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Changements globaux et assèchement des zones humides fluviales : conséquences sur les processus biogéochimiques et les communautés d'invertébrés / Global changes and wetland drying : consequences on biochemical processes and invertebrate communities

Dehédin, Arnaud 29 November 2012 (has links)
Les zones humides (ZH) alluviales constituent des secteurs à forte valeur écologique etpatrimoniale. Pour comprendre et prédire l’évolution à long terme de ces zones, en particulierface aux changements globaux, il apparaît primordial de traduire les perturbationshydrologiques attendues en termes de perturbations biologiques, afin d'estimer lesconséquences potentielles de ces changements pour la biodiversité et le fonctionnement globalde ces écosystèmes. Cette thèse s’articule donc autour de deux objectifs: proposer un modèleconceptuel de fonctionnement écologique des ZH soumises à des assèchements saisonniers etestimer la vulnérabilité écologique de communautés faunistiques vivant dans ces ZH, enconsidérant conjointement les peuplements benthiques et interstitiels (principalementCrustacés).Nos résultats démontrent que la morphologie des ZH (eau relativement courante, eaustagnante, apports phréatique) et leurs modes d’assèchement (formation de mouilles isoléesou assec complet) sont essentiels dans la structuration des communautés microbiennes etd’invertébrés et dans la réponse saisonnière de la biodiversité et des processus écologiques.L’intensification probable des étiages et des assèchements augmentera l’hétérogénéité spatialeet temporelle des habitats et leur richesse spécifique mais réduira la biodiversité globale desplaines alluviales (disparition des espèces rares). Ces étiages plus sévères modifieront lesprocessus écologiques, diminuant le recyclage de la matière organique et la qualité des eauxsuperficielles. Les recherches futures devraient s’orientées vers des stratégies et des moyensefficaces pour garantir la durabilité écologique des ZH. / Alluvial wetlands offer many ecological goods and services. In order to evaluate thelong term impact of global changes, it appeared essential to translate the hydrological changesin term of biological perturbation, so as to estimate the consequences on biodiversity andecosystem functioning. This PhD thesis focuses on two points: to propose a conceptual modelof ecological functioning of the wetlands that are subjected to seasonal drying and to estimatethe ecological vulnerability of aquatic invertebrate communities of the wetlands facing theincreasing drought risk, by considering both the benthic and interstitial assemblages (with aparticular interest on Crustaceans).Our main results demonstrate that wetlands’ morphology (running water, groundwaterupwelling, stagnant water) and their drying modalities (formation of isolated pools orcomplete drying) influence both the microbial and invertebrate community structures andcontrol the seasonal responses of biodiversity and ecological processes. The potential increasein the low flow period and drying intensity may increase the spatial and temporalheterogeneity of habitats and their specific richness but may decrease the global biodiversityof floodplain (rarefaction of sensible species). Severe low flow periods may also disturb theirecological functioning, reducing the organic matter recycling and the surface waters quality.Future studies should develop efficient strategies to support the ecological durability ofwetlands.
