This thesis is devoted to first-principles simulations of bio- and nano-materials,focusing on various soft x-ray spectra, ground-state energies and structures of isolated largemolecules, bulk materials, and small molecules in ambient solutions. K-edge near-edge x-ray absorption fine structure (NEXAFS) spectra, x-ray emission spectra, andresonant inelastic x-ray scattering spectra of DNA duplexes have been studied by means oftheoretical calculations at the density functional theory level. By comparing a sequence of DNAduplexes with increasing length, we have found that the stacking effect of base pairs has verysmall influence on all kinds of spectra, and suggested that the spectra of a general DNA can bewell reproduced by linear combinations of composed base pairs weighted by their ratio. The NEXAFS spectra study has been extended to other realistic systems. We have used cluster modelswith increasing sizes to represent the infinite crystals of nucleobases and nucleosides, infinitegraphene sheet, as well as a short peptide in water solution. And the equivalent core holeapproximation has been extensively adopted, which provides an efficient access to these largesystems. We have investigated the influence of external perturbations on the nitrogen NEXAFSspectra of guanine, cytosine, and guanosine crystals, and clarified early discrepancies betweenexperimental and calculated spectra. The effects of size, stacking, edge, and defects to theabsorption spectra of graphene have been systematically analyzed, and the debate on theinterpretation of the new feature has been resolved. We have illustrated the influence of watersolvent to a blocked alanine molecule by using the snapshots generated from molecular dynamics. Multi-scale computational study on four short peptides in a self-assembled cage is presented. It isshown that the conformation of a peptide within the cage does not corresponds to its lowest-energyconformation in vacuum, due to the Zn-O bond formed between the peptide and the cage, and theconfinement effect of the cage. Special emphasis has been paid on a linear-scaling method, the generalized energy basedfragmentation energy (GEBF) approach. We have derived the GEBF energy equation at the Hartree-Focklevel with the Born approximation of the electrostatic potential. Numerical calculations for amodel system have explained the accuracy of the GEBF equation and provides a starting point forfurther refinements. We have also presented an automatic and efficient implementation of the GEBFapproach which is applicable for general large molecules. / QC 20110404

The Swedish Nuclear Fuel and Waste Management Company (SKB) has developed a method for final disposal of spent nuclear fuel. This technique requires accurate measurement of the residual decay heat of every assembly. For this purpose, depletion codes as well as calorimetric and gamma-ray spectroscopy experimental methods have been developed and evaluated. In this work a prototype analysis tool has been developed to automate the analysis of both calorimetric and gamma-ray spectroscopy measurements. The performance of the analysis tool has been investigated by comparing its output with earlier results and calculations. Parallel to the software development, new measurements on 73 BWR assemblies were performed. The results obtained for the determination of the residual decay heat are presented. Finally, suggestions for further development are outlined and discussed.

The spectroscopic determination of stellar properties is important for subsequent studies of exoplanet atmospheres. In this thesis, HARPS data for 6 exoplanet-hosting, late-type stars is processed to achieve an average signal-to-noise ratio of ~105. Together with line data, the SME tool is used to synthesize spectra and interpolate model photospheres with which chi-square minimization is performed. Fundamental parameters are derived to an overall precision of 191 K in effective temperature, 0.88 dex in surface gravity and 0.21 dex in metallicity. For 5 of the stars, the parameters are thereafter used to compute specific intensities across the stellar discs. Primary improvements could be made in regards to the stellar models, i.a. through the update of atomic properties and inclusion of magnetic fields. The numerical derivation can also be handled more carefully by excluding parameter-insensitive spectral regions. / Den spektroskopiska bestämningen av stjärnegenskaper är viktig för efterföljande studier av exoplaneters atmosfärer. I denna avhandling bearbetas HARPS-data från 6 stjärnor av sen typ som hyser exoplaneter för att uppnå en genomsnittlig signal-till-bruskvot på ~105. Tillsammans med linjedata, används SME-programvaran för att syntetisera spektra och interpolera modellfotosfärer med vilka chi-kvadratminimering genomförs. Fundamentala parametrar härleds till en medelprecision på 191 K i effektiv temperatur, 0.88 dex i ytgravitation och 0.21 dex i metallicitet. För 5 av stjärnorna används parametrarna till att därefter beräkna specifika intensiteter över stjärnornas projicerade ytor. Huvudsakliga förbättringar kan göras med avseende på stjärnmodellerna, bl.a. genom uppdatering av atomära egenskaper och inkludering av magnetiska fält. Den numeriska härledningen kan också hanteras med högre noggrannhet genom att avsiktligt exkludera parameterokänsliga spektralregioner.

