Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2017-06-21T20:00:00Z No. of bitstreams: 2 Nayara_GCBEV_Dissertação VERSÃO FINAL_Definitiva.pdf: 3041386 bytes, checksum: 04452ee2a4384fb66886d92dc109a417 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-21T20:00:00Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Nayara_GCBEV_Dissertação VERSÃO FINAL_Definitiva.pdf: 3041386 bytes, checksum: 04452ee2a4384fb66886d92dc109a417 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-06-29 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas - FAPEAM / The L-Lactate Dehydrogenase (LDH) is an enzyme key in the processes of anaerobic glycolytic metabolism and has three encoders genes in fish (LDH-A, LDH-B and LDH-C). The regulation of these genes is independent and has tissue specificity in vertebrates. They were originated by successive events of genome replication and its evolution showed be closely related to the development of adaptive thermal mechanisms and, also different physiological conditions as hypoxia. The main objectives of this study were understand the evolution of these genes in fish, basal group of the vertebrates, and identify specific replacements that may be considered adaptive to Amazon fish species and other parts of the world (temperate, subtropical and polar). Our results showed that the genes A and B originate from a genetic duplication event that occurred near the origin of vertebrates, and that in a second duplication event, the LDH-C gene was originated from the LDH-B. Thus, the LDH of the lamprey was identified as LDH-A, and from this gene had the differentiation in teleost. In addition, our study showed that LDH-A presents sites and lineages that have gone through or are still undergoing of the adaptive evolution (Amazonian and cold weather fish). In the same time their phylogeny combined with the time difference, pointed a later specialization of this gene as a result of the adaptation to the environment. The course of evolution for these genes appears to have resulted in the influence of natural selection with variants adapted to their environment and its functions. / A L-Lactato Desidrogenase (LDH) é uma enzima chave nos processos do metabolismo glicolítico anaeróbico e possui três genes codificadores em peixes (ldh-a, ldh-b e ldh-c). A regulação desses genes é independente, resultando em especificidade tecidual nos vertebrados. Esses genes foram originados por eventos sucessivos de duplicação do genoma e sua evolução mostra-se intimamente relacionada com o desenvolvimento de mecanismos adaptativos térmicos e de condições fisiológicas distintas, as quais compreendem a hipóxia. Entender a evolução desses genes em peixes, grupo base dos vertebrados, e identificar substituições pontuais que possam ser consideradas adaptativas para espécies de peixes da Amazônia e de outras regiões do planeta (Temperada, Polar e Subtropical) estão dentre os principais objetivos deste estudo. Nossos resultados mostraram que os genes A e B se originaram a partir de um evento de duplicação gênica próximo a origem dos vertebrados, e que, por um segundo evento de duplicação, o gene da LDH-C foi originado a partir da LDH-B. Assim, a LDH da lampreia foi identificada como uma LDH-A, a partir da qual o gene se diferenciou nos teleósteos. Além disso, nossos estudos mostram que a LDHA apresenta sítios e linhagens que sofreram e estão sofrendo evolução adaptativa (peixes amazônicos e de clima frio) e sua filogenia, combinada com o tempo de divergência, apontou uma especialização mais recente desse gene como resultado da adaptação ao ambiente. O curso da evolução para esses genes parece ter resultado na vitória da seleção natural com variantes adaptadas ao seu meio ambiente e às suas funções.

El objetivo general de esta tesis doctoral es determinar la influencia del contenido lipídico de las dietas administradas a reproductores de lubina (Dicentrarchus labrax L.) en el proceso reproductor de esta especie. Se llevaron a cabo tres experimentos diferentes, de dos años de duración cada uno, observando en cada uno de ellos la eficacia reproductora delubinas sometidas a distintos tratamientos nutricionales en dos estaciones de puesta consecutivas.Experimento 1El objetivo del primer experimento fue determinar si la calidad de las dietas o la cantidad total de lípidos ingerida por los reproductores puede afectar a los resultados de puesta debido a que estos factores alteren la composición de ácidos grasos de los huevos o bien porque puedan llegar a afectar a la cascada de fenómenos hormonales que controlan el proceso reproductor, lo cual podría llegar a reflejarse en los niveles plasmáticos de 17ß-estradiol (E2) o de vitelogenina (Vg). Se varió el contenido total de lípidos que tomaban los animales bien modificando el contenido lipídico de la dieta, bien variando la ración de alimento administrada a los animales. Se establecieron cinco grupos experimentales:o Grupo A. Recibió una dieta comercial con un 9% de lípidos a una ración de _ parte de la normal.o Grupo B. Recibió la misma dieta comercial que el grupo anterior pero a ración normalo Grupo C. La dieta administrada a este grupo poseía un 15% de lípidos y se le suministró a _ de la ración normal.o Grupo D. Recibió el pienso con un 15% de lípidos a ración normal.o Grupo Control. Se le administró un alimento natural, consistente en boga, Boops Boops, troceada y a ración normal.El grupo Control presentó unas fecundidades (número de huevos por hembra, fecundidad total, FT, y número de huevos por Kg de hembra, fecundidad relativa, FR) mayores que las de los otros grupos experimentales. Las tasas de viabilidad de los huevos (medida como porcentaje de huevos viables, flotantes, respecto al total de huevos, viables y no viables, es decir que se hundían en la probeta en la que se recogieron los huevos) y de eclosión fueron también significativamente (P<0.05) mayores en el grupo Control que en los grupos alimentados con dietas artificiales. Al analizar los ácidos