The colorectal cancer (CRC) is the third most common malignancy in the world and in Brazil, the fifth most diagnosed and the third cause of cancer deaths. The detection of molecular markers in peripheral blood applies to the early diagnosis of cancer, before and after surgery, reducing the time of identification of CCR and improving the treatment, it is less invasive and reducing costs. This work is quantified by Real Time PCR in absolute and direct, free of DNA fragments found in the serum of patients with colorectal cancer, thereby determining values that characterize the condition of carrier of tumor. For this, a method was developed in which the measurement used as reference samples of the actual fragments ALU115 and ALU247 purified and quantified. We studied 3 major groups: Control, with healthy volunteers; surgery, patients who have already been submitted to surgical removal of colorectal tumor and non-surgery, patients who have not removed the tumor through surgery. Observing the results we note that the groups differ mainly by the values of quantification ALU247. For the control group, the limits were between 91 fentogramas and 1.55 picograms. The non operated group had amounts ranging from 8.02pg to 23.54pg and the group operators, 80fg to 5.95pg. In contrary, the results presented by quantification ALU115 did not set limits defined capable of differentiating at least one of the groups. The control group presented as limits 2pg and 69.45pg and the non operated group, 9.71pg and and 381.56pg, the group operated, 10.69pg and 196.85pg. The non operated group showed a mean significant when compared to the other two groups, but showed minor differences in the quantification ALU247 (14.62 ± 4.73 pg - p <0.05). It could be concluded that direct measurement, using reference concentrations of the fragments themselves ALU115 and ALU247 is a simple methodology, low cost and with reliable results. Moreover, the quantification ALU247 is able to identify the condition of carrier of tumor. / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Alagoas / O câncer colorretal (CCR) é a terceira neoplasia maligna mais frequente no mundo, sendo no Brasil a quinta mais diagnosticada e a terceira causa de morte por câncer. A detecção de marcadores moleculares no sangue periférico aplica-se ao diagnóstico precoce de neoplasias, antes e após procedimento cirúrgico, diminuindo assim o tempo de identificação do CCR e melhorando o tratamento, que se torna menos invasivo e diminuindo os custos. O objetivo deste trabalho é quantificar, através da PCR em Tempo Real de forma absoluta e direta, os fragmentos de DNA Livre encontrados no soro de pacientes com câncer colorretal, determinando assim valores que caracterizam a condição de portador de tumor. Para isso, foi desenvolvido um método em que a quantificação utiliza como amostras de referências os próprios fragmentos ALU115 e ALU247 purificados e quantificados. Foram estudados 3 grandes grupos: Controle, com voluntários saudáveis; Operados, pacientes que já se submeteram à cirurgia para retirada de tumor colorretal; e Não-Operados, pacientes que ainda não retiraram o tumor através de cirurgia. Observando os resultados podemos notar que os grupos se diferenciam principalmente através dos valores da quantificação ALU247. Para o grupo Controle, os limites ficaram entre 91 fentogramas e 1,55 picogramas. O grupo Não-Operados apresentou quantidades que vão de 8,02pg a 23,54pg e, o grupo Operados, de 80fg a 5,95 pg. De forma contrária, os resultados apresentados pela quantificação ALU115 não permitiram estabelecer limites definidos capazes de diferenciar pelo menos um dos grupos. O grupo Controle apresentou como limites 2pg e 69,45pg; o grupo Não-Operados, 9,71pg e 381,56pg e; o grupo Operados, 10,69pg e 196,85pg. O grupo Não-Operados apresentou uma média significativa quando comparado aos outros dois grupos, porém apresentou menor heterogeneidade na quantificação ALU247 (14,62pg ± 4,73 - p<0,05). Foi possível concluir que a quantificação direta, utilizando como concentrações de referência os próprios fragmentos ALU115 e ALU247, mostrou-se uma metodologia simples, de baixo custo e com resultados confiáveis. Além disso, a quantificação ALU247 é capaz de identificar a condição de portador de tumor.

