O estudo de métodos estatísticos na avaliação de métodos diagnósticos tem aumentado consideravelmente nas últimas décadas. Desde o início, quando Yerushalmy (1947) publicou seu traba lho sobre confiabilidade do roentgeno grama na identificação da tuberculose, novas metodologias surgiram para que fosse possível a obtenção de valores de sensibilidade e especificidade de testes diagnósticos. A sensibilidade é definida como a probabilidade de o teste sob investigação fornecer um resultado positivo, dado que o indivíduo é realmen te portador da enfermidade. A especifi cidade, por sua vez, é definida como a probabilidade de o teste fornecer um resultado negativo, dado que o indivíduo está livre da enfermidade. Na prática, é comum ocorrerem situações em que uma proporção de indivíduos selecionados não pode ter o estado real da doença verificado, por se tratar de procedimentos invasivos, como no diagnóstico de câncer de pulmão, ou quaisquer outros casos em que são envolvidos riscos, portanto não praticá veis, nem éticos, ou ainda por serem de alto custo. Assim, em vez de se contornar o proble ma, muitos estudos de avaliação de performance de testes diagnósticos são elaborados apenas com informações de indivíduos verificados. Esse procedimento pode levar a resultados viesados. É o chamado viés de verificação, que consiste no cálculo de estimativas de sensibilidade e especi ficidade de testes diagnósticos quando apenas os indivíduos verificados pelo padrão ouro são inseridos na análise e os não verificados são descartados ou considerados livres de doença. Este trabalho apresenta uma revisão das metodologias já propostas para se calcularem a sensibilidade e a especificidade quando existe o viés de verificação, bem como uma análise detalhada da influência da proporção de indivíduos não verificados, o efeito do tamanho amostral e a escolha de distri buições a priori, quando utilizada a metodologia bayesiana, no cálculo dessas estimativas. Também foi introduzida uma metodologia, sob enfoque bayesiano, para a estimação das medidas de desempenho de dois testes diagnósticos, na presen ça do viés de verificação. / The study of statistical methods on diagnostic tests evaluation has increa sed in the last decades. Since the beginning, when Yerushalmy (1947) published his work about trustwor thiness of the roentgenogram in the identification of the tuberculosis, new methodologies had appeared and so that it was possible to get values of sensi tivity and specificity of diagnostic tests. Sensitivity is defined as the probability of the test under inquiry supply a positive result, since that the individual is really carrying on the disease. The specificity, in the other hand, is defined as the probability of the test supply a negative result, since that the individual is free of the disease. In practice, it is usual to occur situations where a proportion of selected individuals cannot have verified the real state of the illness, to the fact that the verification test can be an invasive procedure, as in the diagnosis of lung cancer, or any other cases where risks are involved, therefore not practicable, nor ethical, or still procedures with high cost. Thus, instead of solve the problem, many studies of evaluation of performance of diagnostic tests are elaborated only using the information of verified individuals. This procedure can leads to biased results. This is known as verification bias, that consists of the calculation of estimates of sensitivity and specificity of diagnostic tests when only the individuals verified by the gold standard test are inserted in the analysis and the unverified ones, discarded or considered that they are free of the disease. This work presents a revision of the methodologies already proposed to calculate sensitivity and the specificity in the presence of the verifi cation bias, as well as a detailed analysis of the influence of the propor tion of individuals not verified, the effect of the sample size and the influ ence of choosing different prior densi ties, when using the bayesian methodo logy, in the calculation of these estima tes. It was also introduced a bayesian methodology to estimate performance measures of two diagnostic tests when the verification bias is present.

O estudo de métodos estatísticos na avaliação de métodos diagnósticos tem aumentado consideravelmente nas últimas décadas. Desde o início, quando Yerushalmy (1947) publicou seu traba lho sobre confiabilidade do roentgeno grama na identificação da tuberculose, novas metodologias surgiram para que fosse possível a obtenção de valores de sensibilidade e especificidade de testes diagnósticos. A sensibilidade é definida como a probabilidade de o teste sob investigação fornecer um resultado positivo, dado que o indivíduo é realmen te portador da enfermidade. A especifi cidade, por sua vez, é definida como a probabilidade de o teste fornecer um resultado negativo, dado que o indivíduo está livre da enfermidade. Na prática, é comum ocorrerem situações em que uma proporção de indivíduos selecionados não pode ter o estado real da doença verificado, por se tratar de procedimentos invasivos, como no diagnóstico de câncer de pulmão, ou quaisquer outros casos em que são envolvidos riscos, portanto não praticá veis, nem éticos, ou ainda por serem de alto custo. Assim, em vez de se contornar o proble ma, muitos estudos de avaliação de performance de testes diagnósticos são elaborados apenas com informações de indivíduos verificados. Esse procedimento pode levar a resultados viesados. É o chamado viés de verificação, que consiste no cálculo de estimativas de sensibilidade e especi ficidade de testes diagnósticos quando apenas os indivíduos verificados pelo padrão ouro são inseridos na análise e os não verificados são descartados ou considerados livres de doença. Este trabalho apresenta uma revisão das metodologias já propostas para se calcularem a sensibilidade e a especificidade quando existe o viés de verificação, bem como uma análise detalhada da influência da proporção de indivíduos não verificados, o efeito do tamanho amostral e a escolha de distri buições a priori, quando utilizada a metodologia bayesiana, no cálculo dessas estimativas. Também foi introduzida uma metodologia, sob enfoque bayesiano, para a estimação das medidas de desempenho de dois testes diagnósticos, na presen ça do viés de verificação. / The study of statistical methods on diagnostic tests evaluation has increa sed in the last decades. Since the beginning, when Yerushalmy (1947) published his work about trustwor thiness of the roentgenogram in the identification of the tuberculosis, new methodologies had appeared and so that it was possible to get values of sensi tivity and specificity of diagnostic tests. Sensitivity is defined as the probability of the test under inquiry supply a positive result, since that the individual is really carrying on the disease. The specificity, in the other hand, is defined as the probability of the test supply a negative result, since that the individual is free of the disease. In practice, it is usual to occur situations where a proportion of selected individuals cannot have verified the real state of the illness, to the fact that the verification test can be an invasive procedure, as in the diagnosis of lung cancer, or any other cases where risks are involved, therefore not practicable, nor ethical, or still procedures with high cost. Thus, instead of solve the problem, many studies of evaluation of performance of diagnostic tests are elaborated only using the information of verified individuals. This procedure can leads to biased results. This is known as verification bias, that consists of the calculation of estimates of sensitivity and specificity of diagnostic tests when only the individuals verified by the gold standard test are inserted in the analysis and the unverified ones, discarded or considered that they are free of the disease. This work presents a revision of the methodologies already proposed to calculate sensitivity and the specificity in the presence of the verifi cation bias, as well as a detailed analysis of the influence of the propor tion of individuals not verified, the effect of the sample size and the influ ence of choosing different prior densi ties, when using the bayesian methodo logy, in the calculation of these estima tes. It was also introduced a bayesian methodology to estimate performance measures of two diagnostic tests when the verification bias is present.