Sustainability has gained a lot of attention in the field of research. Researchers and consumers both prioritize sustainability and environmental issues over previously dominant materials, such as plastic. Packaging and disposable items that used to be made of plastic have largely been replaced with paper. Unfortunately, paper does not perform as well as plastic regarding barrier properties against grease, oxygen, or water vapor. Barrier properties are an important factor when choosing packaging material for food, among other things, as they help maintain the shelf life of the product. In order to improve the properties of the paper packaging and expand its use, the paper is coated with a polymer. However, the polymer contributes to challenges in the recycling of the products as some of the polymer attaches to the fibers, causing difficulties in the separation of each material. Small fragments of plastic may end up in the material streams and the recycled pulp due to the existing challenges in completely removing plastic from cellulosic substrates during recycling. This thesis analyzes the possibilities of identifying and classifying plastic fragments of polyethylene (PE) and polyvinyl alcohol (PVOH) in recycled paper sheets using near-infrared spectroscopy together with multivariate data analysis. The purpose of the work is to develop models that can identify possible residues that may appear in recycled products from various industries. Paper sheets of two different grammages and six different compositions of recycled fiber and virgin fiber were created and scanned by NIR, with and without plastic film under the sheets. The scans were used to develop classification models to identify and categorize scans not included in the calibration data set. The performance of the models was tested by applying them to images of sheets of paper with plastic fragments of different sizes and different type underneath. The results indicated potential in the method. The prediction of the paper sheets with a lower grammage was mostly correct, whereas the classification of polyethylene showed the best performance. There was some noise in the prediction of the plastic fragments, regardless of the grammage of the paper. The noise may be due to a wide variation in the calibration data set since it consisted of paper sheets of six different compositions. A large part of the noise was incorrectly classified as polyvinyl alcohol, which can be due to differences in the manufacturing process of the plastic films. The conclusion of the thesis is that it is feasible to identify and categorize plastic fragments of polyethylene and polyvinyl alcohol in recycled paper sheets with a certain margin of error. It can be stated that the method shows promise, but further research and development in the field is required to build models that can be applied to a wider range of samples.