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Dynamique des peuplements de poissons dans le bassin inférieur du Mékong / Fish assemblages dynamic in the tropical flood-pulse system of the lower Mekong river basin

Ngor, Peng Bun 10 April 2018 (has links)
Le débit saisonnier du Mékong joue un rôle central dans la structuration amont/aval des communautés aquatiques. Cette étude examine les dynamiques de la structure spatiale et temporelle des communautés de poissons dans le bassin inférieur du Mékong, comprenant le Mékong aval et ses principaux affluents. L'application de méthodes statistiques univariées et multivariées, sur des bases de données spatiales et temporelles piscicoles et environnementales, met en évidence : * Le rôle prépondérant des débits dans l'explication de la dynamique spatiale et temporelle des patrons de diversité et de structure des assemblages piscicoles dans la bassin aval du Mékong. * Les effets de la pêche non sélective dans l'un des plus grands systèmes de production halieutique tropicale au monde, le lac le Tonlé Sap, avec la mise en évidence d'une production globalement durable marquée néanmoins par une composition altérée des communautés de poissons. * Les réponses des assemblages de poissons face aux fluctuations saisonnières et à la stabilité des débits dans les rivières non régulées et régulées du bas Mékong. Les résultats obtenus lors de cette thèse contribuent à la connaissance du fonctionnement des peuplements piscicoles et apportent une aide à la conception de plans de gestion et de conservation des ressources halieutiques et des autres ressources aquatiques dans le bassin du Mékong et au-delà. Cette étude suggère que : * Le maintien de la dynamique saisonnière des débits et de la connectivité des habitats est impératif afin d'assurer la dispersion longitudinale et latérale des poissons vers des habitats vitaux pour leur reproduction, leur alimentation et leur protection. * L'établissement d'une réglementation appropriée basée sur la connaissance des pics migratoires de poissons aux différentes échelles spatio-temporelles permettrait aux poissons migrateurs de franchir les rivières pour accéder à leurs habitats nécessaires à l'accomplissement de leur cycle de vie. Aussi, faire respecter et opérationnaliser de façon efficace les mécanismes officiels de gestion halieutique aux échelles locales, nationales et régionales, mais aussi allouer suffisamment de moyens pour le secteur de la pêche afin de lutter contre les pratiques de pêche illégale et pour la mise en œuvre de mesures de conservation contribuerait à résoudre les problèmes de surexploitation des ressources aquatiques. * La mimique des variations naturelles des débits par les barrages hydroélectriques devrait être priorisées et appliquées comme une des mesures permettant d'atténuer leurs impacts sur les peuplements aquatiques du bassin du Mékong. / The Mekong seasonal flow plays a pivotal role in structuring up- and downstream aquatic communities. The thesis investigates the dynamics of spatial and temporal fish community structure in the Lower Mekong system, i.e. the Lower Mekong River and its major tributaries. Using spatial and time-series datasets and univariate as well as multivariate statistical approaches, the thesis highlights: * The importance of flow and other environmental factors in explaining spatial and temporal dynamics of fish diversity patterns and assemblage structure in the Lower Mekong system. * The effects of indiscriminate fishing in one of the world's largest tropical inland fisheries, the Tonle Sap, with the finding of, despite overall stationary catch per unit effort (CPUE), strong alterations in assemblages composition, with decreasing trends in catches of large-sized species, and increasing trends in the catches of some small-sized species. * Contrasted responses of fish assemblages to a gradient of disruption of flow seasonality and predictability due to dams in the Lower Mekong system. The results obtained through this thesis contribute to the ecological understanding of fish assemblages and to the design of applications for long-term planning, monitoring, management and conservation of fisheries in the Mekong Basin and beyond. The thesis suggests that: * Maintaining the Mekong robust and predictably seasonal flood pulse dynamics and habitat connectivity is imperative to ensure fish longitudinal and lateral dispersal ability among critical habitats for breeding, feeding and seeking refuge. * Setting appropriate regulations based on known peak fish migrations at various spatiotemporal scales would allow migratory fish species to pass through rivers, access critical habitats and complete their life cycles. Also, enforcing and operationalizing the existing formal fisheries management mechanisms effectively at local, national and regional levels as well as allocating sufficient resources to the fishery sector to combat illegal fishing practices and implementing fisheries conservation measures in critical habitats would help deal with the problem of overharvesting. * Hydropower-related pulsed flows that can mimic as far as possible the natural pulsed flows are critical to reduce downstream effects on aquatic organisms, and, thus, should be prioritized and applied as one of the measures to mitigate the impacts from existing and planned hydropower dams in the Mekong Basin.
