Neste trabalho será feita uma análise da quantidade de pontos de controle para correção geométrica de imagens, mais especificamente, do satélite CBERS-I, utilizando o sensor CCD, através de análises estatísticas para o cálculo da quantidade de pontos e estudo quantitativo através da análise de variância da média dos resíduos obtidos de amostras de tamanhos variados. Os pontos de controle foram coletados com receptor GPS e foi utilizado um modelo polinomial de segunda ordem para a correção geométrica da imagem. Os resultados experimentais obtidos na análise da média para o cálculo da quantidade de pontos mostram que o erro residual tende a se estabilizar para a quantidade de pontos definidos pela estatística. Apresenta-se ao final, considerações iniciais sobre a aplicação desta proposta para diversos outros sensores, permitindo um maior aproveitamento destes na atualização cartográfica e na geração de cartas imagens.

Submitted by Ramon Santana (ramon.souza@ufpe.br) on 2015-03-10T19:29:00Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) DISSERTAÇÃO Iasmine Andreza Basilio dos Santos.pdf: 4588179 bytes, checksum: 78b5e224d40bbfe1d1d29d1fde02790b (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-10T19:29:00Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) DISSERTAÇÃO Iasmine Andreza Basilio dos Santos.pdf: 4588179 bytes, checksum: 78b5e224d40bbfe1d1d29d1fde02790b (MD5) Previous issue date: 2014-02-17 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) e FACEPE / Simarouba amara Aubl. (Simaroubaceae) é amplamente utilizada na medicina popular brasileira e de países tropicais para tratamento de malária, parasitas intestinais, diarreia, anemia, sífilis, dispepsia. Apesar de sua importância etnofarmacológica, de ter sido integrante da primeira e segunda edições da Farmacopeia Brasileira e de ser empregada na fitoterapia e homeopatia, poucos estudos acerca de seu controle de qualidade são encontrados na literatura. Nesse contexto, o presente estudo objetivou a realização de uma padronização farmacognóstica, nos âmbitos farmacobotânico, fitoquímico, e físico-químico além do desenvolvimento e validação de metodologia analítica para a determinação de taninos na droga vegetal. Segundo a caracterização farmacobotânica, a raiz apresenta parênquima cortical compacto e cilindro vascular anficrival, além de inclusões e abundantes cristais poliédricos em seu parênquima axial. O caule demonstrou a presença de células tabulares no súber, parênquima cortical com células pétreas, parênquima axial do tipo paratraqueal aliforme, com cristais, além de canais secretores, encontrados no xilema. A folha é hipoestomática, com estômatos anomocíticos e papilas. O mesofilo é dorsiventral, com parênquima lacunoso compreendido por células braciformes. A nervura central apresenta contorno biconvexo, epiderme uniestratificada e sistema vascular anficrival. A triagem fitoquímica revelou a presença de quassinoides, fenilpropanoglicosídeos, derivados cinâmicos, taninos, cumarinas, triterpenos, esteroides, mono e sesquiterpenos. Quanto ao estudo físico-químico, o teor de umidade foi 8,00 (±0,05) %; os teores de cinzas totais e insolúveis em ácido apresentaram valores de 0,98(±0,02) % e 0,54(±0,07) %, respectivamente. A análise granulométrica permitiu classificar o pó como grosso. Para a determinação de taninos, foi desenvolvido e validado um método espectrofotométrico baseado em quantificação a um comprimento de onda de 760 nm, após adição do reagente Folin-Ciocalteu. O estudo permitiu especificar as quantidades ótimas de material vegetal e reagentes e demonstrou que o método foi linear, específico, preciso, exato e robusto, destacando-se pela facilidade de execução e baixo custo, além de constituir uma ferramenta útil para o controle de qualidade de Simarouba amara. Diante disso, as descrições anatômicas, estabelecidas pelo estudo farmacobotânico, os valores determinados pelos ensaios físico-químicos, as classes de metabólitos visualizadas na caracterização fitoquímica e a metodologia espectrofotométrica desenvolvida para a determinação de taninos em Simarouba amara constituem parâmetros para o controle de qualidade desta matéria-prima vegetal, fornecendo subsídios para a garantia da autenticidade da espécie, homogeneidade de seus constituintes e eficiência de procedimentos que abrangem desde a coleta, secagem até a pulverização do vegetal.

