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Observação por co-específicos e influências sociais na apresendizagem do uso de ferramentas para quebrar cocos por macacos-prego (Cebus.sp.) em semi-liberdade / Observation by conspecifics and socially-biased learning in nutcracking tool-use by semi-wild capuchin monkies (Cebus sp.)Coelho, Camila Galheigo 14 April 2009 (has links)
A presente dissertação dá continuidade às pesquisas que vêm sendo desenvolvidas há mais de uma década com um grupo de macacos-prego (Cebus sp.) do Parque Ecológico do Tietê, e cujo escopo reside na análise dos comportamentos de manipulação de objetos, uso de ferramentas para obtenção de alimento e na transmissão social de informação. Filhotes manipulam cocos e pedras, inicialmente de forma inepta e gradualmente desenvolvem as técnicas necessárias para o uso de pedras como ferramentas percussivas para quebrar cocos posicionados sobre bigornas. Durante o processo de aquisição da técnica de quebrar cocos, os filhotes observam co-específicos executando o comportamento. Os macacos-prego adultos são extremamente tolerantes a infantes e juvenis, permitindo uma observação próxima da atividade, acesso aos cocos e martelos e inclusive a possibilidade de se alimentar de restos de cocos quebrados. Essa tolerância confere oportunidades sociais que podem facilitar a aprendizagem de indivíduos ingênuos, levando à transmissão social do uso de pedras como ferramentas. Um estudo anterior (Ottoni et al 2005) verificou que a escolha de alvos não se correlacionava significativamente com sua idade, proximidade social ou posto hierárquico, mas sim se correlacionava com a proficiência dos alvos potenciais, uma estratégia que otimiza as possibilidades de transmissão social de informação, mas que poderia estar sendo mediada por um mecanismo simples de otimização pelas oportunidades de comer restos (scrounging). Buscamos aqui investigar com mais precisão estas correlações entre os fatores sociais e de desempenho da técnica que estariam associados à escolha dos alvos de observação. Verificamos que a observação de co-específicos durante a quebra de cocos se correlacionou significativamente com diversos fatores: proximidade social, hierarquia social, idade, proficiência e produtividade na quebra. Diferenças em relação ao estudo anterior sugerem que o comportamento de quebra de cocos podia estar, então, se disseminando pelo grupo, estando hoje em sua fase de tradição. Observamos a ocorrência de scrounging em 74,5% dos eventos observacionais, o que dá suporte à hipótese de que o scrounging constitua a motivação proximal para a observação da quebra de cocos, e outras oportunidades de aprendizagem socialmente enviesada que não dependem da observação do comportamento em si: a farta disponibilidade de restos de cocos nos sítios após um episódio de quebra permite aos observadores fazer scrounging e manipular os elementos nos sítios, mesmo em se tratando de indivíduos pouco tolerados socialmente. Foi registrada uma alta freqüência de observações de alvos machos adultos por fêmeas adultas, o que sugere um possível papel de display sexual da quebra de cocos. Uma idiossincrasias foi observada no comportamento atual de quebra de cocos pelos macacos-prego do P.E.T: as fêmeas, usualmente pouco ativas em outros estudos, mostraram-se freqüentes quebradoras e foram alvo de observação no presente estudo A dinâmica das interações sociais que ocorrem no contexto da quebra de cocos com o auxílio de ferramentas, associada aos padrões de desenvolvimento ontogenético da proficiência neste comportamento, favorecem a caracterização do uso de ferramentas na quebra de cocos como uma tradição comportamental. / This dissertation gives continuity to research with a group of Capuchin monkeys (Cebus sp.) from the Tietê Ecological Park, under way for over a decade. The scope of the research includes manipulative behaviours of objects, tool-use and social transmission of information. Infants and juveniles manipulate nuts and stones, initially in a non-proficient way and gradually they develop the necessary skills for the use of the stone as percussive tools for nutcracking on top of anvils. During the acquisition of the nut-cracking technique, infants and juveniles observe conspecifics cracking nuts. Adult capuchin monkeys are extremely tolerant with infants and juveniles, allowing close observation, access to nuts and hammers and even the possibility of scrounging cracked nuts. This tolerance gives way to social opportunities which may facilitate learning for naive individuals, leading to the social transmission of the use of stones as tools. A previous study (Ottoni et al 2005) verified that observation did not significantly correlate to age, social proximity or hierarchy, but it did correlate to the proficiency of observational targets. A simple mechanism such as optimizing scrounging opportunities could hence maximize possibilities of social transmission of information. Here we sought out to investigate more accurately the correlations between the choice of observation targets and social factors and between the former and factors related to the performance of the technique. We verified that the observation of conspecifics during nutcracking significantly correlated to several factors: social proximity, social hierarchy, age, proficiency and productivity in cracking nuts. Differences in relation to the previous study suggest that the nut-cracking behaviour has recently (as of 15 years or so) disseminated through the group, as is presently in the tradition phase. We observed the occurrence of scrounging in 74,5% of the observational episodes, which support the hypotheses that scrounging constitutes the proximal motivation for nut-cracking observation, and other opportunities of socially-biased learning. This does not depend on observing behaviour per se as there is abundant availability of left-over cracked nuts on the anvils after an episode of nutcracking, which allows the monkeys to scrounge and manipulate the elements on site. This is especially relevant for individuals that are less tolerated socially. High frequency of observations by adult females was registered, suggesting a possible role of sexual display in nut-cracking. One idiosyncrasy was observed in the current nut-cracking behavior by Capuchin monkeys at P.E.T: the females, usually less active in other studies, appeared frequent crackers and targets of observation in this study. The dynamics of social interactions which occur in the tool-use-nut-cracking context associated to the patterns of the ontogenetic development of proficiency in this behaviour, favour the characterization of tool use in nutcracking as a behavioral tradition.
