Made available in DSpace on 2014-08-20T13:59:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ficha_de_ariadne_henriques.pdf: 7102 bytes, checksum: cc97ba6f61e703cab77ba5c8126e97b2 (MD5) Previous issue date: 2008-02-21 / The objective was to evaluate the growth and development of plants, as well as the physiological quality of seeds of rice (Oryza sativa L.) under various concentrations of cadmium seed, rice cultivar BR-IRGA 410 were grown in plastic pots containing soil and irrigated with increasing concentrations (0, 0.2, 0.4, 0.6 and 0.8 mM) of CdCl2. The harvests were carried out at successive regular time of 14 days throughout the cycle of development of culture. In order to evaluate the characteristics of growth, the partition of assimilated, changes in photosynthetic pigments and peroxidase activity of guaiacol in plants under development . Moreover, the end of the reproductive cycle, the seeds from the plants of rice irrigated with cadmium were analyzed through biochemical tests (sugar, starch and protein) and tests of viability and force, and also evaluated the cadmium content in seeds. The growth of rice plants was affected negatively with the increase in doses of cadmium. The presence of cadmium in the soil solution also reduced the accumulation of dry matter and the rate of growth of all organs of the plant, causing a decrease drastically in the total number of seeds and the number of seeds potentially viable, greatly increasing the percentage of aborted seeds, the levels of chlorophylls and carotenoids decreased and the guaiacol peroxidase activity increased in the leaves with the augmente on the concentration of cadmium. The rice seed showed quantitative changes in their constituents reserve, but the viability and vigor of these seeds have not been changes. Moreover, the ions of cadmium were easily translocados for grains of rice, restraining the use of grain for human consumption. Thus, one can infer that the cadmium is an extremely phytotoxic that can enter into our food chain and cause serious problems to health. / O objetivo foi avaliar o crescimento e o desenvolvimento de plantas, bem como a qualidade fisiológica de sementes de arroz (Oryza sativa L.) submetidas a diversas concentrações de cádmio. Sementes de arroz da cultivar BR-IRGA 410 foram semeadas em vasos plásticos contendo solo e irrigadas com concentrações crescentes (0; 0,2; 0,4; 0,6 e 0,8 mM) de CdCl2. Neste experimento realizou-se coletas sucessivas a intervalos regulares de 14 dias durante todo o ciclo de desenvolvimento da cultura, para avaliar as características de crescimento, a partição de assimilados, as alterações nos pigmentos fotossintéticos e a atividade da guaiacol peroxidase nas plantas em desenvolvimento. Além disso, ao final do ciclo reprodutivo, as sementes provenientes das plantas de arroz irrigadas com cádmio foram analisadas através de testes bioquímicos (açúcar, amido e proteína) e testes de viabilidade e vigor, sendo também avaliado o teor de cádmio nas sementes. O crescimento das plantas de arroz foi afetado negativamente com o incremento nas doses de cádmio. A presença de cádmio na solução do solo reduziu o acúmulo de matéria seca e a taxa de crescimento de todos os órgãos da planta, ocasionando diminuição drástica no número total de sementes e no número de sementes potencialmente viáveis, aumentando fortemente a porcentagem de sementes abortadas. Os teores de clorofilas e carotenóides decresceram e a atividade da guaiacol peroxidase aumentou nas folhas com o incremento da concentração de cádmio. As sementes de arroz apresentaram alterações quantitativas nos seus constituintes de reserva, mas a viabilidade e o vigor dessas sementes não sofreram modificações. Além disso, os íons de cádmio foram facilmente translocados para os grãos de arroz, inviabilizando o uso dos grãos para consumo humano. Desta maneira, se pode inferir que o cádmio é um elemento extremamente fitotóxico, podendo adentrar na nossa cadeia alimentar e causar sérios problemas para a saúde.

Made available in DSpace on 2014-08-20T14:06:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_naciele_marini.pdf: 2585701 bytes, checksum: 33b5a6dcb2a064ddfbf3b977f715ecff (MD5) Previous issue date: 2013-12-07 / There is a constant need for studies aiming to increase yield and quality traits in rice, which have to consider abiotic stress tolerance and genetic variability. This work had as objective to characterize rice mutant families regarding rice iron stress tolerance and validate a technique based on retrotransposons with the goal of detecting genetic variability in rice. Also, to analyse gene expression of genes involved in starch synthesis in the rice grain. Therefore, nine mutant families were characterized for phenotypic traits and iron content in hydroponic conditions. Twenty genotypes were molecularly characterized with the REMAP technique and three cultivars were analysed the profiled for starch biosynthesis related gene expression by qRT-PCR. The results obtained demonstrate that the genotypes BR-IRGA 409 and BRS7-Taim characterized as sensitive presented a higher accumulation of Fe2+ in the shoots. The mutant families CGF-Z-M9-444CD, CGF-Z-M9-328 and CGF-Z-M9-243, were ranked in this study as tolerant. The genotype CGF-Z-M9-444CD was one of the mutants that accumulated less iron in the tissues under stress conditions, being also characterized as resistant in the phenotypic analysis. The variables root length, number of roots, iron, zinc and manganese, were altered in response to hydroponic culture growth with excess iron. In the gene expression study, it was possible to detect contrasting genotypes regarding amylose content presented differential expression for some of the analysed genes. Some of these genes have their expression levels altered at the beginning of starch biosynthesis, suggesting a higher contribution at the beginning of grain filling and other genes at the end of grain maturation. There is a tendency, mainly, for the cultivar BRS Firmeza, to increase the activity of