Submitted by Amanda Silva (amanda.osilva2@ufpe.br) on 2015-03-13T15:23:20Z No. of bitstreams: 2 DISSERTAÇÃO Taciana Conceição Manso.pdf: 6155125 bytes, checksum: 90f35a01604b2b31eea1963f27b7e0b0 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-13T15:23:20Z (GMT). No. of bitstreams: 2 DISSERTAÇÃO Taciana Conceição Manso.pdf: 6155125 bytes, checksum: 90f35a01604b2b31eea1963f27b7e0b0 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2014 / CNPq; FACEPE / A cana-de-açúcar é uma gramínea com grande capacidade de acumular sacarose em seu colmo, a qual é purificada para produção de açúcar, etanol e biodiesel.As plantas são capazes de perceber alterações ambientais e modificar o perfil de expressão gênica, ativando mecanismos de defesa, incluindo a regulação da fotossíntese nos cloroplastos. Assim, o conhecimento do perfil de expressão do genoma cloroplastidial viabiliza a identificação dos genes que regulam a respostaaestresses abióticos. Através de busca in silico por transcritos cloroplastidiais em banco de ESTs de cana-de-açúcar, foram identificados12 genes com expressão em bibliotecas de folha em diferentes estágios de desenvolvimento,utilizados para desenho deprimers específicos. O RNA total foi extraído a partir de folhas+1 de cana-de-açúcar das variedades RB92579 (tolerante) e RB72454 (sensível) submetidas a estresse por déficit hídrico. Após transcrição reversa, aqPCR foi conduzida no sistema Rotor-Gene 6000 e a validação dos dados foirealizada no programa REST 2009. A análise in silicomostrouuma prevalência dos genes cloroplastidiaisem bibliotecas de folhas. As análises de expressão gênica apontam a perfis de expressão diferenciados nas variedades analisadas. O aumento nos níveis dos transcritos codificantes para componentes dos fotossistemas parece auxiliar a cana-de-açúcar na tolerância à seca, pela reposição e/ou aumento do número de fotossistemas na membrana do tilacóide. Enquanto que a repressão do gene petA (citocromo b6f) pode favorecer a redução da produção de espécies reativas de oxigênio (ROS). O gene rbcLapresentou uma indução navariedade tolerante em comparação com a sensível, podendo estar relacionado com a alta produtividade atribuída a essa variedade. Assim, indicamos os genes cloroplastidiais psaA, psaB, psbA,psbD e petA os mais relacionados à tolerância à seca, podendo ser fortes candidatos a marcadores moleculares cloroplastidiais de tolerância à seca, visando auxiliar programas de melhoramento genético de cana-de-açúcar.

Made available in DSpace on 2018-08-01T21:35:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_10024_Tese_Eduardo de Almeida Soares.pdf: 3867541 bytes, checksum: 68dcf6cd58e085e15a6b6526d0da5f27 (MD5) Previous issue date: 2016-06-29 / Mamão (C. papaya L), uma fruteira de grande importância econômica mundial, vem sofrendo acentuados prejuízos na pré colheira, sobretudo pela doença da meleira do mamoeiro, caracterizada pela exsudação espontânea de látex aquoso e fluido que oxida e se acumula como uma substância pegajosa nos órgãos da planta. A meleira é causada por uma infecção sinérgica dos vírus PMeV e PMeV2, cuja sintomatologia manifesta-se apenas após a transição juvenil-adulto (florescimento) das plantas. Para entender os mecanismos de interação planta-vírus e a dependência fenológica da sintomatologia, o proteoma de C. papaya foi acessado, via proteômica quantitativa livre de marcação baseada em LC-MS/MS, para plantas infectadas e não infectadas (controle) em quatro diferentes idades (3, 4, 7 e 9 meses pós germinação). Este estudo possibilitou a identificação de 1.623 e a quantificação de 1.609 proteínas, cuja comparação de abundâncias revelou uma elevação nos níveis de proteínas relacionadas à fotossíntese e redução nos níveis de proteínas relacionadas à atividade de caspase-like, 26S-proteassomo e remodelamento de parede celular no período assintomático e anterior ao florescimento. O surgimento dos sintomas após o florescimento (7 meses pós germinação) foi acompanhado de uma redução no acúmulo de proteínas relacionadas à fotossíntese e elevação no acúmulo de proteínas relacionadas ao metabolismo de carboidratos, lipídeos, aminoácidos, proteínas, nucleotídeos e ácidos nucléicos. Além do acúmulo de proteínas envolvidas em resposta a estresse, sinalização, transporte e parede celular. O somatório destes resultados aponta para a existência de um mecanismo de tolerância incompleto na fase assintomática e anterior ao florescimento, com uma sinalização por ROS via cloroplasto seguido de um sistema ineficiente na contenção da infecção sistêmica pela depleção da atividade caspásica, proteassomal, e de remodelamento de parede. Este mecanismo de tolerância incompleta no pré florescimento ganha novos elementos com a transição juvenil-adulto, que com uma infecção já instalada de forma sistêmica, origina os sintomas de resposta necrótica e clorótica tardios. A inibição nos processos de remodelamento de parede celular anteriores ao florescimento acarreta no enfraquecimento dos laticíferos, que se rompem quando em desequilíbrio osmótico, gerando o aspecto melado do mamoeiro doente.