grasos de la fracción lipídica de las dietas y de los huevos se observó que las proporciones de ácidos grasos de las dietas influían en las de los huevos. En particular, las relaciones entre los ácidos docosahexaenoico (DHA, 22:6n-3) y eicosapentaenoico (EPA, 20:5 n-3), y entre los ácidos grasos DHA y araquidónico (AA, 20:4 n-6) fueron mucho mayores en la dieta natural que en las artificiales así como en los huevos procedentes del grupo Control con respecto a los huevos de los otros grupos. Además, el grupo Control mostró unos niveles significativamente más altos de VTG y más bajos de E2 que los otros grupos en varios de los meses correspondientes al periodo de puesta. Se llegó a la conclusión de que la calidad de los huevos obtenidos estaba profundamente influida por las relaciones DHA /EPA y AA/EPA observadas en los huevos, que a su vez se iban a ver influidas por las relaciones DHA /EPA y AA/EPA que aparecen en las dietas. La composición inadecuada de ácidos grasos de las dietas artificiales estuvo asociada con las bajas concentraciones de VTG en los animales de los grupos A, B, C y D. Muy probablemente las concentraciones plasmáticas elevadas de E2 en estos animales fueron debidas a la presencia en los piensos de unas proporciones elevadas de ácidos grasos monoenoicos de cadena larga.Experimento 2El objetivo de este experimento fue determinar si una proporción inadecuada de ácidos grasos, particularmente DHA /EPA, podría ser compensada por un incremento de las cantidades absolutas de estos ácidos grasos ingeridas por los reproductores de lubina. El otro objetivo fue describir, por primera vez, los niveles plasmáticos de hormona gonadotropa II (GtH II) a lo largo del ciclo reproductor de la lubina.Se establecieron cuatro grupos experimentales:o Grupo A. Alimentado con una dieta comercial con un 9% de lípidoso Grupo B. Recibió el mismo pienso que el grupo A, pero el contenido de lípidos se elevó hasta un 22% mediante inmersión en un aceite comercial rico en ácidos grasos poliinsaturados de la serie n-3.o Grupo C. Se le administró un pienso formulado en el que la cantidad de lípidos se había elevado hasta un 30%o Grupo Control. Fue alimentado con boga troceadaEl grupo Control presentó mayores FT y FR que el resto de los grupos y también unas tasas de viabilidad y de eclosión de los huevos significativamente (P<0.05) mayores que las de los otros tres grupos. De nuevo, la mayor eficacia reproductora del grupo Control estuvo asociada con unas mayores relaciones DHA /EPA y AA/EPA en la comida natural que las observadas en las dietas de los otros grupos experimentales. Los huevos del grupo Control también presentaron relaciones DHA /EPA y AA /EPA mayores que las observadas en los huevos de los grupos alimentados con dietas artificiales. El grupo Control mostró de nuevo concentraciones plasmáticas de VTG significativamente (P<0.05) mayores que las observadas en los otros grupos experimentales en varios meses de la época de puesta. Contrariamente, las concentraciones plasmáticas de E2 en esos meses fueron mayores en los grupos alimentados con dietas artificiales que en el grupo Control, probablemente debido a la presencia de cantidades elevadas de ácidos grasos monoenoicos de cadena larga en los piensos. Los niveles plasmáticos de GtH II presentaron un pico claro en el punto medio del periodo de puesta, cuando mayor es la proporción de oocitos en maduración y ovulación, indicando el papel fundamental de esta hormona en el control de la maduración final de los oocitos y de la ovulación, igual que en otras especies de vertebrados. Además, los niveles absolutos de GtH II fueron mayores en los grupos alimentados con dietas artificiales que en el grupo Control, evidenciando un efecto de retroalimentación positiva del E2 sobre la síntesis de GtH II en la hipófisis.Experimento 3El objetivo de este experimento fue determinar si hay una variación estacional en las necesidades de ácidos grasos de los reproductores de lubina, dependiendo del momento del ciclo reproductor en el que se encuentren. Se utilizaron dos tipos de dieta, una dieta comercial normal, con un 9% de lípidos, que en los otros experimentos había estado asociada con malos resultados de puesta. Y una dieta rica en ácidos grasos esenciales (EFA), que se preparó sumergiendo los granos de pienso de la dieta mencionada anteriormente, en aceite de pescado.Se establecieron cuatro grupos experimentales:o Grupo Sep-Feb: recibió una dieta rica en EFA entre el 15 de septiembre y el 15 de febrero. Es decir, en la época de vitelogénesis, y primera mitad del periodo de puestao Grupo Feb-Abr: recibió la dieta rica en EFA entre el 15 de febrero y el 15 de abril, durante la segunda mitad del periodo de puesta.o Grupo Abr-Sep: recibió la dieta rica en EFA entre el 15 de abril y el 15 de septiembre, es decir en la época de postpuestao Grupo Ene-Dic: recibió la dieta rica en EFA a lo largo de todo el añoEn la primera época de puesta estudiada, el grupo Sep-Feb y el grupo Ene-Dic presentaron unas tasas de viabilidad y de eclosión de los huevos significativamente más elevadas que las de los otros dos grupos. En la segunda época de puestas, estos dos grupos mostraron de nuevo los valores más altos de viabilidad y de eclosión de los huevos, y en el grupo Abr-Sep estas tasas de viabilidad y de eclosión se elevaron enormemente con respecto al año anterior y al grupo Feb-Abr. Al realizar los análisis de ácidos grasos de los huevos se observó que las mejores tasas de eclosión de los grupos Sep-Feb y Ene-Dic estuvieron asociadas con unas relaciones DHA / EPA y ácidos grasos de la serie n-3 con respecto a ácidos grasos de la serie n-6 (n-3 / n-6) mayores que las aparecidas en los huevos de los otros grupos experimentales. La mejoría en la eficacia reproductora observada en el grupo Abr-Sep en el segundo año con respecto al primero se produjo después de que este grupo recibiera, en este segundo ciclo experimental, el pienso rico en EFA durante 5 meses (en el primer ciclo experimental