Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-24T12:55:35Z No. of bitstreams: 1 Marcelo Augusto Soares Rego.pdf: 833356 bytes, checksum: 1a5a4f1c36e44f371f7effe11bc5b82f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-24T12:55:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Marcelo Augusto Soares Rego.pdf: 833356 bytes, checksum: 1a5a4f1c36e44f371f7effe11bc5b82f (MD5) Previous issue date: 2016-02-25 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Biofloc Technology (BFT) is considered an alternative, sustainable culture system of the marine shrimp Litopenaeus vannamei. However, there are doubts about its financial return in the short and long period of time, as well as uncertainties regarding losses caused by variations in major economic items and shrimp performance. The Thesis evaluated the economic viability, risk and the efficiency of BFT in comparison to a conventional system of a shrimp farm located in the State of Pernambuco, Brazil. Data for the BFT and conventional farming systems were obtained from 9 production cycles in three 625 m2 ponds lined with HDPE and 12 production cycles in the farm’s conventional ponds, respectively. Viability indicators were favorable for both systems, with greater expressiveness of net present value (NPV) for the BFT (R$ 353,591.00) and internal rate of return (IRR) 4.5 times greater for the conventional (131.86%). When used the Monte Carlo Method (MMC) it was found to BFT system the failure probability of 7%, 10% and 15% when combined with a discount rate of 10%, 13% and 16% respectively. According the Data Envelopment Analysis (DEA) four productions cycles (7.0%) were classified as technically efficient on the farm over the years 2013 and 2014. There was significant difference in the average technical efficiency scores of production systems. There was greater influence of management on the conventional system efficiency, while the production scale was the factor to influence the reduction of the average technical efficiency score of BFT system. The works provide useful information to improve the L. vannamei culture and give greater security to the investment in the BFT system by producers in the Northeast region of Brazil. Both culture systems represent important investment alternatives for the rural sector of Brazil, confirmed by the favorable results of profitability and viability. / A tecnologia de bioflocos (BFT) é apontada como uma alternativa para o cultivo sustentável do camarão marinho Litopenaeus vannamei. Porém, existem dúvidas quanto ao seu retorno financeiro, no curto e no longo período de tempo, como também incertezas relacionadas à probabilidade de perdas diante de variações futuras nos principais índices econômicos e de desempenho zootécnico. Assim, objetivou-se com os estudos avaliar aspectos relacionados à viabilidade econômica, ao risco e a eficiência dos sistemas BFT e convencional em fazenda de criação de camarão do litoral sul do estado de Pernambuco. Para a obtenção das informações necessárias para as análises, utilizaram-se três viveiros (625 m2 cada) forrados com polietileno de alta densidade (PEAD) operando nos moldes do sistema BFT e informações do sistema convencional da mesma fazenda. Na análise de investimento, os indicadores foram favoráveis para ambos os sistemas, com maior expressividade do valor presente líquido (VPL) para o BFT (R$ 353.591,00) e taxa interna de retorno (TIR) 4,5 vezes maior para o convencional (131,86%). Porém, através de simulações pelo Método de Monte Carlo (MMC), verificou-se risco apenas no sistema BFT, com probabilidade de 7, 10 e 15% quando submetido à taxa de desconto de 10, 13 e 16%, respectivamente. Ao avaliar os ciclos produtivos da fazenda ao longo de 2013 e 2014, por meio da análise envoltória de dados (DEA), detectaram-se apenas quatro produções (7,0%) eficientes tecnicamente. Ao comparar os sistemas produtivos, verificou-se diferença significativa nos escores médios de eficiência técnica destes. Em relação às operações dos ciclos produtivos, foi constatada uma maior influência do manejo na ineficiência do sistema convencional, enquanto a escala produtiva foi o fator a influenciar na redução do escore médio de eficiência técnica do sistema BFT. Os resultados dos estudos permitirão o aperfeiçoamento do cultivo do camarão L. vannamei, além de dar maior segurança para o investimento no sistema BFT pelos produtores da região Nordeste do Brasil. Ambos os sistemas de produção de camarão representam importantes alternativas de investimento para o setor rural brasileiro, confirmado pelos resultados favoráveis de rentabilidade e viabilidade.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-24T13:09:10Z No. of bitstreams: 1 George do Nascimento Leao.pdf: 1841819 bytes, checksum: 8817ba2a46764f3fa488c0abe9b8ba3b (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-24T13:09:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 George do Nascimento Leao.pdf: 1841819 bytes, checksum: 8817ba2a46764f3fa488c0abe9b8ba3b (MD5) Previous issue date: 2016-02-17 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / This study describes biological aspects of the species Eucinostomus argenteus collected in the Santa Cruz Channel, city of Itapissuma (Pernambuco), with regard to reproduction and feeding habit. Totally, 1910 individuals -16.4% females, 5% males and 78.6% with indeterminate sex- were sampled monthly from October 2013 to September 2014. There was a predominance of females over males (3,3:1) (p<0,05). The length-weight relationship for females, males and pooled sexes showed positive allometry. The length at first sexual maturity (in total length, cm) (L50) was 8,31 for pooled sexes; 6,02 for males and 8,03 for females. It was observed that approximately 73% of the individuals were in length classes lower than the L50, with an average size of 4.97 cm (SD= ±0.94). Juveniles predominated in almost all months, representing 67% of the total. In the months of October / November 2013, there was the highest percentage of mature individuals, as well as the highest values of gonadosomatic index and gonadal index, representing a peak breeding for the specie. To diet composition were used the indexes of frequency of occurrence (%FO), numeric (%N), percentage weight (%P), and the