Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-09-11T18:22:16Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_PerfilEpidemiologicoLetalidade.pdf: 6450186 bytes, checksum: 900819e85da412b4fed491bd4c3a29d6 (MD5) / Rejected by Irvana Coutinho (irvana@ufpa.br), reason: Verificar a autoria registrada. on 2017-09-27T11:54:58Z (GMT) / Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-09-27T12:45:48Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_PerfilEpidemiologicoLetalidade.pdf: 6450186 bytes, checksum: 900819e85da412b4fed491bd4c3a29d6 (MD5) / Approved for entry into archive by Irvana Coutinho (irvana@ufpa.br) on 2017-09-27T15:19:39Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_PerfilEpidemiologicoLetalidade.pdf: 6450186 bytes, checksum: 900819e85da412b4fed491bd4c3a29d6 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-27T15:19:39Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_PerfilEpidemiologicoLetalidade.pdf: 6450186 bytes, checksum: 900819e85da412b4fed491bd4c3a29d6 (MD5) Previous issue date: 2014 / A resistência bacteriana é responsável por grandes preocupações quanto ao impacto imediato aos sistemas de saúde. A proposta deste estudo foi determinar as características epidemiológicas, letalidade e aspectos moleculares de Pseudomonas aeruginosa isoladas de pacientes internados na Unidade de Terapia Intensiva (UTI) em hospital de ensino de Belém/Pará e analisar o desempenho do teste de sensibilidade para P. aeruginosa em sistema automatizado VITEK-2 para esclarecimento da resistência. A população do estudo foi constituída de 54 pacientes com infecção por P. aeruginosa internados na UTI adulto, pediátrica e neonatal no período de janeiro de 2010 a março de 2012. Para investigação epidemiológica foram coletados dados demográficos, co-morbidades, tempo de permanência na UTI, classificação dos episódios de Infecção Relacionada à Assistência à Saúde (IRAS), uso de procedimentos invasivos, tipo de infecção, terapia utilizada e desfecho do paciente (alta ou óbito), escore de MacCabe Jackson, APACHE II, escore de Charlson. A identificação bacteriana foi realizada a partir dos testes bioquímicos e do sistema Vitek-2. O teste de sensibilidade foi realizado com a aplicação do método de referência microdiluição em caldo, e a detecção da produção de metalo-beta-lactamase pelo método do duplo disco e pela PCR. A genotipagem por amplificação por meio do sistema DiversiLab. A P. aeruginosa foi o segundo patógeno mais freqüente no hospital e esta ocorrência foi maior na UTI adulto. A infecção respiratória foi predominante na UTI adulto, enquanto a infecção de corrente sanguinea prevaleceu nas UTI neonatal e pediátrica. A multirresistência foi mais encontrada na UTI adulto, a média da faixa etária da população foi de 28 anos com tempo de internação em média de 87,1 dias, a maioria das doenças de base eram potencialmente fatais e os principais fatores de risco para aquisição de infecção por PaMR foram o uso de ventilação mecânica e sonda vesical. Podemos afirmar que após os resultados da metanálise foi possível evidenciar que as cepas MR apresentaram taxa de mortalidade maior, com duas vezes mais chances de ocorrer o óbito, sendo a multirresistência um fator de mau prognóstico em pacientes com infecção por PaMR. Foi detectado quatro isolados produtores da variante blaSPM-1 e na genotipagem figurou a presença de similaridade genética maior que 97%, as variações observadas podem ter relação com pressão seletiva existente na UTI adulto, somada a terapia inadequada. Este estudo mostrou a importância de investigação de infecções por patógenos multirresistentes em unidades críticas, contribuindo para o melhor monitoramento e controle destas infecções. / The bacterial resistance is responsible for major concerns about the great problems on health systems. The proposal of this study was to determine the epidemiological, lethality and molecular characteristics of Pseudomonas aeruginosa isolated from patients admitted to the Intensive Care Unit (ICU) in a teaching hospital in city of Belem, Pará, Brazil and analyze the performance of susceptibility testing for P. aeruginosa in automated VITEK -2 to study the antimicrobial resistance. The target