The animal experiments seem to be current theme of these days. This thesis is focused on using animals, especially rodents, in the Czech Republic for the last ten years. There is also emphasis on the legal principles of animal protection and observance of three "R" principles. In this study there were used data from available sources about using laboratory animals in the Czech Republic. Also there was prepared a questionnaire research in different scientific institutions which use animal models in their researches. There were found out from available sources that the amount of experimental animals is on the same level (about 230 000) during the years 2006-2015. There were no deflection. Also this fact is the same for using rodents (about 120 000) as biomodels. Further there was found out that the laboratory mouse (Mus musculus var. alba) is the most used experimental model. 66,7% of questioned respondents considered the laboratory mouse the most common used laboratory animal and 60% of questioned respondents supposed that the number of used laboratoty animals was decreasing.

I studied outer, middle and inner ear morphology in Chinese bamboo rat (Rhizomys sinensis).I compared studied specimen with other subterranean, fossorial and aboveground rodents and assumed degree of its adaptation to subterranean environment.

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro / As florestas tropicais brasileiras (Amazônia e a Mata Atlântica) possuem alta diversidade de espécies e atualmente estão separadas por um cinturão de vegetação aberta. Parte deste cinturão é ocupada pela Caatinga, onde se encontram os Brejos de Altitude, testemunhos das conexões históricas entre a Mata Atlântica e a Amazônia. O Centro de Endemismos Pernambuco (CEPE) é a unidade biogeográfica que compõe a Mata Atlântica ao norte do rio São Francisco e contém diversos táxons endêmicos. Esta região apresenta uma mastofauna compartilhada com a Amazônia, devido às conexões existentes durante o Cenozóico. A presença do rio São Francisco em seu limite sul pode atuar como barreira ao fluxo gênico e explicar os endemismos encontrados no CEPE. Contrastando com sua situação peculiar, a mastofauna do CEPE ainda carece de estudos aprofundados sobre a identificação de suas espécies, padrões geográficos e relações filogenéticas. Revisões recentes têm identificado espécies diferentes ao norte e ao sul do rio São Francisco, mas poucos trabalhos têm proposto hipóteses biogeográficas para o CEPE. Para ampliar o conhecimento sobre a identidade e distribuição geográfica dos pequenos mamíferos do CEPE e sua estrutura filogeográfica, foram realizados levantamentos de espécies e análises de diversidade genética e morfométrica para algumas espécies. Os levantamentos consistiram de visitas às coleções científicas a fim de identificar as espécies ocorrentes no CEPE e excursões de coleta com 5 a 17 noites consecutivas em 12 localidades ao longo do CEPE, que totalizaram 64691 armadilhas noites e resultaram na coleta de 476 exemplares de 31 espécies. As espécies foram identificadas com base na morfologia externa e craniana e por análises citogenéticas. Para investigar a biogeografia do CEPE, análises de genética de populações, filogeográficas e morfométricas foram realizadas para os marsupiais Caluromys philander, Didelphis aurita, Marmosa murina, Metachirus nudicaudatus e os roedores Akodon cursor, Oecomys catherinae e Rhipidomys mastacalis para avaliar a existência de diferenciação nas populações do CEPE e suas relações com as linhagens Amazônicas e Atlânticas. Estes resultados mostraram que a diversificação dos pequenos mamíferos do CEPE ocorreu tanto no Terciário quanto no Quaternário. Algumas populações, como em Caluromys philander e Oecomys catherinae, mostraram afinidades com linhagens amazônicas, enquanto outras, como em Metachirus nudicaudatus e Rhipidomys mastacalis, apresentaram afinidades com linhagens atlânticas. Os pequenos mamíferos do CEPE apresentaram diferenciação em relação às suas linhagens irmãs, com algumas linhagens podendo tratar-se de espécies ainda não descritas (e.g. Didelphis aff. aurita e Rhipidomys aff. mastacalis). Esta diferenciação provavelmente foi causada pelos eventos cíclicos de flutuações climáticas que provocaram elevações no nível do mar e retração das florestas tropicais, isolando as populações do CEPE. Por fim, para auxiliar na identificação das espécies em novas coletas, de