Aluminium och aluminiumlegeringar har ganska bra korrosionsbeständighet, men dessa material kan fortfarande korrodera. Metallkorrosion är aldrig önskvärt och det kan leda till katastrofala resultat i olika branscher och applikationer. Det finns olika metoder för att skydda aluminium och dess legeringar från korrosion, såsom anodisering och användning av olika beläggningstekniker. Inte mycket forskning har gjorts på aluminium belagd med en organisk beläggning innehållande ledande polymer. Ännu mindre är känt om aluminium belagt med en vattenbaserad polymer matris innehållande ledande polymer.  Tre system undersöktes i mitt examensarbete om deras korrosionsskyddande egenskaper. För detta ändamål användes elektrokemisk impedansspektroskopi, öppen kretspotential och potentiodynamisk polarisering, samt gjordes även en del atomkraftsmikroskopi, AFM, mätningar. Aluminium belagt med en vattenbaserad polymer matris i frånvaro av PANI hade ett bra korrosionsskydd först men reducerade barriäregenskaper över tiden i 1 M NaCl. Hållbarheten för den vattenbaserade polymer matrisen i frånvaro av PANI undersöktes också kort. Det visades att en nygjord vattenbaserad polymer matris uppvisade bättre korrosionsskydd än en 2 år gammal vattenbaserad polymer matris lagrad vid rumstemperatur.  Aluminium belagt med den vattenbaserade polymer matrisen i närvaro av PANI visade initialt tecken på aktivt korrosionsskydd men övergick till passivt korrosionsskydd med tiden. Atomkraftmikroskop användes i olika lägen för att få insikt om den vattenbaserade polymer matrisen i närvaro av PANI. Ett ledande nätverk observerades i AFM-mätningarna och konfokalt ljusmikroskop antydde verkligen att detta skulle vara fallet. Det ledande nätverket i den vattenbaserade polymer matrisen kan förklara det aktiva korrosionsskyddet som observerades initialt. Fler studier behövs för att få insikt om de kemiska processerna vid gränssnittet mellan aluminiumlegeringen och den vattenbaserade polymer matrisen i närvaro av PANI. / Aluminum and aluminum alloys have rather good corrosion resistance, but these materials can still corrode. Metal corrosion is never wanted, and it can lead to disastrous outcomes in various industries and applications. There are different methods to protects aluminum and its alloys from corrosion, such as anodization and the use of various coatings techniques. Not a lot of research have been done on aluminum coated with an organic coating containing conductive polymer. Even less is known about aluminum coated with a waterborne polymer matrix containing conductive polymer.  Three systems were investigated in my diploma thesis work regarding their anti-corrosion properties. To this end electrochemical impedance spectroscopy, open circuit potential and potentiodynamic polarization were utilized, and also some atomic force microscopy, AFM, measurements were done. Aluminum coated with a waterborne polymer matrix in the absence of PANI had a good corrosion protection at first but reduced barrier properties over time in 1 M NaCl. The shelf-life of the waterborne polymer matrix in the absence of PANI was also briefly investigated. It was shown that a freshly made waterborne polymer matrix exhibited better corrosion protection than a 2 years old waterborne polymer matrix stored at room temperature.  Aluminum coated with the waterborne polymer matrix in the presence of PANI showed signs of active corrosion protection initially, but it transitioned to passive corrosion protection with time. Atomic force microscopy was used in various modes to gain insight on the waterborne polymer matrix in the presence of PANI. A conducting network was observed in the AFM measurements and confocal light optical microscopy indeed suggested that this would be the case. The conducting network in the waterborne polymer matrix could explain the active corrosion protection observed initially. More studies are needed to gain insight on the chemical processes at the interface of the aluminum alloy and the waterborne polymer matrix in presence of PANI.