studied genes 20 days after flowering with a decrease at 25 days after flowering and a new increase at 30 days after flowering, indicating an association between the activity of these genes and the stay-green character and the late starch accumulation in this genotype. Also, according with the studies performed, it was possible to measure the genetic variability in the rice germplasm used using the REMAP with a combination of low cost and simple protocols. Therefore, it is possible to discriminate genotypes at DNA level with the goal of predicting genetic distance and directed crosses between elite genotypes, thus exploiting population variability and transgressive segregants within breeding programs / Existe a constante necessidade de estudos visando o aumento da produtividade e da qualidade de grãos de arroz, auxiliados por avaliações de tolerância a estresses abióticos e, detecção da variabilidade genética. Portanto, este trabalho teve por objetivo caracterizar famílias mutantes de arroz quanto à tolerância ao estresse por toxidez de ferro, validar uma técnica de marcadores moleculares baseados em retrotransposons, com o intuito de detectar variabilidade genética em genótipos de arroz e analisar a expressão dos genes envolvidos na síntese do amido no endosperma de grãos de arroz. Sendo assim, nove famílias mutantes foram caracterizadas para caracteres fenotípicos e conteúdo de ferro em condições de hidroponia. 20 genótipos foram caracterizados com a técnica de REMAP e três cultivares de arroz tiveram a sua expressão gênica caracterizada por qRT-PCR. Os resultados obtidos demonstram que os genótipos BR-IRGA 409 e BRS 7 Taim, apresentam maior acúmulo de Fe2+ na parte aérea. As famílias de mutantes CGF-Z-M9-444CD, CGF-Z-M9-328 e CGF-Z-M9-243 foram classificadas neste estudo como tolerantes. O genótipo CGF-Z-M9-444CD foi um dos mutantes que menos acumulou ferro nos tecidos sob condição de estresse, sendo também caracterizado como tolerantes na analise visual. As variáveis comprimento de raiz, número de raiz, ferro, zinco e manganês, sofreram alterações em resposta ao estresse por ferro em condições hidropônicas. No estudo de expressão gênica para qualidade de grão foi possível constatar que constituições genéticas contrastantes quanto ao teor de amilose apresentam expressão diferencial para alguns genes analisados. Alguns destes genes tem seus níveis de expressão alterados no início do desenvolvimento do endosperma, indicando uma maior contribuição no inicio do enchimento dos grãos e que outros genes tem maior atividade no final do ciclo de desenvolvimento. Existe uma tendência, principalmente, para a cultivar BRS Firmeza de aumento na atividade dos genes estudados aos 20 dias após o florescimento com um declínio aos 25 dias após o florescimento e um aumento novamente aos 30 dias após o florescimento, evidenciando a relação existente entre a atividade destes genes com o caráter stay-green e a acumulação tardia de amido no endosperma deste genótipo. Também de acordo com os estudos realizados foi possível mensurar a variabilidade genética no germoplasma de arroz utilizando a técnica REMAP com baixo custo de execução e sem a demanda de equipamentos caros. Assim, é possível identificar indivíduos mais diferentes a nível de DNA, com o objetivo de utilizar essa informação para a realização de cruzamentos entre genitores distantes geneticamente, explorando assim a variabilidade em populações de segregantes transgressivos dentro de programas de melhoramento.

Made available in DSpace on 2014-08-20T14:06:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese _Mauricio_ Marini_ Kopp.pdf: 840580 bytes, checksum: aa13499ffc402e82213fc46d39ba5dd0 (MD5) Previous issue date: 2008-04-07 / Hydromorphic soils present as main feature a reduced natural drainage ability, being mostly used for growing irrigated rice. Thus, the occurrence of anaerobic conditions associated to the presence of organic matter enables the development of anaerobic microorganisms which, while decomposing the organic matter, generate phytotoxic substances represented mainly by short chain aliphatic organic acids. The selection of promising genotypes adapted for use in these situations requires complicated field evaluations, which can be simulated under hydroponic culture. The research was composed of four articles that had as major goals to establish an adequate methodology for growing rice under organic acid rich hydroponic culture. The first work aimed at determining the range of concentrations and response variables most indicated for evaluating rice genotypes under hydroponics. The effects of six different concentrations for the three major acids formed in the soil: acetic (0; 4; 8; 12; 16 and 20 mM), propionic (0; 3; 6; 9; 12 and 15 mM) and butyric (0; 2; 4; 6; 8 and 10 mM) acids in two genotypes of high divergence (BRS 7-TAIM and SAIBAN). The results indicated that the most adequate concentration range for organic acid studies in rice are between 15.8 and 8.4; 9.1 and 4.2 and 7.7 and 3.7 mM for acetic, propionic and butyric acids, respectively. Also, the most responsive variable was root length. The second experiment had as goal to determine, under hydroponics, the influence of the pH level used in the hydroponic solution on the phytotoxicity caused by acetic, propionic and butyric acids in rice, as well as the performance of some variables currently used in studies of abiotic stress tolerance in hydroponic systems. For this experiment, three acids (acetic, propionic and butyric) and four pH (4.0; 5.0; 6.0 and 7.0) levels were evaluated. The results allow one to conclude that reduced pH levels increase the phytotoxicity of all acids. The root and shoot lengths have independent behavior from the acid used, as opposite to root number and root and shoot dry matter. Root length was the variable most affected by the treatments. The third article had as objective to evaluate the response of 25 rice genotypes to the phytotoxic effect of acetic, propionic and butyric acids, individually. In this work, 4 