Alimentary Index (%AI). The feeding strategy was defined by the graphical method of Costello. We used the Restricted Analysis coordinates Main (CAP) and PERMANOVA analysis to compare the diet between climatic periods and ontogenetic stages. The diet was based mainly on Cefalocordados, Teleosts and polychaetes. The component 1 (CAP1) showed an explanation of 88%, indicating the formation of groups 3, despite the observed overlap. While CAP2 explained 6% of the variation, contributing very little to interpretation of the scene. There were significant differences in all combinations evaluated period (PERMANOVA; R Global = 0.03834, p <0.05), ontogeny: Period (PERMANOVA; R Global = 0.16515, p <0.05), however the " ontogeny "represented a further explanation of these variables (PERMANOVA; p <0.05). The species presented a feeding strategy of an opportunistic benthivorous fish. We may indicate that the estuary of the Santa Cruz Channel is being used as a feeding ground for species of the family Gerreidae. The high number of individuals, especially in the juvenile stage, highlights the importance of the waters of the estuary of the Santa Cruz Channel-PE, as natural habitat and shelter for this kind of Gerreidae family. It is important to the regulation by the relevant public bodies, preventing the use of nets with small mesh openings, to avoid catching very young species. / O presente estudo descreve os aspectos biológicos da espécie Eucinostomus argenteus capturada no Canal de Santa Cruz no município de Itapissuma (Pernambuco), no que se refere à alimentação e reprodução. Um total de 1910 indivíduos da espécie - 16,4% fêmeas, 5% machos e 78,6% com sexo indeterminado - foram capturados mensalmente de outubro de 2013 a setembro de 2014. Houve um predomínio de fêmeas sobre os machos (3,3:1) (p<0,05). Para fêmeas, machos e sexos agrupados, a relação peso-comprimento indicou alometria positiva. O tamanho de primeira maturação (em comprimento total, cm) (L50) para os sexos agrupados foi de 8,31cm, para os machos 6,02 e para as fêmeas 8,03. Observou-se que aproximadamente 73% dos indivíduos encontravam-se nas classes inferiores ao L50, com um tamanho médio de 4,97 cm (D.P. = ±0,94). Os indivíduos juvenis predominaram em quase todos os meses de estudo, correspondendo a 62,67% do total. No bimestre de outubro/novembro de 2013, registrou-se o maior percentual de indivíduos maduros, assim como os maiores valores de relação gonadossomática e do índice gonadal, caracterizando um pico de reprodução para a espécie. Para composição da dieta foram utilizados os índices de frequência de ocorrência (%FO), numérica (%N) e peso percentual (%P), além do índice de Importância Alimentar (%IAi). A estratégia alimentar foi definida através do método gráfico de Costello. Foram utilizados a Análise Restrita de Coordenadas Principais (CAP) e a análise de PERMANOVA para comparar a dieta entre os períodos climáticos e as fases ontogenéticas. A dieta da espécie foi baseada principalmente em Cephalochordata, Teleósteos e Poliquetas. A componente 1 (CAP1) apresentou uma explicação de 88%, indicando a formação de 3 grupos, apesar da sobreposição observada. Enquanto a CAP2 explicou 6% da variação, contribuindo muito pouco para interpretação do cenário. Houve diferença significativa em todas as combinações avaliadas, Período (PERMANOVA; R Global = 0,03834; p<0,05), Ontogenia:Período (PERMANOVA; R Global = 0,16515; p<0,05), no entanto a “Ontogenia” representou a maior explicação entre estas variáveis (PERMANOVA; p<0,05). A espécie apresentou estratégia alimentar zoobentívora oportunista. Podemos indicar que o estuário do Canal de Santa Cruz, é utilizado como área de alimentação pela espécie da família Gerreidae. O elevado número de indivíduos, principalmente na fase juvenil, evidencia a importância das águas do estuário do Canal de Santa Cruz-PE, como criadouro natural e abrigo para esta espécie da família Gerreidae. É importante realizar a regulamentação, por parte dos órgãos públicos competentes, do impedimento do uso de redes com aberturas de malha pequena, para evitar a captura de espécies muito jovens.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-26T13:40:10Z No. of bitstreams: 1 Raquel Ventura Lima.pdf: 907594 bytes, checksum: b1c95adf4722d8417b5de6105e98b747 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-26T13:40:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Raquel Ventura Lima.pdf: 907594 bytes, checksum: b1c95adf4722d8417b5de6105e98b747 (MD5) Previous issue date: 2015-02-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The pacamã (Lophiosilurus alexandri) is a species of endemic catfish São Francisco river belonging to the order Siluriformes. It is a species very appreciated in the regions of the São Francisco River by the absence of intramuscular bones and quality of their steak, also highlighting the great potential for aquaculture. The pacamã among the most endangered species and restocking programs in the various regions of this basin have been developed. The aim of this study was to develop novel microsatellite markers for pacamã that can be used for genetic studies of this species and their populations. Tissue samples were collected from adult fish caught by artisanal fishing between the reservoirs of Sobradinho and Itaparica-BA-PE. First, a genomic DNA library was performed and a set of microsatellite was obtained. After genotyping, the number of alleles ranged from two to nine, and the average heterozygosity were 0659 (He) and 0.603 (Ho), respectively. Only one marker showed deviation from HWE and presence of null alleles. The overall coefficient of inbreeding (FIS) was 0.091, suggesting the presence of homozygous, which may be due to species characteristics. Polymorphic information content is, in most cases, greater than 0.5, confirming the efficiency of these markers for genetic studies / O pacamã (Lophiosilurus alexandri) é uma espécie de bagre endêmico do rio São Francisco pertencente a ordem dos Siluriformes. Trata-se de uma espécie muito apreciada nas regiões do rio São Francisco pela ausência de espinhos intramusculares e qualidade de seu filé, se destacando também pelo grande potencial para a aquicultura. O pacamã figura entre as espécies mais ameaçadas e programas de repovoamento