Resumo: O alho é propagado através de bulbilhos, prática que favorece a perpetuação de patógenos, especialmente os vírus. Pode ser infectado por vírus pertencentes aos gêneros Allexivirus, Carlavirus e Potyvirus. Garlic common latent virus (GarCLV) e Shallot latent virus (SLV) são os principais carlavirus encontrados em alho no mundo. No Brasil, existem poucas informações sobre as espécies de carlavirus ocorrendo em alho, de modo que os objetivos do trabalho foram realizar levantamento visando determinar a ocorrência de carlavirus em algumas regiões produtoras do País, caracterizar e identificar através de técnicas biológicas e moleculares os isolados obtidos. Novecentas e dezenove amostras foram coletadas nos estados de São Paulo, Paraná, Goiás e Minas Gerais. Através do teste de ELISA, 560 foram positivas somente para potyvirus, 53 verificou-se a infecção pelo complexo entre GarCLV e potyvirus, sete foram positivas para SLV e potyvirus, duas positivas para GarCLV e uma para SLV. Cento e oito amostras foram negativas para os testes realizados. Alguns isolados de GarCLV foram inoculados mecanicamente, utilizando extrato vegetal, em plantas de Chenopodium amaranticolor, Celosia argentea, C. murale, C. quinoa, Nicotiana occidentalis, Gomphrena globosa, Allium tuberosum (cebolinha japonesa), Allium porrum (alho-porro) e Allium fistulosum (cebolinha). A presença de anéis cloróticos e mosaico foram observados em plantas de Celosia argentea, pontos cloróticos em Nicotiana occidentalis e lesões locais em Chenopodium quinoa. 2 Os oligonucleotídeos universais e específicos para GarCLV foram eficientes para detecção de vírus. Quatorze isolados foram sequenciados, indicando se tratar de isolados de GarCLV. A identidade de nucleotídeos entre os isolados de GarCLV foram de 87% a 97% comparadas com sequências depositadas no GenBank. Pela primeira vez no Brasil, foi detectado... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Garlic is propagated by bulbs, practice that favors the transmission of pathogens, especially viruses. Garlic can be infected by viruses belonging to the genus Allexivirus, Carlavirus and Potyvirus. Garlic common latent virus (GarCLV) and Shallot latent virus (SLV) are the most important carlavirus species infecting garlic around the world. In Brazil there is no information about the species of carlavirus occurring in garlic, so the objective of this work was to evaluate the occurrence of carlavirus in some producing regions of Brazil and to identify and characterize the isolates by molecular and biological techniques. Nine hundred and nineteen samples were collected in the states of São Paulo, Paraná, Goiás and Minas Gerais. Through the ELISA test, 560 were positive for the presence of potyvirus, 53 were infected with GarCLV and potyvirus, seven were infected with SLV and potyvirus, two by GarCLV, and one for SLV. One hundred and eight samples were negative for the presence of viruses. 4 Some GarCLV isolates were inoculated by sap transmission on Chenopodium amaranticolor, Celosia argentea, C. murale, C. quinoa, Nicotiana occidentalis, Gomphrena globosa, Allium tuberosum Allium porrum and Allium fistulosum. The presence of rings spots and mosaic were observed on Celosia argentea, chlorotic spots on Nicotiana occidentalis and chlorotic local lesions on C. quinoa. The universal oligonucleotides for carlavirus and the specifics for GarCLV were efficiently used for the detection of the viruses. Fourteen isolates were sequenced, indicating the presence of GarCLV species. The identity of nucleotides between the GarCLV isolates was of 87% to 97% compared to the sequences deposited in GenBank. SLV was detected for the first time in Brazil on samples collected in São Manuel and Piraquara. The nucleotide identity of the complete CP sequence was of 90% to 99% compared to the sequences... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Marcelo Agenor Pavan / Coorientador: Renate Krause Sakate / Banca: Antonio Carlos Maringoni / Banca: Valdir Atsushi Yuki / Mestre

Orientador: Dirceu Maximino Fernandes / Banca: Roberto Lyra Villas Bôas / Banca: Marcelo Agenor Pavan / Banca: Rosemary Marques de Almeida Bertani / Banca: Clarice Backes / Resumo: O alho é uma hortaliça utilizada como condimento e como planta medicinal. O Brasil é um importante produtor/consumidor desta hortaliça, entretanto a produção nacional é insuficiente e portanto importa de quase 60% do alho consumido. Práticas precisas de manejo na produção e pós-colheita precisas podem resultar em economia na produção, aumento da produtividade e qualidade. Entre as práticas de manejo destaca-se a fertilização destaca-se pela influência direta na produção do alho e constituir um dos principais itens do custo de produção. Após a colheita a deterioração do alho minimamente processado (produto com maior valor agregado) pode ser diminuída através do armazenamento em temperatura controlada e atmosfera modificada. Com o objetivo de avaliar e documentar as melhores fontes e doses de nitrogênio e fontes potássio, bem como o melhor método para o armazenamento do alho minimamente processado foram conduzidos três ensaios que serão apresentados em três capítulos, sendo o primeiro intitulado "Fontes de nitrogênio e potássio sob a produtividade e nutrição mineral do alho", o segundo capítulo intitulado "Produtividade e nutrição mineral do alho sob diferentes doses de nitrogênio e fontes de potássio", e o terceiro capítulo intitulado "Efeito de diferentes temperaturas e atmosfera modificada sob as características qualitativas do alho minimamente processado". Concluiu- se a) Diferentes fontes de N e K podem ser combinadas para a obtenção de máxima produção de alho comercial, b... