A la fois témoins et acteurs de contamination, les sédiments constituent un élément essentiel des écosystèmes aquatiques qu'il convient de surveiller, évaluer et protéger. Les méthodes actuelles d'évaluation de leurs risques écotoxiques restent peu transférables aux écosystèmes, et ne rendent pas compte de la présence de multiples facteurs de stress abiotiques et biotiques. Les sédiments stockés par les seuils et barrages offrent l'opportunité de développer des méthodes originales de diagnose des réponses biologiques in situ. Six retenues au fil de l'eau dont les sédiments présentent un gradient de contamination métallique et organique ont été étudiées. Les effets de la contamination ont été explorés à différentes échelles spatiales et biologiques via des approches structurelles et fonctionnelles. Dans les retenues, en réponse à l'augmentation de la perturbation chimique, nos résultats montrent une sélection de cortèges faunistiques associée à une réduction de la diversité taxonomique et fonctionnelle. Des réponses sublétales des macroinvertébrés ont été identifiées, notamment sur les niches spatiales, les régimes alimentaires ou la compétition interspécifique. La contamination des sédiments impacte aussi le potentiel métabolique bactérien et la richesse et la biomasse fongique. L'ensemble de ces altérations biocénotiques se traduisent au niveau écosystémique par la rupture du processus de décomposition des litières et la modification des flux benthiques à l'interface eau-sédiment. Les écosystèmes en aval sont également perturbés via la remise en suspension des sédiments contaminés, l?altération de la qualité de l'eau et les effets en cascades des réponses structurelles et fonctionnelles des communautés des retenues. L'ensemble de nos résultats soulignent les enjeux de préservation de la qualité des sédiments et la nécessité de développer des méthodologies intégratives de la vulnérabilité à chaque niveau d'organisation biologique pour mieux appréhender l'état et les trajectoires écologiques des écosystèmes aquatiques / Sediment evaluation and monitoring is an essential part of ecosystem monitoring since sediments represent an important component of aquatic habitats and are also a potential source of contamination. Current methodologies of their ecotoxic risk assessment do not encompass ecosystemic responses and do not take into account multiple abiotic and biotic stressors. Run-of-river reservoirs entrap a large amount of sediments and constitute an opportunity to develop original risk assessment methodologies that integrate biological responses in situ and their potential effects for river ecosystem functioning. Six run-of-river reservoirs were selected to study the effects of sediment contamination at several spatial and biological scales, thanks to structural and functional approaches. Our results evidenced a selection in faunistic assemblages in response to contamination, associated with low taxonomic and functional diversity. Our results also evidenced sublethal responses, with niches shifts of invertebrate population and modification of biotic interactions. Sediment contamination has also impacted metabolic functional diversity of bacterial communities and fungal richness and biomass. These biocenotic alterations have resulted in disturbances in ecosystemic processes such as leaf breakdown and benthic flux at the water-sediment interface. Ecosystems downstream dams were also impacted, through resuspension of contaminated sediments, alteration of water quality and cascading effects related to structural and functional responses of reservoirs communities. Our findings evidenced challenges of the sediment quality preservation and the need to develop risk assessment methodologies based on the vulnerability at each biological scale in order to understand and elucidate ecological status and trajectories of aquatic ecosystems