suas distribuições geográficas e de suas características citogenéticas e ecológicas, foi elaborado um guia reunindo todas as informações disponíveis sobre as espécies de pequenos mamíferos do CEPE. / The Brazilian tropical rainforests (Amazon and Atlantic Forest) present high species diversity and are currently separated by a belt of open and dry vegetation. Part of this belt is occupied by the Caatinga, where are found the Brejos de Altitude, evidence of the historical connections between the Atlantic Forest and the Amazon. The Pernambuco Endemism Center (CEPE) is the biogeographic unit of the Atlantic Forest located north of the São Francisco River and contains several endemic taxa. Part of its mammal fauna is shared with the Amazon, due to former connections in the Cenozoic. The presence of the São Francisco river in its southern limit may act as a barrier to gene flow and explain the endemism found in CEPE. In contrast to their peculiar situation, the mammalian fauna from CEPE still lacks detailed studies on its taxonomic composition, geographic patterns and phylogenetic relationships. Recent reviews have identified different species in the north and south of the San Francisco river, but few studies have proposed biogeographical hypotheses for the CEPE. In order to increase knowledge on the identity and geographical distribution of the small mammals in the CEPE and their phylogeographic structure, species surveys were carried out and the genetic and morphometric diversity of some of the species found were assessed. The surveys consisted of visits to scientific collections to identify the species occurring in CEPE and trapping trips, with 5 to 17 consecutive nights, in 12 sites throughout the CEPE, totaling 64,691 trap-nights, resulting in the collection of 476 specimens of 31 species. The specimens were identified based on external and cranial morphology and cytogenetic analysis. To investigate the biogeography of CEPE, genetics, phylogeographic and morphometric analysis were performed with the marsupials Caluromys philander, Didelphis aurita, Marmosa murina, Metachirus nudicaudatus and the rodents Akodon cursor, Oecomys catherinae and Rhipidomys mastacalis to assess the existence of differentiation in CEPE populations and their relationships with the Amazon and Atlantic Forest lineages. These results showed that diversification of small mammals in CEPE occurred in both the Tertiary and Quaternary. Some populations, such as Caluromys philander and Oecomys catherinae showed affinities with amazonian lineages, while others, like Metachirus nudicaudatus and Rhipidomys mastacalis, showed affinities with atlantic lineages. The small mammals from CEPE showed differentiation from their sisters lineages, with some lineages probably being, in fact, undescribed species (eg Didelphis aff. aurita and Rhipidomys aff. mastacalis). This differentiation was probably caused by cyclical events of climate fluctuations that led to sea level rises and retractions of the tropical forests, thus isolating the populations in CEPE. Finally, to help identifying species in future field surveys, their geographic distributions and ecological and cytogenetic features, a guide was prepared by gathering all available information on the species of small mammals from CEPE.

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The small-mammal community structure of two conservation unit (CUs), Taim Ecological Station (TES) and Espinilho State Park (ESP), of the Pampa biome in southern Brazil, was investigated and compared regarding species richness, composition and abundance. Additionally, a Deciduous forest area was compared with those ones. For this purpose, ten transects with live-traps pitfall traps were used. In addition, sixteen environmental variables were measured in the TES to verify the small-mammal micro-spatial distribution. During six field phases in each area, 11 species were capture at TES, while nine species were captured in the ESP. The two areas of the Pampa biome showed high species richness when compared to forested areas, since both are influenced by other biomes: TES by the Atlantic Forest, as it is close to the coastal region, and the ESP by the interior of the continent biomes, Chaco and Espinal. The abundance and composition were different due to environmental heterogeneity, biogeography effect, size areas and degree of disturbance. However, environmental