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Garlic is used as a spice and as a medicinal plant, Brazil is an important producer/ consumer of this herb, however small domestic production stimulates import of about 60% the garlic consumed in this country. Management practices in the production and accurate post-harvest can result in savings in production and increasing in yield and quality. Among the management practices, fertilization is distinguished by its direct influence on the production of garlic and constitute one of the main cost items of production and postharvest deterioration of minimally processed garlic (product with higher added value) can be reduced by storing in controlled and modified atmosphere temperature. In order to assess and document the best sources and doses of nitrogen and potassium sources, as well as the more suitable storage method for fresh-peeled garlic we carried out three tests that will be presented in three chapters, the first entitled "Yield and mineral nutrition of vernalized virus free garlic in response to nitrogen and potassium sources topdressing" the second chapter entitled "Yield and mineral nutrition of garlic in response to nitrogen doses and potassium sources topdressing", "Quality changes in fresh-peeled garlic cloves in relation to storage temperatures and modified atmospheres". From these assays we concluded that a) Different sources of N and K may be combined to obtain maximum production of commercial garlic, b) the garlic mineral content is not influenced by the sources of N and K to be considered a critical factor to garlic productivity, c) 80 kg ha -1 of N is the best way to obtain both maximum fertilizer efficiency and productive of virus free vernalizated garlic cultivar Caçador, d) from the dose 80 kg ha -1, the lowest accumulation of nutrients in the bulb in SKO treatments suggests that potassium sulfate, alleviates possible effects of toxicity caused by excess NH4 + and reduces minerals ... / Doutor

Resumo: Os objetivos deste trabalho foram avaliar os efeitos do silicato de cálcio e do N no controle preventivo da reinfecção viral e pseudoperfilhamento do alho convencional e alho livre de vírus, visando aumentar a eficiência no uso da água, o aproveitamento do nitrogênio e conseqüentemente a produtividade, através de avaliações fitopatológicas e fitotecnicas da cultivar Roxo Pérola de Caçador, vernalizada por 45 dias a 4°C. O trabalho foi conduzido durante os anos agrícolas de 2009 e 2010 na Fazenda Experimental São Manuel, pertencente à Faculdade de Ciências Agronômicas (FCA), Campus de Botucatu - Unesp (latitude 22o45' S, longitude 48o34' W, altitude de 750m). O delineamento experimental utilizado foi o de blocos ao acaso, em esquema fatorial de 4 x 4 x 2 com quatro repetições. Os tratamentos foram constituídos por quatro doses de nitrogênio, (0, 50, 100 e 200 kg ha-1); quatro doses de silicato de cálcio, (0, 2, 4 e 6 Mg ha-1) e dois tipos de alho, convencional e livre de vírus. As parcelas foram de 1,20 x 2,0 m. Observou-se que o pH não variou em função das doses de silicato de cálcio, variando apenas o teor de silício e conseqüentemente o teor de Ca, em 2009 e 2010. O índice SPAD de alho livre de vírus é superior ao alho convencional. A assimilação liquida de CO2 (A) de alho livre de vírus é superior a do alho convencional. A relação Si:Ca encontrada na massa seca de alho é em média de 0,45, sendo portanto, classificado como planta não acumuladora de Si. O teor de Si de 0,85% na massa seca, não impede a reinfecção viral em alho livre de vírus. A produtividade de alho convencional apresenta resposta variável em função do nitrogênio. A produtividade de alho livre de vírus é influenciada pela interação ilicato de cálcio x N, atingindo a máxima produtividade de 18 Mg ha-1 / Abstract: The objectives of this research were to evaluate the effects of calcium silicate and N in the preventive control of viral reinfection and the lateral bud growth in conventional garlic and virus-free garlic, aiming at increasing the efficiency of water use, making a good use of nitrogen and consequently increasing the productivity, through the phytopathological and phytotechnical evaluations of the cultivar Roxo Pérola de Caçador, vernalized for 45 days at 4 °C. The task was held during the two agricultural years of 2009 and 2010 in the Experimental Farm in São Manuel, belonging to the School of Agronomical Sciences, São Paulo State University (UNESP), Botucatu Municipality, São Paulo State, Brazil at latitude 22o45" S, longitude 48o34" W, altitude 750m. The experimental design was randomized blocks in factorial scheme 4 x 4 x 2 with four replications. The treatments consisted of four doses of nitrogen (0, 50, 100 and 200 kg ha-1), four doses of calcium silicate, (0, 2, 4 and 6 Mg ha-1) and two types of garlic, conventional garlic and virus-free garlic. The plots were of 1.20m x 2.0 m. It was observed that the pH did not vary with the doses of calcium silicate, only varying the silicon content and therefore the content of Ca in 2009 and 2010. The SPAD index of virus-free garlic is superior to conventional garlic. The CO2 assimilation net (A) of the virusfree garlic is superior to conventional garlic. The Si:Ca ratio in the dry mass of garlic is an average of 0.45 being, therefore classified as a not Si accumulating plant. The Si content of 0.85% in dry weight, does not prevent viral reinfection in virus-free garlic. The productivity of conventional garlic has a variable response depending on the nitrogen. Productivity of free virus garlic is influenced by the interaction of calcium silicate x N, reaching the maximum yield of 18 Mg ha-1 / Orientador: Leonardo Theodoro Büll / Coorientador: Marcelo Agenor Pavan / Coorientador: Rumy Goto / Banca: Dirceu Maximino Fernandes / Banca: João Domingos Rodrigues / Banca: Shizuo Seno / Banca: Rovilson José de Souza / Doutor

Orientador: Leonardo Theodoro Büll / Banca: Rumy Goto / Banca: Takashi Muraoka / Resumo: Conduziu-se dois experimentos, um em ambiente protegido e outro em campo, com o objetivo de avaliar a viabilidade do monitoramento da adubação nitrogenada em cobertura, na cultura do alho vernalizado, através de medidas indiretas do teor de clorofila nas folhas, relacionando-as com o estado nutricional das plantas. Foi adotado o delineamento experimental de blocos ao acaso e os resultados foram submetidos à análise de variância através de regressão, adaptando a melhor equação, através do programa Sisvar, versão 4.2. Os tratamentos utilizados foram: 0, 20, 40, 60, 120, 240 e 360 kg N ha-1, aplicados parceladamente em cobertura aos 30 e 50 dias após a emergência (DAE), tendo sido aplicado 20 t ha-1 de esterco bovino no plantio. Foram realizadas nove avaliações do teor de clorofila e altura das plantas com intervalos de 10 dias entre cada avaliação, iniciando-se aos 20 e finalizando aos 100 DAE. Por ocasião de cada avaliação, foram coletadas duas plantas para análise do conteúdo de nitrogênio e demais nutrientes. Na colheita, após o período de "cura", foram obtidos os dados de produção de bulbos, porcentagem de bulbos pseudoperfilhados, índice de formato de bulbos e classificação de acordo com o tamanho. No experimento realizado em campo ocorreu interação entre as doses de nitrogênio e as épocas de avaliação para altura e teor de clorofila. Os maiores valores de altura foram encontrados sem aplicação de nitrogênio e nas épocas mais tardias de avaliações. Os maiores teores de clorofila foram encontrados quando se aplicou a dose de 240 kg ha-1 de nitrogênio, para as épocas avaliadas a maior concentração foi encontrada aos 100 DAE. A concentração de nitrogênio foi influenciada pelas doses e pelas épocas de avaliações, ocorrendo interação entre esses fatores...(Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Two experiments were carried out, one in a protected environment and another in the field, aiming to evaluate the viability of the sidedress nitrogen management in the vernalizated garlic culture, through indirect measures of the chlorophyll rate in the leaves, relating them with the nutritional state of the plants. The randomized block experimental design was adopted and the results were submitted to Analysis of variance through regression, adapting the best equation through Sisvar program, 4.2 version. The treatments used were: 0, 20, 40, 60, 120, 240 and 360 Kg N ha?£, applied in parts sisedress at 30 and 50 days after emergency (DAE), 20 t ha?£ of bovine manure during planting had been applied. Nine evaluations of the chlorophyll rate and plants height were carried out with 10 days intervals between each evaluation, beginning at 20 and ending at 100 DAE. In each evaluation two plants were collected for nitrogen rates analysis and other nutrients. At harvest, after the "cure " period, the production bulb data were obtained, secondary growth bulbs percentage, bulb formation index and classification according to the size. In the experiment carried out in the field there was interaction between the nitrogen dose and the dates of height evaluation and chlorophyll rate. The highest values of height were found without nitrogen application and in the latest evaluations. The highest chlorophyll rates were found when 240 Kg ha?£ of nitrogen were applied, for the dates evaluated the highest concentration occurred at 100 DAE. The nitrogen concentration was influenced by doses and dates of evaluation, with interaction between these factors...(Complete abstract click electronic access below) / Mestre

O alho (Allium sativum L.) originário das zonas temperadas da Ásia Central é uma planta herbácea da família Alliaceae; possui como principais constituintes funcionais a alicina e a inulina. A alicina é um componente ativo e responsável pelo cheiro característico e atividade antimicrobiana, enquanto que a inulina é classificada como prebiótico e como fibra alimentar solúvel por ser resistente à digestão na parte superior do trato intestinal. Neste trabalho foram estudadas as propriedades físico-químicas do alho in natura, além do processo de branqueamento em água e vapor e a desidratação por ar quente e liofilização no alho. Os bulbos de alho foram limpos e selecionados considerando a ausência de injúrias visuais e infecções, bem como a uniformidade de tamanho e cor. O alho in natura apresentou umidade de 64,15±0,09 %, atividade de água de 0,986±0,001, sólidos solúveis de 36,00±0,85 °Brix e pH de 6,41±0,008. As concentrações de inulina, glicose e frutose foram de 56,62±0,89, 2,37±0,03 e 2,23±0,05 g/100g de matéria seca respectivamente. Os bulbilhos do alho foram descascados e cortados em rodelas com diâmetros de 15±2,40 mm e espessuras de 1±0,35 mm. A seguir as amostras passaram pelo processo de branqueamento em água previamente aquecido a 80 e 90 °C e em vapor a 100 °C à pressão atmosférica. Foram empregados tempos de 1, 2, 4, 6, 8 e 10 minutos em ambos os casos. Nesta etapa verificou-se o efeito do tempo e temperatura de branqueamento sobre a atividade das enzimas peroxidase, polifenoloxidase e inulinase e, mediram-se os parâmetros de cor L*, a* e b*, avaliando-se a cinética de inativação dessas enzimas e das mudanças de cor. A análise das concentrações de inulina, glicose e frutose foram realizadas para as melhores condições de branqueamento utilizando Cromatografia Líquida de Alta Eficiência. A melhor condição de branqueamento foi obtida no vapor por 4 minutos, onde não se observaram mudanças na textura, com redução da atividade enzimática de 93,53 %, 92,15 % e 81,96 % para a peroxidase, polifenoloxidase e inulinase respectivamente. Nesta condição a concentração da inulina diminuiu 3,72 %, enquanto que a glicose aumentou 0,67 % e a frutose 0,55 %, quando comparadas ao alho in natura, devido à atividade residual da inulinase. Durante o branqueamento em água e vapor o parâmetro de cor L* aumentou com o tempo, tornando as amostras mais claras, enquanto que a* e b* diminuíram, obtendo-se rodelas mais esverdeadas e azuladas. Na secagem, as rodelas de alho sem ou com branqueamento em vapor por 4 minutos, foram levadas a um secador de ar forçado às temperaturas de 50, 60 e 70 °C durante 6 horas. Para a liofilização as rodelas foram previamente congeladas a -80 °C por 24 horas e dispostas em bandejas dentro de um liofilizador empregando pressão de 64 μmHg, onde permaneceram por tempo médio de 48 horas. Ao estudar a cinética de secagem em ar forçado usando os modelos propostos por Henderson-Pabis, Page e Newton constatou-se o aumento da constante da taxa de secagem com o aumento da temperatura e com o uso do branqueamento. Os valores de umidade e de atividade de água no equilíbrio, obtidos a partir da porção assintótica das curvas de secagem em condições dinâmicas, estiveram na faixa de 0,086 a 0,102 g/g de matéria seca e de 0,376 a 0,521 aw respectivamente, sendo estes menores com o aumento da temperatura e com emprego do branqueamento. Posteriormente as amostras desidratadas por ar quente e liofilização, foram moídas para medição dos parâmetros de cor, tamanho de partículas e determinação dos teores de inulina, glicose e frutose, temperatura de transição vítrea e observação da microestrutura por microscopia eletrônica de varredura. As amostras liofilizadas tiveram valores de L* significativamente