ITC/USA 2013 Conference Proceedings / The Forty-Ninth Annual International Telemetering Conference and Technical Exhibition / October 21-24, 2013 / Bally's Hotel & Convention Center, Las Vegas, NV / The CNES (French Space Agency) has studied memoryless predistortion techniques for power amplifier nonlinearity of satellite payload telemetry. These techniques are applied to high order modulations taken from the DVB-S2 standard and the associated CCSDS blue book. An easy-to-implement calibration method was also developed. The predistortion was implemented at two times the symbol rate after Square Root Raised Cosine shaping on a breadboard model of a 16APSK modulator associated to a Solid State Power Amplifier. It allows to reduce the amplifier back-off and thus to increase the power added efficiency for an equivalent signal quality.

This dissertation aimed to explore the S2 region with an attempt to modulate its elasticity in order to tune the contraction output. Two peptides, the stabilizer and destabilizer, showed high potential in modifying the S2 region at the cellular level, thus they were prepared for animal model testing. In this research, (i) S2 elasticity was studied, and the stabilizer and destabilizer peptides were built to tune contraction output through modulating S2 flexibility; (ii) the peptides were attached to heart homing adducts and the bond between them was confirmed; and (iii) it was shown that minor changes were imposed on the modulating peptides' functionality upon attaching to the heart homing adducts. S2 flexibility was confirmed through comparing it to other parts of myosin using simulated force spectroscopy. Modulatory peptides were built and computationally tested for their efficacy through interaction energy measurement, simulated force spectroscopy and molecular dynamics; these were attached to heart homing adducts for heart delivery. Interaction energy tests determined that tannic acid (TA) served well for this purpose. The stoichiometry of the bond between the TA and the modulating peptides was confirmed using mass spectroscopy. The functionality of the modulating peptides was shown to be unaltered through expansion microscopy where they located to the same position on the sarcomere with and without TA. They were also shown to cause the sarcomeres to contract similarly with and without the TA in contractility assay. Taken together, this work prepared the modulating peptides for animal model tests by attaching them to tannic acid.

No grupo das doenças infecciosas emergentes e reemergentes, os arbovírus transmitidos por mosquitos, são considerados importantes desafios para a saúde pública. O alastramento mundial do vírus Chikungunya (CHIKV, Togaviridae, Alphavirus), acabou resultando na introdução do CHIKV no Brasil, através da transmissão zoonótica por mosquitos do gênero Aedes spp, particularmente Ae. aegypti e Ae. albopictus, duas espécies invasoras e cosmopolitas. Outro Alphavirus, o vírus Mayaro (MAYV) presente na região amazônica da América do Sul, vem apresentando indícios de uma real urbanização, elevando a preocupação sobre sua possível transmissão por mosquitos urbanos. Diante desse cenário, fica clara a necessidade da realização de estudos sobre estratégias de controle e prevenção da infecção por MAYV e CHIKV, uma vez que não há vacinas ou terapia antiviral específica para a infecção por esses arbovírus. Este projeto descreve pela primeira vez a eficiente expressão, purificação e análise de partículas semelhantes a vírus (VLP, virus-like particles) dos Alphavirus CHIKV e MAYV em células de inseto S2 (Drosophila melanogaster). Para esse fim, clonamos os genes das proteínas estruturais dos vírus MAYV e CHIKV em vetores para a expressão recombinante em células S2. Essa plataforma de expressão de proteínas provou ser adequada para o processamento de glicoproteínas do CHIKV e MAYV para produção de VLP, uma vez que detectamos a presença de partículas no sobrenadante do cultivo por Western blotting e Microscopia eletrônica de transmissão (TEM). Ainda, foi possível selecionar células para uma maior produção de VLP e estabelecer um método de purificação das partículas. / In the group of emerging and reemerging infectious diseases, mosquito-borne arboviruses are considered major public health challenges. The transmission of Chikungunya (CHIKV, Togaviridae, Alphavirus) in America continent was first reported in Central America and Caribbean region The CHIKV epidemics reached Brazil through zoonotic transmission by Aedes spp mosquitoes, particularly Ae. Aegypti and Ae. albopictus, two invasive and cosmopolitan species. Another Alphavirus, the Mayaro virus (MAYV) present mainly in the Amazon region has been showing evidence of a real urbanization, increasing concerns about its transmission by urban mosquitoes. Therefore, it is clear that studies on strategies for the control and prevention of MAYV and CHIKV infection are needed. Currently no vaccines or antiviral therapy specific for CHIKV and MAYV infection are available. This work describes for the first time an efficient expression, purification and analysis of virus-like particles (VLP) of CHIKV and MAYV Alphaviruses in S2 (Drosophila melanogaster) insect cells. The genes coding for the structural proteins of the MAYV and CHIKV viruses were cloned into vectors for recombinant expression in S2 cells. This platform proved to be suitable for the processing of CHIKV and MAYV glycoproteins and to produce VLP, since we detected the presence of particles in the culture supernatant by Western blotting and Transmission Electron Microscopy (TEM). Furthermore, it was possible to select cells for greater production of VLP and to establish a method for particle purification.