This study investigates the presence of water vapor plumes in the region south of Enceladus, a moon in the Saturnian system, through observations conducted by the James Webb Space Telescope. Enceladus is believed to harbor a subsurface ocean or localized water reservoir that gives rise to water geysers, expelling vapor into its tenuous atmosphere and outer space. On the 9th of November 2022, the James Webb Space Telescope made its first observations of the satellite using its Near-Infrared Spectrograph. The instrument's high sensitivity and spectral resolution offer the potential to measure these Enceladus' water vapor plumes, providing an opportunity to study this feature from a telescope located near Earth. However, it remains uncertain whether the obtained results are consistent with previous missions or if the instrument is even capable of conducting detailed examinations of the plumes. Hence, the primary objective of this research is to gain insights into the methodology of conducting scientific investigations of Enceladus and to understand the available data. More specifically, the aim is to verify the presence of the moon's water vapor plumes through a comprehensive analysis of the obtained data. The approach involves deriving spectral maps and extracting residual spectra that are used for comparisons with a reference spectrum entailing known water vapor emission features. The results reveal distinct emission peaks in the extracted spectra that closely resemble the features of water vapor. Additionally, the calculated column density of 6.25 - 8.25E+14 cm-2 over a region of 8.16E+07 km2 closely aligns with observations from the Herschel Space Observatory and Cassini mission. This outcome strongly supports the hypothesis that water vapor plumes are present in the area south of Enceladus, verifying the feasibility of using the James Webb Space Telescope for detecting and studying the characteristics of Enceladus' plumes. / Denna studie utforskar Enceladus' vattenplymer, en måne i Saturnussystemet, genom observationer utförda av James Webb Space Telescope. Det antas att Enceladus har en underjordisk ocean eller en lokaliserad vattenreservoar som ger upphov till vattengejsrar som sprutar ut ånga i dess tunna atmosfär och rymden. Den 9:e november 2022 genomförde James Webb-rymdteleskopet sina första observationer av satelliten med hjälp av sin nära-infraröda spektrograf. Instrumentets höga känslighet och spektrala upplösning erbjuder möjligheten att mäta Enceladus vattenplymer och därigenom möjliggöra studier av denna egenskap från ett teleskop beläget nära jorden. Det är emellertid fortfarande osäkert om de erhållna resultaten är förenliga med tidigare uppdrag eller om instrumentet ens är kapabelt att genomföra detaljerade undersökningar av plymer. Det primära syftet med denna forskning är att få insikt i metodologin för att utföra vetenskapliga undersökningar av Enceladus och att förstå den tillgängliga datan. Mer specifikt är målet att verifiera närvaron av vattenånga i månens plymer genom en omfattande analys av den insamlade datan. Metoden innefattar framställning av spektrala kartor och extrahering av restspektra. Därefter görs jämförelser mellan de extraherade spektrana och ett referensspektrum med kända emissionslinjer för vattenånga. Resultaten visar tydliga emissionspektrum i de extraherade spektrana som starkt liknar egenskaperna hos vattenånga. Dessutom stämmer den beräknade kolumn densiteten på 6.25 - 8.25E+14 cm-2 över ett område på 8,16E+07 km2 väl överens med observationer från Herschel Space Observatory och Cassini-uppdraget. Denna slutsats stöder starkt hypotesen att vattenånga finns i Enceladus' plymer och bekräftar möjligheten att använda James Webb Space Telescope för att detektera och studera egenskaperna hos Enceladus' plymer.

Litiumjonbatterier (LIB) är viktiga komponenter i dagens teknologi och används för att driva en mängd olika elektroniska system, allt från datorer och mobiltelefoner till bilar och flygplan. Eftersom efterfrågan på effektiv energilagring fortsätter att växa finns ett fortsatt behov för forskning och utveckling inom området. Denna rapport undersöker hårt kol, ett lovande material för anoder i litiumjonbatterier och andra alkali-jon batterier. I likhet med grafit är hårt kol ett kolbaserat material som inte är en väldefinierad allotropp utan en komplex blandning med avseende på både hybridiseringstillstånd och långdistansordning.  