Foram caracterizadas e comparadas a morfologia, a dieta, a utilização do substrato, a atividade sazonal e a biologia reprodutiva de Tropidodryas serra e T. striaticeps ao longo de toda sua distribuição na Mata Atlântica. Há segregação altitudinal na maior parte da distribuição geográfica das duas espécies-irmãs, T. serra habita predominantemente áreas de baixada e T. striaticeps ocupa as porções mais elevadas. Em localidades onde ocorrem em simpatria, há diferenciações na morfologia, na utilização do hábitat, nos tipos de presas consumidas e na extensão dos ciclos reprodutivos, possibilitando a partilha de recursos entre as duas espécies afins. As fêmeas das duas espécies foram maiores que os machos, indicando que não há combate ritual. Os machos em ambas as espécies apresentaram maiores comprimentos relativos da cauda, da cabeça e do olho que as fêmeas conspecíficas. Nas duas espécies as fêmeas foram mais robustas que os machos. Com relação às diferenças interespecíficas, T. serra é maior e mais pesada e T. striaticeps tem cauda, cabeça e olhos maiores. Nas duas espécies, os juvenis apresentaram a ponta da cauda branca. Os adultos de T. serra alteraram a coloração da ponta da cauda com a mudança nos tipos de presas ingeridas, ao passo que os adultos de T. striaticeps mantiveram a ponta da cauda branca mesmo com a variação na dieta. Poucos foram os indivíduos, em ambas as espécies, com mutilações na ponta da cauda. As duas espécies são diurnas, procuram ativamente por suas presas no solo e sobre a vegetação. Parecem utilizar mais a vegetação para repousar. Tropidodryas serra utiliza a vegetação com maior freqüência que T. striaticeps. Alimentam-se principalmente de mamíferos, mas incluem também aves, lagartos, anuros e serpentes na sua dieta. Tropidodryas serra apresentou maior equitabilidade na freqüência de captura de diferentes itens alimentares. Tropidodryas striaticeps apresentou maior freqüência de indivíduos com alimento no trato digestivo. Há variação ontogenética na dieta: juvenis se alimentam de presas ectotérmicas e adultos, em sua maioria, de endotérmicas. As fêmeas de T. serra foram coletadas com mais freqüência durante os meses mais quentes e chuvosos e os machos tiveram um pico de atividade entre fevereiro e abril. Os machos e as fêmeas de T. striaticeps não apresentaram diferenças na abundância ao longo do ano. Em T. serra as fêmeas atingiram a maturidade sexual antes que os machos coespecíficos, já em T. striaticeps ocorreu o contrário, os machos maturaram antes que as fêmeas. As fêmeas das duas espécies apresentam ciclos sazonais, com vitelogênese secundária e ovos durante a estação chuvosa. Nas fêmeas de T. serra o ciclo reprodutivo é mais restrito, as ninhadas são menores, os recém-nascidos maiores e a freqüência reprodutiva é maior que nas fêmeas de T. striaticeps. O ciclo espermatogênico é contínuo em ambas as espécies. O volume dos testículos e o diâmetro dos ductos deferentes se mantiveram elevados durante todo o ano nas duas espécies congêneres. Portanto, o ciclo sazonal nas fêmeas é pós-nupcial (a produção de ovos é dissociada da época de cópula) e o ciclo contínuo nos machos é pré-nupcial (a cópula ocorre simultaneamente com a produção de espermatozóides). / Morphology, diet, habitat use, seasonal activity and reproductive biology were analyzed and compared between Tropidodryas serra and T. striaticeps along their geographical distribution in the Atlantic Forest. The distribution of these sister species do not overlap in most of their range, T. serra have its distribution in lower altitude areas\' while T. striaticeps occurs in higher ones. In some localities where both species occur in sympatry they develop differences in body size, habitat preferences, food items and extension of reproductive cycles allowing them to share the resources. Mature females attained larger body sizes than mature males in T. striaticeps and T. serra, such differences in body length suggest that the ritual combat is absent. Males attained larger lengths of tail, head and eye than did females. In both species females have stouter body than males. Interespecific comparison shows that T. serra has the largest body size and is stouter whereas T. striaticeps has the largest tail, head and eye and is more slender. The juveniles present the tip of the tail white. Tail tip of adults T. serra is suffused with cryptic colors but in T. striaticeps the whitish tail tip remains until adult stage although the ontogenetic dietary changes take place. There were few individuals with tail injures. Both species are diurnal and forage actively on the ground and upon the vegetation. They may use the vegetation to rest. Tropidodryas serra seems to inhabit more frequently the lower branches of the vegetation instead T. striaticeps may use the canopy trees. They feed mainly on mammals, but also prey birds, lizards, anurans and snakes. Tropidodryas serra has a more equitable frequency of capture of food items whereas T. striaticeps shows a higher frequency of individuals with preys in their gut. The ontogenetic shift in diet is present, juveniles prey upon ectothermics and adults feed on endothermic preys. Females of T. serra show a peak of abundance during the warmest and rainy periods of the year and males show a peak of activity in February and April. Both sexes in T. striaticeps were equally distributed among seasons, showing no differences between rainy and dry one. Females attained sexual maturity before males in T. serra, the converse occur to T. striaticeps where males where mature before the co-specific females. Both females of these two closely related species present seasonal reproductive cycles with vitellogenesis and egg-laying occurring at the rainy season. In T. serra females the reproductive cycle is more restrict, the clutch size is smaller, the newborns are bigger and the frequency of reproduction higher than T. striaticeps. The spermatogenic cycle is continuous, testes volume and deferent ducts diameter did not vary throughout the year for both species. The seasonal cycle in females is postnuptial (mating seems to be dissociated from vitellogenesis and egg production) and the continuous cycle in males is prenuptial (the produced sperm is used immediately during the mating).