maiores, e parâmetros de a* e b* menores que as amostras desidratadas em ar forçado, sendo as amostras liofilizadas mais claras, esverdeadas e azuladas, próxima à cor do alho in natura. Também foi encontrado a diminuição da concentração de inulina e aumento dos teores de glicose e frutose nas amostras desidratadas, indicando a possível hidrólise da inulina, podendo estar relacionada à atividade residual da enzima inulinase. Também foi observado nas amostras branqueadas menores concentração de inulina, glicose e frutose, que quando não branqueadas, devido à possível lixiviação na água. Nas amostras liofilizadas os diâmetros médios das partículas foram de 79,35 μm e 104,79 μm no alho sem e com branqueamento respectivamente, sendo menores que às desidratadas em ar quente que variaram de 119,28 μm à 302,04 μm, observando-se, por microscopia eletrônica, menores danos na superfície das amostras liofilizadas, pois este processo origina menor contração e conseqüentemente menor rugosidade nas amostras quando comparado com a secagem em ar. As temperaturas de transição vítrea do alho desidratado em pó variaram de 99,39±1,98 °C à 120,15±3,80 °C, sendo maior quanto menor o valor de atividade de água, confirmando o efeito plasticizante da água. / Garlic (Allium sativum L.) originated in the temperate zones of Central Asia and is a herbaceous plant of the Alliaceae family; its main functional components are allicin and inulin. Allicin is the active component responsible for the characteristic odor and anti-microbial activity, whereas inulin is classified as a prebiotic substance and as a soluble dietary fiber since it is resistant to digestion in the small intestine. The physicochemical properties of garlic in natura were studied in the present work, and also the processes of water and steam blanching and dehydration in hot air and by freeze-drying. The garlic cloves were cleaned and selected considering the absence of visual injuries and infections and also uniformity of size and color. The in natura garlic presented a moisture content of 64.15±0.09 %, water activity of 0.986±0.001, soluble solids of 36.00±0.85 °Brix and pH of 6.41±0.008. The inulin, glucose and fructose concentrations were 56.62±0.89, 2.37±0.03 and 2.23±0.05 g/100g of dry matter, respectively. The garlic cloves were peeled and cut into slices with diameters of 15±2.40 mm and thicknesses of 1±0.35 mm. The samples were submitted to blanching in water baths previously heated to 80 and 90 ºC and, steam at a temperature of 100 ºC at atmospheric pressure. Times of 1, 2, 4, 6, 8 and 10 minutes were employed for both water and steam blanching. At this stage the effects of blanching time and temperature on the activities of the enzymes peroxidase, polyphenoloxidase and inulinase were determined, and the color parameters of L*, a* and b* were measured, evaluating the kinetics of inactivation of these enzymes and the color changes. The concentrations of inulin, glucose and fructose were determined by high performance liquid chromatography in the samples treated with the best of the blanching conditions. The best blanching conditions were obtained using steam for 4 minutes. Under these conditions no changes in texture were observed, and the enzymatic activities were reduced by 93.53 %, 92.15 % and 81.96 % for peroxidase, polyphenoloxidase and inulinase, respectively. Under these conditions the inulin concentration decreased by 3.72 % and the glucose and fructose concentrations increased by 0.67 % and 0.55 %, respectively, when compared to the in natura garlic, due to the residual inulinase activity. The color parameter L* increased with time during both steam and water blanching, whereas a* and b* decreased, obtaining slices which were greener and bluer. For drying, the garlic slices, with or without steam blanching for 4 minutes, were placed in forced air dryers at 50, 60 and 70 ºC for 6 hours. For freeze drying, the slices were previously frozen at -80 ºC for 24 hours and then placed in trays in the freeze drier at a pressure of 64 μmHg, where they remained for a mean time of 48 hours. The models proposed by Henderson-Pabis, Page & Newton were used to study the drying kinetics, and it was shown that the drying rate constant increased with increase in temperature and with the use of blanching. The equilibrium values for moisture content and water activity (aw), obtained from the asymptotic part of the drying curves under dynamic conditions, were in the range from 0.086 to 0.102 g/g of dry matter and from 0.376 to 0.521 respectively, these values decreasing with increase in temperature and with the use of blanching. After drying the samples using both hot air and freeze-drying, they were ground for subsequent determination of the color parameters, particle size, inulin, glucose and fructose contents and glass transition temperatures, and for observation of the microstructure by scanning electronic microscopy. The freeze-dried samples showed significantly higher values for L* and lower values for a* and b* than the samples dried by forced air, and thus the freeze-dried samples were lighter in color and more greenish or bluish, closer to the color of the in natura garlic. All the dehydrated samples showed a decrease in the inulin contents and increase in the glucose and fructose contents, indicating a possible hydrolysis of the inulin which could be related to the residual activity of the enzyme inulinase. There were also lower inulin, glucose and fructose concentrations in the blanched samples as compared to the non-blanched samples, possibly due to leaching into the water. In the freeze-dried samples the mean particle diameters were 79.35 μm and 104.79 μm for the non-blanched and blanched samples, respectively, smaller than the values obtained in the forced air-dried samples, whose diameters varied from 119.28 μm to 302.04 μm. By way of scanning electronic microscopy, it was observed that the surface of the freeze-dried samples was less damaged than that of the forced air-dried samples, since freeze-drying results in less contraction and consequently less wrinkling than air drying. The glass transition temperatures of the dehydrated garlic powders varied from 99.39±1.98 °C to 120.15±3.80 °C, increasing with decrease in the water activity, confirming the plasticizing effect of water.