Därför är den mycket dåligt definierat. Ändå är hårt kol ett önskvärt material eftersom det kan produceras från förnybara resurser samt på grund av dess kompatibilitet med natrium, vilket möjliggör natriumjonbatterier. I den här studien har elektroder av hårt kol syntetiserats och litierats i olika grader och sedan studerats med 7Li NMR-spektroskopi där både spektra och longitudinella relaxationshastigheter mättes. Vid lägre litieringsnivåer observerades tydliga smala 7Li toppar inom intervallet 4-16 ppm, vilket indikerar förekomsten av joniskt litium. Vid högre litieringsnivåer framträdde en bred topp vid 61 ppm. Utseendet av denna topp, tillsammans med en hög Knight-skift, indikerar närvaron av kvasi-metalliskt litium. Det är värt att notera att detta kvasi-metalliska litium finns i de oordnade och porösa områdena hos hård kol. 7Li longitudinella relaxationshastigheter, som rapporterar om jonisk dynamik, registrerades vid olika temperaturer och från det observerade temperaturberoendet beräknades den genomsnittliga aktiveringsenergin för de involverade joniska rörelserna. Intressant nog visade sig denna aktiveringsenergi vara lägre jämfört med den i PAN-baserade kolfibrer och grafit, som båda uppvisar en högre grad av ordning. Denna observation tyder på ett samband mellan lokal oordning och snabbare jondynamik. / Lithium-ion batteries (LIB) are vital components of modern technology, powering a wide range of devices from computers and cell phones to cars and aeroplanes. As the demand for efficient energy storage continues to grow, research and development in the field of lithium-ion batteries remain active. This report focuses on the investigation of hard carbon, a promising anode material for lithium-ion batteries and other alkali-ion batteries. Akin to graphite, hard carbon is a carbon-based material that is not a well-defined allotrope but a complex mixture with regard to both hybridization state and long-range order. Hence it is very poorly defined. Yet, hard carbon is a desirable material as it can be produced from renewable resources and because of its compatibility with sodium, allowing for sodium-ion batteries. In this study, hard carbon electrodes were synthesised and lithiated to various degrees and then studied with 7Li NMR spectroscopy where both spectra and longitudinal relaxation rates were measured.   At lower lithiation levels, distinct narrow 7Li peaks were observed within the 4-16 ppm range, indicating the presence of ionic lithium. At higher lithiation levels a broad peak at 61 ppm emerged. The appearance of this peak, along with a high Knight shift, signifies the presence of quasi-metallic lithium, presumably in the more disordered and more porous regions of hard carbon. The 7Li longitudinal relaxation rates, reporting on ionic dynamics, were recorded at different temperature and from the observed temperature dependence the average activation energy for the involved ionic motions was calculated. Interestingly, this activation energy was found to be lower compared to that for PAN-based carbon fibres and graphite, both of which exhibit a higher degree of order. This observation suggests a correlation between local disorder and faster ion dynamics.

This report employs advanced Raman spectroscopy techniques to investigate the fundamental properties of 9-AGNRs comprehensively. It is divided into two main sections addressing distinct aspects of 9-AGNR behavior. In the first section, Polarization Raman spectroscopy (PRS) probes phonon mode symmetries in 9-AGNRs. Our analysis reveals deviations from predicted symmetries, suggesting the presence of lattice defects. We also investigate specific phonon modes (G, D, and RBLM), providing insights into lattice integrity. The second section employs temperature-dependent Raman spectroscopy to explore the thermal properties of 9-AGNRs. This dynamic analysis quantifies vibrational mode responsiveness to temperature variations using the Grüneisen parameter (χ). Comparisons across various carbon-based materials uncover distinct sensitivities and stabilities. This research advances our understanding of 9-AGNR properties, with implications for nanomaterial science and potential applications. / Denna rapport använder avancerade Raman spektroskopitekniker för att på ett omfattande sätt undersöka de grundläggande egenskaperna hos 9-AGNRs. Den är uppdelad i två huvudsektioner som tar upp distinkta aspekter av 9-AGNR beteende. I det första avsnittet sonderar Polarisation Raman spektroskopi (PRS) fononlägessymmetrier i 9-AGNRs. Vår analys avslöjar avvikelser från förutsagda symmetrier, vilket tyder på närvaron av gitterdefekter. Vi undersöker också specifika fononlägen (G, D och RBLM), vilket ger insikter om gitterintegritet. Den andra sektionen använder temperaturberoende Raman-spektroskopi för att utforska de termiska egenskaperna hos 9-AGNRs. Denna dynamiska analys kvantifierar vibrationslägets känslighet för temperaturvariationer med hjälp av Grüneisen-parametern (χ). Jämförelser mellan olika kolbaserade material avslöjar distinkta känsligheter och stabiliteter. Denna forskning främjar vår förståelse av 9-AGNR-egenskaper, med implikationer för nanomaterialvetenskap och potentiella tillämpningar.