Orientador : Hildete Prisco Pinheiro / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas. Instituto de Matematica, Estatistica e Computação Cientifica / Made available in DSpace on 2018-08-03T04:59:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Carvalho_BeniltondeSa_M.pdf: 474587 bytes, checksum: a36675e0b9caba0eb2ecc12ecde9c758 (MD5) Previous issue date: 2003 / Mestrado / Mestre em Estatística

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2018-06-14T17:59:05Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 576076 bytes, checksum: a35361e9df206cb269d00894da983094 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-14T17:59:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 576076 bytes, checksum: a35361e9df206cb269d00894da983094 (MD5) Previous issue date: 2018-02-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O capim-elefante é uma cultura perene alógama com reprodução assexuada. Devido a essas características, os melhoristas têm como alternativa desenvolver híbridos para explorar a hetorose. Uma das dificuldades para obter os melhores híbridos é a escolha dos genitores. Uma das alternativas para a escolha dos genitores é realizar cruzamentos dialélicos e realizar as análises para obter informações sobre as capacidades geral e específica de combinação. No entanto, sendo uma cultura perene, diversos cortes são realizados, ou seja, várias medidas em um mesmo indivíduo são realizadas, dificultando a avaliação dos dados nas análises estatísticas. Para esse tipo de dados uma forma simples de fazer a análise é utilizar os modelos de repetibilidade. Dessa maneira um modelo de análise dialélica que permite estimar a capacidade geral e específica de combinação e a repetibilidade seria mais adequado que os modelos que não permitem a estimação da repetibilidade e, portanto, não levam em consideração a forma que os dados foram obtidos. Assim, foi proposto no presente trabalho, um modelo de análise dialélica com informação de repetibilidade e a aplicação desse modelo em dados obtidos de um cruzamento dialelo de capim elefante. Foram utilizadas informações de cinco cortes para características morfológicas e dois cortes para características de valor nutritivo. O modelo dialelo com a informação de repetibilidade permitiu estimar além do efeito genético, informações sobre o número de cortes e interação de corte x genótipos. Foi evidenciado que o modelo proposto mostrou ser uma alternativa que permitiu estimar os parâmetros genéticos para escolha de parentais além de levar em consideração a estrutura de medidas repetidas dos dados. / Elephant grass is an allogamous perennial crop with asexual reproduction. Because of these characteristics, the plant breeders have with alternative to develop hybrids to explore the heterosis. One of difficulties to develop hybrids is the choice of the parents. One alternative for this problem is make a crossings following a scheme and analyze the data to estimate the general and specific combination. However, as a perennial crop, several cuttings are made or in other words repeated measured are made, and it difficult to evaluate the data in the statistical analyzes. For this type of data, a simple way to do the analysis is to use repeatability models. In this way, a diallel analysis model that allows to estimate the general and specific combination ability and repeatability would be more adequate instead the models that do not allow the repeatability estimation and, therefore, do not take into account how the data were obtained. Thus, we proposed in the present study, a diallelic analysis model with repeatability and we gave an application of this model in data obtained from a diallel cross of elephant grass. It was used information of five cuttings for morphological traits and two cuttings for nutritive value traits. The diallel model with repeatability information allowed estimate in addition to the genetics effects, information about the number cuttings and genotype x cutting interaction. It was evidenced that the proposed model was a better alternative to analyze the data allowing to estimation of genetic parameters for choosing the best parents, besides taking into account the structure of repeated measurements of the data.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2018-06-14T18:26:01Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1296377 bytes, checksum: 4cf50482fa770814eb465e7df5af6db5 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-14T18:26:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1296377 bytes, checksum: 4cf50482fa770814eb465e7df5af6db5 (MD5) Previous issue date: 2018-02-23 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A identificação de genótipos com desempenho superior é um dos principais objetivos da maioria dos programas de melhoramento de plantas. No entanto, a capacidade de atingir esse objetivo é limitada pelo alto custo da fenotipagem e realização de experimentos. Neste contexto, a Seleção Genômica (SG) foi proposta para estimar o valor genético (VGG) de indivíduos que ainda não