people of this study consisted of 54 patients with P. aeruginosa infection at the adult , pediatric and neonatal ICUs from January 2010 to March 2012. For the epidemiological research, demographic data, comorbidities, length of stay were collected. Episodes of Healthcare-associated infections were defined in accordance to Center for Disease Control and Prevention (CDC), use of invasive procedures, previous therapy and patient outcome, Jackson MacCabe score, APACHE II score and Charlson score were documented. The bacterial identification was performed by biochemical tests and VITEK-2 system. The sensitivity test was performed with the application of the method of broth microdilution , and detection of metallo-beta-lactamase by the double disc and PCR method. The test of Genotyping was made by amplification throug DiversiLab system. The P. aeruginosa was the second most common pathogen in the hospital and this occurrence was higher in the adult ICU. The respiratory infection was predominant in the adult ICU, while bloodstream infection was prevalent in pediatric and neonatal ICU. The multidrug resistance was higher in the adult ICU, the average age of patients was 28 years, with an average length of stay of 87.1 days, the diseases were potentially fatal and major risk factors for acquisition of PaMR infection were the use of mechanical ventilation and urinary catheterization. Through the meta-analysis study, we found that infections caused by MR strains showed higher mortality rate, and were twice as likely to death occurs, multidrug resistance a factor of poor prognosis in patients with infection PaMR. Four isolates producers blaSPM-1 variant was detected and genotyping figured the presence of genetic similarity greater than 97%, the changes observed may be related to selective pressure existing in the adult ICU, coupled with inadequate therapy. This study demonstrated the importance of investigations of infections with multidrug-resistant pathogens in critical care units, contributing to these data the possibility of better monitoring and control of these infections.

Submitted by Marta Toyoda (1144061@mackenzie.br) on 2017-01-06T21:12:59Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Siriana Mansur Capra.pdf: 1176760 bytes, checksum: 6843d3b90c5a839e5c35dba7eb3473c5 (MD5) / Approved for entry into archive by Paola Damato (repositorio@mackenzie.br) on 2017-01-16T11:41:43Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Siriana Mansur Capra.pdf: 1176760 bytes, checksum: 6843d3b90c5a839e5c35dba7eb3473c5 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-16T11:41:43Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Siriana Mansur Capra.pdf: 1176760 bytes, checksum: 6843d3b90c5a839e5c35dba7eb3473c5 (MD5) Previous issue date: 2016-06-06 / Williams-Beuren syndrome (WBS) is caused by microdeletions in the region 7q11.23. The main clinical features of the syndrome are congenital heart disease, typical facial dysmorphisms, friendly personality and intellectual disabilities. Previous studies have shown that polymorphism in the gene encoding the enzyme responsible for conversion of T4 to T3, the deiodinase type 2 (D2) does not alter its catalytic activity, but are positively associated with neuropsychiatric disorders and intellectual impairment, bipolar disorder and depression. Later it was demonstrated that polymorphic D2 (Thr92Ala-D2) alters the expression of genes involved in oxidative stress also altered in individuals with Alzheimer's disease. Taken together, we hipostenizamos the Thr92Ala-D2 might be related to cognitive impairment in individuals with SWB. Thus, this study aimed to track the frequency of polymorphism in a group of 63 patients with SWB and correlate the presence of the polymorphism with its indicators of intellectual functioning. Participants were 4-37 years on molecular diagnosis of SWB and were matched for sex and age. The DNA from patients was obtained from the collection of buccal epithelial cells using Swab and mutation status was determined by the technique of Polymerase Chain Reaction (PCR). Intellectual performance of participants was assessed by the instruments: WASI, WISC-III or WAIS-III. 10 individuals were identified polymorphic (A / A) and 39 heterozygotes (T / A), featuring 15.88% and 61.90% of the study population, respectively. 