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Predição do limiar de lactato em atletas de endurance a partir da curva de esforço percebido durante teste progressivo

Ferreira, Guilherme Assunção January 2015 (has links)
Orientador : Prof. Dr. Raul Osiecki / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Educação Física. Defesa: Curitiba, 23/02/2015 / Inclui referências / Área de concentração: Exercício e esporte / Resumo: A identificação do limiar de lactato (LL) em teste progressivo (TP) é comumente empregado para a discriminação da aptidão aeróbia e verificação de efeitos de treinamento. Alternativamente, a percepção subjetiva de esforço (PSE) possibilita a identificação de um limiar de PSE (LPSE) em não atletas, restando dúvidas sobre sua intensidade de ocorrência e seu uso na identificação do LL em atletas. O objetivo deste estudo foi verificar intensidade de ocorrência do LPSE e sua associação com o LL em atletas de endurance. Vinte e quatro sujeitos (13 atletas de endurance (GA) e 11 indivíduos ativos fisicamente - grupo não atletas (NA)) realizaram um TP em ciclo ergômetro, à 80 rpm, carga inicial de 110 W durante cinco minutos, estágios de três minutos e incrementos de 47 W. O LL foi identificado por três diferentes critérios: 1) - intensidade do exercício que precede um aumento na concentração de lactato em 1 mmol.l-1 sobre os valores de repouso (LL1mmol); 2) - intensidade do exercício correspondente à concentração fixa de 4 mmol.l-1 (LL4mmol); e 3) - Dmax da diferença entre um ajuste polinomial de 3° ordem da curva formada pela relação Lactato/carga e um ajuste linear ligando os extremos da curva (LLDmax). O LPSE foi identificado no Dmax da diferença entre um ajuste polinomial de 3° ordem da curva formada pela relação PSE/carga e um ajuste linear ligando os extremos da curva (LPSE). No GA a potência máxima (Wmax) e a potência de ocorrência dos Limiares (i.e. LPSE, LL1mmol, LLDmax e LL4mmol) foram significativamente superiores ao valores obtidos para o NA (p < 0,05). Similarmente, o mesmo foi observado para a %Wmax de ocorrência do LL1mmol (p < 0,05) e a FC (bpm) e %FCpico de ocorrência do LL1mmol e LL4mmol (p < 0,05). O LPSE no GA foi encontrado em intensidade similares ao LL1mmol e, em menores intensidade que LLDmax e LL4mmol (p < 0,05). Foi encontrado um pequeno viés entre a potência mensurada no LPSE e a potência mensurada no LL1mmol ( > 5%) e um amplo viés entre a potência mensurada no LPSE e a potência mensurada no LLDmax e LL4mmol ( > 5%). Para o NA, o LPSE foi encontrando em maiores intensidades que o LL1mmol (p < 0,05), mas em intensidades similares ao LLDmax e LL4mmol (p > 0,05). Embora fosse observado um amplo viés entre a potência mensurada no LPSE e a potência mensurada no LLDmax e LL4mmol (> 5%). Estes resultados sugerem que o LPSE pode predizer alternativamente o LL identificado na intensidade do exercício que precede um aumento na concentração de lactato em 1 mmol.l-1 sobre os valores de repouso em atletas, mas deve ser utilizado com cautela para a identificação do LLDmax, uma vez que o LPSE tende a subestimar o LLDmax em atletas e não atletas. Palavras Chaves: Limiar de percepção subjetiva de esforço; Atletas; Limiares de transição fisiológica; Avaliação de atletas; Desempenho. / Abstract: The lactate threshold (LT) identified in progressive test has been widely used to discriminate aerobic fitness. Alternatively, the rate of perceived exertion (RPE) present a threshold (RPET) in non-athletes, but it is unclear if this possible to determinate LT in athletes. The aim of this study was to verify the occurrence of RPET and its association with LT in endurance athletes. Twenty four subjects (13 endurance athletes - athlete group (AG) with age = 35.9 ± 9.3 years; body mass = 72.4 ± 5.4 kg; height = 176.0 ± 4.9 cm and body fat = 9.3 ± 3.2 % and 11 physically active individuals - non-athlete group (NA) with age = 28.5 ± 10.1 years; body mass = 88.8 ± 11.0 kg, height = 179, 6 ± 7.2 cm and body fat = 14.5 ± 6.2 %) performed an incremental test on a cycle ergometer, at 80 rpm, with initial load of 110 W, and increments of 47 W each 3 min. until voluntary exhaustion or inability to maintain the specified pace. The LT was identified by three different criteria: 1) - intensity of exercise that precedes an increase in lactate concentration in 1 mmol.l-1 on resting values (LT1mmol); 2) - intensity of the corresponding fixed blood lactate concentration of 4 mmol.l-1 (LT4mmol); and 3) - Dmax of the difference between a polynomial fit to the 3rd order of the curve formed by lactate / power output and a linear fitting curve connecting the end (LTDmax). The RPET was identified by Dmax of the difference between a polynomial fit to the 3rd order curve formed by the RPE/power output relationship and a linear fitting curve connecting the end (RPET). For GA the maximum power output (Wmax) and power output of occurrence of thresholds (I.e. RPET, LT1mmol, LTDmax and LT4mmol) were significantly higher than the values obtained for the NA (P < 0.05). Similarly, the same was observed for the %Wmax at LT1mmol (p < 0.05) and HR and %HRpeak at LT1mmol and LT4mmol (p < 0.05). The RPET in GA was found in similar intensity to LT1mmol (p > 0.05), and lower intensity that LTDmax and LT4mmol (p < 0.05). A small bias was found between the power output measured in RPET and LT1mmol (< 5%) and a large bias was found between the power output of measured RPET and other thresholds (LTDmax and LL4mmol) (> 5%). For the NA the REPT was found in higher intensity that LT1mmol (p < 0.05) and in similar intensities that LTDmax and LL4mmol (p > 0.05). Although a large bias was found between the power output measured at RPET and thresholds (LTDmax and LL4mmol). These results suggest that RPET may alternatively predict the LT identified in exercise intensity above an increase in lactate concentration of 1 mmol.l-1 over basal levels in athletes, however the RPET should to be utilized with precaution to predict to LTDmax, since RPET tends to underestimate the LTDmax in athletes and non-athletes. Key words: Perception exertion threshold; athletes; Physiological transition threshold; Athletes evaluation; Performance.