Orientador: José Carlos de Figueiredo Pantoja / Resumo: O objetivo deste estudo foi avaliar novas estratégias de identificação e tratamento de mastite subclínica causada por Streptococcus agalactiae. Dois estudos foram conduzidos para alcançar os objetivos propostos: 1) um ensaio clínico randomizado, para avaliar a eficácia do tratamento de S. agalactiae com cloxacilina intramamária (CLOXIMM), cefquinoma intramamária (CEFIMM) e cefquinoma intramuscular (CEFIM); e avaliar a não-inferioridade da CLOXIMM em relação a CEFIMM. E, 2) um estudo de acurácia diagnóstica, para estimar a acurácia do Somaticell, California Mastitis Test (CMT) e do exame microbiológico do leite composto (leite dos quatro quartos) na detecção de quartos e animais infectados com S. agalactiae. Os resultados indicaram que quartos tratados com CEFIM apresentaram menor taxa de cura bacteriológica (55%) do que aqueles tratados com CLOXIMM (86%) ou CEFIMM (98%). A diferença na proporção de cura bacteriológica entre CEFIMM e CLOXIMM foi de 0,121 (intervalo de confiança de 95%: 0,056 - 0,184). A CLOXIMM foi considerada não inferior a CEFIMM quando margens de não inferioridade de 0,20 e 0,25 foram utilizadas. Contudo, a determinação da não inferioridade foi inconclusiva para margens de 0,10 e 0,15. A cultura do leite composto apresentou acurácia diagnóstica satisfatória (95,7%) quando comparada a cultura individual por quarto. Para identificação dos quartos infectados com S. agalactiae, o ponto de corte considerado mais adequado foi de 205.000 células/mL para o teste So... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The objective of the present study was to assess new strategies to identify and treat Streptococcus agalactiae subclinical mastitis. Two studies were conducted to achieve the proposed objectives: 1) a randomized clinical trial, to assess the efficacy of intramammary cloxacillin (CLOXIMM), intramammary cefquinome (CEFIMM), and intramuscular cefquinome (CEFIM), to treat S. agalactiae intramammary infections (IMI); and assess whether CLOXIMM was non-inferior to CEFIMM to treat S. agalactiae IMI. And, 2) a diagnostic accuracy study, to estimate the accuracy of the Somaticell, California Mastitis Test (CMT), and the composite milk microbiological examination of milk to detect S. agalactiae IMI. Results indicated that the bacteriological cure rate was lower for quarters treated with CEFIM (55%), as compared with CLOXIMM (86%) or CEFIMM (98%). The bacteriological cure difference between CEFIMM and CLOXIMM was 0.121 (95% confidence interval: 0.056 - 0.184). The CLOXIMM was considered non-inferior to CEFIMM when the non-inferiority margins of 0.20 and 0.25 were considered. Nevertheless, determination of non-inferiority was inconclusive for margins of 0.10 and 0.15. Microbiological examination of composite milk was of high accuracy (95.7%), as compared with microbiological examination of quarter milk samples. The thresholds of 205,000 cells/mL for the Somaticell and of score 1 for the CMT can be considered the most appropriate for diagnosing S. agalactiae IMI. The higher sensitivity an... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Submitted by Renorbio (renorbioba@ufba.br) on 2018-04-25T17:41:58Z No. of bitstreams: 1 Tese de Doutorado - Maria da Conceição Aquino de Sá.pdf: 3251110 bytes, checksum: f7580c2d7b59b8cd7c2c1409212927e0 (MD5) / Approved for entry into archive by Delba Rosa (delba@ufba.br) on 2018-05-04T14:16:29Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese de Doutorado - Maria da Conceição Aquino de Sá.pdf: 3251110 bytes, checksum: f7580c2d7b59b8cd7c2c1409212927e0 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-04T14:16:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese de Doutorado - Maria da Conceição Aquino de Sá.pdf: 3251110 bytes, checksum: f7580c2d7b59b8cd7c2c1409212927e0 (MD5) / FUNDACAO DE AMPARO A PESQUISA DO ESTADO DA BAHIA - EDITAL 013/2014 Programa De Bolsas De Mestrado e Doutorado / A procura por produtos da caprino-ovinocultura é frequente e contribui para aumentar a economia mundial, por isso é necessário produzir em larga escala e com qualidade para atender à demanda da população. Entretanto, diversos fatores na criação desses animais ainda necessitam melhorar, principalmente na área sanitária, na qual muitas doenças acometem o rebanho, dentre elas, a Linfadenite Caseosa, doença causada por Corynebacterium pseudotuberculosis, uma bactéria que apresenta sua toxicidade através de genes de virulência, assim como pela produção de biofilme, que protege a bactéria de ambientes hostis. Dessa forma, estudos sobre esse patógeno são necessários, a exemplo do sequenciamento genômico, na busca de conhecer genes para análises de biomoléculas e com isso compreender melhor a sua antigenicidade e imunogenicidade com o objetivo de melhorar a especificidade e sensibilidade de testes sorológicos, utilizados como prevenção da doença no rebanho. Além disso, é essencial entender o mecanismo de patogenicidade desta bactéria no hospedeiro e suas formas de defesa no sistema imunológico do animal. Assim, no presente estudo, foram caracterizados os genomas de quatro cepas de C. pseudotuberculosis, comparando as cepas produtoras (OVI2C, CAPJ4) e