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601

The development of CT urography for investigating haematuria

Cowan, Nigel Christopher January 2013 (has links)
This thesis addresses the three principal questions concerning the development of CT urography for investigating haematuria and each question is the subject of a separate chapter. The questions are: What is the reasoning behind using CT urography? What is the optimum diagnostic strategy using CT urography? What are the problems with using CT urography and how may solutions be provided? Haematuria can signify serious disease such as urinary tract stones, renal cell cancer, upper tract urothelial cancer (UTUC) and bladder cancer (BCa). CT urography is defined as contrast enhanced CT examination of kidneys, ureters and bladder. The technique used here includes unenhanced, nephrographic and excretory-phases for optimized diagnosis of stones, renal masses and urothelial cancer respectively. The reasoning behind using excretory-phase CT urography for investigating haematuria is based on results showing its high diagnostic accuracy for UTUC and BCa. Patients with haematuria are classified as low risk or high risk for UTUC and BCa, by a risk score, determined by the presence/absence of risk factors: age > 50 years, visible or nonvisible haematuria, history of smoking and occupational exposure. The optimum diagnostic strategy for patients at high risk for urothelial cancer, uses CT urography as a replacement test for ultrasonography and intravenous urography and as a triage test for flexible and rigid cystoscopy, resulting in earlier diagnosis and potentially improving prognosis. For patients at low risk, ultrasonography, unenhanced and nephrographic-phase CT urography are proposed as initial imaging tests. Problems with using CT urography include false positive results for UTUC, which are eliminated by retrograde ureteropyelography-guided biopsy, an innovative technique, for histopathological confirmation of diagnosis. Recommendations for the NHS and possible future developments are discussed. CT urography, including excretory-phase imaging, is recommended as the initial diagnostic imaging test before cystoscopy for patients with haematuria at high risk for urothelial cancer.
602

The Effects of Serum from Obese Patients and Adipocyte-derived Cytokines on Growth of Prostate Cancer Cells In Vitro

Mora, Benjamin 03 July 2014 (has links)
Obesity has been related to a greater incidence of more aggressive, advanced stage prostate cancer. It is expected that serum adipokines related to obesity will promote a more aggressive phenotype in PC cells in vitro. Patient serum (n = 80) was obtained for analysis and divided into four patient groups based on obesity and prostate cancer status. Characteristics of serum-treated PC cells in vitro were measured. In a separate set of analyses, LNCaP and PC3 cells were treated with adiponectin and resistin in vitro, and cell characteristics were analyzed. Serum from obese PC patients induces greater amounts of cell migration and lower amounts of cell proliferation and invasion in vitro. Exogenous treatment of adiponectin on PC cells in vitro does not affect cell migration or invasion. However, adiponectin modulates cytosolic protein levels of soluble β-catenin and GSK-3β, indicating that its mechanism of action may be through the Wnt signalling pathway.
603

Дигитална мамографија и томосинтеза у детекцији и радиолошкој БИ РАДС категоризацији туморских лезија дојке / Digitalna mamografija i tomosinteza u detekciji i radiološkoj BI RADS kategorizaciji tumorskih lezija dojke / Digital mammography and tomosynthesis in BIRADS lesions characterization

Prvulović Bunović Nataša 28 April 2015 (has links)
<p>Циљ ове студије је да се упореди дијагностичкa значајност 2Д и 2Д+3Д мамографије у детектовању тумора дојке. Испитивали смо 864 дојки у 740 пацијенткиња. Студија је спроведена у току рутинског рада у Центру за имиџинг дијагностику Институту за онкологију Војводине. 2Д + 3Д мамографија су начињене појединачно или у истом акту снимања као комбо опција на Selenia Dimensions апарату произвођача фирме Холоџик. Радиолошки извешатаји су класификовани у категорије 1-5 према АЦР БИ РAДС-у. Патохистолошка верификација је вршена у свих суспектних промена или у току њиховог праћења . Све пацијенткиње са уредним налазом или мамографски уочених бенигних промена су радиолошки праћене најкраће током 2 године. Уочено је 103 малигне лезије у дојкама класификованих као БИ РАДС 4, 5 на дигиталној мамографији и у 22 дојке чије су промене класификоване као БИ РАДС 1-3, током праћења или прегледа дојки помоћу других модалитета. На 2Д + 3Д мамографији малигните је потврђен у 125 дојке од којих је 118 класификовано као БИ РАДС 4,5 и у 7 дојки чује су промене категорисане у БИРАДС 1-3. Постоји статистички значајна разлика у дистрибуцији малигних налаза у односу на подгрупе Студија је показала 20% лажно негативних налаза на 2Д, а 5,6% на 2Д + 3Д модалитету прегледа дојки. Осетљивост у откривању рака у овој студији износи 82,4% на 2Д и 94,4% на 2Д+3Д методи прегледа, док је специфичност 90,5% и 92,0%, респективно. ППВ је већа за 2Д + 3Д технику прегледа , износи 66,7%, као и негативна предиктивна вредност која износи 99,0%. У 172 случаја (19, 9%) налази 2Д мамографије се не уочавају на 3Д техници прегледа и сматрају се последицом структурне или анатомске &bdquo;буке&ldquo;. Већина не -сталних налаза (85%) је класификовано као фокална асиметрија. У овој студији 500 дојки је класификовано према АЦР структури у масне (АЦР 1) или дифузне фибро-гландуларне (АЦР 2), а преосталих 264 је било хетеродензно (АЦР 3) и значајно дензно (АЦР 4). Статистички значајна разлика није показана приликом дистрибуције малигних налаза у поређењу са подгрупама дојки начињеним према њиховој густини - складу са правилима АЦР-а. Укупна тачност теста износи 89,4% за 2Д и 92,4% за 2Д + 3Д мамографију. Предиктивне вредности добијене за 2Д + 3Д мамографију су боље од оних које се односе само на 2Д мамографију, што је резултат њене веће осетљивости и шире могућности карактеризације промена. Варијабилност у интерпретацији налаза међу два радиолога је је ниска, показано је слагање у интершпретавцији евалуираних мамограма у 94.1% случајева.</p> / <p>Cilj ove studije je da se uporedi dijagnostička značajnost 2D i 2D+3D mamografije u detektovanju tumora dojke. Ispitivali smo 864 dojki u 740 pacijentkinja. Studija je sprovedena u toku rutinskog rada u Centru za imidžing dijagnostiku Institutu za onkologiju Vojvodine. 