21 patients were evaluated and the IQ values ranged from 37 to 72, characterized intellectual deficit, mild to moderate, as described in the literature. There was no significant correlation between the presence of the polymorphism and IQ patients, even when the sample was stratified according to gender. Two patients heterozygous for the polymorphism had subclinical hypothyroidism and IQ values were 42.2 and 37. We note a full IQ downward trend as there is an increase in serum levels of TSH, although no statistical significance. / A Síndrome de Williams-Beuren (SWB) é causada por microdeleções na região 7q11.23. As principais características clínicas da síndrome são cardiopatia congênita, dismorfismos faciais típicos, habilidade social e deficiência intelectual. Estudos anteriores mostraram que polimorfismos no gene que codifica a enzima responsável pela transformação de T4 em T3, a Desiodase do tipo 2 (D2), não alteram sua atividade catalítica, mas estão positivamente relacionadas com transtornos neuropsiquiátricos, como deficiência intelectual, bipolaridade e depressão. Posteriormente foi demonstrado que a D2 polimórfica (Thr92Ala-D2) altera a expressão de genes envolvidos com o stress oxidativo, também alterados em indivíduos com doença de Alzheimer. Tomados em conjunto, nós hipostenizamos que a Thr92Ala-D2 poderia estar relacionada com déficit cognitivo em indivíduos com SWB. Assim, o presente estudo teve como objetivo rastrear a frequência do polimorfismo em um grupo de 63 pacientes com SWB e correlacionar a presença do polimorfismo com seus indicadores de funcionamento intelectual. Os participantes tinham de 4 a 37 anos com diagnóstico molecular de SWB e foram pareados por sexo e idade. O DNA dos pacientes foi obtido pela coleta de células do epitélio bucal utilizando Swab e a presença da mutação foi determinada pela técnica de Polymerase Chain Reaction (PCR). O desempenho intelectual dos participantes foi avaliado pelos instrumentos: WASI, WISC-III ou WAIS-III. Foram identificados 10 indivíduos polimórficos (A/A) e 39 indivíduos heterozigotos (T/A), caracterizando 15,88% e 61,90% da população estudada, respectivamente. 21 pacientes foram avaliados e os valores de QI variaram entre 37 a 72, caracterizando déficit intelectual de leve a moderado, como descrito na literatura. Não houve correlação significativa entre a presença do polimorfismo e o QI dos pacientes, nem mesmo quando estratificamos a amostra de acordo com o sexo. Dois pacientes heterozigotos para o polimorfismo apresentaram hipotireoidismo subclínico e os valores de QI foram de 42,2 e 37. Notamos uma tendência de diminuição do QI total conforme há aumento nos níveis séricos de TSH, apesar de não haver significância estatística.

Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-06T14:21:39Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_AssociacaoMarcadoresResposta.pdf: 1182695 bytes, checksum: 77fee73e4ba90714b6fede844c3a22f5 (MD5) / Rejected by Irvana Coutinho(irvana@ufpa.br), reason: Alteração no título Alterar no título a primeira letra da palavra chlamydia pneumoniae para Chlamydia pneumoniae. on 2014-02-06T14:59:05Z (GMT) / Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-06T15:03:28Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_AssociacaoMarcadoresResposta.pdf: 1182695 bytes, checksum: 77fee73e4ba90714b6fede844c3a22f5 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2014-02-11T13:58:34Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_AssociacaoMarcadoresResposta.pdf: 1182695 bytes, checksum: 77fee73e4ba90714b6fede844c3a22f5 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-02-11T13:58:34Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_AssociacaoMarcadoresResposta.pdf: 1182695 bytes, checksum: 77fee73e4ba90714b6fede844c3a22f5 (MD5) Previous issue date: 2010 / A base genética das doenças é frequentemente estudada a partir dos polimorfismos dos genes de citocinas. O presente estudo investigou marcadores da resposta inflamatória associados a infecções virais e bacterianas que possam influenciar o curso da infecção. Foram medidos os