Orientadores: Marlene Tiduko Ueta, Eleonore Zulnara Freire Setz / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-05T12:53:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rondon_MichelleVivianeSadosSantos_M.pdf: 2874588 bytes, checksum: 28e75d1c2516ff11dfb2158b272c510f (MD5) Previous issue date: 2005 / Resumo: Durante o período de agosto de 2003 a julho de 2004 foram realizadas coletas mensais de fezes de bugios-ruivos, Alouatta guariba (Primates, Atelidae), em um fragmento de Floresta Atlântica Semidecídua, a Mata Ribeirão Cachoeira, situada no Distrito de Souzas ¿ Campinas/SP, com 234 hectares. As fezes foram coletadas ao longo de duas trilhas longitudinais dentro do fragmento florestal, um pela calha do riacho e outro por uma trilha paralela com 4.000m de comprimento, com o objetivo de realizar um estudo de helmintos intestinais nestes animais. Foram realizadas 13 coletas com um total de 112 amostras, entre fezes frescas (N=102) e secas (N=10), que foram processadas qualitativamente pelos métodos de sedimentação Hoffman e Rugai e pelos métodos de flutuação Faust e Willis. Das 112 amostras, 61 foram positivas para ovos, larvas ou adultos de nematódeos, representando 54,5%. Os tipos morfológicos de nematódeos encontrados, foram identificados neste trabalho, pela numeração seqüencial, conforme foram sendo observados. Foram encontrados sete tipos morfológicos de ovos, nove tipos morfológicos de larvas e sete de nematódeos adultos. Os ovos tipo 2 de Trypanoxyuris (Trypanoxyuris) minutus (Oxyuridae), foram encontrados em fezes nos dois percursos em nove coletas. Ovos tipo 1 foram pouco freqüentes (N=5) e observados somente em um dos meses de coleta (agosto/2003); são ovos com características morfológicas compatíveis a Strongyloides sp., já relatado para primatas do gênero Alouatta mas, devido ao pequeno número, não houve confirmação. O nematódeo adulto tipo 1 (Oxyuridae, Cosmocercinae) foi o mais comum, ocorrendo em sete coletas no riacho e duas coletas na trilha, tanto em fezes frescas, como secas. O adulto tipo 7, de Trypanoxyuris (Trypanoxyuris) minutus foi observado somente em uma coleta (junho/2004), na trilha paralela. Os outros cinco tipos morfológicos de nematódeos adultos, foram encontrados entre os meses de abril e junho/2004 na trilha, exceto o adulto tipo 6 que foi encontrado no riacho. As amostras fecais mostraram-se positivas para alguma forma de nematódeo em dez coletas do período de estudo / Abstract: From August 2003 to July 2004 I collected fecal samples from the Brown-howler-monkey Alouatta guariba (Primates, Atelidae) monthly in a 234 ha Semideciduous Atlantic Forest fragment (Mata Ribeirao Cachoeira - Campinas/SP) in order to identify intestinal helminths. Feces were collected along two transects inside the forest fragment, one following the stream and the other on a parallel trail, each 4 km long, with the purpose of examining howlers intestinal helminths. On 13 sampling trips 112 samples (102 fresh and 10 dry scats) were collected. All the scats were processed qualitatively by sedimentation (methods of Hoffman and Rugai), and by flotation (Faust and Willis). Of the 112 samples, 61 (54.5%) were positive for eggs, larvae or adults from Nematoda. Morphotypes were enumerated chronologically as they appeared in the samples. There were seven egg morphotypes, nine larvae morphotypes and seven for adults, all Nematoda. Eggs of Trypanoxyuris (Trypanoxyuris) minutus (Oxyuridae) were found in feces along both transects on nine dates. Egg type 1 was uncommon (N=5) and only observed in August 2003. They shared morphological characteristics with Strongyloides sp., already reported for the genus Alouatta. Due to the small sample, confirmation was not possible. A species of Oxyuridae (Cosmocercinae) was the most common adult nematode, occurring on seven dates in the stream transect and twice on the trail. It was found both in fresh and dry scats. Adult Trypanoxyuris (Trypanoxyuris) minutus were observed once (June 2004), on the trail. The additional five adult nematoda morphotypes were found mostly along the trail between April and June 2004, except for the adult type 6 that was found along the stream. The fecal samples were positive for one or more Nematoda on ten sample dates year around / Mestrado / Doutor em Parasitologia

Orientador: Flavio Antonio Maes dos Santos / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-10T19:28:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Aguirre_GuilhermeHenriquede_M.pdf: 4726556 bytes, checksum: 9a2027cf53b2d2b984aec9877670e04e (MD5) Previous issue date: 2008 / Resumo: A Mata Atlântica apresenta altíssima biodiversidade, com destaque para elevada diversidade florística e para o elevado endemismo observado em alguns grupos vegetais. A Mata Atlântica está entre as florestas tropicais mais ameaçadas do mundo e a maioria de seus remanescentes é representada por fragmentos pequenos e alterados, ou áreas maiores encontradas em encostas de montanha com declive acentuado. O conhecimento dos remanescentes florestais quanto à composição florística, distribuição espacial dos organismos e regeneração natural é de grande importância para medidas que visem a conservação da diversidade. Dessa forma, o presente estudo teve como objetivo responder as seguintes questões: como a composição e a diversidade de espécies arbustivo-arbóreas se distribuem em diferentes escalas espaciais, numa região intensamente fragmentada de Mata Atlântica? Características do solo e a proximidade geográfica entre as áreas influenciam na distribuição das espécies no espaço? A composição e diversidade de espécies são relacionadas ao tamanho, forma ou isolamento dos fragmentos? Qual é o potencial de regeneração natural nos fragmentos? Foram estudados 8 fragmentos de Floresta Ombrófila Densa Montana, de 11 a 74 ha, na zona rural do município do São Luiz do Paraitinga, SP. Em cada fragmento foram realizados 30 pontos quadrante, onde foram amostrados indivíduos arbustivo-arbóreos em duas classes: classe I ¿ indivíduos maiores que 1,5 m de altura e com DAP < 5 cm, e classe II ¿ indivíduos com DAP = 5 cm. Ao todo foram amostrados 1920 indivíduos pertencentes a 196 espécies e 44 famílias. De forma geral, as comunidades arbustivo-arbóreas nos fragmentos de mata estudados são muito heterogêneas, sendo a composição de espécies influenciada pela distância geográfica e pelo tamanho dos fragmentos. A riqueza e diversidade nos fragmentos não responderam às métricas usualmente utilizadas em