O vírus Mayaro (MAYV) é um Alphavirus artritogênico responsável por causar uma doença febril aguda com sintomas parecidos aos de Dengue não-hemorrágica, porém com o agravante, como a febre Chikungunya, de ocorrência de artralgia. Os dados epidemiológicos disponíveis ainda são poucos devido à falta de diagnóstico adequado, pois algumas das técnicas desenvolvidas apresentam dificuldades quanto à coleta de amostra, devido à curta viremia, e ao background que interfere na interpretação dos resultados, subestimando o real número dos casos de infecção. Isso é preocupante principalmente em tempos de co-circulação de outras arboviroses como Dengue, Zika e Chikungunya. Neste trabalho desenvolvemos um método de imunofluorescência indireta dirigido à detecção de anticorpos contra a glicoproteína E2 do vírus Mayaro expressa em células S2 de Drosophila melanogaster. / Mayaro virus (MAYV) is an arthritogenic Alphavirus responsible for causing an acute febrile illness with symptoms similar to non-hemorrhagic Dengue, but with the aggravation, as Chikungunya fever, to develop arthralgia. The epidemiological data available still are few due to lack of proper diagnosis, because some of the techniques developed present difficulties regarding sample collection, due to the short viremia, and background that interferes with the interpretation of the results, underestimating the actual number of cases. This is a concern especially in periods of co-circulation of many other socioeconomic impact arboviruses, such as Dengue, Zika and Chikungunya. In this work we developed an indirect immunofluorescence method to the detection of antibodies against Mayaro E2 glycoprotein expressed in Drosophila melanogaster S2 cells.

Com o avanço tecnológico surgem novas ferramentas que auxiliam os médicos no diagnóstico de diversas doenças. Na área cardiovascular, após permanecer por um longo período em segundo plano, a ausculta cardíaca voltou a ser muito utilizada devido ao surgimento, no mercado, de estetoscópios digitais. Tais aparelhos contam com novos recursos tecnológicos que permitem a captação e a análise de dados de forma automática, oferecendo mais informações ao profissional da área. Levando em conta essa nova ascensão da área de Fonocardiografia,o presente trabalho se dedicou à separação das bulhas S1 e S2 por meio de ferramentas computacionais, com o propósito de auxiliar médicos não especialistas em Cardiologia a verificar a existência de possíveis anormalidades no som cardíaco. Acreditando na possibilidade de este procedimento vir a ser utilizado posteriormente para auxiliar no reconhecimento de padrões dos sons cardíacos, este trabalho se propôs a criar um algoritmo para detecção automática de anormalidades que afetam as bulhas S1 e S2. Assim, aplicou-se a técnica de Wavelet sobre uma base de dados de sons cardíacos constituída de 1209 bulhas, auditada pelo Real Hospital Português e também pelo Instituto Dante Pazzanese de Cardiologia. Os melhores resultados obtidos na separação das bulhas foram, nos sons normais, de 96,96% de acurácia para a S1 e de 97,92% para a S2. Já nos sons cardíacos com sopro, obteve-se a acurácia de 87,46% para a separação da S1 e de 89,26% para a S2. Juntos, os