heterogeneity allows both areas to have similar species richness. When compared with the Atlantic forest CU, they differ in species richness, composition and abundance of individuals due to greater homogeneity and complexity of the forested area. With respect to the microspatial distribution, species richness and abundance were associated with sites close to water, with greater availability of arthropods and herbs. Since there is great variability of environments at TES, the heterogeneity is primarily responsible for the variation in richness and abundance of small mammals among microhabitats. The analysis indicated a significant effect of environmental variables on species abundance, showing the selection of some environments more often than others. / A estrutura da comunidade de pequenos mamíferos de duas Unidades de Conservação (UCs), a Estação Ecológica do Taim (ESET) e o Parque Estadual do Espinilho (PEE), do bioma Pampa no sul do Brasil, foi investigada e comparada quanto à riqueza, composição e abundância de espécies. Adicionalmente, uma área de Floresta Estacional Decidual, foi comparada com essas duas. Para tanto, foram utilizadas transecções com armadilhas convencionais e de queda. Ainda, na ESET dezesseis variáveis ambientais foram mensuradas para verificar a distribuição micro-espacial de pequenos mamíferos. Durante seis fases de campo em cada área, 11 espécies foram capturadas na ESET, enquanto nove foram capturadas no PEE. As duas áreas do bioma Pampa apresentaram alta riqueza de espécies quando comparadas a áreas florestadas, já que ambas sofrem influência de outros biomas: a ESET da Mata Atlântica, por se situar na região costeira, e o PEE dos biomas do interior do continente, Chaco e Espinal. A abundância e a composição foram diferentes, devido à heterogeneidade ambiental, efeito biogeográfico, diferença no tamanho das áreas e grau de perturbação. Porém, a heterogeneidade ambiental permite que ambas as áreas possuam riqueza de espécies similar. Quando comparadas com a UC de Floresta Atlântica, diferem na riqueza, composição e abundância de espécies devido à maior homogeneidade e complexidade da área florestada. Com relação à distribuição micro-espacial, a riqueza e a abundância estiveram associadas a locais próximos à água, maior disponibilidade de artrópodes e herbáceas. Uma vez que existe uma grande variabilidade de ambientes na ESET, a heterogeneidade é a principal responsável pela variação na riqueza e abundância de pequenos mamíferos entre os microhabitats. As análises mostraram um efeito significativo das variáveis ambientais na abundância das espécies, evidenciando a seleção de alguns ambientes mais favoráveis em detrimento a outros.

abstract: Social influences are important determinants of drug initiation in humans, particularly during adolescence and early adulthood. My dissertation tested three hypotheses: 1) conditioned and unconditioned nicotine and social rewards elicit unique patterns of neural signaling in the corticolimbic neurocircuitry when presented in combination versus individually; 2) play behavior is not necessary for expression of social reward; and 3) social context enhances nicotine self-administration. To test the first hypothesis, Fos protein was measured in response to social and nicotine reward stimuli given alone or in combination and in response to environmental cues associated with the rewards in a conditioned place preference (CPP) test. Social-conditioned environmental stimuli attenuated Fos expression in the nucleus accumbens core. A social partner elevated Fos expression in the caudate-putamen, medial and central amygdala, and both nucleus accumbens subregions. Nicotine decreased Fos expression in the cingulate cortex, caudate-putamen, and the nucleus accumbens core. Both stimuli combined elevated Fos expression in the basolateral amygdala and ventral tegmental area, suggesting possible overlap in processing both rewards in these regions. I tested the second hypothesis with an apparatus containing compartments separated by a wire mesh barrier that allowed limited physical contact with a rat or object. While 2 pairings with a partner rat (full physical contact) produced robust CPP, additional pairings were needed for CPP with a partner behind a barrier or physical contact with an object (i.e., tennis ball). The results demonstrate that physical contact with a partner rat is not necessary to establish