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Biópsia retal: avaliação da técnica e dos achados histopatológicos em equinos clinicamente saudáveis ou com alterações do trato gastrintestinal / Rectal biopsy: technique assessment and histopathologic findings in clinically healthy horses or with clinical signs of intestinal disorders

Araujo, Dayane Amorim de Oliveira 28 March 2014 (has links)
O objetivo do trabalho foi avaliar a técnica de biópsia retal em equinos e as alterações histopatológicas encontradas na mucosa retal em animais clinicamente saudáveis e em animais com alterações do trato gastrintestinal. Foram utilizados 32 equinos divididos em três grupos: 10 animais clinicamente saudáveis (grupo 1), sete animais com alterações do trato gastrintestinal com diagnóstico estabelecido (grupo 2) e 15 animais com manifestações clínicas inespecíficas do trato gastrintestinal (grupo 3). Os equinos do grupo 1 foram biopsiados duas vezes, a segunda biópsia sendo realizada 48 horas após a primeira. As biópsias retais foram realizadas com os animais em estação, utilizando-se pinça de biópsia tipo jacaré. As amostras de mucosa retal foram coradas por hematoxilina-eosina (HE), azul de alciano com ácido periódico de Schiff a 2,5% e azul de toluidina. No grupo 1, não foram observadas diferenças significativas entre a primeira e a segunda biópsia, mas três equinos apresentaram pequenas alterações que podem ser decorrentes da palpação retal. Na primeira avaliação, sete animais desse grupo apresentaram padrão semelhante, permitindo estabelecer um padrão de normalidade histológica para a mucosa retal: epitélio superficial preservado; criptas uniformes e alinhadas perpendicularmente à superfície com grande número de células caliciformes com mucinas ácidas em maior quantidade; linfócitos intra-epiteliais na superfície do epitélio em número de até 15 linfócitos para cada 100 colonócitos; pequeno número de linfócitos, plasmócitos e eosinófilos infiltrando a lâmina própria e a submucosa. Os outros três equinos deste grupo apresentaram um aumento na intensidade das células inflamatórias (discreto a moderado na intensidade de linfócitos e plasmócitos na lâmina própria e submucosa, e moderado na intensidade dos eosinófilos na submucosa). Os equinos do grupo 2, todos com síndrome cólica, apresentaram as seguintes alterações histopatológicas: proctite linfoplasmocítica simples (4/7) e proctite eosinofílica (1/7). No grupo 3 (12 equinos com diarreia crônica e três com emagrecimento progressivo), apenas um animal apresentou mucosa retal com padrão de normalidade. Nos outros animais foram observadas: proctite linfoplasmocítica simples (6/15), proctite erosiva (3/15), proctite linfoplasmocítica com aumento de neutrófilos (2/15), proctite eosinofílica (2/15), proctite linfoplasmocítica com aumento de neutrófilos e eosinófilos (1/15) e infiltração por linfócitos atípicos/linfoma (1/15). Concluiu-se que: a técnica de biópsia retal avaliada é de fácil execução e segura; embora algumas alterações histológicas possam ser observadas na mucosa retal de equinos clinicamente saudáveis, causadas ou não por palpação retal, há um padrão de normalidade que deve ser usado para a avaliação de equinos com alterações gastrintestinais; apenas em alguns casos as alterações histológicas encontradas na mucosa retal em equinos permitem um diagnóstico definitivo, mas elas podem direcionar o raciocínio diagnóstico em outros, sendo este um importante exame complementar a ser indicado em casos de equinos com alterações gastrintestinais inespecíficas. / The purpose of this study was to asses the rectal biopsy techique in horses and the histopathological changes found in the rectal mucosa in clinically healthy animals and in animals with clinical signs of intestinal disorders. 32 horses were divided into three groups: 10 animals clinically healthy (group 1), seven animals with gastrointestinal disorders with an established diagnosis (group 2) and 15 animals with nonspecific clinical manifestations of the gastrointestinal tract (group 3). The horses in group 1 had two biopsies, the second biopsy was performed 48 hours after the first. Rectal biopsies were performed on the animals station, using alligator biopsy forceps. The samples of rectal mucosa were stained with hematoxylin end eosin (HE), alcian blue PAS pH 2.5% and toluidine blue. In group 1, no significant differences between the first and second biopsy were observed, but three horses showed small changes that may result from rectal palpation. In the first evaluation, seven animals of this group showed a similar pattern, establishing a standard of normality for histological rectal mucosa: Surface epithelial preserved; crypts of uniform length, diameter and perpendicular arrangement to the surface with acid mucins strongly dominated over neutral mucins in the goblet cell population; intraepithelial lymphocytes in the surface of the epithelium with sparse population of approximately 15 cells per stretch of 100 epithelial cells; sparse individual lymphocytes, plasma cells and eosinophils infiltrating the lamina propria and submucosa. The other three horses in this group had an increase in the intensity of inflammatory cells (mild to moderate in intensity of lymphocytes and plasma cells in the lamina propria and submucosa, and moderate intensity of eosinophils in the submucosa). The horses in group 2, all with colic syndrome, showed the following pathological changes: simple lymphocyticplasmacytic proctitis (4/7) and eosinophilic proctitis (1/7). In group 3 (12 horses with chronic diarrhea and three with progressive weight loss), only one animal showed rectal mucosa with normal histology. It was observed in the other animals: simple lymphocytic-plasmacytic proctitis (6/15), erosive proctitis (3/15), lymphocyticplasmacytic proctitis with increased neutrophils (2/15), eosinophilic proctitis (2/15), lymphocytic-plasmacytic proctitis with increased neutrophils and eosinophils (1/15) and atypical lymphocytes infiltration/lymphoma (1/15). It was concluded that: the rectal biopsy technique evaluated is effective and safe; although some histological changes can be observed in the rectal mucosa of clinically healthy horses, whether or not caused by rectal palpation, there is a normal range that should be used to the evaluation of horses with gastrointestinal disorders; only in some cases the histological changes found in the rectal mucosa in horses allow a definitive diagnosis, but they can lead to a diagnostic logic in others, which is an important complementary test to be indicated in cases of horses with nonspecific gastrointestinal disturbances.
