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Hepaintellec um sistema especialista de auxílio diagnóstico em hepatites virais

Ramos Júnior, Manoel Tiago Vidal 22 October 2012 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências da Saúde, Programa de Pós-Graduação em Ciências Médicas, Florianópolis, 2006. / Made available in DSpace on 2012-10-22T18:38:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 275134.pdf: 188387 bytes, checksum: 4dd35f64f96f2b0c9682c59962ea229a (MD5) / Em face da dificuldade na interpretação dos exames laboratoriais em Hepatites virais foi desenvolvido um sistema especialista para auxílio diagnóstico das Hepatites agudas por vírus A, B, e D, e Hepatites crônicas B e C. Foi utilizado o shell Intellec®, desenvolvido pelo Instituto de Engenharia Biomédica da Universidade Federal de Santa Catarina, como plataforma para implementação da base de conhecimento. O trabalho denominado Hepaintellec teve sua eficiência diagnóstica validada através do seu desempenho frente a 98 casos e 22 não casos de Hepatites, resolvidos por 3 especialistas em Gastroenterologia. Os seguintes dados foram obtidos com a amostra selecionada: Sensibilidade 87.8%, Especificidade 100%, Valor Preditivo Positivo 100% e Valor Preditivo Negativo 64,7%. Na amostra estudada o Hepaintellec foi capaz de auxiliar no diagnóstico em 100% dos casos de: Hepatites agudas A e B, Hepatites crônicas B e C e Hepatite aguda D na forma de superinfecção. Não possui capacidade nesta versão para auxiliar no diagnóstico de Hepatite aguda D na forma de coinfecção.
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Utilização de fungos xilófagos para controle da porosidade da madeira para aplicação em cerâmica biomórfica

Zeni, Thiago Luis January 2008 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. Programa de Pós-Graduação em Ciência e Engenharia de Materiais. / Made available in DSpace on 2012-10-23T19:51:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 262206.pdf: 2650663 bytes, checksum: 691641a0dadf514d9f2fd64a8f321a2e (MD5) / A produção de cerâmicas biomórficas é um processo desenvolvido para a fabricação de cerâmicas porosas a partir de estruturas naturais. Esta técnica baseia-se na impregnação de um precursor cerâmico em um suporte natural, seguida da conversão em materiais cerâmicos, que exibem uma micromorfologia similar à bioestrutura de partida. Este trabalho tem como objetivo principal a utilização de fungos xilófagos para o controle da porosidade e permeabilidade da madeira, visando à produção de materiais cerâmicos porosos. Para o aumento da porosidade e permeabilidade da madeira foram utilizadas as espécies Trichoderma sp. e Cytospora eucalypticola, classificadas como fungos manchadores da madeira. Corpos-de-prova cilíndricos da madeira de Pinus elliottii var. elliottii, seccionados nos sentidos radial e axial do tronco e dimensões de 1,0 cm de altura e 1,5 cm de diâmetro, foram submetidos ao ataque dos fungos, por um período de 28 dias. Semanalmente, uma parcela das amostras de madeira foi retirada e foi realizado o teste de permeabilidade ao ar e o cálculo da densidade geométrica para a obtenção da porosidade. Para conversão em cerâmica, os corpos-de-prova foram pirolisados a 900°C/1h/N2, seguido de várias infiltrações a vácuo com TEOS pelo processo sol-gel, e pirólise a 1600°C/3h/Ar, para ocorrer à reação carbono-silício. Para a caracterização do material foram realizadas técnicas de microscopia óptica (MO), microscopia eletrônica de varredura (MEV), espectro por dispersão de energia (EDS) e difratometria de raios X (DRX). Verificou-se o aumento e controle da porosidade e permeabilidade da madeira, após quatro semanas de ataque das duas espécies de fungos. Através das análises de imagens podem-se observar os caminhos percorridos pelos fungos nas células da madeira, além das aberturas provocadas na parede celular. Foi obtida a produção de materiais cerâmicos com características microestruturais semelhante ao material de partida, via processo sol-gel. Análises por MEV, EDS e DRX comprovaram a presença de SiC distribuído na parede celular da madeira e a presença de fases cristalinas.