Submitted by JULIO CESAR AUGUSTUS DE PAULA SANTOS null (julio23@gmail.com) on 2016-04-07T03:20:01Z No. of bitstreams: 1 A ideia de número no ciclo de alfabetização matemática - o olhar do professor.pdf: 1340708 bytes, checksum: b0cb114e45a5b13e025ca4973ae4e528 (MD5) / Approved for entry into archive by Juliano Benedito Ferreira (julianoferreira@reitoria.unesp.br) on 2016-04-07T17:55:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 santos_jcap_me_rcla.pdf: 1340708 bytes, checksum: b0cb114e45a5b13e025ca4973ae4e528 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-07T17:55:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 santos_jcap_me_rcla.pdf: 1340708 bytes, checksum: b0cb114e45a5b13e025ca4973ae4e528 (MD5) Previous issue date: 2016-03-09 / O presente estudo tem o objetivo de investigar qual é a compreensão de número expressa por professores que ensinam matemática no ciclo de alfabetização (do 1º ao 3º ano do Ensino Fundamental). A pesquisa é qualitativa e desenvolvida em uma abordagem fenomenológica seguindo os procedimentos de produção e análise de dados conforme Bicudo (2011a, 2011b). Na trajetória percorrida, realizamos um estudo inicial da região de inquérito, o número no ciclo de alfabetização matemática, na perspectiva do Pacto Nacional pela Alfabetização na Idade Certa (PNAIC), trouxemos uma compreensão fenomenológica de número e procedemos à produção dos dados, entrevistando seis professores do ciclo de alfabetização (um professor do 1º ano, três professores do 2º ano e dois professores do 3º ano) de uma escola estadual da cidade de São Paulo (SP). A análise dos dados mostra que esses professores compreendem número ora como código, presentes em situações cotidianas, ora como quantidade, que emerge das situações de quantificação. / This study aims to research on what is the comprehension of number expressed by teachers who teach mathematics in the ciclo de alfabetização matemática (from 1st to 3rd year of elementary school). The research is qualitative and developed in a phenomenological approach following the production and data analysis procedure as in Bicudo (2011a, 2011b). In the path taken, we did an initial study of the investigation area, the concept of number in the ciclo de alfabetização matemática, in the view of the Pacto Nacional pela Alfabetização na Idade Certa (PNAIC), we brought a phenomenological comprehension of number and proceed to the data production, which consisted in interviewing six teachers of the ciclo de alfabetização matemática (one teacher from the 1st year, three teachers from the 2nd year and two teachers from the 3rd year) of a state school in the city of São Paulo (SP). The data analysis showed us that these teachers understand number sometimes as a code, which is highly noticed in daily situations and sometimes as a quantity, which comes from quantification situations.

Ebastine is a second generation antihistaminic drug used to treat allergic rhinitis and urticaria. It is available in the Brazilian market as tablets and syrup. There are no official methods for ebastine analysis in pharmaceutical formulations. In the present work, methods for quantification and dissolution evaluation of the drug in tablets were developed and validated. Spectrophotometric and liquid chromatographic (LC) methods were used for drug determination. In the spectrophotometric method ebastine can be quantified at 258 nm, using acetonitrile and 0.01M HCl as diluents. The LC analysis were performed on a C18 column maintained at ambient temperature. The mobile phase composed of acetonitrile:phosphoric acid 0.1% pH 3.0 (55:45, v/v), was run at a flow rate of 1.2 mL/min with UV detection at 254 nm. The methods showed good linearity (r>0.999), precision (RSD<2%), and accuracy. The proposed methods were applied for the analysis of pharmaceutical products, showing significant correlation (P>0.05) of the results. The optimization of dissolution test conditions for in vitro quality control of ebastine in tablets was evaluated. The use of 900 mL of 0.01M HCl at 37.0 ± 0.5°C, paddle as apparatus at 75 rpm and 60 minutes of test provided satisfactory results for tested product. The LC method was validated to evaluate dissolution testing and showed to be specific, linear, precise and accurate. The sample tablets containing ebastine were subjected to accelerated stability study under conditions of controlled temperature and relative humidity (40 °C ± 2 °C e 75% ± 5 %, respectively) for six months and then evaluated by LC and mass spectrometry. / A ebastina é um fármaco anti-histamínico de segunda geração utilizado para tratamento de rinite alérgica e urticária. No mercado brasileiro encontra-se disponível na forma de comprimidos e solução oral. Não há monografias descritas em farmacopéias para análise de ebastina em formulações farmacêuticas. No presente trabalho, métodos para quantificação e avaliação da dissolução do fármaco em comprimidos foram desenvolvidos e validados. Os métodos usados para a quantificação do fármaco foram a espectrofotometria no ultravioleta e a cromatografia líquida de alta eficiência (CL). No método espectrofotométrico a ebastina pode ser quantificada em 258 nm, utilizando acetonitrila e HCl 0,01M como diluentes. As análises por CL foram realizadas em coluna C18 mantida a temperatura ambiente. A fase móvel, composta de acetonitrila: ácido fosfórico 0,1% pH 3,0 (55:45, v/v), foi eluída isocraticamente com vazão de 1,2 mL/min com detecção no ultravioleta em 254 nm. Os métodos mostraram boa linearidade (r>0,999), precisão (DPR<2%) e exatidão. Os métodos propostos foram aplicados na análise de produtos farmacêuticos, demonstrando correlação significativa dos resultados (p>0,05). A otimização das condições para o teste de dissolução in vitro para ebastina comprimidos foi avaliada. As condições que forneceram resultados satisfatórios para os produtos testados foram 900 mL de ácido clorídrico 0,01M a 37,0 ± 0,5 ºC, aparato pá, 75 rpm e 60 minutos de teste. O método por CL foi validado para quantificação das amostras do teste de dissolução e mostrou ser específico, linear, preciso e exato. Amostras de comprimidos contendo ebastina foram submetidas a estudo de estabilidade acelerada sob condições controladas de temperatura e umidade relativa (40 °C ± 2 °C e 75% ± 5%, respectivamente) por seis meses e posteriormente avaliadas por cromatografia líquida e espectrometria de massa.