Obesity and overweight have reached epidemic proportions and their prevalence has increased dramatically in the last decades worldwide. This has resulted in a dramatic increase in the incidence of obesity-associated metabolic alterations including type 2 diabetes, cardiovascular complications, and certain types of cancer. Evidences suggest that bioactive compounds present in fruit and vegetables, including polyphenols (or phenolic compounds), may exert beneficial effects against the development of obesity and associated alterations. Brazil is the world\'s third largest fruit producer and the seventh largest producer of tropical fresh fruits; however, only a few of them are being exploited commercially, perhaps due to the limited amount of information available about their chemical composition, and biochemical, nutritional and functional properties. Cagaita (Eugenia dysenterica DC.) and cambuci (Campomanesia phaea Berg.) are fruit species of the Myrtaceae family growing in the regions of the Brazilian Cerrado and Atlantic Coastal Forest biomes, respectively. Cagaita and cambuci fruits are used in various typical preparations, mainly jams, jellies, ice-cream, and liqueurs; whereas both fruit and leaves are used as popular alternative medicine by local communities to treat various disturbs such as diarrhea, diabetes, and jaundice. Previous studies have demonstrated the antioxidant and antidiabetic potential from cagaita and cambuci polyphenols in in vitro assays. Thus, in the present study, we investigated whether the administration of polyphenol-rich extracts from cagaita and cambuci, at two different doses, protect mice from diet-induced obesity and associated alterations. Two biological models, preventive and therapeutic, were designed for cagaita, and preventive for cambuci. For the preventive protocols, C57BL/6J mice fed either with a chow or a high-fat, high-sucrose (HFHS) diets were daily treated by gavage with water or polyphenols-rich extracts at two doses for 8 weeks. The findings demonstrate that polyphenols from cagaita prevented body weight and fat mass gains, attenuated fasting hyperglycemia and dyslipidemia, and reduced hepatic lipid accumulation. On the other hand, polyphenols from cambuci showed absence of changes in body weight and adiposity; however, an attenuation of adipose tissue inflammation was observed for both doses tested. Additionally, polyphenols from cambuci were effective in ameliorating glucose tolerance, as well as reducing fasting hyperglycemia, and improving dyslipidemia. For the therapeutic protocol, C57BL/6J obese mice induced by the intake of a HFHS diet for six weeks were treated with polyphenols from cagaita at two doses by oral gavage for further 8 weeks. Polyphenols from cagaita improved glucose homeostasis and attenuated dyslipidemia in obese mice, without affecting body weight and adiposity. Mechanistically, these beneficial actions seem to be mediated, at least in part, through a reduction in hepatic inflammation. In conclusion, polyphenols from cagaita and cambuci have a potential protective role in diet-induced obesity and their metabolic alterations. / A obesidade é considerada uma das grandes epidemias do século XXI, devido ao aumento de sua prevalência nos últimos anos e às diversas co-morbidades decorrentes destas alterações metabólicas como diabetes mellitus tipo 2, doenças cardiovasculares e alguns tipos de câncer. Evidências sugerem que compostos bioativos presentes em frutas e vegetais, incluindo os polifenóis (ou compostos fenólicos), podem exercer efeitos benéficos contra o desenvolvimento de obesidade e suas alterações associadas. O Brasil é o terceiro produtor mundial de frutas e o sétimo na produção de frutas tropicais, no entanto, um grande número de espécies frutíferas nativas permanece inexplorado em relação a seu potencial nutricional e funcional. Cagaita (Eugenia dysenterica DC.) e cambuci (Campomanesia phaea Berg.) são espécies frutíferas originárias das regiões do Cerrado e da Mata Atlântica, respectivamente, cujos frutos são usados na elaboração de diversos produtos alimentícios, e frutos e folhas de cagaita são usados na medicina popular. Estudos prévios têm demonstrado o potencial antioxidante e antidiabético in vitro dos polifenóis de ambas as frutas. Neste contexto, no presente estudo, foi investigado se a administração de extratos ricos em polifenóis de cagaita e cambuci, em duas doses diferentes, protegem camundongos de obesidade induzida por dieta a suas alterações associadas. Dois modelos biológicos, preventivo e terapêutico, foram desenvolvidos para cagaita, e preventivo para cambuci. Para os protocolos preventivos, foram usados camundongos da linhagem C57BL/6J alimentados com dieta rica em gorduras e sacarose (high-fat high-sucrose diet, HFHS), aos quais foram administrados água (controle) ou extratos ricos em polifenóis por gavagem em duas doses por 8 semanas. Os resultados demonstraram diferentes efeitos para os dois extratos. Os polifenóis de cagaita preveniram ganho de peso corporal e adiposidade, atenuaram hiperglicemia de jejum e dislipidemia, e reduziram acumulação de lipídeos hepáticos. Por outro lado, polifenóis de cambuci não contribuíram na prevenção do ganho de peso corporal e adiposidade, no entanto, foi observada uma atenuação na inflamação do tecido adiposo, em ambas as doses avaliadas. Adicionalmente, polifenóis de cambuci melhoraram a tolerância à glicose, assim como reduziram a hiperglicemia de jejum e atenuaram a dislipidemia. Para o protocolo terapêutico, camundongos da linhagem C57BL/6J foram induzidos à obesidade pela ingestão da dieta alta em gorduras e sacarose por 6 semanas e posteriormente foram tratados com polifenóis de cagaita, em duas doses, por gavagem por 8 semanas. Os polifenóis de cagaita melhoraram a homeostase glicêmica e atenuaram a dislipidemia em camundongos obesos, sem afetar peso corporal e adiposidade. Estes benefícios aparentam ser mediados, ao menos em parte, através da uma redução da inflamação hepática. Em conclusão, polifenóis de cagaita e cambuci têm um papel protetor potencial em obesidade induzida por dieta e suas alterações metabólicas.