La présente thèse cherche une nouvelle approche de la mobilité à Beyrouth, à travers une étude de l’écologie urbaine. L’objet principal est de déterminer les obstacles auxquelles fait face la mobilité dans cette ville et de trouver : quelles influences ont les qualités spatiales sur les pratiques de mobilité à Beyrouth ? L’étude consiste en un croisement entre la notion d’architecture par l’analyse de l’environnement bâti, la notion de paysage en ayant recours aux expériences sensori-motrices et la notion sociale par l’étude des pratiques de mobilité des beyrouthins. Nous avons développé la méthodologie de recherche à partir d’une synthèse des projets et des études contemporains de la mobilité. La thèse est répartie en trois parties essentielles. Au départ, une étude du contexte urbain de la ville de Beyrouth englobe l’analyse rétrospective de l’infrastructure routière, ainsi que l’étude des différentes pratiques de mobilité. La deuxième partie, envisage le rôle des acteurs publics et privés de la mobilité. Nous avons ainsi formulé une interprétation des projets de mobilité actuels et en cours d’étude. La dernière partie de la thèse représente trois études de cas, de zones à caractère social et à formes urbaines distinctes. Par l’intermédiaire des analyses cartographiques et d’une enquête sociale, l’étude paysagère et sociale sont explicites.Les résultats de la recherche, se résument en trois idées centrales. Premièrement, la volonté politique et une bonne gouvernance prennent un rôle fondamental des stratégies durables de la mobilité. Ensuite, les études du site ont démontré l’intérêt du travail sur les multiples échelles de la mobilité, afin de limiter la congestion. Alors que l’influence de l’environnement urbain sur les pratiques de mobilité, promeut l’utilisation des ambiances urbaines pour favoriser les déplacements doux. Une mobilité écologique impulsera l’attractivité et sensibilisera l’hospitalité dans Beyrouth. / The present thesis pursues a new approach regarding mobility in Beirut, through a study of the urban ecology. The main concern is to define the obstacles that the mobility is facing in this city, and to find out: what influences do spatial qualities have on mobility practices in Beirut? The study consists of a cross between the notion of architecture by the analysis of the built environment, the notion of landscape through senses and movement experiences and the social notion by the study of Beirut citizen’s mobility practices. We have developed the research methodology from a synthesis of contemporary mobility, projects and studies. The thesis is divided into three main parts. To start, a study of Beirut urban context includes a retrospective analysis of road infrastructure, as well as the study of the different mobility practices. The second part considers the role of public and private stakeholders. We have thus formulated an interpretation of current and ongoing mobility projects. The final part of the thesis represents three case studies of distinct social and urban forms areas of Beirut. Landscape and social studies are exposed through social survey and mapping.The results of this research, summed up in three key ideas. First, political will and good governance play a fundamental role in implementing sustainable mobility strategies. Secondly, site survey demonstrated the interest of working on the multiple scales of mobility, in order to limit the congestion. Whereas, the influence of urban environment on mobility practices, promotes use of urban environments to favor soft modes of transport. Eco-friendly mobility will stimulate attractiveness and will promote hospitality in Beirut.

Nous avons étudié la végétation de la région du mont Mégantic au moyen de la méthode phytosociologique de Zurich - Montpellier (Braun - Blanquet, 1951). La prospection sur le terrain s'est soldée par l'acquisition de 94 relevés de végétation, chacun complété par une étude pédologique et une étude dendrométrique. Ces informations nous ont permis de définir 13 associations, 10 sous-associations et 9 variantes. Il faut souligner la diversité de nos groupements en raison d'une physiographie particulière du mont Mégantic lui-même, dont l'altitude varie de 1 350 à 3 625 pieds. Une carte des dépôts de surface et une carte phytosociologique complètent notre travail.