lo había recibido solamente durante dos meses ya que el experimento comenzó en julio). La elevación de las tasas de viabilidad y de eclosión en este grupo estuvo asociada con una elevación de las proporciones DHA / EPA y n-3 / n-6 en la fracción lipídica de los huevos, en el segundo año con respecto al primero. / ABSTRACSea bass (Dicentrarchus labrax L.) broodstock were fed with different diets, containing different quantity of lipids or different fatty acid proportions in three different experiments. Every experiment began at the end of the summer and lasted for two years, in order to observe the results of two consecutive spawning seasons (from January to April). During spawning, egg quality and egg hatching rates were measured. Fish were sampled monthly and vitellogenin (VTG), 17ß-estradiol (E2) and gonadotrophin II (GtH II) were analysed. In the first experiment, five groups were established feeding different quantities of lipids. It was observed that better egg quality was associated with high VTG and low E2 plasma concentrations, and also with a high ratio 22: 6 n-3 / 20:5 n-3 (DHA:EPA) in the fatty acid composition of the diets, that was reflected in the fatty acid composition of the eggs. In the second experiment the fatty acid composition of the diets was controlled to confirm if a higher DHA/EPA ratio was really positively influencing egg quality. The importance of a high DHA/EPA ratio for the egg quality was confirmed. It was also observed that the ratio 20:4 n-6 / 20:5 n-3 (AA:EPA) was determinant for the egg quality. VTG and E2 plasma levels behave as in the previous experiment. GtH II plasma levels were analyzed. A direct relationship between E2 and GtH II plasma levels was observed, indicating the importance of the E2 mediated feed-back mechanisms in the regulation of GtH II production and release in the pituitary. In the third experiment, the importance of the time of fatty acid ingestion for the spawning performance was studied. Experimental groups received a diet rich in EPA and DHA at different times of the year: pre-spawning, spawning, post-spawning or all along the year. Egg quality from the group fed all the year with a diet rich in EPA and DHA was similar to that of the group fed with this diet in the pre-spawning period. That means that fatty acids administered only during the pre-spawning period are able to reach the developing oocytes in the ovary and is not necessary to feed these fatty acids all along the year.

Made available in DSpace on 2013-08-07T19:12:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000427290-Texto+Completo-0.pdf: 2139864 bytes, checksum: dfd6c64a3fd5bda5825dbec64550e1c1 (MD5) Previous issue date: 2009 / The Group Salta basin was developed during the Cretaceous and Paleogene in the northwestern Argentina, accumulating mainly continental sediments designated Salta Group. The Lumbrera Formation is the thickest and uppermost unit of the Salta Group, whose paleoenvironment is interpreted as a perenne lake deposited during early to middle Eocene (52-35 Myr). Its fossil content includes palynomorphs, insects, crocodiles, turtles, lizards, marsupials, nothoungulates e ungulates. The fossil fish fauna described for the Lumbrera Formation includes cichlids, poeciliids and tooth plates of Lepidosiren paradoxa. In this paper a new genus of heroine cichlid is described, based on an articulated and almost complete fossil specimen (CNSV10026), coming from this formation. The phylogenetic position of the new genus was assessed using the matrix presented by Kullander (1998), which includes 50 modern cichlid taxa e 91 characters. The inclusion of the new genus among the heroines is supported by the presence of tubular infraorbitals 2 and 3; lachrymal approximately square; and lingual cusp on anterior teeth. According to Kullander (1996) the presence of enlarged canines on the outer tooth series of the oral mandibles, as occurs in the new genus, is not found in any other Neotropical cichlid, being a synapomorphy of the heroines. The occurrence of this fossil heroine, associated to the geophagines described for the same formation provides the strongest evidence to date of a significant diversification of the family in the Lower Eocene. This lends support to the assumption that the Family Cichlidae originated in the Gondwana, sometime during Cretaceous. / A Bacia do Grupo Salta se desenvolveu durante o Cretáceo e Paleógeno no noroeste da Argentina, acumulando principalmente sedimentos continentais denominados de Grupo Salta. A Formação Lumbrera é a unidade mais espessa e superior do Grupo Salta, cujo paleoambiente é interpretado como um lago perene de idade Eoceno Inferior a Médio (52 a 35 Ma). Seu conteúdo fossilífero inclui palinomorfos, insetos alados, crocodilos, tartarugas, lagartos, marsupiais, notoungulados e ungulados. Os peixes fósseis descritos para a Formação Lumbrera incluem ciclídeos, placas dentais de Lepidosiren paradoxa e fragmentos atribuídos a Poeciliidae. Neste trabalho é descrito um novo gênero de ciclídeo heroine com base em um espécime fóssil, quase completo (CNS-V10026), proveniente desta formação. A posição filogenética do novo gênero foi analisada com base na matriz apresentada por Kullander (1998), que inclui 50 táxons modernos de ciclídeos e 91 caracteres. A posição do novo gênero entre os heroines é suportada pela presença dos infraorbitais 2 e 3 de formato tubular, lacrimal aproximadamente quadrado; e cúspide lingual nos dentes anteriores. De acordo com Kullander (1996) a presença de caninos aumentados nas fileiras externas de dentes das mandíbulas orais, como ocorre no fóssil, não é vista em nenhum outro ciclídeo Neotropical, sendo considerada uma sinapomorfia dos Heroini. O reconhecimento deste heroine fóssil, associado aos geofagines já descritos para a mesma formação evidencia uma grande diferenciação da família já no Eoceno inferior (49 Ma). Isto reforça a idéia de que a origem dos ciclídeos teria ocorrido ainda no Cretáceo, no Gondwana.