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Pesquisa de antígenos eritrocitários humanos em macacos-prego (Sapajus sp) e em macacos bugios (Alouatta sp)Silva, Adaíze Pereira da January 2017 (has links)
Orientador: Lucilene Silva Ruiz e Resende / Resumo: Pesquisaram-se 28 antígenos eritrocitários pertencentes aos sistemas de grupos sanguíneos humanos ABO, H, Rh, Kell, Duffy, Kidd, Lewis, P, MNS, Lutheran e Diego, nos eritrócitos de 9 macacos-prego (Sapajus sp) e 10 macacos bugios (Alouatta sp).A maioria dos antígenos humanos pesquisados não foi observada nos 2gêneros de macacos, correspondendo a 19/28 antígenos negativosnos Sapajus sp, e 20/28 antígenos negativosnos Alouatta sp. A fenotipagem eritrocitária foi bastante semelhante em cada grupo de animais, sendo que 5 macacos-prego diferiram dos outros 4 apenasno sistema ABO, e 3 macacos bugios diferiram dos demais 7somente no sistema MNS.Houve diferenças antigênicasentre os gênerosem apenas4 sistemas de grupos pesquisados (P, ABO, Rh, MNS). Constataram-se, nos animais, alguns antígenos eritrocitários com frequências semelhantes e outros com frequências opostas às observadas em humanos ou etnias humanas. Em comparação comestudos prévios envolvendo macacos-prego e macacos bugios, observou-se concordância quanto à presença ou ausência de alguns antígenos eritrocitários, e discordância em relação a outros.Que seja do nosso conhecimento, o presente estudo é o mais completo já realizado quanto ao número de antígenos eritrocitários pesquisados em macacos do Novo Mundo, especialmenteem macacos brasileiros. / Mestre
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Evolução dos genes da rede OXT - AVP - PRL: Aspectos moleculares, fisiológicos e comportamentais em mamíferosRosa, Pamela Laiz Paré da January 2018 (has links)
A busca pelo repertório genético por trás de características comportamentais e reprodutivas de espécies de primatas tem desafiado nosso grupo de pesquisa. A premissa principal nesse tipo de estudo baseia-se na hipótese de que um traço fenotípico (seja ele fisiológico, comportamental, etc) compartilhado por um grupo taxonômico inteiro deve ser determinado por um repertório genético comum a esses táxons. Considerando a complexidade de muitas dessas características, temos ampliado nossos estudos para vários genes da rede OXT – AVP – PRL, usando abordagens in silico, in vitro, e in vivo. Na presente Tese, o conjunto gênico de estudo foi selecionado por uma metodologia baseada na ontologia biológica, com critério de seleção para características como comportamento materno, amamentação e aspectos reprodutivos, tais como comportamento de acasalamento e de corte. Essa seleção resultou em 12 genes candidatos para o estudo: AVP, AVPR1A, AVPR1B, ESR1, FOS, HCRT, OXT, OXTR, PRL, PRLH, PRLR e TRH. Exploramos aqui esse conjunto gênico da rede OXT – AVP – PRL através da mineração de dados, buscando por seus ortólogos nas várias espécies de primatas e de outros mamíferos, bem como através de novos dados de sequências da região codificadora dos genes PRLR e PRLH, em um conjunto de espécies de primatas do Novo Mundo (NWM, conforme sigla em inglês). Adicionalmente, sequências das regiões codificadoras de PRLR foram também obtidos em espécies de marsupiais. Com o objetivo de elucidar os padrões evolutivos dos genes de interesse, utilizamos análises como os testes NsSites e Branch Sites do pacote PAML, assim como vários testes populacionais clássicos, para diferentes conjuntos amostrais. Além disso, foi feita a predição da estrutura secundária das proteínas-alvo, utilizando metodologia específica do programa PSIPRED, bem como o PONDER-FIT, para a caracterização de aminoácidos intrinsecamente desordenados. Nossos resultados das análises in silico sugerem que os genes da família de receptores da vasopressina (AVPR1A, AVPR1B, e AVPR2) apresentam um padrão compatível com seleção positiva em mamíferos placentários. Alguns dos sítios com sinal de seleção apresentam motivos lineares (SLiMS) preditos no receptor AVPR2, que podem ter facilitado a emergência de novidades adaptativas, conforme