Made available in DSpace on 2016-06-02T20:21:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissASL.pdf: 712597 bytes, checksum: b44c9dc651fe1a7af889708ed1193646 (MD5) Previous issue date: 2003-01-24 / Financiadora de Estudos e Projetos / Allelic frequencies at 12 loci (five blood groups: C, D, K, P, and U; and seven protein polymorphisms: Al, A1B, Es, Gc, Hb, PGD, and Tf), are given for two Brazilian horse breeds: Mangalarga Marchador and Mangalarga. The high genetic identity value found (96.0%) is consistent with their common origin, although, at some point of the development of Mangalarga Marchador, Mangalarga separated from the original stock. The expected average heterozygosity was higher in Mangalarga Marchador. The populations presented genetic differentiation, as shown by the statistically significant value of FST. The nonsignificant FIS values showed that there was no appreciable consanguineous mating in any of the two populations. Exclusion probability calculated for the 12 loci was 87.0% and 86.5% for Mangalarga Marchador and Mangalarga, respectively. No genetic equilibrium was observed in the A1B, Tf, and Es loci of Mangalarga Marchador. The frequencies of blood factors A, Q, and T were calculated. / As frequências alélicas de 12 locos (cinco de grupos sangüíneos: C, D, K e U; e sete de polimorfismos proteicos) foram calculadas para duas raças brasileiras de cavalos: Mangalarga e Mangalarga Marchador. O alto valor de identidade genética encontrada (96%) está de acordo com sua origem comum, embora em algum ponto do desenvolvimento do Mangalarga Marchador, o Mangalarga foi separado de sua linhagem original. A heterozigosidade média experada foi maior em Mangalarga Marchador. As duas populações apresentaram diferenciação genética mostrada pelo valor significante estatisticamente de FST. Os valores não significantes de FIS mostraram que não há uma taxa apreciável de endocruzamentos em nenhuma das duas populações. A probabilidade de exclusão calculada para os 12 locos foi de 87,0% e 86,5% para Mangalarga Marchador and Mangalarga, respectivamente. Os locos A1B, Tf, and Es da raça Mangalarga Marchador não apresentaram equilíbrio genético. As freqüências dos fatores sangüíneos A, Q e T também foram calculadas.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Medicina, Programa de Pós-Graduação em Patologia Molecular, 2017. / Submitted by Raquel Almeida (raquel.df13@gmail.com) on 2017-08-02T19:43:49Z No. of bitstreams: 1 2017_LigiaCanongiadeAbreuCardoso_PARCIAL.pdf: 2530188 bytes, checksum: 348c031509a8d7a5d00f67054fd15860 (MD5) / Rejected by Ruthléa Nascimento (ruthleanascimento@bce.unb.br), reason: on 2017-08-02T20:27:56Z (GMT) / Submitted by Raquel Almeida (raquel.df13@gmail.com) on 2017-08-02T20:32:31Z No. of bitstreams: 1 2017_LigiaCanongiadeAbreuCardoso_PARCIAL.pdf: 1700025 bytes, checksum: e9b30d078485db4f8f95483f6e203034 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2017-10-06T18:24:02Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2017_LigiaCanongiadeAbreuCardoso_PARCIAL.pdf: 1700025 bytes, checksum: e9b30d078485db4f8f95483f6e203034 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-06T18:24:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017_LigiaCanongiadeAbreuCardoso_PARCIAL.pdf: 1700025 bytes, checksum: e9b30d078485db4f8f95483f6e203034 (MD5) Previous issue date: 2017-10-06 / O Acidente Vascular Encefálico (AVE) corresponde a uma disfunção neurológica aguda causada pela interrupção do fluxo sanguíneo em áreas do encéfalo, ocasionando diversas incapacidades e o acometimento global interfere em atividades diárias da vida do paciente. O Acidente Vascular Encefálico Hemorrágico (AVEH), compreende a hemorragia subaracnóide e a hemorragia intraparenquimatosa, que tem como principal doença associada a hipertensão arterial sistêmica (HAS). No Brasil, são registradas mais de 68 mil mortes por AVE anualmente, tal doença representa a primeira causa de morte e incapacidade no país, gerando impacto social e econômico. Neste trabalho foram avaliados Polimorfismos Genéticos em pacientes diagnosticados com AVEH e/ou Aneurisma Intracerebral. Polimorfismo genético pode ser compreendido quando há mutação de nucleotídeos em pelo menos 1% dos indivíduos da espécie, onde um específico gene apresenta variações em suas sequências codificadora, não-codificadora ou promotoras, o que pode acarretar fenótipos diferentes. O objetivo do presente estudo foi investigar possível associação entre os polimorfismos dos genes CTLA4, NOS3 e CYP e a ocorrência do AVEH e/ou Aneurisma Intracerebral, descrevendo frequências alélicas e genotípicas, avaliando diferentes manifestações clínicas e prognósticos de pacientes residentes no Distrito Federal. Os participantes preencheram uma ficha de identificação e foram sujeitos à coleta de sangue venoso. Após a coleta, foi realizada extração do DNA, PCR-RFLP e análise do genótipo. As frequências genotípicas foram estimadas por contagem direta, por meio do programa SPSS versão 23.0. Para comparação das