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Produção e obtenção de ciclodextrinas produzidas por CGTases bacterianas /

Sanches, Raisa Déli de Oliveira. January 2014 (has links)
Orientador: Roberto da Silva / Banca: Heloiza Ferreira Alves do Prado / Banca: Gustavo Orlando Bonilla Rodriguez / Resumo: A ciclomaltodextrina glucanotransferase (EC 2.4.1.19) é uma enzima capaz de formar ciclodextrinas a partir do amido. As ciclodextrinas são oligossacarídeos cíclicos, os quais os principais tipos são α-, β- e γ-CD, que apresentam 6, 7 e 8 unidades de glicose interligadas por ligações α-1,4. Duas bactérias alcalofílicas Bacillus sp subgrupo alcalophilus E16 e Paenibacillus campinasensis H69-3 foram estudadas por apresentarem boa produção de CGTase, ambas foram isoladas de amostras de solo. A atividade enzimática foi estudada utilizando os métodos já pré-determinados em estudos anteriores, como dextrinizante, CD-fenolftaleína e determinação de proteína. Para alcançar a purificação foram utilizados os processos de ultrafiltração e purificação por gel filtração em resina Sephadex G-75. A partir desses processos obteve-se resultados significativos, para o extrato purificado produzido por Bacillus sp subgrupo alcalophilus E16, obteve-se um fator de purificação de 35,4 vezes, um rendimento de 34.1 % e atividade específica de 13.10 U/mg, enquanto o extrato purificado de Paenibacillus campinasensis H69-3 resultou em um fator de purificação de 94.5 vezes, um rendimento de 33.2 % e a atividade específica de 23.64 U/mg. Foram feitos ensaios quanto a produção de ciclodextrinas utilizando o extrato bruto concentrado da CGTase por ultrafiltração produzida por Paenibacillus campinasensis H69-3, no perfil de hidrólise de diferentes amidos a 1.0%, a enzima atuou convertendo o amido em β-CD de melhor forma nos amidos de arroz e de mandioca, enquanto que na concentração de 2.5 % a melhor conversão se deu nos amidos de milho e mandioca. Quanto à dextrinização dos amidos, as concentrações de 1.0 % e 2.5 % apresentaram o mesmo perfil de hidrólise, sendo os amidos de mandioca, solúvel e batata apresentaram melhor conversão, quando comparadas aos amidos de arroz e milho. A dextrinização do amido foi mais efetiva na ... / Abstract: The cyclomaltodextrin glucanotransferase ( EC 2.4.1.19 ) is an enzyme able to form cyclodextrin from starch . Cyclodextrins are cyclic oligosaccharides , which are the main types α - , β - and γ - CD which have 6, 7 and 8 glucose units connected by α - 1, 4 bonds. Two bacterial alkalophilic Bacillus sp subgroup alcalophilus E16 and Paenibacillus campinasensis H69 -3 was studied due to their good CGTase production, both of which were isolated from soil samples. The enzymatic activity was studied using the methods already pre-determined in previous studies, as dextrinizante, CD-phenolphthalein and protein determination. To achieve the purification and ultrafiltration processes were used for purification gel filtration resin Sephadex G-75. From these processes significant results were obtained for the purified extract produced by Bacillus sp subgroup alcalophilus E16 gave a purification factor of 35.4 times, a yield of 34.1% and a specific activity of 13.10 U / mg , while the purified extract of Paenibacillus campinasensis H69-3 resulted in a purification factor of 94.5 times , a yield of 33.2 % and specific activity of 23.64 U / mg . Tests were made for the production of cyclodextrins using concentrated crude extract by ultrafiltration CGTase produced by Paenibacillus campinasensis H69 3, hydrolysis of starches from different profile than 1.0 % , the enzyme acted converting starch into β- CD best in rice starch and tapioca , whereas a concentration of 2.5 % and better conversion is given cassava and corn starch . As for dextrinizing the starch, the concentrations of 1.0% and 2.5% showed the same profile hydrolysis , and cassava starches , potato and soluble showed better conversion, when compared to starches of rice and corn. Dextrinisation of starch was more effective at 1.0% concentration , because practically all starch was hydrolyzed at a concentration of 2.5% was slower hydrolysis , for 24 hours, the starches in the study were ... / Mestre
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Caracterização de segurança e tecnológica de bactérias acidoláticas termofílicas autóctones e aplicação em queijo parmesão /