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:35:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 6559.pdf: 9613917 bytes, checksum: 67420e43ad6fad43e2f813af1d7fb65b (MD5) Previous issue date: 2014-10-10 / Universidade Federal de Sao Carlos / The growth of industrial deployment and urbanization play a major role in the degradation of global environmental and resource depletion mainly in countries in development such as Brazil. The problems regarding water pollution in Latin America have been well-documented, and there is no evidence of substantive effort to change the situation. There are a large number of organic pollutants that leads several damages to the ecosystem, threatening human health and are flushed to wastewater treatment plants (WWTPs). The WWTPs are responsible for the removal of natural and anthropogenic pollutants from the sewage and, for this, play an important role in protection of human health and the environment. Due to the varying operational conditions, process and quality, the wastewater treatments need to be monitored continuously to ensure a reliable and efficient operation. Therefore, the NMR analyses are widely used in the study of different components of wastewater such as complex organic matter (fulvic and humic acids), sludge and organic contaminants. In the present work, we employed two methods to study wastewater samples: non-targeted 1D (13C and 1H) and 2D NMR spectroscopy analyses to characterize the largest possible number of compounds in urban wastewater; and analysis by HPLC-(UV/MS)-SPE-ASS-NMR to detect and elucidate the non-specific recalcitrant in treated wastewater, sparing the common use of standards. In the non-targeted 1D NMR analysis, we employed also a method to study wastewater samples by chemometric and quantitative analyses to monitor the seasonal variations and identify anomalous discharges in urban wastewater system. The set of data were constituted of several compounds on which the concentration ranges considerably with treatment and seasonality. An anomalous discharge, the influence of storm water on the wastewater composition and recalcitrant compounds (LAS surfactant homologues) in the effluent were further identified. The seasonal variations and abnormality in the composition of organic compounds in sewage indicated that the employed procedure can be useful to identify the pollution source, to follow up the efficiency of WWTPs plants to design preventive actions in order to protect equipment and preserve the environment. / Atualmente, o crescimento industrial, a urbanização e as atividades rurais, como a agricultura, são um dos responsáveis pela deterioração do meio ambiente, principalmente nos países em desenvolvimento, como o Brasil. Problemas relacionados com a poluição das águas fluviais na América Latina têm sido bem documentados, porém não há evidências de esforços substanciais para alterar essa situação. Existem vários poluentes orgânicos presentes no esgoto tratado pelas Estações de Tratamento de Esgoto (ETEs) que podem causar danos aos ecossistemas e, com isso, ameaçar a saúde humana. As ETEs são responsáveis pela remoção da maioria dos poluentes antropogênicos ou naturais presentes no esgoto sanitário doméstico, e por isso, desempenham um papel fundamental na preservação do meio ambiente e consequentemente da saúde pública. Devido às variações das condições operacionais, processos e qualidade dos descartes, o tratamento do esgoto sanitário doméstico precisa ser monitorado continuamente para assegurar eficiência operacional. Para o estudo de contaminações ambientais, a RMN tem-se configurado como uma valiosa ferramenta, uma vez que ela tem contribuído significativamente no estudo de componentes químicos presentes nas águas e no lodo de esgoto; nas análises de interações com as substâncias húmicas e fúlvicas, além de contaminações ambientais por fármacos, pesticidas, surfactantes e seus produtos de degradação, dentre outros. No presente trabalho, foram propostos dois métodos para estudar as águas oriundas do esgoto anterior e posterior ao tratamento ocorrido na ETE do município de São Carlos-SP: análises de compostos orgânicos não específicos por meio da espectroscopia de RMN 1D (1H e 13C) e 2D (COSY, HSQC e HMBC), com o intuito de caracterizar o maior número de substâncias dissolvidas nas matrizes; análises desenvolvidas através do sistema hifenado HPLC-(UV/MS)-SPE-ASS-NMR, para detectar e elucidar os compostos não específicos recalcitrantes, em baixas concentrações e sem o uso de padrões. Ademais, foram empregadas análises quimiométricas e quantitativas (RMNq) no primeiro método (compostos orgânicos não específicos) para, desta forma, monitorar variações sazonais e identificar descargas anômalas no sistema comum de escoamento do esgoto sanitário doméstico. Portanto, em ambas as matrizes de esgoto (não tratado e tratado pela ETE) foram caracterizados 50 compostos orgânicos, em que as concentrações variaram consideravelmente com o tratamento da ETE e de acordo com a sazonalidade da coleta. Também foram verificados uma descarga anormal no sistema comum de esgoto e influências das águas fluviais sobre a composição das águas de esgoto, além de serem completamente elucidados compostos homólogos recalcitrantes pertencentes a classe dos surfactantes LAS (alquilbenzeno sulfonados de cadeia linear) no efluente. As variações sazonais e anormalidade na composição química no esgoto indicaram que o procedimento empregado pode ser especialmente útil para identificar fontes poluidoras e acompanhar a eficiência do tratamento das ETEs para que, desta forma, sejam tomadas ações preventivas a fim de proteger todo sistema de tratamento e equipamentos e, com isso, minimizar os danos causados ao meio ambiente.