Made available in DSpace on 2016-08-12T18:48:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-27. Added 1 bitstream(s) on 2016-08-12T18:50:34Z : No. of bitstreams: 1 000865660.pdf: 3326465 bytes, checksum: 677165db0436422bb78e6c2bb775bc41 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / FAPESP: 11/18240-2

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:04Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-02-27Bitstream added on 2014-06-13T18:09:12Z : No. of bitstreams: 1 goncalves_alm_me_botib.pdf: 590776 bytes, checksum: 8b55e04bfd5d2925a1cf2b9ac4822357 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Brassica oleracea é uma espécie botânica popularmente conhecida como “couve”. É utilizada na alimentação e também na medicina popular, devido às suas ações antiulcerogênica e quimiopreventiva do câncer, entre outras. Este estudo teve como objetivo avaliar o potencial genotóxico e antigenotóxico do extrato de folhas de Brassica oleracea em células somáticas e germinativas de camundongos in vivo, usando o Ensaio Cometa e o teste do micronúcleo. Os animais (camundongos Swiss albinos machos) foram divididos em oito grupos experimentais (n=6). O grupo controle negativo recebeu água destilada e o controle positivo 80 mg/kg de doxorrubicina (DXR). Três diferentes doses do extrato foram testadas (500, 1000 e 2000 mg/kg) para a avaliação do potencial genotóxico. As mesmas doses do extrato foram utilizadas simultaneamente com injeção intraperitoneal de DXR (uma hora após o tratamento com o extrato via gavage), para a avaliação dos potenciais antigenotóxico e anticlastogênico/antianeugênico. As células analisadas pelo Ensaio Cometa foram leucócitos de sangue periférico coletados 4 e 24 horas após os tratamentos, e células do fígado, cérebro, medula óssea e testículos, coletadas 24 horas após os tratamentos. Para o Teste do Micronúcleo, foram analisadas células de medula óssea, coletadas 24 horas após os tratamentos. Os dados obtidos foram estatisticamente analisados utilizando-se ANOVA e teste de Tukey-Kramer. A ausência de genotoxicidade e aneugenicidade/clastogenicidade foi observada para as três doses do extrato. No entanto, as três doses testadas induziram um decréscimo significante de danos no DNA das células analisadas pelo Ensaio Cometa, assim como redução no número de eritrócitos policromáticos micronucleados analisados pelo Teste do Micronúcleo, em comparação ao grupo controle positivo... / Brassica oleraceae is a botanical specie popularly known as “kale”. Is used in the feeding and also in folk medicine due to its anti-ulcerogenic and cancer chemopreventive activities, among others. The main objective of the present study was to evaluate the genotoxic and antigenotoxic potential of the Brassica oleraceae extract in different cells of mice in vivo, using the comet assay and micronucleus test. The animals (male Swiss mice) were divided in eight experimental groups (n = 6). The negative control group received distilled water and the positive control 80mg/kg of doxorubicin (DXR). Three different doses of the extract were tested (500, 1000 and 2000 mg/kg) to evaluate the genotoxic potential. The same extract doses followed by DXR injection (one hour after the treatment) were used to evaluate the antigenotoxic and anticlastogenic/antianeugenic potentials. The cells analyzed by comet assay were leukocytes from peripheral blood collected 4 and 24 hours after the treatments, and liver, brain, bone marrow and testicles cells collected 24 h after the treatments. Bone marrow cells collected 24 hours after the treatments were analyzed by micronucleus test. The data were statistically analyzed using ANOVA and Tukey-Kramer test. The absence of genotoxic and aneugenic/clastogenic effects was observed with the three tested doses of the extract. On the other hand, the three tested doses of the extract induced a significant decrease in the DNA damage in all cells analyzed by comet assay, and a reduction in the frequency of micronucleated polychromatic erythrocytes, in comparison with DXR positive control group. Under the experimental conditions employed in the present experiment, the results obtained showed that Brassica oleraceae extract is not genotoxic and presents a clear chemoprotection against DNA damage induced by doxorubicin