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Novo método para a avaliação do risco de colapso progressivo em edifícios de alvenaria estrutural / New method for assessment the risk of progressive collapse in masonry structural buildings

Felipe, Túlio Raunyr Cândido 03 February 2017 (has links)
O evento do colapso progressivo começou a ser estudado, principalmente, após o acidente do edifício Ronan Point, em 1968, na cidade de Londres. Esse acidente fez o meio técnico rever as considerações normativas, sobretudo de maneira a adicionar recomendações que visem minimizar os danos causados à estrutura quando sujeita a um dano acidental.Entretanto, tais recomendações não realizam a análise do risco da estrutura colapsar. Essas também não conseguem analisar medidas de robustez e vulnerabilidade, e nem determinar qual é o elemento chave para a estrutura. Desse modo, partindo desses questionamentos, o presente trabalho desenvolveu uma nova metodologia nomeada aqui de Risk Analysis of the Progressive Collapse (RAPC). Este procedimento fornece uma medida mais precisa dos riscos, através de uma abordagem que utiliza a Teoria da Confiabilidade Estrutural. Assim, é deduzida uma expressão para a determinação da probabilidade de colapso progressivo, bem como são definidos os coeficientes de importância e vulnerabilidade para identificar o(s) elemento(s) chave. O elemento chave é definido como o que apresenta a maior interseção entre vulnerabilidade e importância para o colapso estrutural. Essas formulações desenvolvidas na metodologia do RAPC são implementadas em Fortran. Para isso, a modelagem do edifício de alvenaria estrutural é feita utilizando o software DIANA&#174;, no qual os esforços solicitantes são obtidos e utilizados como dados de entrada na análise de confiabilidade. Valores de probabilidades de falha individual por elemento, condicional e condicional dupla são calculados pelo First Order Reliability Method (FORM) e Importance Sampling Monte Carlo (ISMC) com auxílio do programa StRAnD. Um algoritmo em Fortran é implementado para acoplamento do DIANA&#174; e StRAnD, além de mapear a probabilidade de falha dos elementos estruturais. Portanto, torna-se evidente que a identificação dos elementos mais vulneráveis, e do elemento chave em particular, é útil para abordagens diretas de concepção estrutural, tais como a melhoria da resistência local. Contudo, os coeficientes propostos também medem os efeitos dos procedimentos de projeto que conduzem à continuidade, ductilidade e redundância. Quando essas medidas trabalham para reduzir as probabilidades de propagação de dano ou colapso, isso se reflete nas vulnerabilidades de elementos eventualmente iniciando esses caminhos de falha. Sendo assim, conclui-se que a formulação do RAPC se mostra como uma ferramenta na determinação do risco do colapso progressivo nas estruturas. / The progressive collapse event began to be studied, mainly, after the accident of the Ronan Point building, at 1968, in the city of London. This accident caused the engineers review their normative considerations, mainly in order to add recommendations aimed at minimizing the damage to structure when subjected to abnormal loading. However, such recommendations do not perform the risk analysis of the structure to collapse. These also fail to analyze measures of robustness and vulnerability, and either determine which is the key element of the structure. Thus, leaving of these questions, the present work to develop a new methodology named here of Risk Analysis of the Progressive Collapse (RAPC). This procedure provides a more accurate measure of risks through an approach that uses Structural Reliability Theory. Thus, an expression is deduced for the determination of the probability of progressive collapse, as well as the importance and vulnerability coefficients are defined to identify the key element (or key elements). The key element is identified as the one presenting the largest intersection between vulnerability and importance to collapse.These formulations developed in the RAPC methodology are implemented in Fortran.For this, the structural masonry building modeling is done using the DIANA&#174; software, in which the requesting efforts are obtained and used as input data in the reliability analysis. Probabilities values individual, conditional, and double conditional are calculated by the First Order Reliability Method (FORM) and Importance Sampling Monte Carlo (ISMC) using the StRAnD software. A Fortran algorithm is implemented for DIANA&#174; and StRAnD coupling, besides mapping the probability of failure of the structural elements. Therefore, it is clear that identification of the most vulnerable elements, and of the key element in particular, is useful for direct design approaches to structural design, such as local resistance enhancements. However, the coefficients proposed herein also measure the effects of design procedures leading to continuity, ductility or redundancy. When these measures work to reduce probabilities of damage propagation or collapse, this is reflected in the vulnerabilities of elements eventually initiating these failure paths. Therefore, it is concluded that the formulation of RAPC is shown as an tool in determining the risk of progressive collapse in structures.