não produtoras (OVI03, CAP3W) de biofilme. As cepas foram extraídas para produção de antígenos somáticos e de superfícies. A partir de estudos prévios com immunoblotting, foram escolhidas as cepas de origem caprina (CAPJ4 e CAP3W) para o estudo in vivo com dezoito caprinos da raça Canindé, divididos em três grupos experimentais, um grupo controle e dois grupos infectados com cepas de C. pseudotuberculosis, para avaliar a patogenia clinicamente, realizando hemograma, além de outras análises sorológicas através do ensaio de ELISA e Western Blotting. Também foi realizada a cultura de células sanguíneas para o estudo da imunidade celular com IFN- e cultivo de células mononucleares do sangue periférico para observar a modulação da expressão de proteínas do sistema GTPases, Rab 5 e Rab 7. Após esses estudos, observou-se que os genes contidos no genoma das cepas de C. pseudotuberculosis possuem similaridade, mostrando que eles são altamente conservados. A extração das bactérias resultou em antígenos de superfície F3, que apresentaram reatividade no immunoblotting frente aos soros de ovinos experimentalmente infectados. De todos os antígenos, os de origem caprina, apresentaram melhor antigenicidade. No experimento in vivo, após a infecção dos animais, foram realizadas outras colheitas de sangue e foi possível observar que a cepa produtora de biofilme é mais resistente, causando danos maiores aos animais. Para as condições de infecção experimental, os valores do hemograma estão dentro dos parâmetros. Na análise sorológica os caprinos infectados experimentalmente responderam à exposição primária, o que contribui para o aumento da imunoglobulina IgG. A produção de IFN-  também foi observada. Foi verificado que as cepas de C. pseudotuberculosis produtora e não produtora de biofilme podem alterar a expressão de proteínas Rab 5 e Rab 7 em macrófagos derivados de células mononucleares do sangue periférico cultivados in vitro. Esses resultados forneceram informações importantes para a produção de testes diagnósticos, com maior acurácia. / The consumption of sheep and goat products is frequent and increases the values of world economy, so it is necessary to produce large scale and quality to meet the demand of population. However, several factors in the breeding of these animals still have to improve, especially in sanitary area, where many diseases affect the cattle, among them, Caseous Lymphadenitis, caused by Corynebacterium pseudotuberculosis, a bacterium that presents its toxicity through virulence genes, also by production of biofilm that protects the bacteria from hostile environments. Thus, studies of this pathogen are necessary, such as genomic sequencing, in search to know antigenic genes for biomolecule analysis and with this to understand better its antigenicity and immunogenicity, to be possible improve the specificity and sensitivity of serological tests, that are used as prevention of disease in the herd. Besides, it is essential to understand the mechanism of pathogenicity of this bacterium in host and its forms of defense against the animals immune system. At the present study, the genomes of four strains of C. pseudotuberculosis were characterized, comparing the biofilm producing (OVI2C, CAPJ4) and non-producing (OVI03, CAP3W) strains. These strains were extracted for production of somatic and surfaces antigens. From previous studies with immunoblottingting, strains of goat origin (CAPJ4 and CAP3W) were chosen for in vivo study with 18 Canindé goats, divided into three experimental groups, one control group and two groups infected with strains of C. pseudotuberculosis, to evaluate clinically the pathogenesis and through hemogram, in addition to other serological tests as ELISA assay and Western Blotting. Also was performed blood cell culture for the study of cellular immunity with IFN-, as culture of peripheral blood mononuclear cells to observe the modulation of expression of GTPases, Rab 5 and Rab 7 system proteins. After these studies, it was observed that the genes contained in the genome of the strains of C. pseudotuberculosis are genetically homogeneous, showing that they are highly conserved. The extraction of bacteria resulted in F3 surface antigens, that showed reactivity in immunoblottingting against sera from experimentally infected sheep. Of all antigens, those of goat origin had better antigenicity. At the in vivo experiment, after the infection of animals, other blood samples were collected and it was possible to observe that the biofilm producing strain is more resistant, causing greater damages to animals. For the conditions of experimental infection, blood count values are between normal limits. In the serological analysis, the experimentally infected goats responded to primary exposure, which contributes to increase of immunoglobulin IgG. The production of IFN- was also observed. In conclusion, it was observed that strains of C. pseudotuberculosis producing and not producing biofilm can modify the expression of Rab proteins in macrophages derived from mononuclear cells of peripheral blood cultivated in vitro. These results provided important information for production of diagnostic tests, with greater accuracy.