2D + 3D mamografija su načinjene pojedinačno ili u istom aktu snimanja kao kombo opcija na Selenia Dimensions aparatu proizvođača firme Holodžik. Radiološki izvešataji su klasifikovani u kategorije 1-5 prema ACR BI RADS-u. Patohistološka verifikacija je vršena u svih suspektnih promena ili u toku njihovog praćenja . Sve pacijentkinje sa urednim nalazom ili mamografski uočenih benignih promena su radiološki praćene najkraće tokom 2 godine. Uočeno je 103 maligne lezije u dojkama klasifikovanih kao BI RADS 4, 5 na digitalnoj mamografiji i u 22 dojke čije su promene klasifikovane kao BI RADS 1-3, tokom praćenja ili pregleda dojki pomoću drugih modaliteta. Na 2D + 3D mamografiji malignite je potvrđen u 125 dojke od kojih je 118 klasifikovano kao BI RADS 4,5 i u 7 dojki čuje su promene kategorisane u BIRADS 1-3. Postoji statistički značajna razlika u distribuciji malignih nalaza u odnosu na podgrupe Studija je pokazala 20% lažno negativnih nalaza na 2D, a 5,6% na 2D + 3D modalitetu pregleda dojki. Osetljivost u otkrivanju raka u ovoj studiji iznosi 82,4% na 2D i 94,4% na 2D+3D metodi pregleda, dok je specifičnost 90,5% i 92,0%, respektivno. PPV je veća za 2D + 3D tehniku pregleda , iznosi 66,7%, kao i negativna prediktivna vrednost koja iznosi 99,0%. U 172 slučaja (19, 9%) nalazi 2D mamografije se ne uočavaju na 3D tehnici pregleda i smatraju se posledicom strukturne ili anatomske &bdquo;buke&ldquo;. Većina ne -stalnih nalaza (85%) je klasifikovano kao fokalna asimetrija. U ovoj studiji 500 dojki je klasifikovano prema ACR strukturi u masne (ACR 1) ili difuzne fibro-glandularne (ACR 2), a preostalih 264 je bilo heterodenzno (ACR 3) i značajno denzno (ACR 4). Statistički značajna razlika nije pokazana prilikom distribucije malignih nalaza u poređenju sa podgrupama dojki načinjenim prema njihovoj gustini - skladu sa pravilima ACR-a. Ukupna tačnost testa iznosi 89,4% za 2D i 92,4% za 2D + 3D mamografiju. Prediktivne vrednosti dobijene za 2D + 3D mamografiju su bolje od onih koje se odnose samo na 2D mamografiju, što je rezultat njene veće osetljivosti i šire mogućnosti karakterizacije promena. Varijabilnost u interpretaciji nalaza među dva radiologa je je niska, pokazano je slaganje u interšpretavciji evaluiranih mamograma u 94.1% slučajeva.</p> / <p>The aim of this study was to compare diagnostic importance of 2D and 2D+3D diagnostic mammography in breast tumor detection. We evaluated 864 breasts in 740 patients. Study was performed in Diagnostic Imaging Center at Oncology Institute of Vojvodina. 2D+3D mammography were performed during single procedure or via combo option at Selenia Dimensions unit, Hologic, BE. Radiological findings were classified in categories 1-5 according to ACR BIRADS. Pathohistologic verification was obtained in all suspicious findings or after follow up studies. All other patients with mammographic normal findings or benign findings were fallowed up during 2 years period or longer. We detected malignant lesions in 103 breasts classified as BIRADS 4,5 at digital mammography, and in 22 breasts classified as BIRADS 1-3 after followed up or diagnosed by other imaging modalities. At 2D+3D mammography malignancy was confirmed in 125 breasts, 118 classified as BIRADS 4,5 and in 7 breasts classified as BIRADS 1-3. There is statistically significant difference (p&lt;0.001) in distribution of malignant findings compared to the subgroups classified according to 2D mammography. There was 20% false negative findings on 2D, and 5.6% on 2D+3D modality. Sensitivity in cancer detection in this study is 82.4% and 94.4% for 2D and 2D+3D mammography, while specificity is 90.5% and 92.0%, respectively. PPV is higher for 2D+3D technique (66.7%), as well as negative predictive value (99.0%). In 172 cases (19, 9%) 2D mammography findings did not persist on 3D mammography and were considered as structural or anatomical noise. The majority of the non-persistent findings (85%) were classified as asymmetric focal density. In this study 500 breast were classified according to ACR as fatty (ACR 1) or scattered fibroglandular densities (ACR 2), and the remaining 264 had heterogeneously (ACR 3) and extremely dense breasts (ACR 4). Statistically significant difference (p&lt;0.001) was not shown in distribution of malignant findings compared to the subgroups of density structure according to ACR. Overall accuracy of the test was 89.4% and 92.4% for 2D and 2D+3D mammography, respectively. Predictive values obtained in 2D+ 3D mammography are better than those for 2D mammography alone, as a result of its higher sensitivity and better possibility of lesion characterization. Interobserver variability is low, there is an agreement between two radiologist between two radiologic interpretations in 94.1% cases.</p>
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Mediální konstrukce biomatek v českých médiích / Media construction of Biomothers in Czech media

Lišková, Iva January 2016 (has links)
This diploma theses deals with the construction of the neoplasm Biomother in the Czech media between 2010-2015. The 'bio' concept, label borrowed from organic agriculture, resonates in public for quite long. The research component of this theses brings an explanation, why the notion of bio was connected with motherhood, and also why media has changed its meaning and brought new defining topics to it. There are 3 main questions to be answered in the theses. How did the picture of Biomothers change between the years 2010-2015? What other characteristics have been included in the topic? What role does media have in this case: Do they serve as a booster of alternative values or, do they tend to promote conservative values? Media portrayal of Biomothers showed considerable dynamism during the examined period and it altered to greater complexity and controversy. Some features, that accompanied the notion biomatka from the start, remained unchanged and are key for its interpretation. This includes the tendency to search and buy organic products, support an all natural lifestyle, and searching for forms of alternative treatments. During the analysed period (2010- 2015) the relatively uncomplicated and positive image of Biomothers, as a worshiper of organic farming, natural lifestyle and organic products,...