This master's thesis explores the impact of agribusiness on food security in the Kalunga community of Engenho II, located in the Brazilian Cerrado. Agribusiness is a significant cause of water withdrawal and climate change in the region, with extensive lands converted into monocultures to export commodities. Secondary data were analyzed data to generate a picture of Brazilian industrial agriculture and establish interconnections between industrial agriculture and food security. In addition, semi-structured interviews were carried out to explore whether and how the connections between agribusiness and food security and possible threats apply to a particular community in the Cerrado. The study finds that the Kalunga community is not experiencing a threat to their food security, as they maintain agricultural production with no water-stressful situations, as well as their habit of eating local food. However, government policies and financial programs to support agricultural activities in the community come with agribusiness’ logic of farm mechanization, threatening the knowledge systems and practices of family farming. This can jeopardize food security in the future. The study suggests that continued research and action are necessary to address the challenges faced by traditional communities in Cerrado and ensure the preservation of their food security and overall well-being. The study also highlights the need for sustainable land use policies prioritizing communities' traditions. These findings have implications for policies and interventions to improve food security among Kalunga communities and other similar communities globally.

Submitted by Karen Cristina Gimenis Gil Ota (kagimenis@yahoo.com.br) on 2018-04-24T19:41:54Z No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO-KAREN CRISTINA GIMENIS GIL OTA.doc: 2915328 bytes, checksum: 38ba72673310cbede3845e2e16fd85a3 (MD5) / Rejected by Maria Luiza Carpi Semeghini (luiza@assis.unesp.br), reason: Solicitamos que realize correções na submissão seguindo as orientações abaixo: - Encaminhar o arquivo do trabalho em formato PDF Agradecemos a compreensão. on 2018-04-24T20:04:38Z (GMT) / Submitted by Karen Cristina Gimenis Gil Ota (kagimenis@yahoo.com.br) on 2018-04-24T20:29:33Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - KAREN CRISTINA GIMENIS GIL OTA.pdf: 805187 bytes, checksum: 188b67399324ef9b04c0e2079593282a (MD5) / Approved for entry into archive by Maria Luiza Carpi Semeghini (luiza@assis.unesp.br) on 2018-04-24T23:25:12Z (GMT) No. of bitstreams: 1 ota_kcgg_me_assis_int.pdf: 805187 bytes, checksum: 188b67399324ef9b04c0e2079593282a (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-24T23:25:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ota_kcgg_me_assis_int.pdf: 805187 bytes, checksum: 188b67399324ef9b04c0e2079593282a (MD5) Previous issue date: 2018-03-07 / Os frutos do cerrado são atualmente estudados por apresentarem em sua composição substâncias com funções protetoras e preventivas de processos nocivos à saúde, além de fornecerem nutrientes essenciais ao adequado funcionamento do organismo. Dentre estes frutos está o Ananas ananassoides, planta da família Bromeliaceae, endêmica do Cerrado Brasileiro, popularmente conhecida como ananás, ananaí, ananás-de-raposa ou também abacaxizinho do cerrado. Seus frutos são resistentes à ação da natureza, além de pequenos e fibrosos. Apresentam elevado teor de açúcar, acidez e pequenas sementes. Estudos mostram que os frutos do cerrado apresentam boa capacidade antioxidante, porém investigações científicas que envolvem a caracterização físico-química, compostos bioativos, quantificação mineral e o efeito da incidência solar nos frutos de A. ananassoides não foram totalmente elucidados. Como a caracterização e uso deste fruto é pouco explorado o objetivo deste trabalho foi avaliar os compostos bioativos (carotenoides, compostos fenólicos, vitamina C e capacidade antioxidante), bem como as características físico-químicas e minerais do fruto em condições de luminosidade e sombreamento. / The fruits of the cerrado are currently studied because they present substances in its composition with protective and preventive functions against harmful processes to health, besides they provide essential nutrients to the appropriate organism functioning. Among this fruits is the Ananas ananassoides, plant of Bromeliaceae family, endemic of the brazilian cerrado, popularly known as ananás, ananaí, ananás-de-raposa