Santos, Cecília Loyola Afonso dos. January 2015 (has links)
Orientador: Ana Lúcia Barretto Penna / Coorientador: / Banca: Daise Aparecida Rossi / Banca: Roberto da Silva / Resumo: As culturas selvagens ou autóctones isoladas de diversos alimentos podem produzir enzimas, vitaminas e compostos aromatizantes, ou ainda, compostos que apresentem efeitos fisiológicos em humanos. Estudos recentes realizados pelo nosso grupo de pesquisa mostraram que algumas cepas autóctones isoladas de muçarela de búfala são produtoras de bacteriocinas, e outras apresentam características probióticas. Neste contexto, o objetivo do trabalho foi avaliar as características de segurança e tecnológicas de treze cepas autóctones de bactérias acidoláticas (BAL) termófilas de Lactobacillus helveticus (SJRP56 e SJRP191), S. thermophilus (SJRP02, SJRP03, SJRP107 e SJRP109) e Lb. delbrueckii subsp. bulgaricus (SJRP49, SJRP50, SJRP51, SJRP57, SJRP76, SJRP149, SJRP181). Para a caracterização de segurança das culturas foram verificadas a susceptibilidade a antibióticos, a atividade hemolítica e das enzimas β-glucosidase, N-acetil-β-glucosaminidase e β-glucuronidase, e a presença de genes que caracterizam fatores de virulência, produção de aminas biogênicas e resistência a antibióticos. As propriedades tecnológicas: cinética de acidificação, produção de exopolissacarídeos e atividade enzimática, foram avaliadas para todas as cepas. Para as cepas consideradas seguras também foram realizadas as análises da hidrólise da caseína e a atividade de aminopeptidases. A partir da caracterização de segurança e tecnológica foram selecionadas quatro cepas: Lb. helveticus SJRP56 e SJRP191, Lb. delbrueckii subsp. bulgaricus SJRP57 e S. thermophilus SJRP107 para aplicação na produção de queijo Parmesão. Os queijos foram produzidos em escala industrial em dois processamentos independentes, utilizando-se leite pasteurizado e padronizado com 2,3% de gordura. Foi determinada a composição centesimal dos queijos após a produção, e durante o período de maturação foram avaliadas as características físico-químicas... / Abstract: Autochthonous lactic acid bacteria (LAB) isolated from various food can produce enzymes, vitamins, and flavor compounds, or compounds that exhibit physiological effects. Recently, studies performed by our research group showed that some autochthonous strains isolated from water buffalo mozzarella cheese are capable of producing bacteriocin as well as some strains presented probiotic properties. In this context, the aim of this study was to evaluate the safety and technological characteristics of autochthonous thermophilic lactic acid bacteria (LAB) strains of Lactobacillus helveticus (SJRP56 and SJRP191), S. thermophilus (SJRP02, SJRP03, SJRP107 and SJRP109) and Lb. delbrueckii subsp. bulgaricus (SJRP49, SJRP50, SJRP51, SJRP57, SJRP76, SJRP149 and SJRP181). For the safety characterization of the cultures, the antibiotic resistance, the hemolytic, β-glucosidase, N-acetyl-β-glucosaminidase and β-glucuronidase activities, and the investigation of the presence of genes that characterize virulence factors, production of biogenic amines and antibiotic resistance were carried out. The technological properties: acidification kinetics, exopolysaccharide production and enzymatic activity were evaluated for all strains. For the safe strains the analyses of the casein hydrolysis and aminopeptidase activity were also performed. From the safety and technological characterization, four strains were selected: Lb. helveticus SJRP56 and SJRP191, Lb. delbrueckii subsp. bulgaricus SJRP57 and S. thermophilus SJRP107, and used in the production of Parmesan cheese. The cheese were produced in industrial scale in two independent processing using 2.3% fat pasteurized standardized milk. After cheese production, the chemical composition was determined, and during the ripening period, the physicochemical characteristics were evaluated (acidity, pH value and proteolysis). At the third month of ripening, the microbiological quality of cheese was carried out. During ... / Mestre
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Uma pesquisa qualitativa das práticas de testes de software no contexto das aplicações móveis.