Buscou-se identificar e comparar a atividade antibacteriana do extrato alcoólico de três acessos de Allium tuberosum - Rottler ex Sprengl – Liliaceae - originários da região metropolitana de Porto Alegre/RS frente a agentes de toxinfecções alimentares, especificamente: Staphylococcus aureus (ATCC 25.923), Enterococcus faecalis (ATCC 19.433), Salmonella Enteritidis (ATCC 11.076) Escherichia coli (ATCC 11.229). Inicialmente, in vitro, através de Teste de Diluição, por meio de Sistema de Tubos Múltiplos e o emprego de desinibidores bacterianos, determinou-se a Intensidade da Atividade de Inibição Bacteriana (IINIB) e a Intensidade de Atividade de Inativação Bacteriana (IINAB), revelando-se capacidades seletivas sobre os diferentes inóculos Gram-negativos, que atingiram inibição e inativação máximas e permanentes para Salmonella às 48 horas de confrontação inóculo/extrato, e às 72 horas de confrontação para Escherichia coli, respectivamente. As bactérias Gram-positivas ( Staphylococcus e Enterococcus) apresentaram resistência total nas diferentes confrontações. Não houve diferença significativa na atividade antibacteriana das três amostras de alho em estudo. Em um segundo momento, para um dos acessos de alho, através de Teste de Suspensão, determinou-se IINAB em duas simulações de preparação alimentar, requeijão cremoso e caldo de carne, condimentados com alho nirá, respectivamente. No modelo requeijão, E.coli mostrou-se completamente resistente em concentrações finais de 103, 104 e 105 U.F.C./mL, estas imediatamente acima da concentração máxima tolerada pela legislação brasileira, em três tempos de confrontação (24, 48, 72 horas), nas concentrações finais do extrato alcoólico de 10, 20 e 30 %, atendendo à legislação quanto à padrão de identificação e qualidade deste alimento. No caldo de carne, na concentração constante de 50 % de planta originalmente verde, Salmonella foi inativada totalmente na concentração de 105 U.F.C./mL já às 24 horas de confrontação, enquanto Escherichia atingiu este patamar às 48 horas de confrontação,Comenta-se, outrossim, o significado da inibição bacteriana demonstrada, relacionada à preditividade dos resultados de diagnóstico bacteriológico em protocolos de investigação de surtos toxinfectivos alimentares. / It was looked for to identify and to compare the antibacterial activity of the alcoholic extract of three accesses of Allium tuberosum - Rottler ex Sprengl - Liliaceae - original from Porto Alegre (RS/BR) metropolitan area, confronted to alimentary toxic infections agents, specifically: Staphylococcus aureus (ATCC 25.923), Enterococcus faecalis (ATCC 19.433), Salmonella Enteritidis (ATCC 11.076) Escherichia coli (ATCC 11.229). Initially, in vitro, through Test of Dilution, System of Multiple Tubes and the use of bacterial uninhibitors, was determined the Intensity of the Activity of Bacterial Inhibition (IINIB) and the Intensity of Activity of Bacterial Inactivation (IINAB), being revealed selective capacities on the different Gram-negative inoculums, that reached inhibition and maximum and permanent inactivation for Salmonella at 48 hours of confrontation inoculum/extract, and 72 hours of confrontation for Escherichia coli. The Gram-positive bacteria (Staphylococcus and Enterococcus) presented total resistance in the different confrontations. There was not significant difference in the antibacterial activity of the three accesses of garlic in study. Subsequently, for one of the samples of garlic, through Test of Suspension, was determined IINAB in alimentary simulation of creamy cheese seasoned with alcoholic extract in final concentration of 10, 20 and 30%, assisting to the legislation as for to identification pattern and quality of this food; as well as in simulation of alimentary preparation of bouillon, with the plant recently picked, in the final concentration of 50%. In the model creamy cheese, E.coli was shown completely resistant in final concentrations of 103, 104 and 105 U.F.C./mL, these immediately above the maximum concentration tolerated by the Brazilian legislation, in three times of confrontation (24, 48, 72 hours), in all of the final concentrations of the alcoholic extract. In the conditions of the simulated bouillon, Salmonella was totally inactivated in the concentration of 105 U.F.C./mL already at 24 hours of confrontation, while Escherichia reached this point at 48 hours of confrontation. Is commented, likewise, the meaning of the demonstrated bacterial inhibition, related to the prediction of the results of bacteriological diagnosis in protocols of alimentary toxic infective outbreaks investigation.

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Garlic is a natural host of viral species belonging to the genera Potyvirus, Carlavirus and Allexivirus. The latter was recently established as a member of the Flexiviridae family and groups Garlic mite-borne filamentous virus (GarMbFV), Garlic virus A (GarV-A), Garlic virus B (GarV-B), Garlic virus C Garlic virus D (GarV-D), Garlic virus E (GarV-E), Garlic virus X (GarV-X) and Shallot virus X (ShV-X). In Brazil, imported garlic has been used for planting, which constitutes a risk of introduction of exotic viral species in the country. Currently, the detection of allexivirus in bulbs can be performed by serological and / or molecular tests, and planting is necessary to obtain foliar tissue with high concentration of viral particles, which requires, on average, 30 days. Serological tests are efficient, however, because of the difficulty in producing high quality antisera, are currently less indicated than molecular methods. Aiming to reduce the time for analysis of detection of allexivirus in garlic, a methodological adjustment for nucleic acid extraction was sought directly from the leaf primordia of bulbilhos. Samples of garlic, from Rio Grande do Sul and imported from Argentina were analyzed using foliar primordia obtained by dissecting the bulbiles to extract total RNA using the Trizol reagent. Amplifications of the target genomic fragment were performed via RT-PCR. A band at the time corresponding to 500 bp was observed on agarose gel in the two samples studied. PCR products were transferred to membranes for Southern blot testing, for which a cold probe capable of detecting Allexivirus species was used, from which testing the presence of allexivirus was confirmed. Another allexivirus detection analysis was carried out on samples of garlic consumption imported from Argentina, China and Spain, following the same methodology, being verified a band corresponding to 500 bp in samples from Argentina and China. Southern Blot test, in which a specific cold probe was used to detect GarV-C, confirmed viral infection by the aforementioned species. According to the results obtained, it was found that the extraction of total RNA directly from leaf primordia, combined with the use of molecular techniques, presents itself as a fast and efficient method for detection of allexivirus. It was also verified that most of the analyzed samples are infected with allexivirus, evidencing a sanitary pattern that contraindicates the use of this type of material as seed, with the risk of introduction of exotic viral species. / O alho é uma monocotiledônea pertencente à família Aliaceae, originário da Ásia Central. No Brasil, foi introduzido pelos portugueses, na época do descobrimento, sendo amplamente utilizado na culinária até os dias atuais. Botanicamente, trata-se