foram fenotipados por meio de informações de marcadores distribuídos em todo o genoma. No entanto, a maioria das modelagens da SG expressam o valor fenotípico como função apenas do efeito aditivo do valor genotípico o que dificulta, muitas vezes, uma representação mais realística da arquitetura genética de caracteres quantitativos, sendo a inclusão de efeitos dominância e interações epistáticas fatores cruciais para aumentar a acurácia da predição. O papel da epistasia na arquitetura genética de caracteres complexos tem sido discutido desde o surgimento da genética quantitativa e, embora seja visto por diferentes perspectivas, o reconhecimento sobre sua importância é crescente. Nas populações, a variância genética total é dividida em componentes de variância aditivo, de dominância e de epistasia, que dependem dos efeitos dos locos e das frequências dos alelos presentes na população. Assim, se a frequência do alelo epistático varia entre as populações, o efeito do gene de interesse pode significativo em uma população, mas não em outra, e o efeito pode até mesmo ser inverso sobre o caráter em ambientes diferenciados. Neste contexto, as Redes Neurais Artificias (RNAs) tornam-se alternativas de análise promissoras por capturar relações não lineares entre os marcadores a partir dos próprios dados, o que a maioria dos modelos comumente utilizados na SG não conseguem. Entretanto, a inclusão de todos os marcadores no genoma no modelo aumenta as chances de existência de alta correlação entre eles e representa um enorme desafio computacional, que acarreta menor precisão no treinamento da RNA, que utilizam boa parte de seus recursos para representar porções irrelevantes do espaço de busca, dificultando o aprendizado. Assim, um modelo mais realístico deveria incluir apenas os SNPs (Single Nucletiode polymorphism) ao caráter de interesse. Para minimizar os efeitos da dimensionalidade sobre a modelagem de SG usando RNA foi proposta, no presente trabalho, a utilização de métodos de redução de dimensionalidade do tipo Sonda e Stepwise para fins de seleção de um subconjunto de marcadores que serão utilizados na predição do valor genético. Após a seleção de marcadores, foi avaliada a eficiência do método de seleção genômica RR-BLUP e das redes neurais artificias do tipo de base radial (RNA-REF) e Perceptron de Múltiplas camadas (RNA-MLP) na predição do valor genético em população natural com desequilíbrio gamético. Para isso, foi simulada uma população Fl oriunda da hibridação de genitores divergentes, com 500 indivíduos, genotipados com 1000 marcadores do tipo SNP. As características fenotípicas foram determinadas adotando-se três modelos: aditivo, aditivo-dominante e epistático, atendendo duas situações de dominância: parcial e completa com caracteres quantitativos admitindo herdabilidades (hª) de 30 e 60%, controlados cada um por 100 locos, considerando dois alelos por loco, totalizando 12 cenários distintos. Para avaliar a capacidade de predição, o modelo RR-BLUP e RNA- RBF foram treinados utilizando 80% dos indivíduos da população e procedimento de validação cruzada com cinco repetições. Para tanto foram obtidos o quadrado da correlação entre o valor genômico predito (GEBV) e o valor genotípico/fenotípico para medir a acurácia seletiva (R2) e a raiz do erro do quadrado médio (REQM), para medir a acurácia preditiva. Os resultados obtidos pela validação genotípica no primeiro capitulo mostraram que o uso de redes neurais permite capturar as interações epistáticas levando a uma melhora na predição do valor genético e, principalmente, a grande redução da raiz do erro médio quadrado (REQM), o que indica maior confiabilidade da predição do valor genômico. No entanto, a partir dos resultados obtidos por validação fenotípica foi evidente que a acurácia de predição poderia ser melhorada ao introduzir a seleção de marcadores. Consequentemente, no segundo capítulo de trabalho, após aplicar os métodos de redução de dimensionalidade, sonda e Stepwise, acurácia de predição aumentou. Por exemplo, para a h2= 0.3 no cenário aditivo, o R2 de validação foi de 59.l% para rede neural (RNA-REF), 57% (RNA-MLP) e 57% para RR-BLUP e, no cenário epistático, os valores de R2 foram de 50%, 47 e 41%, respectivamente. Adicionalmente, ao analisarmos REQM, a diferença entre os desempenhos das técnicas é ainda maior. Para o cenário 1, as estimativas foram de 91 (RR-BLUP) e 5 para ambas as redes neurais e, no cenário mais crítico que incluía epistasia e dominância, de 427(RR-BLUP) e 20 para as redes neurais. Os resultados obtidos mostram que a utilização de redes neurais permite capturar as interações epistáticas levando a um aumento na acurácia da predição do valor genético e, principalmente, redução do erro quadrático médio, o que indica maior confiabilidade da predição do valor genômico. / The identification of elite individual is a critical component of most plant breeding programs. However, the ability to achieve this goal is limited by the high cost of phenotyping and conducting experiments. In this context the genomic selection