LUCIANO, Achiles Pedro da Cunha. 30 August 2018 (has links)
Submitted by Lucienne Costa (lucienneferreira@ufcg.edu.br) on 2018-08-30T17:06:55Z No. of bitstreams: 1 ACHILES PEDRO DA CUNHA LUCIANO – DISSERTAÇÃO (PPGCC) 2017.pdf: 1197427 bytes, checksum: 46a99b6df28cd76000cf4c5b38285b57 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-30T17:06:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ACHILES PEDRO DA CUNHA LUCIANO – DISSERTAÇÃO (PPGCC) 2017.pdf: 1197427 bytes, checksum: 46a99b6df28cd76000cf4c5b38285b57 (MD5) Previous issue date: 2017-06-01 / Contexto: O desenvolvimento de aplicações móveis cresce, acompanhando as constantes evoluções do hardware dos dispositivos. Com esta evolução, mais e mais recursos são adicionados e integrados à vida diária dos usuários. Contudo, a prática de testes de software utilizada pela comunidade para garantir o correto funcionamento das aplicações, incluindo a verificação de aspectos de segurança, portabilidade e compatibilidade, continua sendo um assunto pouco difundido. Objetivo: O objetivo deste estudo é compreender como as equipes lidam com a prática de testes de software aplicada ao contexto móvel, a relação cotidiana dos desenvolvedores com a literatura científica, a automação de testes e os desafios encontrados neste contexto. Método: Foi elaborado um estudo qualitativo, baseado na metodologia de Análise Temática, em três etapas: um survey, de caráter exploratório, que obteve 44 respostas de profissionais da área, seguido de uma seção de entrevistas com 12 profissionais para detalhar as questões levantadas durante o survey e um novo survey, de caráter confirmatório, que obteve 54 respostas e permitiu aos respondentes avaliar as principais conclusões das etapas anteriores. Resultados: Nossos resultados indicam a preferência dos desenvolvedores por testes manuais em detrimento da automação e o uso de testes funcionais automáticos de performance em alternativa, a escassez de referências para criação dos cenários de teste e os meios utilizados pelos profissionais para lidar com desafios como a fragmentação. / Context: Mobile WebApplicationdevelopmentincrease,followedbyoftenhardwareevolutions fromdevices.Withthisdevelopment,moreandmorefeatureshasbeenaddedina daily lifeofusers.However,thepracticesofsoftwaretestingusedbydeveloperstoensure the correctexecutionflowoftheapplication,includingsafetyaspects,portabilityandcompatibility,remainsawidespreadissue. Objective: This studyaddresseshowtounderstand teams andhowtheyapplythetestsinthedevelopmentphase.plan. Method: There was elaborated aqualitativestudy,basedonTematicAnalisysmethodology,inthreestages:a exploratorysurvey,thatcollected44answersfromprofessionals,followedbyaninterview with 12professionalstodetailtheanswerscollectedduringtheexploratorysurveyanda newconfirmatorysurvey,thatcollected54answersandallowedtheprofessionalstoevaluate the mainconclusionsfrompreviousstages. Results: Our resultsshownapreferencefrom developersformanualtestingoverautomationanduseofautomaticfunctionaltestsinstead, the lackofreferencestocreatenewtestscenariesandthemethodusedbyprofessionalsto deal withchallengessuchasfragmentation.