níveis séricos (por ensaio imunoenzimático) e os polimorfismos de TNF-α (-308), TNF-β (+252), IFN-γ (+874) e da proteína C reativa, por meio de PCR e RFLP ou PCR alelo específico, em grupos de pessoas infectadas pelo vírus da dengue (n=80), com doença febril, não infectados (100), um grupo de infectados pelo HTLV (30 sintomáticos e 47 assintomáticos), um grupo com doença coronariana (58 com sororreatividade para Chlamydia e 31 com sorologia negativa) e um grupo controle (99 pessoas com sorologia negativa para dengue, HTLV e Chlamydia). Nenhum grupo mostrou associação com informações demográficas. O Vírus da dengue 3 (66,2%) e o HTLV-1 (90% em sintomáticos e 76,6% em assintomáticos) foram os agentes mais frequentes dentre os grupos respectivos. A maioria com doença coronariana (65,1%) apresentou anticorpos para Chlamydia (39,6% para C. trachomatis e C. pneumoniae, 58,6% apenas para C. trachomatis e 1,7% somente para C. pneumoniae). Foram significantes as diferenças encontradas entre: (i) os níveis séricos de TNF-β, IFN-γ e PrtCR dos grupos dengue positivo e dengue negativo com o grupo controle (p< 0,01); (ii) os níveis séricos de TNF-α, TNF-β, e IFN-γ dos grupos de HTLV (incluindo os tipos) e grupo controle; (iii) os níveis séricos de TNF-α, TNF-β, IFN-γ e PrtCR entre os pacientes com doença coronariana e sorologia positiva para Chlamydia e o grupo controle; (iv) a presença de anticorpos para C. trachomatis e C. pneumoniae e o grupo controle na comparação com a TNF-β, IFN-γ e PrtCR. As distribuições de frequências genotípicas foram estatisticamente significantes para os polimorfismos: (i) dos genes TNF-α (p=0,0494) e IFN-γ (p= 0,0008), entre os grupos dengue positivo, dengue negativo e controle e para o IFN-γ (p= 0,0007) entre os grupos DEN 1, DEN 2 e DEN 3 e o controle; (ii) do gene IFN-γ (p= 0,0023) nos grupos de pacientes com doença coronariana e sorologia positiva para C. trachomatis e C. pneumoniae, assim como nos monoreativos na comparação entre a positividade para C. trachomatis e o grupo controle. / The genetic basis of diseases is frequently studied aiming the polymorphisms of cytocine genes. The present study investigated markers of the inflammatory response associated to the course of infection and disease caused by viruses and bacteria. Serum levels (measured by an ELISA assay) and the polymorphisms (using PCR, RFLP and allele specific PCR) of TNF-α (-308), TNF-β (+252), IFN-γ (+874) and C reactive protein were measured among persons with febrile disease, infected by dengue virus (n=80), not infected by DV (100), a group of HTLV infected (30 symptomatic and 47 asymptomatic), a group with coronary disease (58 seroreactive to Chlamydia and 31 with negative serology) and a control group (99 persons with no reaction to DV, HTLV and Chlamydia). No group showed association with demographic informations. Dengue virus 3 (66.2%) and HTLV-1 (90% symptomatic and 76.6% asymptomatic persons) were the most frequent agents found among their groups. The majority of those with coronary disease (65.1%) presented antibodies to Chlamydia (39.6% to C. trachomatis and C. pneumoniae, 58.6% solely to C. trachomatis and 1.7% to C. pneumoniae). Statistically significant levels of differences were found among: (i) serum levels of TNF-β, IFN-γ and PrtCR of positive and negative dengue and control groups (p< 0,01); (ii) serum levels of TNF-α, TNF-β and IFN-γ of HTLV (including its types) and control groups; (iii) serum levels of TNF-α, TNF-β, IFN-γ and PrtCR among patients with coronary disease, serum reactive to Chlamydia, and the control group; (iv) the presence of antibodies to C. trachomatis and C. pneumoniae and the control group comparing TNF-β, IFN-γ and PrtCR. Genotypic frequency distributions were statistically significant for the polymorphisms: (i) of TNF-α (p=0,0494) and IFN-γ (p= 0,0008) genes among positive, negative and control dengue groups and to IFN-γ (p= 0,0007) among groups DEN 1, DEN 2, DEN 3 and controls; (ii) of IFN-γ gene (p= 0,0023) among the group of patients with coronary disease and sero reactivity to C. trachomatis e C. pneumoniae, as well as to the mono reactants in the comparison between the positivity to C. trachomatis and the control group.