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\"Pode os limiares da variabilidade da freqüência cardíaca identificar os limiares metabólicos?\" / CAN HEART RATE VARIBILITY IDENTIFY THE METABOLIC THRESHOLDS?

Abad, César Cavinato Cal 16 March 2006 (has links)
O objetivo do presente estudo foi verificar a possibilidade de identificação dos dois limiares metabólicos pelo comportamento da VFC. Para isso, 22 voluntários do gênero masculino [74,5 + 7,99kg, 177,0 + 8cm, 23,86 + 1,69 (índice de massa corporal) e 9,10 % de gordura], habituados à prática do ciclismo, realizaram teste ergométrico em bicicleta estacionária com carga inicial de 120W e incrementos de 30W a cada 3min, até a exaustão. Durante todo o teste foram feitos os registros da freqüência cardíaca (FC) e de sua variabilidade (VFC) e ao final de cada carga foram coletados 25µL de sangue para análise da concentração sangüínea de lactato. Aplicou-se um modelo matemático que ajustou a curva da VFC em três retas e o primeiro e segundo limiar de VFC foram identificados nas intersecções entre as retas. Para identificação do primeiro e segundo limiar de lactato, considerou-se as concentrações fixas de 2,0 e 3,5mM, respectivamente. A análise de variância para medidas repetidas indicou não haver diferenças significativas nas cargas em que os limiares de VFC e de lactato foram encontrados, mostrando que a metodologia proposta pode ser promissora. Entretanto a falta de correlação entre as variáveis indica que novos estudos necessitam ser realizados para confirmação desta possibilidade. / The purpose of this study was to verify the possibility of metabolic thresholds identifications through HRV. For that, 22 male volunteers [74,5 + 7,99kg, 177,0 + 8cm, 23,86 + 1,69 (body mass index) e 9,10 % fat], familiarized to cyclism practice, realized a cycloergometer test with initial load of 120W and 30W increases every 3min., until exhaustion. During all test, it was registered heart rate (HR) and its variability (HRV) and, at the end of each load, it was collected 25mL blood for lactate concentration analysis. It was applied a mathematical model to adjust HRV curve in three straight lines and first and second HRV thresholds were identified in intersections among the lines. For the identification of first and second lactate thresholds, it was considered 2,0 and 3,5mM fixed concentrations, respectively. Variance analysis for repeated measures indicated that there were no significant differences between loads in which HRV and lactate thresholds were found, showing that purposed methodology can be promissor. However, the lack of correlation between variables indicate that new studies must be made to confirm that possibility.