distribuições das frequências foi aplicado o teste do qui-quadrado, de forma a detectar possíveis associações dos genótipos entre os grupos caso e controle. Foram consideradas associações com probabilidades menores que 5% (P<0,05). Concluiu-se que independente do polimorfismo a presença da HAS é um fator de risco para a ocorrência de AVEH/Aneurisma e quando analisado o polimorfismo CTLA4 -318 C/T, a presença do genótipo CT, foi considerada um fator de risco para a ocorrência de AVEH/Aneurisma. Os demais polimorfismos não obtiveram diferença estatística quanto à associação entre os diferentes genótipos. / Stroke refers to an acute neurological dysfunction caused by disruption of blood flow in areas of the brain, causing various disabilities, and global impairment interferes with daily activities of the patient's life. Hemorrhagic Stroke (HS), includes subarachnoid hemorrhage and intraparenchymal hemorrhage, which has as its main disease associated with systemic arterial hypertension (SAH). In Brazil, more than 68 thousand deaths per year are registered, this disease represents the first cause of death and disability in the country, generating social and economic impact. Genetic polymorphism can be understood when there is a mutation of nucleotides in at least 1% of the individuals of the species, where a specific gene presents variations in its coding, non-coding or promoter sequences, which can lead to different phenotypes. The aim of the present study was to investigate possible association between the CTLA4, NOS3 and CYP gene polymorphisms and the occurrence of hemorrhagic stroke/intracerebral aneurysm, describing allelic and genotype frequencies, evaluating different clinical manifestations and prognoses of patients residing in the Federal District. Participants filled out an identification form and were subjected to venous blood collection. After the collection, DNA extraction, PCR-RFLP and genotype analysis were performed. The genotypic frequencies were estimated by direct counting, using SPSS software version 23.0. To compare the frequency distributions, the chi-square test was applied in order to detect possible associations of genotypes between the case and control groups. Associations with probabilities less than 5% (P <0.05) were considered. It was concluded that regardless of the polymorphism the presence of SAH is a risk factor for the occurrence of hemorrhagic stroke/Aneurysm. Analyzing the CTLA4 -318 C/T polymorphism, the presence of the CT genotype was considered a risk factor for the occurrence of hemorrhagic stroke/Aneurysm. The other polymorphisms did not present statistical difference regarding the association between the different genotypes.

Orientador: Claudia Regina Bonini- Domingos / Banca: Flávio Augusto Naoum / Banca: Sônia Maria Oliani / Resumo: A Doença Falciforme é caracterizada por anemia hemolítica e eventos vaso-oclusivos que resultam em crises de dor aguda, com danos crônicos e progressivos nos tecidos e órgãos. Pacientes com Doença Falciforme mostram ativação da coagulação sanguínea e sistema fibrinolítico, bem como aumento da atividade plaquetária e consumo de inibidores da coagulação, especialmente durante as crises vaso-oclusivas. A hiper-homocisteinemia, resultante de mutações no gene da metilenotetrahidrofolato redutase (MTHFR) e no gene da cistationinabeta- sintase (CBS), constituem fatores de risco isolados para doenças vasculares. Diante da importância em se identificar fatores de risco para doenças tromboembólicas, a complexidade da fisiopatologia vascular na da Doença Falciforme e a associação de polimorfismo como potenciais modificadores genéticos, objetivamos avaliar a frequência de polimorfismos nos genes CBS e MTHFR em Doentes Falciformes. Foram pesquisados 300 pacientes de várias localidades do país, com hemoglobinopatia S (Hb SS, Hb SC, Hb S/Beta talassemia) para a presença da mutação C677T no gene da MTHFR e 844ins68, no gene da CBS. Foram coletados 5 mL de sangue venoso em EDTA, após consentimento informado. As metodologias clássicas para o diagnóstico de hemoglobinopatias foram realizadas para a confirmação do fenótipo de cada portador. O DNA foi extraído dos leucócitos pelo método fenol/clorofórmio. As detecções das mutações referentes aos genótipos de Hemoglobina e dos polimorfismos pesquisados foram realizadas por amplificação de um segmento gênico, com iniciadores que flanqueiam a região de inserção e análise por RFLP e AE. Posteriormente foi feita a revelação em gel de agarose, corado com ...(Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Sickle Cell Disease is an inflammatory condition with dependent pathophysiology of vaso-occlusive episodes. Mutations in methylenetetrahydrofolate reductase gene (MTHFR) and cystathionine beta-synthase (CBS) gene are risk factors for vascular disease. Given the importance of identifying risk factors for vasoocclusive events in sickle cell patients, aimed to evaluate the frequency of mutations C677T in the MTHFR gene and 844ins68 in the CBS gene in these patients.We evaluated 300 sickle cell patients, HbSS, HBSC, HbS/Beta thalassemia, from Brasília, Goiânia, Rio de Janeiro, São Jose do Rio Preto and São Paulo. Were collected 5mL of venous blood in EDTA after informed consent. The classical methods were performed to confirm the phenotype of hemoglobin. The mutations to the genotypes of hemoglobin and polymorphisms studied were evaluated by Restriction Fragment Length Polymorphism and Allele Specific. The results showed that 93 patients (31.00%) were heterozygous and 13 (4.33%) homozygous for the C677T mutation and 90 were heterozygotes (30.00%) and 8 homozygous (2.66%) for the 844ins68 mutation, both with significant difference for genotypic frequency between the locatities. The allelic frequencies are in Hardy-Weinberg equilibrium for both mutations. Analyzing punctually the patients of the city of Goiania The frequence of mutations were significant and the presence of related vaso-occlusive events was more incident in patients with HbSS (p=0007). The 844ins68 mutation was approximately three times higher in patients with the presence of vaso-occlusive complications (p=0011). The C677T mutation didn't show association with the risk for vaso-occlusive manifestations (p=0,193) in patients. The C677T/844ins68 interaction occurred in 12.08% of patients and showed an increase of twice the risk of vaso-occlusive manifestations (RR:2.16). The frequencies of mutations... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Christiane Pienna Soares / Banca: Lilian Maria de Castilho / Banca: Luiz Carlos de Mattos / Banca: João Lauro Viana de Camargo / Banca: Haroldo Wilson Moreira / Resumo: A expressão de antígenos ABH e Lewis tem sido associada com o desenvolvimento e prognóstico do câncer, diferenciação tumoral e metástase. Considerando que o carcinoma ductal invasivo (CADI) de mama apresenta múltiplas alterações, o objetivo deste estudo foi avaliar se o polimorfismo dos genes ABO, Lewis e Secretor, bem como a fenotipagem ABO podem estar associados ao câncer de mama e com parâmetros anatomoclínicos do tumor. Foram avaliadas 76 mulheres portadoras de CADI e 78 mulheres doadoras de sangue para a fenotipagem/genotipagem ABO e genotipagem Lewis e Secretor. Fenotipagem foi realizada por método de hemaglutinação, a genotipagem ABO por PCR seguida de restrição enzimática e a genotipagem dos grupos Lewis e Secretor por PCR alelo específico (PCR-AE). A genotipagem foi realizada considerando o polimorfismo dos genes em um único nucleotídeo, sendo que para o gene Lewis nas posições 59, 1067, 202 e 314, para o gene Secretor na posição 428 e para o gene ABO nas posições 261 (alelo O1), 526 (alelos O2 e B) e 703 (alelo B). Os genótipos Lewis foram classificados em Lewis positivo (tipo selvagem ou com duas/três mutações) e Lewis negativo (duas a quatro mutações). O genótipo secretor foi classificado em Secretor (selvagem ou com a mutação em heterozigose) e Não-secretor (homozigoto mutante). Nenhuma associação foi encontrada entre as pacientes com câncer de mama e o fenótipo (P=0,9323) e genótipo (P=0,9356) ABO. Mulheres com genótipo Lewis negativo foram associadas com CADI (P=0,0126), mas não foram associadas com os parâmetros anatomoclínicos (tamanho tumor, estadiamento TNM e metástase em linfonodos axilares). Genótipo Não-secretor foi associado com metástase em linfonodos axilares (P=0,0149). Em conclusão, os genótipos Lewis e Secretor podem ser úteis para predizer, respectivamente suscetibilidade e metástase em linfonodos axilares. / Abstract: ABH and Lewis antigens expression have been associated with cancer development, prognosis, tumor differentiation and metastasis. Considering that invasive ductal breast carcinoma (IDC) present multiple molecular alterations, the aim of the present study was evaluated if the polymorphism of ABO, Lewis and secretor genes, as well as ABO phenotyping could be associated to breast cancer and anatomoclinical parameters of the tumor. In 76 women with IDC and 78 health women blood donors, ABO phenotyping/genotyping, Lewis and Secretor genotyping were evaluated. Phenotyping was performed by hemmaglutination method and genotyping by Polymerase Chain Reaction with Sequence-Specific Primers (PCR-SSP). ABO, Lewis and Secretor were classified by individual single nucleotide polymorphism (SNP) at sites 59, 1067, 202 and 314 of the Lewis gene, 428 of the Secretor gene and 261 (O1 allele), 526 (O2 and B allele) and 703 (B allele). Lewis genotype was classified in Lewis positive (wild-type or two/three SNPs) or Lewis negative (two to four different SNPs). The Secretor genotype was classified in Secretor (wild type or SNP in heterozygoses) and Non-secretor (SNP in homozygoses). No association was found between patients with breast cancer and ABO antigen expression (P=0.9323) and genotypes (P=0.9356). Lewis negative was associated with IDC (P=0.0126), but were not associated with anatomoclinical parameters (tumor size, TNM staging and axillary lymph nodes metastasis). Non-secretor genotype was associated with axilary lymph nodes metastasis (P=0.0149). In conclusion, the Lewis and Secretor genotyping could be useful to predict, respectively, of breast cancer susceptibility and axillary lymph nodes metastasis. / Doutor