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Perfis de expressão de genes relacionados a metástases em uma coorte de pacientes adultos e pediátricos portadores de neoplasias do córtex da supra-renal / Expression profiles of metastasis-related genes in a cohort of childhood and adult adrenocortical tumors

Lerario, Antonio Marcondes 11 September 2008 (has links)
O carcinoma do córtex da supra-renal (ACC) é uma neoplasia rara e de prognóstico sombrio. Embora estudos moleculares tenham explorado diversos aspectos relacionados à tumorigênese destas neoplasias, o conhecimento das vias relacionadas à disseminação metastática é restrito. O objetivo do presente estudo é avaliar a expressão de genes relacionados a metástases em uma coorte de pacientes portadores de tumores do córtex da supra-renal metastáticos e não-metastáticos, a fim de identificar vias envolvidas na disseminação metastática destas neoplasias, novos marcadores prognósticos e eventuais alvos terapêuticos. Os perfis de expressão de 27 tumores do córtex da supra-renal de 15 pacientes adultos (8 ACC e 7 adenomas) e 12 pediátricos (5 metastáticos e 7 não-metastáticos) foram avaliados por um array de expressão contendo um painel de 113 genes que sabidamente estão envolvidos no processo de disseminação metastática de diversas neoplasias humanas. A análise de grupamentos mostrou que adenoma dos pacientes adultos forma um grupo distinto dos demais tumores (ACC de adultos e tumores pediátricos). Os genes MMP11e DENR foram identificados como diferencialmente expressos quando se compararam os adenomas e ACC de adultos. Na comparação dos tumores pediátricos nenhum gene foi diferencialmente expresso. Assim como a análise de grupamento, a PCA utilizando grupo selecionado de genes também não foi capaz partir os tumores pediátricos em subgrupos pela evolução. A expressão dos genes MMP2, TIMP3 e FN1 também foram avaliados por RT-PCR e foram concordantes com os dados gerados pelo array de expressão. O papel da LOH como causa da redução da expressão de TIMP3 foi estudado com tipagem de microssatélites. Em alguns casos, foi identificada LOH da região 22q13. Porém, em outros casos em que a expressão do TIMP3 foi bastante reduzida, não houve LOH. Em resumo, foram identificados aspectos moleculares importantes envolvidos na disseminação e metástases de neoplasias do córtex da supra-renal de adultos e crianças, bem como características biológicas deste processo. Diferentes padrões de expressão identificados em tumores metastáticos e não-metastáticos podem ajudar na predição do prognóstico / Adrenocortical carcinoma (ACC) is a rare neoplasm with a poor prognosis. Although molecular studies have uncovered many aspects of ACC tumorigenesis, little is known about molecular pathways involved in metastatic spread. The objective of our study is to analyze the expression profile of metastasis-related genes in a cohort of metastatic and nonmetastatic adrenocortical tumors in order to identify genes involved in the metastatic spread, as well as to find new prognostic markers. The expression profiles of 27 adrenocortical tumors from 15 adults (8 ACC and 7 adenomas) and 12 children (5 metastatic and 7 non-metastatic) were evaluated by an array of 113 known to be involved in human metastasis. Cluster analysis showed adult adrenocortical adenomas form a group distinct from other adrenocortical tumors (adult carcinomas and pediatric tumors). The comparison of adult adenoma and ACC revealed that MMP11 and DENR were differentially expressed between these two groups while no gene was differentially expressed among pediatric adrenocortical tumors. Similarly to cluster analysis, Principal component analysis failed to identify partition amongst pediatric tumors categorized by their evolution. The expression data of MMP2, TIMP3 and FN1 genes by RT-PCR agreed with those generated by the arrays. LOH of 22q12.3 region was detected in some cases in which TIMP3 down regulation was verified (but not in all cases). In conclusion, we have identified important aspects of molecular pathways and biological characteristics involved in metastatic spread of adrenocortical tumors. Distinctive patterns of gene expression between metastatic and nonmetastatic tumors may help in prognosis prediction
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Determinação de polimorfismos dos genes ABCC2 e ABCG2 como fator preditivo de resposta ao tratamento com cisplatina em pacientes com carcinoma epidermóide de cabeça e pescoço / Determination of ABCC2 and ABCG2 polymorphisms as predictive factor at response to cisplatin treatment in patients with head and neck squamous cell carcinoma

Cadima, Bruno Ferencz Papp 08 September 2010 (has links)
Os transportadores da família ABC são proteínas transmembrânicas envolvidas com o tráfego de substâncias endógenas e exógenas do meio intracelular para o extracelular, sendo alvos de estudo na resistência celular a agentes quimioterápicos. O ABCC2 é um transportador transmembrânico que exporta ativamente fármacos aniônicos conjugados e facilita o transporte de agentes anticâncer. O ABCG2 é outro transportador transmembrânico que tem influência na farmacocinética e farmacodinâmica de certos xenobióticos e substratos endógenos; além disso, acredita-se que este gene contribui para a resistência a várias drogas. Por esses motivos identificamos por sequenciamento ou PCR-RFLP os polimorfismos dos genes ABCC2 (Val417Ile, Ser789Phe e Ala1450Thr) e ABCG2 (Val12Met, Gly126stop códon, Gly141Lys) em 90 pacientes portadores de carcinoma epidermóide de cabeça e pescoço (HNSCC) e tentamos correlacionar a presença do polimorfismo com resposta a tratamento que incluiu cisplatina