Orientador: Edson Luis Maistro / Banca: Mária Sérgio Mantovani / Banca: Wilma de Grava Kempinas / Resumo: Brassica oleracea é uma espécie botânica popularmente conhecida como "couve". É utilizada na alimentação e também na medicina popular, devido às suas ações antiulcerogênica e quimiopreventiva do câncer, entre outras. Este estudo teve como objetivo avaliar o potencial genotóxico e antigenotóxico do extrato de folhas de Brassica oleracea em células somáticas e germinativas de camundongos in vivo, usando o Ensaio Cometa e o teste do micronúcleo. Os animais (camundongos Swiss albinos machos) foram divididos em oito grupos experimentais (n=6). O grupo controle negativo recebeu água destilada e o controle positivo 80 mg/kg de doxorrubicina (DXR). Três diferentes doses do extrato foram testadas (500, 1000 e 2000 mg/kg) para a avaliação do potencial genotóxico. As mesmas doses do extrato foram utilizadas simultaneamente com injeção intraperitoneal de DXR (uma hora após o tratamento com o extrato via gavage), para a avaliação dos potenciais antigenotóxico e anticlastogênico/antianeugênico. As células analisadas pelo Ensaio Cometa foram leucócitos de sangue periférico coletados 4 e 24 horas após os tratamentos, e células do fígado, cérebro, medula óssea e testículos, coletadas 24 horas após os tratamentos. Para o Teste do Micronúcleo, foram analisadas células de medula óssea, coletadas 24 horas após os tratamentos. Os dados obtidos foram estatisticamente analisados utilizando-se ANOVA e teste de Tukey-Kramer. A ausência de genotoxicidade e aneugenicidade/clastogenicidade foi observada para as três doses do extrato. No entanto, as três doses testadas induziram um decréscimo significante de danos no DNA das células analisadas pelo Ensaio Cometa, assim como redução no número de eritrócitos policromáticos micronucleados analisados pelo Teste do Micronúcleo, em comparação ao grupo controle positivo ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Brassica oleraceae is a botanical specie popularly known as "kale". Is used in the feeding and also in folk medicine due to its anti-ulcerogenic and cancer chemopreventive activities, among others. The main objective of the present study was to evaluate the genotoxic and antigenotoxic potential of the Brassica oleraceae extract in different cells of mice in vivo, using the comet assay and micronucleus test. The animals (male Swiss mice) were divided in eight experimental groups (n = 6). The negative control group received distilled water and the positive control 80mg/kg of doxorubicin (DXR). Three different doses of the extract were tested (500, 1000 and 2000 mg/kg) to evaluate the genotoxic potential. The same extract doses followed by DXR injection (one hour after the treatment) were used to evaluate the antigenotoxic and anticlastogenic/antianeugenic potentials. The cells analyzed by comet assay were leukocytes from peripheral blood collected 4 and 24 hours after the treatments, and liver, brain, bone marrow and testicles cells collected 24 h after the treatments. Bone marrow cells collected 24 hours after the treatments were analyzed by micronucleus test. The data were statistically analyzed using ANOVA and Tukey-Kramer test. The absence of genotoxic and aneugenic/clastogenic effects was observed with the three tested doses of the extract. On the other hand, the three tested doses of the extract induced a significant decrease in the DNA damage in all cells analyzed by comet assay, and a reduction in the frequency of micronucleated polychromatic erythrocytes, in comparison with DXR positive control group. Under the experimental conditions employed in the present experiment, the results obtained showed that Brassica oleraceae extract is not genotoxic and presents a clear chemoprotection against DNA damage induced by doxorubicin / Mestre