nas diversas regiões desta bacia vêm sendo desenvolvidos. O objetivo deste trabalho foi desenvolver marcadores microssatélites inéditos para o pacamã que possam servir para estudos genéticos sobre essa espécie e suas populações. Amostras de tecido foram coletadas de peixes adultos capturados pela pesca artesanal entre os reservatórios de Sobradinho-BA e Itaparica-PE. Inicialmente, uma biblioteca genômica de DNA foi realizada e um conjunto de microssatélites foi obtido. Após a genotipagem, o número de alelos variou de dois a nove e as heterozigosidades médias foram de 0,659 (He) e de 0,603 (Ho), respectivamente. Apenas um marcador apresentou desvio do EHW e presença de alelos nulos. O coeficiente de endocruzamento total (FIS) foi de 0.091, sugerindo a presença de homozigotos, que pode ser em decorrência de características da espécie. O conteúdo de informação polimórfica foi, na maioria dos casos, superior a 0,5, atestando a eficiência desses marcadores para estudos genéticos futuros.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-26T13:52:15Z No. of bitstreams: 1 Sandra Cristina Soares da Luz.pdf: 1930040 bytes, checksum: 36344f947e80a6fe3f4734c7d7126fa1 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-26T13:52:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sandra Cristina Soares da Luz.pdf: 1930040 bytes, checksum: 36344f947e80a6fe3f4734c7d7126fa1 (MD5) Previous issue date: 2016-02-29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Several species of Cichla were supposedly introduced in dams, lakes and reservoirs of Brazil causing serious damage to local wildlife. Cichlids captured in Paulo Afonso hydroelectric complex (BA) have uncertain classification due to the fact of not sharing the morphometric discriminant characters and patterns of colorations. This diversity in the form can be attributed to the introduction of more than one species or to the occurrence of hybrids or even may be associated with different stages of gonadal maturation. For the identification of individuals sampled in this study, we used moleculares tools (COI and microsatellites), in addition to morphometric measurements, meristic counts fish and geometric morphometry. Was also performed an evaluation of the reproduction of individuals. Morphometric measurements and meristic counts of fish confirmed the taxonomy of species, but genetic analyses revealed the occurrence of a single species, Cichla monoculus, in the complex. The haplotype analysis pointed to a population that suffered and bottleneck effect in the process of expansion. The different patterns and colors were evaluated with respect to reproductive parameters such as length of first maturity, gonadal gonadossomatic index, and condition factor, stages of gonadal development, fecundity and reproductive period. It was observed a predominance of females relative to males, a reduction in the size of first maturity relative to the natural habitat of the species and a long reproductive period, with peaks of RGS related to rainy season in the region. The morphometry was not allowed to associate the differences of form and colour to the maturational stages. However, a differentiation was observed between the staining patterns for the sample, with the morphotype "gray" with the more elongated body, and with the mouth a lower position compared to the morphotype "yellow". These changes can be attributed to phenotypic plasticity in the environment occupied by cichlids. These morphotypes might be splitting up, there is a crossing between types, through the choice of partner by color, and if the environmental pressure persist, it can lead to speciation of Cichla monoculus. / Várias espécies de Cichla foram supostamente introduzidas em açudes, lagos e reservatórios do Brasil, causando sérios prejuízos à fauna local. Os ciclídeos (Cichla) capturados no Complexo Hidrelétrico de Paulo Afonso (BA), na bacia do São Francisco, têm apresentado identificação incerta, devido ao fato de não compartilharem caracteres morfométricos discriminantes e padrões de colorações. Essa diversidade na forma pode ser atribuída tanto à introdução de mais de uma espécie, à ocorrência de híbridos ou mesmo associados a diferentes estágios de maturação gonadal. Para a identificação dos indivíduos amostrados neste trabalho, foram utilizadas ferramentas moleculares (COI e microssatélites), além de medições morfométricas, contagens merísticas dos peixes e morfometria geométrica. Também foi realizada uma avaliação da reprodução dos indivíduos, para verificar possíveis relações com os “tipos” encontrados. As medições morfométricas e contagens merísticas dos peixes não confirmaram a taxonomia da espécie, contudo as análises genéticas revelaram a ocorrência de uma única espécie, Cichla monoculus, em todo o Complexo. As análises haplotípicas apontaram para uma população que sofreu efeito gargalo e se apresenta em processo de expansão. Os diferentes padrões de fora e cores foi avaliado com relação a parâmetros reprodutivos como comprimento de primeira maturação gonadal, índice gonadossomático, fator de condição, estádios de desenvolvimento gonadal, período reprodutivo e fecundidade. Observou-se uma predominância de fêmeas com relação aos machos, uma redução do tamanho de primeira maturação em relação ao habitat natural da espécie e um longo período reprodutivo, com picos de RGS relacionados ao período chuvoso da região. A morfometria não permitiu associar as diferenças da forma e coloração aos estádios maturacionais. Contudo, foi observada uma diferenciação entre os padrões de coloração para a forma, com o morfotipo “cinza” com o corpo mais alongado, mais baixo e com a boca uma posição mais inferior em relação ao morfotipo “amarelo”. Estas mudanças podem ser atribuídas à plasticidade fenotípica da espécie em relação ao ambiente que ocupam. Se os cruzamentos forem preferenciais por morfotipo, através da escolha do parceiro por coloração; e se a pressão ambiental persistir, é provável que uma especiação do Cichla monoculus venha a ocorrer nesta bacia .