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Nouvelles perspectives sur l'histoire de l'Afrique : mythologies, arts rupestres et génétique / New perspectives on Africa's history

D'Huy, Julien 20 November 2018 (has links)
Dans ce travail, je chercherai à montrer l'intérêt d'une approche phylomémétique des mythes dans la perspective d’une reconstruction du peuplement de l’Afrique et du globe sur la très longue durée. Après une présentation historique de cette approche méthodologique, je soutiendrai que les mythes forment une classe, distincte et largement indépendante, de réplicateurs culturels dont le comportement et la fidélité peuvent rivaliser avec ceux des gènes et des langues, et montrerai qu'il est possible d’appliquer des outils informatiques utilisés en biologie à des familles de mythes ou de traditions orales pour tenter de répondre à des questions portant sur l'histoire des peuples et de leurs migrations, ou encore pour contribuer à l’interprétation des vestiges archéologiques. Je discuterai des objections communes à l'application de la modélisation phylogénétique aux mythes et mettrai en évidence l'extrême lenteur évolutive de certains d'entre eux. J’établirai ensuite une corrélation entre la diffusion des mythes et celle des gènes, ce qui me conduira à proposer, grâce à la construction d'arbres phylogénétiques, un modèle de diffusion des peuples en Afrique et à travers le monde. La forme première de plusieurs récits ou traditions orales, parfois antérieurs à la sortie d'Afrique, pourra ainsi être retrouvée, en même temps qu’un éclairage sur la signification de certains vestiges archéologiques – incluant l’art rupestre – pourra être apporté. Les résultats obtenus apparaissent solides, notamment du fait qu'ils résistent aux changements de corpus et de méthode, tout en demeurant cohérents avec ceux provenant d’autres approches. / In this dissertation, I will try to show you the interest of a phylomemetic approach of myths in the perspective of a reconstruction of the settlement of Africa, and of the globe over longterm.After an historical presentation of this methodological approach, I will argue that the myths form a distinct and largely independent class of cultural replicators whose behaviour and fidelity can rival those of genes and languages, and show that it is possible to apply computer tools used in biology to families of myths or oral traditions in an attempt to answer questions about the history of people and their migrations, or to contribute to the interpretation of archaeological remains.I will discuss common objections to the application of the phylogenetic model of myths, and highlight the extreme slowness of evolution for some of them. I will then establish a correlation between myths and gene diffusion, thanks to the construction of phylogenetic trees, a model of diffusion of peoples inside Africa and throughout the world.The first form of several oral narratives or traditions, sometimes existing prior to the Out-of-Africa process, can thus be found at the same time as a clarification on the meaning of certain archaeological remains including rock art can be brought. Results appear solid, in particular because they resist changes in the corpus and method and remain consistent with those from other approaches.
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Evolution de la biodiversité benthique des vasières subtidales de l'estuaire de la Seine en réponse à la dynamqiue sédimentaire. De l'approche descriptive à l'approche fonctionnelle.

Janson, Anne-Laure 13 July 2007 (has links) (PDF)
La variabilité temporelle de la macrofaune benthique en réponse à son environnement sédimentaire a été étudiée à travers une approche temporelle hiérarchisée, les trois échelles temporelles sélectionnées correspondant à trois constats sédimentologiques : (i) le comblement pluri-annuel de l'estuaire, (ii) la variabilité saisonnière de la couverture sédimentaire, et (iii) les remodelages sédimentaires induits par le système macrotidal. Cette étude a permis dans un premier temps de distinguer un faciès du peuplement des sables fins plus ou moins envasés, riche, diversifié et stable dans la zone la plus avale. En revanche, plus en amont, prennent place des faciès d'appauvrissement dont les cortèges spécifiques soulignent le caractère écotonal de ces secteurs internes, et les frontières imprécises et fluctuantes témoignent d'une forte variabilité temporelle de leurs structures. Cette étude a dans un second temps, mis en évidence la faible influence de la dynamique sédimentaire sur celle des peuplements, soulignant ainsi la difficulté à évaluer les relations « faune - sédiment » sur le seul critère de la taille des particules.<br />En vue de comprendre les relations entre les peuplements macrobenthiques et le fonctionnement du système, la contribution de la faune aux processus géochimiques à l'interface eau-sédiment a été étudiée à travers l'estimation des flux d'irrigation d'ammonium et d'oxygène. Si les premiers sont apparus comme de mauvais marqueurs de l'activité macrobenthique, les seconds ont pu être corrélés aux caractéristiques de la macrofaune. Toutefois, selon les densités et les paramètres faunistiques considérés (richesse spécifique, régime trophique, type de bioturbation), trois hypothèses « diversité biologique – fonctionnement du système » peuvent s'appliquer à l'estuaire de la Seine (idiosyncrasie, rivet-pop et diversité-stabilité). Il est par conséquent difficile d'établir une loi unique de fonctionnement du compartiment macrobenthique de cet estuaire.<br />Les études expérimentales dévelopées en méscosmes ont montré de facon surprenante une réponse temporelle variable de la marofaune à des dépôts sédimentaires. En effet, quels que soient la nature, l'épaisseur, la stabilité et le temps de résidence des dépôts sédimentaires, la perturabation de l'habitat induit une mortalité significative de la macrofaune en période hivernale tandis qu'en période printano-estivale, sa survie n'est pas menacée. La fréquence des modifications sédimentaires que connaît la macrofaune de l'embouchure de l'estuaire de la Seine pourrait être à l'origine de sa réactivité et de ses capacités de résistance.