de uma herbácea agâmica, com aproximadamente 50 cm de altura, propagada via bulbilho, o que permite a manutenção das características agronômicas. Este método de propagação possibilita uma eficiente disseminação de patógenos, principalmente vírus, que são um dos principais grupos de patógenos desta cultura, podendo causar uma redução do potencial produtivo entre 20 e 80%. O alho é hospedeiro natural de espécies virais pertencentes aos gêneros Potyvirus, Carlavirus e Allexivirus. Este último foi recentemente estabelecido como membro da família Flexiviridae e agrupa as espécies Garlic mite-borne filamentousvirus (GarMbFV), Garlic virus A (GarV-A), Garlic virus B (GarV-B), Garlic virus C (GarV-C), Garlic virus D (GarV-D), Garlic virus E (GarV-E), Garlic virus X (GarV-X) e Shallot virus X (ShV-X). No Brasil, o alho consumo importado tem sido empregado para o plantio, o que se constitui um risco de introdução de espécies virais exóticas no país. Atualmente, a detecção de allexivírus em bulbos pode ser realizada por testes sorológicos e/ou moleculares, sendo necessário plantio para obtenção de tecido foliar com alta concentração de partículas virais, o que requer, em média, 30 dias. Os testes sorológicos são eficientes, no entanto, em razão da dificuldade para produção de anti-soros de alta qualidade, atualmente são menos indicados que os métodos moleculares. Objetivando reduzir o tempo para análise de detecção de allexivírus em alho, buscou-se um ajustemetodológico para extração de ácido nucléico diretamente dos primórdios foliares de bulbilhos. Amostras de alho consumo, oriundos do Rio Grande do Sul e importado daArgentina foram analisadas, empregando-se primórdios foliares obtidos por dissecação dos bulbilhos para extração de RNA total com uso do reagente Trizol. As amplificações do fragmento genômico alvo foram realizadas via RT-PCR. Uma banda na altura correspondente a 500 pb foi observada, em gel de agarose, nas duas amostras estudadas. Os produtos de PCR foram transferidos para membranas para teste de Southern Blot, para o qual empregou-se uma sonda fria capaz de detectar espécies de Allexivirus, de cujo teste foi confirmado a presença de allexivírus. Outra análise de detecção de allexivírus foi realizada em amostras de alho consumo importado da Argentina, China e Espanha, seguindo a mesma metodologia, sendo verificada, uma banda na altura correspondente a 500 pb em amostras oriundas da Argentina e da China. Teste de Southern Blot, no qual empregou-se uma sonda fria específica para detectar GarV-C, confirmou infecção viral pela espécie citada. De acordo com os resultados obtidos constatou-se que a extração de RNA total diretamente de primórdios foliares, aliada ao uso de técnicas moleculares apresenta-se como um método rápido e eficiente para detecção de allexivírus. Constatou-se também, que a maior parte das amostras analisadas encontra-se infectada por allexivírus, evidenciando um padrão sanitário que contra-indica o uso deste tipo de material como semente, com o risco de introdução de espécies virais exóticas.

Orientador: Rolf Dieter Illg / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-23T13:18:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Siqueira_WalterJose_D.pdf: 11194906 bytes, checksum: fce62283a5b049541786b1b739673dae (MD5) Previous issue date: 1997 / Resumo: Bulbinhos obtidos em 1987 do cultivo in vitro de ápices caulinares (meristemas) dos cultivares Lavínia 1632, Amarante e Roxinho 5063 foram plantados inicialmente em casa-de-vegetação (1988) e, posteriormente, em condições de campo (1989 a 1995), com a finalidade de avaliar o desempenho agronômico, a estabilidade e adaptabilidade fenotípicas. De 1988 a 1991, os plantios sucessivos para multiplicação dos materiais foram realizados individualmente, bulbo a bulbo, como progênies ou linhas clonais, procedendo-se da mesma forma para os cultivares controles. No ciclo de multiplicação de 1990, cinco plantas de cada progênie clonal foram amostradas ao acaso e avaliadas para os seguintes caracteres de parte aérea: comprimento (CF) e largura de folha (LF), diâmetro do pseudo-caule (DC) e sintomas de viroses nas folhas(VIR). Os bulbos colhidos nas cinco plantas amostradas foram pesados em dois períodos (PB1 e PB2).No ano de 1991, os bulbos de cada planta amostrada constituíram-se em novas progênies clonais, avaliando-se o vigor das plantas (VIG), VIR e peso médio de bulbo (PM). As correlações fenotípicas nos anos de 1990 e 1991 e entre os dois anos, para os grupos de progênies clonais formados (n° 5, n° 6, n° 8, n° 19 e n° 34) e os controles, mostraram uma estreita associação de caracteres de parte aérea, tanto dentro, como entre os ciclos estudados. O caráter VIR mostrou no plantio de 1990, coeficientes de correlação fenotípica negativos e significativos com DC (r=44,91 a -57,48) e com PBl (r=-46,48 a -56,32). No ano seguinte, o caráter VIR correlacionou-se também com VIG e PM. As correlações fenotípicas de pares de caracteres entre os dois anos ou ciclos de multiplicação, foram significativas e de média magnitudes para a maioria das progênies estudadas. O caráter DC/90, foi o que apresentou maior grau de associação com os caracteres VIR, VIG e PM avaliados no ciclo de 1991. Concluiu-se que, a seleção no campo de plantas com maior DC, num determinado ciclo, produziu uma descendência clonal visualmente mais sadia e mais produtiva no ciclo subseqüente. Observou-se neste trabalho que, a avaliação visual de sintomas de vírus nas folhas, mostrou-se adequada para indicar o comportamento dos caracteres ligados ao vigor e peso de bulbo dentro e entre ciclos de multiplicação. As correlações fenotípicas obtidas para os clones experimentais nos ensaios de 1992 a 1995, mantiveram esta mesma tendência. Sobressaíram-se nestes ensaios os clones experimentais Ct 19, ct 34 e ct Rx, além do cultivar controle Gigante de Curitibanos. A seleção massal de plantas de maior vigor no campo, em especial para o diâmetro do pseudo-caule, ou de bulbos maiores mostrou-se eficiente na recuperação da produtividade dos cultivares controles Lavínia 1632 e Amarante. O clone experimental Ct 19 apresentou redução de produtividade ano a ano de tal forma que, em 1995 a produção relativa média igualou-se ao do cultivar controle Lavínia 1632 com seleção. Fato este, não observado para o clone Ct 34 que manteve o rendimento elevado ao longo de quatro anos de multiplicação. A melhor razão de multiplicação em termos de peso de bulbilhos plantados e peso de bulbos colhidos por metro quadrado de parcela, ficou ao redor de 1:12 (Ct 34, Ct 19) enquanto que os respectivos controles, cv Amarante e Lavínia 1632, tiveram os valores de 1:9,4 e 1:9,8. O estudo sobre a influência do tamanho de bulbilhos plantados no peso de bulbo colhido mostrou uma maior resposta para os clones experimentais derivados de ápices caulinares do que os cultivares controles, exceto para o cultivar Gigante de Curitibanos. Finalmente, o estudo da estabilidade fenotípica dos materiais, por dois modelos estatísticos, revelou os clones Ct 34 e cv Gigante de Curitibanos como os mais responsivos às modificações do ambiente e com maior estabilidade fenotípica. O ct 19, por sua vez, foi mais responsivo aos ambientes desfavoráveis do que nos favoráveis, muito embora, neste ultimo, o patamar de produção inicial tenha sido superior do que os demais / Abstract: Bulblets obtained in 1987 from in vitro culture of stem shoot tip (meristems) of cultivars Lavinia 