Studien har genomförts på ett antal stålplåtar från olika kulturhistoriska byggnader. När kulturhistoriskt värdefulla byggnader ska renoveras måste detta göras med så god kunskap som möjligt om byggnadens olika delar och de värden dessa representerar. Det problem som studien har ämnat att lösa har varit en bristande kunskap om historiska stålplåtar. Studien har därför utförts för att bidra med kunskap som kan användas när gamla byggnader ska renoveras.För att uppnå syftet att bidra med kunskap som kan vägleda renovering av kulturhistoriska byggnader har studiens mål varit att undersöka hur de olika plåtarna tillverkats och vilka resultat de processerna har fått.Detta har genomförts genom att utföra en metallografi på samtliga prover för att undersöka deras mikrostrukturer och få en förståelse för materialen. Även en kemisk analys av materialens innehåll har gjorts genom en optisk emissions spektroskopi.De resultat som hämtades från plåtarna visade hur stor skillnad det var mellan olika tillverkningsmetoder och deras konsekvenser. Genom att ha sett den mångfald av egenskaper som fanns bland plåtarna har slutsatserna dragits att det finns ett värde i att respektera de äldre materialen.Genom att vara medveten om att det kan finnas stora skillnader i materialen kan valet av plåt göras på ett bättre sätt. Under studiens gång blev det även uppenbart hur mycket historia som fanns lagrad i de gamla plåtarna som är viktig att ta vara på. / The study has been conducted on a number of steel plates from different buildings of cultural and historical value. When old, cultural buildings are to be renovated, it must be done with as much knowledge as possible about the different parts of the building and the values that they represent. The problem that the study has aimed to solve has been an inadequate level of knowledge in regards to historical steel plates. Because of this, the study has been conducted to contribute with knowledge that could be used when old buildings are to be renovated.To achieve the purpose of contributing knowledge to guide renovations of culturally and historically valuable buildings, the goal of the study has been to analyze how the different plates have been made and what the results of those processes were.This has been carried out by conducting a metallography on all of the samples to analyze their microstructures and to gain an understanding of the materials. A chemical analysis has also been conducted on the contents of the materials by using optical emission spectroscopy.The results showed how big of a difference there was between different manufacturing methods and their consequences. By discovering the diversity of the properties of the plates the conclusion has been drawn that there is value in respecting the values of the older materials.By being conscious of how large the difference is between different types of steel sheets, better decisions can be made during choice of steel sheet, and it is more obvious how much history that is stored within the old plates.

The aim of this thesis is to understand RNA-RNA interactions steering cellular functions, as in the case of this thesis the structure of mRNA(Sirt1) in complex with microRNA-34a (miR-34a). MiR-34a regulates the cancer protein p53 via Sirt1 modulation. This work will be the basis for future drug design and the understanding of misguided regulation in cancer. The miR-34a binds to the mRNA(Sirt1) 3’ untranslated region (3’-UTR) and will either inhibit the translation of the protein Sirtuin 1 by capturing its mRNA or by degrading it. p53, a key activator of miR-34a, prevents cancer development by inducing programmed cell death (apoptosis) on cells with DNA damage. In contrast, the protein Sirtuin 1 (Sirt1) has been shown to help cells with DNA damage to survive by down regulating the activity of protein p53 and will therefore increase the risk of cancer development. Studying the interaction between the mRNA(Sirt1) and miR-34a can present valuable information on the structure of the complex as well as the mode miR-34a uses to inhibit translation of mRNA(Sirt1) leading to down regulation of protein Sirtuin 1 and therefore prevent cancer development. For the elucidation of this question different biochemical and biophysical methods were applied, such as in vitro