Made available in DSpace on 2013-08-07T19:12:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000415037-Texto+Completo-0.pdf: 7396483 bytes, checksum: df4a90ffa80761eba983323de0d55541 (MD5) Previous issue date: 2008 / With base on the analysis morphological of 153 characteres and 53 taxa of Aspredinidae are proposed the following results: a) Acanthobunocephalus and Bunocephalus as monophyletic groups and their interrelations resolved b) eight new species of aspredinids, being that five of them already mentioned by Friel and three discoveries during the development of this study; c) reallocation of some species of Bunocephalus (B. amazonicus, B. bifidus, B. iheringii, B. quadriradiatus, B. rugosus) in Acanthobunocephalus; d) Bunocephalus aloikae as a species valid and not as synonym of Bunocephalus amaurus; e) key for species from Acanthobunocephalus and Bunocephalus; f) a new classification for Aspredinidae; and g) the corroboration of the hypothesis that Aspredinidae is sister to the Asian Sisoroidea (Amblycipitidae, Akysidae, Sisoridae, and Erethistidae) as proposed by de Pinna, Britto and Diogo Vandewalle & Chardon, and not to the Doradoidea, as suggested by Friel and Sullivan, Lundberg & Hardman. / Com base na análise morfológica de 153 caracteres de 53 táxons de Aspredinidae são propostos os seguintes resultados: a) Acanthobunocephalus e Bunocephalus como grupos monofiléticos e com suas inter-relações resolvidas; b) oito espécies novas de aspredinídeos, sendo que cinco delas já mencionadas por Friel (Acanthobunocephalus sp. nov. 1., Acanthobunocephalus sp. nov. 2., Acanthobunocephalus “l” sp. nov., Amaralia sp. nov. e Ernstichthys sp. nov. ) e três descobertas durante o desenvolvimento deste estudo (Acanthobunocephalus sp. nov. 3., Acanthobunocephalus sp. nov. 4 e Bunocephalus sp. nov. ); c) transferência de algumas espécies de Bunocephalus (B. amazonicus, B. bifidus, B. iheringii, B. quadriradiatus e B. rugosus) para Acanthobunocephalus; d) Bunocephalus aloikae como uma espécie válida e não como sinônimo de Bunocephalus amaurus; e) chave para as espécies de Acanthobunocephalus e Bunocephalus; e) uma nova classificação para Aspredinidae; e f) corroboração da hipótese de que Aspredinidae é grupo irmão do clado asiático Sisoroidea (Amblycipitidae, Akysidae, Sisoridae e Erethistidae), como proposto por de Pinna, Britto e Diogo, Vandewalle & Chardon, e não de Doradoidea como sugerido por Friel e Sullivan, Lundberg & Hardman.

Made available in DSpace on 2013-08-07T19:13:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000431167-Texto+Completo-0.pdf: 542283 bytes, checksum: 5b7d7fdff3a3104396a18ddd981388d7 (MD5) Previous issue date: 2011 / The stable isotopic analysis has been increasingly used to understand the real assimilation of the nutrients and the trophic position of several organisms. It is mainly performed for species in which the feeding habits are few known or even when the stomach content analysis shows contradictions. The concept of Isotopic Niche aims to determine one numeric value that represents the isotopic signature of the species, considering the ontogenetic variation of the consumption of different food items and the curve of biomass/age. The main goal of this study is to estimate the isotopic niche of Cyanocharax alburnus, captured in the Pinguela Lagoon (RS). Animal were sampled in November-December/2009 and April/2010, using a beach seine net. A total of 1210 individuals were captured. Two age groups were identified in the sample of November/December and a single group in April/2010. The asymptotic length (Linf) estimated by the von Bertalanffy model was 9. 10 cm and the growth constant (k) 0. 65. The natural rate of mortality (M) was estimated in 1. 65 (SD=0. 24). The adjustment of the weight/height relationship (Huxley model) estimated the proportionality coefficient (a) as 0. 0081 and the allometric coefficient (b) as 3. 074. However, the distribution of the proportional residues of the weight/length relationship showed marked asymmetry for the animals with a length range from 1. 0 cm to 4. 0cm leading us to choose for the adjustment a polyphasic model. The model adjustment indicated a change on the allometric coefficient (b) to throughout ontogeny, which passed from 2. 53 in individuals smaller than 3. 39 cm to 3. 19 in the bigger individuals. The measured values of isotopic signature of δ13C e δ15N for C. alburnus in Pinguela Lagoon showed considerable variation among individuals revealing individuals differences regarding primaries sources of carbon and the trophic position.The values of the isotopic signature of δ13C show the average of -20. 40 ‰ ( SD= 1. 14 ‰) ranging between -18. 18 ‰ and -24. 66 ‰. For the δ15N, we have found average values of isotopic signature of 11. 07 ‰ (SD = 0. 55 ‰) ranging between 10. 41 ‰ and 12. 51 ‰. Through linear regression, it was not identified any trend relating isotopic signature of carbon and nitrogen and length (b=0; δ13C: n = 25, P = 0. 10; δ15N, n = 25, P = 0. 