• Refine Query
  • Source
  • Publication year
  • to
  • Language
  • 468
  • 124
  • 70
  • 34
  • 24
  • 20
  • 20
  • 20
  • 20
  • 20
  • 20
  • 20
  • 14
  • 12
  • 11
  • Tagged with
  • 910
  • 877
  • 195
  • 112
  • 100
  • 95
  • 76
  • 75
  • 72
  • 71
  • 70
  • 69
  • 65
  • 58
  • 52
  • About
  • The Global ETD Search service is a free service for researchers to find electronic theses and dissertations. This service is provided by the Networked Digital Library of Theses and Dissertations.
    Our metadata is collected from universities around the world. If you manage a university/consortium/country archive and want to be added, details can be found on the NDLTD website.
861

Analyse fonctionelle de la nouvelle famille de facteur de transcription GeBP/GPL dans le contrôle du développement d'Arabidopsis thaliana

Chevalier, Florian 31 October 2008 (has links) (PDF)
Notre équipe de recherche étudie l'action des hormones gibbérellines (GA) et cytokinines (CK) dans les processus de développement chez la plante modèle Arabidopsis thaliana. En recherchant des régulateurs de l'expression d'un gène impliqué dans la différenciation des cellules épidermiques et dont l'expression est contrôlée par ces deux hormones, une nouvelle famille de quatre protéines nommées GeBP (GL1 enhancer Binding Protein), GPL1 (GeBP Protein Like 1), GPL2 et GPL3 a été identifiée au laboratoire. Le but de ce travail de thèse était de caractériser moléculairement et fonctionnellement les membres de cette nouvelle famille multigénique.<br /> Nous avons tout d'abord vérifié l'adressage nucléaire des protéines GeBP/GPL et démontré leur capacité à former des dimères in planta via un motif Leucine-Zipper non canonique. L'analyse fonctionnelle a été abordée par l'étude de lignées simples et multiples mutantes gebp/gpl. Différentes données physiologiques et moléculaires convergentes ont démontré un rôle redondant des gènes GeBP/GPL dans le contrôle de la réponse aux CK. Enfin, une analyse globale des transcriptomes d'une lignée surexpresseur de GPL2 et du quadruple mutant gebp/gpl, nous a permis d'établir un lien entre les GeBP/GPL et CPR5, un gène impliqué dans la réponse aux pathogènes, et le contrôle du cycle cellulaire. Ce lien a été conforté expérimentalement par des mesures de ploïdies des noyaux des cellules foliaires montrant une dérégulation du cycle cellulaire chez la lignée quadruple mutant et la lignée surexpresseur de GPL2.<br />Les futurs travaux auront pour but de poursuivre l'étude de la fonction des GeBP/GPL et de confirmer le lien avec CPR5.
862