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Estudo da variabilidade da frequência cardíaca em cães

Pascon, João Paulo da Exaltação [UNESP] 01 December 2009 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:31:10Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-12-01Bitstream added on 2014-06-13T19:20:15Z : No. of bitstreams: 1 pascon_jpe_dr_jabo.pdf: 1019022 bytes, checksum: e615b12cd0597fc04f94b65cd62e8266 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A avaliação da variabilidade da frequência cardíaca (VFC) possibilita quantificar a participação do sistema nervoso autônomo simpático e parassimpático. Clinicamente, esta relaciona-se com o prognóstico e risco de morte súbita em diversas afecções no homem, mas ainda permanece incerta em importantes enfermidades caninas como a degeneração mixomatosa valvar e obesidade. Dentre as alternativas terapêuticas capazes de modificar o balanço autonômico de forma benéfica, o exercício físico se destaca para o homem, entretanto, ainda pouco pesquisado em cães. Neste estudo, avaliou-se o comportamento da VFC, no domínio do tempo, em cães com endocardiose e obesidade mórbida, assim como os efeitos do treinamento sobre as funções autonômicas e hemodinâmicas de cães saudáveis. Nos cães do presente estudo, a endocardiose valvar e obesidade mórbida não modificaram os índices de VFC, sendo estes semelhantes aos índices observados nos cães hígidos. Em etapa posterior, o teste de esforço progressivo e treinamento físico preconizados foram bem tolerados pelos cães saudáveis. Maior participação autonômica parassimpática foi detectada por índices de VFC (SDANN, rMSSD e SDNN), frequências cardíacas mínima, máxima e sua amplitude, além da mudança percentual dos ritmos apresentados no teste de esforço após o treinamento. Em seu aspecto hemodinâmico observou-se melhor função diastólica (relação E/A mitral), redução dos índices indicadores de pré-carga (IEPFd e diâmetro AE) e pós-carga (IEPFs). / Heart rate variability (HRV) is a tool capable to measure the sympathetic and parasympathetic autonomic nervous system participation. These measurements are clinically related to prognosis and sudden death risk in different human diseases, but it remains unknown in dogs even in important disorder such as myxomatous valvar degeneration and obesity. Physical exercises has a special role on therapy of patients with heart disorders, leading to an autonomic balance improvement, but these effects are not still studied in dogs. This study evaluated time domain HRV in dogs with endocardiosis and obesity, and in parallel, the effects of physical training on hemodynamic and autonomic function in health dogs. Myxomatous mitral valve degenetation, and obese dogs presented similar HRV measures compared to health dogs. In subsequent study, the progressive physical effort test and training program were well tolerated for health dogs. Increased parasympathetic participation was detected by HRV (SDANN, rMSSD and SDNN), minimum, maximum and amplitude heart frequencies, besides the rhythm percentage modifications in the effort test after training. In the hemodynamic evaluation improvement of diastolic function (E/A mitral), decreased preload (IEPFd and diâmetro AE) and afterload (IEPFs) indexes were observed. Concluding, the dogs from this study with an initial phase of endocardiosis (class Ib) or morbid obesity did not present autonomic damages detectable by HRV, and training cold change the autonomic control and hemodynamic function in health dogs, opening a new research perspective to use it in canine cardiac diseases.
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Alinhamento múltiplo progressivo de sequências de proteínas / Progressive multiple alignment of protein sequences

Souza, Maria Angélica Lopes de 16 August 2018 (has links)
Orientador: Zanoni Dias / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Computação / Made available in DSpace on 2018-08-16T22:45:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Souza_MariaAngelicaLopesde_M.pdf: 2988201 bytes, checksum: 0742d490b058c7a3dae6fddd7314aba4 (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: O alinhamento múltiplo dc sequências é uma tarefa de grande relevância cm Bioin-formática. Através dele é possível estudar eventos evolucionários c restrições estruturais ou funcionais, sejam de sequências de proteína, DNA ou RNA, tornando possível entender a estrutura, função c evolução dos genes que compõem um organismo. O objetivo do alinhamento múltiplo é a melhor representação do cenário dc evolução das sequencias ao longo do tempo, considerando a possibilidade dc ocorrerem diferentes eventos de mutação. Encontrar um alinhamento múltiplo dc sequencias ótimo é um problema NP-Difícil. Desta forma, diversas abordagens têm sido desenvolvidas no intuito de encontrar uma solução heurística que represente da melhor maneira possível o cenário dc evolução real, dentre elas está a abordagem progressiva. O alinhamento progressivo c uma das maneiras mais simples dc se realizar o alinhamento múltiplo, pois utiliza pouco tempo c memória computacional. Ele c realizado cm três etapas principais: determinar a distância entre as sequências que serão alinhadas, construir uma árvore guia a partir das distâncias c finalmente construir o alinhamento múltiplo. Este trabalho foi desenvolvido a partir do estudo de diferentes métodos para realizar cada etapa dc um alinhamento progressivo. Foram construídos 342 alinhadores resultantes da combinação dos métodos estudados. Os parâmetros dc entrada adequados para a maioria dos alinhadores foram determinados por estudos empíricos. Após a definição dos parâmetros adequados para cada tipo dc ahnhador, foram realizados testes com dois subconjuntos de referencia do BAliBASE. Com esses testes observamos que os melhores alinhadores foram aqueles que utilizam o agrupamento dc perfil para gerar o alinhamento múltiplo, com destaque paTa os que utilizam pontuação afim para penalizar buracos. Observamos também, que dentre os alinhadores dc agrupamento por consenso, os que utilizam função logarítmica, para penalizar buracos demonstraram melhores desempenhos / Abstract: The multiple sequence alignment is a relevant task in Bioinf'ormatics. Using this technique is possible to study evolutionary events and also structural or functional restrictions of protein, DNA, or RNA sequences. This study helps the understanding of the structure, function, and evolution of the genes that make up an organism. The multiple sequence alignment tries to achieve the best representation of a sequence evolution scenario, considering different mutation