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Les Systèmes d'Information Géographique : structure, mise en oeuvre et utilisation dans différentes études

Méaille, Robert 12 September 1988 (has links) (PDF)
L'augmentation de la quantité d'information disponible pour appréhender l'environnement a nécessité la création d'une nouvelle structure de gestion de l'information : le Système d'Information Géographique (SIG). Deux types de SIG peuvent être trouvés : ceux couvrant une large zone (de la taille d'un pays), et ceux plus locaux dont la plupart possèdent un but précis. Quoique la philosophie de ces deux structures soit la même, la mise en oeuvre et la gestion restent plus aisées pour les SIG locaux. La création et la mise en oeuvre d'un ou plusieurs SIG sont discutées. Trois exemples d'utilisation de SIG démontrent l'utilité de ces structures. Le premier exemple correspond à une étude préliminaire d'impact lors d'un projet d'aménagement dans le Parc National du Mercantour. Les informations contenues dans le SIG sont utilisées comme un filtre binaire afin de localiser les lieux propices au projet. Le second SIG concerne les peuplements benthiques de Méditerranée. La finalité de celui-ci est de synthétiser des informations sur un même lieu géographique, mais acquises avec des techniques de prélèvement différentes, par différents chercheurs et à des dates différentes. Cette synthèse fait appel à une notion de fiabilité de l'information. L'association d'un SIG avec un modèle numérique de simulation de l'évolution du milieu urbain constitue le dernier exemple d'utilisation. Ce modèle numérique tient compte des contraintes du milieu environnant données par le SIG, ainsi que de l'apport exogène de population. Les résultats montrent des projections de l'évolution du milieu urbain pour les années 2000 et 2025 et pour différents scénarios, dans la région de Toulon (Var).
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From Civilising Mission to Civilian Power: Rethinking EU Peacebuilding from a Postcolonial Perspective

Paone, Martina 01 December 2018 (has links) (PDF)
This research intends to explore the reverberations of the colonial experience in the European Union (EU) peacebuilding policy-making towards the Democratic Republic of Congo (DRC). In particular, it aims at reconstructing the link between the European colonial past and the EU, in order to address to what extent such historical heritage is manifested in the discursive practices of EU peacebuilding policy-making towards the Democratic Republic of Congo.Thus, the thesis seeks to answer to the following research question: “How does the EU address the European colonial legacy in peacebuilding policy-making towards the Democratic Republic of Congo?” To do so, the research position itself in a critical conversation with EU Studies and Postcolonial Studies, and mobilises Discourse-Historical Approach influenced by Colonial Discourse Theory as a methodological tool. After having gathered interviews with EU Officials working on peacebuilding policies, having conducted archival research in the Historical Archives of the European Union and having undertaken participant observation at the European External Action Service, the results of this research are mainly twofold. Firstly, this study shows that within EU peacebuilding policy-makers the colonial legacy is hardly addressed. Yet, the EU relies on a dehistoricised regime where selective historical events are mobilised to the objective of legitimising EU peacebuilding actions. Secondly, the research identifies discursive strategies that reproduce colonial discourses in EU peacebuilding policy-making. These strategies, mainly based on racial stereotypes, connote an unchanging order based on a fixed donor/recipient binary. Such pervasive discourses tend to perpetuate dependency, instead of reaffirming an independent peace process that is supposed to be the final goal of EU peacebuilding policies. / Doctorat en Sciences politiques et sociales / info:eu-repo/semantics/nonPublished