Genetic And Biochemical Studies On Genes Involved In Leaf Morphogenesis

Aggarwal, Pooja 02 1900 (has links)
Much is known about how organs acquire their identity, yet we are only beginning to learn how their shape is regulated. Recent work has elucidated the role of coordinated cell division & expansion in determining plant organ shape. For instance, in Antirrhinum, leaf shape is affected in the cincinnata (cin) mutant because of an alteration in the cell division pattern. CIN codes for a TCP transcription factor and controls cell proliferation. It is unclear how exactly CIN-like genes regulate leaf morphogenesis. We have taken biochemical and genetic approach to understand the TCP function in general and the role of CIN-like genes in leaf morphogenesis in Antirrhinum and Arabidopsis. Targets of CINCINNATA To understand how CIN controls Antirrhinum leaf shape, we first determined the consensus target site of CIN as GTGGTCCC by carrying out RBSS assay. Mutating each of this target sequence, we determined the core binding sequence as TGGNCC. Hence, all potential direct targets of CIN are expected to contain a TGGNCC sequence. Earlier studies suggested that CIN activates certain target genes that in turn repress cell proliferation. To identify these targets, we compared global transcripts of WT and cin leaves by differential display PCR and have identified 18 unique, differentially expressed transcripts. To screen the entire repertoire of differentially expressed transcripts, we have carried out extensive micro-array analysis using 44K Arabidopsis chips as well as 13K custom-made Antirrhinum chips. Combining the RBSS data with the results obtained from the micro-array experiments, we identified several targets of CIN. In short, CIN controls expression of the differentiation-specific genes from tip to base in a gradient manner. In cin, such gradient is delayed, thereby delaying differentiation. We also find that gibberellic acid, cytokinin and auxin play important role in controlling leaf growth. Genetic characterization of CIN-homologues in Arabidopsis Arabidopsis has 24 TCP genes. Our work and reports from other groups have shown that TCP2, 4 and 10 are likely to be involved in leaf morphogenesis. These genes are controlled by a micro RNA miR319. To study the role of TCP4, the likely orthologue of CIN, we generated both stable and inducible RNAi lines. Down-regulation of TCP4 transcript resulted in crinkly leaves, establishing the role of TCP4 in leaf shape. To study the function of TCP2, 4 & 10 in more detail, we isolated insertion mutants in these loci. The strongest allele of TCP4 showed embryonic lethal phenotype, indicating a role for TCP4 in embryo growth. All other mutants showed mild effect on leaf shape, suggesting their redundant role. Therefore, we generated and studied various combinations of double and triple mutants to learn the concerted role of these genes on leaf morphogenesis. To further study the role of TCP4 in leaf development, we generated inducible RNAi and miRNA-resistant TCP4 transgenic lines and carried out studies with transient down-regulation and up-regulation of TCP4 function. Upon induction, leaf size increased in RNAi transgenic plants whereas reduced drastically in miR319 resistant lines, suggesting that both temporal & spatial regulation of TCP4 is required for leaf development. Biochemical characterization of TCP domain To study the DNA-binding properties of TCP4, random binding site selection assay (RBSS) was carried out and it was found that TCP4 binds to a consensus sequence of GTGGTCCC. By patmatch search and RT-PCR analysis, we have shown that one among 74 putative targets, EEL (a gene involved in embryo development), was down regulated in the RNAi lines of TCP4. This suggests that EEL could be the direct target of TCP4. We have tested this possibility in planta by generating transgenic lines in which GUS reporter gene is driven by EEL upstream region with either wild type or mutated TCP4 binding site. GUS analysis of embryos shows that transgenic with mutated upstream region had significantly reduced reporter activity in comparison to wild type, suggesting that EEL is a direct target of TCP4. We have further shown that TCP4 also binds to the upstream region of LOX2, a gene involved in Jasmonic acid (JA) biosynthesis (in collaboration with D. Weigel, MPI, Tubingen, Germany). TCP domain has a stretch of basic residues followed by a predicted helix-loop-helix region (bHLH), although it has little sequence homology with canonical bHLH proteins. This suggests that TCP is a novel and uncharacterized bHLH domain. We have characterized DNA-binding specificities of TCP4 domain. We show that TCP domain binds to the major groove of DNA with binding specificity comparable to that of bHLH proteins. We also show that helical structure is induced in the basic region upon DNA binding. To determine the amino acid residues important for DNA binding, we have generated point mutants of TCP domain that bind to the DNA with varied strength. Our analysis shows that the basic region is important for DNA binding whereas the helix-loop-helix region is involved in dimerization. Based on these results, we have generated a molecular model for TCP domain bound to DNA (in Collaboration with Prof. N. Srinivasan, IISc, Bangalore). This model was validated by further site-directed mutagenesis of key residues and in vitro assay. Functional analysis of TCP4 in budding yeast To assess TCP4 function in regulation of eukaryotic cell division, we have introduced TCP4 in S. cerevisiae under the GAL inducible promoter. TCP4 induction in yeast cells always slowed down its growth, indicative of its detrimental effect on yeast cell division. Flow cytometry analysis of synchronized cells revealed that TCP4 arrests yeast cell division specifically at G1→S boundary. Moreover, induced cells showed distorted cell morphology resembling shmoo phenotype. Shmooing is a developmental process which usually happened when the haploid cells get exposed to the cells of opposite mating type and get arrested at late G1 phase due to the inhibition of cdc28-cln2 complex. This suggested that TCP4-induced yeast cells are arrested at late G1 phase probably by the inhibition of cdc28-cln2 complex. To further investigate how TCP4 induce G1→S arrest, we carried out microarray analysis and found expression of several cell cycle markers significantly altered in TCP4-induced yeast cells. Studies on crinkly1, a novel leaf mutant in Arabidopsis To identify new genes involved in leaf morphogenesis, we have identified crinkly1 (crk1), a mutant where leaf shape and size are altered. We observed that crk1 also makes more number of leaves compared to wild type. Phenotypic analysis showed that crk1 leaf size is ~5 times smaller than that of wild type. Scanning electron microscopy (SEM) showed that both cell size and number are reduced in the mutant leaf, which explains its smaller size. We have mapped CRK1 within 3 cM on IV chromosome.
863