Cette étude s'inscrit dans la lignée des études écologiques et floristiques de l'archipel de Mingan, débutées par Grondin et Melançon (1980 a) sur la Grosse île au Marteau et l'île â Samuel. Son but particulier est cependant de vérifier une hypothèse émise au départ â savoir si la Petite île au Marteau est propice à l'aménagement d'un sentier d'interprétation de 1 a nature. L'île, malgré sa superficie restreinte, apparaît très diversifiée en ce qui concerne sa flore et sa végétation. Chez les plantes vasculaires, 216 taxons différents ont été relevés, incluant une plante rare dans l'archipel, le Cypripedium passerinum. À cela, s'ajoutent 63 mousses dont 7 nouvelles pour la Minganie et une addition pour l'est du continent américain, Bryum warneum, 116 lichens dont 31 sont nouveaux pour l'archipel , 2 jamais rapportés au Québec, 2 nouveaux pour l'est de l'Amérique du Nord. Enfin, un lichen crustacé, Melanolecia jurana var. bicincta, n'a jamais été signalé auparavant en Amérique du Nord. L'archipel de Mingan fait partie du domaine climacique de la sapinière baumière à épinette blanche. Il possède une végétation nettement différente de celle de la Côte-Nord où prédominent les pessières noires. A l'intérieur de six habitats distincts ((forêt, tourbière, lande, littoral sablo-graveleux, falaise et littoral limoneux), 45 unités phytosociologiques différentes ont été reconnues. Elles se divisent en 24 associations, 3 sous associations et 21 groupements sans rang phytosociologique déterminé. Parmi les associations, la pessière blanche rabougrie et la festuçaie rouge â cladonies n'ont pas été décrites auparavant et parmi les groupements, 18 s'avèrent nouveaux pour la Minganie. Les sols sont représentés par les quatre ordres connus dans l'archipel: podzolique, régosolique, organique et gleysolique, ainsi que les non sols au sens de la nouvelle version de la classification canadienne (Commission canadienne de pédologie, 1978). Une carte de la végétation actuelle de l'île a été élaborée et a servi de document de base à partir duquel d'autres cartes thématiques ont été produites. Elles ont été utilisées pour évaluer et synthétiser les différentes possibilités d'aménagement de l'île. D'après les résultats obtenus, la Petite île au Marteau possède des qualités nécessaires à l'établissement d'un sentier écologique d'interprétation de la nature.

Thèse numérisée par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.

Thèse numérisée par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.

La sélection naturelle est un des facteurs dominants lors de l'évolution répétée et parallèle observée notamment chez les poissons des régions tempérées du Nord. Ainsi, au sein des populations de Coregonus clupeaformis, l'écotype nain s'est différencié plusieurs fois à partir d'un écotype normal, notamment dans six lacs du bassin versant de la rivière St-Jean (Maine, USA et Québec, CA). Cette étude porte sur les caractéristiques de l'habitat ainsi que sur la disponibilité des ressources et leurs variations temporelles influençant le niveau de différenciation atteint entre les écotypes de ces populations. Les résultats appuient les hypothèses théoriques faisant intervenir le rôle des fluctuations environnementales (biomasse et structure des ressources) dans la variation des pressions sélectives et le rôle de la compétition pour les ressources (disponibilités réduites) dans l'établissement et le maintien d'un degré de différenciation. Le rôle de d'autres interactions trophiques comme les relations prédateurs-proies semble aussi impliqué dans ce mécanisme de divergence. / Natural selection is one of the dominant factors in repeated parallel evolution observed notably in north temperate fish populations. In Coregonus clupeaformis populations located in six lakes of the St-John’s river watershed (Maine, USA and Québec, CA), a dwarf ecotype has differentiated from a normal ecotype many times. Here we study habitat and resource features, it temporal variations in relation to the observed level of differentiation between ecotypes of these populations. The results support the hypotheses that environmental fluctuation (zooplankton community structure and biomass) cause variation in selective pressure and that the resource competition (availability of habitat and resources) influence the establishment and persistence of a degree of differentiation. Trophic interactions such as predator-prey relationships seem also to be involved in giving rise to this divergence.