55), indicating that the sources of carbon and nitrogen or the trophic position for C. alburnus do not change for lengths from 2 to 8 cm. In this way, the concept of the Isotopic Niche concept is not applied for C. alburnus, since this species does not alter the carbon source or the trophic level during the ontogenetic development. In the present study, the isotopic signature of carbon and nitrogen showed tree mainly sources of variation: intra-specific variation, variation among different species from the same locality and between different localities. We also verified that the intra-specific variation of C. alburnus, in the terms of isotopic signature, is so wide as different species from the same location. If each plotted value is the result of the average of few individuals, the community pattern could be completely masked by the intra-specific variation, undermining any inference regarding trophic position or the primary sources of carbon. On the other hand, we identified that the bigger sources of variation concerns the geographical origin of the data set, so that direct comparison between gross values from different localities could be dangerous in terms of understanding the feeding patterns. / A análise de isótopos estáveis está sendo cada vez mais utilizadas para o entendimento da real assimilação de nutrientes e da posição trófica de organismos. Ela é utilizada principalmente em espécies para as quais pouco se conhece do habito alimentar ou onde a análise estomacal demonstra contradições. O conceito de nicho isotópico procura determinar um valor único que represente a assinatura isotópica de uma espécie, considerando a variação ontogenética do consumo de diferentes itens alimentares e a curva de biomassa/idade da espécie. No presente trabalho procurou-se estimar o nicho isotópico de Cyanocharax alburnus capturado na Lagoa da Pinguela (RS) através de coletas nos meses de novembro de 2009 e abril de 2010, utilizando rede de arrasto de praia. Foram capturados no total 1210 indivíduos. Através da ferramenta Agegroup foram identificados dois grupos etários na amostra de novembro/dezembro de 2009 e um único grupo na amostra de abril de 2010. Através da ferramenta Age-Group estimou-se o comprimento assintótico (Linf) segundo o modelo de von Bertalanffy em 9,1 cm e a constante de crescimento (k) em 0,65.A taxa de mortalidade natural (M) foi estimada em 1,65 (DP=0,24). Através do ajuste da relação de peso/comprimento de Huxley estimou-se o valor do coeficiente de proporcionalidade (a) em 0,0081 e o coeficiente alometria (b) em 3,07. A distribuição de resíduos proporcionais da relação peso/comprimento de Huxley, entretanto, apresentou uma marcada assimetria para animais com comprimentos de 1,0 cm ao 4,0 cm, optando-se pelo ajuste do modelo de relação peso/comprimento polifásico. O modelo ajustado indica uma alteração no coeficiente de alometria (b) ao longo do desenvolvimento ontogenético, que passa de 2,53 em indivíduos menores que 3,39 cm para 3,19 em indivíduos maiores. Os valores mensurados de assinatura isotópica de δ13C e δ15N para C. alburnus na lagoa da Pinguela apresentaram variação considerável entre os indivíduos, revelando diferenças individuais relativas a fontes primárias de carbono e posição trófica. Os valores de assinatura isotópica para δ13C apresentaram média de -20,4 ‰, desvio padrão de 1,14 ‰, e amplitude de variação entre - 18,18 ‰ e -24,66 ‰. Para δ 15N verificou-se um valor médio de assinatura isotópica de 11,0 ‰, desvio padrão de 0,55 ‰, e amplitude de variação entre 10,41 ‰ e 12,51 ‰. Através de regressão linear, não se identificou qualquer tendência de variação da assinatura isotópica de carbono ou nitrogênio em função do comprimento (b=0; δ13C: n = 25, P = 0,10; δ15N, n = 25, P = 0,55), indicando que não há alteração de fonte de carbono ou de nível trófico de C. alburnus entre comprimentos de 2 a 8 cm.Neste sentido, a concepção do conceito de nicho isotópico não se aplica para C. alburnus, já que a espécie não altera a fonte de carbono ou nível trófico em função do desenvolvimento ontogenético. No presente trabalho identificou-se que a assinatura isotópica de carbono e nitrogênio apresenta três fontes principais de variação: variação intraespecífica, variação entre espécies diferentes da mesma localidade e entre localidades diferentes. Verificou-se, entretanto, que a variação intra-específica de C. alburnus, em termos de assinatura isotópica de carbono e nitrogênio, é tão ampla quanto diferentes espécies capturadas em uma mesma localidade. Se cada valor plotado for o resultado de média de poucos indivíduos, então o padrão identificado pode ser completamente mascarado pela variação intraespecífica, prejudicando qualquer inferência quanto à posição trófica ou fonte primária de carbono. Por outro lado, identificou-se que a maior fonte de variação constitui-se na origem geográfica do dado, de forma que a comparação de valores brutos entre localidades diferentes se torna temerária em termos de entendimento de padrões alimentares.