A knowledgebase of stress reponsive gene regulatory elements in arabidopsis Thaliana

Adam, Muhammed Saleem January 2011 (has links)
<p>Stress responsive genes play a key role in shaping the manner in which plants process and respond to environmental stress. Their gene products are linked to DNA transcription and its consequent translation into a response product. However, whilst these genes play a significant role in manufacturing responses to stressful stimuli, transcription factors coordinate access to these genes, specifically by accessing a gene&rsquo / s promoter region which houses transcription factor binding sites. Here transcriptional elements play a key role in mediating responses to environmental stress where each transcription factor binding site may constitute a potential response to a stress signal. Arabidopsis thaliana, a model organism, can be used to identify the mechanism of how transcription factors shape a plant&rsquo / s survival in a stressful environment. Whilst there are numerous plant stress research groups, globally there is a shortage of publicly available stress responsive gene databases. In addition a number of previous databases such as the Generation Challenge Programme&rsquo / s comparative plant stressresponsive gene catalogue, Stresslink and DRASTIC have become defunct whilst others have stagnated. There is currently a single Arabidopsis thaliana stress response database called STIFDB which was launched in 2008 and only covers abiotic stresses as handled by major abiotic stress responsive transcription factor families. Its data was sourced from microarray expression databases, contains numerous omissions as well as numerous erroneous entries and has not been updated since its inception.The Dragon Arabidopsis Stress Transcription Factor database (DASTF) was developed in response to the current lack of stress response gene resources. A total of 2333 entries were downloaded from SWISSPROT, manually curated and imported into DASTF. The entries represent 424 transcription factor families. Each entry has a corresponding SWISSPROT, ENTREZ GENBANK and TAIR accession number. The 5&rsquo / untranslated regions (UTR) of 417 families were scanned against TRANSFAC&rsquo / s binding site catalogue to identify binding sites. The relational database consists of two tables, namely a transcription factor table and a transcription factor family table called DASTF_TF and TF_Family respectively. Using a two-tier client-server architecture, a webserver was built with PHP, APACHE and MYSQL and the data was loaded into these tables with a PYTHON script. The DASTF database contains 60 entries which correspond to biotic stress and 167 correspond to abiotic stress while 2106 respond to biotic and/or abiotic stress. Users can search the database using text, family, chromosome and stress type search options. Online tools have been integrated into the DASTF&nbsp / database, such as HMMER, CLUSTALW, BLAST and HYDROCALCULATOR. User&rsquo / s can upload sequences to identify which transcription factor family their sequences belong to by using HMMER. The website can be accessed at http://apps.sanbi.ac.za/dastf/ and two updates per year are envisaged.</p>
864

Etude biochimique et immunocytochimique de l'impact de mutations génétiques sur la lignification et l'assemblage des parois d'Arabidopsis thaliana