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:36:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2116.pdf: 642759 bytes, checksum: e242d729b3245bc7f7270819da7f0b67 (MD5) Previous issue date: 2008-05-21 / Universidade Federal de Sao Carlos / This work reports the development of analytical methods, using High Performance of Liquid Chromatography (HPLC), to quantify unreacted monomers from dental reline autopolimerizing acrylic resins. The quantification of these unreacted methacrylates is directly related with theirs toxicity, once that these may not only be irritant to the mucosa, but may also cause allergic and inflammatory reactions. In addition to this, high concentrations of unreacted monomers may cause alterations in physical and mechanical properties. For this purpose, three experimental resins (RE1, RE2 and RE3) and a commercial resin, Tokuyama Rebase Fast II (TKY), were selected to be analyzed. The development of these experimental resins has been carried out in cooperation with Faculty of Dentistry, Araraquara (FOAr - Unesp) and the dental corporation VIPI Ltda (Pirassununga, SP). The relevance of development these new resins is related to the necessity to have a national confectioned resin, because all resins used for these treatments are imported and reducing the cost of treatment. For quantification of unreacted monomers was necessary to extract them from the resins, so the extraction procedure was carried out in an ice-bath using methanol as extraction solvent. This procedure was validated through extractions in replicates. The monomers quantified were acetoacetoxy ethyl methacrylate (AAEM) from TKY resin, ethylene glycol dimethacrylate (EDMA), buthanediol dimethacrylate (BDMA) and cyclo hexyl metharylate (CHMA) all from experimental resins. Higher concentrations were found for experimental resins which the unreacted monomers concentrations range were, approximately 120&#956;g/mL to 500&#956;g/mL, 150&#956;g/mL to 500&#956;g/mL and 100 to 300&#956;g/mL for resins RE3, RE1 e RE2, respectively Only for TKY resin was carried out a procedure to evaluate the quantity of unreacted monomer leached out in vitro in artificial saliva. There were found concentration in the range from 5.00 to 64.0&#956;g/mL, in view of that the higher concentrations were leached from resin in the first 24 hours and after one week of artificial saliva immersion it was not observed the leaching of AAEM monomer. / Neste trabalho, foram desenvolvidos métodos analíticos, por Cromatografia Líquida de Alta Eficiência (CLAE), para a quantificação de monômeros metacrilatos não polimerizados de resinas acrílicas autopolimerizáveis, utilizadas em tratamentos odontológicos para reembasamento de bases de prótese. A importância da quantificação de metacrilatos residuais está associada à sua toxicidade, uma vez que podem causar reações alérgicas e irritações na mucosa bucal do paciente. Além disso, altas concentrações de monômeros não polimerizados podem comprometer as propriedades físicas e mecânicas da resina e, consequentemente, a qualidade do tratamento de reembasamento. Para isso, foram analisadas três resinas experimentais e uma resina comercial, a Tokuyama Rebase Fast II (TKY). As resinas experimentais (RE1, RE2 e RE3) estão em desenvolvimento pela empresa VIPI Indústria Comércio Exportação e Importação de Produtos Odontológicos Ltda, em colaboração com a Faculdade de Odontologia de Araraquara (FOAr - Unesp). O desenvolvimento dessas novas resinas deve-se à necessidade de se ter uma resina de fabricação nacional, visando reduzir o custo do tratamento, uma vez que as resinas utilizadas para este fim são todas importadas. Para a quantificação de monômeros residuais, realizou-se a extração destes a partir das resinas com metanol refrigerado em banho de gelo, e processo foi validado através de extrações em replicata. Os monômeros quantificados foram: metacrilato de acetoacetoxietil (AAEM - resina TKY), dimetacrilato de butila (BDMA), dimetacrilato de etila (EDMA) e metacrilato de cicloexila (CHMA) - resinas experimentais. As maiores concentrações foram encontradas para as resinas experimentais, nas quais as concentrações de monômeros não polimerizados variaram aproximadamente de 120&#956;g/mL a 500&#956;g/mL, de 150&#956;g/mL a 500&#956;g/mL e de 100 a 300&#956;g/mL para as resinas RE3, RE1 e RE2, respectivamente. A variação encontrada para a resina TKY foi de 70 a 110&#956;g/mL. Para a resina comercial (TKY) foi realizado um estudo no sentido de avaliar a quantidade de monômero não polimerizado e liberado in vitro em saliva artificial. Foram encontradas concentrações de 5,00 a 64,0&#956;g/mL, sendo que os maiores valores foram obtidos nas primeiras 24 horas. Após uma semana de imersão em saliva artificial não se observou a liberação do monômero AAEM.