Made available in DSpace on 2014-08-13T14:50:38Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-12-12Bitstream added on 2014-08-13T18:01:36Z : No. of bitstreams: 1 000741724_20141201.pdf: 197926 bytes, checksum: ac91e5d8eb4d509b8ea2984eab3e732a (MD5) Bitstreams deleted on 2014-12-02T13:27:21Z: 000741724_20141201.pdf,Bitstream added on 2014-12-02T13:27:59Z : No. of bitstreams: 1 000741724.pdf: 972060 bytes, checksum: 9c1d21f7846078e519f3d9100e012d54 (MD5) / Nas últimas décadas, a incidência de indivíduos com sobrepeso ou obesos vem aumentando exponencialmente. Hoje, a obesidade é considerada pela Organização Mundial da Saúde como uma epidemia mundial, com graves consequências que podem levar à morte. A obesidade é uma desordem multifatorial que envolve fatores hereditários, ambiente e estilo de vida, e suas consequências não são apenas sociais ou psicológicas, mas estão principalmente relacionadas à presença de co-morbidades como a hipertensão arterial, diabetes tipo II, doenças cardiovasculares e vários tipos de câncer. Portanto, o controle da obesidade é um desafio para a manutenção da saúde humana, atraindo o interesse de inúmeros pesquisadores que buscam o entendimento dos mecanismos associados ao seu desenvolvimento, bem como novos métodos terapêuticos e de prevenção. Com base nessas premissas, o presente estudo objetivou avaliar a associação entre alterações genéticas e a obesidade, com especial foco para a presença de danos no DNA e para o perfil de expressão e polimorfismos gênicos. A casuística do estudo incluiu 300 mulheres cadastradas na lista de espera para a realização de cirurgia bariátrica e 300 mulheres saudáveis, eutróficas, pareadas por idade. O teste do cometa foi utilizado para avaliação de danos primários no DNA de células sanguíneas; os polimorfismos dos genes da grelina (GHRL)e leptina (LEP)e dos seus receptores (GHSR e LEPR), da interleucina 6(IL-6) e da serotonina (5-HT2C) foram analisados pela técnica de RT-PCR; o perfil de expressão gênica em linfócitos foi avaliado pela metodologia do DNA microarray e a expressão dos genes adiponectina (ADIPOQ) e leptina (LEP) em adipócitos foi avaliada pela técnica de qRT-PCR. Os resultados mostraram que a frequência dos polimorfismos dos genes GHRL(rs26802), GHRS(rs572169), LEP(rs7799039), LEPR(rs 1137101), IL-6 (rs1800796) e 5-HT2C ... / In the last decades, the incidence of overweight and obesity has increased worldwide. Nowadays, obesity is considered by the World Health Organization as a global epidemic with severe consequences that can lead to death. Obesity is a multifactorial disorder which involves different factors such as genetic, environment and life style, and its consequences are not only social or psychological, but are also related to the presence of comorbidities such as hyperthension, type 2 diabetes, heart diseases and many types of cancer. Therefore, obesity control has become a challenge for the human health maintenance, catching the attention of researchers that are trying to understand the mechanisms associated to its development, as well as therapeutical and preventive methods. Based on the information above, the present study aimed to evaluate the association between genetic alterations and obesity, with special focus on the presence of DNA damage, gene expression profiling and genetic polymorphisms. Our study included 300 morbid obese women registered for the bariatric surgery and 300 healthy eutrophic women, matched by age. The comet assay was used to assess primary DNA damage in blood cells; the genetic polymorphisms of ghrelin (GHRL), leptin (LEP) and their receptors (GHSR and LEPR), interleukin-6 (IL-6) and serotonin receptor (5-HT2C) were evaluated by the RT-PCR; gene expression profiling in lymphocytes was assessed by DNA microarrays; and adiponectin (ADIPOQ) and leptin (LEP) gene expression in adipocytes were evaluated by qRT-PCR. Our results showed that the frequencies of GHRL (rs26802), GHRS (rs572169), LEP (rs7799039), LEPR (rs 1137101), IL-6 (rs1800796) and 5-HT2C (rs 3813929) polymorphisms were not different between obese and control groups. However, obese presented higher levels of primary DNA damage (single and double strand breaks, alkali-labile sites and oxidative damage) than eutrophic women, indepedent on ...