or also abacaxizinho-do-cerrado. Its fruits are little and fibrous besides being resistant to the action of nature, They present high sugar content, acidity and small seeds. Studies show that the fruits of the cerrado present good antioxidant capacity, however scientific investigations that involve the physical-chemical caracterization, bioactive compounds, mineral quantification and the effect of solar incidence in fruits of A. ananassoides were not totally elucidated. As the caracterization and use of this fruit is poorly explored, the objective of this study was to avaliate the bioactive compounds (carotenoids, phenolic compounds, vitamin C and antioxidant capacity), as well as the physical-chemical and mineral characteristics of the fruit in conditions of luminosity and darkness.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-05-02T12:49:32Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Carlos Eduardo Silva Sena - 2018.pdf: 4213255 bytes, checksum: 7e77275e41eeaea368f385135a4ce1d9 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-05-02T13:01:36Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Carlos Eduardo Silva Sena - 2018.pdf: 4213255 bytes, checksum: 7e77275e41eeaea368f385135a4ce1d9 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-02T13:01:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Carlos Eduardo Silva Sena - 2018.pdf: 4213255 bytes, checksum: 7e77275e41eeaea368f385135a4ce1d9 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2018-03-21 / Outro / Medicinal herbs are important natural riches to several cultures, mostly because of their phytotherapic use originated from traditional knoledge aqcired through direct contact with nature. Given that relevance, to secure products’ quality and to boost the sector’s progress, a group of institutions developed themselves attending to the Política Nacional de Plantas Medicinais e Fitoterápicos (PNPMF), however, contradictorily, they stablish barriers to the production chain base constituted by strategic agents to the sector’s consolidation in Brazil. Besides, added to these barriers, when it comes to brazilian biomes, specially Cerrado, despite it’s composition by an abundant floristic diversity, that biome faces a scenario of land occupation due to agriculture advent, what sugests that services of medicinal herbs provision might be threatened. Therefore, this work highlights the value of the phytotherapy performed by Grupo Espírita da Paz as a critical point of sucsess on developing medicinal herbs production chain from income generation, cultural recognition and conservation of biomes that provide genetical resourses to phytotherapic herbs production, proposing a strategic guideline to the institutional improvement of the sector from this perspective. / As plantas medicinais são bens naturais importantes para diversos povos, principalmente devido seu uso na fitoterapia, fruto do conhecimento tradicional adquirido pelo contato direto com a natureza. Frente a esta relevância, e a fim de assegurar a qualidade dos produtos e impulsionar o avanço do setor, um conjunto de instituições se desenvolvem a partir da Política Nacional de Plantas Medicinais e Fitoterápicos (PNPMF), entretanto, contraditoriamente, tal conjunto estabelece entraves à base da cadeia de produção, constituída por agentes estratégicos à consolidação deste setor no Brasil. Além disso, somados a esses entraves, em se tratando dos biomas brasileiros, especialmente o Cerrado, apesar de compor uma diversidade florística abundante, este bioma defronta com um cenário de ocupação de terras destacado pela expansão da agropecuária, sugerindo que o serviço de provisão de plantas medicinais possa estar cada vez mais ameaçado de se extinguir. Nesse sentido, este trabalho, estudando o caso do Grupo Espírita da Paz, destaca o valor da fitoterapia de base tradicional como ponto crítico de sucesso no desenvolvimento da produção de plantas medicinais, por meio do cultivo, extração sustentável e fonte de recursos informacionais à prospecção farmacológica, favorecendo a conservação de biomas, provedores de recursos genéticos à produção de fitoterápicos.