estudos de fragmentação (área, forma e isolamento). O fato de cada fragmento ter apresentado uma composição de espécies diferente, ou seja, uma baixa similaridade de espécies entre fragmentos e a alta diversidade beta, ressaltam a importância da conservação, mesmo de pequenos fragmentos, para a manutenção da elevada diversidade regional. O alto potencial de regeneração natural dos fragmentos analisados em conjunto evidencia ainda mais a importância da manutenção de diferentes fontes de regeneração na manutenção da elevada diversidade florística nos fragmentos florestais da região / Abstract: The Atlantic Forest possesses enormous biodiversity and is highlighted by the high floristic diversity and endemism in some plant groups. The Atlantic Forest is among the most endangered tropical forests in the world and most of its remnants are small and altered fragments, or larger areas in mountains, with pronounced slope. Knowledge of the forest remnants as to floristic composition, spatial distribution of the organisms and natural regeneration is very important for measures that aim diversity conservation. In this manner, the goal of the present study was to answer the following questions: how are composition and diversity of the shrub and tree species distributed across different spatial scales, in a highly fragmented region of Atlantic Forest? Are the composition and diversity of species related to size, shape or isolation of the fragments? What is the natural regeneration potential in the fragments? Eight fragments of Montane Ombrophilous Dense Forest, sized 11 to 74 ha, were studied in the rural area of the Municipality of São Luis do Paraitinga, State of São Paulo, Southeast Brazil. In each fragment 30 point-centered quadrat were established, where shrub and tree individuals were sampled in two groups: group I ¿ individuals larger than 1.5 m height and DBH < 5 cm; group II ¿ individuals with DBH = 5 cm. A total of 1920 individuals from 196 species and 44 families were sampled. In most cases the shrub and tree communities in the studied fragments are very heterogeneous, and the species¿ composition is influenced by geographical distance and fragment size. Richness and diversity in the fragments did not answer to the metrics usually employed in fragmentation studies (area, shape and isolation). The fact that each fragment presented a different species composition, that is, a low species similarity among fragments and high diversity between them, highlight the importance of conservation, even of small fragments, for the maintenance of the high regional diversity. The great natural regeneration potential of the analyzed group of fragments brings out even more the importance of keeping different sources of regeneration in the maintenance of the high floristic diversity in the forest fragments in the region / Mestrado / Ecologia / Mestre em Ecologia

Orientador: Fernando Roberto Martins / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-11T15:33:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 VanMelis_Juliano_M.pdf: 1390063 bytes, checksum: 7c525d7204f312e3db23b7fb3945a8d3 (MD5) Previous issue date: 2008 / Resumo: As lianas (plantas trepadeiras lenhosas) são importantes componentes nos ciclos biogeoquímicos e da biodiversidade nas florestas tropicais. A partir dos dados estruturais das árvores e lianas em um hectare (23º21¿54¿-23º21¿59¿S; 45º05¿02¿-45º05¿04¿W)de Floresta Ombrófila Densa Atlântica (348-395 m) construímos dois capítulos. O primeiro teve como objetivos estudar variáveis estruturais que determinam a abundância e biomassa acima do solo das lianas (LAGB). Nossas hipóteses eram que havia correlação positiva entre abundância e LAGB com a abundância e biomassa aérea de árvores (AAGB), e negativamente com a abundância de palmeiras e samambaiaçus (grupo sem fuste). Em uma escala continental investigamos quais variáveis geográficas e climáticas determinariam maiores valores absolutos e relativos (contribuição das lianas na biomassa florestal total) de LAGB. Encontramos correlação entre abundância de árvores pequenas e a AAGB com a abundância das lianas pequenas, não sendo encontradas outras correlações relevantes. A biomassa aérea individual dos forófitos e lianas associadas tiveram correlação positiva fraca. Nenhuma variável sozinha explicou os valores absolutos e proporcionais de LAGB na escala continental, apesar da sazonalidade da precipitação ser a mais importante dentre aquelas colocadas. Acreditamos que a sazonalidade da precipitação caracterize florestas com árvores caducifólias, permitindo maior entrada de luz, beneficiando em importância sociológica (abundância e área basal) as lianas nessas florestas. A LAGB na escala fina depende de suportes potencialmente adequados, pois as lianas grandes estão associadas a árvores de grande biomassa. Mas a existência de grandes árvores não necessariamente decorre em maior LAGB. Portanto, destacamos que a susceptibilidade das árvores à escalada das lianas acarretaria maior abundância e LAGB nas florestas tropicais. No segundo capítulo buscamos investigar qual é a relação observada entre a riqueza das espécies lenhosas amostradas com a sua produtividade (SRPR), assumindo a biomassa aérea (AGB) como valor de produtividade. Nossas expectativas foram: a) as lianas têm uma SRPR de forma unimodal, devido à reprodução clonal e ao predomínio da exclusão competitiva; b) as árvores têm uma SRPR linear positiva, devido à complementaridade das espécies; c) a inclusão das lianas altera a SRPR, devido aos seus baixos valores de AGB e alta contribuição para a riqueza; d) a variação de abundância influi na correlação entre a riqueza e a AGB, pois ambas dependem da abundância. Todas as SRPR foram significativas, mesmo com a inclusão da abundância, indicando que a SRPR não é um artefato decorrente de características da comunidade. As lianas apresentaram SRPR unimodal, e as árvore e o conjunto lianas+árvores apresentaram SRPR linear positiva. A inclusão das lianas não alterou a forma monotônica da SRPR nem a inclinação da reta de regressão, mas produziu um intercepto maior, indicando que a inclusão das lianas aumenta a riqueza em qualquer valor de AGB, mesmo com SRPR linear e positiva / Abstract: Lianas (woody climbing plants) are important components in biogeochemical cycles and biodiversity in tropical forests. Two chapters were written from the data of a stand (23º21¿54¿-23º21¿59¿S; 45º05¿02¿-45º05¿04¿W) of lianas and trees in Atlantic Rain Forest (348-395 m). The