1632, Amarante and Roxinho 5063 were mul tiplied ini tially in greenhouse (1988) and, later, in field condi tions (1989 to 1995) in order to evaluate the agronomic performance and phenotypic stability as compared to each other and to control cultivars. From 1988 to 1991, the plantings for multiplication were made bulb by bulb, as clonal progenies. The same procedures were observed for the original control cultivars, Lavinia 1632, Amarante and Roxinho 5063. In the 1990 cycle of multiplication, five plants were sampled from each progeny and evaluated for the following vegetative characters: lenght (LF) and width (WF)of the foliar blade, diameter of the pseudo-stem (DS) and leaf vírus symptoms (VS). The bulbs harvested from the five plants sampled were weighed individually after 50 days (BW1) and 160 days (BW2) after harvest. The follow year, progenies from such bulbs were grown and vigor of plant (VP), meam bulb weight (MW)and VS were recorded. The phenotypic correlations obtained from the characters within and between years (199O and 1991) for the each formed groups of clonal progenies (nºs 5, 6, 8, 19 and 34) and the controls showed a close association of the vegetative characters, either within or between the cycles studied, especially for clones 19 and 34. In 1990, VS showed highly significant phenotypic correlation coefficients with DS (r= -44,91 to -57,48) and BWl (r= -46,48 to -56,32). In 1991, VS was also strongly correlated with VP and MW. The phenotypic correlations of the paired characters between both years or cycles of multiplication were significant and of medium magnitude in most of the progenies studied. The character DS/90 showed the highest associations with the three characters evaluated in the 1991 cycle, VIR, VIG and MW. It was concluded that field selection of plants with larger DS, in a given cycle, greatly contributed to obtain healthier plants and with higher yields in the next cycle. It was observed that the visual evaluation of virus symptoms in leaves, made in a practical way in field conditions, provided a reasonable indication about the influence of characters associated to vigor and bulb weight, within and between cycles of multiplication. The phenotypic correlations with the data collected in experiments from 1992 to 1995, maintained the same tendency. In these trials, the best performances were observed for Ct 19, Ct 34 and Ct Rx experimental clones, and the control cultivar Gigante de Curitibanos. Mass selection for plants with higher vigor in the field or with larger bulbs was efficient in recovering yield of controls cvs. Lavinia 1632 and Amarante. The clone ct 19 showed such an year-to year yield reduction that, in 1995, its mean relative yield was close to that of control cultivar Lavinia 1632, after mass selection of the later. In the other hand, Ct34 did not show decrease in mean yield along the years or cycles of multiplication. The best multiplication ratio, as to the weight of planted bulblets and harvested bulbs per meter square of plot, remained at around 1:12 (Ct 34, ct 19), while the respective controls, cv Amarante and Lavinia 1632 showed values of 1:9,4 and 1:9,8. The preliminary study about the influence of size of bulblets planted on harvested bulb weight showed a higher response of experimental clones derived from in vitro culture as compared to the control cul ti vars. The study of phenotypic stability, through two statistical models, indicated clones ct 34 and cv. Gigante de Curitibanos as the most responsive to environmental improvement, as well as showing the greatest phenotypic stability and adaptability. Clone Ct 19 was more responsive in unfavorable than in favorable environments, although, in the later, its initial yield level was higher than the others / Doutorado / Doutor em Ciências

O alho é uma hortaliça importante não só pelo atrativo culinário, como também pelo grande número de propriedades medicinais. A utilização efetiva de recursos genéticos, conservados em bancos de germoplasma, em programas de melhoramento depende de criteriosa caracterização, utilizando em combinação caracteres agromorfológicos e marcadores moleculares. Neste estudo, 16 novos locos microssatélites específicos para a espécie foram desenvolvidos, 10 polimórficos. Os bancos de germoplasma de alho, das instituições IAC, ESALQ e Embrapa, foram caracterizados utilizando 17 locos microssatélites polimórficos, sete deles disponíveis na literatura. A maioria dos locos foi considerada moderado a altamente informativo, com PIC médio de 0,545 e máximo de 0,851. Foram encontrados 90 alelos, com riqueza alélica média de 2,258 alelos por loco e índice de Shannon de 1,176. A coleção da Embrapa apresentou destaque, com maior número de alelos privados e genótipos multi locos (MLGs). Os 151 acessos avaliados foram representados por 65 MLGs. A estratégia M foi utilizada para definição de uma coleção nuclear, que foi constituída por 16 acessos, com cobertura de 100% dos alelos e mínima redundância. O GST geral foi de 0,200 e para MLGs de 0,068, indicando alta diferenciação genética dentro dos bancos de germoplasma, e GIS de 0,195, indicando excesso de heterozigotos, comum em espécies de propagação vegetativa como o alho. A estruturação genética dos MLGs resultou na distinção de dois subgrupos pelo método Bayesiano, consistente com os agrupamentos observados no dendrograma e PCA. Os grupos formados apresentaram coerência com a classificação de acessos de acordo com o ciclo fenológico, em nobres e seminobres. Os marcadores microssatélites desenvolvidos neste trabalho são ferramentas valiosas para estudos de diversidade genética, conservação de germoplasma, mapeamento genético e associativo e espera-se que sejam úteis em futuros programas de melhoramento da espécie. / Garlic is an important crop not only for its culinary attractiveness, but also because of a huge number of medicinal properties. The genetic resources in germplasm require characterization by morphological traits and molecular markers to be effectively used in breeding programs. A novel set of 16 SSR loci specific to garlic were developed. Ten loci were polymorphic, moderate to highly informative, with an average PIC of 0.545 and maximum of 0.851. A total of 151 accessions of garlic from three Brazilian germplam, IAC, ESALQ, and Embrapa, were evaluated for genetic diversity using 10 novel polymorphic SSR loci and other 7 available in the literature. A total of 90 alleles were detected, the average allelic richness was 2.258 alleles per locus and the Shannon index 1.176. The Embrapa collection had the vast majority of private alleles and multi locus genotypes (MLGs). The whole collection was reduced to 65 MLGs. The M strategy were used to define a core collection, 16 accessions were selected with 100% coverage of alleles and minimum redundancy. Overall GST was 0.200 and for MLGs, 0.068, indicating a high genetic differentiation within collections, and GIS was 0.195, indicating an excess of heterozygosity, which was expected as garlic is vegetatively propagated. MLGs were structured in two subgroups by Bayesian approach, consistent with the clustering based on genetic distances and PCA. The groups were coherent with the classification of accessions according to phenology (noble and semi-noble). The new SSR loci are tools for future studies of genetic diversity, germplasm conservation, mapping, and associative genetics, and hopefully will shed light on garlic breeding programs.