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Espectroscopia de dupla ressonância em molécula de iodo usando dois laser de corante

Cunha, Silvio Luiz Souza January 1978 (has links)
Utilizando um laser de corante pulsado sintonizado em 5460.7 R excitamos seletivamente os níveis rovibrônicos v=25 j=34, v=25 J=28, v=27 J=108 e v=28 J=45 do estado eletrônico B 3110+da mo fécula de iodo. A partir destes níveis, utilizando um segundo laser de corante sintonizãvel na região de 4130-4400 R e sincronizado com o primeiro, estudamos as transições para os estados eletrônicos com energia acima de 41000 cm-1 que normalmente são inacessíveis por absorção de um único fóton a partir d.o estado fundamental. As séries de transições observadas podem ser identificadas como ab sorção para um único estado eletrônico de simetria 0g + e caráter iônico. / With a pulsed dye laser tuned in 5460.7 R we selectively excite the rovibronic leveis v=25 J=34, v=25 J=28, v=27 J=108 and v=28 J=45 of the 12 B 3110 + electronic state. With a second dye laser, tunable in the range 4130-4400 R and synchronized with the first, we search for transitions from the leveis populated in the B 3116 +state to leveis of the electronic states with energy above 41000 cm 1, that normally are inaccessible by single absorbtion from the ground state. The observed transitions can be assigned to a single ion-pair state with 0g + symmetry.
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Caracterização e potencial tecnológico de amidos de diferentes cultivares de mandioca (Manihot esculenta Crantz)

Oliveira, Daiana Cardoso de 26 October 2012 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico, Programa de Pós-Graduação em Engenharia de Alimentos, Florianópolis, 2011 / Made available in DSpace on 2012-10-26T05:45:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 296887.pdf: 3395265 bytes, checksum: 2b5a8ec26e563355a284fb97c177458f (MD5) / O amido de mandioca (Manihot esculenta Crantz) é de baixo custo e de grande produção no Brasil. Os grânulos de amido têm características próprias segundo as origens que não correspondem ao grande número de aplicações para esta matéria-prima. Neste sentido, o presente trabalho teve como objetivo caracterizar dez diferentes cultivares de mandioca, produtos de melhoramento genético, fornecidos pela Epagri- SC. Foram estudadas as cultivares STS 2/03-10 (raiz branca), SCS 252 - Jaguaruna, Mandim Branca (proveniente de Neossolo Quartzarênico), Mandim Branca (proveniente de Argissolo), STS 1302/96-3 - Vermelhinha (proveniente de Neossolo Quartzarênico), STS 1302/96-3 - Vermelhinha (proveniente de Argissolo), SCS 253 - Sangão (proveniente de Neossolo Quartzarênico), SCS 253 - Sangão (proveniente de Argissolo), STS 1311/96-1, STS 1302/96-4, Preta, STS 1309/96-7 e STS 2/03-7. O amido destas cultivares foram caracterizados quanto ao pH, pureza, amilose, densidade absoluta, amido danificado, viscosidade intrínseca e massa molar, susceptibilidade enzimática, tamanho e forma dos grânulos, poder de inchamento e índice de solubilização, índice de cristalinidade e propriedades visco-amilográficas. Dentre as cultivares em estudo o amido da cultivar STS 1302/96-3 - Vermelhinha, proveniente de Argissolo, que se mostrou mais susceptível ao ataque enzimático e consequentemente, maior velocidade de hidrólise, poderia ser utilizado para a elaboração de álcool e amidos modificados, como os amidos fermentados. O maior poder de inchamento apresentado pela cultivar Preta direciona o uso deste amido como espessante, com melhor rendimento do produto final. Amidos das cultivares STS 1302/96-4 e Mandim Branca (proveniente de Argissolo) deram origem a pastas finas e transparentes e apresentaram baixos picos de viscosidade máxima. Estes resultados vêm direcionar as aplicações para estes amidos como espessantes de suave viscosidade, como para a produção de molhos, sopas e alimentos infantis. Como esperado para amido de mandioca, todas as cultivares em estudo apresentaram baixa tendência à retrogradação, destacando-se as cultivares STS 1302/96-3 - Vermelhinha (proveniente de Argissolo), SCS 252- Jaguaruna, STS 1302/96-4 e Mandim Branca (proveniente de Argissolo e Neossolo Quartzarênico). Assim, os amidos destas cultivares poderiam ser utilizados em produtos que permanecem estocados, como pães e produtos panificáveis, assim como onde é indesejável a perda de água, como pudins e sobremesas. Os resultados obtidos também vêm comprovar que diferenças significativas podem ocorrer em amidos de uma mesma cultivar, mostrando a necessidade da caracterização do amido de uma mesma planta sempre que esta for aplicada como matéria-prima no processo industrial.