first chapter aimed at studying structural variables that determine the abundance and lianas above-ground biomass (LAGB) and the correlation of these variables to the above-ground biomass phorophytes on local scale. Our assumptions were that the LAGB and lianas abundance was positively correlated with the above-ground biomass (AAGB) and arboreal abundance, and negatively correlated with the abundance and types of trees without bole (palm and ferns). We also investigated, in continental scale, the geographical and the climatic variables which determine the largest absolute and relative (lianas contribution to total above-ground biomass) LAGB. We found a positive correlation between abundance of small trees and AAGB with the abundance of small lianas, and no correlation between the group without bole and AAGB with LAGB. There was weak positive correlation between the individual phorophytes biomass and associated lianas. At a continental scale any variable alone explained the absolute and proportional LAGB, despite the seasonality of precipitation to be the most important among those released. We believe that the seasonality of precipitation features forests with caducifolius trees, occurring largest entry of light during the dry season, benefiting lianas in sociological importance (higher values of basal area and abundance) on the forests. On local scale, the LAGB depends of tree potentially suitable, because the large liana, which are the largest contributors of LAGB, are associated with large trees. But the large trees do not necessarily result in greater value of LAGB. Therefore the susceptibility of trees to lianas is a factor that would result in greater abundance and LAGB in tropical forests. The second chapter sought investigate the relationship between richness of trees, lianas both the woody floras with its productivity (SRPR), assuming the above-ground biomass (AGB) as a surrogate of productivity. Our expectations were: a) lianas has a unimodal SRPR, due to clonal reproduction and the dominance of competitive exclusion, b) Trees has a positive linear SRPR, due to the complementarity of species c) the inclusion of lianas changes the SRPR of woody flora, due to its low contribution to the AGB and high contribution to the richness d) the change of abundance influences the correlation between richness and AGB, because both depends on the abundance. All SRPR were statistically significant, even with the inclusion of abundance, indicating that the SRPR is not an artifact due to characteristics of the community. We found a unimodal SRPR for lianas and a positive linear SRPR for trees and of trees and lianas as a whole. The inclusion of lianas not changed the monotonic SRPR nor the inclination of the straight regression, but produced a higher value of intercept, indicating that the inclusion of lianas increases the value of wealth in any AGB, even with positive linear SRPR / Mestrado / Mestre em Biologia Vegetal

A Mata Atlântica é considerada um dos ecossistemas mais biodiversos e ao mesmo tempo mais ameaçados do planeta. As aves são apontadas como o grupo de vertebrados com a maior riqueza geral, endemismos e espécies ameaçadas desse domínio. Embora possa ser considerado o domínio natural brasileiro cuja avifauna foi mais intensamente estudada, o conhecimento ornitológico acumulado sobre a Mata Atlântica encontra-se segmentado e altamente disperso, o que acaba por torná-lo sub-utilizável. Embora existam na literatura valores de riqueza e listas de espécies de aves da Mata Atlântica, há uma grande discrepância entre os resultados apresentados e uma falta de métodos explícitos detalhados nas maior parte desses trabalhos. Essa situação, somada a um significativo crescimento do conhecimento ornitológico em anos recentes, demonstra a necessidade de uma iniciativa que busque reunir o atual estado de conhecimento sobre a avifauna desse domínio. Dentro desse contexto, os objetivos do presente estudo foram definir a riqueza e composição de espécies, subspécies e endemismos da avifauna da Mata Atlântica, compilar informações sobre o status de ocorrência e preferência de habitat das suas espécies e traçar um panorama atualizado sobre a conservação das mesmas. Para isso, foram analisados os padrões de distribuição dos táxons com ocorrência conhecida dentro dos limites geográficos da Mata Atlântica e, para as espécies aceitas como pertencentes à sua avifauna, informações sobre sua ecologia e sazonalidade. Como fontes de informação foram consultados a literatura científica, mapas de distribuição, espécimes ornitógicos e informações primárias colhidas durante trabalhos de campo. Os resultados apontam que a avifauna da Mata Atlântica possui elevada riqueza de táxons, sendo composta por 891 espécies, das quais 464 são políticas e representadas no domínio por 608 subespécies, totalizando 1035 táxons específicos e subespecíficos, distribuidos em 26 ordens e 80 famílias. Apesar da maioria das espécies de aves da Mata Atlântica ser residente, deve ser ressaltada a presença de um número expressivo de espécies que realizam deslocamentos sazonais, cerca de 16%. Mais da metade das espécies de aves da Mata Atlântica ocorrem em ambientes florestais, mas uma parte significativa está associada a outros habitats, incluindo ambientes abertos naturais e antrópicos, áreas úmidas e ambientes marinhos costeiros. A avifauna da Mata Atlântica é caracterizada por uma alta taxa de endemismos, incluindo 27 gêneros, 213 espécies e 162 subespécies. O panorama atualizado sobre o estado de conservação das aves da Mata Atlântica reitera sua situação crítica e revela que um número de espécies muito maior do que se supunha pelas listas nacionais e internacional de espécies ameaçadas corre sério risco de se extinguir ou já se extinguiu dentro do domínio. Com base nas informações compiladas durante esse estudo são apontados como os principais desafios e oportunidades de pesquisa para a ornitologia da Mata Atlântica: a necessidade de revisão taxonômica de um grande número de subespécies, sobretudo de diversos táxons endêmicos e ameaçados; necessidade de revisão das áreas de endemismos de aves no domínio; utilização dos padrões de distribuição das aves da Mata Atlântica para analisar afinidades biogeográficas entre suas diferentes regiões; necessidade de levantar informações sobre padrões de ocorrência e sazonalidade de suas espécies migratórias e uma reavaliação da atual estratégica de conservação baseada em listas nacionais de espécies ameaçadas / The Atlantic Forest is one of the most important biodiversity hotspots, yet it is one of the most threatened domains in the planet. Birds are among the vertebrates with the greatest species richness, endemism and number of threatened species of this domain. The Atlantic Forest may be considered the domain in which the avifauna has been studied the most, but this ornithological knowledge is fragmented and highly dispersed, which makes it underused. Some reviews of the bird species occurring in the Atlantic Forest are available in the literature, but a comparative analysis of their results reveals many discrepancies and a lack of systematic methodology among most of them. In addition, in recent years there has been a significant increase in the ornithological knowledge of the Atlantic Forest, demonstrating the need for a new review that gathers the current knowledge about the avifauna of the Atlantic Forest. Therefore, the objectives of the present study were to define which are the species, sub-species and endemisms of the Atlantic Forest avifauna, to gather information about species occurrence and habitat preference and to give an updated overview of their conservation status. I analyzed the distribution patterns of each species and/or subspecies within the Atlantic Forest and described their habitat and seasonality. Data was gathered from the scientific literature, distribution maps, museum specimens and field work. The Atlantic Forest avifauna is composed of 861 species, with 464 of them being polytypic and accounting for, 608 subspecies, thus amounting 1035 specific and subspecific taxons grouped into 26 orders and 80 families. The majority of the species were found to be resident whereas a noteworthy 16% of them perform seasonal movements. More than half of species occur in forest habitats, while a significant portion is associated with other habitats including natural open habitats and anthropic environments, humid areas and costal marine environments. The Atlantic Forest avifauna is characterized by a high level of endemism, including 27 genera, 213 species and 162 sub-species. The updated overview about the conservation status of the Atlantic Forest birds reiterates their critical situation and reveals that the number of threatened or extinct species in this domain is much greater than previously reported in national and international lists of threatened species. The main challenges and opportunities to future research efforts on the Atlantic Forest avifauna are the need for a taxonomic review of the large number of sub-species, especially the many endemic and threatened taxons; a review of the endemic areas within the domain; the use of distribution patterns of the Atlantic Forest birds to analyze the biogeographic affinities among the different regions of the domain; to gather information about the occurrence of migratory species and their seasonal patterns; and re-evaluation of the a current conservation policies based on the national red list of threatened species

De julho de 2012 a junho de 2013 foram realizadas doze expedições mensais à Estação Biológica de Boraceia (EBB), Salesópolis, São Paulo. Os esfingídeos foram atraídos por lâmpadas externas de um alojamento da EBB durante quatro noites consecutivas, das 18h às 6h. Registrou-se em campo o horário de coleta e sexo de cada indivíduo, além de dados climáticos a cada meia hora. As mariposas foram levadas ao Museu de Zoologia da Universidade de São Paulo (MZUSP), onde foram identificadas até nível de espécie e contabilizadas. As análises de diversidade envolveram curva de rarefação, estimador de riqueza, gráficos descritivos de riqueza, abundância, composição e equabilidade (por mês e por horário de coleta), e estatística multivariada. Gráficos de riqueza e abundância por temperatura e umidade relativa foram construídos para analisar o efeito destas variáveis climáticas sobre a amostragem, e a influência de neblina e chuva foi verificada pela aplicação de testes de Mann-Whitney. Testes de qui-quadrado foram utilizados para examinar se a razão sexual diferiu da proporção 1:1, na totalidade, por mês e por horário de coleta. Esfingídeos coletados na EBB desde 1940, que estão disponíveis no MZUSP, também foram identificados e contabilizados para elaboração de um panorama histórico da esfingofauna do local, e para possibilitar comparação entre uma intensa amostragem realizada de 1948 a 1950 na Estação e a amostragem recente. Esta comparação foi feita por meio de curvas de rarefação, gráficos descritivos de riqueza e composição, e estatística multivariada. Todas as espécies já registradas na EBB foram fotografadas para elaboração de um guia ilustrado. No presente estudo foram coletados 2.509 esfingídeos de 64 espécies, das quais três corresponderam a novos registros para a EBB, e contabilizou-se um total de 81 espécies já coletadas no local. Os meses mais quentes e chuvosos apresentaram maiores riquezas, abundâncias e equabilidades; a composição de espécies se manteve mais homogênea durante estes meses e variou muito entre os meses mais secos, padrão observado também nas coletas de 1948 a 1950. Com o avançar da noite ocorreu diminuição na abundância e na riqueza, e a composição de espécies se alterou bastante. Temperaturas mais altas, neblina e chuva foram favoráveis à coleta de esfingídeos. A razão sexual foi, de forma geral, enviesada a favor dos machos. Não se observou diferença significativa de riqueza entre a campanha de coleta antiga e a recente, mas diversas espécies foram registradas em apenas uma das campanhas. Comparações com outros levantamentos de Sphingidae mostraram que a EBB conta com espécies possivelmente raras na Mata Atlântica e com uma das mais altas riquezas registradas para o bioma / Samplings were performed from July 2012 to June 2013, in twelve monthly expeditions to the Boraceia Biological Station (Estação Biológica de Boraceia - EBB), Salesópolis, São Paulo. Hawkmoths were attracted using outdoor light bulbs of one of the EBB\'s houses, during four consecutive nights, from 6 p.m. to 6 a.m. Each individual\'s collecting time and sex were registered, as well as climatic data every half hour. Specimens were taken to the Museu de Zoologia da Universidade de São Paulo (MZUSP), where they were identified to species and counted. Diversity analyses included rarefaction curve, richness estimator, descriptive graphics of composition, evenness, richness and abundance (by month and time of sampling), and multivariate