Submitted by Marlene Santos (marlene.bc.ufg@gmail.com) on 2016-06-01T20:07:51Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Liliane de Sousa Silva - 2015.pdf: 4894695 bytes, checksum: ef4469d862b59150ebb61ed28e1293ff (MD5) license_rdf: 19874 bytes, checksum: 38cb62ef53e6f513db2fb7e337df6485 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-06-02T15:32:33Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Liliane de Sousa Silva - 2015.pdf: 4894695 bytes, checksum: ef4469d862b59150ebb61ed28e1293ff (MD5) license_rdf: 19874 bytes, checksum: 38cb62ef53e6f513db2fb7e337df6485 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-02T15:32:33Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Liliane de Sousa Silva - 2015.pdf: 4894695 bytes, checksum: ef4469d862b59150ebb61ed28e1293ff (MD5) license_rdf: 19874 bytes, checksum: 38cb62ef53e6f513db2fb7e337df6485 (MD5) Previous issue date: 2015-09-30 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The gallic acid (GA) and its derived ellagic acid (EA) are widely distributed in nature tannins, present in tea, red wine, fruit, drinks and various medicinal plants. AG and AE are known to have anti inflammatory properties, antimutagenic, anticancerígenica and antioxidant activity. To produce functionalized derivatives of such compounds by biotransformation with filamentous fungi is an efficient and sustainable alternative, due to their ability to catalyze further reactions regio and stereo-selective. The aim of this study was to apply strains of Cerrado in the biotransformation of AG and AE. For this Thin Layer Chromatography (TLC) and High Performance Liquid Chromatography (HPLC) to monitor the production of derivatives developed analytical methodologies. Five strains of the Brazilian Cerrado were selected, these are Beauveria sp. IP06, IP08, IP94, IP98 and IP153. Incubation was performed in two different culture media: Glucose and "corn steep" for 96 hours at 27 C and 200 rpm. At the end of incubation the extraction and purification of the derivatives was performed. All strains were effective for biotranformação compounds. The culture medium influenced quali-quantitatively the production of derivatives, "corn steep" provided greater variety of substrates for both derivatives. The obtained derivatives were characterized by MS, ¹H NMR, HSQC, HMBC, UV and CCD. Derivatives of fatty acids are: benzoic acid, 3-O-methyl-β-glucopyranosyl galatoester (Labiocon 465); benzoic acid, 4 - [[6-O- (3,4-dihydroxy-5-methoxybenzoic acid)-α-D-glucopyranoside]oxy]-3-hydroxy-5metoxi (Labiocon 484); gallic acid 3-O-β-glucopiranoside (510 Labiocon) and 3,4-dihydroxy-5-methoxy-benzoic acid 2-hydroxy-5-methoxycarbonyl-phenyl ester (Labiocon 530). The AE is derived from 3,8-Dimethoxy-dibenzo [b, d] pyran-6-one ellagic acid (511 Labiocon) and 4-O, 3'-O-methyl -β-D-glucose (Labiocon 534) . / O ácido gálico (AG) e o seu derivado o ácido elágico (AE), são taninos amplamente distribuído na natureza, presente no chá, vinho tinto, frutas, bebidas e várias plantas medicinais. AG e AE são conhecidos por apresentarem propriedades antiinflamatórias, antimutagênica, anticancerígenica e atividade antioxidante. Produzir derivados funcionalizados desses compostos por meio da biotransformação com fungos filamentosos é uma alternativa eficiente e sustentável, devido à sua capacidade para catalisar novas reações regio e estereo-seletivas. O objetivo deste trabalho foi aplicar cepas do Cerrado na biotransformação do AG e AE. Para isso foram desenvolvidas metodologias analíticas por Cromatografia em Camada Delgada (CCD) e Cromatografia Líquida de Alta Eficiência (CLAE), a fim de monitorar a produção dos derivados. Foram selecionadas cinco cepas isoladas do Cerrado brasileiro, sendo estas Beauveria sp. IP06, IP08, IP94, IP98 e IP153. A incubação foi realizada em dois meios de cultura diferentes: glicose e “Corn Steep” durante 96 horas a 27º C e 200 rpm. Ao término da incubação foi realizada a extração e purificação dos derivados. Todas as cepas mostraram-se eficazes para a biotranformação dos compostos. O meio de cultura influenciou quali-quantitativamente na produção dos derivados, o “Corn Steep” proporcionou maior variedade de derivados para ambos substratos. Os derivados obtidos foram caracterizados por EM, RMN ¹H, HSQC, HMBC, UV e CCD. Os derivados do AG são: ácido benzoico, 3-O-metil β-glucopiranosil-galatoester (Labiocon 465); ácido benzóico,4-[[6-O-(3,4-diidroxi-5-metoxibenzoico)-α-D-glucopiranosideo]oxi]-3-hidroxi-5metoxi (Labiocon 484); ácido gálico 3-O-β-glucopiranoside (Labiocon 510) e ácido 3,4-Diidroxi-5-metoxi-benzoico 2-hidroxi-5-metoxicarbonil-fenil ester (Labiocon 530). O derivado do AE é 3,8-Dimetoxi-dibenzo[b,d]piran-6-one (Labiocon 511) e o ácido elágico 4-O,3’-O-metil -β-D-glicose (Labiocon 534).

Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2016-07-29T20:42:04Z No. of bitstreams: 2 Tese - Luciano Lajovic Carneiro - 2014.pdf: 1982044 bytes, checksum: a99d1192ee28bcd53fc85e279dee8904 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2016-07-29T20:55:36Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Luciano Lajovic Carneiro - 2014.pdf: 1982044 bytes, checksum: a99d1192ee28bcd53fc85e279dee8904 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-29T20:55:36Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Luciano Lajovic Carneiro - 2014.pdf: 1982044 bytes, checksum: a99d1192ee28bcd53fc85e279dee8904 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2014-11-27 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / The vast majority of orchids species are pollinated by insects, mainly bees, butterflies and moths. The orchid family is generally considered allogamic, but information about the type of reproduction are unknown for most species. Little information exist about orchids of Cerrado, which hinders plant breeding of these species and postpones their use in developing new varieties for the ornamental market. Recent methods of plant biotechnology can assist both plant breeding and conservation of these species, such as induction of early in vitro flowering as important technique particularly for species with a long cycle, and cryopreservation as a tool for the conservation of genetic variability. This study aims to contribute to the improvement and conservation of orchids with distribution in the Brazilian Cerrado. Selfcompatibility was evaluated for seven species: Cohniella cepula, Cyrtopodium eugenii, C. saintlegerianum, Epidendrum densiflorum, Epidendrum nocturnum, Epidendrum secundum e Lockhartia goyazensis. Only three were autocompatible: Epidendrum nocturnum, Epidendrum secundum and Lockhartia goyazensis. Interspecific compatibility was assessed for Cyrtopodium and Epidendrum genera, using reciprocal crosses. Just E. nocturnum and C. eugenii produced viable seeds. For early in vitro floral induction 20 different treatments were used through nutritional changes and use of cytokinin (BAP) in modified MS medium. Only C. cepula showed positive responses to treatment with formation of 46% floral stems. The effect of BAP was evident in the results. Cryopreservation was tested by vitrification of seeds of seven species of orchids, obtained from outcrossing. The responses to cryopreservation were partially different for each species. Most seeds tested showed any significant differences between freezing in liquid nitrogen without cryoprotectants and control without freezing. The freezing without cryoprotectant was successful to maintaining seed viability for all species, C. cepula 63%, C. eugenii 59%, C. sainttlegerianum 70%, E. densiflorum 42%, E. nocturnum 31%, E. secundum 69% and L. goyazensis 52%. Only E .nocturnum and C. cepula showed a significant reduction in viability when submitted to freezing in liquid nitrogen. The results presented here are useful for the development of breeding programs for orchids and conservation of these species. / A grande maioria das espécies de orquídeas é polinizada por insetos, principalmente abelhas, borboletas e mariposas. A família Orchidaceae é, em geral, considerada alógama, mas informações sobre o tipo de reprodução não são conhecidas para a maioria das espécies. Pouca informação existe sobre orquídeas do Cerrado, o que prejudica o melhoramento destas espécies e adia sua utilização no desenvolvimento de novas cultivares para o mercado de ornamentais. Métodos recentes de biotecnologia vegetal podem auxiliar tanto o melhoramento quanto a conservação destas espécies, como a indução a floração precoce in vitro, técnica importante principalmente para espécies de ciclo longo, e a criopreservação, como ferramenta para o desenvolvimento de bancos de germoplasma, essenciais tanto para o melhoramento quanto para a conservação da variabilidade genética. Este trabalho teve como objetivos contribuir para o melhoramento e conservação de orquídeas com distribuição no Cerrado Brasileiro. Foi avaliada a autocompatibilidade para sete espécies: Cohniella cepula, Cyrtopodium eugenii, Cyrtopodium saintlegerianum, Epidendrum densiflorum, Epidendrum nocturnum, Epidendrum secundum e Lockhartia goyazensis. Apenas três foram autocompatíveis: E. nocturnum, E. secundum e L. goyazensis. Foi avaliada a compatibilidade interespecífica dentro dos gêneros Cyrtopodium e Epidedrum utilizando cruzamentos recíprocos. Apenas C. eugenii e E. nocturnum produziram sementes viáveis. Para a indução floral precoce in vitro foram testadas diferentes composições nutricionais e concentrações de benzilaminopurina (BAP) no meio MS modificado. Apenas C. cepula apresentou respostas positivas aos tratamentos, com formação de até 46% de hastes florais. O efeito do BAP ficou evidente nos resultados dos tratamentos. Foi testada a criopreservação por vitrificação de sementes das sete espécies de orquídeas, obtidas de cápsulas originadas de fecundação cruzada. As respostas aos crioprotetores foram parcialmente distintas para os tratamentos de criopreservação avaliados, dependendo da espécie. A maioria das sementes testadas não apresentou diferenças significativas entre o congelamento em nitrogênio líquido e o controle sem o crioprotetor e sem o congelamento. O congelamento sem crioprotetor foi bem sucedido para todas as espécies mantendo a viabilidade das sementes, para C. cepula em 63%, C. eugenii em 59%, C. sainttlegerianum 70%, E. densiflorum 42%, E. nocturnum 31%, E. secundum 69% e L. goyazensis em 52%. Apenas E. nocturnum e C. cepula apresentaram redução significativa da viabilidade quando submetidas ao congelamento direto em nitrogênio líquido, sem crioprotetor. Os resultados apresentados neste trabalho são úteis ao desenvolvimento de programas de melhoramento para orquídeas e para conservação destas espécies.