foi sugerido para a espécie do rato-canguru Dipodomys ordii, que habita regiões áridas. As análises dos dados originais da região codificadora do gene PRLR em 17 espécies de NWM revelaram vários sítios presentes na forma longa do receptor com alta probabilidade de estarem sob seleção positiva, sendo que alguns deles (posições 507, 532 e 572) estão associados com o parto gemelar, uma característica das espécies de Callitrichidae. Adicionalmente verificamos no ramo dos Siimiformes um motivo linear de interação que reconhece domínios SH3 (Src Homology 3). Os domínios SH3 e os seus locais de ligação foram descritos para centenas de proteínas; eles fornecem à célula um meio particularmente conveniente e adaptável de interação específica proteína-proteína, que pode ser de importância funcional. Esse trabalho como um todo contribuiu para o conhecimento do repertório genético relacionado à complexa rede de mecanismos neuroendócrinos associados à emergência de traços adaptativos, tanto fisiológicos quanto comportamentais em diferentes clados de mamíferos. / The search for the genetic repertoire behind behavioral and reproductive features of Primate species has challenged our research group. The principal premise in this kind of study is based on the hypothesis that a phenotypic trait (either physiological, behavioral, etc.) shared by an entire taxonomic group should be determined by a genetic repertoire common to these taxa. Considering the complexity of many of these features, we have expanded our studies for several genes of the OXT - AVP - PRL network, using in silico, in vitro, and in vivo approaches. In the present Thesis, the set of genes for the study was selected by a methodology based on biological ontology, with features like maternal behavior, breastfeeding, and reproductive aspects, such as mating and courtship behavior. This selection resulted in 12 candidate genes for the study: AVP, AVPR1A, AVPR1B, ESR1, FOS, HCRT, OXT, OXTR, PRL, PRLH, PRLR, and TRH. We explored here this gene set of the OXT – AVP – PRL network through data mining, searching for their orthologues in many Primate species and other mammals, as well as through new sequence data from the PRLR and PRLH coding region in a set of New World Monkey (NWM) species. Additionally, sequences from the PRLR coding regions were also obtained in marsupial species. To elucidate evolutionary patterns of the genes of interest, we used the NsSites and Branch Sites tests from PAML package, as well as several classic population tests, for different sample sets. In addition, we predicted the secondary structure of target proteins, using a specific methodology of the PSIPRED program, as well as PONDER-FIT for prediction of intrinsically disordered amino acids. Our in silico results suggest that the genes of the vasopressin receptor family (AVPR1A, AVPR1B, and AVPR2) present a pattern compatible with positive selection in placental mammals. Some of the sites with selection signals have linear motifs (SLiMS) predicted in the AVPR2 receptor, which may have facilitated the emergence of adaptive novelties, as was suggested for the kangaroo rat Dipodomys ordii, which inhabits arid regions. Analyses of the original PRLR coding region data on 17 NWM species revealed several sites present in the long form of the receptor with a high probability of being under positive selection, some of them (positions 507, 532 and 572) being associated with twin births, a characteristic of Callitrichidae species. Additionally, we verified in the Siimiformes branch a linear interaction motif that recognizes SH3 domains (Src Homology 3). The SH3 domains and their ligands were described for hundreds of proteins; they provide a particularly convenient and adaptable medium of specific protein-protein interaction to the cell, which can be of functional importance. This work as a whole contributed to the knowledge of the genetic repertoire connected to the complex network of neuroendocrine mechanisms associated to the emergence of physiological and behavioral adaptive traits in different mammalian clades.