statistics. Graphics of richness and abundance by temperature and relative humidity were constructed to assess the effect of these climatic variables on sampling, and the influence of fog and rainfall was examined by applying the Mann-Whitney test. Qui-square tests were performed to check whether the sex ratio differed from 1:1, in totality, by month and by time of sampling. Hawkmoths collected in the EBB since 1940 are available at MZUSP. They were identified and counted for elaboration of a historical overview of the local sphingofauna, and to allow comparison between an intense sampling carried out from 1948 to 1950 in the EBB and the recent sampling. This comparison was performed by means of rarefaction curves, descriptive graphics of richness and composition, and multivariate statistics. All species ever recorded in the EBB were photographed for the production of an illustrated guide. In the present study, a total of 2,509 hawkmoths, belonging to 64 species, were collected. Three of these species corresponded to new records for the EBB, and the list of species recorded in the Station reached the amount of 81. The rainiest and hottest months showed the highest richness, abundances and evenness. The species composition maintained relatively homogeneous during these months but it largely varied during the driest months; this pattern was also noticed in the sampling from 1948 to 1950. Abundance and richness decreased throughout the night, and the species composition underwent many changes. Higher temperatures, fog and rainfall were favorable to hawkmoth sampling. Sex ratio was generally skewed toward males. No significant difference in richness was found between the former and the recent sampling, but many species were recorded in only one of them. Comparisons with surveys on other sphingofaunas showed that some possibly rare species occur in the EBB and that this locality holds one of the highest Sphingidae richness in the Brazilian Atlantic Rainforest

Esta dissertação trata da distribuição das aves no gradiente altitudinal dos municípios de Bertioga e Salesópolis, na Serra do Mar do Estado de São Paulo, Brasil. Está separada em três capítulos distintos, os quais, apesar de relacionados, podem ser lidos independentemente. O primeiro capítulo, Uma revisão do conhecimento ornitológico na Estação Biológica de Boracéia, faz uma revisão inédita sobre todos os registros avifaunísticos realizados ao longo de 68 anos de inventários na localidade e apresenta a importância dessa Unidade de Conservação localizada em Mata Atlântica Montana para a conservação das aves do Bioma. Foram registradas 323 espécies, sendo 117 endêmicas e 28 ameaçadas de extinção, motivos pelos quais a Estação pode ser considerada uma área prioritária para a conservação de aves no Brasil. O segundo capítulo, Análise dos padrões altitudinais das aves de Mata Atlântica: a influência do mid-domain effect , traz uma revisão sobre todas as publicações já realizadas sobre a distribuição altitudinal das aves da Mata Atlântica, determina o padrão da curva espécies-altitude de cada estudo e testa as previsões do modelo nulo chamado mid-domain effect (MDE) nos conjuntos de dados por eles apresentados. Dos oito estudos encontrados foram descritos três padrões de distribuição altitudinal, sendo que a robustez das previsões do MDE não foi consistente para nenhum deles. Provavelmente outros fatores moldam a distribuição das aves, porém a falta de padronização dos estudos não permite esse tipo de investigação. Finalmente, o terceiro capítulo, Distribuição altitudinal das aves na Serra do Mar: efeitos da altitude, área e mid-domain effect , apresenta o padrão de distribuição altitudinal encontrado ao longo do gradiente Bertioga-Salesópolis, na Serra do Mar de São Paulo e introduz pela primeira vez o estudo de variáveis explanatórias para a distribuição altitudinal das aves na Mata Atlântica. São testadas três variáveis espaciais (altitude, área e MDE) que possam ser responsáveis pelo padrão de distribuição encontrado e os resultados, comparados com padrões já estudados em outras regiões do mundo. A variável que mais explicou a distribuição altitudinal encontrada foi a área e, apesar de diversos estudos considerarem esta variável como secundária na determinação das curvas espécie-altitude, no gradiente altitudinal aqui amostrado, ela mostrou-se importante. / This master thesis aims to investigate the bird diversity along the elevational gradient of the cities of Bertioga and Salesópolis in the Serra do Mar from the state of São Paulo, Brazil. It is divided into three distinct chapters that, although related, may be independently read. The first chapter, A review of the ornithological history of the Boracéia Biological Station, reviews for the first time every ornithological record of more than 68 years of birding in that location and shows the importance of this Montane Atlantic forest Conservation Unit for the preservation of birds from this biome. During 68 years, investigators recorded 323 species of which 117 are endemic and 28 are threatened. For these reasons the Station may be considered an Important Bird Area for the conservation of birds in Brazil. The second chapter, The elevational diversity of Atlantic forest birds: influence of the mid-domain effect, reviews all published studies on bird elevational distribution in the Brazilian Atlantic Forest, establishes the species-altitude curve of each study and tests their data sets for the mid-domain effect (MDE) null model predictions. I found eight investigations from which three distinct altitudinal patterns could be determined. The MDE predictions were not consistently robust for none of them and the investigation of candidate factors that drive the elevational diversity of birds is not possible due to the lack of standardized procedures. Finally, the third chapter, Elevational diversity of birds of the Serra do Mar: implications of altitude, area and the mid-domain effect, deals with the diversity of birds along the Bertioga-Salesópolis elevational gradient in the Serra do Mar and explores for the first time three candidate variables (altitude, area and MDE) driving the elevational diversity of birds in the Atlantic forest; I further compare my results with patterns found elsewhere in the world. Area was the best predictor of the bird elevational diversity and, although a few investigators claimed this variable as secondary in determining the species-altitude curve, here it proved worth analyzing.