Submitted by GUADALUPE SAMPAIO FERREIRA null (guadasampaio@gmail.com) on 2017-03-15T19:22:17Z No. of bitstreams: 1 Tese_Guadalupe_Sampaio_Ferreira.pdf: 2230762 bytes, checksum: 8f45e525792b3bc473f7830fae3daa07 (MD5) / Approved for entry into archive by Juliano Benedito Ferreira (julianoferreira@reitoria.unesp.br) on 2017-03-15T19:37:07Z (GMT) No. of bitstreams: 1 ferreira_g_dr_jabo.pdf: 2230762 bytes, checksum: 8f45e525792b3bc473f7830fae3daa07 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-15T19:37:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ferreira_g_dr_jabo.pdf: 2230762 bytes, checksum: 8f45e525792b3bc473f7830fae3daa07 (MD5) Previous issue date: 2017-02-10 / Com o objetivo de estudar a fisiopatologia da reação inflamatória em tilápias, este estudo avaliou a participação do tratamento exógeno com cetoconazol sobre o efeito glicocorticoide de tilápias do Nilo, Oreochromis niloticus, durante aerocistite aguda induzida por Aeromonas hydrophila. Para tanto, foram utilizadas 91 tilápias, constituindo cinco tratamentos: Não tratado e não inoculado (Padrão fisiológico); Não tratado e inoculado (controle infectado); Tratado com dexametasona (DEXA) e inoculado; Tratado com cetoconazol (CETO) e inoculado; Tratado com DEXA + CETO e inoculado. Após anestesia profunda nos períodos experimentais de 6, 24 e 48 horas pós-inoculação (HPI) coletou-se o exsudato para contagem celular e sangue para determinação do hemograma completo, proteinograma, bioquímico sérico. Na fase inicial da infecção (6HPI), o tratamento subcutâneo das tilápias com 200 UI-kg-1 de cetoconazol resultou em atividade pró-inflamatória caracterizada pelo aumento do acúmulo de granulócitos e diminuição de trombócitos no exsudato, associado à neutrofilia e aumento dos níveis séricos de haptoglobina e ceruloplasmina. No quadro eritrocitário inicial de tilápias tratadas com cetoconazol, observou-se diminuição do número de hemácias com diminuição do hematócrito e do volume corpuscular médio, caracterizando alterações microcíticas comuns em deficiências por ferro, corroborando os aumentos observados nos níveis séricos das proteínas de fase aguda haptoglobina e ceruloplasmina. No pico de exsudação celular para o foco inflamado 24 HPI, tilápias tratadas com cetoconazol apresentaram aumento do acúmulo de trombócitos associado à trombocitopenia e aumento dos níveis séricos de transferrina. Na fase tardia da infecção (48 HPI), o tratamento subcutâneo das tilápias com 200 UI-kg-1 de cetoconazol resultou em atividade pró-inflamatória caracterizada pelo aumento do acúmulo de macrófagos no exsudato associado ao quadro de monocitose e diminuição da produção de espécies reativas de oxigênio na atividade respiratória leucocitária. Contudo, os resultados da participação do cetoconazol no efeito glicocorticoide demonstraram atividade pró-inflamatória por favorecer a cinética de acúmulo de granulócitos na fase inicial e de macrófagos em fase mais tardia com aumento de atividade de proteínas de fase aguda, entretanto, efeitos deletérios transitórios foram evidentes no quadro hematológico associados à patogenia da aeromonose em animais tratados com este derivado do imidazol.

Made available in DSpace on 2016-02-13T01:07:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000477228-Texto+Parcial-0.pdf: 201037 bytes, checksum: 842e14f9326d662b1b590ec126cc0e5f (MD5) Previous issue date: 2015 / The Auchenipteridae have an extensive and confusing taxonomic and phylogenetic history. Several studies developed since 1766 involving descriptions of species generated controversial results about the composition of the family and their interrelationships. The weakness of the systematic knowledge and diversity of the family hinders the understanding about the evolutionary history since the informative potential of morphology, molecules and biogeography was not yet fully explored. A comprehensive and densely sampled phylogenetic study of the species relationships of the Auchenipteridae, a Neotropical family of inseminating catfishes, is here documented based on combined datasets, morphological and molecular. The present study aimed to include most species of Auchenipteridae (109 species), as well as several members of other siluriform families representing the outgroup (28 species comprising Mochokidae, Aspredinidae, Doradidae, Ariidae, Pimelodidae, Cetopsidae, and Diplomystidae) to embrace the greater diversity of forms existing within Siluriformes, providing a robust comparison between the taxa and providing therefore a series of information from different sources including morphology (261 characters) and molecular data (2814 characters based on four genes: COI, 16S, RAG2, and MyH6).The parsimony analysis based on combined data yielded 1691 maximally parsimonious trees and the strict consensus corroborated the monophyly of the superfamily Doradoidea, the family Auchenipteridae and its two subfamilies, Centromochlinae and Auchenipterinae as well. The new classificatory proposal also raises the number of tribes within Auchenipteridae from two to nine, evidencing the following major groups within Auchenipterinae: Liosomadoradini, Trachelyopterini, Asterophysini, Auchenipterini, and Ageneiosini; and in Centromochlinae: Gelanoglanini, Gephyromochlini, Centromochlini, and Glanidini. Additionally, most of auchenipterid genera were recovered as monophyletic, except for Centromochlus and Tatia. Centromochlus is restricted to only three species while Tatia is recovered as the most specious centromochline genus including the currently Centromochlus simplex, C. reticulatus and Pseudotatia parva, herein reallocated. To address the paraphyly of Centromochlus and Tatia, two new genera of Centromochlinae were proposed and a nomenclatural reorganization of the species in these genera was conducted. Furthermore, Glanidium and Trachycorystes resulted as paraphyletic, and a new combination for Glanidium leopardum, resurrecting Gephyromochlus, to allocate this taxa