Made available in DSpace on 2015-12-06T23:46:03Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013 / Associação Fundo de Incentivo à Psicofarmacologia (AFIP) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Introdução: A defiCiência de alfa-1 antitripsina e uma desordem genetica que resulta no aparecimento precoce de enfisema pulmonar e doenca hepatica. A Organizacao Mundial de Saúde e American Thoracic Society /European Respiratory Society preconizam que os pacientes com doenca pulmonar obstrutiva cronica realizem o rastreamento para defiCiência de alfa-1 antitripsina. No entanto, existe a necessidade de exames mais acessiveis para possibilitar a realizacao dessa orientacao em paises com extensa dimensao territorial, como o Brasil. A tecnica em papel filtro e um procedimento simples, que tem sido amplamente utilizado para o rastreamento genetico e diagnostico de diversas doencas. Objetivo: Validacao do metodo de dosagem de alfa-1 antitripsina por imunonefelometria em amostras de papel filtro em pacientes com doenca pulmonar obstrutiva cronica no Brasil. Metodos: Foi analisada a dosagem da alfa-1 antitripsina plasmatica e em papel filtro de 192 pacientes com doenca pulmonar obstrutiva cronica. Para a analise o papel filtro (WhatmanTM, GE, 903, lot W101, USA) foi picotado em discos com diametro de 6 mm e, posteriormente, diluidos em 200 μL de soro fisiologico permanecendo a 4ºC durante 12 horas. Tanto as amostras de papel filtro quanto de plasma foram analisadas no equipamento da Siemens BNII pelo metodo de imunonefelometria. Resultados: O coeficiente de correlacao entre a concentracao de alfa-1 antitripsina serica e no papel filtro foi de r= 0,45. Atraves da tecnica de reamostragem obootstrapo foi determinado um ponto de corte de 2,02 mg/dl, com um intervalo de confianca de 1,45 u 2,64 mg/dL (97%), para o papel filtro. Com o ponto de corte de 2,02 no papel filtro foi observado sensibilidade de 100%, especificidade de 95,7% e valor preditivo positivo de 27,2% e negativo de 100%. Conclusao: O metodo em papel filtro se mostrou uma ferramenta confiavel para o rastreamento de pacientes com defiCiência de alfa-1 antitripsina. Entretanto, recomenda-se que os individuos que apresentarem valores da alfa-1 antitripsina no papel filtro abaixo do valor maximo do intervalo de confianca (2,64 mg/dL) sejam investigados por meio de testes mais especificos, garantindo maior confiabilidade ao metodo / BV UNIFESP: Teses e dissertações

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:05:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissEMP.pdf: 2351835 bytes, checksum: 336e30a60b741bebe39a08dc4f379ba0 (MD5) Previous issue date: 2006-01-05 / In the medical area, diagnostic tests are used to classify a patient as positive or negative with respect to a given disease. There are simple and more elaborate tests, each one with a speci9ed rate of misclassi9cation. To verify the accuracy of the medical tests, we could have comparisons with a "gold stantard", here is a test with no error. In many situations we could not have "gold standard", by ethical reasons or by chance that the individual is disease free or by high costs of the test. Joseph et al (1999) introduces a Bayesian approach that solves the lack of a gold standard, by using latent variables. In this work, we introduce this Bayesian methodology giving generalizations in the presence of covariates. A comparative study is made with the presence or not of gold standard to check the accuracy of the medical tests. Some diGerent proportions of patients without gold standard are considered in a simulation study. Numerical examples are considered using the proposed methodology. We conclude the dissertation assuming dependence among two or more tests. / Na área médica testes diagnósticos são usados para classi9car um paciente como positivo ou negativo com relação a uma determinada condição ou moléstia. Existem testes mais simples e outros mais elaborados, cada um fornecendo diferentes chances de erro de classi9cação dos pacientes. Para quanti9car a precisão dos testes diagnósticos, podemos compará-los com testes Padrão Ouro , termo utilizado para testes com satisfatória exatidão, como biopsias, inspeções cirúrgicas e outros. Existem algumas condições que não possuem testes considerados Padrão Ouro, outras até possuem, mas não é ético aplicá-los em indivíduos sem a evidência da moléstia, ou ainda o seu uso pode ser inviável devido a seu alto custo ou por oferecer risco ao paciente. Joseph et al. (1999) [16] propõem a abordagem Bayesiana que supera o problema de pacientes não veri9cados pelo teste Padrão Ouro introduzindo variáveis latentes. Apresentamos também esta metodologia considerando a presença de covariáveis, que fornece subsídios para a tomada de decisão médica. Um estudo comparativo é feito para situações com ausência de Padrão Ouro para todos, alguns ou nenhum paciente, e assim, descrevemos sobre a importância de se considerar uma porcentagem de pacientes veri9cados pelo teste Padrão Ouro para melhores estimativas das medidas de desempenho dos testes diagnósticos. Introduzimos um novo parâmetro que classsi9ca o grupo veri9cado ou não veri9cado pelo teste Padrão Ouro. As metodologias propostas são demonstradas através de exemplos numéricos. Como sugestão de continuidade, demonstramos a metodologia para a veri9cação de dependência condicional entre testes diagnósticos.