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Phénologies, mécanismes et perturbations anthropiques des dynamiques de migration dulçaquicoles des espèces amphidromes : cas des Sicydiinae de La Réunion / Phenology, mechanisms and anthropogenic disturbances of freshwater migrations dynamics of amphidromous species : example of the Sicydiinae in Reunion Island

Lagarde, Raphael 25 June 2018 (has links)
Les gobies amphidromes et, en particulier, ceux de la sous famille des Sicydiinae représentent une part importante de la diversité et de l'abondance des peuplements de poissons d'eau douce des îles tropicales. Ces espèces se reproduisent dans les rivières et ont une phase larvaire marine pendant plusieurs mois avant de retourner croitre et maturer en eau douce. L'objectif de cette thèse est d'acquérir des connaissances concernant la phénologie des dynamiques de migration en eau douce de deux espèces de Sicydiinae de La Réunion, Sicyopterus lagocephalus et Cotylopus acutipinnis et les mécanismes qui peuvent en être à l'origine. Ces études montrent que la dévalaison des larves vers la mer immédiatement après leur éclosion avait principalement lieu pendant l'été austral et en début de nuit dans les zones aval. Le débit des cours d'eau et ses fluctuations saisonnières et journalières jouent un rôle prépondérant dans cette dynamique de dévalaison en termes d'abondances de larves dérivant, de temps de dévalaison jusqu'à la mer et de survie des larves. Après leur arrivée en eau douce, les juvéniles vont coloniser l'ensemble des zones des bassins versants. Les plus fortes abondances de juvéniles en migration vers les zones amont sont observées en fin d'étiage et pendant l'après-midi. Enfin, S. lagocephalus présente des performances locomotrices supérieures à celles de C. acutipinnis soutenues par des morphologies plus diverses. Ces meilleures performances, soutenues par des morphologies plus diverses, sont l'un des facteurs qui peuvent expliquer la large aire de répartition de S. lagocephalus, présent dans les océans Indien et Pacifique, par rapport à C. acutipinnis qui est endémique de l’archipel des Mascareignes. Des recommandations de gestion, permettant principalement de restaurer la continuité biologique au niveau des barrages, sont faites au regard des résultats obtenus durant cette thèse. / Amphidromous gobies, especially those of the Sicydiinae subfamily, represent most of the diversity and abundance of the freshwater fish assemblages in tropical islands. These species spawn in rivers, spend months in the ocean as pelagic larvae and return to freshwater to grow and reproduce. This doctoral thesis aims at describing the phenology and some mechanisms of the dynamics of migration in freshwater of two Sicydiinae species in Réunion Island: Sicyopterus lagocephalus and Cotylopus acutipinnis. These studies highlighted that larval downstream migration to the sea, immediately after hatching, occurs mainly during austral summer and a few hours after sunset in downstream reaches. Seasonal and daily fluctuations of the flow regime also greatly influence the abundances, the transport duration from spawning site to the sea and the survival of larvae during their downstream migration. After their return to the freshwater, juveniles settle in the watersheds from the estuary to the most upstream reaches. The highest abundances of juveniles migrating to upstream reaches are observed during low flow conditions at the end of the afternoon. Finally, locomotor performances are better for S. lagocephalus compared to C. acutipinnis. These better locomotor performances, supported by more diverse morphologies, are among the factors explaining the presence of S. lagocephalus from Eastern Pacific Ocean to Western Indian Ocean when C. acutipinnis is endemic to the Mascarenes Archipelago. Based on the results obtained in this doctoral thesis, management and conservation recommendations are suggested especially for the restoration of fish passage at several migration barriers such as dams and weirs.
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Étude de l'écologie du Spirotropis longifolia DC Baill. (Leguminosae-Papilionoideae) : Espèce monodominante dans les forêts de Guyane française / The ecology of Spirotropis longifolia DC Baill. (Leguminosae-Papilionoideae) : a monodominant species in French Guiana.