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:02:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 3950.pdf: 2965296 bytes, checksum: 1e00d517bd464f272b8c1a2c9f67ca9c (MD5) Previous issue date: 2011-10-11 / Valée S.A. / Swine erysipelas is among the diseases that causes great economic losses in swine cultures worldwide. The disease is caused by the bacterium Erysipelothrix rhusiopathiae, and the surface protein SpaA is one of its main antigens. Herein, we report studies concerning the development of recombinant vaccines against swine erysipelas based on the SpaA antigen. Protein production for a subunit vaccine formulation was studied in shaken flasks and 5.0 L bioreactors. For this propose, a 1026 bp fragment of the spaA gene was cloned in Escherichia coli cells under the lac promoter control. The recombinant organism (E. coli BL21(DE3) pET28a_spaA) was cultivated in fed batch using complex medium with glycerol as carbon source. Nonconventional induction strategies were evaluated and high protein yield (198 mgprot/gDCW) and productivity values (0.4 gprot/L.h) were reached. The same antigen was cloned for expression and secretion in attenuated Salmonella typhimurium cells to obtain a live bacterial vector for the SpaA antigen. The recombinant lineage was able to express and secrete the SpaA fragment fused to the alpha-hemolysin secretion signal both in vitro and in vivo. High plasmid maintenance was observed in both conditions. The vaccinal vehicle showed to be able to colonize the Peyer patches and to invade the gut epithelial barrier in the inoculated animals. Immunization tests in murine model showed that the recombinant antigen delivered by Salmonella cells inoculated by oral route induced the production of seric IgG antibodies anti-SpaA. According to the literature, these antibodies must be able to promote pathogen opsonization in case of infection, contributing to confer a protective immunity against swine erysipelas to the vaccinated animals. In summary, this work presents contributions to development of subunit vaccines against swine erysipelas, in the form of recombinant protein formulations, or SpaA antigen delivery by attenuated S. typhimurium cells. / A erisipela suína é uma das enfermidades que causam grandes prejuízos na suinocultura em todo o mundo. A doença é causada pela bactéria Erysipelothrix rhusiopathiae, e a proteína de superfície SpaA desse microrganismo é um de seus principais antígenos. Neste trabalho, estudou-se o desenvolvimento de vacinas recombinantes contra a erisipela suína a partir do antígeno SpaA. Avaliou-se a produção de uma vacina de subunidade composta pelo antígeno recombinante, a qual foi estudada em frascos agitados e em biorretores de bancada de 5,0 L. Para isso, um fragmento de 1026 pb do gene spaA foi clonado em células de Escherichia coli sob controle do promotor lac e o organismo recombinante (E. coli BL21(DE3) pET28a_spaA) foi cultivado em batelada alimentada, utilizando-se meio complexo contendo glicerol como fonte de carbono. Estratégias não convencionais de indução foram avaliadas e altos valores de rendimento (198 mgprot/gDCW) e produtividade (0,4 gprot/L.h) da proteína recombinante foram alcançados. O mesmo antígeno foi clonado em um plasmídeo que possibilita a expressão e secreção da proteína recombinante em Salmonella typhimurium atenuada, a fim de se obter um vetor bacteriano vivo para o antígeno em questão. A linhagem recombinante foi capaz de expressar e secretar o fragmento da proteína SpaA fusionado ao sinal de secreção da alfa-hemolisina tanto in vitro quanto in vivo, apresentando alta taxa de manutenção plasmidial nas duas condições. Além disso, o veículo vacinal se mostrou capaz de colonizar as placas de Peyer e de invadir a barreira epitelial do intestino dos animais inoculados. Ensaios de imunização em modelo murino mostraram que a veiculação do antígeno pelas células de Salmonella inoculadas por via oral induziu a produção de anticorpos IgG séricos anti-SpaA, que de acordo com a literatura, devem ser capazes de promover a opsonização do patógeno em caso de infecção, contribuindo para conferir uma imunidade protetora contra a erisipela suína aos animais vacinados. Em suma, este trabalho apresenta contribuições para o desenvolvimento de vacinas de subunidade contra a erisipela suína na forma de uma vacina de proteína recombinante, ou por veiculação do antígeno SpaA por linhagens atenuadas de S. typhimurium.