Orientador: Woodruff Whitman Benson / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-19T11:22:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sobral-Souza_Thadeu_M.pdf: 2228457 bytes, checksum: 1bafa7e233e5df09e117aab4299abb4c (MD5) Previous issue date: 2011 / Resumo: A ecologia de populações busca entender a variação na abundância das espécies no tempo e no espaço. Espécies que possuem ciclos de vida de curta duração, como a maior parte dos insetos, se tornam especialmente convenientes para essa finalidade. Este estudo examinou os padrões de abundância durante o ano 2009 de uma borboleta tropical próximo ao limite de sua distribuição geográfica, no sudeste do Brasil, em uma localidade subtropical. Neste trabalho, Heliconius sara apseudes foi estudada ao longo de uma estrada no Vale do Rio Quilombo, próximo à cidade de Santos, SP, Brasil, usando a metodologia de captura, marcação, liberação e recaptura (CMLR). Foram marcados 498 indivíduos de Heliconius sara (378 machos e 120 fêmeas) sendo 27,7% destes recapturados. Em 2009, indivíduos adultos de ambos os sexos apareceram na área na última semana de abril, sendo que os machos tiveram pico no início do mês de maio enquanto as fêmeas no fim do mês de abril. Os machos sempre foram muito mais abundantes que as fêmeas, independente da parte da estrada e da época do ano. Durante abril, plantas floridas, que servem de alimento para os adultos, eram abundantes. A abundância de adultos se manteve alta de abril a julho, seguido por um período de crescente raridade até sumir da área no início de outubro. Espacialmente, a abundância de H. sara foi maior na unidade demográfica 2 (final da estrada), próxima à serra, quando comparada com o início. A atividade, número de indivíduos voando, foi maior no final da estrada do que no início. Indivíduos marcados em diferentes segmentos da estrada se mostraram altamente residentes (96%). Os poucos que se dispersaram mais que 100 m (6 entre 138 recapturas) eram machos. O tempo médio de permanência no local foi de 18,8 dias para recapturas, com uma permanência máxima de 86 dias para machos e de 44 dias para fêmeas. Por fim, o comprimento da asa anterior (CAA) das fêmeas foi superior (2mm) ao dos machos. Diferente de H. sara de populações de Carajás - PA e de Linhares - ES que apresentam adultos ativos o ano inteiro, a população do Vale do Rio Quilombo aparentemente recruta de forma concentrada no mês de abril e some sem vestígios em outubro, ou mantêm populações baixas ou persiste em refúgios ecológicos sazonais / Abstract: Population ecology seeks to understand the variation in species abundance in time and space. Species that have life cycles of short duration, like most insects, is especially convenient for this purpose. This study examined patterns of abundance during one year in a tropical butterfly near the limit of geographical distribution, in southeastern Brazil, in a subtropical location. In this work, Heliconius sara apseudes was studied along of road in the Quilombo River Valley, near of Santos' city, SP, Brazil, using the method of capture, marking, release and recapture. 498 individuals were marked (378 males and 120 females) being 27.7% of those recaptured. In 2009, individuals of both sexes appeared in the last week of April, and the males had peaks in the beggining of the month of May while the females at the end of April. Males have always been much more abundant than females, regardless of road part and of the season. During April, flowering plants, which provide food for the adults were abundant. The abundance of adults remained high from April to July, followed by a period of rarity increasing until disappear in the area in early October. Spatially, the abundance of H. sara was higher in the second demographic unit (final Road), near the mountains, when compared with the beginning. The activity, number of individuals flying, was bigger in the end of the road than at the beginning. Individuals marked in different segments of the road were shown highly residents. The few that were dispersed more than 100 m (6 of 138 recaptures) were males. The average length of stay in place was 18.8 days for recaptures, with a maximum stay of 86 days for males and 44 days for females. Finally, the length of forewing of females was higher (2mm bigger) than the males. There was an increase in the size of the wings of males advancing years, perhaps due to better survival of larger butterflies. Different of H. sara populations further north that have active adults throughout the year, the population of Quilombo River Valley apparently recruits in concentrated form in April and disappears without a trace in October, or maintaining low populations or persisting in seasonal ecological refuges / Mestrado / Ecologia / Mestre em Ecologia

Durante muito tempo as ilhas vêm sendo fundamentais para pesquisa em ecologia e biologia evolutiva. Esses estudos tornaram possível a elaboração de importantes teorias nesses campos e que puderam ser extrapoladas para diversos outros ambientes. O aumento dos desmatamentos e da fragmentação de habitats tem levado ao isolamento dos organismos em \"ilhas\" dentro do continente. A perda de diversidade em fragmentos é uma situação preocupante. Populações restritas a ilhas ou fragmentos possuem maior probabilidade de extinção. As abelhas possuem um papel fundamental nos ecossistemas e por isso a extinção de uma população terá impacto nos outros níveis tróficos. Em virtude disso, o objetivo desse trabalho foi testar a hipótese de que populações das abelhas Tetragonisca angustula e Bombus morio de ilhas com mais de 100 ha localizados nos estados de Santa Catarina (SC), Paraná (PR), São Paulo (SP) e Rio de Janeiro (RJ), e populações continentais em áreas próximas a remanescentes de Mata Atlântica nos estados de Minas Gerais (MG), PR, RJ, SC e SP possuem baixa diversidade genética e, por isso, estariam mais propensas à extinção. Nossos resultados mostraram que a espécie T. angustula apresenta alta filopatria de rainhas e baixa diversidade genética mitocondrial. Por outro lado, os microssatélites mostraram menor estruturação e alta/moderada diversidade genética, indicando que os machos são o sexo dispersor. Para a espécie B. morio, a diversidade genética observada para ambos os marcadores foi alta, com exceção de duas populações. As fêmeas também apresentaram maior estruturação populacional, enquanto que para os machos essa estruturação praticamente não existiu. Portanto, as populações das espécies T. angustula e B. morio não apresentam inclinação à extinção. A sobrevivência em ambientes urbanos e a grande capacidade de migração dos machos parecem ser fatores fundamentais para isso. Além disso, essas características parecem ser as responsáveis pelo não isolamento genético entre muitas das populações geograficamente isoladas / Islands have been key research fields on the ecology and evolutionary biology for a long time. The study of their biota has made possible the development of important theories that could be extrapolated to other environments. The increase in deforestation and habitat fragmentation has led to isolation of the organisms in \"islands\" within the continent. Loss of diversity in fragments is a concern, because nowadays many species only exist in fragments. Populations restricted to islands or fragments have higher probability of extinction. Bees have a key role in ecosystems and the extinction of their populations will impact other trophic levels. The aim of this study was to test the hypothesis that populations of two bee species, Tetragonisca angustula and Bombus morio, in islands with more than 100 ha located in the states of Santa Catarina (SC), Paraná (PR), São Paulo (SP) and Rio de Janeiro (RJ), and mainland populations in areas near the Atlantic Forest remnants in the states of Minas Gerais (MG), PR, RJ, SC and SP have low genetic diversity and therefore would be more prone to extinction. Our results to T. angustula showed low mitochondrial genetic diversity which can be associated to queen philopatry behavior. Moreover, microsatellites showed lower structure and moderate/high genetic diversity, indicating a greater dispersion by males. The genetic diversity observed for B. morio for both markers was high, excepting two populations. Females also had higher population structure than detected for males. Therefore, most of T. angustula and B. morio populations are not prone to extinction, mainly because of their capability to survive in urban environments and high male migration. Therefore, these characteristics seem to be responsible for allowing many of the geographically isolated populations do not present genetic isolation