em todos os pacientes. Não encontramos nenhuma correlação entre a presença de polimorfismo para Val12Met, Gly141Lys e Val417Ile, determinados em 68 pacientes tratados exclusivamente com cisplatina e radioterapia, e a resposta ao tratamento. As curvas de sobrevida, determinadas por Kaplan-Meier, considerando polimórfico os pacientes que continham pelo menos um dos alelos alterados e selvagem os que não tivessem nenhum deles, mostraram que os pacientes selvagens para o polimorfismo Val12Met tiveram tendência a uma pior sobrevida (sobrevida mediana de 18,7 meses) em relação aos pacientes polimórficos (sobrevida mediana não atingida; P=0,089 Teste de log-rank), já os pacientes selvagens para o polimorfismo Gly141Lys tiveram tendência a uma pior sobrevida (sobrevida mediana de 15,8 meses) em relação aos pacientes polimórficos (sobrevida mediana de 25,6 meses; P = 0,16 Teste de logrank). Não observamos correlação entre os outros polimorfismos e sobrevida. Quanto ao GLY126stop, somente um paciente foi identificado como polimórfico. Conclusões: No nosso estudo, a freqüência do polimorfismo Val12Met de 10% está próxima dos 18% descrito na população normal (Kobayashi 2004). Nosso trabalho foi o primeiro a correlacionar estes polimorfismos com resposta ao tratamento em pacientes com carcinoma epidermóide de cabeça e pescoço e indica que Val12Met e Gly141Lys e o gene ABCG2 como um todo são candidatos a um estudo maior / ATP binding cassette (ABC) transporters form one of the largest transmembrane protein families. These proteins use cellular ATP to drive the transport of various substrates across cell membranes including many exogenous and endogenous compounds, which includes drugs used in cancer treatment. ABCC2 is an ATP binding cassette transporter which accepts a diverse range of substrates, including glutathione, glucuronide, and sulfate conjugates of many metabolites and xenobiotics. ABCG2 is a member of the ATP binding cassette (ABC) transporters whose function is to pump out of the cell a wide variety of endogenous and exogenous compounds. Widely expressed in stem cells, ABCG2 is also recognized as a universal marker of stem cells. For these reasons we had identified the following polymorphisms of ABCC2 gene: -Val417Ile, Ser789Phe and Ala1450Thr- and of ABCG2 gene as well: -Val12Met, Gly126stop códon, Gly141Lys in 88 patients with head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC). Methodology included PCR - RFLP and direct sequencing. Survival analysis was done using Kaplan-Meier curves and response measured by RECIST criteria. Comparisons were done between polymorphic patients in which at least one polymorphism was present as opposed to the patients without the polymorphism. Correlation with response to treatment was studied for Val12Met, Gly141Lys e Val417Il in 68 patients exclusively treated with concomitant cisplatin and radiotherapy and no correlation was found between these markers and treatment response. Patients without the Val12Met presented a trend towards shorter survival (median survival 18.7 months) as compared to polymorphic patients (median survival not reached, long rank p= 0.089). Although statistical significance was not reached, patients wild type for Gly141Lys polymorphism (median survival 15.8 months) had shorter survival than polymorphic patients (25.6 months, p=0.16). We did not observe any other correlation between other polymorphisms and survival. With respect to Gly126stop, only one patient was identified as polymorphic and survival analysis was not possible. As far as we know this is the first study to try to correlate these polymorphisms with treatment response and survival in HNSCC patients. Although we were unable to draw any definitive conclusions, our results indicate that Val12Met and Gly141Lys deserve to be further studied in the future.
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Estudo clínico e de mutações no gene PTCH1 em pacientes portadores de carcinomas basocelulares múltiplos familiares não sindrômicos / Clinical and PTCH1 gene mutations studies in patients bearing multiple familiar non-syndromic basal cell carcinomas

Cardoso, Alberto Eduardo Oiticica 13 August 2010 (has links)
INTRODUÇÃO: O carcinoma basocelular (CBC) é o tipo de câncer cutâneo mais comum no ser humano. O aparecimento de CBC na maioria das vezes se dá de forma esporádica em indivíduos que se expõem cronicamente ao sol. Eventualmente pode estar associado a síndromes, como: Bazex-Dupré- Christol, Rombo e Gorlin-Goltz. Diferente do que ocorre nas síndromes, os casos de CBCs múltiplos familiares não sindrômicos(CBCMFNS) são poucos estudados, tendo na literatura somente cinco relatos de famílias com a doença. O fenótipo é de múltiplos CBCs superficiais sem presença de outras anormalidades. Devido os CBCs esporádicos e os CBCs presentes na Síndrome de Gorlin-Goltz apresentarem mutações no gene PTCH1, possivelmente os CBCs múltiplos também estejam associados a alterações neste gene. Este gene esta localizado na região 9q22.3 possuindo 23 éxons, tem um papel importante na formação embrionária e de supressão tumoral. OBJETIVO: Análise genética dos éxons 9,11, 16, 17 e 23 do PTCH1 de oito componentes da mesma família, pertencentes a três diferentes gerações, sendo três portadores de CBCs múltiplos, e dentre estes dois suspeitos de CBCMFNS. MÉTODOS: Extração de DNA dos leucócitos do sangue periférico; PCR; clonagem dos produtos de amplificação (pGEM T Easy Vector) e seqüenciamento (Big Dye Terminator Kit). As mutações e polimorfismos encontrados foram comparados com a literatura e banco de dados de mutação do gene PTCH1 (www.cybergene.se/PATCH). RESULTADOS: Duas novas mutações foram