events occurrence. Finding an optimal multiple sequence alignment is a NP-Hard problem. Thus, several approaches have been developed in order to find an heuristic solution that represents the real evolution cenário, such as the progressive approach. The progressive alignment is a simple way to perform the multiple alignment, because its low memcny usage and computational time. It is performed in three main stages: (i) determining the distance between the sequences to be aligned, (ii) constructing a guide tree from the distances and finally (hi) building the multiple alignment guided by the tree. This work studied different methods for performing each step of progressive alignment and 342 aligners were built combining these methods. The input parameters suitable for most aligners were determined by empirical studies. After the parameters definition for each type of aligner, which where tested against two reference subsets of BAliBASE. The test results showed that the best aligners were those using the profile alignment to generate the multiple alignment, especially those using affine gap penalty function. In addition, this work shows that among the aligners of grouping by consensus, those that use the logarithmic gap penalty function presented better performance / Mestrado / Bioinformatica / Mestre em Ciência da Computação
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Novo método para a avaliação do risco de colapso progressivo em edifícios de alvenaria estrutural / New method for assessment the risk of progressive collapse in masonry structural buildings

Túlio Raunyr Cândido Felipe 03 February 2017 (has links)
O evento do colapso progressivo começou a ser estudado, principalmente, após o acidente do edifício Ronan Point, em 1968, na cidade de Londres. Esse acidente fez o meio técnico rever as considerações normativas, sobretudo de maneira a adicionar recomendações que visem minimizar os danos causados à estrutura quando sujeita a um dano acidental.Entretanto, tais recomendações não realizam a análise do risco da estrutura colapsar. Essas também não conseguem analisar medidas de robustez e vulnerabilidade, e nem determinar qual é o elemento chave para a estrutura. Desse modo, partindo desses questionamentos, o presente trabalho desenvolveu uma nova metodologia nomeada aqui de Risk Analysis of the Progressive Collapse (RAPC). Este procedimento fornece uma medida mais precisa dos riscos, através de uma abordagem que utiliza a Teoria da Confiabilidade Estrutural. Assim, é deduzida uma expressão para a determinação da probabilidade de colapso progressivo, bem como são definidos os coeficientes de importância e vulnerabilidade para identificar o(s) elemento(s) chave. O elemento chave é definido como o que apresenta a maior interseção entre vulnerabilidade e importância para o colapso estrutural. Essas formulações desenvolvidas na metodologia do RAPC são implementadas em Fortran. Para isso, a modelagem do edifício de alvenaria estrutural é feita utilizando o software DIANA&#174;, no qual os esforços solicitantes são obtidos e utilizados como dados de entrada na análise de confiabilidade. Valores de probabilidades de falha individual por elemento, condicional e condicional dupla são calculados pelo First Order Reliability Method (FORM) e Importance Sampling Monte Carlo (ISMC) com auxílio do programa StRAnD. Um algoritmo em Fortran é implementado para acoplamento do DIANA&#174; e StRAnD, além de mapear a probabilidade de falha dos elementos estruturais. Portanto, torna-se evidente que a identificação dos elementos mais vulneráveis, e do elemento chave em particular, é útil para abordagens diretas de concepção estrutural, tais como a melhoria da resistência local. Contudo, os coeficientes propostos também medem os efeitos dos procedimentos de projeto que conduzem à continuidade, ductilidade e redundância. Quando essas medidas trabalham para reduzir as probabilidades de propagação de dano ou colapso, isso se reflete nas vulnerabilidades de elementos eventualmente iniciando esses caminhos de falha. Sendo assim, conclui-se que a formulação do RAPC se mostra como uma ferramenta na determinação do risco do colapso progressivo nas estruturas. / The progressive collapse event began to be studied, mainly, after the accident of the Ronan Point building, at 1968, in the city of London. This accident caused the engineers review their normative considerations, mainly in order to add recommendations aimed at minimizing the damage to structure when subjected to abnormal loading. However, such recommendations do not perform the risk analysis of the structure to collapse. These also fail to analyze measures of robustness and vulnerability, and either determine which is the key element of the structure. Thus, leaving of these questions, the present work to develop a new methodology named here of Risk Analysis of the Progressive Collapse (RAPC). This procedure provides a more accurate measure of risks through an approach that uses Structural Reliability Theory. Thus, an expression is deduced for the determination of the probability of progressive collapse, as well as the importance and vulnerability coefficients are defined to identify the key element (or key elements). The key element is identified as the one presenting the largest intersection between vulnerability and importance to collapse.These formulations developed in the RAPC methodology are implemented in Fortran.For this, the structural masonry building modeling is done using the DIANA&#174; software, in which the requesting efforts are obtained and used as input data in the reliability analysis. Probabilities values individual, conditional, and double conditional are calculated by the First Order Reliability Method (FORM) and Importance Sampling Monte Carlo (ISMC) using the StRAnD software. A Fortran algorithm is implemented for DIANA&#174; and StRAnD coupling, besides mapping the probability of failure of the structural elements. Therefore, it is clear that identification of the most vulnerable elements, and of the key element in particular, is useful for direct design approaches to structural design, such as local resistance enhancements. However, the coefficients proposed herein also measure the effects of design procedures leading to continuity, ductility or redundancy. When these measures work to reduce probabilities of damage propagation or collapse, this is reflected in the vulnerabilities of elements eventually initiating these failure paths. Therefore, it is concluded that the formulation of RAPC is shown as an tool in determining the risk of progressive collapse in structures.