treatments were used for each acid: 0 (control); 4; 8 and 12 mM for acetic; 0; 3; 6 and 9 mM for propionic and 0; 2; 4 and 6 mM for butyric acid, respectively. The variables measured were root (CR) and shoot (CPA) length, root number (NR) and root (MSR) and shoot (MSPA) dry matter. The relative performance of the variable CR was the most affected by the acids and the regressions established for this variable revealed ix ix tolerant and sensitive genotypes to organic acids, with 6; 6 and 9 tolerant genotypes for acetic, propionic and butyric acids, respectively. It was observed a higher number of tolerant genotypes on the japonica than on the indica group. The fourth experiment had as objective to evaluate the response of 20 rice cultivars to the interactive phytotoxic effect of acetic, propionic and butyric acids. In these work, four treatments, 0 (control); 3; 6 and 9 mM were used, consisting of the mixture of three acids (acetic, propionic and butyric) at a 6:3:1 ratio. The variables measured were root (CR) and shoot (CPA) length, root number (NR) and root (MSR) and shoot (MSPA) dry matter, phosphorus (P) and potassium (K) content. The results indicated significant differences between the genotypes evaluated for the characters CR, CPA, P and K. Four genotypes were ranked as tolerants. The variable CR associated to CPA, P and K are indicated for the selection of tolerant genotypes. The results obtained allowed one to establish an adequate methodology for the selection of rice genotypes under hydroponic systems combined with organic acid stress (acetic, propionic and butyric) as well as to select promising genotypes regarding their response to this stress. / Os solos do tipo hidromórfico apresentam como característica principal uma reduzida capacidade de drenagem natural, sendo utilizados principalmente para cultivo de arroz irrigado. Assim, a ocorrência de condições anaeróbias associada com a presença de matéria orgânica favorece o desenvolvimento de microrganismos anaeróbios que causam a fermentação desta matéria orgânica produzindo substâncias fitotóxicas representadas principalmente pelos ácidos orgânicos alifáticos de cadeia curta. A seleção de constituições genéticas de arroz promissoras e adaptadas para utilização nestas situações requer avaliações de difícil execução a campo, sendo simplificada com a utilização de sistemas hidropônicos. A pesquisa foi composta de quatro trabalhos que tiveram como objetivo principal estabelecer uma metodologia adequada para estudos com ácidos orgânicos em arroz mediante cultivo hidropônico. O primeiro trabalho determinou a faixa de concentrações e variáveis resposta mais indicadas para avaliações de genótipos de arroz em hidroponia. Foram estudados os efeitos de seis concentrações dos três principais ácidos formados no solo: ácido acético (0; 4; 8; 12; 16 e 20 mM), ácido propiônico (0; 3; 6; 9; 12; e 15 mM) e ácido butírico (0; 2; 4; 6; 8 e 10 mM) em dois genótipos de elevada divergência (BRS 7-TAIM e SAIBAN). Os resultados indicam que as faixas de concentração mais adequadas para estudos de tolerância de arroz a ácidos orgânicos estão entre 15,8 e 8,4; 9,1 e 4,2 e 7,7 e 3,7 mM para os ácidos acético, propiônico e butírico respectivamente, e a variável mais responsiva foi comprimento de raízes. O segundo experimento teve como objetivo determinar, em hidroponia, a influência do nível de pH utilizado na solução hidropônica na fitotoxidade causada pelos ácidos acético, propiônico e butírico em arroz, bem como o desempenho de algumas variáveis atualmente utilizadas em estudos de tolerância a estresses abióticos em sistemas hidropônicos. Neste experimento, foram avaliados três ácidos (acético, propiônico e butírico) e quatro níveis de pH (4,0; 5,0; 6,0 e 7,0). Os resultados permitem concluir que níveis reduzidos de pH aumentam a fitotoxidez de todos os ácidos. Os comprimentos de raízes e parte aérea têm comportamento independente do ácido utilizado, ao contrário do número de raízes e matérias secas de raízes e parte aérea. O comprimento de raízes foi a variável mais afetada pelo efeito das doses. O terceiro trabalho teve como objetivo avaliar a resposta de 25 genótipos de arroz à ação fitotóxica dos ácidos acético, propiônico e butírico individualmente. Neste trabalho foram utilizadas quatro doses para cada ácido: 0 vii vii (testemunha); 4; 8 e 12 mM para ácido acético; 0; 3; 6 e 9 mM para ácido propiônico e 0; 2; 4 e 6 mM para ácido butírico As variáveis mensuradas foram comprimento de raízes (CR) e parte aérea (CPA), número de raízes (NR) e matéria seca de raízes (MSR) e parte aérea (MSPA). O desempenho relativo da variável CR foi o mais afetado pelos ácidos e as regressões estabelecidas para essa variável revelaram genótipos tolerantes e sensíveis aos ácidos orgânicos, com seis; seis e nove genótipos tolerântes para os ácidos acético, propiônico e butírico, respectivamente. Foi constatado ainda maior número de tolerantes no grupo japonica do que no indica. O quarto experimento teve como objetivo avaliar a resposta de 20 genótipos de arroz a ação fitotóxica interativa dos ácidos acético, propiônico e butírico. Neste trabalho foram utilizados quatro doses, 0 (testemunha); 3; 6 e 9 mM, que foram constituídos da mistura dos três ácidos (acético, propiônico e butírico) na relação 6:3:1. As variáveis mensuradas foram comprimento de raízes (CR) e parte aérea (CPA), número de raízes (NR) e matéria seca de raízes (MSR) e parte aérea (MSPA), teor de fósforo (P) e de potássio (K). Os resultados demonstraram diferenças significativas entre os genótipos avaliados nos caracteres CR, CPA, P e K. Quatro genótipos foram classificados como tolerantes. A variável CR associada a CPA, P e K são indicadas para seleção de genótipos tolerantes. Os resultados obtidos pelos trabalhos permitiram estabelecer uma metodologia adequada para utilização em seleção de genótipos de arroz mediante sistemas de hidroponia sob estresse por ácidos orgânicos (acético, propiônico e butírico) bem como selecionar genótipos promissores quanto a resposta à este estresse.