Orientador: Pedro Luis da Costa Aguiar Alves / Coorientador: Janete Aparecida Desidério / Coorientador: Silvano Bianco / Banca: Dagoberto Martins / Banca: Leonardo Bianco de Carvalho / Resumo: O conhecimento da biologia aliado as estudos genéticos são ferramentas importantes para o manejo eficaz de plantas daninhas resistentes. Contudo os objetivos do trabalho foram: a) Comprovar existência de biótipo de Digitaria insularis resistente a glyphosate por meio de curva dose-resposta obtidas quando as plantas apresentaram de 2 a 4 folhas totalmente expandidas; b) Avaliar efeito da temperatura na presença e na ausência de luz; Avaliar o efeito da duração da luz (fotoperíodo) e disponibilidade hídrica na germinação das sementes de R e S; c) Verificar o efeito da profundidade de semeadura na emergência das plântulas de R e S; d) Estudar e comparar a fenologia e desenvolvimento de R e S; e) Detectar a taxa de polimorfismo entre os biótipos. Pra isso, foram utilizadas sementes de Digitaria insularis R e S e submetidas ás temperaturas constantes: 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35 e 40°C; Alternadas: 10-20, 15-25, 20-30, 25-35 e 15-35°C; fotoperíodo: 0, 6, 8, 10, 12, 14, 16 e 18 horas; potenciais osmóticos: 0,0, -0,2, -0,4, -0,6, -0,8 e 1,0 MPa; profundidades de semeadura: 0, 1, 2, 3, 4, 5, 7, 10 e 15 cm; além da caracterização dos estádios fenológicos e desenvolvimento, e taxa de polimorfismo. Verificou-se que o fator de resistência (FR) foi de 5,3 para nota de controle, sendo o EC50 para a porcentagem de controle, de 416,6 g e.a.ha-1 para o R e 78,5 g e.a.ha-1 para o S. A temperatura fixa ótima para a germinação de ambos os biótipos foi de 30ºC e alternadas de 20-30ºC, tanto na presença quanto na ausência de luz, ainda a faixa fotoperiódica ótima foi de 10 a 12 horas de luz. O biótipo R germinou até potencial osmótico de -0,8 MPa enquanto o S até -0,4 MPa. Quando submetidos a diferentes profundidades de semeadura, ambos os biótipos apresentaram alta taxa de emergência até 4 cm. Em todas as variáveis propostas para a germinação e emergência, o biótipo ... / Abstract: The knowledge of the biology ally will genetic studies are important tools for the effective management of resistant weeds. However, the objectives this work were: a) proves the existence of Digitaria insularis biotypes resistant to glyphosate through dose-response curve obtained when the plants had 2-4 fully expanded leaves b) Evaluate the effect of temperature in the presence and absence of light; evaluate the effect of light duration (photoperiod) and water availability on germination of the R and S c) to investigate the effect of sowing depth on seedling emergence of the R and S d) to study and compare the phenology and growth the R and S, e) Detecting the polymorphism among biotypes. For this, was used seeds of Digitaria insularis R and S which were submitted ace constant temperatures: 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35 and 40 ° C; Alternate: 10-20, 15-25, 20 - 30, 25-35 and 15-35 ° C, photoperiod: 0, 6, 8, 10, 12, 14, 16 and 18 hours; osmotic potential: 0.0, -0.2, -0.4, -0 , 6, 1.0 and -0.8 MPa; sowing depth: 0, 1, 2, 3, 4, 5, 7, 10 and 15 cm, besides characterization of the growth stages and development, and rate of polymorphism. It was found that the resistance factor (RF) was 5.3 to note control, and the EC50 for the percentage of control, 416.6 g e.a.ha-1 to R and 78.5 g e.a.ha-1 to S. The optimal temperature stationary was 30ºC and alternate was 20-30ºC both in the presence and absence of light, although the photoperiodic optimum range was 10 to 12 hours of light. The R biotype germinated until the osmotic potential of -0.8 MPa, while the S to -0.4 MPa. When subjected to different sowing depths, both biotypes showed high germination rate up to 4 cm. In all the proposed variables for germination and emergence, the R biotype showed better performance than the S. Furthermore, the R biotype development was faster and strong relative to S, the first reaching the reproductive stage. The rate ... / Mestre