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Biópsia retal: avaliação da técnica e dos achados histopatológicos em equinos clinicamente saudáveis ou com alterações do trato gastrintestinal / Rectal biopsy: technique assessment and histopathologic findings in clinically healthy horses or with clinical signs of intestinal disorders

Dayane Amorim de Oliveira Araujo 28 March 2014 (has links)
O objetivo do trabalho foi avaliar a técnica de biópsia retal em equinos e as alterações histopatológicas encontradas na mucosa retal em animais clinicamente saudáveis e em animais com alterações do trato gastrintestinal. Foram utilizados 32 equinos divididos em três grupos: 10 animais clinicamente saudáveis (grupo 1), sete animais com alterações do trato gastrintestinal com diagnóstico estabelecido (grupo 2) e 15 animais com manifestações clínicas inespecíficas do trato gastrintestinal (grupo 3). Os equinos do grupo 1 foram biopsiados duas vezes, a segunda biópsia sendo realizada 48 horas após a primeira. As biópsias retais foram realizadas com os animais em estação, utilizando-se pinça de biópsia tipo jacaré. As amostras de mucosa retal foram coradas por hematoxilina-eosina (HE), azul de alciano com ácido periódico de Schiff a 2,5% e azul de toluidina. No grupo 1, não foram observadas diferenças significativas entre a primeira e a segunda biópsia, mas três equinos apresentaram pequenas alterações que podem ser decorrentes da palpação retal. Na primeira avaliação, sete animais desse grupo apresentaram padrão semelhante, permitindo estabelecer um padrão de normalidade histológica para a mucosa retal: epitélio superficial preservado; criptas uniformes e alinhadas perpendicularmente à superfície com grande número de células caliciformes com mucinas ácidas em maior quantidade; linfócitos intra-epiteliais na superfície do epitélio em número de até 15 linfócitos para cada 100 colonócitos; pequeno número de linfócitos, plasmócitos e eosinófilos infiltrando a lâmina própria e a submucosa. Os outros três equinos deste grupo apresentaram um aumento na intensidade das células inflamatórias (discreto a moderado na intensidade de linfócitos e plasmócitos na lâmina própria e submucosa, e moderado na intensidade dos eosinófilos na submucosa). Os equinos do grupo 2, todos com síndrome cólica, apresentaram as seguintes alterações histopatológicas: proctite linfoplasmocítica simples (4/7) e proctite eosinofílica (1/7). No grupo 3 (12 equinos com diarreia crônica e três com emagrecimento progressivo), apenas um animal apresentou mucosa retal com padrão de normalidade. Nos outros animais foram observadas: proctite linfoplasmocítica simples (6/15), proctite erosiva (3/15), proctite linfoplasmocítica com aumento de neutrófilos (2/15), proctite eosinofílica (2/15), proctite linfoplasmocítica com aumento de neutrófilos e eosinófilos (1/15) e infiltração por linfócitos atípicos/linfoma (1/15). Concluiu-se que: a técnica de biópsia retal avaliada é de fácil execução e segura; embora algumas alterações histológicas possam ser observadas na mucosa retal de equinos clinicamente saudáveis, causadas ou não por palpação retal, há um padrão de normalidade que deve ser usado para a avaliação de equinos com alterações gastrintestinais; apenas em alguns casos as alterações histológicas encontradas na mucosa retal em equinos permitem um diagnóstico definitivo, mas elas podem direcionar o raciocínio diagnóstico em outros, sendo este um importante exame complementar a ser indicado em casos de equinos com alterações gastrintestinais inespecíficas. / The purpose of this study was to asses the rectal biopsy techique in horses and the histopathological changes found in the rectal mucosa in clinically healthy animals and in animals with clinical signs of intestinal disorders. 32 horses were divided into three groups: 10 animals clinically healthy (group 1), seven animals with gastrointestinal disorders with an established diagnosis (group 2) and 15 animals with nonspecific clinical manifestations of the gastrointestinal tract (group 3). The horses in group 1 had two biopsies, the second biopsy was performed 48 hours after the first. Rectal biopsies were performed on the animals station, using alligator biopsy forceps. The samples of rectal mucosa were stained with hematoxylin end eosin (HE), alcian blue PAS pH 2.5% and toluidine blue. In group 1, no significant differences between the first and second biopsy were observed, but three horses showed small changes that may result from rectal palpation. In the first evaluation, seven animals of this group showed a similar pattern, establishing a standard of normality for histological rectal mucosa: Surface epithelial preserved; crypts of uniform length, diameter and perpendicular arrangement to the surface with acid mucins strongly dominated over neutral mucins in the goblet cell population; intraepithelial lymphocytes in the surface of the epithelium with sparse population of approximately 15 cells per stretch of 100 epithelial cells; sparse individual lymphocytes, plasma cells and eosinophils infiltrating the lamina propria and submucosa. The other three horses in this group had an increase in the intensity of inflammatory cells (mild to moderate in intensity of lymphocytes and plasma cells in the lamina propria and submucosa, and moderate intensity of eosinophils in the submucosa). The horses in group 2, all with colic syndrome, showed the following pathological changes: simple lymphocyticplasmacytic proctitis (4/7) and eosinophilic proctitis (1/7). In group 3 (12 horses with chronic diarrhea and three with progressive weight loss), only one animal showed rectal mucosa with normal histology. It was observed in the other animals: simple lymphocytic-plasmacytic proctitis (6/15), erosive proctitis (3/15), lymphocyticplasmacytic proctitis with increased neutrophils (2/15), eosinophilic proctitis (2/15), lymphocytic-plasmacytic proctitis with increased neutrophils and eosinophils (1/15) and atypical lymphocytes infiltration/lymphoma (1/15). It was concluded that: the rectal biopsy technique evaluated is effective and safe; although some histological changes can be observed in the rectal mucosa of clinically healthy horses, whether or not caused by rectal palpation, there is a normal range that should be used to the evaluation of horses with gastrointestinal disorders; only in some cases the histological changes found in the rectal mucosa in horses allow a definitive diagnosis, but they can lead to a diagnostic logic in others, which is an important complementary test to be indicated in cases of horses with nonspecific gastrointestinal disturbances.