Submitted by JÚLIO HEBER SILVA (julioheber@yahoo.com.br) on 2018-02-08T12:09:10Z No. of bitstreams: 2 Tese - Jordana Moura Caetano - 2017.pdf: 1316232 bytes, checksum: 3ad854051d9dbce860e70eef1a19ac7a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Liliane Ferreira (ljuvencia30@gmail.com) on 2018-02-08T12:45:52Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Jordana Moura Caetano - 2017.pdf: 1316232 bytes, checksum: 3ad854051d9dbce860e70eef1a19ac7a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-08T12:45:52Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Jordana Moura Caetano - 2017.pdf: 1316232 bytes, checksum: 3ad854051d9dbce860e70eef1a19ac7a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-12-14 / Brazil is the worlds largest producer of sugarcane and its derivatives (sugar and ethanol). Due to the growing demand of these products, there has been a constant expansion of land with sugarcane in the country, mainly in the state of Goiás, which currently has the second largest harvest and production crop area countrywide. Considering its complex production system, which involves different growing environments (climate and soil), the characterization of the growth, development and maturation of sugarcane is one of the most fundamental aspects for determining the quality and quantification of the raw material, besides assisting in the planning of harvesting activities. In tropical (hot) regions, such as midwest Goiás, the reduction of grown and development rates and the process of accumulation in soluble solids of stems occurs mainly as a function of soil water deficit and atmospheric water demand. The quantification of these responses from the crop to the environment can be estimated by mathematical models generated as a function of agrometeorological and soil water variables. A mathematical model was used as a tool for estimating grown development and plant production, also the agricultural sector has benefited from these models of crop forecasting. However, the estimate of soluble solids accumulation in sugarcane still requires studies since the knowledge of the procedure that involves interaction of the agrometeorological conditions and the physiological responses of the crop is insufficient. Thus, the objectives of this research were: characterization of the biometric behavior and soluble solids content of sugarcane in response to the natural environment and soil conditions of the midwest region of Goiás, identification of the water depth in the soil that causes the reduction of growth rates and development of the crops that contributes to the accumulation of soluble solids in the stems, creation of empirical models for the determination of biometric parameters and the soluble solids content of the plant in response to the growing time and agrometeorological variables, elaboration of multiple linear regression models of soluble solids content, (°Brix) and total recoverable sugars (ATR, kg t-1 ) due to the agrometeorological variables and water depth in the soil to obtain the estimation errors of the models and their validation. The following shows the research stucture: after the general introduction and bibliographic review on the subject, the first article presents the characterization and trend of behavior of the grown and development of sugarcane for the environment conditions and soil water table in midwest Goiás, and the second article shows agrometeorological models generated for the estimation of soluble solids (°Brix) and total recoverable sugars (ATR, kg t-1 ) in order to use them as an alternative of estimation in crop environments similar to the conditions that were generated. / O Brasil é o maior produtor mundial de cana-de-açúcar e de seus derivados (açúcar e etanol). Devido à crescente demanda por estes produtos, vem sendo observada a constante expansão das áreas com cultivo da cana-de-açúcar no país, principalmente no Estado de Goiás, que atualmente possui a segunda maior área colhida e produção da cultura no país. Considerando esse complexo sistema de produção, do qual envolvem diferentes ambientes de cultivo (clima e solo), a caracterização do crescimento, desenvolvimento e maturação da cana-de-açúcar é um dos aspectos fundamentais para a determinação da qualidade e quantificação da matéria-prima, além auxiliar no planejamento das atividades de colheita. Em regiões tropicais (quentes), como é o caso do centro-oeste goiano, a redução das taxas de crescimento e desenvolvimento e o processo de acúmulo de sacarose nos colmos ocorre, principalmente, em função do déficit hídrico do solo e demanda hídrica atmosférica. A quantificação dessas respostas da cultura ao ambiente pode ser estimada por meio de modelos matemáticos gerados em função de variáveis agrometeorológicas e da água no solo. A modelagem matemática vem sendo utilizada como ferramenta para a estimativa do crescimento, desenvolvimento e produção vegetal e o setor agrícola tem sido beneficiado com estes modelos de previsão de safra. Contudo, a estimativa do acúmulo de sacarose na cana-de-açúcar ainda demanda de estudos, visto que o conhecimento que se tem dos processos que envolvem a interação das condições agrometeorológicas e as respostas fisiológicas da cultura ainda é insuficiente. Desta forma, os objetivos desse estudo foram: caracterizar o comportamento biométrico e de teor de sólidos solúveis da cana-de-açúcar em resposta às condições de ambiente e solo naturais do centro-oeste goiano, identificar a lâmina de água no solo que gera a redução das taxas de crescimento e desenvolvimento da cultura e que contribui para o acúmulo de sacarose nos colmos, gerar modelos empíricos de determinação de parâmetros biométricos e teor de sólidos solúveis da planta em resposta ao tempo de cultivo e a variáveis agrometeorológicas, elaborar modelos de regressão linear múltipla de estimativa do teor de sólidos solúveis (°Brix) e açúcares totais recuperáveis (ATR, kg t-1 ) em função de variáveis agrometeorológicas e lâmina de água no solo e obter os erros de estimativa dos modelos e realização de sua validação. A estrutura do trabalho é a seguinte: após a introdução geral e revisão bibliográfica sobre o tema, no primeiro artigo é apresentada a caracterização e tendência de comportamento do crescimento e desenvolvimento da cana-de-açúcar para as condições de ambiente e lâmina de água no solo do centro-oeste goiano; e no segundo artigo são apresentados modelos agrometeorológicos gerados para a estimativa do teor de sólidos solúveis (°Brix) e açúcares totais recuperáveis (ATR, kg t-1 ) de forma a utilizá-los como alternativa de estimação em ambientes de cultivo semelhantes às condições em que foram gerados.