social-reward CPP. I tested the third hypothesis with duplex operant conditioning chambers separated either by a solid or a wire mesh barrier to allow for social interaction during self-administration sessions. Nicotine (0.015 and 0.03 mg/kg, IV) and saline self-administration were assessed in male and female young-adult rats either in the social context or isolation. Initially, a social context facilitated nicotine intake at the low dose in male rats, but suppressed intake in later sessions more strongly in female rats, suggesting that social factors exert strong sex-dependent influences on self-administration. These novel findings highlight the importance of social influences on several nicotine-related behavioral paradigms and associated neurocircuitry. / Dissertation/Thesis / Doctoral Dissertation Psychology 2015

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:41Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-07-17Bitstream added on 2014-06-13T20:11:20Z : No. of bitstreams: 1 araujo_fap_me_botfmvz.pdf: 1074978 bytes, checksum: 6abbf36fcc0af997f7f58dae2699c60a (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / O trabalho teve por objetivos avaliar, por meio de estudos goniométricos, radiográficos e tomográficos, medidas aferidas dos membros pélvicos de pacas criadas em cativeiro, de forma a fornecer informações para esta espécie. Foram utilizadas nove pacas (Cuniculus paca) adultas, sendo três fêmeas e seis machos, com peso médio variando de 5,9 até 8,2 kg. O valor médio do arco de movimento para articulação do joelho foi de 77,34 ±13,48º e o da articulação tarsocrural de 99,09 ±8,42º, porém a articulação coxofemoral apresentou valores de 67,38 ±6,16º até 81,00 ±7,52º. Pela avaliação radiográfica, a média do ângulo de Norberg foi de 132,33 ±2,29º e 129,22 ±2,72º para os membros pélvicos direito e esquerdo, respectivamente. Os valores do ângulo de inclinação apresentaram variação de 142,44 ±4,82º até 145,44 ±4,09º para o método A de Hauptman, de 129,78 ±3,84º até 133,22 ±2,58º para o método B de Hauptman e de 144,94 ±3,13º até 148,22 ±3,25º para o método de Montavon. O valor médio do comprimento do ligamento patelar (L) foi 15,87 ±1,14 mm, e o do comprimento longitudinal da patela (P) de 27,26 ±1,93mm, sendo a proporção L:P de 0,59 ±0,06, na mensuração radiográfica em projeção mediolateral. Pela aferição tomográfica, a média do comprimento patela no plano coronal foi 2,93 ±0,17cm e no plano sagital variou de 2,78 ±0,30cm até 2,89 ±0,20cm. A média do ângulo de anteversão, mensurado por tomografia, foi de 28,56 ±5,56º até 32,91 ±2,62º. A conformação óssea das pacas apresenta muitas semelhanças com a do porquinho da índia, porém foram detectadas apenas duas lúnulas e uma fabela lateral. Os valores obtidos servirão de base para futuros estudos comparativos com outras espécies de roedores ou mamíferos. / The aim of this study was to evaluate the hind limbs of pacas raised in captivity using goniometrical, radiographical and computed tomography (CT) studies to establish data about this specie. Nine mature pacas (Cuniculus paca), 3 females and 6 males, weighing 5.9-8.2 kg were used. Mean values of range of motion of knee and tarsus were 77.34 ±13.48º and 99.09 ±8.42º, respectively, and range of motion of hip joint ranged from 67.38 ±6.16º to 81.00 ±7.52º. Radiographically, Norberg angle had mean values of 132.33 ±2.29º and 129.22±2.72º for right and left hind limbs, respectively. Angles of Inclination ranged from 142.44 ±4.82º to 145.44 ±4.09º for Hauptman A method, from 129.78 ±3.84º to 133.22 ±2.58º for Hauptman B method, and from 144.94 ±3.13º to 148.22 ±3.25º for Montavon method. The mean values of patellar ligament length (L) and longitudinal length of the patella (P) were 15.87 ±1.14mm and 27.26 ±1.93mm, respectively, and the length ratio between the patellar tendon and the patella (L:P) was 0.59 ±0.06, measured on the mediolateral radiographs. Length of the patella in the coronal plane was 2.93 ±0.17cm, and in the sagittal plane ranged from 2.78 ±0.30cm to 2.89 ±0,20cm using CT measurements. Average values for the femoral head and neck anteversion angles measured by CT were from 28.56 ±5.56º to 32.91 ±2.62º. The bone structure of the pacas has similarity to the guinea pigs, but two lunulae and one lateral fabela were observed. The data obtained may be used to future studies comparing the pacas to other rodent species or mammals.