Orientador: Raquel Mantuaneli Scarel-Caminaga / Resumo: Diversos fatores relacionados ao hospedeiro, como fatores ambientais (tabagismo), doenças sistêmicas (diabetes e dislipidemia) e herança genética vêm sendo estudados quanto à influência no início e progressão da doença periodontal. Embora muitos estudos tenham investigado a relação entre dislipidemia e periodontite crônica (PC), examinando os níveis séricos de lipídeos, os resultados ainda são contraditórios, indicando a demanda da realização de uma metanálise. Alguns Genome-Wide Association Studies (GWAS), estudos de bioinformática e diversos estudos caso-controle evidenciaram variantes genéticas associadas à suscetibilidade à periodontite, mas os resultados para alguns desses polimorfismos são escassos ou contraditórios entre as diferentes populações. Assim, nota-se a importância de realizar metanálises e estudos caso-controle para buscar validar ou identificar a associação de polimorfismos com a PC na população brasileira. O objetivo deste estudo foi dividido em 3 capítulos: (1) investigar se os pacientes com PC apresentam diferentes níveis séricos de parâmetros lipídicos (HDL, LDL, colesterol total e triglicérides) em comparação com indivíduos saudáveis; (2) avaliar se polimorfismos de base única (SNPs, single nucleotide polymorphisms) nos genes LDLR (rs5925 e rs688) e APOB (rs676210 e rs693) contribuem para a suscetibilidade à PC, uma vez que PC está associada a níveis plasmáticos de LDL mais elevados, e os polimorfismos nestes genes podem aumentar as concentrações plasm... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Several factors related to the host, such as environmental factors (smoking), systemic diseases (diabetes and dyslipidemia) and genetic inheritance have been studied regarding the influence on the onset and progression of periodontal disease. Although several studies have investigated the relationship between dyslipidemia and chronic periodontitis (CP), focusing on serum lipid levels, the results are still contradictory, indicating the necessity of a meta-analysis. Some genome-wide association studies (GWAS), bioinformatics studies and several case-control studies have shown genetic variants associated with susceptibility to CP, but the results of some of these polymorphisms are sparse and contradictory among different populations. Thus, it is important to conduct meta-analysis and case-control studies in order to validate or identify an association of polymorphisms with CP in a Brazilian population. The objective of this study was divided into three chapters: (1) to investigate whether patients with CP present different serum levels of lipid parameters (HDL, LDL, total cholesterol and triglycerides) compared to healthy individuals; (2) to assess whether single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the LDLR (rs5925 and rs688) and APOB (rs676210 and rs693) genes contribute to CP susceptibility, since CP is associated with higher plasma LDL levels and the polymorphisms of these genes may increase plasma LDL concentration; (3) to validate, in the Brazilian population, the associati... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Daisy Maria Fávero Salvadori / Banca: Elza Tieme Sakamoto Hojo / Banca: Raquel Alves dos Santos / Banca: Camila Correa / Banca: Débora Damasceno / Resumo: Nas últimas décadas, a incidência de indivíduos com sobrepeso ou obesos vem aumentando exponencialmente. Hoje, a obesidade é considerada pela Organização Mundial da Saúde como uma epidemia mundial, com graves consequências que podem levar à morte. A obesidade é uma desordem multifatorial que envolve fatores hereditários, ambiente e estilo de vida, e suas consequências não são apenas sociais ou psicológicas, mas estão principalmente relacionadas à presença de co-morbidades como a hipertensão arterial, diabetes tipo II, doenças cardiovasculares e vários tipos de câncer. Portanto, o controle da obesidade é um desafio para a manutenção da saúde humana, atraindo o interesse de inúmeros pesquisadores que buscam o entendimento dos mecanismos associados ao seu desenvolvimento, bem como novos métodos terapêuticos e de prevenção. Com base nessas premissas, o presente estudo objetivou avaliar a associação entre alterações genéticas e a obesidade, com especial foco para a presença de danos no DNA e para o perfil de expressão e polimorfismos gênicos. A casuística do estudo incluiu 300 mulheres cadastradas na lista de espera para a realização de cirurgia bariátrica e 300 mulheres saudáveis, eutróficas, pareadas por idade. O teste do cometa foi utilizado para avaliação de danos primários no DNA de células sanguíneas; os polimorfismos dos genes da grelina (GHRL)e leptina (LEP)e dos seus receptores (GHSR e LEPR), da interleucina 6(IL-6) e da serotonina (5-HT2C) foram analisados pela técnica de RT-PCR; o perfil de expressão gênica em linfócitos foi avaliado pela metodologia do DNA microarray e a expressão dos genes adiponectina (ADIPOQ) e leptina (LEP) em adipócitos foi avaliada pela técnica de qRT-PCR. Os resultados mostraram que a frequência dos polimorfismos dos genes GHRL(rs26802), GHRS(rs572169), LEP(rs7799039), LEPR(rs 1137101), IL-6 (rs1800796) e 5-HT2C ... / Abstract: In the last decades, the incidence of overweight and obesity has increased worldwide. Nowadays, obesity is considered by the World Health Organization as a global epidemic with severe consequences that can lead to death. Obesity is a multifactorial disorder which involves different factors such as genetic, environment and life style, and its consequences are not only social or psychological, but are also related to the presence of comorbidities such as hyperthension, type 2 diabetes, heart diseases and many types of cancer. Therefore, obesity control