encontradas nos pacientes suspeitos de CBCMFNS: uma frameshift nt4130(del C) e uma missense nt4261(A->G). Nos familiares foram encontradas cinco novas mutações: Em um primeiro indivíduo uma missense nt1420(G->T); em um segundo a mesma missense nt1420(G->T) e mais uma missense nt2873(C->T); em um terceiro duas frameshift nt1443 (ins T) e nt1468 (ins T), em dois outros indivíduos, irmãos, uma outra mutação missense nt4130(C->T). Foram encontradas ainda dezoito mutações, não descritas anteriormente, nos íntrons 10,15,16 e 17, algumas se repetindo em todos os indivíduos analisados. CONCLUSÃO: Pela primeira vez estão sendo descritas mutações em éxons e íntrons do gene PTCH1 em indivíduos portadores de CBCMFNS e em alguns de seus familiares. / INTRODUCTION: Basal cell carcinomas (BCC) are the most usual skin cancer that affects human beings. Sporadic BCCs are prevalent, often arising in people chronically exposed to UV radiation from the sun. Eventually BCCs may be associated to different syndroms like Bazex-Dupré-Christol, Rambo and Gorlin. Contrarily to syndromic BCCs, the cases of multiple familiar nonsydromic BCCs(MFNSBCC) have only few studies found in the literature. Only five families have been described to date with the disease. Since sporadic and Gorlin BCCs are associated to many mutations in the PTCH1 gene, we hypothesized that the multiple BCCs phenotype is also associated with mutations in this same gene. The PTCH1 tumor suppressor gene is located in the 9q22.3 chromosomal region, contains 23 exons, and has an important role in embryogenesis. OBJETIVE: To perform genetic analysis of PTCH1 exons 9, 11, 16, 17 e 23. METHODS: Eight individuals belonging to different generations from the same family were studied. Three of them bore multiple BCCs, and two of those were suspect to have MFNSBCC. DNA was extracted from blood leukocytes, submitted to PCR, and the PCR products were cloned (pGEM T Easy Vector, Promega) and sequenced (Big Dye Terminator Kit; ABI Prism 3100 sequencer; Applied Biosystems). The polymorphisms and mutations found were analyzed and compared to literature and PTCH1database (www.cybergene.se/PTCH/). RESULTS: In the patients suspect of MFNSBCC were found two new mutation: one frameshift nt4130(del C) and one missense nt4261(A->G). In the relatives were found five new mutation: Three missense nt1420(G->T); nt2873(C->T); nt4130(C->T); and two frameshift nt1443 (ins T) and nt1468 (ins T). In the introns 10,15,16 and 17 were found eighteen new mutations that were not previously reported. CONCLUSION: For the first time mutation in exons and introns of PTCH1 gene have been described in patients bore MFNSBCC and some of their relatives.
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Papel do LIN28, uma proteína ligadora de RNAs, na tumorigênese adrenocortical / Role of LIN28, an RNA-binding protein, in adrenocortical tumorigenesis

Faria, André Murad 08 December 2014 (has links)
INTRODUÇÃO: O carcinoma adrenocortical é uma neoplasia rara que carreia um prognóstico reservado. Recentemente, uma série de estudos demonstrou o potencial do perfil de miRNAs na diferenciação entre adenomas e carcinomas adrenocorticais, estratificação de risco e prognóstico. Entretanto, pouco se sabe ainda sobre a regulação pós-transcricional de miRNAs. Nesse contexto, o LIN28 é uma proteína ligadora de RNAs altamente conservada que surgiu como um modulador do let-7, uma importante família de miRNAs amplamente conhecida por seus efeitos supressivos tumorais. Além do let-7, o LIN28 também mostrou regular e ser regulado pelo mir-9, mir-30 e mir-125. OBJETIVOS: Analisar a expressão gênica e proteica do LIN28 em uma grande coorte de tumores adrenocorticais (TACs) de adultos e pediátricos, além de investigar a variação no número de cópias dos genes LIN28A e LIN28B e a expressão dos miRNAs regulatórios do LIN28 (família let-7, mir-9, mir-30 e mir-125) em um subgrupo desta coorte. MÉTODOS: A expressão proteica do LIN28 foi avaliada em um total de 266 TACs de adultos (78 adenomas e 188 carcinomas) e 44 pediátricos (35 clinicamente benignos e 9 clinicamente malignos). A expressão dos genes LIN28A e LIN28B foi avaliada em um subgrupo de 86 TACs adultos e pediátricos e a análise da variação no número de cópias destes genes em 58 TACs. O estudo de expressão das famílias dos miRNAs let-7, mir-9, mir-30 e mir-125 foi realizado em 28 carcinomas adrenocorticais de adultos. RESULTADOS: Em adultos, o gene LIN28A mostrou-se hiperexpresso em carcinomas agressivos quando comparado a adenomas [7,0 (0 a 174,3) vs. 3,6 (0 a 18,3); p = 0,006, respectivamente] e observou-se uma tendência a maior expressão quando comparados a carcinomas não agressivos [7,0 (0 a 174,3) vs. 7,1 (0 a 17,1); p = 0,092]. A expressão do LIN28B foi negativa na grande maioria (92%) dos TACs de adultos. Curiosamente, uma imunorreatividade fraca para o LIN28 foi significativamente associada com diminuição da sobrevida livre de doença nessa população (p = 0,01), mas para sobrevida global apenas uma tendência foi observada (p = 0,117). Na análise multivariada, somente o índice Ki67 >= 10% (RR 5,7, 95% IC 3,0-10,8; p= 0,0001) e imunorreatividade fraca para o LIN28 (RR 2,3, 95% IC 1,2-4,4; p = 0,008) foram preditores independentes de recorrência em adultos. De forma interessante, a expressão do mir-9, um regulador negativo do LIN28A/B, foi significativamente maior em carcinomas agressivos quando comparados a não agressivos [2076 (36 a 9307) vs. 133,4 (2,4 a 5193); p = 0,011] e fortemente associada com a redução da sobrevida global (p = 0,01) e livre de doença (p = 0,01). Na população pediátrica, não se observou diferença significativa entre expressão da proteína