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\"Pode os limiares da variabilidade da freqüência cardíaca identificar os limiares metabólicos?\" / CAN HEART RATE VARIBILITY IDENTIFY THE METABOLIC THRESHOLDS?

César Cavinato Cal Abad 16 March 2006 (has links)
O objetivo do presente estudo foi verificar a possibilidade de identificação dos dois limiares metabólicos pelo comportamento da VFC. Para isso, 22 voluntários do gênero masculino [74,5 + 7,99kg, 177,0 + 8cm, 23,86 + 1,69 (índice de massa corporal) e 9,10 % de gordura], habituados à prática do ciclismo, realizaram teste ergométrico em bicicleta estacionária com carga inicial de 120W e incrementos de 30W a cada 3min, até a exaustão. Durante todo o teste foram feitos os registros da freqüência cardíaca (FC) e de sua variabilidade (VFC) e ao final de cada carga foram coletados 25µL de sangue para análise da concentração sangüínea de lactato. Aplicou-se um modelo matemático que ajustou a curva da VFC em três retas e o primeiro e segundo limiar de VFC foram identificados nas intersecções entre as retas. Para identificação do primeiro e segundo limiar de lactato, considerou-se as concentrações fixas de 2,0 e 3,5mM, respectivamente. A análise de variância para medidas repetidas indicou não haver diferenças significativas nas cargas em que os limiares de VFC e de lactato foram encontrados, mostrando que a metodologia proposta pode ser promissora. Entretanto a falta de correlação entre as variáveis indica que novos estudos necessitam ser realizados para confirmação desta possibilidade. / The purpose of this study was to verify the possibility of metabolic thresholds identifications through HRV. For that, 22 male volunteers [74,5 + 7,99kg, 177,0 + 8cm, 23,86 + 1,69 (body mass index) e 9,10 % fat], familiarized to cyclism practice, realized a cycloergometer test with initial load of 120W and 30W increases every 3min., until exhaustion. During all test, it was registered heart rate (HR) and its variability (HRV) and, at the end of each load, it was collected 25mL blood for lactate concentration analysis. It was applied a mathematical model to adjust HRV curve in three straight lines and first and second HRV thresholds were identified in intersections among the lines. For the identification of first and second lactate thresholds, it was considered 2,0 and 3,5mM fixed concentrations, respectively. Variance analysis for repeated measures indicated that there were no significant differences between loads in which HRV and lactate thresholds were found, showing that purposed methodology can be promissor. However, the lack of correlation between variables indicate that new studies must be made to confirm that possibility.
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Recomendações para projeto de lajes formadas por vigotas com armação treliçada / Recommendations for design of slabs with lattice reinforcement

Cunha, Mateus Ortigosa 09 August 2012 (has links)
As lajes formadas por vigotas pré-moldadas são utilizadas em larga escala no Brasil, em especial as formadas por vigotas treliçadas. As facilidades no manuseio e economia de fôrmas são algumas das vantagens do sistema. Apesar de serem muito utilizadas, ainda existe necessidade de estudo das recomendações no sentido de basear o projeto destas lajes. Os objetivos deste trabalho são: (a) contribuir no projeto de lajes formadas por vigotas com armação treliçadas através de uma análise crítica da bibliografia pesquisada; (b) tratar de temas pouco disseminados no que se refere ao cálculo de lajes pré-moldadas; (c) fornecer recomendações de projeto através de exemplo resolvido que aborda as principais dúvidas de projetistas da área. Neste exemplo avaliam-se as lajes, entre outros aspectos, quanto às flechas iniciais e ao longo do tempo, vibrações e momento negativo nos apoios. Os resultados são analisados e confrontados com as indicações da bibliografia. Comprova-se o fato destas lajes serem mais susceptíveis quanto às vibrações causadas por caminhada e mostra a dificuldade em atender à ABNT NBR 6118:2003. O vão máximo admissível para uma laje do exemplo de aplicação é 28% inferior quando comparado à laje maciça de mesma espessura na análise da vibração excessiva. Enfatiza a importância em prever armadura contra o colapso progressivo e demonstra que o aumento de consumo de aço em 5% é pequeno quando comparado ao total, para uma laje do exemplo de aplicação. / Precast slabs are used in large scale in Brazil, special those formed by lattice reinforcement. Facilities handling and economy mold are some of the advantages of the system. The objectives of this work are: (a) improve study of the design of slabs formed by precast lattice reinforcement through a review of literature; (b) address topics a little spread regards to the calculation of precast slabs; (c) providing design recommendations through examples solved by addressing the main concerns of designers in the area. This example evaluate the slabs to initials and long-term deflections, vibrations and bending moment at the supports. The results are analyzed and compared with indications in the literature. It demonstrates the suscetibility of the slabs for vibrations caused by walking and shows the difficulty in following ABNT NBR 6118:2003. The maximum span for one slab of the aplication example is 28% slower than solid slabs with the same thickness in excessive vibration analysis. This dissertation emphasizes the importance of predicting reinforcement against progressive collapse and shows the increase in steel consumption is small compared to the total, for one slab of the example.

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