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[pt] O monitoramento oficial do desmatamento na Amazônia brasileira tem dependido tradicionalmente de especialistas humanos que avaliam visualmenteas imagens de sensoriamento remoto e rotulam cada pixel individual comodesmatamento ou não desmatamento. Essa metodologia é obviamente carae demorada devido à vasta área monitorada. A razão para não utilizar métodos totalmente automáticos para a tarefa é a necessidade da maior precisãopossível nos números oficiais de desmatamento. Neste trabalho é propostauma alternativa semi-automática baseada em aprendizagem profunda, naqual uma rede neural profunda é primeiro treinada com imagens existentes e referências de anos anteriores, e empregada para realizar detecção dedesmatamento em imagens recentes. Após a inferência, a incerteza nos resultados em nível de pixel da rede é estimada e assume-se que os resultadosda classificação com baixa incerteza podem ser confiáveis. As demais regiõesde alta incerteza, que correspondem a uma pequena porcentagem da áreade teste, são então submetidas à pós-classificação, por exemplo, um procedimento de auditoria realizado visualmente por um especialista humano.Desta forma, o esforço de etiquetagem manual é bastante reduzido.Investigamos várias estratégias de estimativa de incerteza, incluindo abordagens baseadas em confiança, Monte Carlo Dropout (MCD), conjuntosprofundos e aprendizagem evidencial, e avaliamos diferentes métricas de incerteza. Além disso, conduzimos uma análise abrangente para identificar ascaracterísticas das áreas florestais que contribuem para a elevada incerteza.Ilustramos as principais conclusões da análise em 25 polígonos selecionados em quatro locais-alvo, que exemplificam causas comuns de incerteza.Os sítios-alvo estão localizados em áreas de estudo desafiadoras nos biomasbrasileiros da Amazônia e do Cerrado. Através da avaliação experimental nesses locais, demonstramos que a metodologia semi-automática proposta atinge valores impressionantes de pontuação F1 que excedem 97 por cento, aomesmo tempo que reduz a carga de trabalho de auditoria visual para apenas 3 por cento da área alvo. O código desenvolvido para este estudo está disponível emhttps://github.com/DiMorten/deforestation_uncertainty. / [en] Official monitoring of deforestation in the Brazilian Amazon has relied traditionally on human experts who visually evaluate remote sensing images and label each individual pixel as deforestation or no deforestation. That methodology is obviously costly and time-consuming due to the vast monitored area. The reason for not using fully automatic methods for the task is the need for the highest possible accuracies in the authoritative deforestation figures. In this work, a semi-automatic, deep learning-based alternative is proposed, in which a deep neural network is first trained with existing images and references from previous years, and employed to perform deforestation detection on recent images. After inference, the uncertainty in the network s pixel-level results is estimated, and it is assumed that low-uncertainty classification results can be trusted. The remaining high-uncertainty regions, which correspond to a small percentage of the test area, are then submitted to post classification, e.g., an auditing procedure carried out visually by a human specialist. In this way, the manual labeling effort is greatly reduced. We investigate various uncertainty estimation strategies, including confidence-based approaches, Monte Carlo Dropout (MCD), deep ensembles and evidential learning, and evaluate different uncertainty metrics. Furthermore, we conduct a comprehensive analysis to identify the characteristics of forest areas that contribute to high uncertainty. We illustrate the main conclusions of the analysis upon 25 selected polygons on four target sites, which exemplify common causes of uncertainty. The target sites are located in challenging study areas in the Brazilian Amazon and Cerrado biomes. Through experimental evaluation on those sites, we demonstrate that the proposed semi-automated methodology achieves impressive F1-score values which exceeds 97 percent, while reducing the visual auditing workload to just 3 percent of the target area. The current code is available at https://github.com/DiMorten/deforestation_uncertainty.