Submitted by Valquíria Barbieri (kikibarbi@hotmail.com) on 2018-03-16T20:42:12Z No. of bitstreams: 1 _DISS_2014_Aline Regina Barella.pdf: 1002749 bytes, checksum: b469471d8633b241a1b7721a1183e45d (MD5) / Approved for entry into archive by Jordan (jordanbiblio@gmail.com) on 2018-03-20T13:03:04Z (GMT) No. of bitstreams: 1 _DISS_2014_Aline Regina Barella.pdf: 1002749 bytes, checksum: b469471d8633b241a1b7721a1183e45d (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-20T13:03:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 _DISS_2014_Aline Regina Barella.pdf: 1002749 bytes, checksum: b469471d8633b241a1b7721a1183e45d (MD5) Previous issue date: 2014-02-28 / CAPES / A implantação de sistemas integrados de produção tem sido considerada uma alternativa para intensificar o uso da terra de forma sustentável, porém, os distintos arranjos entre os componentes agrícolas assim como as variações nas condições climáticas podem afetar a comunidade de bactérias presentes nesses ambientes. Diante disso o objetivo do trabalho foi estudar a diversidade de colônias bacterianas, os efeitos sazonais de uso da terra e a presença de isolados com capacidade de solubilização de fosfato in vitro. O experimento foi composto por 5 tratamentos com diferentes arranjos (1- Eucalipto; 2- Lavoura de soja no verão e milho na 2o safra; 3- Pastagem; 4- Integração Lavoura Floresta; 5- Integração Pastagem Floresta). O delineamento experimental foi de blocos casualisados com 4 repetições.Também foram analisadas uma área de mata nativa e uma de pousio. As coletas de solo foram realizadas em março e setembro de 2012, final do período chuvoso e seco, respectivamente. De cada amostra foram realizadas diluições seriadas, seguidas de inoculação em placas de Petri contendo o meio de cultura DYG’S, sendo mantidas a 28oC e após 48 horas foi realizada a contagem de unidades formadoras de colônia.Posteriormente os isolados purificados foram caracterizadosmorfologicamente e testados quanto a capacidade de solubilização de fosfato. A quantidade de unidades formadoras de colônias variou entre 106 e 107UFC.g-1solo, sendo que a maior quantidadefoi encontrada na época chuvosa, independente da área. A diferença nas características morfológicas dos isolados permitiu encontrar 77 grupos fenotípicos diferentes. Os isolados a 80% de similaridadeformaram 13 grupos durante a época chuvosa enquanto que durante o período de seca formaram 14 grupos. Foram encontrados isolados com capacidade de solubilizar fosfato in vitroem todas as áreas, sendo que durante a época chuvosa a quantidade encontrada foi maior. / The implementation of integrated production systems has long been considered an alternative to intensify land use in a sustainable manner, however, the different arrangements between agricultural components as well as changes in the climatic conditions can affect the bacterial community present in these environments. In view of this the objective of this study was to verify the diversity of bacterial colonies, seasonal effects of land use and the presence of isolates capable of solubilizing phosphate in vitro. The experiment was composed by 5 treatments with different arrangements (1- Eucalyptus, 2- tillage soya in the summer and corn in 2o season, 3- pasture, 4- integrating agriculture florest, 5- integration pasture florest). Randomized block design with four replications, were also analyzed an area of native forest and fallow. The samplings were conducted in March and September, respectively rainy and dry period. From each sample dilutions, followed by inoculation were performed in Petri dishes containing the culture medium DYG'S, these plates were maintained at 28 °C and after 48 hours the count of colonies forming units was performed subsequently isolates purified were characterized according to their characteristics morphological and tested for ability to solubilize phosphate. The number of colonies forming units ranged between 106 and 107of CFU.g-1, and the larger amount was found the rainy season in all treatments. The difference in the morphological characteristics of the isolates allowed to find 77 different phenotypic groups. Isolates at 80% similarity, during the rainy season were grouped into 13 groups whereas during the dry period formed 14 groups. Isolates were found capable of solubilizing phosphate in vitro in all areas, and during the rainy season the greatest quantity was found.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:32Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-06-22Bitstream added on 2014-06-13T18:39:11Z : No. of bitstreams: 1 figueiredo_as_me_botfmvz.pdf: 290159 bytes, checksum: 38ae46f390705b8d387a7ef9c78d6040 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O Vírus da Imunodeficiência Felina (FIV) é um lentivírus que causa uma síndrome de imunodeficiência em gatos domésticos. O FIV tem sido particularmente utilizado em estudos de resistência viral aos análogos de nucleosídeos devido a Transcriptase Reversa (TR) apresentar propriedades físicas, catalíticas e sensibilidade às drogas semelhantes à TR do HIV. Os objetivos desse trabalho foram tratar com AZT gatos naturalmente infectados com o FIV, fazer o monitoramento da carga viral e DNA proviral por PCR em tempo real e monitoramento genético por seqüenciamento. Dos 12 animais infectados, 6 receberam o AZT na dose de 10mg/kg/dia e 6 receberam placebo. Durante 96 dias de tratamento, o plasma e sangue destes animais foram analisado com relação à carga viral e concentração relativa de DNA proviral utilizando-se a técnica de quantificação relativa