Fonty, Emile 16 December 2011 (has links)
Pour de nombreux écologistes, les forêts tropicales sont synonymes de richesse et de diversité spécifique ; aussi l'existence de forêts monodominantes, à savoir de forêt dominée par une seule espèce, reste un formidable énigme. Nous présentons ici la première étude de l'autécologie d'une nouvelle espèce monodominante : Spirotropis longifolia (DC) Baill. (Leguminosae-Papilionoideae) se développant en Guyane française. La monodominance du S. longifolia est très importante, ce dernier pouvant représenter jusqu'à 70% du peuplement. Par ailleurs, le cortège floristique associé à cette espèce diffère largement de celui de la forêt adjacente, très diversifiée. La monodominance du S. longifolia ne peut être expliquée ni par des conditions pédologiques particulières ni par l'absence de compétiteur dans ses peuplements. Nous suggérons en revanche que ses étonnantes capacités à réitérer et à marcotter lui permettent d'installer de maintenir sa monodominance. Nous avons de plus développé un jeu de marqueurs microsatellites et constitué une banque de gènes au cours d'une importante campagne de terrain. Nous proposons une nouvelle classification de la monodominance afin de mieux appréhender les processus écologiques qui lui sont associés, et y replaçons le S. longifolia. Enfin, nous mettons en perspective nos résultats avec la gestion des peuplements naturels. / Large expanses of forest dominated by a single tree species, i.e. monodominant forests, occur through the tropics and remain an long-standing conundrum to most ecologists. In French Guiana, we described a new monodominant tree species: Spirotropis longifolia (DC) Baill. (Leguminosae-Papilionoideae), and studied, for the first time, its autecology. We reported a strong monodominant feature (up to 70 % of stems >10 cm in d.b.h.) and a marked difference between floristic composition of the dominated and adjacent, highly diverse, stands. The monodominance of S. longifolia was supported neither by peculiar soil conditions nor by a lack of competitors but may be owned to its astonishing self-coppicing and layering abilities which induce a sharp spatial structure. We also developed a set of microsatellite markers and conduct a large field survey to built up a gene data base. Facing the variety of ecological processes involved in monodominance, we identified a lack of conceptual framework, set a new classification of monodominance and positioned S. longifolia within. We finally discuss these results in the frame of the forest management.
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Les relations sol/plantes en forêts méditerranéennes : approche bioclimatique des déterminants de la structuration fonctionnelle des communautés microbiennes des sols et de leurs réponses à un double stress hydrique et thermique en région provençale calcaire / Soil-plant relationships in Mediterranean forests : bioclimatic assessment of the driving factors of soil microbial community functional structure and response to a water and thermic stress in limestome-based Provence area

Pailler, Alexia 18 December 2013 (has links)
En contexte forestier méditerranéen au sein de la région provençale calcaire (sud de la France), les relations sol/structure fonctionnelle catabolique des communautés microbiennes/communautés végétales ont été abordées selon différentes échelles bioclimatiques : un gradient latitudinal et altitudinal, et une échelle écosystémique restreinte à différentes séries de chênes pubescents. Ces travaux ont permis d’estimer les contributions respectives (et de leurs interactions) de la structure et de la composition de la végétation et des variables abiotiques dans la détermination des propriétés fonctionnelles des communautés microbiennes des sols. Dans le contexte des changements climatiques globaux, cette même stratégie a été mise en œuvre pour estimer les incidences, sur les potentiels cataboliques et les profils fonctionnels, d’un double stress hydrique et thermique ex situ, mimétique d’une vague de chaleur. Pour les diverses échelles spatiales, nos résultats ont mis en évidence la prépondérance de la part d’interaction entre la végétation et les variables abiotiques épigées et hypogées dans la structuration fonctionnelle des communautés microbiennes. Suite au stress, une diminution globale de leurs potentiels cataboliques a pu être observée. Néanmoins, nos résultats ont révélé une robustesse différentielle des relations entre la végétation et la structure fonctionnelle des communautés microbiennes selon le stade d’évolution de la végétation et de la nature des espèces constitutives de ces formations au niveau de leur dynamique d’occupation spatiale. Ceci pourrait atténuer ou exacerber les effets du réchauffement climatique sur les écosystèmes forestiers méditerranéens. / In Mediterranean forest ecosystems in the limestome-based Provence area (south of France), soil-microbial community functional catabolic structure-vegetation relationships were assessed based on different bioclimatic scales, across a latitudinal gradient, an elevation gradient, and at a restricted ecosystemic scale focusing on Pubescent oak forest stands. The respective parts (and their interactions) of the vegetation composition and structure and the abiotic variables in their functional profiles were investigated. Furthermore, in the context of climate change, this same strategy was used to investigate the effects of an ex situ water and thermic stress, mimetic to a heatwave event on microbial community catabolic potentials and functional profiles. For all the considered scales, our results highlighted the major part of the interactions between vegetation and abiotic aboveground-belowground variables in the determination of soil microbial community functional structure. Drought induced a decrease in their potential catabolic activities. Nevertheless, our results revealed a varying robustness of the interactions between vegetation and soil microbial functional structure based on the dynamic step of the evolution of the forest stands and on the type of their constitutive species. This may mitigate or exacerbate climate change effects on Mediterranean forest ecosystems.