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-27T12:44:53Z No. of bitstreams: 1 Joana Angelica Lyra Vogeley de Carvalho.pdf: 1376015 bytes, checksum: 83c8b8a2eb0e7f8feefee9e03ebf6461 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-27T12:44:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Joana Angelica Lyra Vogeley de Carvalho.pdf: 1376015 bytes, checksum: 83c8b8a2eb0e7f8feefee9e03ebf6461 (MD5) Previous issue date: 2016-03-31 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / This study focused on selecting wild shrimp Bacillus for a probiotics use in shrimp farming. Bacillus circulans and Bacillus subtilis were isolated from the Farfantepenaeus subtilis intestine and have showed antagonism against Vibrio harveyi, Vibrio alginolyticus, Vibrio vulnificus and Vibrio mimicus in in vitro tests. Afterwards, these bacteria inhibited Vibrio parahaemolyticus ATCC 17802 (VP) in a wide pH and salinity range and produced lipase, amylase and protease in vitro showing that these Bacillus had the needed requirements for in vivo experiments. Thus, juveniles of Litopenaeus vannamei were grown according to the following diet: feed + B. subtilis (BS); feed + B. circulans (BC) and feed without bacteria (Control). Every 15 days samples were collected in order to quantify the bacteria and enzyme activity. After 45 days, the shrimp’s weight fed with BS and BC was significantly higher when compared to the control group. There was a significant increase in Bacillus spp. and a Vibrio spp. reduction in the intestine and hepatopancreas, especially after the 30th and 45th day mark. The trypsin, chymotrypsin, lipase and amylase also had significant increase in shrimp fed with BC and BS, especially after the 30th day mark. After 60 days, the immune system gene expression (proPO, LGBP and HEM) increased significantly in the shrimp fed with BS and BC. In addition to these experiments, the shrimp were infected (by injection) and challenged (water) against VP. The shrimp fed with BC diet had significantly higher survival rates after the injection and there were no differences after the challenge. The proPO expression did not differ between diets after infection or challenge. There was a Vibrio spp. reduction and a significant Bacillus spp. increase in the shrimps’ intestines which were fed with BC and BS diets after the challenge. The Bacillus spp. increase in shrimp fed with BC and BS diets suggest that there was colonization in the gastrointestinal tract during all the experimental period. This may have increased the enzyme activity improving digestion and weight gain, reduced the Vibrio spp. and increased the immune system gene expression, making the shrimp more resistant to infection (BC diet). Thus, B. circulans and B. subtilis have showed the potential for its application as probiotics in shrimp farming. / O objetivo desse estudo foi selecionar Bacillus de camarões selvagens para uso como probiótico na carcinicultura. Bacillus circulans e Bacillus subtilis foram isolados do intestino de Farfantepenaeus subtilis e demonstraram antagonismo contra Vibrio harveyi, Vibrio alginolyticus, Vibrio vulnificus e Vibrio mimicus em testes in vitro. Posteriormente, essas bactérias inibiram Vibrio parahaemolyticus ATCC 17802 (VP) em uma ampla faixa de pH e salinidade e produziram lipase, amilase e protease in vitro, demonstrando que esses Bacillus possuíam características requeridas para experimentos in vivo. Então, juvenis de Litopenaeus vannamei foram cultivados com as dietas: ração + B. subtilis (BS); ração + B. circulans (BC) e ração sem bactérias (Controle). A cada 15 dias, amostras foram coletados para quantificação bacteriana e de atividade enzimática. Ao final de 45 dias, o peso dos camarões alimentados com BS e BC foi significativamente maior comparados ao grupo controle. Houve um significativo aumento de Bacillus spp. e redução de Vibrio spp. no intestino e hepatopâncreas, sobretudo após 30 e 45 dias. As atividades da tripsina, quimotripsina, lipase e amilase aumentaram significativamente nos camarões alimentados com BC e BS, principalmente após 30 dias. Após 60 dias, a expressão de genes do sistema imunológico (proPO, LGBP e HEM) aumentou significativamente nos camarões alimentados com BS e BC. Adicionalmente, os camarões foram infectados (injeção) e desafiados (água) com VP. A sobrevivência dos camarões alimentados com BC foi significativamente maior após infecção e não houve diferenças após desafio. A expressão da proPO não diferiu entre as dietas após infecção e desafio. Houve uma redução de Vibrio spp. e significativo aumento de Bacillus spp. no intestino dos camarões alimentados com BC e BS após desafio. Durante todo o período experimental, o aumento de Bacillus nos camarões alimentados com BC e BS sugere que houve colonização no trato digetório de B. circulans e B. subtilis. Isso pode ter incrementado a atividade enzimática, melhorando a digestão e ganho de peso, reduzido Vibrio spp. e aumentado a expressão de genes do sitema imunológico, tornando os camarões mais resistentes ao VP (dieta BC). Assim, B. circulans e B. subtilis apresentam potencial para utilização como probiótico na carcinicultura.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-30T12:49:02Z No. of bitstreams: 1 Reginaldo Florencio da Silva Junior.pdf: 1573897 bytes, checksum: 6b4cdfaa9a70f1efb155726c3d8b7512 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-30T12:49:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Reginaldo Florencio da Silva Junior.pdf: 1573897 bytes, checksum: 6b4cdfaa9a70f1efb155726c3d8b7512 (MD5) Previous issue date: 2016-02-19 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The massive growth of aquaculture and limited supply of fish meal, means that alternative sources of food need to be studied to make more sustainable industry. In this context, the apparent digestibility coefficients (ADC) eight ingredients used in the aquafeeds were determined in terms of dry matter (DM), crude protein (CP), ether extract (EE), mineral contente (MM), phosphorus (P), gross energy (GE) and amino acids (AA) in juvenile common snook (Centropomus undecimalis) using chromium oxide as inert marked. The ingredients included fish meal (FM), shrimp meal (CM), poultry by-products (PBP), hydrolyzed feather meal (HFM), soybean meal (SM), corn gluten meal (CGM) wheat bran (WB) and maize (M). A reference diet (56.7%CP, 22.7 MJ/kg GE) was formulated in parallel experimental diets which included 30% of each ingredient and 70% of the reference diet. The