was proposed to use all marks presents in the genome to estimate the genomic breeding value of individuals (GEBV) without the need to phenotyping. However, most applications of GS includes only the additive portion of the genetic value, and a more realistic representation of the genetic architecture of quantitative traits should have the inclusion of dominance and epistatics interaction. The role of epistasis in the genetic architecture of quantitative traits has been debated since first formulations of quantitative genetic theory, and different perspectives regarding the importance of epistasis arise. In populations, the total genetic variance is partitioned into components that are attributable to additive, dominance and epistatic variance, which depend on allele frequencies. If the allele frequency of the interacting locus varies among populations, the effect of the target locus can be significant in one population but not in another, or can even be of the opposite sign. In this context, Artificial Neural Networks (ANNs) has a great potential because they can capture non-linear relationships between markers from the data themselves, which most of the models commonly used in the GS can not. However, the inclusion of all markers in the prediction model increases the chances of a high correlation between the marks and represents a huge challenge that add less precision and a great computational demand for ANNs training that use a good part of their resources to represent irrelevant portions of the search space and compromising the learning process. Thus, a more realistic model should include only SNPs that are related to the traits of interest. Because of this, it was proposed to use dimensionality reduction methods, applied to the prediction of genetic values, for the purpose of selecting a subset of markers by means of specific procedures such as Sonda or Stepwise regressions. In this way, the objective of this work is to evaluate the efficiency of genome enabled prediction by using RR-BLUP (GS) and artificial neural networks as radial basis function neural network (RBFNN), and Multi-layer Perceptron (RNA-MLP) in the prediction of the genetic value in a natural population with linkage disequilibrium without (chapter 1) and with (chapter 2) the dimensionality reduction. For this, an Fl population from the hybridization of divergent parents with 500 individuals genotyped with l,000 SNP-type markers was simulated. The phenotypic traits were determined by adopting three different gene action models: additive, additive-dominance and epistasis, attending two dominance situations: partial and complete with quantitative traits admitting heritabilities (hz) ranging from 30 to 60%, each is controlled by 50 loci, considering two alleles per loco, totaling 12 different scenarios. To evaluate the predictive ability of RR-BLUP and the neural networks a cross- validation procedure with five replicates were trained using 80% of the individuals of the population. Two dimensionality reduction methods Stepwise and Sonda were used to calculated the square of the correlation between predicted genomic value (GEBV) and genotype/phenotype value was used to measure predictive reliability(R2) and the predictive mean-squared error root (MSER). In the chapter one of this work the results showed that the use of neural networks allows capturing the epistasic interactions leading to an improvement in the accuracy of the prediction of the genetic value and, mainly, a large reduction of the mean square error root (MSER) that indicates greater reliability of the prediction of the genomic value. But from the results using phenotypic validation it was clearly that is possible to make further improvements on the accuracy by introducing the variable selection. Consequently, in the second chapter, after applied the dimensionality reduction methods, the the accuracy increased. For example, for h2 = 0.3 in the additive scenario, the validation R2 was 59% for neural network (RBFNN), 57% (RNA-MLP) and 57% for RR-BLUP, and in the epistemic scenario R2 values were 50%, 47 and 41%, respectively. Additionally, when analyzing the mean-squared error root the difference in performance of the techniques is even greater. For additive scenario, the estimates were 9l (RR-BLUP) and 5 for both neural networks and, in the most critical scenario, 427 (RR-BLUP) and 20 for neural networks. The results show that the use of neural networks allows capturing the epistasis interactions leading to an improvement in the accuracy of the prediction of the genetic value and, mainly, a large reduction of the mean square error root that indicates greater reliability of the prediction of the genomic value. / A folha de aprovação está com o nome do curso errado.