Rhipsalis inclui 37 espécies e representa o maior gênero de Cactaceas epífitas. Grande parte das espécies de Rhipsalis são endêmicas do Brasil (81%), e apenas três espécies são amplamente distribuídas pela América Tropical: Rhipsalis micrantha (Kunth) DC. (Peru, Colômbia, Venezuela e Costa Rica), Rhipsalis floccosa Salm-Dyck ex Pfeiff. (Paraguai até a Venezuela) e Rhipsalis baccifera (em toda a América do Sul, desde a Argentina e Uruguai até as partes úmidas do México e Caribe, com limite norte no estado da Flórida, EUA). Rhipsalis baccifera é a única espécie a extrapolar a distribuição americana de Cactaceae, ocorrendo amplamente em áreas tropicais úmidas do continente Africano e parte do continente Asiático. Apesar de estudos recentes terem abordado a taxonomia do gênero, a identificação de táxons de Rhipsalis permanece problemática, principalmente em razão da plasticidade natural de caracteres morfológicos, falta de informação sobre os padrões de variação morfológica em populações naturais, existência de complexos de espécies e espécies crípticas. Além disso, pouco se conhece sobre a biologia e evolução desse grupo. Este trabalho visa aprofundar o conhecimento da tribo Rhipsalideae e do gênero Rhipsalis, os quais incluem plantas epífitas extremamente abundantes e diversas na região Neotropical. A área de estudo do presente trabalho compreende a Floresta Atlântica, uma área biologicamente muito importante, mas extremamente ameaçada. A elevada diversidade de espécies e alta taxa de endemismo de representantes da tribo Rhipsalideae na Mata Atlântica tornam este grupo particularmente interessante para um melhor entendimento dos mecanismos associados à diversificação de espécies na Mata Atlântica. Os objetivos do presente estudo são: (1) Reconstruir a filogenia da tribo Rhipsalideae com base em caracteres moleculares visando o teste do monofiletismo dos gêneros da tribo; (2) Reconstruir a filogenia do gênero Rhipsalis com base em caracteres moleculares visando o teste do monofiletismo dos seus subgêneros, o estudo da evolução de caracteres morfológicos, o estudo da ocupação dos hábitats epifítico e rupícola, e o estudo da biogeografia do grupo; (3) Elaborar uma nova classificação para o grupo com base em dados morfológicos e moleculares; e, (4) Revisar o \"clado caule-alado\" pertencente ao gênero Rhipsalis (= Rhipsalis subg. Phyllarthrorhipsalis). Estes quatro objetivos correspondem aos objetivos dos quatro capítulos desta tese. No primeiro capítulo, é apresentada a filogenia molecular da tribo Rhipsalideae reconstruída com base nos marcadores moleculares trnQ-rps16, rpl32-trnL, psbAtrnH e ITS. Com base nessa filogenia e num estudo da evolução de caracteres morfológicos, são propostas mudanças taxonômicas para os gêneros Hatiora e Schlumbergera. No segundo capítulo, é apresentada a filogenia do gênero Rhipsalis com base nos marcadores moleculares trnQ-rps16, rpl32-trnL, psbA-trnH, ITS e MS. Esta filogenia é então utilizada como base para inferir o padrão de evolução de características morfológicas e do hábito das espécies de Rhipsalis, bem como estudar a história biogeografica do gênero. No terceiro capítulo, uma nova classificação infragenérica para Rhipsalis é proposta com base na filogenia do gênero (capítulo 2) e informações morfológicas. Por fim, no quarto capítulo é apresentada a revisão taxonômica do clado \"caule-alado\", incluindo descrições, informações sobre a distribuição geográfica das espécies, novas circunscrições para diversos táxons e uma chave para a identificação das espécies do subgênero Rhipsalis / Rhipsalis includes 37 species and represents the largest genus of epiphytic cacti. Species of Rhipsalis are mainly endemic to Brazil (81%), and only three species are widely distributed throughout the Neotropics: Rhipsalis micrantha (Peru, Colombia, Venezuela and Costa Rica), Rhipsalis floccosa (Paraguay to Venezuela), and Rhipsalis baccifera (throughout South America, México, Caribbean region and Florida, USA). Rhipsalis baccifera is the only species whose distribution extends beyond the Americas, also occurring in tropical areas of the African continent and part of Asia. Despite recent taxonomic studies in the genus, the identification of taxa within Rhipsalis has remained problematic, mainly due to the natural plasticity of morphological characters, lack of information on the patterns of morphological variation in natural populations, existence of species complexes and cryptic species. In addition, little is known about the biology and evolution of this group. This study focuses on the tribe Rhipsalideae and on the genus Rhipsalis, very abundant and diverse groups of epiphytes in the Neotropics. The study area comprises the Atlantic Forest, which is an extremely important area biologically but also a highly threatened ecosystem. The high diversity of species and high endemism of Rhipsalideae in the Atlantic Forest makes this group particularly interesting for the study of the processes involved in the diversification of species within Mata Atlântica. The objectives of the present project are to: (1) Reconstruct the molecular phylogeny of the tribe Rhipsalideae and test the monophyly of genera within this tribe; (2) Reconstruct the molecular phylogeny of Rhipsalis in order to test the monophyly of its subgenera, study the evolution of morphological features, study the occupation of the rupiculous and epiphytic habitats, as well as the biogeographical history of the group; (3) Propose a new classification for the group based on novel molecular and morphological data; and, (4) Revise the \"wingedstem\" clade (= Rhipsalis subg. Phyllarthrorhipsalis). These four objectives correspond to the four chapters of the present thesis. The first chapter includes a molecular phylogeny of Rhipsalideae based on the molecular markers trnQ-rps16, rpl32-trnL, psbAtrnH and ITS. Information derived from this phylogeny and from a study on the evolution of selected morphological characters, is then used as basis to propose taxonomic changes in Hatiora and Schlumbergera. The second chapter presents a phylogeny of Rhipsalis based on the molecular markers trnQ-rps16, rpl32-trnL, psbA-trnH, ITS and MS. This phylogeny is then used as basis to study the evolution of selected morphological traits, study the evolution of the habit, and the biogeographical history of the genus. In the third chapter, a new infrageneric classification for Rhipsalis is proposed based on the phylogeny of Rhipsalis (chapter 2) and novel morphological information. Lastly, the fourth chapter presents a taxonomic revision of the \"winged-stem\" clade, including descriptions, information on the geographic distribution of species, novel circumscriptions for several taxa, and an identification key for all species of the subgenus Rhipsalis