Submitted by Rodolfo Santos Rossi null (rodolfosrossi@gmail.com) on 2017-06-20T19:44:52Z No. of bitstreams: 1 Rossi - Dissertação Repositório UNESP.pdf: 1649974 bytes, checksum: eab3c6db952f25d7d6aa51700765d11b (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-06-21T14:07:38Z (GMT) No. of bitstreams: 1 rossi_rs_me_bot.pdf: 1649974 bytes, checksum: eab3c6db952f25d7d6aa51700765d11b (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-21T14:07:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 rossi_rs_me_bot.pdf: 1649974 bytes, checksum: eab3c6db952f25d7d6aa51700765d11b (MD5) Previous issue date: 2017-04-27 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / O objetivo deste estudo foi avaliar novas estratégias de identificação e tratamento de mastite subclínica causada por Streptococcus agalactiae. Dois estudos foram conduzidos para alcançar os objetivos propostos: 1) um ensaio clínico randomizado, para avaliar a eficácia do tratamento de S. agalactiae com cloxacilina intramamária (CLOXIMM), cefquinoma intramamária (CEFIMM) e cefquinoma intramuscular (CEFIM); e avaliar a não-inferioridade da CLOXIMM em relação a CEFIMM. E, 2) um estudo de acurácia diagnóstica, para estimar a acurácia do Somaticell, California Mastitis Test (CMT) e do exame microbiológico do leite composto (leite dos quatro quartos) na detecção de quartos e animais infectados com S. agalactiae. Os resultados indicaram que quartos tratados com CEFIM apresentaram menor taxa de cura bacteriológica (55%) do que aqueles tratados com CLOXIMM (86%) ou CEFIMM (98%). A diferença na proporção de cura bacteriológica entre CEFIMM e CLOXIMM foi de 0,121 (intervalo de confiança de 95%: 0,056 - 0,184). A CLOXIMM foi considerada não inferior a CEFIMM quando margens de não inferioridade de 0,20 e 0,25 foram utilizadas. Contudo, a determinação da não inferioridade foi inconclusiva para margens de 0,10 e 0,15. A cultura do leite composto apresentou acurácia diagnóstica satisfatória (95,7%) quando comparada a cultura individual por quarto. Para identificação dos quartos infectados com S. agalactiae, o ponto de corte considerado mais adequado foi de 205.000 células/mL para o teste Somaticell e escore 1 para o teste CMT. O teste Somaticell foi considerado mais acurado para uso em programas de erradicação, pois apresentou maior sensibilidade e menor proporção de resultados falso-negativos. Resultados deste estudo podem ser aplicados diretamente em nível de campo, para aumentar a eficiência de programas de erradicação de S. agalactiae. / The objective of the present study was to assess new strategies to identify and treat Streptococcus agalactiae subclinical mastitis. Two studies were conducted to achieve the proposed objectives: 1) a randomized clinical trial, to assess the efficacy of intramammary cloxacillin (CLOXIMM), intramammary cefquinome (CEFIMM), and intramuscular cefquinome (CEFIM), to treat S. agalactiae intramammary infections (IMI); and assess whether CLOXIMM was non-inferior to CEFIMM to treat S. agalactiae IMI. And, 2) a diagnostic accuracy study, to estimate the accuracy of the Somaticell, California Mastitis Test (CMT), and the composite milk microbiological examination of milk to detect S. agalactiae IMI. Results indicated that the bacteriological cure rate was lower for quarters treated with CEFIM (55%), as compared with CLOXIMM (86%) or CEFIMM (98%). The bacteriological cure difference between CEFIMM and CLOXIMM was 0.121 (95% confidence interval: 0.056 - 0.184). The CLOXIMM was considered non-inferior to CEFIMM when the non-inferiority margins of 0.20 and 0.25 were considered. Nevertheless, determination of non-inferiority was inconclusive for margins of 0.10 and 0.15. Microbiological examination of composite milk was of high accuracy (95.7%), as compared with microbiological examination of quarter milk samples. The thresholds of 205,000 cells/mL for the Somaticell and of score 1 for the CMT can be considered the most appropriate for diagnosing S. agalactiae IMI. The higher sensitivity and lower proportion of false-negative results are characteristics that can justify the use of the Somaticell in S. agalactiae eradication programs, as an alternative to the CMT. Results of this study can be directly applied at the farm level, to improve the efficiency of S. agalactiae eradication programs. / CNPq: 132538-2015-6

Submitted by Gustavo José Luvizutto null (gluvizutto@fmb.unesp.br) on 2016-06-17T14:29:20Z No. of bitstreams: 1 Tese_Doutorado_Gustavo_Final.pdf: 2479589 bytes, checksum: 29a51ed15da908051b8667068b430e40 (MD5) / Rejected by Juliano Benedito Ferreira (julianoferreira@reitoria.unesp.br), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo a orientação abaixo: O arquivo submetido não contém o certificado de aprovação. A versão submetida por você é considerada a versão final da dissertação/tese, portanto não poderá ocorrer qualquer alteração em seu conteúdo após a aprovação. Corrija esta informação e realize uma nova submissão contendo o arquivo correto. Agradecemos a compreensão. on 2016-06-22T14:48:29Z (GMT) / Submitted by Gustavo José Luvizutto null (gluvizutto@fmb.unesp.br) on 2016-06-23T11:32:49Z