The blast rice, caused of fungus Pyricularia oryzae is the most important rice crop disease and can cause up to 100% crop damage. The cultural, varietal and chemical management at the field level and the monitoring and knowledge of in vitro blast isolates sensitivity are essential tools for better understanding and control of this disease. The objective of this project was to evaluate the effect of the fungicides most used in blast control in three cultivars of irrigated rice in two sowing seasons and to determine in vitro the sensitivity of the mycelial growth of two isolates of P. oryzae to the same fungicides: Triciclazole, Tebuconazole, Azoxystrobin, Trifloxystrobin + Tebuconazole and Casugamycin. For that, an experiment was carried at the field level in the 2015/2016 cropseason in Santa Maria-RS and another experiment in the laboratory. In the first experiment the cultivars used were Guri INTA CL, Puitá INTA CL and IRGA 424 RI sown in the beginning and end of the recommended period and submitted to the same fungicides. The second experiment tested the fungicides at concentrations of 0, 0.01, 0.1, 1, 10 and 100 ppm in two isolates of blast. It was concluded that the cultivar IRGA 424 IR showed to be resistant to blast and that for the maintenance of productive levels in the cultivars susceptible to P. oryzae, especially in the second sowing season, the adoption of more efficient fungicides is indispensable. In relation to mycelial growth in vitro, the first insensitivity of a P. oryzae isolate to the active ingredients Triciclazol and Azoxystrobin was verified at the national level. / A brusone, causada pelo fungo Pyricularia oryzae, é a doença mais importante da cultura do arroz, podendo causar até 100% de prejuízos à cultura. O manejo cultural, varietal e químico a nível de campo bem como o monitoramento e conhecimento da sensibilidade in vitro de isolados de brusone, são ferramentas imprescindíveis para o melhor entendimento e controle desta doença. O objetivo deste projeto, foi avaliar o efeito dos fungicidas mais utilizados no controle de brusone, em três cultivares de arroz irrigado, em duas épocas de semeadura e determinar in vitro a sensibilidade do crescimento micelial de dois isolados de P. oryzae aos mesmos fungicidas: Triciclazol, Tebuconazole, Azoxistrobina, Trifloxistrobina + Tebuconazole e Casugamicina. Para tal, foi realizado um experimento em nível de campo na safra 2015/2016 em Santa Maria-RS e outro experimento em laboratório. No primeiro experimento foram utilizadas as cultivares GURI INTA CL, PUITÁ INTA CL e IRGA 424 RI, semeadas no início e no final da época recomendada e essas submetidas aos mesmos fungicidas. O segundo experimento, testou os fungicidas anteriormente citados nas concentrações de 0, 0.01, 0.1, 1, 10 e 100 ppm em dois isolados de brusone. Concluiu-se que a cultivar IRGA 424 RI mostrou-se resistente à brusone e que para a manutenção dos patamares produtivos nas cultivares suscetíveis a P. oryzae, principalmente na segunda época de semeadura, torna-se necessário a adoção de fungicidas mais eficientes. Em relação ao crescimento micelial in vitro, constatou-se à nível nacional, a primeira insensibilidade de um isolado de P. oryzae aos ingredientes ativos Triciclazol e Azoxistrobina.

Made available in DSpace on 2014-07-29T16:16:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao july ana s tavares.pdf: 2960047 bytes, checksum: db90116ac492ad8556d54577789f08f3 (MD5) Previous issue date: 2010-10-01 / Rice is a cereal consumed primarily as whole grain, and its composition and fractions are subject to varietal differences, environmental variations, handling, processing and storage. Broken grains of rice are fractions generated during processing and may represent between 14% and 60% of total grains. The processing of broken grains in the form of flour is an alternative to the use of this byproduct in the food industry. The thermal changes, such as toasting, could modify the sensory characteristics of rice flour due to the occurrence of reactions such as Maillard, and changes in the technological characteristics such as absorption capacity and water solubility, viscosity and amylose content. This research studied the influence of moisture content and toasting time in microwave on physical characteristics (size, modulus of fineness, color, viscosity, water absorption index and water solubility index) chemical (moisture, ash, crude protein, fat, carbohydrates and amylose content) and sensorial of raw rice flour and toasted of cultivars BRS Primavera, BRS Sertaneja and IRGA 417. We also determined the income benefit, whole grain and the degree of polishing of rice grains of these cultivars and scanning electron microscopy of some raw flour and toast. He was employed a Central Composite Rotational Design (CCRD), which includes a factor of 22 over 3 replications at the central point and axial 4, totaling 11 treatments for each cultivar. The cv. BRS Sertaneja presents higher income benefit, while cv. IRGA 417 has a higher yield of integers and degree of polish. The cv. BRS Primavera has a higher percentage of broken grains may be suitable for production of flour. The flour of raw rice and toast were placed between thin and medium. The color of the raw flours from three cultivars are significantly different. The toasting process causes the darkening, reddening and yellowing of the meal toast. The humidification followed by toasting in microwave rice flours from three cultivars did decrease the formation of paste, moisture, protein, lipid and amylose, increasing the absorption index and water solubility and ash content, and carbohydrates . The Free Profile enabled to differentiate the samples on the cultivar and time of toasting. The longer, the flour toasts were characterized with more intense flavor and aroma of toasted and / or burned, and granularity in appearance and texture. / O arroz é um cereal consumido principalmente como grão inteiro, sendo que sua composição e de suas frações estão sujeitas às diferenças varietais, variações ambientais, de manejo, de processamento e de armazenamento. Grãos quebrados são frações de arroz gerados durante o beneficiamento e podem representar entre 14% e 60% do total dos grãos beneficiados. O processamento de grãos quebrados sob a forma de farinha é alternativa para uso deste subproduto na indústria de alimentos. As modificações térmicas, como a torração, poderiam modificar as características sensoriais da farinha de arroz devido à ocorrência de reações como a de Maillard, além de modificações nas características tecnológicas como capacidade de absorção e solubilidade em água, viscosidade de pasta e teor de amilose. Este trabalho objetivou verificar a influência das variáveis umidade e tempo de torra em micro-ondas sobre as características físicas (granulometria; módulo de finura; cor; viscosidade; índice de absorção de água e índice de solubilidade em água), químicas (umidade, cinzas, proteína bruta, lipídios, carboidratos e o teor de amilose) e sensorial das farinhas de arroz cruas e torradas das cultivares BRS Primavera, BRS Sertaneja e IRGA 417. Foram também determinados a renda do benefício, rendimento de inteiros e grau de polimento dos grãos de arroz destas cultivares, além de microscopia eletrônica de varredura de algumas farinhas cruas e torradas. Foi empregado um Delineamento Composto Central Rotacional (DCCR), que inclui um fatorial de 22 mais 3 repetições no ponto central e 4 axiais, totalizando 11 tratamentos para cada cultivar. A cv. BRS Sertaneja apresenta maior renda do benefício, enquanto a cv. IRGA 417 possui maior rendimento de inteiros e grau de polimento. A cv. BRS Primavera possui maior porcentagem de grãos quebrados podendo ser indicada para produção de farinha. As farinhas de arroz cruas e torradas foram classificadas entre muito fina e média. A cor das farinhas cruas das três cultivares são significativamente diferentes. O processo de torra provoca o escurecimento, avermelhamento e amarelamento das farinhas torradas. A umidificação seguida de torra em micro-ondas nas farinhas de arroz das três cultivares fez diminuir a formação de pasta, a umidade, o teor protéico, lipídico e de amilose, aumentando o índice de absorção e solubilidade em água e o conteúdo de cinzas e carboidratos. O Perfil Livre permitiu diferenciar as amostras quanto a cultivar e o tempo de torra. Quanto maior o tempo, as farinhas torradas caracterizaram-se com aroma e sabor mais intenso de torrado e/ou queimado, além de granulosidade na aparência e textura.