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Pesquisa de antígenos eritrocitários humanos em macacos-prego (Sapajus sp) e em macacos bugios (Alouatta sp) / Research on human erythrocyte antigens in nail monkeys (Sapajus sp) and in howler monkeys (Alouatta sp)Silva, Adaíze Pereira da [UNESP] 29 June 2017 (has links)
Submitted by Adaize Pereira da Silva null (adaizebtu@yahoo.com.br) on 2017-07-27T13:16:38Z
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Previous issue date: 2017-06-29 / Pesquisaram-se 28 antígenos eritrocitários pertencentes aos sistemas de grupos sanguíneos humanos ABO, H, Rh, Kell, Duffy, Kidd, Lewis, P, MNS, Lutheran e Diego, nos eritrócitos de 9 macacos-prego (Sapajus sp) e 10 macacos bugios (Alouatta sp).A maioria dos antígenos humanos pesquisados não foi observada nos 2gêneros de macacos, correspondendo a 19/28 antígenos negativosnos Sapajus sp, e 20/28 antígenos negativosnos Alouatta sp. A fenotipagem eritrocitária foi bastante semelhante em cada grupo de animais, sendo que 5 macacos-prego diferiram dos outros 4 apenasno sistema ABO, e 3 macacos bugios diferiram dos demais 7somente no sistema MNS.Houve diferenças antigênicasentre os gênerosem apenas4 sistemas de grupos pesquisados (P, ABO, Rh, MNS). Constataram-se, nos animais, alguns antígenos eritrocitários com frequências semelhantes e outros com frequências opostas às observadas em humanos ou etnias humanas. Em comparação comestudos prévios envolvendo macacos-prego e macacos bugios, observou-se concordância quanto à presença ou ausência de alguns antígenos eritrocitários, e discordância em relação a outros.Que seja do nosso conhecimento, o presente estudo é o mais completo já realizado quanto ao número de antígenos eritrocitários pesquisados em macacos do Novo Mundo, especialmenteem macacos brasileiros. / The aim of this study was to evaluate the presence of 28 erythrocyte antigens of 11 human blood groups systems (ABO, H, Rh, Kell, Duffy, Kidd, Lewis, P, MNS, Lutheran and Diego) on erythrocytes of 9 nail monkeys (Sapajus sp) and 10 howler monkeys (Alouatta sp). Most of the human erythrocyte antigens were not observed in the 2 generaof monkeys, corresponding to 19/28 negative antigens in Sapajus sp, and 20/28 negative antigens in Alouatta sp. Erythrocyte phenotyping was very similar in each group, being that 5 nail monkeys differed from the other 4 only for the ABO system, and 3 howler monkeys differed from the other 7 only for the MNS system.Antigenic differences between the 2 generawere observed only for 4 blood groups systems (P, ABO, Rh, MNS). This study revealed that some monkey erythrocyte antigens were similar in frequency, and others werein opposite frequency from those observed in human or human ethnicities.When this study is compared with previous similar studies some concordance and some disagreement of findings are found, but as far as we known our study is the most complete in relation to the number of investigated erythrocyte antigens in New World monkeys, specially in the Brazilian ones.
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Estudo clínico-morfométrico, hematológico, bioquímico e imunocitoquímico em alouatta belzebul (Primates, Platyrrhini) /Guimaraes, Victor Yunes. January 2016 (has links)
Orientador: Regina Kiomi Takahira / Coorientador: José Augusto P. C. Muniz / Resumo: Os guaribas-de-mãos-ruivas (Alouatta belzebul) são endêmicos do Brasil, atualmente classificados em nível global e nacional como "Vulnerável" e podem ser encontrados principalmente na Amazônia Oriental. Este estudo se propôs a realizar a avaliação clínica e laboratorial de primatas do complexo Alouatta belzebul no bioma amazônico, a fim de caracterizar parâmetros de higidez para uma população residente às margens do Baixo rio Xingu. 27 primatas foram capturados nas áreas de influência da UHE Belo Monte, estado do Pará, Brasil. As variáveis biométricas avaliadas reforçaram as inferências para o gênero, em relação ao dimorfismo sexual pelo tamanho corpóreo, além da constatação de polimorfismos no padrão de coloração da pelagem. Entretanto, as variações talvez possam ser atribuídas a características geográficas, não suficientes para separar as populações em nível taxonômico. A estratificação etária também revelou diferenças significativas nas contagens de eritrócitos, nas concentrações de hemoglobina, hematócrito, na atividade sérica de fosfatase alcalina e GGT para os indivíduos jovens. Enzimas como AST, CK e LDH registraram atividade sérica significantemente superior, quando comparadas aos estudos em cativeiro. Os percentuais de linfócitos T e B circulantes foram 51 e 31% respectivamente, caracterizando o predomínio de linfócitos com o imunofenótipo T. Diante dos desafios imunológicos a que estes animais estão submetidos constantemente, presume-se que o perfil imunológico enco... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Mestre
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Trypanosoma cruzi e outros tripanosomas em primatas não humanos procedentes do Parque Zoológico Municipal de Bauru, São Paulo, BrasilSantos, Wesley José dos. January 2016 (has links)