por PCR em tempo real com SYBR Green, desenvolvida por nossa equipe. Além disso, foi realizado o sequenciamento genético da região que codifica a TR de 3 dos animais. Foi realizada com sucesso a padronização da PCR em tempo real para quantificação relativa do FIV. Não houve diferença estatisticamente significativa da carga viral ou do DNA proviral entre os grupos tratado e controle. O seqüenciamento genético revelou a presença de lisina na posição 41 do sítio ativo da TR. A presença deste aminoácido confere até 4 vezes menor sensibilidade ao AZT em mutantes do HIV. Por possuir alta estabilidade genética, supomos que os vírus dos demais animais não sequenciados possuem também a 41-lisina A presença da 41-lisina pode ser uma das possíveis explicações para a falha do tratamento com AZT. Outra hipótese é a de que a dose fornecida não foi adequada. / Feline Immunodeficiency Virus (FIV) is a lentivirus which causes a progressive disruption of the host's immune functions. FIV has been particularly used as a model for studies in retroviral resistance to nucleoside analogs because its similarities in physical properties, catalytic and sensitivity in comparison with HIV/RT. The aims of this work were to treat cats naturally infected with FIV, quantify viral load and proviral DNA by real time quantitative PCR with SYBR Green and analyze the viral nucleotide sequence. From 12 animals naturally infected, 6 received AZT at a dose of 10mg/kg/day and 6 received placebo. During 96 days of treatment, viral load and concentration of proviral DNA were measured by relative quantitative real time PCR developed by our staff. The nucleotide sequence of the RT encoding region was also achieved for 3 animals. The real time PCR relative quantification was successfully standardized for FIV. There was no significant statistical difference between treated and control groups. The nucleotide sequence revealed a lysine at position 41 on the enzyme active site. This lysine confers 4-fold decreased sensitivity to AZT in HIV RT-mutants. FIV subtype B has high genetic stability and we purposed that the other virus not sequenced have the same amino acid and hypothesized that this mutations can be one of the reasons determining the failure of the treatment. The other hypothesis is that the dose was not adequate.

A introdução de variedades transgênicas de soja provocou grandes alterações no mercado mundial e na legislação de países produtores e compradores, principalmente no que se refere à certificação, rastreabilidade, biossegurança e rotulagem. A soja é responsável por quase metade das receitas com exportação do Brasil, estando presente na forma de matéria-prima ou ingrediente em parte significativa dos alimentos no mercado brasileiro. O limite estabelecido de 1,0 % para presença de transgênicos em alimentos, acima do qual a rotulagem passa a ser obrigatória, gerou a demanda por materiais de referência para controle e quantificação em matérias-primas e alimentos, para harmonização e uniformização dos resultados obtidos em diferentes equipamentos e laboratórios, atualmente produzidos com exclusividade pelo Instituto de Materiais de Referência e Medidas - IRMM, na Bélgica. Diante do alto custo e da dificuldade de obtenção destes produtos, foram elaborados, utilizando-se técnica de moagem e mistura criogênica, com verificação por PCR em tempo real, candidatos a materiais de referência para soja transgênica Roundup Ready® (soja RR) em pó nas concentrações de 0%, 0,1%, 0,5%, 1,0%, 2,0% e 5% de material transgênico. Para rastrear a origem da soja transgênica, aplicou-se o método de marcadores AFLP sobre 29 variedades de soja RR, sendo 21 argentinas e 8 brasileiras, encontrando-se 6 bandas polimórficas, produtos de 4 pares de primers, selecionados de um total de 67 reações usando diferentes combinações de primers seletivos. Por este método, foram caracterizadas 15 das variedades argentinas e todas as variedades brasileiras. Para alimentos processados em análise de PCR, adotou-se a estratégia de detecção de fragmentos curtos (cerca de 100 pb) de soja RR, com desenho de primers usando programas computacionais de livre acesso na Internet (Primer3, NetPrimer, Rebase) e validação por digestão com endonucleases e sequenciamento. Foram estabelecidos dois novos conjuntos de primers para detecção e quantificação de fragmentos dos genes da lectina e CP4 EPSPS de soja RR, testados nas 29 variedades de soja RR e três matrizes de alimentos à base de soja / The introduction of soybean transgenic cultivars brought several changes in both world trade and regulation rules for producers and consumers, mainly in relation to certification, traceability, biosafety and labeling. Soybean is one of the largest commodities in the world trade and responsible for half of the Brazilian export incomings, present as raw material or ingredient in significant part of foods in the local market. The adoption of the threshold of 1,0 % for nonintentional presence of GMO in food, requiring obligatory labeling for contents above this level, demands reference materials for the control and quantification of transgenics in raw material and processed food, allowing the harmonization of results from different methods and laboratories, currently being produced exclusively by the Institute for Reference Materials and Measurements - IRMM, in Belgium. Due to the high costs and difficulty to obtain these products, candidate reference materials of Roundup Ready® transgenic soybean (RR soybean) were produced at levels of 0 %, 0,1 %, 0,5 %, 1,0 %, 2,0 % and 5,0 % of transgenic