Orientador: Ricardo Antonio Ferreira Rodrigues / Banca: Marcelo Andreotti / Banca: Marlene Cristina Alves / Resumo: O arroz é o principal alimento consumido pela população brasileira, demonstrando assim a importância sócio-econômica que este cereal representa para a economia nacional. O trabalho teve por objetivo avaliar o comportamento de cultivares de arroz (Primavera e Maravilha) em função do preparo do solo com arado de aiveca, sistema plantio direto e manejo de água, em um LATOSSOLO VERMELHO de cerrado, na área experimental da Faculdade de Engenharia - UNESP, Campus de Ilha Solteira, localizada em Selvíria (MS). Trabalhou-se com dois manejos de água, calculados através do Kc e aplicados por um sistema de irrigação por aspersão, controlado pelo tanque "Classe A" e água proveniente apenas da chuva. O delineamento experimental adotado foi de blocos ao acaso, no esquema de parcelas subdivididas com quatro repetições, sendo as mesmas constituídas pelos manejos de água e as subparcelas pelos cultivares. Durante o desenvolvimento do trabalho foram realizadas as seguintes avaliações: número de dias para o florescimento, características físicas do solo, altura de planta, número de colmos e de panículas m-2, colmos férteis, número de grãos/panícula, fertilidade das espiguetas, renda de benefício, rendimento de grãos, massa de 100 grãos, massa hectolítrica e produtividade. De acordo com os resultados obtidos nas condições em que foi conduzido o experimento, concluiu-se que os sistemas de cultivo não apresentaram diferenças para a densidade do solo, a macro e microporosidade nas profundidades de 0,0 a 0,05 m e 0,30 a 0,35 m. A irrigação suplementar proporcionou maior produtividade à cultura do arroz de terras altas. O cultivar Maravilha é mais indicado para o sistema de manejo, do solo com o arado de aiveca. O preparo do solo com arado de aiveca comparado ao sistema plantio direto propiciou maior produtividade do arroz de terras altas. / Abstract: Rice is the main food consumed by people, demonstrating the social-economic importance that this cereal represents for national economy. The present work was developed to evaluate rice cultivars (Primavera and Maravilha) under no till and mold-board plow and water management, in a Red Latosol of Brazilian Cerrado, in an experimental area at Faculdade de Engenharia - UNESP, Campus de Ilha Solteira, situated in Selvíria (MS). Were evaluated two different water management, one calculated by Kc and used sprinkle irrigation, controlled by Class A tank, and the rain water. The experiment design was randomized blocks in a split plot scheme with four repetitions, being water management in the plots and the cultivars in the sub plots. The following evaluations were done: numbers of days for flowering, soil physical characteristics, plant height,number of stems and panicles per m-2, numbers of stems/panicles, number of grains/panicles, spikelet fertility, processing efficiency, grains yield, mass of 100 grains, hectoliter mass and yield. According to the results obtained under the conditions that the experiment was carried out, concluded that Primavera cultivar obtained better values for yield parameters. Bulk density, macro and micro porosity had the same values for the depths of 0,0 to 0,05 m and 0,30 a 0,35 m on both tillage systems. The different water regimes did not affect soil structure. Additional irrigation provided higher yields to the upland rice crop. The cultivar Maravilha is the most indicated for the mold-board plow tillage of the soil. The tillage with this equipament provided a higher yield for up land rice. / Mestre

Orientador: Orivaldo Arf / Resumo: O sistema de produção baseado na sucessão de culturas, assim como a sucessão entre soja e milho no Brasil, não se sustenta ao longo dos anos. Assim, a inserção de plantas de cobertura, bem como o cultivo do arroz substituindo parte da área de soja, podem ser opções para beneficiar o sistema agrícola no Cerrado. O objetivo foi avaliar a adoção de plantas de cobertura no cultivo do arroz de terras altas, da soja e o efeito no milho segunda safra consorciado com Urochloa. O projeto foi constituído por três subprojetos. Subprojeto 1: Sistemas de produção para arroz de terras altas com o uso de plantas de cobertura. Subprojeto 2: Sistemas de produção para soja com o uso de plantas de cobertura. Subprojeto 3: Milho segunda safra consorciado com Urochloa ruziziensis, cultivado sobre palhada de arroz e soja, em função de plantas de cobertura. Foram utilizadas seis plantas de cobertura [milheto (Pennisetum americanum), crotalária (Crotalaria juncea), guandu (Cajanus cajan), milheto + crotalária, milheto + guandu e pousio] semeadas na primavera. O delineamento experimental para o arroz e soja foi o de blocos casualizados, com seis tratamentos e 4 repetições. O delineamento para o milho foi o de blocos casualizados, com esquema em faixas, com 4 repetições. O estudo foi realizado no município de Selvíria – MS, na região de Cerrado, sobre um Latossolo Vermelho Distrófico, conduzido no período de setembro de 2014 a setembro de 2016, com o uso de irrigação suplementar. Subprojeto 1 – No cul... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The production system based on the succession of cultures as well as the sequence between corn and soybean in Brazil, does not hold up over the years. Thus, the inclusion of cover crops, and rice cultivation by replacing part of the soybean area may be options to benefit the agricultural system in the Cerrado. The objective was to evaluate the adoption of cover crops in the cultivation of upland rice, soybean and the effect on maize second crop intercropped with Urochloa. The project consisted of three subprojects. Subproject 1: Production systems for upland rice with the use of cover crops. Subproject 2: Soybean production systems with the use of cover crops. Subproject 3: Maize second crop intercropped with Urochloa ruziziensis cultivated on rice and soybean straw, as a function of cover crops. Six cover crops were used [millet (Pennisetum americanum), sunn hemp (Crotalaria juncea), pigeon pea (Cajanus cajan), millet + sunn hemp, millet + pigeon pea and fallow] soothed in the spring. The experimental design for rice and soybean was randomized blocks, with six treatments and 4 replications. The design for maize was randomized blocks, with a scheme in strips, with 4 replications. The study was conducted in Selvíria - MS in the Cerrado region, on a Oxisoil, conducted from September 2014 to September 2016, with the use of supplemental irrigation. Subproject 1 – In the cultivation of upland rice, the consortium millet + sun hemp provides greater accumulation of straw, macronutri... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

by Ng Wing Man. / Thesis (M.Phil.)--Chinese University of Hong Kong, 2005. / Includes bibliographical references (leaves 156-174). / Abstracts in English and Chinese. / Acknowledgements --- p.iii / Abstract --- p.v / 摘要 --- p.vii / Table of Contents --- p.ix / List of Figures --- p.xiii / List of Tables --- p.xvi / List of Graphs --- p.xvii / List of Abbreviations --- p.xviii / Chapter Chapter 1 --- General Introduction --- p.1 / Chapter Chapter 2 --- Literature Review --- p.3 / Chapter 2.1 --- Human granulocyte colony-stimulating factor (hG-CSF) --- p.3 / Chapter 2.1.1 --- Historical background --- p.3 / Chapter 2.1.2 --- Physiological Roles --- p.5 / Chapter 2.1.3 --- Molecular properties --- p.8 / Chapter 2.1.4 --- Biochemical properties --- p.9 / Chapter 2.1.5 --- Comparison to G-CSF of other species --- p.11 / Chapter 2.1.6 --- Biological Activities --- p.12 / Chapter 2.1.7 --- Clinical Applications --- p.14 / Chapter 2.1.7.1 --- Clinical use in myelosuppressive chemotherapy and neutropenic fever --- p.14 / Chapter 2.1.7.2 --- Clinical use in bone marrow transplantation (BMT) and peripheral blood progenitor cell (PBPC) transplantation --- p.14 / Chapter 2.1.7.3 --- Clinical use in HIV infection --- p.16 / Chapter 2.1.7.4 --- Clinical use in diabetes mellitus --- p.17 / Chapter 2.1.7.5 --- Clinical use in severe chronic neutropenia --- p.18 / Chapter 2.1.7.6 --- Future prospects --- p.18 / Chapter 2.1.7.7 --- Dosages and adverse effects --- p.19 / Chapter 2.1.8 --- Economic value --- p.20 / Chapter 2.2 --- Plant as bioractor --- p.20 / Chapter 2.2.1 --- Medical molecular farming --- p.20 / Chapter 2.2.2 --- Commercial biopharmaceutical proteins --- p.25 / Chapter 2.2.3 --- Transgenic plants producing hematopoietic growth factors --- p.25 / Chapter 2.2.3.1 --- Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor (GM-CSF) --- p.26 / Chapter 2.2.3.2 --- Interleukin-2 (IL-2) --- p.28 / Chapter 2.3 --- Rice as expression system --- p.29 / Chapter 2.3.1 --- Characteristics --- p.29 / Chapter 2.3.2 --- Advantages of using rice as bioreactor --- p.30 / Chapter 2.3.3 --- Previous studies --- p.31 / Chapter 2.3.4 --- Transformation method --- p.33 / Chapter 2.3.5 --- Super-binary vector --- p.34 / Chapter 2.4 --- Strategies for enhancing protein expression level --- p.36 / Chapter 2.4.1 --- Vacuolar targeting --- p.36 / Chapter 2.4.1.1 --- Protein targeting signals --- p.38 / Chapter 2.4.1.2 --- Binding protein of 80kDa (BP-80) --- p.39 / Chapter 2.4.1.3 --- a-Tonoplast intrinsic protein (α-TIP) --- p.39 / Chapter 2.4.1.4 --- Receptor homology region-transmembrane domain-Ring H2 motif (RMR) --- p.40 / Chapter 2.4.2 --- Fusion with glutelin in rice --- p.41 / Chapter 2.5 --- Hypotheses and aims of this study --- p.43 / Chapter Chapter 3 --- Materials and Methods --- p.45 / Chapter 3.1 --- Introduction --- p.45 / Chapter 3.2 --- Chemicals --- p.45 / Chapter 3.3 --- Bacterial strains --- p.46 / Chapter 3.4 --- Chimeric genes construction --- p.46 / Chapter 3.4.1 --- Protein targeting constructs --- p.51 / Chapter 3.4.2 --- Enterokinase site constructs --- p.60 / Chapter 3.4.3 --- Glutein signal peptide constructs --- p.65 / Chapter 3.4.4 --- Glutelin fusion constructs --- p.70 / Chapter 3.4.5 --- Sequence fidelity of chimeric genes --- p.77 / Chapter 3.4.6 --- Cloning of chimeric genes into rice super-binary vector --- p.77 / Chapter 3.5 --- Rice transformation --- p.79 / Chapter 3.5.1 --- Plant materials --- p.79 / Chapter 3.5.2 --- Agrobacterium transformation --- p.79 / Chapter 3.5.3 --- A grobacterium-mediated transformation of rice --- p.79 / Chapter 3.6 --- Transgenic expression --- p.81 / Chapter 3.6.1 --- Extraction of leaf genomic DNA --- p.81 / Chapter 3.6.2 --- Synthesis of DIG-labeled double-stranded DNA probe --- p.82 / Chapter 3.6.3 --- Southern blot analysis --- p.83 / Chapter 3.6.4 --- Extraction of total RNA from immature rice seeds --- p.84 / Chapter 3.6.5 --- Northern blot analysis --- p.85 / Chapter 3.6.6 --- Protein extraction --- p.86 / Chapter 3.6.7 --- Tricine SDS-PAGE --- p.86 / Chapter 3.6.8 --- Western blot analysis --- p.87 / Chapter 3.6.9 --- Enterokinase digestion of EK fusion proteins --- p.88 / Chapter 3.7 --- Confocal immunoflorescence studies of rhG-CSF in rice grain --- p.89 / Chapter 3.7.1 --- Preparation of sample sections --- p.89 / Chapter 3.7.2 --- Double-labeling of fluorescence probes --- p.89 / Chapter 3.7.3 --- Image collection --- p.90 / Chapter 3.8 --- Functional analysis of rhG-CSF --- p.91 / Chapter 3.8.1 --- Culture of NFS-60 cells --- p.91 / Chapter 3.8.2 --- MTT cell proliferation assay --- p.92 / Chapter 3.9 --- Bacterial expression of anti-hG-CSF --- p.93 / Chapter 3.9.1 --- pET expression in E. coli --- p.93 / Chapter 3.9.2 --- Purification of His-hG-CSF --- p.97 / Chapter 3.9.3 --- Immunization of rabbits --- p.97 / Chapter Chapter 4 --- Results --- p.99 / Chapter 4.1 --- Construction of chimeric genes for rice transformation --- p.99 / Chapter 4.2 --- "Rice transformation, selection and regeneration" --- p.103 / Chapter 4.3 --- Southern blot analysis --- p.105 / Chapter 4.4 --- Northern blot analysis --- p.109 / Chapter 4.5 --- Western blot analysis --- p.114 / Chapter 4.6 --- Enterokinase digestion of EK fusion proteins --- p.125 / Chapter 4.7 --- Confocal immunofluorescence studies of rhG-CSF in transgenic rice grain --- p.128 / Chapter 4.8 --- Functional analysis of rhG-CSF --- p.132 / Chapter 4.9 --- Bacterial expression of anti-hG-CSF --- p.135 / Chapter 4.9.1 --- Expression and purification of recombinant His-hG-CSF in E. coli --- p.135 / Chapter 4.9.2 --- Titer and specificity of the anti-serum --- p.137 / Chapter Chapter 5 --- Discussion --- p.139 / Chapter 5.1 --- Introduction --- p.139 / Chapter 5.2 --- Fusion of hG-CSF with protein sorting determinants --- p.141 / Chapter 5.3 --- Fusion of hG-CSF with rice glutelin --- p.145 / Chapter 5.4 --- Glutelin signal peptide --- p.146 / Chapter 5.5 --- O-glycosylation --- p.148 / Chapter 5.6 --- Enterokinase digestion --- p.148 / Chapter 5.7 --- Expression level of rhG-CSF --- p.149 / Chapter 5.8 --- Functional analysis of rhG-CSF --- p.151 / Chapter 5.9 --- Future perspectives --- p.151 / Chapter Chapter 6 --- Conclusion --- p.155 / References --- p.156

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O trabalho foi conduzido em três etapas: a) ajuste de procedimentos de preparo das sementes de arroz para condução do teste de tetrazólio, para tanto foram utilizados sementes de quatro cultivares de arroz irrigado e duas de sequeiro, cada uma composta por dois lotes. Sendo testado quanto à necessidade da remoção da casca (pálea e lema) e corte das sementes; b) estudo de concentrações do sal de tetrazólio, período de pré-condicionamento e de coloração para avaliar a viabilidade de sementes de arroz. Nesta etapa foram utilizadas as mesmas cultivares da primeira etapa, cada uma composta por um lote, sendo utilizadas as metodologias que apresentaram os melhores resultados na etapa anterior. Foram avaliadas diferentes concentrações do Sal de Tetrazólio (0,1; 0,25; 0,5 e 1,0%), três tempos de coloração (0,5; 1 e 2h), cinco períodos de hidratação (0,5; 1; 2; 3 e 4h) das sementes e duas temperaturas de embebição (35 e 40 °C); c) estimativa do vigor das sementes pelo teste de tetrazólio, utilizando-se sementes de dez lotes da cultivar Irga 424. Foram estabelecidas quatro classes de viabilidade (sementes viáveis de alto vigor, viáveis de médio vigor, viáveis de baixo vigor e não viáveis e mortas). Os resultados indicaram que para a avaliação da viabilidade de sementes de arroz pelo teste de tetrazólio é recomendável a remoção da pálea e lema, sendo mais eficiente o corte longitudinal na metade distal do eixo embrionário. O período de execução do teste de tetrazólio para sementes de arroz pode ser reduzido para três horas, utilizando hidratação das sementes por 1h a 40°C, 1h para as atividades de corte e avaliação e 1h para coloração na concentração de 0,25%. Dessa forma, é possível concluir que as metodologias propostas nessa pesquisa permitem avaliar a viabilidade de sementes de arroz pelo teste de tetrazólio; para avaliação do vigor o teste se mostrou promissor, porém necessitando de aprimoramento metodológico. / Calibration methodologies able to identify quickly and efficiently the quality of a lot of seeds through viability and vigor tests is constantly searched by seed technology. One of the most widely used tests for this purpose is the tetrazolium test, which methodological procedure for the rice crop still needs adjustments. This research aimed to study the preparation of alternatives, preconditioning and staining of rice seeds to evaluate the viability and establishing classes of viability to estimate the vigor of rice seed. The experiment was conducted in three stages: a) adjustment preparation procedures of rice seeds for conducting the tetrazolium test for both irrigated and upland plant varieties, were used four irrigated rice plant variety and two of upland plant variety, each consisting of two lots. It is tested on the need for removal of the shell (palea and lemma) and cut the seeds; b) study tetrazolium salt concentrations, preconditioning period and staining to evaluate the viability of rice seeds. At this stage, we used the same cultivars of the first stage, each consisting of a lot being used methodologies that showed the best results in the previous step. They were evaluated different concentrations of tetrazolium salt (0.1, 0.25, 0.5 and 1.0%) three times of staining (0.5, 1 and 2h), five periods of hydration seeds (0,5; 1, 2, 3 and 4h) and two soaking temperatures (35 and 40 ° C); c) estimate of seed vigor by the tetrazolium test, using ten seed lots of plant variety Irga 424 were established four viability classes (viable seeds of high vigor, viable medium vigor, viable low vigor and no viable and dead). The results indicated for the evaluation of viability of rice seed by tetrazolium testing is recommended to remove palea and lemma thereof and slitting the distal half of the embryonic axis is more efficient. The tetrazolium test execution period for rice seeds can be reduced to three hours using seed hydration for 1h at 40 ° C, for 1h cutting and evaluation activities and staining for 1h at 0.25% concentration. Thus, it leads to conclude that the proposed methodologies in this research to allow to evaluate the viability of rice seeds by the tetrazolium test; in order to evaluate vigor the test showed promise but needing methodological improvement.