Berrio-Sierra, Jimmy 17 December 2007 (has links) (PDF)
La biomasse végétale suscite un intérêt accru en raison de son potentiel pour les énergies de remplacement du pétrole. Dans toutes ces formes d'utilisation et de valorisation, la paroi cellulaire lignocellulosique occupe un rôle central. C'est dans ce contexte d'une meilleure connaissance de la structure fine de la paroi secondaire lignifiée et de la fonction des polymères constitutifs dans l'élaboration du biocomposite qu'est la paroi que se situent les travaux réalisés dans le cadre de cette thèse.<br />Plusieurs mutants nuls de la plante modèle Arabidopsis thaliana, dont un ou plusieurs gènes (cinnamoyl-CoA-réductase, mutant ccr1 ; cinnamyl alcohol deshydrogénase, mutants cad-c et cad-d ; aldéhyde déshydrogénase, mutant ref1 ; férulate 5-hydroxylase, mutant f5h) impliqués dans la synthèse des alcools coniférylique et sinapylique, précurseurs des unités G et S des lignines, ont été totalement réprimés, ont constitué les modèles utilisés pour étudier les effets de la mutation sur la composition et la structure des parois. L'analyse biochimique des lignines des plantes mutantes par thioacidolyse, d'une part, et l'étude à l'échelle ultrastructurale par immunomarquage en microscopie électronique, d'autre part, ont constitué les deux principales approches complémentaires privilégiées par lesquelles il a été possible de décrire les impacts des mutations sur la structure des lignines et par là sur l'assemblage macromoléculaire des parois. Les conséquences des mutations se sont avérées tissu-spécifiques et suggèrent une régulation spatio-temporelle de la lignification accompagnant la différenciation. La comparaison des altérations induites dans l'assemblage des parois par les différentes mutations a permis de déduire que les structures non-condensées des lignines assuraient un rôle important dans la cohésion du composite cellulose-hémicelluloses-lignines. L'analyse des impacts des mutations simples ou multiples des différents gènes montre que les effets sur les lignines et les parois ne correspondent pas à la simple sommation des effets de chacune des mutations des gènes, suggérant des régulations croisées. Le développement d'une nouvelle approche de microanalyse impliquant la microdissection à capture laser a permis de préciser pour la première fois les différences analytiques des lignines des fibres par rapport aux vaisseaux, et a montré tout son potentiel pour l'analyse de l'impact des mutations à l'échelle tissulaire.
865

Dynamique des hélitrons dans le genome d'Arabidopsis thaliana : développement de nouvelles stratégies d'analyse des éléments transposables

Tempel, Sébastien 18 June 2007 (has links) (PDF)
Les hélitrons constituent un groupe d'éléments transposables découverts récemment dans les génome eucaryotes. A travers une étude bioinformatique, nous avons étudié leur mode d'invasion, la modularité de leur séquence et leurs impacts sur les gènes à leur proximité dans le génome d'Arabidopsis thaliana. Les hélitrons sont les éléments transposables les plus répandus dans ce génome ; néanmoins ils ne sont que partiellement reconnus par des logiciels d'alignement. Nous avons modélisé ces éléments sous la forme d'une grammaire formelle. Cette grammaire est constituée des deux extrémités terminales séparées par une séquence nucléotidique quelconque de taille fixée. Nous avons créé une matrice d'occurrences des modèles associant toutes les combinaisons possibles d'extrémités. La matrice a fait apparaître des associations préférentielles entre certaines extrémités et a permis la découverte de nouvelles familles d'hélitrons chimériques. La détection des ORFs contenant les protéines de transposition a permis de confirmer la relation hélitron autonome non-autonome et de comprendre le mécanisme de création des chimères d'hélitrons. Nous avons proposé une nouvelle nomenclature des hélitrons basée sur leurs extrémités et non sur leur séquence globale. L'étude de la séquence d'une famille d'hélitrons a montré une réorganisation constante des domaines nucléiques entre les différentes copies de cette famille. Pour comprendre cette organisation, nous avons mis au point le logiciel DomainOrganizer qui permet d'observer la composition en domaines des éléments transposables. DomainOrganizer détecte les frontières entre domaines à partir d'un alignement multiple et crée la liste des domaines. A partir de cette liste, il recherche, par un algorithme d'optimisation combinatoire, le nombre minimal de domaines qui recouvrent au maximum l'ensemble des séquences. Enfin, DomainOrganizer visualise et classe les séquences en fonction de leurs domaines. L'analyse par domaines de la famille AtREP21 a permis de comprendre la nature de cette variabilité et de retracer l'histoire évolutive de cette famille à partir de l'identification des domaines. L'étude de la localisation des hélitrons AtREP3 dans ce génome de plante a montré une insertion préférentielle de ceux-ci dans les promoteurs de gènes. Les profils d'expression de ces gènes, nous a permis d'identifier plusieurs clusters. Par ailleurs, les motifs de régulation ont montré une grande variabilité de motifs dans les promoteurs mais pas dans les hélitrons. Ces résultats ont montré que les hélitrons non-autonomes transportent dans leurs séquences internes des motifs de liaisons aux facteurs de transcription. Des analyses complémentaires devront être réalisées pour comprendre l'action régulatrice des hélitrons sur les gènes situés à leur proximité.
866