transcription, gel electrophoresis, RNA purification with gel, crush & soak and Cicular Dichroism (CD) melting studies. For this thesis work, the target sequence in mRNA(Sirt1) was optimized and purified so melting studies could be carried out. For future structural characterization using Nuclear Magnetic Resonance (NMR) studies with the miR-34a also produced in the lab. The mRNA(Sirt1) target sequence was produced and purified with the final yield of 0.02%. The results show that the sequence is highly ATP dependent and suggest the ratio between the nucleotides ATP/CTP to be 1:2. Low yield of purified mRNA(Sirt1) was received and still contained some impurities, which imply that another method than crush & soak should be used when purifying. The results, indicate that High-Preformance Liquid Chromatography (HPLC) might be a better solution for the pufication process. The melting profiles done on mRNA(Sirt1) show that the secondary structures decrease with an increase in temperature. Accroding to the results, the mRNA(Sirt1) sequence is folded in room temperature, though not very stable. The wavelength which provided the best resolution was at 268 nm and the melting point of mRNA(Sirt1) was determined to 44 °C. This thesis also contains an educational part, where an educational material was provided and testing was conducted for the subject Chemistry 2 for students age 18 and the material was evaluated with qualitative methods together with pedagogical methods. The study showed that the student can develope the different abilities stated in the curriculum with the material created. The results also showed that the students preferably choose cultural arguments when dicussing socio scientific question, rather than economical, democratic or utility arguments. / Syftet med studien är att förstå RNA-RNAinteraktioner som styr cellulära funktioner, i detta fall mRNA(Sirt1) i komplex med microRNA-34a (miR-34a). MiR-34a reglerar cancerproteinet p53 via modulation av Sirt1. Detta arbete kommer lägga grund för framtida läkemedelsdesign vid reglering av cancer. MiR-34a binder till den 3’ otranslerade regionen i mRNA(Sirt1) och hämmar antingen translationen av protein Sirtuin 1 (Sirt1) genom att fånga dess mRNA eller genom att försämra det. p53 förhindrar utvecklingen av cancer genom att framkalla programmerad cell död (apoptosis) av celler med skadat DNA. Det har visats att proteinet Sirtuin 1 hjälper celler med skadat DNA att överleva, genom att sänka aktiviteten av p53. På så vis ökar risken för utveckling av cancer. Genom att studera interaktionen mellan mRNA(Sirt1) och miR-34a kan värdefull information kring komplexets struktur fås. Samt hur miR-34a hämmar translationen av mRNA(Sirt1), vilket leder till minskad aktivitet av protein Sirt1. För att klarlägga denna fråga har olika biokemiska och biofysiska metoder använts, såsom in vitro transkription, gelelektrofores, RNA rening med gel och Circular Dichroism (CD). För detta arbete har målsekvensen i mRNA(Sirt1) optimerats och renats så CD smältstudier med kunde genomföras. Resultatet visar att mRNA(Sirt1) sekvensen renats med ett utbyte på 0.02 %. Sekvensen är beroende av ATP och förhållandet mellan ATP/CTP nukleotider bör vara 1:2. Resutatet visar på ett lågt utbyte som visar på att High-Performance Liquid Chromatography (HPLC) kan vara en bättre metod än Crush & soak för reningen av mRNA(Sirt1). Ur de smältprofiler som gjorts visade det sig att de sekundära strukturerna av mRNA(Sirt1) minskade med ökande temperatur. I enlighet med resultaten visar det att mRNA(Sirt1) är veckat i rumstemperatur men är inte stabil. Den bästa upplösningen erhölls vid 268 nm och mRNA(Sirt1) har en smältpunkt runt 44 °C. Detta arbete innehåller även ett utbildningskapitel, där ett utbildningsmaterial har skapats och testats på 18-åriga kemi 2 studenter i åldern 18 år. Materialet har utvärderats med hjälp av kvalitativa metoder tillsammans med pedagogiska metoder. Studien visade att de flesta förmågorna för kemi 2 kan utvecklas med hjälp av denna typ samhällsfrågor i det naturvetenskapliga klassrummet (SNI-fall) förutom förmågan att planera och genomföra experiment. Det argument som eleverna helst väljer att använda då de diskuterar det skapade SNI-fallet är Kulturargument och det minst använda är Demikratiargument.