LIN28, assim como dos genes LIN28A e mir-9, entre tumores clinicamente benignos e malignos. Nas crianças, a hiperexpressão do LIN28B foi significativamente associada com redução da sobrevida livre de doença (p = 0,026), mas não da sobrevida global (p = 0,406). A análise da variação do número de cópias mostrou que somente uma criança com tumor virilizante benigno apresentou amplificação do LIN28B e uma mulher com carcinoma adrenocortical metastático apresentou deleção do LIN28B. Não houve variação no número de cópias para o gene LIN28A. Um índice de Ki67 >= 20% nas crianças foi capaz de discriminar pacientes com pior prognóstico: houve uma associação significativa tanto com diminuição da sobrevida global (p = 0,015) como da sobrevida livre de doença (p = 0,001) em 36 TACs pediátricos com Weiss >- 3. CONCLUSÕES: A imunorreatividade fraca para o LIN28 foi associada à diminuição da sobrevida livre de doença em uma grande coorte de carcinomas adrenocorticais de adultos. O gene LIN28A teve expressão aumentada em carcinomas agressivos de adultos, sugerindo uma regulação pós-transcricional negativa da expressão proteica do LIN28. A hiperexpressão do mir-9, um regulador negativo do LIN28, mostrou-se um importante preditor de desfecho desfavorável nos adultos. Adicionalmente, a hiperexpressão do gene LIN28B mostrou-se um potencial marcador de mau prognóstico na população pediátrica. Um índice de Ki67 >= 10% em adultos e >= 20% em crianças foram associados a mau prognóstico / INTRODUCTION: Adrenocortical carcinoma is a rare neoplasm with overall poor prognosis. Recently, several studies demonstrated the potential of miRNA profiling in differentiating between adrenocortical adenomas and carcinomas, risk stratification and prognosis. Nevertheless, little is known about posttranscriptional regulation of miRNAs. LIN28 is a highly conserved RNA-binding protein that has emerged as a modulator of the processing of let-7, an important family of miRNAs widely known for its tumor-suppressive effects. Besides from let-7, LIN28 has also shown to regulate and be regulated by mir-9, mir-30 and mir-125. OBJECTIVES: To analyze LIN28 gene and protein expression in a large cohort of adult and pediatric adrenocotical tumors (ACTs), and investigate the copy number variation analysis for LIN28A and LIN28B genes and the expression of LIN28 regulatory microRNAs (let-7 family, mir-9, mir-30 e mir-125) in a subgroup of this cohort. METHODS: LIN28 protein expression was assessed in a total of 266 adult (78 adenomas and 188 carcinomas) and 44 pediatric ACTs (35 clinically benign and 9 clinically malignant). LIN28A and LIN28B gene expression was evaluated in a subgroup of 86 adult and pediatric ACTs and copy number variation analysis of these genes in 58 ACTs. The expression of let-7 family, mir-9, mir-30 and mir-125 was performed in 28 adult carcinomas. RESULTS: In adults, LIN28A gene was overexpressed in aggressive carcinomas when compared with adenomas [7.0 fold change (from 0 to 174.3) vs. 3.6 (from 0 to 18.3); p = 0.006, respectively] and a trend towards greaten expression when compared with non-aggressive carcinomas [7.0 (from 0 to 174.3) vs. 7.1 (from 0 to 17.1); p = 0.092]. LIN28B expression was undetectable in the great majority (92%) of adult ACTs. Surprisingly, weak LIN28 staining was significantly associated with reduced disease-free survival in this population (p = 0.01), but for overall survival only a trend was detectable (p= 0.117). In the multivariate analysis, only Ki67 index >- 10% (HR 5.7, 95% CI 3.0-10.8; p = 0,0001) and weak LIN28 staining (HR 2.3, 95% CI 1.2-4.4; p = 0,008) were independent predictors of recurrence in adult patients. Interestingly, mir-9 expression, a negative LIN28A/B regulator, was significantly higher in aggressive than in non-aggressive ACCs [2076 (from 36 to 9307) vs. 133.4 (from 2.4 to 5193); p = 0.011] and was highly associated with reduced overall survival ( p= 0.01) and disease-free survival (p = 0.01). In the pediatric population, no significant difference was observed in the expression of LIN28 protein and LIN28A and mir-9 gene expression between clinically benign and clinically malignant tumors. Additionally. overexpression of LIN28B was significantly associated with reduced disease-free survival (p = 0.026), but not with overall survival (p = 0.406). Copy number variation analysis showed that only a child with a virilizing benign tumor had LIN28B amplification and a woman with a metastatic adrenocortical carcinoma had LIN28B deletion. No LIN28A copy number variation was detected. A Ki67 >= 20% in children was able to discriminate patient with worse prognosis: there was a significant associtation with reduced overall (p = 0,015) and disease-free survival (p = 0,001) in 36 pediatric ACTs with Weiss >- 3. CONCLUSIONS: Weak LIN28 staining was associated with reduced disease-free survival in a large cohort of adult adrenocortical carcinoma. LIN28A had higher expression in aggressive carcinomas in adults, suggesting there might be negative posttranscriptional regulation of LIN28 protein expression. Interestingly, overexpression of mir-9, a negative LIN28A regulator, predicted poor outcome in adult patients. In addition, LIN28B overexpression was an potential marker of poor prognosis in the pediatric population. A Ki67 index >- 10% in adults and >- 20% in children were associated with poor prognosis
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A importância da tríplice endoscopia no diagnóstico de neoplasias primárias múltiplas em pacientes com carcinoma epidermóide de vias aerodigestivas superiores / Importance of triple endoscopy in the diagnosis of multiple primary tumors in patients with upper aerodigestive tract squamous cell carcinoma