Made available in DSpace on 2016-05-17T16:51:48Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-11-11. Added 1 bitstream(s) on 2016-05-17T16:55:42Z : No. of bitstreams: 1 000864394.pdf: 1398611 bytes, checksum: 1d53902014d0da0cad94053a5326233a (MD5)

Made available in DSpace on 2015-10-06T13:03:18Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-20. Added 1 bitstream(s) on 2015-10-06T13:18:39Z : No. of bitstreams: 1 000849919.pdf: 1764719 bytes, checksum: cc1c24d4e6a06602b8ef15a77cbefe66 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / No presente estudo, foram analisadas citogeneticamente cinco espécies de peixes pertencentes ao gênero Trichomycterus: T. diabolus, T. iheringi, T. zonatus, Trichomycterus cf. mimonha e Trichomycterus sp., provenientes de diferentes bacias hidrográficas brasileiras. Foram utilizadas as técnicas de citogenética clássica (coloração com Giemsa, localização das RONs pela marcação com nitrato de Prata e bandamento C) e cito-moleculares (Hibridação Fluorescente in situ - FISH com sondas de DNAr 5S e 18S e o snDNA U2). Todas as espécies apresentaram número diploide de 2n=54 cromossomos com variações em sua fórmula cariotípica. Trichomycterus diabolus, T. iheringi, T. zonatus e Trichomycterus cf. mimonha apresentaram seu cariótipo com 34m + 12sm + 8st e Trichomycterus sp. apresentou 36m + 10sm + 8st, além da ocorrência de cromossomos supranumerários. As espécies também revelaram diferenças em relação ao tamanho dos dois primeiros pares cromossômicos do cariótipo, onde Trichomycterus sp. e T. diabolus apresentaram o primeiro e segundo metacêntrico de tamanho semelhante e maiores em relação aos demais cromossomos, enquanto em T. zonatus, Trichomycterus cf. mimonha e T. iheringi apenas o primeiro metacêntrico foi considerado o maior par. O bandamento C evidenciou blocos heterocromáticos instersticiais nos pares 2, 3, 7, 8, 19 e 23 de T. iheringi e no par 18 de T. diabolus, sendo que as demais espécies apresentaram blocos centroméricos de diferentes tamanhos espalhados por quase todo o cariótipo. As RONs foram identificadas em apenas um par cromossômico e foram coincidentes com a hibridação fluorescente in situ realizada com a sonda para DNAr 18S, com exceção de T. zonatus e Trichomycterus sp. que apresentaram marcações centroméricas no primeiro par e em um pequeno metacêntrico, respectivamente. A hibridação com a sonda para DNAr 5S revelou resultados mais diversos, sendo detectado um par para... / In the present study five species of fish from the genus Trichomycterus were analyzed cytogenetically, including T. diabolus, T. iheringi, T. zonatus, Trichomycterus cf. mimonha and Trichomycterus sp., collected at different Brazilian basins. The analyses involved classical (Giemsa conventional staining, localization of NORs for silver nitrate marking and C-banding) and molecular cytogenetic techniques (fluorescent in situ hybridization with ribosomal 5S and 18S, and U2 snDNA probes). All species showed diploid number of 2n = 54 chromosomes with variations in karyotype formula. Trichomycterus diabolus, T. iheringi, T. zonatus and Trichomycterus cf. mimonha presented their karyotype with 34m + 12sm + 8st and Trichomycterus sp. presented 36m + 10sm + 8st, besides the occurrence of supernumerary chromosomes. The species also reveals differences in relation to the size of the first two chromosome pairs of the karyotype, where Trichomycterus sp. and T. diabolus presented the first and second metacentric with similar size and larger than the other chromosomes, while in T. zonatus, Trichomycterus cf. mimonha and T. iheringi only the first metacentric was considered the largest pair. The constitutive heterochromatin showed interstitial blocks in pairs 2, 3, 7, 8, 19 and 23 in T. iheringi and the par 18 in T. diabolus and the other species presented centromeric blocks with different sizes spread throughout the greater part of the karyotype. NORs were identified in only one chromosome pair and were coincident with the fluorescent in situ hybridization using probes of 18S rDNA, except for T. zonatus and Trichomycterus sp. that showed additional centromeric signals on the first pair and other small metacentric, respectively. FISH using the probes of 5S rDNA was differentially distributed in the different species, with one chromosome pairs detected in T. diabolus, two pairs in T. iheringi, T. zonatus and three ...