Orientador: Simone Baldini Lucheis / Coorientador: Virgínia Bodelão Richini Pereira / Resumo: Os animais silvestres, tanto os de vida livre como os de cativeiro, podem ser reservatórios e portadores de diversos protozoários, como os integrantes do gênero Trypanosoma. Trypanosoma cruzi é um dos mais conhecidos tripanosomas, agente etiológico da doença de Chagas. Manifesta-se clinicamente com um caráter multifacetado, afetando humanos e várias espécies de animais domésticos e silvestres, como os primatas não humanos, que podem constituir-se em reservatórios do parasito. Em relação aos primatas neotropicais, ocorrem diferentes infecções por tripanosomas que também acometem humanos. No presente estudo, foram coletadas amostras de sangue de 39 primatas não humanos procedentes do Parque Zoológico Municipal de Bauru para pesquisa sorológica anti-T. cruzi e molecular de T. cruzi utilizando-se primers da região de kDNA de T. cruzi (TCZ1 e TCZ2) e da região codificadora da proteína de choque térmico (hsp70). Todos os animais foram negativos ao teste sorológico anti-T. cruzi e molecular para T. cruzi com os primers da região de kDNA. Porém, com a utilização de primers para hsp70, 11 dos 39 (28,2%) animais foram positivos. Os resultados do sequenciamento apresentaram similaridade para protozoários do gênero Trypanosoma. Apesar das dificuldades em se chegar à espécie circulante de tripanosoma entre os primatas, conclui-se que vetores triatomíneos e/ou moscas hematófagas podem estar circulando no ambiente dos animais e que ações de vigilância e busca dos mesmos são altamente recome... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Wild animals, both free-living and the captive ones, can be reservoirs and carriers of various protozoa, such as members of the genus Trypanosoma. Trypanosoma cruzi, the etiologic agent of Chagas disease, is one of the most known trypanosomes. Chagas disease is manifested clinically with a multifaceted character, affecting humans and several species of wild and domestic animals, such as non-human primates, which can be reservoirs of this parasite. Regarding the Neo-tropical primates, different infections occur by trypanosomes that also can affect humans. In this study, 39 blood samples were collected from nonhuman primates from Zoo Park Municipal of Bauru, São Paulo, Brazil, by serological and molecular analysis for T. cruzi infection using specific primers for kDNA region (TCZ1 and TCZ2) and the region encoding the heat shock protein (hsp70). All animals were negative to the serological test for anti-T. cruzi and molecular for T. cruzi with primers for kDNA region. However, with the use of primers for hsp70, 11 of 39 (28.2%) animals were positive. The sequencing results showed similarity to the genus Trypanosoma. Despite the difficulties in stablish the species of trypanosome among these primates, it is concluded that triatomine vectors and/or bloodsucking flies may be present in the animal environment; so, the entomologic vigilance for these insects are highly recommended. / Mestre
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Pesquisa de tripanosomatídeos em primatas de cativeiro do Parque Zoológico Municipal de Bauru, São PauloGuiraldi, Lívia Maísa. January 2016 (has links)
Orientador: Simone Baldini Lucheis / Coorientador: Virgínia Bodelão Richini Pereira / Resumo: A família Trypanosomatidae inclui agentes etiológicos responsáveis por ocasionar doenças em humanos e demais animais, englobando dezenas de protozoários pertencentes a diferentes gêneros, destacando-se os protozoários representantes dos gêneros Leishmania, causadores das leishmanioses e Trypanosoma, causador de tripanosomíase. Enquanto a transmissão das leishmanioses ocorre devido à picada de insetos fêmeas de flebotomíneos pertencentes ao gênero Phlebotomus no Velho Mundo e Lutzomyia no Novo Mundo, a transmissão da tripanossomíase depende da espécie de tripanosoma envolvida na infecção, podendo ocorrer pela picada de insetos adultos do gênero Glossina; pelas fezes de triatomíneos, sobretudo do gênero Triatoma e mecanicamente por moscas hematófagas, principalmente do gênero Stomoxys. Além dos humanos, animais domésticos e silvestres podem atuar como reservatórios de tripanosomatídeos, incluindo os primatas não humanos, os quais estão associados com o ciclo enzoótico das leishmanioses e tripanosomíase, sendo que a infecção natural por protozoários do gênero Trypanosoma e Leishmania em mamíferos selvagens é comum na natureza. O objetivo do trabalho foi pesquisar tripanosomatídeos em primatas de cativeiro procedentes do Parque Zoológico Municipal de Bauru - SP por meio de anticorpos contra o parasito e pela amplificação do DNA do protozoário. Para tanto, foram coletadas amostras de sangue de 39 primatas. A técnica molecular de Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) foi aplicada na... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The family Trypanosomatidae includes etiological agents responsible for causing diseases in humans and other animals. There are dozens of protozoa belonging to different genres, especially protozoa representatives of Leishmania genre, which causes leishmaniasis and Trypanosoma, responsible for trypanosomiasis. While the transmission of leishmaniasis is due to the bites of female sand flies belonging to the genus Phlebotomus in the Old World and Lutzomyia in the New World, the transmission of trypanosomiasis depends on the species of trypanosome involved in the infection. It may occurs by the bite of adult insects of the genus Glossina or by the feces of insects, especially by the genre Triatoma and mechanically by bloodsucking flies, especially the Stomoxys genre. In addition to humans, domestic and wild animals can act as trypanosomatids reservoirs, including non-human primates, which are associated with the enzootic cycle of leishmaniasis and trypanosomiasis; the natural infection by Trypanosoma and Leishmania protozoa in wild mammals is common in nature. The aim of the study was to investigate trypanosomatids in captive primates coming from Municipal Zoological Park of Bauru by antibodies against the parasite and the amplification of the DNA of the parasite. For this, blood samples were collected from 39 primates. The molecular technique of Polymerase Chain Reaction (PCR) was applied in research for Leishmania braziliensis, Leishmania amazonensis and Leishmania infantum us... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Evolução dos genes da rede OXT - AVP - PRL: Aspectos moleculares, fisiológicos e comportamentais em mamíferosRosa, Pamela Laiz Paré da January 2018 (has links)
A busca pelo repertório genético por trás de características comportamentais e reprodutivas de espécies de primatas tem desafiado nosso grupo de pesquisa. A premissa principal nesse tipo de estudo baseia-se na hipótese de que um traço fenotípico (seja ele fisiológico, comportamental, etc) compartilhado por um grupo taxonômico inteiro deve ser determinado por um repertório genético comum a esses táxons. Considerando a complexidade de muitas dessas características, temos ampliado nossos estudos para vários genes da rede OXT – AVP – PRL, usando abordagens in silico, in vitro, e in vivo. Na presente Tese, o conjunto gênico de estudo foi selecionado por uma metodologia baseada na ontologia biológica, com critério de seleção para características como comportamento materno, amamentação e aspectos reprodutivos, tais como comportamento de acasalamento e de corte. Essa seleção resultou em 12 genes candidatos para o estudo: AVP, AVPR1A, AVPR1B, ESR1, FOS, HCRT, OXT, OXTR, PRL, PRLH, PRLR e TRH. Exploramos aqui esse conjunto gênico da rede OXT – AVP – PRL através da mineração de dados, buscando por seus ortólogos nas várias espécies de primatas e de outros mamíferos, bem como através de novos dados de sequências da região codificadora dos genes PRLR e PRLH, em um conjunto de espécies de primatas do Novo Mundo (NWM, conforme sigla em inglês). Adicionalmente, sequências das regiões codificadoras de PRLR foram também obtidos em espécies de marsupiais. Com o objetivo de elucidar os padrões evolutivos dos genes de interesse, utilizamos análises como os testes NsSites e Branch Sites do pacote PAML, assim como vários testes populacionais clássicos, para diferentes conjuntos amostrais. Além disso, foi feita a predição da estrutura secundária das proteínas-alvo, utilizando metodologia específica do programa PSIPRED, bem como o PONDER-FIT, para a caracterização de aminoácidos intrinsecamente desordenados. Nossos resultados das análises in silico sugerem que os genes da família de receptores da vasopressina (AVPR1A, AVPR1B, e AVPR2) apresentam um padrão compatível com seleção positiva em mamíferos placentários. Alguns dos sítios com sinal de seleção apresentam motivos lineares (SLiMS) preditos no receptor AVPR2, que podem ter facilitado a emergência de novidades adaptativas, conforme foi sugerido para a espécie do rato-canguru Dipodomys ordii, que habita regiões áridas. As análises dos dados originais da região codificadora do gene PRLR em 17 espécies de NWM revelaram vários sítios presentes na forma longa do receptor com alta probabilidade de estarem sob seleção positiva, sendo que alguns deles (posições 507, 532 e 572) estão associados com o parto gemelar, uma característica das espécies de Callitrichidae. Adicionalmente verificamos no ramo dos Siimiformes um motivo linear de interação que reconhece domínios SH3 (Src Homology 3). Os domínios SH3 e os seus locais de ligação foram descritos para centenas de proteínas; eles fornecem à célula um meio particularmente conveniente e adaptável de interação específica proteína-proteína, que pode ser de importância funcional. Esse trabalho como um todo contribuiu para o conhecimento do repertório genético relacionado à complexa rede de mecanismos neuroendócrinos associados à emergência de traços adaptativos, tanto fisiológicos quanto comportamentais em diferentes clados de mamíferos. / The search for the genetic repertoire behind behavioral and reproductive features of Primate species has