Dénaturer l’écocritique : une lecture de l’écologie queer de Timothy Morton propose de réfléchir l’écocritique à la lumière de l’écologie queer. Alors que l’écocritique s’intéresse aux traces de la « nature » dans les textes littéraires, les outils de la théorie queer permettent de faire apparaître le caractère artificiel de l’idée de nature. L’essai réfléchit à l’implication d’une écologie « sans nature » pour l’écocritique et propose la focalisation et l’ironie comme moyens d’approcher un texte selon une écocritique queer. Cochoncetés et autres nouvelles est une exploration littéraire de l’écologie queer sous différentes formes. Les personnages du recueil tissent des liens avec humains et non-humains, traversent des réseaux toujours ouverts, entrent en relation avec un temps, un espace, une matière ou un savoir qui les dépasse. / Dénaturer l’écocritique : une lecture de l’écologie queer de Timothy Morton proposes to reflect on ecocriticism in the light of queer ecology. While ecocriticism is interested in the traces of “nature” in literary texts, the tools of queer theory examine the idea of nature to reveal its artificiality. The essay reflects on the implication of an ecology “without nature” for ecocriticism and proposes focalization and irony as ways to approach a text through queer ecocriticism. Cochoncetés et autres nouvelles is a literary exploration of queer ecology in various shapes. The characters in the collection connect with humans and non-humans, pass through open networks, engage with a time, a space, a matter or a knowledge that expand beyond their reality.

Les norovirus sont maintenant reconnus mondialement comme étant la cause majeure de maladies d'origine alimentaire. Deux causes majeures expliqueraient la recrudescence des cas d'empoisonnements alimentaires d'origine virale: leur très grande stabilité dans l'environnement facilitant ainsi leur transfert et leur résistance à la majorité des approches de lutte contre les microorganismes pathogènes tels que la désinfection chimique. L'objectif général de ce projet était d'étudier et de caractériser le phénomène d'attachement des norovirus humain et murin aux surfaces inertes en fonction des différents paramètres physico-chimiques (pH et humidité relative) et d'évaluer l'impact de ce phénomène sur la sensibilité des norovirus aux désinfectants chimiques domestiques. Les résultats obtenus ont démontré un meilleur attachement à pH acide ou neutre peu importe l'humidité relative. On a d'ailleurs observé un attachement moindre lorsque le norovirus murin était sous des conditions de pH 9 et de faible humidité relative comparativement au norovirus humain où aucune différence n'a été observée selon les différentes conditions. Pour les deux virus, un attachement maximal a été observé après un temps de contact de 10 minutes. L'évaluation de la sensibilité des norovirus aux différents désinfectants chimiques a montré une plus grande sensibilité aux composés chlorés avec une réduction virale supérieure à 3 log comparativement aux alcools ou aux ammoniums quaternaires qui n'ont permis qu'une faible réduction généralement inférieure à 1 log. On a également noté que le norovirus murin est généralement plus sensible que le norovirus humain.