Made available in DSpace on 2015-07-13T12:10:12Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-01-23. Added 1 bitstream(s) on 2015-07-13T12:25:39Z : No. of bitstreams: 1 000825088_20160130.pdf: 143158 bytes, checksum: 1209a3e2f1bc3903da54429dc938e213 (MD5) Bitstreams deleted on 2016-02-01T10:15:52Z: 000825088_20160130.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-02-01T10:16:43Z : No. of bitstreams: 1 000825088.pdf: 567086 bytes, checksum: 73ca882633cceb536b683b63c338096b (MD5) / A identificação humana por meio do DNA constitui um dos produtos mais revolucionários da Genética Moderna, tornando-se uma ferramenta indispensável na investigação criminal. Essa identificação é baseada no perfil genético do indivíduo, pela combinação de diversos marcadores herdados de seus progenitores. Os marcadores são, geralmente,e diferenças nas sequências de DNA nuclear entre os indivíduos (polimorfismos). Em alguns casos, em que a análise do DNA nuclear não puder ser aplicada, a alternativa de maior sucesso é a análise do DNA mitocondrial (DNAmt). As mitocôndrias são organelas intracelulares de dupla membrana presentes em todas as células nucleadas de mamíferos, com genoma extracromossômico separado e distinto do genoma nuclear, o DNA mt. A maioria dos laboratórios que utilizam tipagem do DNAmt baseiam-se nos polimorfismos presentes na sequência de nucleotídeos na região não codificadora (também conhecida como região controle, hipervariável, ou D-loop) do DNAmt. No entanto, a classificação em alguns haplogrupos pode não ser possível com base em dados apenas da região controle. Assim, estudos sugerem a necessidade de tipagem adicional de polimorfismos de nucleotídeos únicos (SNPs) em outras regiões do DNAmt, em especial, nos casos onde não é possível diferenciar os indivíduos apenas pela análise da região hipervariável. Este trabalho teve como objetivo analisar, analisar 30 (trinta) SNPs do DNAmt em amostras de indivíduos não relacionados, nascidos e residentes no Estado do Espírito Santo, permitindo a classificação das mesmas em haplogrupos e complementando os dados de SNPs da região controle do DNAmt obtidos em trabalho anterior no laboratório, para posterior utilização em casos forense. De um total de 100 amostras, foram encontrados 19 haplogrupos e a população estudada foi classificada conforme sua origem em: 43% africana, 30% europeia... / Human identification through DNA is one of the most revolutionary products of Modern Genetics, making it an indispensable tool in criminal investigation. This identification is based on the genetic profile of the individual, the combination of several markers inherited from their parents. The markers are generally differences in nuclear and DNA sequences between individuals (polymorphisms). In some cases, the analysis of nuclear DNA cannot be applied, the most successful alternative is the analysis of mitochondrial DNA (mtDNA). Mitochondria are intracellular organelles with a double membrane present on all nucleated mammalian cells with separate and distinct extrachromosomal genome nuclear genome, the mt DNA. Most laboratories use typing based mtDNA polymorphisms in the nucleotide sequence in the noncoding region (also known as the control region, the hypervariable or D-loop) of mtDNA. However, in some haplogrupos classification may not be possible based on only control data region. Thus, studies suggest the need for additional typing single nucleotide polymorphisms (SNPs) in other regions of mtDNA, especially in cases where it is not possible to differentiate individuals only by the analysis of hypervariable region. This study aimed to analyze, analyze thirty (30) SNPs of mtDNA in samples of unrelated individuals born and living in the State of Espírito Santo, allowing their classification in haplogroups and complementing the SNPs data of mtDNA control region achieved in previous work in the laboratory, for later use in forensic cases. A total of 100 samples, 19 were found haplogroups and the sample were classified according to its origin: 43% African, 30% European, 26% Native American, and 1% Asian. The haplogroup was found more L3 having African origin. Some samples of previous work could not be correctly classified only with the sequencing of the control region of mtDNA, after analysis of 30...