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Sistema hipermídia sobre câncer de colo de útero com interface adaptativa usando redes neurais artificiais MLP e sistema especialista

Malinverni, Márcia dos Santos January 2006 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. Programa de Pós-Graduação em Engenharia Elétrica. / Made available in DSpace on 2012-10-22T12:43:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 235615.pdf: 1569675 bytes, checksum: 6d1b9b91ff67874c9b5cdaac372ce113 (MD5) / Esta dissertação apresenta a implementação de um Sistema Hipermídia com adaptação de interface, baseada na metodologia desenvolvida por Barbosa (2004), onde o desenvolvimento de um site com conteúdos sobre Câncer de Colo de Útero foi utilizado como ferramenta de auxílio ao ensino e aprendizagem dos alunos da área da saúde. Na implementação da metodologia foi definido que a adaptação seria centrada na apresentação da interface, através dos conteúdos gerados em diferentes mídias (texto, desenho e animação), que são apresentadas de acordo com as características do usuário fundamentadas na Teoria das Inteligências Múltiplas. No mecanismo de adaptação foi utilizado Sistemas Especialistas para a implementação, respectivamente da adaptatividade e adaptabilidade do sistema. Na parte de avaliação da metodologia adaptada foram utilizados dois testes: um para avaliar a parte motivacional, e outro, a parte ergonômica do site. A avaliação motivacional comparou o site adaptativo com outro site estático, e foi realizada através de um teste aplicado em 31 alunos. Verificou-se que o site adaptativo, em relação ao estático, foi 45,01% mais estimulante, sendo assim, 15,20% mais motivador que o estático. A avaliação ergonômica, foi realizada através de um teste aplicado em 8 professores. Verificou-se que o site adaptativo, teve uma aceitação ergonômica satisfatória de 91,08% por parte dos usuários. Como resultados, conclui-se que a metodologia adaptada e implementada, utilizando técnica de IA, bem como Sistemas Especialistas é indicada a ser aplicada em sistemas hipermídia que necessitem de adaptação de interface.
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Caracterização bioquímica, biológica e estrutural de uma quitinase recombinante de chromobacterium violaceum / The biochemical, biological and structural characterization of a recombinant chitinase from chromobacterium violaceum

Lobo, Marina Duarte Pinto January 2012 (has links)
LOBO, Marina Duarte Pinto. Caracterização bioquímica, biológica e estrutural de uma quitinase recombinante de chromobacterium violaceum. 2012. 155 f. Dissertação (Mestrado em Bioquímica)-Universidade Federal do Ceará, Fortaleza-CE, 2012. / Submitted by Eric Santiago (erichhcl@gmail.com) on 2016-06-20T13:15:13Z No. of bitstreams: 1 2012_dis_mdplobo.pdf: 6869513 bytes, checksum: 8d02e390f0ef45b4615dca68d8af1c3c (MD5) / Approved for entry into archive by José Jairo Viana de Sousa (jairo@ufc.br) on 2016-07-26T19:58:36Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_dis_mdplobo.pdf: 6869513 bytes, checksum: 8d02e390f0ef45b4615dca68d8af1c3c (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-26T19:58:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_dis_mdplobo.pdf: 6869513 bytes, checksum: 8d02e390f0ef45b4615dca68d8af1c3c (MD5) Previous issue date: 2012 / Chromobacterium violaceum is a Gram-negative, saprophytic, non-pathogenic and free living bacterium. The complete sequencing of its genome has revealed many genes encoding products of biotechnological interest. Among these products are several chitinases. Chitinases, enzymes capable of degrading chitin, an insoluble polymer of β(1,4)-linked N-acetyl-β-D-glucosamine (GlcNAc), are of great biotechnological interest, because they can be used to convert chitin in useful derivatives as well as being exploited for the control of fungi and insects that cause damages in crops. This study aimed to