results indicated that the ADC of nutrients and GE were affected (P <0.05) by the test composition ingredients. The CGM and HFM showed similar results (P> 0.05) in nutrients and GE. The digestibility DM ranges from 83% (SM) to 145% (CGM). The EE was well digested by fish with differences (P>0.05) among the ingredients. The smaller ADC MM were observed in the PBP (37%) and SM (28%) and difference (P<0.05) among the treatments. The ADC GE in the FM (118%) and SM (117%) were significantly higher (P<0.05) than the other ingredients for common snook. The ADC P were higher in all the ingredients. The ADC of AA reflected the digestibility of CP, and FM, SM, HFM and CGM greater than PBP, SM and M. The results of this study indicate high digestibility of protein and energy ingredients for juvenile C. undecimalis. However, the digestibility of mineral content to PBP, SM and M were significantly lower FM, CM, HFM, CGM, SM and WB, indicating the potential use of these ingredients in feed for this species. Thus, this study also investigated the effects of a commercial diet (I) and experimental on profile of digestive enzymes in C. undecimalis. The activities of peptidases, acid and alkaline, showed differences (P<0.05) between the fish fed the diets. The analysis differ (P<0.05) between treatments with greater intensity in the diets I, FM and HFM. In studies with trypsin, there is difference (P<0.05), with higher enzyme activity in fish fed diet I. Chymotrypsin showed higher proportion of enzymes in diets with protein ingredients, except for the PBP in relation to energy. Amylase, it was also high in protein ingredients except CGM. There was no difference (P>0.05) for specific activity of pepsin. The different ether extract concentrations in the diet REF and consequently in the other experimental diets, inhibited total alkaline proteolytic activities and trypsin in juveniles de common snook. The identification and characterization of acidic and alkaline proteases in fish digestibility studies is an important step in understanding the digestive mechanisms. The results of this thesis will allow the formulation of experimental and commercial diets based on digestible nutrients for juvenile common snook. / Os coeficientes de digestibilidade aparente (CDA) de oito ingredientes utilizados na indústria aquícola foram determinados em termos de matéria seca (MS), proteína bruta (PB), extrato etéreo (EE), matéria mineral (MM), fósforo (P), energia bruta (EB) e aminoácidos (AA) em juvenis de robalo-flecha (Centropomus undecimalis), utilizando óxido de cromo como marcado inerte. Os ingredientes incluíam a farinha de peixe (FP), farinha de camarão (FC), farinha de vísceras de aves (FVA), farinha de penas hidrolisada (FPH), farelo de soja (FS), farelo de glúten de milho (FGM), farelo de trigo (FT) e farinha de milho (FM). Uma dieta referência (REF) (56,7%PB, 22,7 MJ/kg ED) foi formulada em paralelo as dietas experimentais que incluiu 30% de cada ingrediente e 70% da dieta referência. Os resultados indicaram que o CDA dos nutrientes e EB foram afetados (P<0,05) pela composição dos ingredientes testes. O FGM e FPH apresentaram resultados semelhantes (P>0,05) nos nutrientes e EB. A digestibilidade da MS variou de 83% (FS) a 145% (FGM). O EE foi bem digerido pelos peixes com diferenças (P>0,05) entre os ingredientes. Os menores CDA de MM observados na FVA (37%), FS (28%) e FM (47,8%) com diferença (P<0,05) entre os tratamentos. Os CDA de EB na FP (118%) e FC (117%) foram significativamente maiores (P<0,05) do que os demais ingredientes utilizados para os robalo-flecha. Os CDA do P foram altos em todos os ingredientes. Os CDA dos AAs refletiram a digestibilidade da PB, sendo a FP, FC, FPH e FGM maior que FVA, FS e FM. Os resultados deste estudo indicam alta digestibilidade dos ingredientes proteicos e energéticos para juvenis de C. undecimalis. No entanto, a digestibilidade da matéria mineral para FVA, FS e FM, foram bastante inferiores a FP, FC, FPH, FGM e FT, indiciando potencial uso desses ingredientes em rações para essa espécies. Para melhorar a utilização das dietas em peixes, além da digestibilidade dos ingredientes é importante que se conheça o perfil de enzimas digestivas do animal cultivado. Assim, este trabalho também investigou os efeitos de uma dieta comercial (I) e experimentais sobre o perfil das enzimas digestivas em juvenis de C. undecimalis. As atividades das proteases ácidas e alcalinas, mostraram diferença (P<0,05) entre os peixes alimentados com as dietas. A análise diferiu (P<0,05) entre os tratamentos com maior intensidade nas dietas I, FP e FPH. Nos estudos com a tripsina, observa-se diferença (P<0,05), com maior atividade enzimática nos peixes alimentados com a dieta I. A quimotripsina, mostrou maior atividade de enzimas nas dietas com ingredientes proteicos, exceto para a FVA, em relação aos energéticos. A amilase, também se mostrou alta nos ingredientes proteicos, exceto FGM. Não houve diferença (P>0,05) para atividade específica da pepsina. As diferentes concentrações de extrato etéreo na dieta (REF) e consequentemente nas demais dietas experimentais, inibiram as atividades proteolítica alcalina total e de tripsina nos juvenis de robalo-flecha. A identificação e caracterização das proteases ácidas e alcalinas em estudos de digestibilidade de peixe é um passo importante para a compreensão dos mecanismos digestivos. Os resultados dessa tese permitirão a formulação de dietas experimentais e comerciais com base em nutrientes digestíveis para juvenis do robalo-flecha.