No. of bitstreams: 1 Tese_Doutorado_Gustavo_Final.pdf: 2479589 bytes, checksum: 29a51ed15da908051b8667068b430e40 (MD5) / Approved for entry into archive by Juliano Benedito Ferreira (julianoferreira@reitoria.unesp.br) on 2016-06-23T19:56:57Z (GMT) No. of bitstreams: 1 luvizutto_gj_dr_bot.pdf: 2479589 bytes, checksum: 29a51ed15da908051b8667068b430e40 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-23T19:56:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 luvizutto_gj_dr_bot.pdf: 2479589 bytes, checksum: 29a51ed15da908051b8667068b430e40 (MD5) Previous issue date: 2016-06-16 / Não recebi financiamento / Introdução: A negligência espacial unilateral (NEU) é caracterizada pela incapacidade de reportar ou responder pessoas ou objetos do lado contralateral à lesão cerebral, e ocorre principalmente após Acidente Vascular Cerebral (AVC) do lobo parietal direito, sendo associada à pior desfecho funcional à longo prazo. Objetivo: Os objetivos desta tese foram: normatizar os principais testes diagnósticos de NEU e verificar a relação com fatores sócio-demográficos na população brasileira; avaliar as variáveis bioquímicas que interferem na NEU na fase aguda do AVC; e revisar sistematicamente os principais tratamentos farmacológicos na NEU em pacientes após AVC. Método: Para o primeiro objetivo foi realizado estudo transversal em 150 indivíduos sem alterações neurológicas, sendo aplicados: teste face-mão (TFM), testes de cancelamento de linhas (TCL), cancelamento de estrelas (TCE) e bisseção de linhas (TBL). Os resultados dos testes foram relacionados com o perfil sócio demográfico da população, sendo estipulado pontos de cortes para a normalidade; para o objetivo 2 foi realizado estudo observacional em 40 indivíduos com diagnostico de NEU após AVC. Foram aplicados os TCL, TCE e TBL, sendo relacionado com o nível de hemoglobina na fase aguda do AVC corrigido para potenciais confundidores; para o objetivo 3 foi realizado revisão sistemática de literatura por meio de ensaios clínicos randomizados e quasi-randomizados para determinar o melhor tratamento farmacológico. Resultados: os resultados do objetivo 1 estão apresentados nos artigos 1 e 2; o objetivo 2 no artigo 3; e o objetivo 3 no artigo 4. Conclusão: Com base nos resultados obtidos dos artigos 1 e 2, o TFM apresenta taxa de normalidade entre 8 a 10 estímulos sensoriais, com prevalência de extinção associada com o grau de escolaridade e aumento da idade; no TCL o ponto de corte para considerar NEU é acima de 0 e no TCE acima de 2, ambos associados à idade. No TBL o ponto médio de corte para considerar NEU foi de 6,6 mm, associado com pior escolaridade. No artigo 3 foi observado que quanto menor o valor de hemoglobina na fase aguda do AVC, pior o desempenho nos testes de NEU; No artigo 4 foi observado que a efetividade e segurança dos tratamentos farmacológicos para NEU após AVC permanecem incertos, necessitando de ensaios clínicos randomizados adicionais para avaliar o efeito deste tratamento. / Background: Unilateral spatial neglect (USN) is characterized by the inability to report or respond to people or objects presented on the side contralateral to the lesioned side of the brain and has been associated with poor functional outcomes. Objective: The objectives of this thesis were: to standardize the USN tests and verify the relationship with socio-demographic data in the Brazilian population; evaluate the biochemical variables that influence in USN tests after acute stroke; and systematically review the pharmacological interventions to treat USN after stroke. Method: For the first aim, we performed a cross-sectional study of 150 individuals without neurological changes by applying: face-hand test (FHT), line cancellation test (LCT), star cancellation test (SCT) and line bisection test (LBT). The test results were related to the sociodemographic data, with cutoff points being stipulated to define USN; the second aim was achieved by conducting an observational study of 40 individuals with USN after acute stroke. The tests applied – LCT, SCT and LBT – were correlated with the hemoglobin level in the acute phase of stroke corrected by confounders; the third aim was analyzed by a systematic review of randomized controlled trials and quasi-randomized clinical trials to determine the efficacy of pharmacological intervention. Results: The first aim is presented in Articles 1 and 2, the second aim in Article 3 and the third in Article 4. Conclusion: Based on the results of Articles 1 and 2, the FHT shows normal rate between 8-10 sensory stimuli, with an extinction prevalence associated with the education level and increasing age; The LCT cutoff point to define is USN above 0 and SCT above 2, and both were associated with age. The LBT cutoff point to indicate NEU was 6.6 mm, associated with poorer education level. Article 3 reveals the relationship between a lower hemoglobin level in acute phase of stroke with worse performance on USN tests; Article 4 reports that the effectiveness and safety of pharmacological treatments for USN after stroke remain uncertain, requiring additional randomized clinical trials to evaluate the effect of treatment.