resultados dos sons normais e dos sons com sopro totalizaram uma acurácia de 94,02% para a separação da S1 e de 94,54% para a S2. / New technological tools are often created in the medical field to assist doctors in the clinical diagnosis of many diseases. After being forgotten for many years in the cardiovascular area, cardiac auscultation is now back in the spotlight, as soon as digital stethoscope became available in the market. New digital stethoscope records patient\'s heart sounds, which can be automatically analyzed or also sent to another device for further more detailed investigation. This feature helps physicians in the study of auscultation results. Taking into account the new rise of cardiac auscultation, the present paper attempted to provide the separation of S1 and S2 heart sounds by computer tools, in order to support non-specialist physicians in finding heart sound abnormalities. Heart sound separation can thus be employed for the creation of pattern recognition algorithms, which are able to identify abnormalities automatically. This paper proposed the development of a S1 and S2 heart sound separation algorithm by using Wavelet technique, who was applied upon a database containing 1209 individual heart sounds. The referred database was audited by Royal Portuguese Hospital and Dante Pazzanese Institute of Cardiology medical staff. The best obtained results for S1 and S2 separation in regular heart sounds were a 96.96% accuracy rate for S1 and a 97.92% accuracy rate for S2. In murmur heart sounds were obtained an 87.46% accuracy rate for S1 and an 89.26% accuracy rate for S2. Overall results achieved a 94.02% accuracy rate for S1 and a 94.54% accuracy rate for S2.

AVELA, Adriano Silva. O número médio de representações de um inteiro positivo como soma dos quadrados de dois inteiros. 2017. 46 f. Dissertação (Mestrado Profissional em Matemática em Rede Nacional) - Centro de Ciências, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2017. / Submitted by Jessyca Silva (jessyca@mat.ufc.br) on 2017-08-16T14:27:56Z No. of bitstreams: 1 2017_dis_asavela.pdf: 787094 bytes, checksum: 1b45101b32e7b3738ea38b152f128087 (MD5) / Rejected by Rocilda Sales (rocilda@ufc.br), reason: Boa tarde, Conferi a Dissertação de ADRIANO SILVA AVELA e detectei alguns erros que devem ser corrigidos pelo próprio autor. Os mesmos seguem listados abaixo: 1- CAPA (altere o termo MESTRADO PROFISIONAL EM MATEMÁTICA EM REDE NACIONAL para PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM MATEMÁTICA EM REDE NACIONAL) 2- FICHA CATALOGRÁFICA (está faltando a ficha catalográfica do trabalho, a mesma poderá ser elaborada sistema CATALOG, no endereço eletrônico: - http://fichacatalografica.ufc.br/ - e deve ser inserida antes da folha de aprovação) 3- FOLHA DE APROVAÇÃO (a folha de aprovação do trabalho está com formatação inadequada a mesma deve ocupar apenas uma página. O modelo encontra-se disponível no GUIA DE NORMALIZAÇÃO DE TRABALHOS ACADÊMICOS DA UFC, disponível no endereço eletrônico: http://www.biblioteca.ufc.br/images/arquivos/documentos_tecnicos/guia_normalizacao_trabalhos_ufc_2013.pdf 4- DEDICATÓRIA (veja o modelo de formatação da dedicatória no GUIA DE NOEMALIZAÇÃO DA UFC) 