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-30T13:14:04Z No. of bitstreams: 1 Ugo Lima Silva.pdf: 3091661 bytes, checksum: da23ed34f94de8d802980a2fcb17916e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-30T13:14:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ugo Lima Silva.pdf: 3091661 bytes, checksum: da23ed34f94de8d802980a2fcb17916e (MD5) Previous issue date: 2016-02-04 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The development of aquaculture systems based on biofloco technology can contribute to the fish production in regions with reduced water availability. Thus, this thesis evaluated the quality of water in the Nile tilapia culture, Oreochromis niloticus, as well as performance and animal welfare with biofloco technology in the in the nursery phase and growout, using different carbon sources and relations C:N. In the first study, It was adopted a experimental design, with two relationships carbon (C) and nitrogen (N) (10:1 and 20:1) and three carbon sources (molasses, sugar and cassava starch) in the nursery phase. The water quality was evaluated daily on the basis of temperature, dissolved oxygen, pH, redox potential, conductivity, transparency and salinity. It was monitored weekly up ammonia, nitrite, nitrate, phosphate, alkalinity, settleable solids, turbidity and total suspended solids. The best results in the induction of microbial flocs were observed with added molasses or sugar in the C:N ratios 10:1 and 20:1. Induction to heterotrophic means causes constant changes in water quality that can harm the growth and survival of tilapia fingerlings. The temperature (23.2 ± 0.8ºC), dissolved oxygen (7.1 ± 0.4 mg/L), pH (8.1 ± 0.1), the redox potential (168.2 ± 25.2 mV), conductivity (2.0 ± 0.1 mS/cm) and salinity (0.3 ± 0.8 ‰) did not differ significantly between treatments (P>0.05). The C:N ratio and carbon source influenced some variables, as alkalinity, settleable solids (SS), turbidity and total suspended solids (TSS) showing values significantly higher in the C:N ratio of 20:1 (P<0.05). In the second study, we evaluated the influence of molasses used different C:N ratios and different carbon sources on water quality, productive performance and health of tilapia grown with biofloco technology in the fattening stage. The average values of total plasma protein (5.9 g/dL), albumin (0.8 g/dL) and globulin (5.1 g/dL) demonstrating the potential of biofloco technology in development of the immune system fish. Were stocked 50 fingerlings/m3 (73.2 ± 2.7 g) in 12 tanks (800 L). After 107 days of cultured, it was possible to produce 14.5 ± 1.0 kg/m3 of survival over 95% with no significant differences among the treatments. In the third study, molasses can be used as a carbon source to achieve C:N 10 or 20:1 ratios on tilapia culture with biofloco technology. The animal performance and welfare of tilapia was satisfactory with all carbon sources proving to be effective in maintaining the physical and chemical parameters. The most rapid degradation of molasses and sugar may have provided higher levels of carbon as a substrate for the formation of microbial flocs. Information and knowledge of haematological variables and water quality in tilapia farming with biofloco technology can be used by the fish farmer as an evaluation tool of creation of system of ecological prudence and animal welfare. / O desenvolvimento de sistemas aquícolas com uso da tecnologia de biofloco pode contribuir para a produção de pescado em regiões com reduzida disponibilidade de água. Desta forma, a presente tese avaliou a qualidade da água no cultivo de tilápia do Nilo, Oreochromis niloticus, bem como desempenho e bem estar dos animais com tecnologia de biofloco, na fase de alevinagem e de engorda, utilizando diferentes fontes de carbono e relações C:N. No primeiro estudo, adotou-se um delineamento experimental, com duas relações Carbono (C) e Nitrogênio (N) (10:1 e 20:1) e três fontes de carbono (melaço, açúcar e fécula de mandioca) na fase de alevinagem. A qualidade da água foi analisada diariamente com base na temperatura, oxigênio dissolvido, pH, potencial de oxiredução, condutividade, transparência e salinidade. Semanalmente monitorou-se amônia, nitrito, nitrato, fosfato, alcalinidade, sólidos sedimentáveis, turbidez e sólidos suspensos totais. Os melhores resultados na indução dos flocos microbianos foram constatados com adição de melaço e/ou açúcar nas relações C:N 10:1 e 20:1. A indução ao meio heterotrófico provoca constantes variações na qualidade da água que podem prejudicar o crescimento e sobrevivência de alevinos de tilápia. A temperatura (23,2±0,8ºC), o oxigênio dissolvido (7,1±0,4 mg/L), pH (8,1±0,1), o potencial de oxiredução (168,2±25,2 mV), a condutividade (2,0±0,1 mS/cm) e a salinidade (0,3±0,8 ‰) não diferiram significativamente (P>0,05) entre os tratamentos. A relação C:N e a fonte de carbono influenciaram as variáveis de alcalinidade, sólidos sedimentáveis (SS), turbidez e sólidos suspensos totais (SST), apresentando valores significativamente superiores na relação C:N de 20:1. No segundo estudo, foram avaliados a influência do uso do melaço em diferentes relações carbono:nitrogênio (C:N) e de diferentes fontes de carbono na qualidade da água, desempenho produtivo e saúde da tilápia cultivada com tecnologia de biofloco, na fase de engorda. Os valores médios de proteína plasmática total (5,9 g dL-1), albumina (0,8 g dL-1) e globulina (5,1 g dL-1) demonstrando o potencial da tecnologia de biofloco no desenvolvimento do sistema imunológico do peixe. Foram estocados 50 alevinos/m3 (73,2±2,7 g) em 12 tanques (800 L). Após 107 dias de cultivo, foi possível produzir 14,5±1,0 kg/m3 com sobrevivência acima de 95% sem diferenças significativas entre os tratamentos. No terceiro estudo, o melaço pode ser utilizado como fonte de carbono para alcançar relações C:N 10 ou 20:1 no cultivo do tilápia (O. niloticus) com tecnologia de biofloco. O desempenho zootécnico e o bem estar da tilápia foi satisfatório com todas as fontes de carbono demonstrando serem efetivas na manutenção das variáveis físico-químicas da água. A degradação mais rápida do melaço e do açúcar pode ter fornecido níveis mais elevados de carbono como um substrato para a formação dos flocos microbianos. As informações e conhecimentos sobre as variáveis hematológicas e qualidade de água no cultivo de tilápia com tecnologia de biofloco podem ser utilizadas pelo aquicultor como ferramenta de avaliação do sistema de criação com prudência ecológica e bem estar animal.