Harnessing the anabolic properties of dark respiration to enhance sink activity at elevated CO2 using Arabidopsis thaliana L. with partially-suppressed mitochondrial pyruvate dehydrogenase kinase

Weraduwage, Sarathi 17 May 2013 (has links)
Sink limitations in plants reduce the potential for photosynthesis and yield, particularly under conditions that favour enhanced source activity such as elevated CO2 (EC). Dark respiration, considered catabolic, has rarely been exploited to enhance sink activity in plants. Arabidopsis thaliana L. lines with partially-suppressed mitochondrial pyruvate dehydrogenase (mtPDH) kinase (mtPDHK), a negative post-translational regulator of the mtPDH complex, was shown previously to have both elevated mtPDH complex activity and increased seed weight and oil content at ambient CO2 (AC), suggesting an enhancement of sink activity. The mtPDH links glycolysis with the tricarboxylic acid (TCA) cycle. It was hypothesized that Arabidopsis having suppressed mtPDHK will display their greatest plant productivity at EC through a combined enhancement of source and sink activities. Control and transgenic Arabidopsis having either constitutive or seed-specific expression of antisense mtPDHK were grown at either AC or EC. Expression of mtPDHK and mtPDH complex activity in rosette leaves and reproductive tissues were measured, which required the development of an assay to quantify mtPDH activity. Vegetative and reproductive growth over time, seed oil parameters, and leaf net C exchange were also quantified. A parabolic relationship was found between mtPDHK expression and mtPDH activity, reflecting a role for mtPDH in balancing photosynthetic and respiratory processes. A number of growth and seed oil parameters were improved in transgenic lines, particularly at EC; many of these parameters showed a significant linear or quadratic correlation with mtPDHK expression and mtPDH activity. The proportion of very long chain fatty acids was increased in transgenic lines. Leaf net C exchange was enhanced at AC and EC, and particularly in lines showing repression of mtPDHK. The greatest enhancement in total seed and oil productivity was found for the constitutive lines 104 and 31 at EC (up to 2.8 times). These two lines exhibited a significant increase in inflorescence size, an increase in leaf water use efficiency, the lowest rate of mtPDH complex inactivation by ATP, and an intermediary enhancement of mtPDH complex activity in seeds. Thus, it is concluded that the mtPDH plays a key role in regulating sink and source activities in plants. / Natural Sciences and Engineering Research Council (NSERC) through the Green Crop Networks Research Network; Ontario Graduate Scholarship; Syngenta Graduate Scholarship; Ball Farm Services and Agrico Canada Ltd. Scholarship; Mrs. Fred Ball Scholarship; Arthur D. Latornell Scholarship; Hoskins Scholarship; Robb Travel Grant; Registrars and the Deans Scholarship and travel awards and bursaries from the University of Guelph, and the Ontario Agricultural College.
867

A knowledgebase of stress reponsive gene regulatory elements in arabidopsis Thaliana