Submitted by Luiz Ricardo Gonçalves null (tatinho_tva@hotmail.com) on 2016-07-27T18:25:27Z No. of bitstreams: 1 dissertação LRG.pdf: 2432897 bytes, checksum: 0ce4cc1f4bd2a278c07c6602aa1453d0 (MD5) / Approved for entry into archive by Felipe Augusto Arakaki (arakaki@reitoria.unesp.br) on 2016-07-29T13:34:29Z (GMT) No. of bitstreams: 1 golcalves_lr_me_jabo.pdf: 2432897 bytes, checksum: 0ce4cc1f4bd2a278c07c6602aa1453d0 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-29T13:34:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 golcalves_lr_me_jabo.pdf: 2432897 bytes, checksum: 0ce4cc1f4bd2a278c07c6602aa1453d0 (MD5) Previous issue date: 2016-06-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Patógenos transmitidos por vetores artrópodes são mundialmente importantes, podendo causar enfermidades tanto no homen quanto nos animais. Recentemente, diversos estudos têm sido realizados a fim de elucidar o papel dos animais selvagens na epidemiologia desses patógenos. A identificação desses microrganismos, assim como dos seus vetores e hospedeiros, permite mapear áreas de ocorrência desses patógenos, auxiliando os órgãos competentes na elaboração de medidas de controle. Sendo assim, o presente estudo teve como objetivo detectar e caracterizar, por métodos moleculares, micoplasmas hemotróficos e bartonelas em amostras de baço de roedores selvagens e sinantrópicos distribuídos em cinco biomas brasileiros. Para tal, foram analisadas 500 amostras de roedores pertencentes a 51 espécies distribuídas em 13 estados. Dentre as 457 amostras de DNA positivas nos ensaios de PCR baseados nos genes Interphotoreceptor retinoid binding protein [IRBP] ou Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase [GAPDH], 100 (21,9%) mostraram-se positivas para Mycoplasma spp. por meio da cPCR baseada no gene 16S rRNA. A análise filogenética de 24 sequências do gene 16S rRNA mostrou a presença de dez diferentes clusters, todos agrupados dentro do grupo Mycoplasma haemofelis. O posicionamento filogenético associado com a baixa porcentagem de identidade entre as sequências amplificadas no presente estudo e aquelas previamente depositadas no Genbank sugere a circulação de novas espécies de hemoplasmas em roedores no Brasil. Por meio da qPCR, 117 (25,6%) amostras mostraram-se positivas para Bartonella sp. A análise de diversidade das sequências do gene gltA mostrou a presença de 15 haplótipos. A relação filogenética entre as sequências do gene gltA mostrou que a espécie de Bartonella detectada em roedores no Brasil é intimamente relacionada com Bartonella sp. denominada como grupo filogenético A detectada em roedores da Família Cricetidae na América do Norte, provavelmente formando uma única espécie ou um complexo de espécies. Por outro lado, as sequências amplificadas por meio de ensaios de cPCR adicionais, baseados nos genes ftsZ, groEL e pap-31, mostraram-se filogeneticamente próximas ao complexo Bartonella vinsonii. Por fim, as sequências de Bartonella amplificadas no presente estudo formaram um grupo monofilético e amplamente difundidas em sete diferentes espécies de roedores amostrados em três biomas. Tais achados sugerem uma provável dominância desse genótipo entre os roedores silvestres no Brasil. Copositividade para hemoplasmas e Bartonella sp. foi observada em 41 (9%) dos roedores amostrados. O presente estudo demonstrou, por meio de métodos moleculares, a ocorrência de micoplasmas hemotróficos e Bartonella sp. em roedores selvagens e sinantrópicos no Brasil. / Arthropod-borne pathogens are wordwide important, causing diseases in humans and animals. Recently, several studies have been performed in order to elucidate the role of wild animals in the epidemiology of these pathogens. The identification of these microorganisms, as well as their vectors and hosts, allow to map the areas of occurrence of these pathogens, helping competent agencies in the development of control measures. Therefore, the present study aimed to detect and characterize, using molecular methods, hemotrophic mycoplasmas and Bartonella in wild and sinantropic rodent spleen samples distributed in five Brazilian biomes. For this purpose, 500 rodent samples belonging to 51 species distributed in 13 states were analyzed. Among 457 DNA samples positive to PCR assays based on the Interphotoreceptor retinoid binding protein [IRBP] or Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase [GAPDH]) genes, 100 (21.9%) were positive to Mycoplasma spp. by cPCR based on 16S rRNA gene. The phylogenetic analysis of 24 sequences of the 16S rRNA gene showed the presence of ten different clusters, which grouped within the Mycoplasma haemofelis group. The phylogenetic position associated with the low percentage of identity between the sequences amplified in the present study and those previously deposited in Genbank suggest the circulation of new hemoplasmas species in rodents in Brazil. Additionally, 117 (25.6%) samples were positive to Bartonella sp. by qPCR. The diversity analysis of the gltA gene sequences showed the presence of 15 haplotypes. The phylogenetic relationships between the sequences of gltA gene showed that Bartonella species detected in rodents in Brazil is closely related to Bartonella sp. namely phylogenetic group A detected in the rodents belonging to Cricetidae family in North America, probably constituting only one species, or a complex of species. On the other hand, the amplified sequences by additional cPCR assays based on ftsZ, groEL and pap-31 genes were phylogenetically positioned to Bartonella vinsonii complex. Finally, the Bartonella sequences amplified in the present study formed a monophyletic and widespread group in seven different species of rodents sampled in three biomes. These findings suggest a probable dominance of this genotype among wild rodents in Brazil. Co-positivity was observed in 41 (9%) of rodents sampled. The presente study demonstrated using molecular methods, the occurrence of hemotrophic mycoplasmas and Bartonella sp. in wild and synanthropic rodents in Brazil.