5- AGRADECIMENTOS (este item do trabalho não deve conter o nome do autor ao final dos agradecimentos, verifique o modelo no GUIA DE NORMALIZAÇÃO) 6- NUMERAÇÃO INADEQUADA DE PÁGINAS (verifique o trabalho e retire as numerações desordenada das primeiras páginas do trabalho. O número das páginas só deve aparecer a partir da INTRODUÇÃO) 7- EPÍGRAFE (a frase que compõe este elemento do trabalho deve conter a identificação do autor ao qual ela pertence. Mas ela é um elemento opcional, assim você poderá retirá-la sem nenhum prejuízo) 8- RESUMO/ABSTRACT (a formatação dos termos RESUMO e ABSTRACT está incorreta, esses dois termos devem estar em CAIXA ALTA, NEGRITO e FONTE n° 12) 9- PALAVRAS-CHAVE/KEYWORD (acrescente um ponto final no lugar das vírgulas que separam as Palavras e as Keywords) 10 – LISTA DE FIGURAS/LISTA DE TABELAS (Veja o modelo adequado para esses dois itens no GUIA DE NORMALIZAÇÃO) 11 - SUMÁRIO (verifique no GUIA DE NORMALIZAÇÃO o modelo adequado para a elaboração do sumário. Ressalto que o item INTRODUÇÃO é um capítulo e deve constar no sumário com a numeração de primeiro capítulo, Já os termos REFERÊNCIAS e APÊNDICE não devem apresentar numeração de capítulo, verifique no GUIA a formatação desses itens) 12 - TITULO DOS CAPÍTULOS (os títulos de capítulos e seções devem seguir a seguinte formatação: 1 TÍTULOS DE CAPÍTULOS (incluindo a Introdução, CAIXA ALTA, FONTE n° 12, NEGRITO, ALINHADO À ESQUERDA) 1.1 Títulos de seções (seção primária, CAIXA BAIXA, NEGRITO, FONTE N° 12, ALINHADO À ESQUERDA) *NO CASO DE DUVIDA CONSULTE O GUIA DE NORMALIZAÇÃO 13 - NUMERAÇÃO DE PÁGINAS (a número das páginas deve começar a aparecer a partir da folha de introdução, no CANTO SUPERIOR DIREITO) 14- CONCLUSÃO (a conclusão é um item obrigatório que deve constar na dissertação, o GUIA DE NORMALIZAÇÃO DA UFC menciona que “A conclusão deve ser decorrência natural do que foi exposto no desenvolvimento. Assim, em qualquer tipo de trabalho, deve resultar de deduções lógicas sempre fundamentadas no que foi apresentado e discutido anteriormente. Visa a recapitular sinteticamente os resultados da pesquisa.” 15 – REFERÊNCIAS/APÊNDICE (verifique no GUIA DE NORMALIZAÃO a formatação adequada para os títulos da REFERÊNCIAS e APÊNCE) on 2017-08-16T16:56:52Z (GMT) / Submitted by Jessyca Silva (jessyca@mat.ufc.br) on 2017-08-21T13:41:34Z No. of bitstreams: 1 2017_dis_asavela.pdf: 834141 bytes, checksum: 7d55f68b04bdc455d1c717f7a76571de (MD5) / Rejected by Rocilda Sales (rocilda@ufc.br), reason: Boa tarde, Ainda há alguns erros na Dissertação de ADRIANO SILVA AVELA que devem ser corrigidos. Eu envie uma cópia desse email para ele, pois contem o anexo com a ficha catalográfica, que não tem como ser enviado aqui pelo repositório. 