and a new genus of Auchenipterinae to allocate Trachycorystes menezesi were proposed. Notwithstanding, Ageneiosus was recovered as paraphyletic since Ageneiosus militaris was recovered as sister group to Ageneiosus and Tympanopleura. The paraphyly of Ageneiosus seems to be an artifact of morphological missing data for A. militaris and until these data are included in the analysis to readily test the position of this species, both genera are maintained as valid. A synapomorphy list and the diagnosis for each clade are presented under a new classification proposal. Furthermore, the interrelationship and monophyly of the genera and major groups are discussed and compared to previous propositions. / Auchenipteridae possui uma extensa e confusa história taxonômica e filogenética. Diversos estudos desenvolvidos desde 1766 envolvendo descrições de espécies geraram resultados controversos a cerca da composição da família e suas relações de parentesco. A deficiência no conhecimento da sistemática e diversidade da família tem dificultado a compreensão sobre a história evolutiva, uma vez que o potencial informativo morfológico, molecular, e biogeográfico ainda não foi totalmente explorado. Um estudo filogenético compreensivo e densamente amostrado das relações de parentesco das espécies de Auchenipteridae, uma família de bagres Neotropical inseminadores, é aqui documentado através de um conjunto de dados combinados, morfológicos e moleculares. O presente estudo objetivou incluir a maioria das espécies de Auchenipteridae (109 espécies), bem como diversos membros de outras famílias de Siluriformes representando o grupo externo (28 espécies de Mochokidae, Aspredinidae, Doradidae, Ariidae, Pimelodidae, Cetopsidae, e Diplomystidae) para contemplar a grande diversidade de formas existente dentro de Siluriformes, fornecendo uma robusta comparação entre os táxons além de uma série de informações de diferentes fontes incluindo dados morfológicos (261 caracteres) e moleculares (2814 caracteres de quatro genes: COI, 16S, RAG2 e MYh6).A análise de parcimônia baseada em dados combinados produziu 1691 árvores maximamente parcimoniosas e o consenso estrito corroborou a monofilia da superfamília Doradoidea e de Auchenipteridae e, também, de suas duas subfamílias Centromochlinae e Auchenipterinae. A nova proposta de classificação aumenta o número de tribos em Auchenipteridae, de duas para nove, evidenciando os seguintes grandes grupos dentro de Auchenipterinae: Liosomadoradini, Trachelyopterini, Asterophysini, Auchenipterini, and Ageneiosini; e quatro novas tribos em Centromochlinae: Gelanoglanini, Gephyromochlini, Centromochlini, e Glanidini. Adicionalmente, a maioria dos gêneros de auchenipterídeos foi recuperada como monofilética, exceto por Centromochlus e Tatia. Centromochlus é restringido a somente três espécies, enquanto que Tatia é recuperado como gênero mais diverso incluindo as atuais espécies Centromochlus simplex, C. reticulatus e Pseudotatia parva, aqui realocadas. Para resolver a parafilia de Centromochlus e Tatia, dois novos gêneros de Centromochlinae são propostos e uma reorganização nomenclatural destes gêneros é feita. Adicionalmente, Glanidium e Trachycorystes resultaram como parafiléticos, e uma nova combinação é proposta para Glanidium leopardum, revalidando Gephyromochlus para alocar este táxon e também um novo gênero de Auchenipterinae para alocar Trachycorystes menezesi. Não obstante, Ageneiosus foi recuperado como parafilético, uma vez que A. militaris foi recuperado como grupo irmão do clado Ageneiosus e Tympanopleura. A parafilia de Ageneiosus parece ser um artefato de dados morfológicos faltantes para A. militaris e até os mesmos serem incluídos na análise para realmente testar a posição desta espécie, os dois gêneros são mantidos como válidos. Uma lista de sinapomorfias e as diagnoses dos clados são apresentadas sob uma nova proposta de classificação. Ainda, as relações de parentesco e a monofilia dos gêneros e grandes grupos são discutidas e comparadas à proposições prévias.

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Made available in DSpace on 2013-08-07T18:41:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000424470-Texto+Completo-0.pdf: 1933848 bytes, checksum: 8ff49b9ceaa68691d9de882c207c447c (MD5) Previous issue date: 2010 / First identified in Saccharomyces cerevisie as silent information regulators (SIRs) sirtuins (SIRTs) are widely distributed in all phyla of life. These large and diverse class III histone deacetylases (HDACs) comprise a family of NAD+-dependent protein deacetylases that catalyze mono-ADP-ribosyl transfer and/or deacetylation, and are considered a highly conserved family of proteins. Zebrafish (Danio rerio) is a freshwater fish widely used as model organism in many research areas. Characteristics such as low costs of breeding and maintenance, easy water-soluble drugs administration and rapid adaptation to new environments, among others, made the zebrafish a suitable model organism for studying many human diseases; including aging-associated disorders. Despite its promising use as a vertebrate model of aging, little is known about the presence of sirtuin-related genes in zebrafish, which has been considered an important research target for its therapeutics potential. Therefore, the purpose of this study was to identify all sirtuin-related genes and to map their expression patterns in nine different tissues of adult zebrafish. Total RNA was extracted from tissues samples of male and female zebrafish. RT-PCR reactions were performed under optimized conditions for expression pattern analysis of the sirtuins-related genes, previously identified using NCBI-Blast searches. Results showed the existence of eight sirtuins-related genes, including two paralogs. Each gene presented a unique expression pattern, illustrating their wide tissue distribution. In order to test a modulatory effect on gene expression of the sirtuin members, we exposed fish to