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-06-15T13:15:58Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 897348 bytes, checksum: 27c29d4798a08865747a2822404e74cf (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-15T13:15:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 897348 bytes, checksum: 27c29d4798a08865747a2822404e74cf (MD5) Previous issue date: 2018-02-16 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O lançamento de uma nova cultivar ou híbrido é uma tarefa complexa e que envolve várias etapas, sendo a primeira delas a escolha dos genitores para montar a população de onde o novo cultivar será retirado. Este trabalho tem como objetivo realizar um estudo comparativo entre várias estratégias de escolha de genitores, para fins de hibridação, baseadas em análises fenotípicas ou em análises que agregam informações moleculares. Também avaliou-se a eficácia da predição do desempenho de híbridos não realizados por meio de abordagem de predição genômica. Para a escolha dos genitores, com base em informação fenotípica, foram consideradas as análises de ensaios de competição para a característica de interesse agregando informações multivariadas do estudo da diversidade genética ou, ainda, informações do valor genético aditivo predito por análise dialélica em cruzamento de genitores pré-selecionados. Para a escolha de genitores, com base em informações moleculares adicionais, foi empregado modelo de predição genômica a partir de dados fenotípicos e genotípicos de todos os genitores. No estudo adicional, para a predição dos híbridos não realizados, também foi usado a abordagem de seleção genômica em que o conjunto de dados para treinamento foi constituído com as informações genotípicas e fenotípicas de todas as linhagens analisadas, acrescida da informação de 1λ0 híbridos gerados para fins do estudo da análise dialélica anterior. O modelo de predição foi utilizado numa população de validação constituída por informações genotípicas de todos os híbridos não realizados. O s dados foram obtidos através de simulação utilizando o programa computacional GENES. Das linhagens escolhidas pelos métodos convencionais (com base em informação fenotípica) de 40 a 70% coincidiu na classe ótima e quando cruzadas formaram híbridos em que de 37,8 a 53,3% também estavam nessa classe. Pela análise considerando as informações genotípicas, todas as linhagens escolhidas foram classificadas na melhor classe e dos híbridos formados 66,7% estavam também nesse grupo. Sobre a predição dos híbridos não realizados, usando um modelo genômico, foi previsto o valor genômico desses e escolhidos os 45 melhores para uso no programa de melhoramento. Quando comparados os valores genômicos, 82,2% dos híbridos coincidiram na classe de ótimos. Por meio desses trabalho foi visto que a seleção genômica consiste em um método útil e eficaz para predição dos valores genéticos genômicos de linhagens e de híbridos, devendo ser explorada em maior magnitude. / The development of a new cultivar or hybrid is a complex task and take several steps, the first being the parental selection for the breeding population where the cultivar will be made. The objective of this work has the objective of evaluate a comparative study among several strategies of parental selecting, for hybridization purposes, based only in phenotypic data or including molecular information. The efficacy of the prediction of the performance of unrealized hybrids through a genomic prediction approach was also evaluated. For parental selection, based in phenotypic information, the analyses were carried out using the information of competition tests for the phenotypic trait adding multivariate information from the study of genetic diversity or, also, information of the additive genetic value predicted by diallel analysis with the parents that were selected .For the parental selection adding molecular information, a genomic prediction model was used based on phenotypic and genotypic data of all the parents. In the additional study, for the prediction of unrealized hybrids, the genomic selection approach was also used, in which the training data set consisted of the genotypic and phenotypic information of all the inbred lines analyzed, plus the information of 190 hybrids generated for study of the previous diallel cross analysis. The prediction model was used in a validation population consisting of genotypic information of all unrealized hybrids. The data were generated from simulation using the software GENES. From the inbred lines chosen by conventional methods (based only on phenotypic information) from 40 to 70% coincided in the optimal class and from 37.8 to 53.3% the unrealized hybrids from them were also in this class. By analyzing the genotypic information, all the selected inbred lines were classified in the best class and 66.7% of the hybrids formed were also in this group. In addition, from the genomic selection prediction of unrealized hybrids, the best 45 hybrids(based in genomic breeding value estimated) were chosen in order to use in the inbreeding program. When comparing the genomic values, 82.2% of the hybrids are also in the optimal class. Through this work it was seen that genomic selection is a useful and effective method to predict genetic values of inbreed lines and hybrids, and should be explored in greater magnitude.