1- FICHA CATALÓGRAFICA (havia alguns erros na ficha catalográfica, por isso enviamos em anexo a nova ficha para ser inserida no trabalho) 2- RESUMO E ABSTRACT (Retire o recuo do parágrafo na primeira linha do resumo e do abstract. A letra inicial das duas palavras chaves e das Keywords deve ser maiúscula) 3- NUMERAÇÃO DAS PÁGINAS ( o modelo da numeração está coreto, apenas comece com o número 9 na página da INTRODUÇÃO) 4- SUMÁRIO (segue abaixo o modelo do sumário com a formatação adequada, apenas deve ser inserida a numeração das páginas e a linha pontilhada) 1 INTRODUÇÃO 2 ARITMÉTICA DO RESTOS 2.1 A relação de congruência 2.2 Congruências lineares 2.3 Resíduos quadráticos 3 NÚMEROS PRIMOS E SOMAS DE QUADRADOS 4 FUNÇÃO˜ s2 E FUNÇÃO˜ s3 4.1 Função s2 4.2 Função s3 5 SOMA DE DOIS QUADRADOS 6 SOMA DE TRES QUADRADOS 7 CONCLUSÃO REFERÊNCIAS APÊNDICE A - TABELAS DE VALORES APÊNDICE B - RESULTADOS COMPLEMENTARES APÊNDICE C - TEOREMA DOS QUATRO QUADRADOS on 2017-08-21T17:16:15Z (GMT) / Submitted by Jessyca Silva (jessyca@mat.ufc.br) on 2017-08-22T15:34:15Z No. of bitstreams: 1 2017_dis_asavela.pdf: 833511 bytes, checksum: 0e2b00b8533fc647e6c76928c5de4671 (MD5) / Approved for entry into archive by Rocilda Sales (rocilda@ufc.br) on 2017-08-23T11:09:25Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2017_dis_asavela.pdf: 833511 bytes, checksum: 0e2b00b8533fc647e6c76928c5de4671 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-23T11:09:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017_dis_asavela.pdf: 833511 bytes, checksum: 0e2b00b8533fc647e6c76928c5de4671 (MD5) Previous issue date: 2017-07 / This paper aims to address two themes: the representation of positive integers as sum of squares and the average number of representations of a positive integer as the sum of two squares. About the first theme, we will prove several results to understand under what conditions a positive integer has a representation as a sum of two, three or four squares. About the second theme, we will prove that the mean number of representations of a positive integer as the sum of the squares of two integers is . To do so, we will introduce the function s 2 which associates an integer n with the cardinality of the set X n = {( a, b ) ∈ Z 2 ; a 2 + b 2 = n } and we will calculate the limit of its average value. Finally, as an analogy to the result regarding the mean value of s 2 , we will define the function s 3 , that associates a positive integer n with the cardinality of the set Y n = {( a, b, c ) ∈ Z 3 ; a 2 + b 2 + c 2 = n } and we will prove that there is no mean number of representations of a positive integer as the sum of the squares of three integers. / Este trabalho tem como objetivo abordar dois temas: a representação de inteiros positivos como soma de quadrados e o número médio de representações de um inteiro positivo como soma de dois quadrados. Sobre o primeiro tema, provaremos diversos resultados para entender em quais condições um inteiro positivo possui uma representação como soma de dois, três ou quatro quadrados. Sobre o segundo tema, provaremos que um inteiro positivo tem, em média,pi representações como soma dos quadrados de dois inteiros. Para tanto, introduziremos a função s2 (n), que associa um inteiro n com a cardinalidade do conjunto Xn = {(a, b) Z2 ; a2 + b2 = n} e calcularemos o limite do seu valor médio. Por fim, como analogia ao resultado a respeito do valor médio de s2, definiremos uma outra função s3 que associa um inteiro positivo n com a cardinalidade do conjunto Yn = {(a, b, c) Z3 ; a2 + b2 + c2 = n} e provaremos que não existe um número médio de representações de um inteiro positivo como soma dos quadrados de três inteiros.