Le paysage arctique est un mélange d’étendues désertiques, fouettées par les vents, et d’une grande diversité d’écosystèmes aquatiques. Confronté à des augmentations de température nettement supérieures à la moyenne globale qui modifient les propriétés de ces paysages, l’Arctique est un site d’étude stratégique pour suivre les impacts des changements climatiques sur les communautés microbiennes endogènes. Caractéristique importante des écosystèmes arctiques, la cryosphère commence déjà à atteindre des seuils de non-retour le long de la côte nord de l’île d’Ellesmere. Dans les lacs, la combinaison naturelle des basses températures, de la variabilité de l’irradiance et de la faible teneur en nutriments inorganiques limite la production primaire et la croissance de nombreux organismes. La richesse des microorganismes dans ces systèmes est le résultat d’une diversité de stratégies adaptatives et nutritives. Ainsi, les changements observés dans les couverts de glace auront des impacts sur l’activité biologique de ces lacs. Contribuant à celle-ci, les protistes, eucaryotes unicellulaires microscopiques, exploitent une large gamme des ressources de carbone et d’énergie, incluant la phototrophie, la prédation et la combinaison des deux, la mixotrophie. Cette thèse cherche à déterminer la contribution des mixotrophes à la structure des communautés de protistes dans les lacs arctiques, et à développer la connaissance sur leurs réponses potentielles aux conditions environnementales changeantes. Le lac Char, le lac A et le lac Ward Hunt ont été sélectionnés pour leurs propriétés limnologiques distinctes et pour investiguer la biodiversité de leurs communautés de protistes en Aout 2008. La microscopie, les pigments et les banques de clones du gène de l'ARN de la petite sous-unité ribosomale 18S indiquent la dominance des chrysophytes, des protistes principalement mixotrophes, dans les trois lacs. Pour le lac A, l’été 2008 était marqué par la perte d’un couvert de glace permanent, créant des conditions d’eau libre inhabituelles. Le séquençage à haut-débit de la région V4 du gène 18S ARNr révèle le contraste entre les communautés homogènes dans la colonne d’eau marquée d’une stratification méromictique sous le couvert de glace en mai 2008 et les variabilités spatiales établies en août 2008 dans la colonne d’eau libre de glace ainsi qu’en Juillet 2009 sous un couvert de glace normal. Ces résultats illustrent l’importance qu’ont les facteurs environnementaux, tel que l’irradiance, sur les communautés de protistes. Pour examiner plus attentivement le rôle de la lumière et investiguer l’impact de la disponibilité des proies, nous avons entrepris une expérience de lumière/dilution au lac Ward Hunt. Le pyroséquençage de la région V4 de l’ARN ribosomal ainsi que son gène révèlent des différences taxonomiques entre les deux traitements d’irradiance, suggérant une divergence du type de mixotrophie entre une dominance de dinoflagellés essentiellement brouteurs à faible irradiance et de chrysophytes bactérivores sous une forte lumière. Cette thèse révèle la diversité des protistes et leur variation saisonnière au sein des lacs arctiques, et offre un aperçu de l’importance des conditions environnementales sur la stratégie mixotrophe adoptée par les communautés de protistes. / The Arctic region is a blend of stark windswept landscapes interwoven with a wide diversity of freshwater ecosystems. Presently confronted by temperature increases well above global average, causing changes in landscape and aquatic properties, the Arctic is a strategic area to study the impact of climate change on endogenous microbial communities. Ice is a crucial characteristic of Arctic ecosystems and has already begun to cross thresholds along the northern coastline of Ellesmere Island. In lakes, the effects of cold temperatures, variable irradiance and low inorganic nutrients combine to restrict primary production and growth of most organisms. The established richness of microorganisms present in these systems is due to the high diversity of their adaptive and nutritive strategies. Hence, the observed shifts in ice cover regimes of lakes will have impacts on their biological activity. Of these microbial components, the protists, unicellular eukaryotes, exploit a wide range of carbon and energy resources from phototrophy to predation and the combination of both, mixotrophy. The subject of this research was to determine the contribution of mixotrophs to protist community structure in Arctic lakes, and to develop knowledge of their potential response to the changing environmental conditions. Char Lake, Lake A and Ward Hunt Lake, three limnologically different lakes, were chosen to investigate the biodiversity of protists in August 2008. Microscopy, pigments and 18S gene clone libraries revealed a dominance of each lake by chrysophytes, prominent mixotrophic protists. At Lake A, the summer of 2008 was marked by a loss of ice-cover, creating atypical open-water conditions. High-throughput sequencing of the V4 region of the 18S ribosomal RNA gene revealed the contrast between the homogenous community structure within the ice-covered water column of May 2008, despite the sharp physico-chemical meromictic stratification within the lake, and the established spatial variability of the protist communities under the ice-free conditions of August 2008 and ice-covered conditions of July 2009. These results illustrate the importance of varying environmental factors, such as underwater irradiance, in shaping protist communities. To further examine the role of light and to investigate the impact of low prey resources, we conducted a light/dilution experiment at Ward Hunt Lake. Pyrosequencing of the V4 region of the 18S ribosomal RNA, along with the gene, showed taxonomic differences under the two light conditions, suggesting a divergence in the dominant type of mixotrophy, with dominance of primarily microflagellate grazers, the dinoflagellates, under low irradiance, and of bacterivorus chrysophytes in the high light treatment. This thesis research underscored the diversity of mixotrophs and their seasonal variations in Arctic lakes, and provided insights into the importance of environmental conditions on the mixotrophic strategy adopted by protist communities.