Orientador: Sheila Canavese Rahal / Banca: Marcia Rita Fernandes Machado / Banca: José Morceli / Resumo: O trabalho teve por objetivos avaliar, por meio de estudos goniométricos, radiográficos e tomográficos, medidas aferidas dos membros pélvicos de pacas criadas em cativeiro, de forma a fornecer informações para esta espécie. Foram utilizadas nove pacas (Cuniculus paca) adultas, sendo três fêmeas e seis machos, com peso médio variando de 5,9 até 8,2 kg. O valor médio do arco de movimento para articulação do joelho foi de 77,34 ±13,48º e o da articulação tarsocrural de 99,09 ±8,42º, porém a articulação coxofemoral apresentou valores de 67,38 ±6,16º até 81,00 ±7,52º. Pela avaliação radiográfica, a média do ângulo de Norberg foi de 132,33 ±2,29º e 129,22 ±2,72º para os membros pélvicos direito e esquerdo, respectivamente. Os valores do ângulo de inclinação apresentaram variação de 142,44 ±4,82º até 145,44 ±4,09º para o método A de Hauptman, de 129,78 ±3,84º até 133,22 ±2,58º para o método B de Hauptman e de 144,94 ±3,13º até 148,22 ±3,25º para o método de Montavon. O valor médio do comprimento do ligamento patelar (L) foi 15,87 ±1,14 mm, e o do comprimento longitudinal da patela (P) de 27,26 ±1,93mm, sendo a proporção L:P de 0,59 ±0,06, na mensuração radiográfica em projeção mediolateral. Pela aferição tomográfica, a média do comprimento patela no plano coronal foi 2,93 ±0,17cm e no plano sagital variou de 2,78 ±0,30cm até 2,89 ±0,20cm. A média do ângulo de anteversão, mensurado por tomografia, foi de 28,56 ±5,56º até 32,91 ±2,62º. A conformação óssea das pacas apresenta muitas semelhanças com a do porquinho da índia, porém foram detectadas apenas duas lúnulas e uma fabela lateral. Os valores obtidos servirão de base para futuros estudos comparativos com outras espécies de roedores ou mamíferos. / Abstract: The aim of this study was to evaluate the hind limbs of pacas raised in captivity using goniometrical, radiographical and computed tomography (CT) studies to establish data about this specie. Nine mature pacas (Cuniculus paca), 3 females and 6 males, weighing 5.9-8.2 kg were used. Mean values of range of motion of knee and tarsus were 77.34 ±13.48º and 99.09 ±8.42º, respectively, and range of motion of hip joint ranged from 67.38 ±6.16º to 81.00 ±7.52º. Radiographically, Norberg angle had mean values of 132.33 ±2.29º and 129.22±2.72º for right and left hind limbs, respectively. Angles of Inclination ranged from 142.44 ±4.82º to 145.44 ±4.09º for Hauptman A method, from 129.78 ±3.84º to 133.22 ±2.58º for Hauptman B method, and from 144.94 ±3.13º to 148.22 ±3.25º for Montavon method. The mean values of patellar ligament length (L) and longitudinal length of the patella (P) were 15.87 ±1.14mm and 27.26 ±1.93mm, respectively, and the length ratio between the patellar tendon and the patella (L:P) was 0.59 ±0.06, measured on the mediolateral radiographs. Length of the patella in the coronal plane was 2.93 ±0.17cm, and in the sagittal plane ranged from 2.78 ±0.30cm to 2.89 ±0,20cm using CT measurements. Average values for the femoral head and neck anteversion angles measured by CT were from 28.56 ±5.56º to 32.91 ±2.62º. The bone structure of the pacas has similarity to the guinea pigs, but two lunulae and one lateral fabela were observed. The data obtained may be used to future studies comparing the pacas to other rodent species or mammals. / Mestre

Orientador: Lucia Helena O'Dwyer de Oliveira / Resumo: Espécies do gênero Hepatozoon incluem um grupo diverso de parasitas com mais de 340 espécies descritas em anfíbios, répteis, aves e mamíferos. A hepatozoonose canina é uma hemoparasitose transmitida por carrapatos relatada em diversas regiões do mundo e pode estar relacionada às espécies Hepatozoon canis e Hepatozoon americanum. Em nosso país, diferentes estudos demonstraram que H. canis é a espécie envolvida na infecção dos cães e os relatos são comuns, principalmente, em áreas rurais. Trabalhos previamente conduzidos mostram que o vetor de H. canis em áreas rurais do Brasil permanece desconhecido, o que pode sugerir a existência de outros mecanismos de transmissão, como a predação de hospedeiros paratênicos. Assim, este trabalho teve como objetivo investigar a presença de Hepatozoon spp. em pequenos roedores silvestres capturados