Com o avanço tecnológico surgem novas ferramentas que auxiliam os médicos no diagnóstico de diversas doenças. Na área cardiovascular, após permanecer por um longo período em segundo plano, a ausculta cardíaca voltou a ser muito utilizada devido ao surgimento, no mercado, de estetoscópios digitais. Tais aparelhos contam com novos recursos tecnológicos que permitem a captação e a análise de dados de forma automática, oferecendo mais informações ao profissional da área. Levando em conta essa nova ascensão da área de Fonocardiografia,o presente trabalho se dedicou à separação das bulhas S1 e S2 por meio de ferramentas computacionais, com o propósito de auxiliar médicos não especialistas em Cardiologia a verificar a existência de possíveis anormalidades no som cardíaco. Acreditando na possibilidade de este procedimento vir a ser utilizado posteriormente para auxiliar no reconhecimento de padrões dos sons cardíacos, este trabalho se propôs a criar um algoritmo para detecção automática de anormalidades que afetam as bulhas S1 e S2. Assim, aplicou-se a técnica de Wavelet sobre uma base de dados de sons cardíacos constituída de 1209 bulhas, auditada pelo Real Hospital Português e também pelo Instituto Dante Pazzanese de Cardiologia. Os melhores resultados obtidos na separação das bulhas foram, nos sons normais, de 96,96% de acurácia para a S1 e de 97,92% para a S2. Já nos sons cardíacos com sopro, obteve-se a acurácia de 87,46% para a separação da S1 e de 89,26% para a S2. Juntos, os resultados dos sons normais e dos sons com sopro totalizaram uma acurácia de 94,02% para a separação da S1 e de 94,54% para a S2. / New technological tools are often created in the medical field to assist doctors in the clinical diagnosis of many diseases. After being forgotten for many years in the cardiovascular area, cardiac auscultation is now back in the spotlight, as soon as digital stethoscope became available in the market. New digital stethoscope records patient\'s heart sounds, which can be automatically analyzed or also sent to another device for further more detailed investigation. This feature helps physicians in the study of auscultation results. Taking into account the new rise of cardiac auscultation, the present paper attempted to provide the separation of S1 and S2 heart sounds by computer tools, in order to support non-specialist physicians in finding heart sound abnormalities. Heart sound separation can thus be employed for the creation of pattern recognition algorithms, which are able to identify abnormalities automatically. This paper proposed the development of a S1 and S2 heart sound separation algorithm by using Wavelet technique, who was applied upon a database containing 1209 individual heart sounds. The referred database was audited by Royal Portuguese Hospital and Dante Pazzanese Institute of Cardiology medical staff. The best obtained results for S1 and S2 separation in regular heart sounds were a 96.96% accuracy rate for S1 and a 97.92% accuracy rate for S2. In murmur heart sounds were obtained an 87.46% accuracy rate for S1 and an 89.26% accuracy rate for S2. Overall results achieved a 94.02% accuracy rate for S1 and a 94.54% accuracy rate for S2.

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / In this work we presented the idea to perform excision assays using the piggyBac transposable element as enzyme supplier and the inverted terminal sequences of the element, both necessary for mobilization of a transposable element. Drosophila S2 cells were electroporated to perform insertion of two different plasmids in the cytoplasm of cells, a plasmid carrying the terminal inverted repeats of piggyBac element flanking a GFP gene and other with the transposase coding sequence enzyme which recognizes the terminal inverted repeats, excise of the region where the element is and insert it into another locus. This is a vector-helper system, in which a fragment is excised from a plasmid with the help of the transposase located in the other. Conventional PCR was used to verify excision events showing a 200bp amplification region where the fragment was excised and a region 3kb amplification reagion at times when the fragment was full, ie, it has not mobilized. The qPCR technique was used to quantify the excision of this fragment, carrying out comparisons of the amount of plasmid DNA recovered from the S2 cells after the end of experiment with serial dilutions of the original plasmids carrying the ITRs, which was used as standard. The results showed that the technique involving electroporation and qPCR is feasible and can be used to quantify mobilization of transposable elements. Paralleling with existing tools for this type of quantification, qPCR shows up as a very sensitive technique of detection mobilization, as well as a low cost technique budget. / Neste trabalho apresentamos a ideia de realizar ensaios de excisão utilizando o elemento transponível piggyBac como fornecedor da enzima e das sequências terminais invertidas do elemento, ambos necessários para mobilização. Células S2 de Drosophila melanogaster foram eletroporadas para que houvesse inserção de dois diferentes plasmídeos no citoplasma das células, um plasmídeo portando as repetições terminais invertidas do elemento piggyBac flanqueando um gene GFP e o outro com a sequência codificadora da enzima transposase, a qual reconhece as repetições terminais invertidas e excisa o elemento da região onde está inserido, num sistema vector-helper, em que um fragmento é excisado de um plasmídeo com ajuda da transposase localizada no outro. PCR convencional foi usado para verificar os eventos de excisão, mostrando uma região de amplificação de 200pb nos casos de excisão do fragmento e uma região amplicada de 3kb, nas ocasiões em que o fragmento ficou inteiro, ou seja, não foi mobilizado. A qPCR foi utilizada para quantificar a excisão desse fragmento, realizando comparações da quantidade de DNA plasmidial recuperado das células S2 após o término do experimento com diluições em série do plasmídeo com as ITRs, que foi utilizado como standard. Os resultados mostraram que a técnica envolvendo eletroporação e qPCR é exequível e pode ser utilizada para quantificar mobilização de elementos transponíveis. Fazendo um paralelo com as ferramentas já existentes para esse tipo de quantificação, qPCR mostra-se como uma técnica bastante sensível de detecção de mobilização, bem como uma técnica de baixo custo orçamentário.