Made available in DSpace on 2016-06-07T17:12:12Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-27. Added 1 bitstream(s) on 2016-06-07T17:16:47Z : No. of bitstreams: 1 000864281.pdf: 2841286 bytes, checksum: e1b59c63f77c2d49bd85b14c3d63dde2 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / No presente estudo, foram analisadas dezoito espécies de peixes do gênero Characidium, C. cf. zebra, C. tenue, C. xavante, C. stigmosum, Characidium sp1, Characidium sp2, Characidium sp3, Characidium sp4, Characidium sp5, Characidium sp6, C. pterostictum, C. vestigipinne, C. rachovii, C. orientale, C. serrano, C. timbuiense, C. vidali e Characidium sp. aff. C. vidali de diferentes bacias hidrográficas brasileiras, com o uso de técnicas citogenéticas básicas (coloração com Giemsa e bandamento C) e moleculares (hibridação in situ fluorescente com sondas de DNAr 18S e 5S, DNA telomérico (TTAGGG)n e 4 sequências de microssatélites ((CA)15, (GA)15, (CG)15 e (TTA)10), e pintura cromossômica através da microdissecção e amplificação do cromossomo sexual W de C. gomesi (sonda chamada de CgW). Além disso, foi realizado o sequenciamento de DNA associado a sítios de restrição pela enzima SbfI (RAD-tags) através do sistema Illumina Genome Analyzer em machos e fêmeas de C. gomesi. Todas as espécies apresentaram número diploide de 2n=50 cromossomos, com predominância dos cromossomos dos tipos meta e submetacêntricos, além da ocorrência de cromossomos supranumerários em Characidium sp. aff. C. vidali e um par cromossômico acrocêntrico exclusivo detectado em C. pterostictum, C. serrano e C. timbuiense. Foi observada também a ocorrência de um sistema ZZ/ZW de cromossomos sexuais em distintos estágios de diferenciação em todas as espécies, com exceção de Characidium cf. zebra, C. tenue, C. xavante e C. stigmosum. A análise da heterocromatina constitutiva por bandamento C revelou a presença de heterocromatina nos cromossomos sexuais, principalmente no cromossomo W e em blocos intersticiais e/ou teloméricos nos braços longos do cromossomo Z e nos cromossomos Bs de Characidium sp. aff. C. vidali. Sequências de DNAr 5S foram localizadas em diferentes cromossomos, com variação na quantidade de sítios entre as espécies,... / In the present study, eighteen species from the genus Characidium collected at different river basins were analyzed, including C. cf. zebra, C. tenue, C. xavante, C. stigmosum, Characidium sp1, Characidium sp2, Characidium sp3, Characidium sp4, Characidium sp5, Characidium sp6, C. pterostictum, C. vestigipinne, C. rachovii, C. orientale, C. serrano, C. timbuiense, C. vidali e Characidium sp. aff. C. vidali. The analyses involved classical (Giemsa conventional staining and C-banding) and molecular cytogenetic techniques (fluorescent in situ hybridization with ribosomal 5S and 18S, telomeric, microsatellite motifs and U2 snDNA probes, whole chromosome painting using W-specific probe obtained from C. gomesi-CgW). Besides that, DNA sequencing of restriction-associated DNA (RAD) was carried out in males and females of C. gomesi. All species showed diploid chromosome numbers of 2n=50, with karyotypes mainly composed of meta- and submetacentric types, besides the occurrence of supernumerary chromosomes in Characidium sp. aff. C. vidali and one acrocentric pair in C. pterostictum, C. serrano e C. timbuiense. Also, almost all the analyzed species showed a ZZ/ZW sex chromosome system in distinct evolutionary stages, except Characidium cf. zebra, C. tenue, C. xavante e C. stigmosum. The constitutive heterochromatin was located differentially on the W chromosomes and in interstitial and telomeric position on the Z chromosomes, as well as in the B chromosomes of Characidium sp. aff. C. vidali. 5S rDNA was differentially distributed in the different species, with variations on the number of clusters per genome and position in the karyotype, while the 18S rDNA was conserved in number of sites per genome and variable in location. Conversely, the U2 snDNA distribution was conserved in a single homologous chromosome pair in all species, except in Characidium sp. aff. C. vidali and Characidium sp2. Telomeric probes revealed species with several interstitial... / FAPESP: 10/19971-8