em fragmentos florestais nos arredores de propriedades rurais do município de Botucatu, São Paulo, Brasil, onde o parasita foi também estudado em cães domésticos. Foram analisadas 158 amostras sanguíneas de cães, pela reação em cadeia da polimerase (PCR) e pela técnica de extensão de sangue periférico. Amostras de sangue e tecidos de 67 roedores foram coletadas para pesquisa do parasita pela técnica de extensão sanguínea, histopatologia e também por diagnóstico molecular. Os resultados do presente estudo mostraram uma prevalência elevada de H. canis em cães de áreas rurais do município de Botucatu (66,45%). Além disso, as espécies de roedores silve... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Hepatozoon spp. belong to a diverse group of parasites with more than 340 species described in amphibians, reptiles, birds and mammals. Canine hepatozoonosis is a tick-borne disease reported throughout the world and can be related to Hepatozoon canis and Hepatozoon americanum. In our country, previously studies have shown that H. canis is the species involved in the infection of dogs and reports are common, especially in rural areas. Hepatozoon canis vectors in rural areas of Brazil remain unknown, which might suggest the existence of other transmission mechanisms, such as predation of paratenic hosts. Thus, this study aimed to investigate the presence of Hepatozoon spp. in wild rodents trapped in forest fragments surrounding rural areas of Botucatu, São Paulo, Brazil, where the prevalence of the parasite was also studied in domestic dogs. In dogs, the study was conducted in 158 blood samples using polymerase chain reaction (PCR) and peripheral blood extension technique. Blood samples and tissues from 67 rodents were collected for parasite blood extension technique, histopathology and for molecular diagnosis. The results showed a high prevalence of H. canis in dogs from rural areas of Botucatu (66.45%). In addition, species of Brazilian wild rodents are infected with Hepatozoon spp., other than H. canis. Additionally, the finding of monozoics cysts in the examined rodents may indicate that, in addition to intermediate hosts, small wild rodents may also act as paratenic hosts ... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro / As florestas tropicais brasileiras (Amazônia e a Mata Atlântica) possuem alta diversidade de espécies e atualmente estão separadas por um cinturão de vegetação aberta. Parte deste cinturão é ocupada pela Caatinga, onde se encontram os Brejos de Altitude, testemunhos das conexões históricas entre a Mata Atlântica e a Amazônia. O Centro de Endemismos Pernambuco (CEPE) é a unidade biogeográfica que compõe a Mata Atlântica ao norte do rio São Francisco e contém diversos táxons endêmicos. Esta região apresenta uma mastofauna compartilhada com a Amazônia, devido às conexões existentes durante o Cenozóico. A presença do rio São Francisco em seu limite sul pode atuar como barreira ao fluxo gênico e explicar os endemismos encontrados no CEPE. Contrastando com sua situação peculiar, a mastofauna do CEPE ainda carece de estudos aprofundados sobre a identificação de suas espécies, padrões geográficos e relações filogenéticas. Revisões recentes têm identificado espécies diferentes ao norte e ao sul do rio São Francisco, mas poucos trabalhos têm proposto hipóteses biogeográficas para o CEPE. Para ampliar o conhecimento sobre a identidade e distribuição geográfica dos pequenos mamíferos do CEPE e sua estrutura filogeográfica, foram realizados levantamentos de espécies e análises de diversidade genética e morfométrica para algumas espécies. Os levantamentos consistiram de visitas às coleções científicas a fim de identificar as espécies ocorrentes no CEPE e excursões de coleta com 5 a 17 noites consecutivas em 12 localidades ao longo do CEPE, que totalizaram 64691 armadilhas noites e resultaram na coleta de 476 exemplares de 31 espécies. As espécies foram identificadas com base na morfologia externa e craniana e por análises citogenéticas. Para investigar a biogeografia do CEPE, análises de genética de populações, filogeográficas e morfométricas foram realizadas para os marsupiais Caluromys philander, Didelphis aurita, Marmosa murina, Metachirus nudicaudatus e os roedores Akodon cursor, Oecomys catherinae e Rhipidomys