Mad1 est une protéine clé du point de contrôle du fuseau en mitose. Associée à Mad2,elle est recrutée aux kinétochores non-attachés où elle y catalyse la production du complexe inhibiteur d’anaphase. La protéine Mad1 a longtemps été décrite comme étant un simple récepteur de Mad2 aux kinétochores. Certaines études laissaient toutefois entrevoir des rôles additionnels de cette protéine en mitose comme en interphase.Afin d’explorer ces fonctions additionnelles de Mad1, j’ai étudié le phénotype mitotique associé à une déplétion de la protéine par ARN interférence dans des lignées cellulaires S2 de drosophile. J’ai également analysé des mutations et délétions du domaine N-terminal de Mad1, celui-ci présentant certaines particularités de structures primaires et secondaires tels que des sites de phosphorylation, un putatif NLS et des hélices amphipathiques. J’ai ainsi montré que le recrutement de Mad1 aux kinétochores en mitose nécessitait la phosphorylation de son domaine N-terminal. Mes analyses cytologiques ont de plus permis de déterminer que le NLS, situé dans ce même domaine N-terminal, est non seulement fonctionnel mais également essentiel à la localisation de Mad1 à l’enveloppe nucléaire et dans le nucléoplasme en interphase.J’ai finalement étudié une protéine Mad1 déplétée de son domaine N-terminal (Mad1Δ71) en spermatocytes de drosophile. Notre laboratoire a récemment montré que dans ces cellules, la protéine Mad1 fait partie d’un territoire nucléaire associé à la chromatine, appelé MINT (Mad1 containing Intranuclear Territory). Ce nouveau territoire, comportant au moins quatre autres protéines (Mad2, Mtor/Tpr, Ulp1 et Raf2), est impliqué dans la régulation de la conformation de la chromatine. Mes analyses ont révélé que la protéine Mad1 Δ71 se localisait anormalement dans le noyau, restant accolée à l’enveloppe nucléaire, et entraînait avec elle l’ensemble de ses partenaires. Ceci suggère que Mad1 est essentielle à l’organisation de ces protéines dans le nucléoplasme, mais également qu’elle pilote la mise en place du territoire MINT. / Mad1 is a key component of the spindle assembly checkpoint in mitosis. Recruitedwith Mad2 to unattached kinetochores, they catalyze the formation of the anaphase inhibitor.Mad1 has long been described as a simple receptor for Mad2 at kinetochores. However,studies are pointing toward additional roles of this protein in mitosis as well as in interphase. To explore these additional functions of Mad1, I studied the mitotic phenotypeassociated with a depletion of the protein by RNA interference in Drosophia S2 cell lines. Ialso analyzed mutations and deletions of the N-terminal domain of Mad1, this one havinginteresting features in its primary and secondary structures, namely phosphorylation sites, aputative NLS and amphipathic helices. I have shown that Mad1 recruitment to kinetochore inmitosis depends on phosphorylations of its N-terminal domain. Moreover, my cytologicalanalyses allowed me to determine that the N-terminal NLS was not only functional but alsoessential for the localization of Mad1 into the nucleus in interphase. Finally, I studied a Mad1 mutant depleted for its N-terminal region (Mad1 Δ71) indrosophila spermatocytes. Our laboratory recently showed that in these cells, Mad1 is part ofa nuclear territory associated with chromatin, named MINT (Mad1 containg IntranuclearTerritory). This new territory, composed of at least four other proteins (Mad2, Mtor/Tpr,Ulp1, Raf2), is involved in chromatin conformation regulation. My studies revealed that inthese cells, Mad1 Δ71 is abnormally localized in the nucleus, staying closed to the nuclearenvelope, and carry with it all its partners. This suggests that Mad1 is essential for the nuclearorganization of these proteins, but also that it pilots the establishment of the MINT territory.