Orientador: Luiz Antônio de Lima Resende / Resumo: Introdução: A negligência espacial unilateral (NEU) é caracterizada pela incapacidade de reportar ou responder pessoas ou objetos do lado contralateral à lesão cerebral, e ocorre principalmente após Acidente Vascular Cerebral (AVC) do lobo parietal direito, sendo associada à pior desfecho funcional à longo prazo. Objetivo: Os objetivos desta tese foram: normatizar os principais testes diagnósticos de NEU e verificar a relação com fatores sócio-demográficos na população brasileira; avaliar as variáveis bioquímicas que interferem na NEU na fase aguda do AVC; e revisar sistematicamente os principais tratamentos farmacológicos na NEU em pacientes após AVC. Método: Para o primeiro objetivo foi realizado estudo transversal em 150 indivíduos sem alterações neurológicas, sendo aplicados: teste face-mão (TFM), testes de cancelamento de linhas (TCL), cancelamento de estrelas (TCE) e bisseção de linhas (TBL). Os resultados dos testes foram relacionados com o perfil sócio demográfico da população, sendo estipulado pontos de cortes para a normalidade; para o objetivo 2 foi realizado estudo observacional em 40 indivíduos com diagnostico de NEU após AVC. Foram aplicados os TCL, TCE e TBL, sendo relacionado com o nível de hemoglobina na fase aguda do AVC corrigido para potenciais confundidores; para o objetivo 3 foi realizado revisão sistemática de literatura por meio de ensaios clínicos randomizados e quasi-randomizados para determinar o melhor tratamento farmacológico. Resultados: os resul... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Doutor

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No. of bitstreams: 1 delianevileladeoliveira.pdf: 2301067 bytes, checksum: f01e829116b34f9daf190e8d706de303 (MD5) Previous issue date: 2013-07-11 / Resumo: Pesquisa quantiqualitativa cuja trajetória metodológica visou analisar as representações sociais da punção venosa entre indivíduos adultos que vivenciaram a experiência com o processo de punção de vasos periféricos. Adotou-se múltiplos métodos e técnicas. Na abordagem quantitativa foi realizado um survey e no delineamento qualitativo foram utilizadas entrevistas individuais com aplicação das técnicas de “recorte e colagem de gibi” e “evocação livre”. A aplicação destas técnicas visou captar as variáveis intervenientes sobre o processo de punção de vasos periféricos e subsidiar a identificação dos elementos e caracterizar a relevância da representação social sobre tal processo. Dados obtidos no período de outubro/2012 a fevereiro/2013, por meio de entrevistas individuais gravadas e registro cursivo em diário de campo, realizados numa instituição hospitalar (setor de internação convencional) e num serviço de terapia renal substitutiva. Amostra de seleção completa. Após a aplicação dos critérios de elegibilidade e exclusão, foram realizadas 365 abordagens de coleta de dados, tendo participado 235 pessoas na fase do survey, das quais 120 estavam internadas, 75 estavam em hemodiálise e 40 coletaram sangue. Houve abordagem individualizada do questionário com auxílio para preenchimento. Técnica de evocação aplicada a partir de entrevista com participação de 90 pessoas, sendo 30 delas internadas, em coleta de sangue ou em tratamento hemodialítico. Foram obtidas 444 palavras/expressões evocadas para cinco das solicitadas. Na aplicação da técnica de “recorte e colagem de gibi” e gravação do discurso explicativo participaram 60 pessoas, sendo 20 em cada situação abordada. Foi oferecido o mesmo material de figuras para os participantes desta etapa. Um mesmo participante integrou uma ou mais técnicas. Os dados do survey foram tratados em software Statistical Package for the Social Sciences (SPSS) versão 20 com análise descritiva. Os dados provenientes da evocação formaram o corpus, sendo consolidados no software EVOC versão 2000 com análise pela técnica do quadro de quatro casas. E os conteúdos obtidos pela técnica de recorte e colagem de gibi foram consolidados no software NVivo versão 10 e analisados segundo similitude de expressões. Todas as informações foram abordadas com padrões de anonimato, utilizando nomes de flores, pedras ou cores. Foram atendidos todos os requisitos éticos e legais de pesquisa envolvendo seres humanos. No perfil dos participantes da fase survey predominou a participação de mulheres na coleta de sangue e de homens internados ou em tratamento hemodialítico; com idade mais nova entre mulheres que coletavam sangue; predomínio de pele declarada como branca (40%), menos de nove anos de escolaridade (65%), união estável (55%) e filhos. Sendo o processo de punção de vasos um procedimento técnico/científico, os usuários, porém, se apropriam do mesmo de forma particular, havendo destaque de algumas etapas em detrimento de outras. Foi possível identificar as variáveis intervenientes (exposição às diferentes situações e ocasiões de ocorrência do processo de punção de vasos) comparando-as com as variáveis de desfecho, ou seja, com os sentimentos, percepções e comportamentos dos participantes diante do processo de punção de vasos sanguíneos. Houve modificação de percepções, de sentimentos e de comportamentos ao longo das etapas do processo de punção dos vasos. No período que antecedeu a introdução da agulha no interior do vaso houve predomínio de sentimentos de medo, desconforto, ansiedade, indiferença e normalidade e foram adotados comportamentos de silêncio, colaboração, normalidade e de "acostumado", embora xx acompanhados pelo nervosismo das pessoas que fizeram hemodiálise. O período de introdução da agulha foi vivenciado com sentimentos de dor e desconforto e comportamentos de colaboração, silêncio e nervosismo, com ocasional desvio do olhar para não acompanhar o procedimento técnico realizado. Manter a agulha no interior do vaso gerou predomínio de sentimentos de limitação de movimento e desconforto quando o período foi prolongado e houve comportamento de colaboração. O sentimento de alívio e a sensação de ardência foram aqueles que predominantemente emergiram por ocasião da remoção do cateter do interior do vaso e os participantes mencionaram adotar comportamentos de colaboração e de indiferença frente à remoção. No período pós-remoção predominaram os sentimentos de indiferença, alívio, normalidade e nada e comportamentos de silêncio e colaboração, caracterizando a não percepção deste momento como uma etapa do processo, exceção feita às pessoas que realizaram hemodiálise. Os resultados evidenciaram que a estrutura das representações sociais do processo de punção de vasos foi composta pelos elementos centrais de dor e medo. Como elementos periféricos apareceram a insegurança, quem punciona, habilidade profissional, resultado, repuncionar e sangrar, configurando uma abordagem negativa ou neutra expressa em diferentes situações de punções que se apoiaram em experiências, informações, julgamento de valores, concepção de sua finalidade e percepção sensorial, o que foi reafirmado pela técnica de recorte e colagem. Captar as representações sociais através dos