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Polymorphisme érythrocytaire : approche anthropologique et interprétation de patterns de diversité génétique, entre peuplement et sélection / Red cell polymorphism : anthropological approach and interpretation of genetic diversity patterns, between settlement and selection

Petit, Florence 22 June 2018 (has links)
Mon travail de thèse est fondé sur la recherche d’une meilleure compréhension de la distribution géographique des polymorphismes érythrocytaires: antigènes de surface des systèmes de groupes sanguins érythrocytaires (GSE) et glucose-6-phosphate déshydrogénase (G6PD) intracellulaire. L’analyse sur 75 populations d’Asie des fréquences de l'allèle DI*01 du système de GSE Diego, des haplotypes C2-M217 et C2-M401 du chromosome Y, des coordonnées géographiques et des langues, a pu montrer la corrélation entre ces marqueurs. La répartition de DI*01 semble suivre les conquêtes mongoles, avec une expansion radiale depuis la Mongolie, porté par les nomades de langue Altaïque présentant C2-M217 et C2-M401. L'étude du gène G6PD chez 80 individus de Guyane Française de la communauté des Noirs Marrons originaire d’Afrique sub-Saharienne, aborde les relations santé-environnement. Les mutations du déficit en G6PD caractéristiques des variants sub-Sahariens ont été retrouvées chez une personne sur huit. La répartition du déficit était inconnue en Guyane Française et est encore mal connue en Amérique Latine et dans les Caraïbes, où sévit encore Plasmodium vivax dont le traitement nécessite l’utilisation de la primaquine pouvant entraîner une hémolyse sévère chez les individus G6PD-déficients. Mon troisième objectif a été de mettre en évidence l’influence de différents facteurs sur la répartition des polymorphismes de 10 systèmes de GSE étudiant 343 populations. Par des modélisations, les fréquences alléliques ont été confrontées aux données environnementales et culturelles. Enfin, une étude a été réalisée sur le système Duffy avec des analyses de détection de la sélection sur données SNP. / My Ph.D. work is based on the search for a better understanding of the geographical distribution of red blood cell polymorphisms: the surface antigens of red cell blood group systems (BGS) and the intracellular glucose 6-phosphate dehydrogenase (G6PD). The analysis on 75 Eurasian populations of frequencies of the DI*01 allele coding for Diego a antigen of Diego BGS, the C2-M217 and C2-M401 haplotypes of the Y chromosome, geographic coordinates and languages, has shown a correlation between these markers. The DI*01 distribution seems to follow the Mongol conquests, carried by the Altaic-speaking nomads possessing the C2-M217 and C2-M401 haplotypes with a radial expansion from Mongolia. The study of the G6PD gene in 80 individuals from French Guiana of the Noir Marron community originating from sub-Saharan Africa, addresses health-environment relations. Characteristic mutations of sub-Saharan variants of G6PD deficiency have occurred in one in eight people. The G6PD deficiency distribution was previously unknown in French Guiana and is still poorly known in Latin America and the Caribbean, where Plasmodium vivax still cracks down. Its treatment requires the use of primaquine which may cause severe haemolysis in G6PD-deficient individuals. My third objective was to highlight the influence of different factors on the distribution of polymorphisms of 10 BGS studying 343 populations. Through model adjustments, allelic frequencies have been confronted to environmental and cultural data. Finally, a study has been also conducted on the Duffy BGS by analyses of detection of natural selection on SNP data.

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