has become a challenge for the human health maintenance, catching the attention of researchers that are trying to understand the mechanisms associated to its development, as well as therapeutical and preventive methods. Based on the information above, the present study aimed to evaluate the association between genetic alterations and obesity, with special focus on the presence of DNA damage, gene expression profiling and genetic polymorphisms. Our study included 300 morbid obese women registered for the bariatric surgery and 300 healthy eutrophic women, matched by age. The comet assay was used to assess primary DNA damage in blood cells; the genetic polymorphisms of ghrelin (GHRL), leptin (LEP) and their receptors (GHSR and LEPR), interleukin-6 (IL-6) and serotonin receptor (5-HT2C) were evaluated by the RT-PCR; gene expression profiling in lymphocytes was assessed by DNA microarrays; and adiponectin (ADIPOQ) and leptin (LEP) gene expression in adipocytes were evaluated by qRT-PCR. Our results showed that the frequencies of GHRL (rs26802), GHRS (rs572169), LEP (rs7799039), LEPR (rs 1137101), IL-6 (rs1800796) and 5-HT2C (rs 3813929) polymorphisms were not different between obese and control groups. However, obese presented higher levels of primary DNA damage (single and double strand breaks, alkali-labile sites and oxidative damage) than eutrophic women, indepedent on ... / Doutor

Made available in DSpace on 2016-07-01T13:10:35Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-11-12. Added 1 bitstream(s) on 2016-07-01T13:14:17Z : No. of bitstreams: 1 000866541.pdf: 1198385 bytes, checksum: 265d4dc3d78da2996e89f94af5e66b2d (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Fundação Paulista Contra a Hanseníase / hanseníase é uma doença de caráter complexa causada pelo Mycobacterium leprae, que é um patógeno intracelular obrigatório com predileção por macrófagos na pele e células de Schwann nos nervos periféricos. O genoma altamente conservado do bacilo sugere que o patógeno não seja o responsável pela variedade de fenótipos clínicos e biológicos observada na doença, atribuindo grande importância aos fatores genéticos do hospedeiro. Estudos de ligação do tipo genome-wide apontaram um locus de susceptibilidade para a doença na região cromossômica 10p13 e o gene GATA3, localizado na região 10p15, é um forte candidato a fazer parte dessa associação devido à sua localização no genoma e ao seu papel na resposta imune. O GATA-3 é um fator de transcrição clássico na diferenciação de células Th2, no entanto, sabe-se hoje que essa proteína possui outras funções importantes para o sistema imune. Nós empregamos a estratégia de estudo de associação do tipo caso-controle em série, utilizando duas amostras populacionais do Brasil com 1.633 indivíduos, para testar sete variantes genéticas do GATA3. Um estudo funcional também foi conduzido para avaliar o efeito dos polimorfismos associados sobre a expressão de GATA-3 e produção de citocinas. O alelo A do polimorfismo rs10905284 foi associado com resistência para a hanseníase em ambas as amostras. Na análise combinando as duas amostras este efeito do alelo A foi confirmado (OR 0,67; IC95%: 0,54-0,84; p=0,0004). A análise funcional mostrou que os indivíduos portadores do genótipo AA expressam altos níveis da proteína GATA-3 nos linfócitos. Portanto, nós confirmamos que o marcador rs10905284 está associado à hanseníase na população brasileira e influencia os níveis de expressão do fator de transcrição GATA-3 / Leprosy outcome is a complex trait and the host-pathogen-environment interaction defines the emergence of the disease. The causative agent of the disease, Mycobacterium leprae, exhibits a conserved genome and could not be accountable for the variety of outcomes observed from exposition, infection and disease. Thus, host genetic risk factors have been successfully associated to leprosy. The 10p13 chromosomal region was linked to leprosy in familial studies and the GATA3 gene is a strong candidate to be part of this association due to its locus and the role that exerts in the immune response. The GATA-3 is a transcription factor involved in the Th2 cell differentiation, however, today it is recognized the ample role of this protein in the immune response. Here, we applied a stepwise strategy to test genetic variants at GATA3 in two case-control samples from Brazil comprising a total of 1,633 individuals. A functional investigation was also conducted to evaluate the effect of the polymorphisms on the GATA-3 protein and the cytokines production. The A allele of rs10905284 marker was associated to leprosy resistance in both samples. In the analysis combining the two samples this effect was reinforced (OR 0,67; CI95%: 0,54-0,84; p=0,0004). The functional analysis showed that individuals carrying AA genotype express higher levels of GATA-3 protein in lymphocytes. So, we confirmed that the rs10905284 is a locus associated to leprosy in the Brazilian population and influences the levels of this transcription factor.

