, com base na hipótese de que as cultivares da Segunda subespécie apresentam maior tolerância à salinidade. No experimento foram utilizadas as cultivares BRS Bojuru, IAS 12-9 Formosa e Goyakuman pertencentes à O. sativa ssp. japonica e as cultivares de O. sativa ssp. indica BRS-7 Taim, BRS Querência e BRS Atalanta. As plântulas de arroz com 10 dias após a emergência (DAE) foram transferidas para casa de vegetação com temperatura e umidade controlada e crescidas em bacias de 15 L, contendo solução nutritiva de Hoagland meia força acrescida de 0, 25, 50, 75 e 100 mM de NaCl. As plântulas foram coletadas aos 14, 28, 42 e 56 dias após a transferência (DAT) e imediatamente armazenadas em ultrafreezer à -70 °C para posterior anáxiv -lises. Os tecidos vegetais foram macerados e colocados em tubos eppendorf com solução extratora de Scandálios. A eletroforese foi realizada em géis de poliacrilamida 7% colocados em cubas eletroforéticas verticais. As bandas foram reveladas para os sistemas enzimáticos superóxido dismutase, peroxidase, catalase, esterase, glutamato desidrogenase, álcool desidrogenase, fosfoglucose isomerase, malato desidrogenase, enzima málica, alfa amilase e glucose-6-fosfato desidrogenase. Por intermédio de pesquisa in silico, realizada junto ao National Center for Biotechnology Information foram identificados os genes AY785147 SOS e AF319481 - CK1, envolvidos na tolerância a salinidade. A detecção dos genes consistiu da extração de DNA genômico segundo o método CTAB 2%, seguido de reações de PCR realizadas em termociclador mediante a utilização dos primers desenhados também in silico. Os produtos da amplificação foram detectados por eletroforese em gel de agarose 1,5%. A visualização do DNA corado com brometo de etídio foi feita sobre iluminação ultravioleta e as imagens digitalizadas. A expressão das enzimas envolvidas nos mecanismos de tolerância ao estresse salino é maior em O. sativa ssp. japonica. Fragmento do gene SOS1 foi encontrado em todas cultivares, com exceção da BRS Atalanta e o gene CK1 está presente em todas as cultivares avaliadas. Conclui-se que os sistemas enzimáticos são mais expressos nas cultivares de O. sativa ssp. japonica, nas folhas e aos 14 DAT, apresentando bandas mais intensas conforme o aumento da salinidade. A expressão das enzimas envolvidas nos mecanismos de tolerância ao estresse salino é maior em O. sativa ssp. japonica e os genes estudados estão presentes nas duas subespécies.