Adam, Muhammed Saleem January 2011 (has links)
<p>Stress responsive genes play a key role in shaping the manner in which plants process and respond to environmental stress. Their gene products are linked to DNA transcription and its consequent translation into a response product. However, whilst these genes play a significant role in manufacturing responses to stressful stimuli, transcription factors coordinate access to these genes, specifically by accessing a gene&rsquo / s promoter region which houses transcription factor binding sites. Here transcriptional elements play a key role in mediating responses to environmental stress where each transcription factor binding site may constitute a potential response to a stress signal. Arabidopsis thaliana, a model organism, can be used to identify the mechanism of how transcription factors shape a plant&rsquo / s survival in a stressful environment. Whilst there are numerous plant stress research groups, globally there is a shortage of publicly available stress responsive gene databases. In addition a number of previous databases such as the Generation Challenge Programme&rsquo / s comparative plant stressresponsive gene catalogue, Stresslink and DRASTIC have become defunct whilst others have stagnated. There is currently a single Arabidopsis thaliana stress response database called STIFDB which was launched in 2008 and only covers abiotic stresses as handled by major abiotic stress responsive transcription factor families. Its data was sourced from microarray expression databases, contains numerous omissions as well as numerous erroneous entries and has not been updated since its inception.The Dragon Arabidopsis Stress Transcription Factor database (DASTF) was developed in response to the current lack of stress response gene resources. A total of 2333 entries were downloaded from SWISSPROT, manually curated and imported into DASTF. The entries represent 424 transcription factor families. Each entry has a corresponding SWISSPROT, ENTREZ GENBANK and TAIR accession number. The 5&rsquo / untranslated regions (UTR) of 417 families were scanned against TRANSFAC&rsquo / s binding site catalogue to identify binding sites. The relational database consists of two tables, namely a transcription factor table and a transcription factor family table called DASTF_TF and TF_Family respectively. Using a two-tier client-server architecture, a webserver was built with PHP, APACHE and MYSQL and the data was loaded into these tables with a PYTHON script. The DASTF database contains 60 entries which correspond to biotic stress and 167 correspond to abiotic stress while 2106 respond to biotic and/or abiotic stress. Users can search the database using text, family, chromosome and stress type search options. Online tools have been integrated into the DASTF&nbsp / database, such as HMMER, CLUSTALW, BLAST and HYDROCALCULATOR. User&rsquo / s can upload sequences to identify which transcription factor family their sequences belong to by using HMMER. The website can be accessed at http://apps.sanbi.ac.za/dastf/ and two updates per year are envisaged.</p>
868

Mécanismes moléculaires de la réponse des plantes aux radiations ionisantes. Exploration du rôle des glucosinolates dans la réponse antioxydante.

Gicquel, Morgane 14 September 2012 (has links) (PDF)
Les organismes terrestres sont exposés à des faibles doses de radiations ionisantes d'origine naturelle ou anthropique. Les effets majeurs de ces rayonnements sont dus aux dommages sur l'ADN et à la radiolyse de l'eau qui génère un stress oxydant via la production de radicaux libres. De part leur métabolisme secondaire développé, les végétaux sont utilisés pour l'étude des effets des radiations ionisantes et pour la recherche de molécules antioxydantes. Cette thèse financée par la région Bretagne a donc caractérisé la réponse physiologique et moléculaire de la plante modèle Arabidopsis thaliana à des doses faibles (10 Gy) à modérées (40 Gy) de radiations ionisantes, ainsi que le rôle des glucosinolates, composés caractéristiques de la famille des Brassicaceae. Deux études globales en protéomique et en transcriptomique ont révélée : (1) une réponse commune aux deux doses concernant les mécanismes de réparation de l'ADN, la régulation du cycle cellulaire et la protection des structures cellulaires ; (2) Un ajustement du métabolisme énergétique et une activation des voies métaboliques secondaires (i.e. glucosinolates et flavonoïdes) après la dose 10 Gy ; (3) une induction du contrôle enzymatique des ROS, du recyclage des composés cellulaires et de la mort cellulaire programmée après la dose 40 Gy. Le rôle protecteur des glucosinolates a ensuite été exploré. La capacité antioxydante in vitro de certains d'entre eux et de leurs dérivés a été montrée. Leurs effets modulateurs par rapport à l'irradiation ont été testés in vivo sur des marqueurs physiologiques de croissance. L'importance de la teneur en glucosinolates pour avoir un effet positif ou négatif a été mise en évidence.
869

Effet du ver de terre Aporrectodea caliginosa sur la croissance des plantes, leur développement et leur résistance aux pathogènes : réponse physiologique et moléculaire de la plante à l'émission de molécules-signal