sentimentos e comportamentos, bem como, conhecimentos, valores e experiências das pessoas que possuem seus vasos puncionados para fins de coleta de sangue, terapêutica farmacológica ou hemodialítica durante o processo de punção possibilitou fazer uma releitura da punção de vasos. Enquanto atividade processual, evidenciaram-se demandas de cuidado para as quais o enfermeiro dispõe de oportunidades para imprimir ao cuidado orientações educacionais, ações terapêuticas e gerenciais e captar/utilizar evidências a partir da investigação. Foram caracterizadas respostas dos indivíduos para as quais o enfermeiro é capaz de minimizar sentimentos e comportamentos negativos e favorecer formas positivas de enfrentamento. Ao propor-se uma abordagem quantiqualitativa, utilizando múltiplos métodos e técnicas a partir de um recorte conceitual e metodológico, a presente investigação mostrou-se enriquecedora e criativa e trouxe como limite a não comparação entre os participantes enquanto grupos que possuem vivências peculiares no processo de punção de vasos sanguíneos. / Abstract: Quanti-qualitative research whose methodological route intended to analyze the social representations of venipuncture among adults who have experienced the peripheral vessels puncture. Multiple methods and techniques were adopted. During the quantitative approach a survey research was conducted, while in the qualitative approach individual interviews were taken, applying the techniques of "cutting and pasting of comics" and "free recall". The application of these techniques aimed to capture intervening variables on the process of puncturing peripheral vessels and support the identification of elements and characterize the relevance of the social representation of this process. Data obtained from October 2012 to February 2013 through individually recorded interviews and field diary, both conducted in a hospital (regular hospitalization area) and in a program of renal replacement therapy. Sample selection complete. After applying the eligibility and exclusion criteria, there were 365 approaches for data collection, 235 people participated in the phase of the survey, of whom 120 were hospitalized, 75 were on hemodialysis and 40 collected blood samples. There was individualized approach and help to fill the questionnaire. Evocation technique applied in the interviews, with participation of 90 people, 30 of them hospitalized for blood collection or hemodialysis. With the inductive term appointed (process of vessel puncture). We obtained 444 words/expressions evoked to five of the requested. In applying the technique of "cutting and pasting of comics" and recording the explanatory discourse 60 people participated, 20 in each situation addressed. The same comics were shown to the participants of this step. A participant joined one or more techniques. For the treatment of the survey data, with descriptive analysis, was used the Statistical Package for Social Sciences (SPSS) version 20. Evocation data formed the corpus, consolidated in EVOC 2000 version, and were analyzed through the fourhouse board technique. The contents obtained by the technique of cutting and pasting the comics were consolidated into NVivo software version 10 and analyzed according to similarity of expressions. All information has been addressed with patterns of anonymity, using names of flowers, stones or colors. We met all ethical and legal requirements for research involving humans. In the survey phase participants profile predominated the participation of women in blood sample collection and men hospitalized or undergoing hemodialysis, with younger age among women who collected blood; predominance of skin declared as white (40%), less than nine years of education (65%), marital stability (55%) and children. As the process of vessel puncture is a technical/scientific procedure, users, however, interpret it in a particular way, featuring some steps over others. It was possible to identify the intervening variables (exposure to different situations and times of occurrence of vessels puncture processes) compared with the outcome variables, i.e., the feelings, perceptions and behaviors of the participants before the process of puncturing blood vessels. There was a modification of perceptions, feelings and behaviors throughout the stages of the process of vessels puncturing. In the period preceding the introduction of the needle inside the vessel there was a predominance of feelings of fear, discomfort, anxiety, indifference and normality and behaviors of xxii silence, collaboration, normality and "being used to" were adopted, although accompanied by the nervousness of those people in hemodialysis. The length of the needle insertion was experienced with feelings of pain and discomfort and behaviors of collaboration, silence and nervousness, with occasional gaze deviation, not to follow the technical procedure performed. Maintaining the needle in the vessel predominantly generated feelings of limitation of movement and discomfort when the period was extended. There was also the behavior of collaboration. The feeling of relief and burning sensation were predominantly those who emerged during the removal of the catheter inside the vessel and the participants mentioned to adopt behaviors of collaboration and indifference to the removal. In the post-removal time predominated feelings of indifference, relief, normality and nothing and behaviors of silence and collaboration, showing the non-perception of this moment as a step of the process, except to people who underwent hemodialysis. The results showed that the structure of social representations of vessel puncture was composed by the central elements of pain and fear. The peripheral elements appeared insecurity, who punctures, professional skill, result, repuncturing and bleed, setting a neutral or negative approach expressed in different puncture situations that relied on experience, information, value judgment, conception of its purpose and sensory perception, what was reaffirmed by the technique of cutting and pasting. To capture the social representations through the feelings and behaviors, as well as knowledge, values, experiences of people own their vessels punctured for the purpose of blood collection, drug therapy or hemodialysis during puncture, allowed to reread the puncture of vessels. While a procedural activity, care demands showed up for which the nurse has opportunities to print educational guidelines, therapeutic and management actions and to capture/use evidences from the investigation. Answers of individuals were characterized for which the nurse is able to minimize negative feelings and behaviors and to encourage positive ways of coping. In proposing a quanti-qualitative approach, using multiple methods and techniques from a conceptual and methodological framework, this research proved to be enriching and creative and brought as its limitation the not comparison of the participants while groups that have peculiar experiences in the process of blood vessels puncturing.