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-30T13:47:02Z No. of bitstreams: 1 Ricardo Luis Mendes de Oliveira.pdf: 1317636 bytes, checksum: 15cf1c9f6b999bf3bde2c6e2c177d011 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-30T13:47:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ricardo Luis Mendes de Oliveira.pdf: 1317636 bytes, checksum: 15cf1c9f6b999bf3bde2c6e2c177d011 (MD5) Previous issue date: 2016-02-24 / The combined effects of feeding frequency and ration size on the growth of laboratory-reared common snook (Centropomus undecimalis) and cobia (Rachycentron canadum) juveniles were evaluated. For the first experiment (named "S") juveniles of snook with a mean weight of 2.55 g (± 0.48) and mean total length of 6.81 cm (± 0.48) were divided into groups of 20 fish and kept in 30 x 50 L experimental units for 60 days. For the cobia experiment ("C") juveniles with a weight of 2.47 g (± 0.12) and total length of 9.55 cm (± 0.18) were divided into groups of 12 fish and kept at 30 x 50 L experimental units for 28 days. In both studies the experimental design was factorial (3 x 3) with three feeding frequencies and three ration sizes, which differed between species. For the snook, 2, 4 and 6 daily meals and ration sizes of 1.0, 2.5 and 4.0% of fish biomass were tested, while for the cobia we tested 1, 3 and 6 daily meals and 3, 6 and 12% of fish biomass. An external control, using the mean food frequency of each experiment (S = 4 and C = 3) and feeding to apparent satiation, was added. There were thus ten treatments with three replicates each. The weight and length of all fish in both studies was measured to adjust the amount of feed to be administered every 15 (S) and 7 days (C). Water quality remained within acceptable levels for both species. For both species, the ration size had a larger effect on the results than feeding frequency. It is recommended to feed common snook juveniles weighing from 1 to 16 g with 4 to 6 meals a day with a ration size between 1.86 and 3.31%, while for juvenile cobia ranging from 1.6 to 38.6 g it is recommended 3 to 6 daily meals with a ration size between 6.16 and 10.51%. In both cases the ration size should decrease according to fish size. / Os efeitos da frequência e da taxa de alimentação sobre o crescimento de juvenis do robalo-flecha (Centropomus undecimalis) e do beijupirá (Rachycentron canadum) criados em laboratório foram avaliados. No primeiro experimento (denominado "R"), grupos de 20 juvenis de robalo com peso médio de 2,55 g (± 0,48) e comprimento total médio de 6,81 cm (± 0,48) foram mantidos em 30 unidades experimentais de 50 L durante 60 dias. No segundo experimento ("B"), juvenis de beijupirá com peso médio de 2,47 g (± 0,12) e comprimento total médio de 9,55 cm (± 0,18) foram divididos em grupos de 12 peixes e mantidos em 30 unidades experimentais de 50 L durante 28 dias. Em ambos estudos o delineamento experimental foi fatorial (3 x 3) com três frequências alimentares e três taxas de alimentação diárias, as quais diferiram entre as espécies. Para o robalo, foram testadas 2, 4 e 6 refeições diárias e taxas de 1,0, 2,5 e 4,0% da biomassa dos peixes, enquanto para o beijupirá testamos 1, 3 e 6 refeições diárias e 3, 6 e 12% da biomassa dos peixes. Foi adicionado um controle externo, utilizando a frequência alimentar média de cada estudo (R = 4 e B = 3) e alimentação até a saciedade aparente. Houveram, portanto, dez tratamentos com três repetições cada. Nos dois estudos foram aferidos peso e comprimento total de todos os peixes para ajuste da quantidade de ração a ser administrada a cada 15 (R) e 7 dias (B). A qualidade de água manteve-se dentro de níveis considerados aceitáveis para ambas espécies. Em ambas espécies, a taxa de alimentação teve maior influência nos resultados do que a frequência. Para juvenis de robalo com peso entre 1 a 16 g recomenda-se de quatro a seis refeições diárias com uma taxa de alimentação entre 1,86 e 3,31%/dia, enquanto que, para beijupirás com peso entre 1,6 a 38,7 g, recomenda-se o fornecimento de três a seis refeições diárias com uma taxa de alimentação entre 6,16 e 10,51%. Em ambos casos, a taxa de alimentação deve decrescer de acordo com o tamanho dos peixes.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-11-01T12:22:04Z No. of bitstreams: 1 Izabel Cristina da Silva Almeida Funo.pdf: 3957187 bytes, checksum: 43e9590f401b0f3753de80740bfee8f0 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-01T12:22:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Izabel Cristina da Silva Almeida Funo.pdf: 3957187 bytes, checksum: 43e9590f401b0f3753de80740bfee8f0 (MD5) Previous issue date: 2016-02-19 / This thesis evaluated productive and biological parameters of the native oyster on Maranhão Island to contribute to the improvement of cultivation methods suitable to the region’s environmental characteristics. To attain this objective, three experiments were conducted which evaluated the efficiency of capturing oyster spats in artificial collectors (experiment II); the growth and the survival of the oyster Crassostrea gasar, exposed to different salinity levels (experiment I) and submitted to different cultivation systems (experiment III). The most important results in this study demonstrate that the C. gasar species is resistant to a wide range of salinity, and can be cultivated in marine regions with salinity from 30-35, and in estuaries in which the salinity is not equal to or lower than 5. It was found that the spat capture of the oysters was significantly influenced by the type of collector, location and period of collection (P<0.05, MANOVA). The spat collection was significantly higher in the PVC collector and at point II (mangue) (P<0.05, Tukey). The spat capture took place during the whole year, and the dry period (with less rainfall and higher salinity) was more propitious to spat collection, while the rainy period (with lower salinity) had higher growth of the individuals. The growth of the C. gasar oysters was significantly higher in the longline cultivation system (P<0.05, Student t test). Nevertheless, no significant difference was found in survival between the cultivation systems tested (P>0.05 Student t test). The months with greater rainfall, concentration of particulate inorganic matter, food availability (particulate organic material and chlorophyl a) and with lower salinity and temperature had better oyster growth. On the other hand, there was a greater agglomeration of organisms undesirable to cultivation at this time, which were associated to the lower survival rate registered in this period. / A presente tese visou avaliar parâmetros produtivos e biológicos da ostra nativa na ilha do Maranhão, a fim de contribuir com o aprimoramento de metodologias de