Priante, Antonio Vitor Martins 12 March 2010 (has links)
INTRODUÇÃO: Pacientes com carcinomas das vias aerodigestivas superiores (VADS) apresentam um alto risco de desenvolver outros cânceres tanto simultaneamente quanto subsequentemente. A maioria destes tumores ocorre nas VADS, pulmões ou esôfago. A tríplice endoscopia (laringoscopia, endoscopia digestiva alta e broncoscopia) possibilita o diagnostico de lesões precursoras e de tumores invasivos. No entanto, a maioria dos estudos limita-se a descrever a frequência de diagnósticos, mas não os resultados do tratamento e o impacto na sobrevida. OBJETIVOS: Avaliar a importância da tríplice endoscopia para o diagnóstico de neoplasias primárias múltiplas e as diferenças no estadiamento e nas taxas de sobrevida de pacientes com carcinoma epidermóide de VADS. Caracterizar o perfil e analisar fatores de risco para neoplasias primárias múltiplas. MÉTODOS: Trata-se de estudo caso-controle retrospectivo em que foram incluídos pacientes com carcinoma epidermóide de VADS, submetidos à tríplice endoscopia antes do início do tratamento (grupo tríplice endoscopia), pareados, por sexo, idade e localização, estádio clínico e tratamento do tumor primário, com pacientes não submetidos à tríplice endoscopia na avaliação inicial (grupo controle). RESULTADOS: Foram incluídos 135 pacientes em cada grupo. No grupo tríplice endoscopia ocorreram mais diagnósticos de segundo tumor primário (STP), 34 (17 simultâneos e 17 metacrônicos), do que no grupo controle, 20 (1 simultâneo e 19 metacrônicos). Não foi identificada diferença significativa entre o estadiamento dos tumores de grupo tríplice endoscopia e do grupo controle. As curvas de sobrevida global, específica por câncer, livre de doença e pós-STP foram semelhantes nos dois grupos. A sobrevida livre de STP foi maior no grupo controle. Na análise multivariada foram identificados como fatores prognósticos independentes para a sobrevida, o sexo (feminino, RR 0,51, IC 0,30 0,88), a idade (maior que 57 anos, RR 1,73, IC 1,29 2,31), a localização do tumor primário (laringe, RR 0,60, IC 0,39 0,93), o estádio N (N2 e N3, RR 1,78, IC 1,26 2,51) e o estádio clínico do tumor primário (III e IV, RR 2,75, IC 1,69 4,46). As variáveis independentes relacionadas ao diagnóstico e à ocorrência de STP foram a realização de tríplice endoscopia (RR 1,93; IC 95% 1,02 - 3,65), o tipo de tratamento do tumor primário (cirurgia exclusiva, RR 3,14; IC 95% 1,11 - 8,85) e o tempo de seguimento (maior que 24 meses, RR 3,69; IC 95% 1,19 - 11,47). CONCLUSÃO: Não ocorreu diferença no estádio clínico dos STP e nas sobrevidas global, específica por câncer, livre de doença e pós-STP entre o grupo tríplice endoscopia e o grupo controle. Foram identificados como fatores independentes relacionados ao diagnóstico e a ocorrência de STP o tratamento realizado (cirurgia exclusiva), o tempo de seguimento (maior que 24 meses) e a realização da tríplice endoscopia. / INTRODUCTION: Patients with upper aerodigestive tract (UADT) carcinomas have a high risk of developing others cancers simultaneously or subsequently. Most of these tumors occur in UADT, lungs or esophagus. Triple endoscopy (laryngoscopy, endoscopy and bronchoscopy) enables the diagnosis of premalignant and invasive tumors. However, most of the studies describe only the frequency of the diagnosis, but not the results of treatment and its impact on survival. OBJECTIVES: To evaluate the importance of triple endoscopy for the diagnosis of multiple primary tumors and the differences in clinical stage and survival rates of patients with squamous cell carcinoma of the UADT. To characterize and to analyze the risk factors for multiple primary tumors. METHODS: This is a case-control study that included patients with squamous cell carcinoma of the UADT, that were submitted to a triple endoscopy before the first treatment (triple endoscopy group), matched by sex, age and location, clinical stage and treatment of primary tumor, with patients not undergoing triple endoscopy in the initial evaluation (control group). RESULTS: One hundred and thirty five patients were included in each group. The diagnosis of second primary tumor (SPT) was more frequent in the triple endoscopy group than in the control group, 34 (17 simultaneous and 17 metachronous) and 20 cases (1 simultaneous and 19 metachronous), respectively. No significant difference was found between the clinical stage of triple endoscopy group and the control group. The curves of overall survival, cancer specific, disease-free and after SPT were similar in both groups. The SPT free survival was higher in the control group. In the multivariate analysis were identified as independent prognostic factors for survival, sex (women, RR 0.51, CI 0.30 - 0.88), age (older than 57 years, RR 1.73, CI 1.29 - 2.31), the primary tumor site (larynx, RR 0.60, CI 0.39 - 0.93), N stage (N2 and N3, RR 1.78, CI 1.26 - 2.51) and the clinical stage of primary tumor (III and IV, RR 2.75, CI 1.69 - 4.46). The independent variables related to the diagnosis and the occurrence of SPT were triple endoscopy (RR 1.93, 95% CI 1.02 - 3.65), the primary tumor treatment (surgery alone, RR 3.14, 95% CI 1.11 - 8.85) and follow-up (greater than 24 months, RR 3.69, 95% CI 1.19 - 11.47). CONCLUSION: There was no difference in the clinical stage of the SPT and overall survival, cancer specific, disease-free and post SPT between the triple endoscopy group and control group. As independent predictors for the diagnosis and the occurrence of SPT were treatment performed (just surgery), follow-up time (greater than 24 months) and triple endoscopy.