Orientador: Gilberto de Nucci / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-04T10:02:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 AbibJunior_Eduardo_D.pdf: 639040 bytes, checksum: e96fa4a810e2980947816b23f3c078a1 (MD5) Previous issue date: 2005 / Resumo: Objetivo: Esta tese tem por objetivos: avaliar a agregação plaquetária e o comportamento da pressão arterial em três momentos (sem alho; alho dose única (3,5 g) e alho dose diária (3,5 g) duas vezes ao dia por 4 dias) em voluntários sadios; Analisar a resposta de agregação plaquetária in vitro adicionando extrato de alho diluído em PRP e por ultimo correlacionar os dados obtidos da analise da agregação com os parâmetros TxB2, GMPc entre in vivo e in vivo. Para Analise em in vivo foram selecionados dezoito (18) voluntários do sexo masculino, entre 18 a 45 anos, saudáveis, para estudo não randomizado, aberto e divididos em tres grupos (Grupo Sem alho; Grupo Com Alho Único e Grupo Alho Diário). Amostras de sangue dos voluntários foram coletadas de acordo com horários pré-estabelecidos. Após execução da agregação plaquetária, Pressão arterial através da MAPA e quantificação dos níveis de TXB2, foram realizadas análises estatisticas. Para analise in vitro foram selecionados 5 voluntários sadios, de ambos os sexos, isentos de qualquer medicação uma semana antes coleta. O sangue foi coletado e o PRP foi separado e adicionado extrato de alho em volume determinado. Após execução da agregação plaquetária e quantificação dos níveis de TXB2, foram tb realizadas análises estatisticas. Tendo estes dados tanto in vivo quanto in vivo procedeu-se a analise comparativa entre eles. Resultados : Na analise in vivo, tanto a agregação plaquetária quanto a inibição da formação de TxB2 não se observou diferença entre os outros grupos independente do agonista utilizado. Na analise in vitro, os resultados sugeriram que o extrato de alho, em quantidades pequenas, inibi a agregação plaquetária Os resultados se confirmaram com o TXB2, pois quantidades de extrato que foram capazes de inibir a agregação plaquetária induzida por todos agonistas, inclusive àquela induzida por AA, não causou diminuição significativa da síntese de TXA2 induzida por AA. Houve variação significativa da PA sistólica e FC com administração diária de alho fresco comparada ao sem alho e alho único. Conclusão: Concluímos que outros mecanismos podem estar envolvidos na inibição da agregação plaquetária que não da inibição da ciclooxigenase plaquetária quando utilizado o extrato de alho. Não há uma inibição da agregação plaquetária através da ação sobre a ciclooxigenase quando observado em voluntários que ingeriram alho fresco. A administração de alho in natura, pequenas quantidades (3,5g de dente de alho = 16 mg alicina/g de alho) pode contribuir para promover alterações no comportamento hemodinâmico como observado através da MAPA em voluntários sadios / Abstract: Objective: This thesis has as objectives: to evaluate the platelet aggregation and the behavior of blood pressure in three moments (control; garlic single dose (3,5 g) and garlic daily dose (3,5 g) twice a day for 4 days) in healthy volunteers; To analyze the in vitro platelet aggregation answer adding garlic extract diluted in PRP and the last to correlate the obtained data from the aggregation analysis with the TxB2, GMPc parameters between in vivo and in vivo. For the in vivo Analysis eighteen (18) healthy volunteers of the masculine gender between 18 and 45 years old were selected, for an open, non-randomized study and divided into three groups (Control; Group With Single Garlic and Group Daily Garlic). Samples of the volunteers' blood were collected according to the pre-established schedules. After execution of the platelet aggregation, blood Pressure through AMBP and quantification of TXB2 levels , statistical analyses were accomplished. For in vitro analysis 5 healthy volunteers of both genders were selected, free of any medication one week before collection. The blood was collected and the PRP was separated and added garlic extract in determined volume. After execution of the platelet aggregation and quantification of TXB2 levels, statistical analyses were also accomplished. Having these in vivo data as well in in vivo the comparative analysis between them was preceeded. Results: There was significant variation of the systolic BP and HR with daily administration of fresh garlic compared to control and single garlic. Regarding the platelet aggregation it was observed difference between the daily garlic group and the other two groups (P <0.005) when used agonist arachidonic acid. In the in vitro analysis, the results suggested that the garlic extract, in small amounts, can inhibit the platelet aggregation without affecting in a significant way the activity of ciclooxygenase. The results were confirmed with the TXB2, for amounts of extract that were capable to inhibit the platelet aggregation induced by all agonists, including that one induced by AA, didn't cause significant decrease of TXA2 synthesis induced by AA. Conclusion: We concluded that other mechanisms can be involved in the inhibition of the platelet aggregation other than the inhibition of the platelet ciclooxygenase when used the garlic extract. There is not an inhibition of the platelet aggregation through the action on the ciclooxygenase when observed in volunteers that ingested fresh garlic. The administration of garlic in natura, small quantities (3,5g garlic glove = 16 mg allicim/g garlic) can contribute to promote alterations in the hemodynamic behavior as observed through the AMBP in healthy volunteers / Doutorado / Clinica Medica / Doutor em Clínica Médica