challenged our research group. The principal premise in this kind of study is based on the hypothesis that a phenotypic trait (either physiological, behavioral, etc.) shared by an entire taxonomic group should be determined by a genetic repertoire common to these taxa. Considering the complexity of many of these features, we have expanded our studies for several genes of the OXT - AVP - PRL network, using in silico, in vitro, and in vivo approaches. In the present Thesis, the set of genes for the study was selected by a methodology based on biological ontology, with features like maternal behavior, breastfeeding, and reproductive aspects, such as mating and courtship behavior. This selection resulted in 12 candidate genes for the study: AVP, AVPR1A, AVPR1B, ESR1, FOS, HCRT, OXT, OXTR, PRL, PRLH, PRLR, and TRH. We explored here this gene set of the OXT – AVP – PRL network through data mining, searching for their orthologues in many Primate species and other mammals, as well as through new sequence data from the PRLR and PRLH coding region in a set of New World Monkey (NWM) species. Additionally, sequences from the PRLR coding regions were also obtained in marsupial species. To elucidate evolutionary patterns of the genes of interest, we used the NsSites and Branch Sites tests from PAML package, as well as several classic population tests, for different sample sets. In addition, we predicted the secondary structure of target proteins, using a specific methodology of the PSIPRED program, as well as PONDER-FIT for prediction of intrinsically disordered amino acids. Our in silico results suggest that the genes of the vasopressin receptor family (AVPR1A, AVPR1B, and AVPR2) present a pattern compatible with positive selection in placental mammals. Some of the sites with selection signals have linear motifs (SLiMS) predicted in the AVPR2 receptor, which may have facilitated the emergence of adaptive novelties, as was suggested for the kangaroo rat Dipodomys ordii, which inhabits arid regions. Analyses of the original PRLR coding region data on 17 NWM species revealed several sites present in the long form of the receptor with a high probability of being under positive selection, some of them (positions 507, 532 and 572) being associated with twin births, a characteristic of Callitrichidae species. Additionally, we verified in the Siimiformes branch a linear interaction motif that recognizes SH3 domains (Src Homology 3). The SH3 domains and their ligands were described for hundreds of proteins; they provide a particularly convenient and adaptable medium of specific protein-protein interaction to the cell, which can be of functional importance. This work as a whole contributed to the knowledge of the genetic repertoire connected to the complex network of neuroendocrine mechanisms associated to the emergence of physiological and behavioral adaptive traits in different mammalian clades.
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Conservação e risco de extinção em primatas / Conservation and extinction risk in primatesMachado, Flávia de Figueiredo 28 May 2018 (has links)
Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-08-28T11:09:57Z
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Previous issue date: 2018-05-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / (Sem resumo em outra língua) / Nesta tese tive o objetivo de investigar os fatores relacionados ao risco de extinção
em primatas, assim como as tendências e vieses nos esforços de pesquisas voltadas para a
conservação do grupo. No primeiro capítulo, por meio de uma cienciometria, mostrei quais
são os temas, abordagens e espécies mais estudadas, bem como as instituições e locais que
mais realizam esses estudos. Demonstrei que os esforços de pesquisa com conservação de
primatas não têm sido motivados pelo status de conservação das espécies e tamanho da sua
distribuição, e sim pelo peso corporal e idade (tempo desde a sua descrição). No segundo
capítulo, testei se a dieta de primatas pode predizer o risco de extinção das espécies,
mensurando dieta de diferentes maneiras: amplitude de dieta, diversidade de dieta, tipo de
dieta e disparidade de itens. Concluí que a dieta prediz o risco de extinção, mas apenas pela
métrica de disparidade de itens, sendo que espécies capazes de consumir itens mais
diferentes entre si estarão menos propensas à extinção. No terceiro e último capítulo,
avaliei os padrões de risco de extinção em primatas. Incluí variáveis intrínsecas e
extrínsecas em modelos que particionam a variância em componentes espaciais,
filogenéticas e independentes. Mostrei que espécies próximas na filogenia e no espaço
tendem a apresentar status de ameaça semelhantes. Além disso, encontrei que a região
Madagascar é a pior para os primatas e que o tempo de desmame, tamanho da distribuição
geográfica e fatores como “human footprint” e pobreza humana influenciam no risco de
extinção das espécies. Por fim, demonstrei que o espaço possui grande influência no risco
de extinção de primatas, não devendo ser ignorado nesse tipo de análise.