Made available in DSpace on 2016-08-12T18:48:52Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-12-01. Added 1 bitstream(s) on 2016-08-12T18:51:09Z : No. of bitstreams: 1 000865131.pdf: 520117 bytes, checksum: 91056e3b2cd8c27c469abfbd99f32de1 (MD5) / Uma vez que a mecanização possibilita o plantio da cana-deaçúcar em épocas desfavoráveis e também estimula a ocorrência de ferimentos nos toletes, o aumento na utilização desse tipo de plantio favorece algumas podridões, como a podridão abacaxi, a qual pode ser considerada uma das mais importantes doenças da cultura da cana-de-açúcar. No entanto, há poucos estudos sobre a variabilidade genética do seu agente causal, Thielaviopsis paradoxa, fato que dificulta os programas de melhoramento genético da cultura para essa doença. Assim sendo, esse estudo teve como objetivo avaliar, por meio de marcadores AFLP (Polimorfismo de Comprimento de Fragmento Amplificado) a diversidade genética existente em 11 isolados de T. paradoxa provenientes de cinco diferentes regiões produtoras de cana-de-açúcar no Brasil. Foram obtidas 298 bandas polimórficas, mas, excluindo isopolimorfismos restaram 174 bandas com correlações diferentes de (1) ou (-1) nos 11 isolados, evidenciando diversidade entre os isolados de T. paradoxa em estudo, a qual pode ser explicada, principalmente pela característica polífaga do patógeno e sua conseqüente baixa especificidade. Os valores médios de PIC (Conteúdo Informativo de Polimorfismo) de cada combinação de primers apresentaram uma média de 0,406, valor que pode ser considerado alto, ou seja, informativo, tratando-se de marcador dominante. O fenograma construído com as 174 bandas reuniu os 11 isolados em três diferentes grupos. O grupo I incluiu cinco isolados e três Estados (BA, GO e SP), o grupo II incluiu cinco isolados e três Estados (SP, PR e MG) e o grupo III incluiu apenas um isolado e um Estado (SP). Portanto, o presente estudo demonstrou haver alto polimorfismo entre os isolados de de T. paradoxa, fato que sinaliza a existência de alta variabilidade genética dessa espécie de fitopatógeno / Once mechanization allows sugarcane planting in almost all year and increases mechanical injuries, this type of planting provides the occurrence of many diseases, as pineapple disease, which is an economically important sugarcane disease that occurs in almost all sugarcane commercial planting areas. The genetic improvement of sugarcane to this disease is affected because of the lack of studies about genetic diversity of Thielaviopsis paradoxa, causal agent of pineapple disease. Thus, the genetic diversity study of 11 isolates of T. paradoxa from five different sugarcane commercial planting areas was accomplished using AFLP technique. A total of 298 polymorphic bands were obtained, but only 174 polymorphic bands had correlation different than (1) or (-1) in the 11 isolates of T. paradoxa. Based on our result was possible to infer genetic variation among T. paradoxa isolates. Once T. paradoxa is parasitic on a range of economic and food crops, this fact can explain the detected genetic variation among T. paradoxa isolates. The medium values of PIC (Polymorphism Information Content) of each primers combination revealed an average of 0,406, which can be considered high (informative), once the molecular marker is dominant. The phenogram, obtained by 174 polymorphic bands, separated the 11 isolates in three different groups. The group I contained five isolates and three Brazilian States (BA, GO e SP), the group II contained five isolates and three Brazilian States (SP, PR e MG) and the group III contained only one isolate and one Brazilian State (SP). Therefore, this study showed high polymorphism among T. paradoxa isolates, what reveal high genetic variability in this phytopathogenic specie

A agenesia dentária é a falha do desenvolvimento do germe dentário causando a ausência definitiva do dente. Constitui–se na anomalia dentária mais comum, afetando até um quarto da população em geral. A principal causa está relacionada com a função anormal de genes específicos que desempenham um papel chave durante a odontogênese, especialmente o MSX1 e o PAX9. Apesar da alta frequência dessa anomalia, apenas algumas mutações no MSX1 e no PAX9 foram associadas com a agenesia não–sindrômica até o momento. Uma vez que um número maior de indivíduos afetados é esperado nos próximos anos, uma análise mais profunda dos defeitos genéticos que levam à agenesia torna–se fundamental. O objetivo desta pesquisa foi estudar seis famílias segregando oligodontia/hipodontia não–sindrômica, além de investigar a presença de mutações nos genes MSX1 e PAX9 com a finalidade de associar fenótipo e genótipo. As famílias, que apresentam mais de um integrante com agenesia, foram selecionadas a partir de uma clínica particular. Amostras de células epiteliais bucais foram coletadas de todos os indivíduos por meio de escovas citológicas. O DNA foi isolado, amplificado e sequenciado. Todas as sequências foram comparadas