cultivo adequadas às características ambientais da região. Para atingir esse objetivo, foram desenvolvidos três experimentos, os quais avaliaram a eficácia da captação de semente de ostras em coletores artificiais (experimento II); o crescimento e a sobrevivência da ostra Crassostrea gasar, exposta a diferentes níveis de salinidades (experimento I) e submetida a diferentes sistemas de cultivo (experimento III). Os resultados mais relevantes neste estudo demonstram que a espécie C. gasar é resistente a uma ampla faixa de salinidade, podendo ser cultivada em áreas marinhas com salinidades entre 30 e 35, como também em áreas estuarinas nas quais a salinidade da água não apresente valores iguais ou inferiores a 5. Verificou-se que a captação de sementes de ostras foi influenciada significativamente pelo tipo de coletor, local e período de coleta (P<0,05, MANOVA). A coleta de sementes foi significativamente superior no coletor de PVC e no ponto II (mangue) (P<0,05, Tukey). A captação de semente ocorreu durante todo ano, sendo que o período seco (menor intensidade pluviométrica e maior salinidade) mostrou-se mais propício para a coleta de semente, enquanto no período chuvoso (menor salinidade) foi registrado maior crescimento desses indivíduos. O crescimento das ostras C. gasar foi significativamente superior no sistema de cultivo espinhel (P<0,05, teste t de Student). Contudo, não foi constatada diferença significativa da sobrevivência entre os sistemas de cultivo balsa e espinhel (P>0,05, teste t de Student). Os meses com maior intensidade pluviométrica, concentração de material particulado inorgânico, disponibilidade de alimento (material particulado orgânico e clorofila a) e com menor salinidade e temperatura favoreceram o crescimento das ostras. Por outro lado, resultaram em maior aglomeração de organismos indesejáveis ao cultivo, os quais foram associados à menor sobrevivência registrada nesse período.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-11-01T12:38:51Z No. of bitstreams: 1 Jessika Lima de Abreu.pdf: 437059 bytes, checksum: 48c646e45bfd30571e1a87f1cd475d66 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-01T12:38:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jessika Lima de Abreu.pdf: 437059 bytes, checksum: 48c646e45bfd30571e1a87f1cd475d66 (MD5) Previous issue date: 2016-02-16 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Financiadora de Estudos e Projetos - Finep / Microalgae are widely used in aquaculture for their high nutritional value, the objective of this study was to evaluate the growth of microalgae Navicula sp. using a solid residue biofloco cultivation system as culture medium. Therefore, two experiments were conducted: the first with the addition of trace metals to the environment with waste and the second without the addition of trace metals to the environment with waste, totaling five treatments (one control) with three replicates each: R0C100 (0% residue and 100% means Conway); R25C75 (25% waste and 75% medium Conway); R50C50 (50% waste and 50% medium Conway) R75C25 (75% waste and 25% medium Conway) and R100C0 (100% and 0% residue Conway medium). The crops had 10 days duration and were conducted in Erlenmeyer flasks with a volume of 1L, with initial inoculum of 5x104 cél.mL. The units were kept under constant aeration and luminosity of 2.000 lux, for monitoring the maximum cell density (DCM), doubling time (DT) and growth rate (K) were held daily counts with the help of a Neubauer chamber. The pH and temperature were measured at the beginning and end of the experiments, for statistical analysis tests were used Cochran, Shapiro Wilk, ANOVA and Tukey (P<0.05). Chemical analysis of the solid residue showed that it has 3,83 g/L of total nitrogen, 1,25 g/L total phosphorus and 0,32 g/L of sulfur. Water quality variables were in normal concentrations of cultivation. As for growth, even with no significant difference between treatments, the R50C50 treatment showed higher cell density in the experiment with trace metals and R25C75 treatment showed higher cell density in the experiment without trace metals, noting that the presence of trace metals favored growth Navicula sp. The study showed that the medium with residue can be used in any proportion in the cultivation of Navicula sp. / As microalgas são amplamente utilizadas na aquicultura, por apresentarem alto valor nutricional, o objetivo deste estudo foi avaliar o crescimento da microalga Navicula sp. utilizando resíduo sólido de um cultivo em sistema de biofloco, como meio de cultura. Para tanto, foram realizados dois experimentos: o primeiro com adição de metais traços ao meio com resíduo e o segundo sem adição de metais traços ao meio com resíduo, totalizando cinco tratamentos (sendo um controle), com três repetições cada: R0C100 (0% de resíduo e 100% de meio Conway); R25C75 (25% de resíduo e 75% de meio Conway); R50C50 (50% de resíduo e 50% de meio Conway), R75C25 (75% de resíduo e 25% de meio Conway) e R100C0 (100% de resíduo e 0% de meio Conway). Os cultivos tiveram duração de 10 dias e foram realizados em erlenmeyers com volume útil de 1L, com inóculo inicial de 5x104 cél.mL. As unidades foram mantidas sob aeração constante e luminosidade de 2.000 Lux, para o acompanhamento da densidade celular máxima (DCM), tempo de duplicação (TD) e a velocidade de crescimento (K) realizaram-se contagens diárias com o auxílio da câmara de Neubauer. O pH e a temperatura foram mensurados no início e final dos experimentos, para as análises estatísticas foram utilizados os testes de Cochran, Shapiro Wilk, ANOVA e Tukey (P < 0,05). A análise química do resíduo sólido mostrou que o mesmo apresenta 3,83 g/L de nitrogênio total, 1,25 g/L de fósforo total e 0,32 g/L de enxofre. As variáveis de qualidade da água estiveram em concentrações normais de cultivo. Quanto ao crescimento, mesmo não havendo diferença significativa entre os tratamentos, o tratamento R50C50 apresentou maior densidade celular no experimento com metais traços e o tratamento R25C75 apresentou maior densidade celular no experimento sem metais traços, ressaltando que a presença de metais traços favoreceu o crescimento da Navicula sp. O estudo mostrou que o meio com resíduo pode ser utilizado em qualquer proporção no cultivo da Navicula sp.