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Levantamento das populações de callicebus coimbrai Kobayashi & Langguth, 1999 em fragmentos de Mata Atlântica no Sul do estado de Sergipe, Brasil / Survey of the Populations of Callicebus coimbrai Kobayashi & Langguth, 1999 in Fragments of the Atlantic Forest in the south of the Brazilian state of SergipeChagas, Renata Rocha Déda 27 February 2009 (has links)
Coimbra-Filho s titi monkey (Callicebus coimbrai Kobayashi & Langguth, 1999) is an endangered, but poorly-known primate that inhabits remnants of the Atlantic Forest in the
Brazilian states of Sergipe and Bahia (northern coast). The present study aimed to evaluate the effects of habitat fragmentation on the ecological characteristics and provide
information on population density and size, and basic ecological characteristics of the species within the study area. These data were also collected for other local primate
species. The survey took place at the Fazenda Trapsa in southern Sergipe, where two survey techniques were applied playbacks (in fragments of < 50 ha) and line transects
(fragments > 50 ha). A total of 476.1 km of line transect was walked between april and october, 2008. Population density was estimated using the DISTANCE program and the
Kelker method. Density was also calculated directly from group counts. A total of 12 groups were identified in the four large fragments surveyed. Groups of Cebus xanthosternos and Callithrix jacchus were also observed in all four fragments. The
presence of Callicebus in the two smaller fragments was confirmed by playback. The overall density in the larger fragments was 12.6 individuals per km². Both DISTANCE and
Kelker provided considerable over-estimates of density. The results of this study indicate the need for caution in the interpretation and comparison of density estimates in studies of titi monkeys, as well as re-emphasizing the efficiency of alternative methods for the surveying of populations in small fragments. Fazenda Trapsa appears to have a total population of around 50 titis, which may have a good chance of survival over the long term, especially if certain conservation measures are taken. The results of the study reinforce the need for the establishment of a reserve network, and the development of
active metapopulation management strategies, in order to guarantee the long-term prospects for the survival of C. coimbrai. / O guigó de Coimbra-Filho (Callicebus coimbrai Kobayashi & Langguth, 1999) é um primata ameaçado de extinção, porém é uma espécie pouco conhecida e habita fragmentos
de Floresta Atlântica no Estado de Sergipe e Bahia (litoral norte). O objetivo deste trabalho foi avaliar os efeitos da fragmentação de habitat sobre suas características ecológicas, trazendo informações sobre densidade, tamanho populacional e características básicas da ecologia dentro da área de estudo. Esses dados também foram coletados para outras espécies de primatas. O trabalho foi realizado na Fazenda Trapsa, no sul de Sergipe, onde duas técnicas de levantamento foram aplicadas - playback (fragmentos < 50 ha) e transecção linear (fragmentos > 50 ha). Foi percorrido um total de 476,1 km entre abril a outubro de 2008. Densidade populacional foi estimada através do programa DISTANCE e
pelo método de Kelker. A densidade também foi calculada diretamente das contagens de grupos. Um total de 12 grupos foi identificado nos quatro maiores fragmentos levantados.
Grupos de Cebus xanthosternos e Callithrix jacchus também foram observados em todos os quatro fragmentos. A presença de Callicebus nos dois fragmentos menores foi confirmada por playback. A densidade geral nos quatro fragmentos maiores foi de 12,6 indivíduos por km2. Tanto o DISTANCE quanto o Kelker forneceram super-estimativas de densidade. Os resultados do presente estudo indicam a necessidade de cautela na avaliação e comparação de estimativas de densidade de guigós, como também reenfatizou a eficiência de métodos alternativos para o levantamento de populações de guigós em
fragmentos pequenos. A Fazenda Trapsa parece abrigar uma população de 50 guigós, que pode ter boas chances de sobreviver a longo prazo, principalmente se algumas medidas de conservação forem tomadas. Os resultados do estudo reforçam a necessidade para o estabelecimento de uma rede de reserva, e o desenvolvimento de estratégias de manejo
metapopulacional ativo, a fim de garantir a longo prazo possibilidades para sobrevivência de C. coimbrai.
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