Intertidal cohesive sediment systems are found throughout the world in areas of low hydrodynamic energy. These systems are ecologically and economically important but are under pressure from global warming, sea level rise and other anthropogenic influences. To protect and conserve these systems it is important to understand the sediment dynamics, especially the erosional properties of the sediment. The study of sediment erosion and transport is complex, encompassing biological, chemical and physical properties of the ecosystem. This thesis contributes towards this area of research, firstly in regard to the methods used to measure sediment erosion on exposed and submerged sediments and secondly with respect to assessing influences upon sediment stability through changes in the ecosystem, comprising of both the sediment environment and the macrofaunal community. Chapter 3: In partnership with Sediment Service a thorough re-evaluation of the Cohesive Strength Meter (CSM), a commercially available device used to measure surface sediment strength, was performed. New components, deployment method and calibration protocol were devised and tested. The new design was not effective, but the deployment and calibration have improved the ease of use and interpretation CSM data. Chapter 4: The study of intertidal sediment stability was conducted during the submerged period of the tidal cycle. Protocols and methods were devised or modified to sample submerged sediments with the aim to determine how sediment properties are affected by submersion and the resulting effect on sediment stability. Sediment stability increased with submersion. The existence of a fine layer of sediment on the surface, similar to the fluff layer found in submerged sediments, is given as a suggested explanation as it may be removed by the incoming tide. However, no other changes in sediment properties were detected. This may be due to flaws in the methods used in detecting fine scale changes in the sediment surface. In situ and laboratory experiments revealed contrasting effects of submersion on sediment stability with disturbance from the sampling and movement of sediment from the field to the laboratory given as an explanation for this. Chapter 5: The influence of the ecosystem engineering polychaete Arenicola marina on sediment properties was examined with an exclusion experiment. A. marina was excluded from five 20m² plots on an intertidal mudflat on the German island of Sylt. A holistic approach was used to measure the ecosystem, including a range of biotic and abiotic sediment properties as well as the macrofauna community. It was hypothesised that A. marina’s exclusion would alter the macrofaunal community and increase sediment stability. However, there was no consistent change in the macrofauna community or sediment environment with the exclusion of A. marina and subsequently no change in sediment stability. Chapter 6: The impact of bait digging for A. marina was examined with six 5m² plots dug up and A. marina removed, the plots were then monitored over a three month period. Bait digging disturbance was expected to have an impact upon the sediment environment and macrofauna community, resulting in a reduction in both sediment stability and microphytobenthic abundance. However, bait digging had minimal impact on the macrofauna community and caused no change in the sediment environment, despite the removal of a large proportion of the A. marina population. No change was recorded in the sediment stability or biomass of the microphytobenthos, indicating that with the exception of removing A. marina, bait digging of this nature was not detrimental to the sediment ecosystem. However, the consequences of larger, longer term digging operations can not be determined from this work and further studies are suggested. The study of intertidal sediment stability was progressed with advances made in methods and protocols. The work highlighted the importance of studying sediment stability as an ecosystem function through a holistic ecosystem approach rather than isolating individual variables.