Orientador: Mario Luiz Possas / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Economia / Made available in DSpace on 2018-07-24T12:36:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Silva_LuizAfonsoSimoensda_D.pdf: 6270574 bytes, checksum: 96da8b27e9f832afbd4a938e248b67f5 (MD5) Previous issue date: 1989 / Resumo: Não informado / Abstract: Not informed. / Doutorado / Doutor em Economia

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-02-10T16:02:01Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 850228 bytes, checksum: 559deb1262f72e7ff2749a61c43ef55f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-10T16:02:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 850228 bytes, checksum: 559deb1262f72e7ff2749a61c43ef55f (MD5) Previous issue date: 2012-11-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A cana-de-açúcar é uma das principais culturas do agronegócio brasileiro. Para atender a demanda do setor sucroenergético novas estratégias devem ser propostas no programa de melhoramento em prol da obtenção de novas variedades agronomicamente superiores. A depressão endogamica é um fenômeno que acarreta na redução da média geral, todavia, proporciona um aumento na variância genética na população. A literatura acerca dos efeitos da endogamia em poliploides é escassa. O objetivo deste trabalho foi estimar parâmetros genéticos em cana-de-açúcar com base em dados de produção e tecnológicos. Foram utilizadas oito clones RB925345, RB867515, RB739359, SP80-1816, RB928064, RB865230, RB855536 e RB943365, com sua primeira geração de autofecundação. O experimento foi conduzido em um delineamento em blocos casualisados com classificação hierárquica. Foram calculados os coeficientes de variação genético e ambientais, os percentuais de depressão endogâmica, as correlações fenotípica e as médias foram submetidas ao teste de agrupamento de médias de Scott-Knott (1974) modificando por Bhering et al. (2008). Foi observado que o percentual de fibra foi o único caráter que aparentemente não sofreu o efeito da depressão endogâmica. Diante do exposto conclui-se que: Com a autofecundação dos clones ocorre redução das médias e aumento da variância nas famílias de selfs para todas as características com exceção de Fibra; Os clones SP80-1816 e RB943365 apresentam elevada carga genética e a seleção deve ser feita com maior intensidade dentro das famílias RB867515⊗, RB928064⊗, RB739359⊗ e RB855536⊗. / The sugar cane is an important crop of Brazilian agribusiness. To meet the demand of the sugarcane industry new strategies must be proposed in the breeding program for aiming to obtain new varieties agronomically superior. The inbreeding depression is a phenomenon that causes a reduction in the overall average, however, provides an increase in genetic variance in the population. Literature about effects of inbreeding in polyploids is scarce. The aim of this study was to estimate genetic parameters in sugar cane based on production and technologic data. A total of eight varieties RB925345, RB867515, RB739359, SP80-1816 RB928064, RB865230, RB855536 and RB943365, with its first generation of selfing. The experiment was conducted in a randomized block design with hierarchical classification. Genetic variation coefficients and environmental factors were calculated, the percentage of inbreeding depression, phenotypic correlations and means were tested with group averages of Scott-Knott. It was observed that the percentage of fiber was the only character which apparently did not suffer the effects of inbreeding depression. Given the above it follows that: By selfing variety occurs average reduction and increased variance in the families of selfs for all characteristics except for fiber; Based on the average inbred families the breeder can infer about which varieties have better behavior; The Clones SP80-1816 and RB943365 show high genetic load and the selection should be made with greater intensity families RB867515⊗, RB928064⊗, RB739359⊗ and RB855536⊗.