Made available in DSpace on 2014-07-29T16:21:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Faleiro Frederico Dissertacao.pdf: 1687158 bytes, checksum: e1a8a44e89beea38d1a839934c890e56 (MD5) Previous issue date: 2012-03-28 / The human actions has triggered many threats to biodiversity like land-use and climate changes, overexploitation, pollution, and introduction of invasive species, which can affect organisms both at local and global scale. The science of spatial conservation prioritization emerged as a quantitative approach to support the spatial decisions in face of these threats, while minimizing the socioeconomic and political conflicts. Here we developed spatial solutions to the conservation of non-flying mammals from Brazilian Cerrado considering the socioeconomic costs and the opportunities of environmental governance (first objective). Further, we generated solutions to face the land-use and climate change taking into account the dispersal abilities of species and uncertainties in the species distribution modeling (SDM) process (second objective). We considered the current network of reserves of the Cerrado in both objectives. We built SDMs for 154 species combining model projections weighted by their statistical fit to produce consensus maps of species distribution grouped in three distinct types of models (envelope, statistical and machine-learning models), for both current future scenarios of climate (used only in the last aim). For the first goal, we used the current predicted distribution to run spatial prioritization analyses indicating the best sites for the conservation investment considering human population density, land cost, anthropogenic land use, level of environmental governance, and the distribution of species in trade-off analyses. For the second goal, we used both current and future predicted distribution to run optimization procedures and propose priority sites for conservation, while minimizing species climate-forced dispersal distance , the mean uncertainty associated to the SDM process, and taking into account the future changes in the landscape (by our land use model). SDMs indicated that species-rich sites converge to regions with high population density, high land cost, high anthropogenic land use, and with diverse levels of environmental governance. There was a significant change in spatial priorities when socioeconomic and political dimensions were included in analyses: top priority sites moved towards the north. This spatial change reduced by 68% the potential conservation conflicts with human population, by 72% the likely conflicts arising from land cost and by 68% anthropogenic land use. It also increased by 51% the beneficial effect of environmental governance. Including land-use changes and the modeling uncertainty in the conservation planning process changed significantly the spatial distribution of priority sites in the region. While the inclusion of land-use models altered the spatial location of priority sites at the regional scale, the effects of climate change tended to take place at the local scale. Note that, our solutions already include possible dispersal corridors linking current and future priority sites for mammal conservation, as well as a formal risk analysis based on planning uncertainties. Our results allowed dealing with both complex nature of conflicts among socioeconomic and political dimensions, and the dynamic problem imposed mainly by land-use and climate change. Thus, our analyses figure as a methodological prospect supporting the decision-make process and the consequent translation of conservation planning outcomes into conservations actions / As ações humanas têm desencadeado diversas ameaças a biodiversidade como as mudanças de uso do solo e do clima, sobre-exploração, poluição e introdução de espécies invasoras, que afetas os organismos da escala local até a global. A ciência da conservação espacial para conservação emergiu como uma abordagem quantitativa que tem o objetivo de auxiliar escolhas espaciais que lidem com essas ameaças enquanto minimizam conflitos socioeconômicos e políticos. Aqui nós desenvolvemos soluções espaciais para conservação de mamíferos não voadores do Cerrado considerando os custos socioeconômicos e as oportunidades vindas da governança ambiental (primeiro objetivo). Além disso, nós geramos soluções espaciais que lidem com as mudanças do uso do solo e climáticas levando em consideração as capacidades de dispersão das espécies e as incertezas associadas ao processo de modelagem de distribuição de espécies (MDE) (segundo objetivo). Em ambos objetivos nós consideramos a atual rede de reservas do Cerrado. Nós modelamos a distribuição de 154 espécies combinando as projeções dos modelos e pesado pelo ajuste estatístico para produzir os mapas consenso de distribuição das espécies, agrupados em três distintos tipos de modelos (modelos de envelope, estatísticos e de inteligência artificial), para a atualidade e projetados para o futuro (usado apenas no último objetivo). Para o primeiro objetivo, nós usamos as predições da atual distribuição das espécies para realizar as análises de priorização espacial, indicando os melhores locais para investimento considerando a densidade humana, custo da terra, uso do solo antropogênico, nível de governança ambiental e a distribuição das espécies na perspectiva da análise de demandas conflitantes. Para o segundo objetivo, nós usamos a distribuição atual e futura das espécies para realizar o procedimento de otimização e propor locais para conservação que minimizem os efeitos da dispersão induzida pelas mudanças climáticas, incertezas associadas ao processo MDE e considerando as futuras mudanças na paisagem (através do nosso modelo de uso do solo). A MDE indicou que locais ricos em espécies convergem para locais com alta densidade populacional, alto custo de terra, alta proporção de uso do solo voltado para atividades humanas e diversos níveis de governança ambiental. Houve significativas mudanças nas prioridades espaciais quando as dimensões socioeconômicas e políticas foram incluídas nas análises, fazendo que os locais prioritários mudassem para o norte. Essa mudança espacial reduziu em 68% de potenciais conflitos com população humana, em 72% de conflitos de custo da terra, em 68% de conflitos com o uso do solo antropogênico e 51% de aumento dos possíveis benefícios da governança ambiental. Quando incluímos as mudanças de uso de solo e a incerteza da modelagem no processo de planejamento, os locais prioritários mudaram significativamente na região. Enquanto a inclusão das mudanças no uso do solo alterou a localização espacial dos locais prioritários em escala regional, os efeitos da mudança climática tenderam a ocorrem em escala local. Note que nossas soluções já incluíram possíveis corredores de dispersão para ligação entre as atuais áreas prioritárias com aquelas importantes no futuro, tão bem quanto a análise de risco baseado nas incertezas do planejamento. Nossos resultados permitiram lidar tanto com a complexa natureza dos conflitos entre dimensões socioeconômicas e políticas quanto com problema dinâmico imposto principalmente pelas mudanças do uso do solo e climáticas. Assim, nossas análises auxiliam metodologicamente a dar suporte no processo de tomada de decisão e a consequente tradução dos resultados de planejamentos de conservação em ações de conservação