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Análise da expressão da proteína NY-ESO-1 no melanoma cutâneo / NY-ESO-1 protein analysis in cutaneous melanoma

Giavina-Bianchi, Mara Huffenbaecher 01 April 2016 (has links)
INTRODUÇÃO: o câncer é a doença que mais mata pessoas com idade abaixo de 85 anos e é um problema de saúde pública. Os tumores podem expressar em determinada fase de seu desenvolvimento proteínas anômalas que podem ser alvo de métodos diagnósticos e de intervenções terapêuticas. A expressão de NY-ESO-1 é detectada em 20 a 40% dos melanomas. Há evidências que esta expressão é mais freqüente em tumores de estágios mais avançados e está associada a um pior prognóstico. OBJETIVOS: determinar a frequência de expressão da proteína NY-ESO-1 no melanoma cutâneo e tentar correlacioná-la com o índice de Breslow, aspectos histopatológicos do melanoma, incluindo o infiltrado linfocítico tumoral, e a morbi-mortalidade dos pacientes. MÉTODOS: o presente estudo é longitudinal de coorte retrospectiva e foi realizado de agosto de 2009 a outubro de 2015. Foram selecionados 89 melanomas de 87 pacientes do Ambulatório de Tumores do Departamento de Dermatologia da FMUSP, divididos em 3 grupos, sendo: grupo 1: 34 melanomas com índice de Breslow <= 1,0 mm; grupo 2: 29 melanomas com índice de Breslow entre 1,1 - 4,0 mm e grupo 3: 26 melanomas com índice de Breslow >= 4,0 mm. As lâminas dos exames anátomo-patológicos destes pacientes foram revisadas quanto ao diagnóstico de melanoma, seu índice de Breslow e a presença de infiltrado linfocítico tumoral. A seguir, realizou-se exame de imunohistoquímica para a determinação da presença do antígeno NY-ESO-1 em todos os 89 tumores coletados e em mais 20 nevos (11 displásicos e 9 intradérmicos) escolhidos ao acaso. Através da revisão dos dados do prontuário, foram obtidos os dados clínicos de: idade, sexo, raça, fototipo da pele, local de aparecimento do melanoma, status do linfonodo sentinela quando realizado, desenvolvimento de metástases e sobrevida dos pacientes. Os dados anátomo-patológicos do tumor analisados foram: tipo histológico, presença de ulceração, e tipo de infiltrado linfocítico tumoral. Nos melanomas que apresentavam infiltrado linfocítico tumoral, foram realizados testes imunohistoquímicos para pesquisa de células CD3+, CD8+, FoxP3+ e CD8+FoxP3+ (duplamente positivas). RESULTADOS: O antígeno NY-ESO-1 esteve presente em 19% dos melanomas cutâneos primários e não foi detectado em nenhum dos 20 nevos pesquisados. A expressão do antígeno NY-ESO-1 esteve estatisticamente relacionada a tumores com espessuras maiores. Apresentou também uma associação inversa com o tipo extensivo superficial em relação aos outros tipos histológicos. O infiltrado linfocítico tumoral dos melanomas NY-ESO-1 positivos continha menor número de células CD3+, que se encontravam isoladas ou arranjadas em pequenos grupos de até 5 células, o que contrastava significantemente com os tumores NY-ESO-1 negativos, com maior densidade de células CD3+, dispostas em grandes grupos, com 6 ou mais células. A expressão da proteína NY-ESO-1 não esteve associada à idade, ao sexo, ao fototipo, ao sítio primário do tumor, à presença de ulceração, ao status do linfonodo sentinela, ao desenvolvimento de metástases ou à sobrevida. CONCLUSÕES: Há expressão de NY-ESO-1 em uma porcentagem considerável dos melanomas, principalmente nos mais espessos. O menor número de células CD3+ no infiltrado linfocítico tumoral, acrescido ao fato destas células estarem isoladas ou em pequenos grupos, sugere que embora imunogênico, a expressão do antígeno NY-ESO-1 não resulta num estímulo eficaz do sistema imune no combate ao tumor. O desenvolvimento de uma vacina para estes pacientes poderá, no futuro, aumentar as possibilidades terapêuticas do melanoma / INTRODUCTION: cancer is the disease that leads to the greatest number of deaths in people over 85 years old and it has become a major public health problem. Tumors may express aberrantly proteins during certain phases of their development, which can be target for diagnostic or treatment purposes. NY-ESO-1 is detected in 20 to 40% of melanomas. There is evidence that it is more frequent in advanced stages and that is associated with a worse prognosis. OBJECTIVES: to determine the frequency of NY-ESO-1 protein expression in cutaneous melanoma and to try to correlate it to Breslow index, melanoma histopathological aspects, including the tumor infiltrating lymphocytes, and patients morbi-mortality. METHODS: the present study is longitudinal of retrospective cohort. The research was carried on from August 2009 to October 2015. Eighty nine melanomas were selected from 87 patients in Oncology Outpatient Clinic, Dermatology Division, University of São Paulo and divided in 3 groups, such as: group 1: 34 melanomas with Breslow index <= 1,0 mm; group 2: 29 melanomas with Breslow index between 1,1 - 4,0 mm e group 3: 26 melanomas with Breslow index >= 4,0 mm. All specimens were reviewed for diagnostic, Breslow index and tumor infiltrating lymphocytes. After that, immunohistoquimical test for the presence of NY-ESO-1 antigen was performed in all 89 melanomas collected and in 20 nevi (11 dysplastic nevi and 9 dermal nevi) that were randomly chosen. By reviewing clinical charts, the following data was obtained: age, sex, skin phototype, site of the tumor, lymph node sentinel status, development of metastases and survival of the patients. The histological data analyzed was: histological melanoma type, presence of ulceration, grade of tumor infiltrating lymphocytes. In those melanomas that had tumor infiltrating lymphocytes, we performed immunohistoquimical tests for the presence of CD3+, CD8+, FoxP3+ and CD8+FoxP3+ (double positive) cells. RESULTS: antigen NY-ESO-1 was present in 19% of primary cutaneous melanomas and none of the 20 nevi. The expression of antigen NY-ESO-1 was statistically related to thicker melanomas. It presented also an inverse association with superficial spreading melanoma type compared to other subtypes. Tumor infiltrating lymphocytes of NY-ESO-1 positive melanomas had fewer CD3+ cells, that were isolated or arranged in small groups up to 5 cells, which was significantly different from tumors NY-ESO-1 negatives, with higher density of CD3+ cells, displayed in large groups of 6 or more cells. The expression of NY-ESO-1 protein was not associated to age, sex, phototype, site, ulceration, lymph node sentinel status, development of metastases and survival. CONCLUSIONS: A considerable amount of melanomas express NY-ESO-1, mainly thicker tumors. The fewer number of CD3+ cells in the tumor infiltrating lymphocytes, added to the fact of those cells being isolated or in small groups suggest that, although immunogenic, the expression of NY-ESO-1 antigen does not result in a efficient stimulus of the immune system to fight the tumor. The development of a vaccine to those patients may, in the future, enhance the roll of therapeutic possibilities for melanoma

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