mastacalis para avaliar a existência de diferenciação nas populações do CEPE e suas relações com as linhagens Amazônicas e Atlânticas. Estes resultados mostraram que a diversificação dos pequenos mamíferos do CEPE ocorreu tanto no Terciário quanto no Quaternário. Algumas populações, como em Caluromys philander e Oecomys catherinae, mostraram afinidades com linhagens amazônicas, enquanto outras, como em Metachirus nudicaudatus e Rhipidomys mastacalis, apresentaram afinidades com linhagens atlânticas. Os pequenos mamíferos do CEPE apresentaram diferenciação em relação às suas linhagens irmãs, com algumas linhagens podendo tratar-se de espécies ainda não descritas (e.g. Didelphis aff. aurita e Rhipidomys aff. mastacalis). Esta diferenciação provavelmente foi causada pelos eventos cíclicos de flutuações climáticas que provocaram elevações no nível do mar e retração das florestas tropicais, isolando as populações do CEPE. Por fim, para auxiliar na identificação das espécies em novas coletas, de suas distribuições geográficas e de suas características citogenéticas e ecológicas, foi elaborado um guia reunindo todas as informações disponíveis sobre as espécies de pequenos mamíferos do CEPE. / The Brazilian tropical rainforests (Amazon and Atlantic Forest) present high species diversity and are currently separated by a belt of open and dry vegetation. Part of this belt is occupied by the Caatinga, where are found the Brejos de Altitude, evidence of the historical connections between the Atlantic Forest and the Amazon. The Pernambuco Endemism Center (CEPE) is the biogeographic unit of the Atlantic Forest located north of the São Francisco River and contains several endemic taxa. Part of its mammal fauna is shared with the Amazon, due to former connections in the Cenozoic. The presence of the São Francisco river in its southern limit may act as a barrier to gene flow and explain the endemism found in CEPE. In contrast to their peculiar situation, the mammalian fauna from CEPE still lacks detailed studies on its taxonomic composition, geographic patterns and phylogenetic relationships. Recent reviews have identified different species in the north and south of the San Francisco river, but few studies have proposed biogeographical hypotheses for the CEPE. In order to increase knowledge on the identity and geographical distribution of the small mammals in the CEPE and their phylogeographic structure, species surveys were carried out and the genetic and morphometric diversity of some of the species found were assessed. The surveys consisted of visits to scientific collections to identify the species occurring in CEPE and trapping trips, with 5 to 17 consecutive nights, in 12 sites throughout the CEPE, totaling 64,691 trap-nights, resulting in the collection of 476 specimens of 31 species. The specimens were identified based on external and cranial morphology and cytogenetic analysis. To investigate the biogeography of CEPE, genetics, phylogeographic and morphometric analysis were performed with the marsupials Caluromys philander, Didelphis aurita, Marmosa murina, Metachirus nudicaudatus and the rodents Akodon cursor, Oecomys catherinae and Rhipidomys mastacalis to assess the existence of differentiation in CEPE populations and their relationships with the Amazon and Atlantic Forest lineages. These results showed that diversification of small mammals in CEPE occurred in both the Tertiary and Quaternary. Some populations, such as Caluromys philander and Oecomys catherinae showed affinities with amazonian lineages, while others, like Metachirus nudicaudatus and Rhipidomys mastacalis, showed affinities with atlantic lineages. The small mammals from CEPE showed differentiation from their sisters lineages, with some lineages probably being, in fact, undescribed species (eg Didelphis aff. aurita and Rhipidomys aff. mastacalis). This differentiation was probably caused by cyclical events of climate fluctuations that led to sea level rises and retractions of the tropical forests, thus isolating the populations in CEPE. Finally, to help identifying species in future field surveys, their geographic distributions and ecological and cytogenetic features, a guide was prepared by gathering all available information on the species of small mammals from CEPE.