com as existentes no GenBank. A homologia das sequências mutantes também foi comparada utilizando–se o software online BLAST. Os genes MSX1 e PAX9 de dez indivíduos controle não afetados e sem grau de parentesco também foram sequenciados. Foi identificada uma nova mutação missense no exon 2 próximo ao final do domínio pareado do PAX9 em três famílias. A mutação heterozigótica C503G resulta em uma troca de aminoácido de alanina para glicina no resíduo 168 (Ala168Gly), o qual é invariavelmente conservado entre várias espécies. A mudança alanina–glicina pode determinar uma alteração da estrutura proteica devido às propriedades únicas de flexibilidade da glicina, levando à agenesia dentária. Tal mutação não encontra–se registrada em nenhum banco de dados conhecido ou na literatura sendo, portanto, inédita. As mutações intrônicas IVS2–109G>C, IVS2–54A>G e IVS2–41A>G também foram identificadas no PAX9. Essas variantes polimórficas podem estar envolvidas no fenótipo uma vez que um probando, o qual apresentou todas as três mutações intrônicas em homozigose, foi afetado com a mais severa forma de oligodontia dentro da amostra. A transição * 6C>T foi identificada no exon 2 do MSX1, em apenas uma família. Devido ao fato de estar localizada seis bases após o stop codon, essa mutação homozigótica pode dificultar/alterar o término da tradução contribuindo, assim, para o fenótipo. Novos estudos acerca da expressão gênica em um número maior de famílias afetadas irá aumentar o conhecimento sobre agenesia dentária. Tal entendimento permitirá alcançar melhores opções de tratamento e, talvez, uma ferramenta de diagnóstico precoce que, possivelmente, envolverá o exame de DNA baseado em variantes polimórficas. Todos esses dados podem auxiliar a clínica odontológica em um futuro próximo. / Submitted by Marcelo Teixeira (mvteixeira@ucs.br) on 2014-06-17T14:28:55Z No. of bitstreams: 1 Tese Breno Ramos Boeira Junior.pdf: 3106508 bytes, checksum: d974027dc18150cfe6e3bc0b2ba8edb1 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-06-17T14:28:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese Breno Ramos Boeira Junior.pdf: 3106508 bytes, checksum: d974027dc18150cfe6e3bc0b2ba8edb1 (MD5) / Universidade de Caxias do Sul / Tooth agenesis, the failure of development of tooth bud causing definitive absence of the tooth, is the most common dental anomaly affecting up to one quarter of the general population. The main cause is related to abnormal function of specific genes which play key roles during odontogenesis, particularly MSX1 and PAX9. Despite the high frequency of this anomaly, there are only a restricted number of mutations in MSX1 and PAX9 that have been associated with non–syndromic tooth agenesis so far. Since a greater number of affected subjects is expected over the coming years, a deeper analysis of the gene networks underlying tooth agenesis is critical. The aim of this research was to investigate six families segregating non–syndromic oligodontia/hypodontia as well as to screen for mutations in their MSX1 and PAX9 genes, attempting to associate phenotype and genotype. Families were selected from a private office. They should present more than one relative affected with agenesis. All subjects had a sample of buccal epithelial cells collected with cytology brushes. DNA was isolated, amplificated and sequenced. All sequences were compared to those in GenBank. Homology of the mutant sequences was also compared using BLAST online software. MSX1 and PAX9 genes from ten unrelated unaffected control subjects were also sequenced. A novel missense mutation lying in the exon 2 close to the end of the paired domain of PAX9 was identified in three families. Heterozygous mutation C503G is expected to result in an alanine–to–glycine amino acid change in residue 168 (Ala168Gly), which is invariably conserved among several species. The alanine–glycine change might lead to protein structural alteration due to the unique flexibility properties of glycine, leading to tooth agenesis. This is a novel mutation since it is not registered neither in any known database nor in literature. Intronic mutations IVS2–109G>C, IVS2–54A>G and IVS2–41A>G were also identified in PAX9. These polymorphic variants may be involved in the phenotype as one proband, showing all three intronic mutations in homozygosis, was affected with the most severe oligodontia within the sample. Transition *6C>T lying in the exon 2 six base pairs after the stop codon was detected in MSX1 gene in one family. Due to its proximity to the stop codon, this homozygous mutation can hinder a regular translation termination thus contributing to the phenotype. Further studies with gene expression in larger affected families will increase knowledge of tooth agenesis. Such understanding will allow to achieve better treatment options and, perhaps, an early diagnosis tool which would possibly lie on the DNA examination based on polymorphic variants. All this data may assist dental practice in a near future.