Puga Freitas, Ruben, Puga Freitas, Ruben 03 December 2012 (has links) (PDF)
Les plantes se développent et évoluent en interaction avec les organismes du sol. L'impact des vers de terre sur la croissance des plantes, généralement positif, a été attribué à des modifications physiques, chimiques ou biochimiques du sol, souvent sans démonstration rigoureuse. Dans ce travail, les techniques développées en sciences du végétal (culture in vitro, utilisation de mutants et transcriptomique) ont été utilisées afin de comprendre les mécanismes à l'origine de l'effet des vers de terre sur les plantes. Nos résultats apportent de nouvelles connaissances fondamentales: (1) la production de molécules-signal à l'intérieur des déjections de vers de terre a un impact significatif sur la croissance d'Oryza sativa et Lolium perenne. (2) Ces molécules agissent sur la voie de signalisation fortement liée à l'auxine, comme suggéré par l'effet significatif du ver de terre sur la croissance du double mutant d'A. thaliana aux1-7;axr4-2. (3) L'abondance de ces molécules-signal en présence de vers de terre pourrait être liée à la stimulation de certaines populations bactériennes capables de synthétiser de l'auxine. (4) Le ver de terre induit une accumulation de transcrits pour des gènes sous contrôle de l'acide jasmonique et de l'éthylène. Ces hormones sont notamment impliquées dans un mécanisme de résistance systémique induite (ISR), connu pour être induit par certaines rhizobactéries promotrices de la croissance des plantes. Enfin, (5) le piétin échaudage, maladie due à un champignon pathogène, déclenche chez le blé (Triticum aestivum) une réaction d'hypersensibilité et une modification de la signalisation hormonale, qui sont considérées comme des mécanismes de contrôle du métabolisme de la plante qui facilitent l'infection du pathogène. La sévérité de cette maladie est réduite en présence de vers de terre. La synthèse de ces résultats indique que les vers de terre, comme d'autres organismes du sol, modifient l'équilibre hormonal de la plante. L'homéostasie hormonale apparaît comme un élément incontournable pour prédire l'issue des interactions multiples que les plantes entretiennent avec les organismes du sol
870

Calcium signaling in plant defense : involvement of subcellular compartments and glutamate receptors

Manzoor, Hamid 11 May 2012 (has links) (PDF)
Plants do not display an adaptive immune system but express an efficient innate immune system defending them by inducing sophisticated multilevel defense responses against different potential pathogens. Indeed, plant immune responses are triggered upon the detection of many common pathogen- or microbe-associated molecular patterns (PAMPs/MAMPs) through specific pattern-recognition receptors (PRRs) and/or pathogen- or plant-derived signal molecules called elicitors. Cryptogein (Cry) and oligogalacturonides (OGs) are well known elicitors of defense reactions and their recognition induce a Ca2+-dependent signaling pathway: Ca2+ influx and subsequent free cytosolic [Ca2+] ([Ca2+]cyt) variations are earliest steps to trigger downstream plant defense signaling. Here we have demonstrated that elicitor-induced Ca2+ signaling in tobacco also takes place in mitochondria and chloroplasts. Pharmacological studies indicated that IP3-channels play an important role in the regulation of Ca2+ signaling in mitochondria and chloroplasts. Mitochondrial respiration and energy dissipation mechanisms in chloroplasts are partly controlled by [Ca2+] in these organelles. Moreover, using pharmacological and genetic approaches, our data demonstrated that glutamate receptors homologs (GLRs) participate in OGs-mediated Ca2+ signaling in Arabidopsis. GLRs partly control OGs-induced nitric oxide (NO) production, reactive oxygen species (ROS) production and expression of defense-related genes. Importantly, plants treated with GLRs antagonists exhibited compromised resistance to necrotrophic fungal pathogen, Botrytis cinerea and biotrophic oomycete, Hyaloperonospora arabidopsidis. Analysis of Atglr single mutants revealed the important contribution of AtGLR3.3 in resistance against H. arabidopsidis. Moreover, striking similarities in gene expression levels were observed after OGs elicitation/H. arabidopsidis infection. Finally, transcriptomic analysis demonstrated that about 60 % of the total OGs-modulated genes modified their expression in GLRs-dependent manner. These GLRs-dependent genes belong to different functional categories including the category "responses to biotic stresses". Taken together, these data provide strong evidences of 1) elicitor-induced Ca2+ signaling in mitochondria and chloroplasts in tobacco and 2) the regulation of elicitor/pathogen mediated plant defense signaling pathways through GLRs in Arabidopsis thaliana

Page generated in 0.0701 seconds