Made available in DSpace on 2016-07-01T13:10:21Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-24. Added 1 bitstream(s) on 2016-07-01T13:14:06Z : No. of bitstreams: 1 000866307.pdf: 3768056 bytes, checksum: 8490480d72a7d7bf0de5818b9bc07d6a (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A família Characidae é a mais especiosa entre os peixes da ordem Characiformes. Um desses especiosos gêneros, com muitos conflitos taxonômicos é Astyanax, o qual é composto por, atualmente, 142 espécies, das quais 52 foram descritas nos últimos dez anos. Nesse estudo apresentamos um extenso trabalho de amostragem geográfica do gênero Astyanax, com exemplares provenientes da América do Sul e Central, cobrindo em sua maioria a distribuição do gênero. Neste contexto foram analisados espécimes do gênero em duas abordagens, uma acerca da diversidade de espécies e outra com foco nas relações filogenéticas do grupo. O estudo de diversidade foi baseado em sequencias barcode, do qual a porção 5' do gene Citocromo Oxidase subunidade I, proposta como capaz de separar espécies em nível molecular, auxiliando assim os estudos taxonômicos e a descoberta de novas espécies. O uso de diferentes abordagens para a clusterização de sequências (análises ABGD, GMYC e BIN) mostram uma consistência dos resultados obtidos com o valor inicial de corte de 2%, mas GMYC tende a identificar um número maior de grupos do que as demais análises. Os resultados apontam para a existência de quatro grandes grupos no gênero, totalizando 122 grupos de espécies, mas, em muitos casos, diversas espécies estão agrupadas em único cluster, tornando a identificação por DNA barcode praticamente impossível. Para a filogenia do gênero a análise baseada em dados moleculares multilocus apontam que Astyanax é polifilético e com pelo menos quatro linhagens, as quais são formadas pelos complexos de espécies A. scabripinnis e A. fasciatus, outro pelo complexo A. bimaculatus, uma linhagem com os exemplares da América Central e outra com espécies de regiões costeiras do leste do Brasil. Além disso, algumas espécies de Astyanax estão relacionadas com gêneros como Moenkhausia e Jupiaba, conhecidamente similares ao gênero em estudo. Todos os Astyanax... / The Characidae family is the most species rich between the order Characiformes. One such species rich genera, with many taxonomic conflicts is Astyanax, which comprises currently 142 species, of which 52 were described in the last ten years. In this study we present an extensive geographic sampling of the genus Astyanax with specimens from South and Central America, covering almost the entire distribution of the genus. In this context, the genus was examined by two approaches, one about the diversity of species and another focusing on the phylogenetic relationships of the group. The diversity study was based on barcode sequences, of which the 5' portion of Cytochrome Oxidase subunit I gene, proposed as standard tool to separate species at the molecular level, thus helping the taxonomic studies and the discovery of new species. The use of different approaches to clustering sequences (ABGD, GMYC and BIN analysis) show a consistency of results obtained with the initial cutoff value of 2%, but GMYC tends to identify a larger number of groups than other analyzes. The results point to the existence of four major groups in the genus, comprising 122 species groups, but in many cases, several species are grouped into a single cluster, making identification by DNA barcode virtually impossible. For the phylogeny analysis of the genus based on multilocus molecular, data shows that Astyanax is polyphyletic and at least four lineages, which are formed by the species complexes A. scabripinnis and A. fasciatus, other by complex A. bimaculatus, a lineage with specimens from Central America and other with species from coastal regions of South America. In addition, some species of Astyanax are related with genera such as Moenkhausia and Jupiaba, known to be morpholgical similar. All Astyanax are present in Clade C, with only exception of A. festae, who was in Clade A, and then we propose its review. Final data from this study point to a very complex ... / FAPESP: 11/00264-2