carry out the biochemical, biological and structural characterization of a recombinant chitinase, belonging to family GH18, from C. violaceum ATCC 12472. The ORF CV2935 was amplified by polymerase chain reaction (PCR) and cloned into the vectors pET303/CT-His and pPICZαA, for expression in Escherichia coli and Pichia pastoris, respectively. In both systems, the enzyme was secreted into the culture medium, in its soluble and functional form, and purified to homogeneity by affinity chromatography on a chitin matrix followed by size-exclusion chromatography on Superdex75 matrix. The yields of pure chitinase expressed in E. coli and P. pastoris were 2.6 and 44 mg per liter of culture, respectively. The recombinant chitinase produced in both microrganisms showed optimal activity at pH 3.0 and it was active after treated at temperatures up to 60 °C. The enzyme produced in P. pastoris (45 kDa) was N-glycosylated as revealed by Schiffʼs reagent and digestion with N-glycosidase F. Moreover, the glycosylated chitinase was found to be slightly more thermostable than the enzyme produced in E. coli (43 kDa). The rCV2935 showed hydrolytic activity against colloidal chitin, crab shell, and synthetic substrates containing p-nitrophenol. It was also able to hydrolyse glycol-chitin in SDS-PAGE and showed low chitosanase activity. The fluorescence spectra revealed that the proteins were produced in their folded conformation. The crystal structure of the recombinant chitinase produced in P. pastoris was determined by X-ray crystallography at a resolution of 2.1Ǻ. Its catalytic domain adopts an (β/α)8 triose-phosohate isomerase (TIM) barrel fold, and the residues essential for catalysis are conserved. The recombinant chitinase reduced the growth of the phytopathogenic fungus Rhizoctonia solani, and bioassays with cowpea weevil Callosobruchus maculatus showed that the rCV2935 possibly interfered with the insect feeding, which resulted in decreased weight of adults. The biochemical, biological and structural studies of rCV2935 may be useful for biotechnological application of this enzyme. / Chromobacterium violaceum é uma bactéria Gram-negativa, saprófita, não patogênica e de vida livre. O seqüenciamento completo do genoma dessa espécie revelou muitos genes codificando produtos com potenciais aplicações em diversas áreas. Dentre esses produtos, estão várias quitinases. Quitinases, enzimas capazes de degradar a quitina, um biopolímero de N-acetil-β-D-glucosamina bastante insolúvel, são de grande interesse biotecnológico, podendo ser utilizadas para converter quitina em derivados úteis, e também para o controle de fungos e insetos que causam danos em culturas agrícolas. O presente trabalho teve como objetivo caracterizar bioquímica, biológica e estruturalmente uma quitinase recombinante (CV2935), da família 18 das glicosídeo hidrolases, de C. violaceum ATCC 12472. A ORF codificando a proteína CV2935 foi amplificada por reação em cadeia da polimerase (PCR) e clonada nos vetores pET303/CT-His e pPICZαA, para expressão em Escherichia coli e Pichia pastoris, respectivamente. Em ambos os sistemas, a enzima foi secretada para o meio de cultura, na sua forma solúvel e funcional, sendo purificada a homogeneidade por cromatografia de afinidade em matriz de quitina, seguida de cromatografia de exclusão molecular em matriz de Superdex75. Os rendimentos da quitinase pura, expressa em E. coli e P. pastoris, foram 2,6 e 44 mg por litro de cultura, respectivamente. A quitinase produzida em ambos os microorganismos mostrou atividade ótima em pH 3,0 e foi ativa quando tratada a temperaturas de até 60 °C. A enzima produzida em P. pastoris (45 kDa) foi N-glicosilada, como revelado por coramento com reagente de Schiff e digestão com N-glicosidase F, mostrando-se ligeiramente mais termoestável do que a enzima não glicosilada, produzida em E. coli (43 kDa). A rCV2935 apresentou atividade hidrolítica (endoquitinásica) frente