resveratrol and the results demonstrated an alteration of the expression levels of some sirtuins. In this sense, we suggest that new drugs potentially able to modulate sirtuins expression could be tested using the system here described, aiming, in the future, to develop more selective therapies for age-associated disorders / Descobertas inicialmente em Saccharomyces cerevisie como reguladoras de silenciamento de informação (SIRs), as sirtuínas (SIRTs) estão amplamente distribuídas em todos os domínios de vida. Esta grande e diversa família de histonas desacetilases da classe III (HDACs) são dependentes de nicotinamida adenina dinucleotídeo (NAD+) para exercer suas funções de desacetilação e/ou transferência de mono-ADP-ribosil. São consideradas uma família de enzimas bastante conservada não apenas entre eucariotos, nos quais são encontradas múltiplas sirtuínas, mas também em procariotos. O zebrafish (Danio rerio) é um teleósteo de água doce amplamente utilizado como animal modelo em diferentes áreas de pesquisa. Características como manutenção em pequenos espaços e com baixos custos, fácil administração de drogas solúveis em água e rápida aclimatação a novos ambientes, tornaram o zebrafish modelo de estudo para várias doenças humanas; entre elas as relacionadas ao envelhecimento. Apesar do uso crescente do zebrafish como sistema modelo, e das sirtuínas serem importantes alvos de pesquisa nos últimos anos principalmente devido seu potencial terapêutico, pouco é conhecido sobre sirtuínas e zebrafish. Portanto, identificar genes relacionados às sirtuínas e caracterizar o padrão de expressão gênica de cada membro em diferentes tecidos do zebrafish foi o objetivo deste trabalho. Para tanto, amostras de diferentes tecidos foram retiradas de animais adultos de ambos sexos e diretamente congeladas em nitrogênio líquido. Após a extração de RNA total de cada amostra, reações de RT-PCR, já padronizadas, foram realizadas para análise do padrão de expressão dos genes relacionados às sirtuínas, identificados previamente através de buscas no NCBI-Blast. Nossa investigação identificou oito genes relacionados às sirtuínas, incluindo dois parálogos. Cada um dos oito genes identificados apresentou um padrão de expressão único, ilustrando ampla distribuição tecidual dos membros da família das sirtuínas. Com o objetivo de testar a modulação na expressão destes genes, realizamos um experimento de exposição ao resveratrol que alterou os níveis de expressão gênica de algumas das sirtuínas. Neste sentido, propomos que novas drogas potencialmente moduladoras de sirtuínas sejam testadas usando o sistema aqui descrito com o objetivo de, no futuro, desenvolver terapias mais seletivas para as doenças associadas ao envelhecimento.

Made available in DSpace on 2013-08-07T18:42:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000434409-Texto+Completo-0.pdf: 489532 bytes, checksum: 6d9ad85140ac1052e70482873df7cc50 (MD5) Previous issue date: 2011 / The 2,3,7,8-tetrachlorodibenzeno-p-dioxin (TCDD) is a member of a group of environmental contaminants known as polychlorinated aromatic hydrocarbon and can be formed during the chlorine bleaching process used by pulp and paper and as a byproduct of the manufacture of certain chemicals. Once associated with ligands such as TCDD, the aryl hydrocarbon receptor (AHR) is translocated into the nucleus where it will form a dimer with nuclear translocator aryl hydrocarbon receptor (ARNT). The heterodimer AHR/ARNT formed, regulates the expression of a number of genes involved in cellular response to environmental changes and development conditions. Among the genes, is the coding for an ecto-ATPase (NTPDase2). Thus, it becomes important to assess the acute exposure (in vivo) of TCDD on the hydrolysis of ectonucleotidases in zebrafish brain membranes. The ectonucleotidases are enzymes capable of hydrolyzing the nucleotides and inactivating the signaling mediated by extracellular nucleotides. Among the ectonucleotidases, there are the NTPDase and ecto-5'-nucleotidase. The NTPDase activity showed no significant difference in the hydrolysis of ATP and ADP, as well as in AMP in menbranes of zebrafish. These findings seem to be important to reinforce the idea that NTPDase2 gene induction cannot be a general pathogenic factor in TCDD toxicity. However, further studies using either higher doses of TCDD and long-term exposure are required. / A 2,3,7,8-tetraclorodibenzeno-p-dioxina (TCDD) é membro de um grupo de contaminantes ambientais conhecido como hidrocarboneto aromático policlorinato e pode ser formada durante o processo de branqueamento com cloro, utilizado por fábrica de celulose e papel e como um subproduto da fabricação de determinados produtos químicos. Uma vez associado a ligantes como a TCDD, o receptor de hidrocarboneto arila (AHR) é translocado para o núcleo onde irá formar um dímero com o translocador nuclear do receptor hidrocarboneto arila (ARNT). O heterodímero AHR/ARNT formado regula a expressão de uma série de genes envolvidos na resposta celular a mudanças ambientais e a condições de desenvolvimento. Entre os genes, está o que codifica para NTPDase2 (previamente conhecida como ecto-ATPase). Com isso, torna-se importante avaliar a exposição aguda (in vivo) da TCDD sobre a hidrólise de ectonucleotidases em membranas cerebrais de zebrafish. As ectonucleotidases são enzimas capazes de hidrolisar os nucleotídeos e inativar a sinalização mediada pelos nucleotídeos extracelulares. Entre as ectonucleotidases, destacam-se as NTPDases e a ecto-5’-nucleotidase. A atividade de NTPDase demonstrou que não houve diferença significativa na hidrólise de ATP e de ADP, bem como de AMP em membranas cerebrais de zebrafish. Estas descobertas parecem ser importantes para reforçar a idéia de que a indução do gene que codifica à NTPDase2 pode não ser um fator geral da toxicidade de TCDD. No entanto, mais estudos utilizando doses mais elevadas de TCDD e exposição a longo prazo são necessárias.