Made available in DSpace on 2016-09-27T13:39:58Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-07-20. Added 1 bitstream(s) on 2016-09-27T13:45:06Z : No. of bitstreams: 1 000868528.pdf: 1329679 bytes, checksum: cfad7bfc51dbbb09d097d17b2827ff26 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O câncer de mama é a forma mais comum de câncer e a segundo causa mais comum de morte por uma doença neoplásica afetando mulheres. Há uma série de fatores de risco reconhecidos para o desenvolvimento do câncer de mama incluindo fatores hereditários, hormonais, reprodutivos e história menstrual, idade, falta de exercício, álcool, radiação, doença benigna da mama, e obesidade. Embora aproximadamente 10% a 30% dos casos de câncer de mama sejam atribuídos a fatores hereditários, apenas 5% a 10% dos casos são identificados com um componente hereditário forte, e apenas uma pequena fração desses (4% a 5%) são explicados por mutações em genes de alta penetrância em uma herança autossômica dominante. Grande parte dos casos de câncer de mama hereditário são atribuídos a mutações germinativas nos genes de alta penetrância BRCA1 e BRCA2, responsáveis pela Síndrome de Câncer de Mama o Ovário Hereditários. Vários estudos têm identificado outros genes de susceptibilidade para o câncer de mama com alta penetrância, mas alguns casos de forte indício para uma síndrome hereditária como causa dos tumores de mama o resultado é negativo para mutações nestes genes. Recentemente, outros genes e marcadores polimórficos comuns também foram associados com aumento pequeno ou moderado no risco para câncer de mama. O sequenciamento de nova geração (NGS) permite analisar múltiplos genes simultaneamente em testes no formato de painéis, a um custo reduzido em comparação com o sequenciamento pela metodologia de Sanger. No entanto, informações clínicas relevantes sobre as variantes encontradas nestes testes estendidos não mantiveram o mesmo ritmo da tecnologia de sequenciamento. Faltam informações importantes como a penetrância das variantes genéticas (em particular, de variantes missense) e o manejo clínico adequado dos portadores destas mutações. O objetivo do presente estudo foi avaliar a ocorrência de... / Breast cancer is the most common form of cancer and the second most common cause of death from a neoplastic disease affecting women. There are a number of recognized risk factors for the development of breast cancer including hereditary factors, hormonal, reproductive and menstrual history, age, lack of exercise, alcohol, radiation, benign breast disease, and obesity. Although approximately 10% to 30% of breast cancer cases are attributed to hereditary factors, only 5% to 10% of cases are identified with a strong genetic component, and only a small fraction of these (4% to 5%) are explained by mutations in high penetrance genes in an autosomal dominant inheritance. Most cases of hereditary breast cancer are attributed to germline mutations in high penetrance genes BRCA1 and BRCA2 that are responsible for Breast Cancer Ovary Syndrome the hereditary. Several studies have identified other susceptibility genes for breast cancer with high penetrance, but some cases of strong evidence for a hereditary syndrome as a cause of breast tumors the result is negative for mutations in these genes. Recently, other genes and common polymorphic markers were also associated with small or moderate increase in risk for breast cancer. The next generation sequencing (NGS) allows the analysis of multiple genes simultaneously in tests on panels format whit a reduced cost compared to sequencing by the Sanger methodology. However, relevant clinical information about variants found in these extended tests have not kept the same pace of sequencing technology. Important information such as penetrance genetic variants (in particular, missense variants) and the appropriate clinical management of carriers of these mutations are not availabe. The aim of this study was to evaluate the occurrence of genetic changes in 17 breast cancer predisposition genes in Brazilian risk patients, suitable for genetic testing. Genetic testing included analysis of the DNA of patients using...