a quitina coloidal, matriz de carapaça de caranguejo obtida comercialmente, glicol-quitina (em gel SDS-PAGE), substratos sintéticos solúveis contendo p-nitrofenol, além de apresentar pequena atividade quitosanásica. Os espectros de fluorescência revelaram que as proteínas foram produzidas na sua conformação enovelada. A enzima teve sua estrutura cristalográfica resolvida a uma resolução de 2.1Å e seu domínio catalítico apresentou um dobramento do tipo barril (β/α)8 (barril TIM) e resíduos essenciais para catálise conservados, características essas, comuns às proteínas da mesma família. A quitinase recombinante retardou o crescimento do fungo fitopatogênico Rhizoctonia solani, e, em bioensaios com o caruncho Callosobruchus maculatus, a rCV2935 possivelmente interferiu com a alimentação do inseto, o que acarretou na diminuição do peso dos mesmos. Os estudos bioquímicos, biológicos e estruturais da rCV2935 poderão ser úteis para aplicação biotecnológica dessa enzima.
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Usando Assertivas de Correspondência para Especificação e Geração de Visões XML para Aplicações Web / Using assertive of correspondence for specification and generation of XML view for applications Web

Lemos, Fernando Cordeiro de January 2007 (has links)
LEMOS, Fernando Cordeiro de. Usando Assertivas de Correspondência para Especificação e Geração de Visões XML para Aplicações Web. 2007. 115 f. : Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Ceará, Centro de Ciências, Departamento de Computação, Fortaleza-CE, 2007. / Submitted by guaracy araujo (guaraa3355@gmail.com) on 2016-06-24T19:44:28Z No. of bitstreams: 1 2007_dis_fclemos.pdf: 1586971 bytes, checksum: d5add67ad3fb40e35813240332a35900 (MD5) / Approved for entry into archive by guaracy araujo (guaraa3355@gmail.com) on 2016-06-24T19:47:37Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2007_dis_fclemos.pdf: 1586971 bytes, checksum: d5add67ad3fb40e35813240332a35900 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-24T19:47:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2007_dis_fclemos.pdf: 1586971 bytes, checksum: d5add67ad3fb40e35813240332a35900 (MD5) Previous issue date: 2007 / Web applications that have large number of pages, whose contents are dynamically extracted from one or more databases, and that requires data intensive access and update, are known as "data-intensive Web applications" (DIWA applications) [7]. In this work, the requirements for the content of each page of the application are specified by an XML view, which is called Navigation View (NV). We believe that the data of NVs are stored in a relational or XML database. In this work, we propose an approach to specify and generate NVs for Web applications whose content is extracted from one or more data sources. In the proposed approach, a NV is specified conceptually with the help of a set of Correspondence Assertions [44], so that the definition of NV can be generated automatically based on assertions of view. / Aplicações Web que possuem grande número de páginas, cujos conteúdos são dinamicamente extraídos de banco de dados, e que requerem intenso acesso e atualização dos dados, são conhecidas como “data-intensive Web applications” (aplicações DIWA). Neste trabalho, os requisitos de conteúdo de cada página da aplicação são especificados através de uma visão XML, a qual denominamos Visão de Navegação (VN). Consideramos que os dados das VNs estão armazenados em um banco de dados relacional ou XML. Nesse trabalho, propomos um enfoque para especificação e geração de VNs para aplicações Web cujo conteúdo é extraído de uma ou mais fontes de dados. No enfoque proposto, uma VN é especificada conceitualmente com a ajuda de um conjunto de Assertivas de Correspondência, de forma que a definição da VN pode ser gerada automaticamente a partir das assertivas da visão.

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