material, using cryogenic milling and mixing techniques, with subsequent verification by real time PCR. Tracing of Roundup Ready cultivars by origin was done through AFLP molecular markers in a total of 29 RR soybean cultivars: 21 Argentinean and 8 Brazilian cultivars. Fingerprinting was possible in 15 Argentinean and all Brazilian cultivars through 6 bands obtained from 4 selective pairs of primers, singled out from 67 different combinations of selective primers. For PCR analysis of processed food, primers were designed using freeware sources over the Internet (Primer3, NetPrimer, Rebase) for short fragments amplification (around 100 bp). Primers sets for the amplification of lectin and CP4 EPSPS gene fragments from RR soybean were designed for the detection of these genes in the 29 RR soybean cultivars and three soybean based food matrices, with the results validated by endonucleases digestion and sequencing

Submitted by Haroudo Xavier Filho (haroudo.xavierfo@ufpe.br) on 2016-07-01T12:40:07Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Tese_RonyMelo_Versao_BC_2.pdf: 1810035 bytes, checksum: 3c75da73e467a1195a630f09d398de6a (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-01T12:40:07Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Tese_RonyMelo_Versao_BC_2.pdf: 1810035 bytes, checksum: 3c75da73e467a1195a630f09d398de6a (MD5) Previous issue date: 2015-09-18 / Anp/prh-28 / O aprimoramento de tecnologias que possam tornar o processo produtivo mais amigável a sociedade e ao meio ambiente é uma busca constante das grandes indústrias, seja por questões mercadológicas, seja por obrigações legais. A indústria do refino de petróleo, pela própria natureza composicional de sua matéria prima principal, produz efluentes com os mais diferentes riscos, os quais necessitam ser eliminados ou reduzidos a níveis aceitáveis. Inserido dentro deste contexto surge à unidade de abatimentos de emissões atmosféricas SNOX®, cujos objetivos visam o tratamento de efluentes e produção de H2SO4 agregando assim valor comercial ao processo, contudo esses mesmos efluentes conferem a possibilidade de sofrer diversos processos corrosivos e que pode acarretar vazamentos de seus gases, os quais são, em sua maioria, nocivos. O presente trabalho teve como objetivos a elaboração de uma simulação em modo estacionário, do processo SNOX® utilizando o software Hysys® a fim de calcular as concentrações dos diversos gases circulantes, e avaliar, de forma probabilística, a dispersão atmosférica (através do modelo SLAB) desses gases devido à presença de incertezas em diversas variáveis. Para a avaliação probabilística foi utilizada técnicas de Quasi-Monte Carlo (Latin Hypercube) para: definição das incertezas relevantes e hierarquização destas através de análise de sensibilidade por decomposição de variâncias; cálculo do tamanho ideal das amostras que representarão as incertezas, considerando um intervalo de confiança de 90%; e exibição dos resultados na forma de famílias de curvas de distribuição de probabilidade para obtenção probabilidades de certos efeitos adversos referentes aos gases presentes no processo SNOX®. Os resultados mostraram que, considerando as condições operacionais da unidade e o tipo de consequência abordado (intoxicação por gases): coeficiente de descarga, vazão de descarga, velocidade (intensidade) dos ventos e diâmetro do orifício são as variáveis que possuem relevância e as incertezas associadas a esses resultados se propagam até as concentrações finais obtidas pelo modelo SLAB, fazendo com que sua melhor representação seja na forma de curvas de distribuição de probabilidades cumulativas. / The improvement of technologies which can implement greater eco-socialfriendly production processes are a goal for the major industries, either by marketing issues or legal restrictions. The oil industry, by its compositional nature of its feedstock, produces effluents with several hazards which must be eliminated or reduced to acceptable levels. In this context, the SNOX® unit rises as answer to the reduction of the atmospheric emissions, aiming the effluent treatment and H2SO4 production, which increases the commercial value to the process, notwithstanding the fact of these emissions enable corrosive process that may lead to leakage of gases, which are usually harmful. The current work has as main objectives the development of a simulation at stationary-state of the SNOX® process by using the HYSYS® software in order calculate the concentration of released gases and probabilistically evaluate the atmospheric dispersion of these gases employing SLAB method. The Quasi-Monte Carlo (Latin Hypercube) was used for probabilistic estimation for: defining the relevant uncertainties as well its hierarchization through sensibility analysis by variance decomposition; calculation of the ideal size for the samples which will represent the uncertainty with a reliability of 90%; and finally for displaying the results as groups of probability distribution curves to obtain the probability of some adverse effects associated with the gases at the process. The results evidenced that considering the operational conditions and the studied kind of consequences (gas intoxication): discharge coefficient, discharge flow rate, wind velocity (intensity of the wind) and the diameter of the orifice were the variables of relevance and the associated uncertainties of the results propagate to the final concentrations obtained by the SLAB model. Hence the results must be suitably represented by cumulative probability distribution curves.

Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2016-07-04T11:22:15Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) TeseLeoCabral_vrsFinal.pdf: 37484380 bytes, checksum: b61e5bb415f505345e69623ffd098b9e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-04T11:22:15Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) TeseLeoCabral_vrsFinal.pdf: 37484380 bytes, checksum: b61e5bb415f505345e69623ffd098b9e (MD5) Previous issue date: 2015-07-08 / A disciplina de geomecânica de reservatórios engloba aspectos relacionados não somente à mecânica de rochas, mas também à geologia estrutural e engenharia de petróleo e deve ser entendida no intuito de melhor explicar aspectos críticos presentes nas fases de exploração e produção de reservatórios de petróleo, tais como: predição de poro pressões, estimativa de potenciais selantes de falhas geológicas, determinação de trajetórias de poços, cálculo da pressão de fratura, reativação de falhas, compactação de reservatórios, injeção de CO2, entre outros. Uma representação adequada da quantificação de incertezas é parte essencial de qualquer projeto. Especificamente, uma análise que se destina a fornecer informações sobre o comportamento de um sistema deve prover uma avaliação da incerteza associada aos resultados. Sem tal estimativa, perspectivas traçadas a partir da análise e decisões tomadas com base nos resultados são questionáveis. O processo de quantificação de incertezas para modelos multifísicos de grande escala, como os modelos relacionados à geomecânica de reservatórios, requer uma atenção especial, principalmente, devido ao fato de comumente se deparar com cenários em que a disponibilidade de dados é nula ou escassa. Esta tese se propôs a avaliar e integrar estes dois temas: quantificação de incertezas e geomecânica de reservatórios. Para isso, foi realizada uma extensa revisão bibliográfica sobre os principais problemas relacionados à geomecânica de reservatórios, tais como: injeção acima da pressão de fratura, reativação de falhas geológicas, compactação de reservatórios e injeção de CO2. Esta revisão contou com a dedução e implementação de soluções analíticas disponíveis na literatura relatas aos fenômenos descritos acima. Desta forma, a primeira contribuição desta tese foi agrupar diferentes soluções analíticas relacionadas à geomecânica de reservatórios em um único documento. O processo de quantificação de incertezas foi amplamente discutido. Desde a definição de tipos de incertezas - aleatórias ou epistêmicas, até a apresentação de diferentes metodologias para quantificação de incertezas. A teoria da evidência, também conhecida como Dempster-Shafer theory, foi detalhada e apresentada como uma generalização da teoria da probabilidade. Apesar de vastamente utilizada em diversas áreas da engenharia, pela primeira vez a teoria da evidência foi utilizada na engenharia de reservatórios, o que torna tal fato uma contribuição fundamental desta tese. O conceito de decisões sob incerteza foi introduzido e catapultou a integração desses dois temas extremamente relevantes na engenharia de reservatórios. Diferentes cenários inerentes à tomada de decisão foram descritos e discutidos, entre eles: a ausência de dados de entrada disponíveis, a situação em que os parâmetros de entrada são conhecidos, a inferência de novos dados ao longo do projeto e, por fim, uma modelagem híbrida. Como resultado desta integração foram submetidos 3 artigos a revistas indexadas. Por fim, foi deduzida a equação de fluxo em meios porosos deformáveis e proposta uma metodologia explícita para incorporação dos efeitos geomecânicos na simulação de reservatórios tradicional. Esta metodologia apresentou resultados bastante efetivos quando comparada a métodos totalmente acoplados ou iterativos presentes na literatura. / Reservoir geomechanics encompasses aspects related to rock mechanics, structural geology and petroleum engineering. The geomechanics of reservoirs must be understood in order to better explain critical aspects present in petroleum reservoirs exploration and production phases, such as: pore pressure prediction, geological fault seal potential, well design, fracture propagation, fault reactivation, reservoir compaction, CO2 injection, among others. An adequate representation of the uncertainties is an essential part of any project. Specifically, an analysis that is intended to provide information about the behavior of a system should provide an assessment of the uncertainty associated with the results. Without such estimate, perspectives drawn from the analysis and decisions made based on the results are questionable. The process of uncertainty quantification for large scale multiphysics models, such as reservoir geomechanics models, requires special attention, due to the fact that scenarios where data availability is nil or scarce commonly come across. This thesis aimed to evaluate and integrate these two themes: uncertainty quantification and reservoir geomechanics. For this, an extensive literature review on key issues related to reservoir geomechanics was carried out, such as: injection above the fracture pressure, fault reactivation, reservoir compaction and CO2 injection. This review included the deduction and implementation of analytical solutions available in the literature. Thus, the first contribution of this thesis was to group different analytical solutions related to reservoir geomechanics into a single document. The process of uncertainty quantification has been widely discussed. The definition of types of uncertainty - aleatory or epistemic and different methods for uncertainty quantification were presented. Evidence theory, also known as Dempster- Shafer theory, was detailed and presented as a probability theory generalization. Although widely used in different fields of engineering, for the first time the evidence theory was used in reservoir engineering, which makes this fact a fundamental contribution of this thesis. The concept of decisions under uncertainty was introduced and catapulted the integration of these two extremely important issues in reservoir engineering. Different scenarios inherent in the decision-making have been described and discussed, among them: the lack of available input data, the situation in which the input parameters are known, the inference of new data along the design time, and finally a hybrid modeling. As a result of this integration three articles were submitted to peer review journals. Finally, the flow equation in deformable porous media was presented and an explicit methodology was proposed to incorporate geomechanical effects in the reservoir simulation. This methodology presented quite effective results when compared to fully coupled or iterative methods in the literature.