Submitted by Maria Beatriz Vieira (mbeatriz.vieira@gmail.com) on 2017-04-26T13:48:20Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) tese_cassyo_de_araujo_rufino.pdf: 1782663 bytes, checksum: 48211778344c5f757ff01c4c9282d9b8 (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2017-05-02T18:29:29Z (GMT) No. of bitstreams: 2 tese_cassyo_de_araujo_rufino.pdf: 1782663 bytes, checksum: 48211778344c5f757ff01c4c9282d9b8 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2017-05-02T18:31:26Z (GMT) No. of bitstreams: 2 tese_cassyo_de_araujo_rufino.pdf: 1782663 bytes, checksum: 48211778344c5f757ff01c4c9282d9b8 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-02T18:31:51Z (GMT). No. of bitstreams: 2 tese_cassyo_de_araujo_rufino.pdf: 1782663 bytes, checksum: 48211778344c5f757ff01c4c9282d9b8 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-03-05 / Sem bolsa / A utilização de produtos naturais conjuntamente com nanopartículas de prata tem atraído interesse de pesquisadores, tanto do ponto de vista tecnológico quanto cientifico devido à ação desses produtos no controle de doenças e pragas. O objetivo desse trabalho foi testar produtos naturais (associados ou não a nanoprata) com ação antimicrobiana sobre Bipolaris oryzae, in vitro, e no tratamento de sementes de arroz. Para o estudo dos compostos contendo quitina e própolis adicionadas opcionalmente nanoprata foram utilizados sementes de arroz na cultivar IRGA 424 inoculadas com um isolado de Bipolaris oryzae. Os compostos utilizados são naturais, têm propriedades antiadesivas e atividade antimicrobiana contra microrganismos, possuem propriedades biocompatíveis e não fitotóxicas aos vegetais em geral. O processo de sínteses dos compostos contendo própolis, quitina e nanoprata, foi realizado por meio da aplicação de sonicação para a dispersão e mistura entre as substâncias. Foram testados os produtos no desenvolvimento e crescimento do fungo Bipolaris oryzae em placas de petri e em sementes de arroz infectadas. Os tratamentos foram: quitina, própolis, prata, quitina+própolis, quitina+própolis+nanoprata, quitina+prata, própolis+nanoprata e testemunha (T - sementes sem tratamentos), totalizando neste estudo 10 tratamentos. Logo a eficiência dos produtos e suas soluções foram testados por meio do blotter test (teste de sanidade de sementes), porcentagem de inibição e diâmetro de crescimento do fungo, germinação e comprimento de plântulas das sementes tratadas com os produtos. Os resultados demonstram que os oligômeros de quitosana e os compósitos de quitosana com extrato de própolis e nanopartículas de prata controlam o crescimento do patógeno. A importância deste achado reside no fato de que é um passo em direção ao objetivo de diminuir o uso de fungicidas químicos. A partir de testes de germinação poderá concluir-se que os melhores resultados foi o tratamento com quitosano/prata compósito NPs, com uma taxa de germinação de 91%. Os novos materiais poliméricos são considerados como muito promissores para o controle de Bipolaris oryzae no arroz, tornando-se assim alternativas ecológicas aos fungicidas químicos. / The use of natural products in conjunction with silver nanoparticles has attracted interest of many researches, from both scientific and technological point of view due to their action for disease and pests control. The objective was to test natural products (with or without nanosilver) with antimicrobial action against Bipolaris oryzae, in vitro, and in the treatment of rice seeds. To study the compounds containing chitin and propolis optionally added nanosilver rice seeds were used in IRGA inoculated with an isolated 424 Bipolaris oryzae. The compounds used are natural, have anti-adhesive properties and antimicrobial activity against microorganisms, have biocompatible properties and not phytotoxic to plants in general. The process of synthesis of compounds containing propolis, chitin and nanosilver was performed by applying the sonication for the dispersion and mixing of the substances. Products were tested on the development and growth of Bipolaris oryzae fungus in petri dishes and infected rice seeds. The treatments were: chitin, propolis, silver, chitin + propolis, chitin + Propolis + nanosilver, chitin + silver, propolis + nanosilver and control (T - treatments seeded), totaling 10 treatments in this study. The results were conclusive in showing that chitosan oligomers and the composites of chitosan with propolis extract and silver nanoparticles led to a remarkable reduction in growth of the pathogen. The importance of this finding lies in the fact that it is a step towards the goal of decreasing the use of chemical fungicides in plant pathology. From germination tests it could be concluded that the best results was the treatment with chitosan/silver NPs composite, with a germination rate of 91%. The novel polymeric materials can thus be deemed as very promising for the control of the Bipolaris oryzae of rice and pave the way towards eco-friendly alternatives to chemical fungicides.