Orientador: Wilter Ricardo Russiano Vicente / Coorientador: Alexeia Barufatti Grisolia / Coorientador: José Fernando Garcia / Banca: Roberto Carvalheiro / Banca: Joaquim Mansano Garcia / Banca: Fernando Sebastián Baldi Rey / Banca: Lenira El Faro / Resumo: Análises de associação genômica ampla (GWAS) para idade ao primeiro parto (IPP) e duração do período gestacional (PG) em bovinos da raça Nelore foram conduzidas utilizando painel de ~ 777.000 polimorfismos de nucleotídeo de sítio único (SNP). As análises de associação foram conduzidas em três grupos amostrais distintos com seus respectivos dados fenotípicos: 1) IPP em meses para 96 fêmeas, 2) valores genéticos preditos (EBVs) para IPP e PG para 831 touros, e 3) EBVs para IPP e PG para 1.278 fêmeas. Para cada conjunto de dados e para cada marcador, efeitos de substituição alélica foram estimados por meio do método dos quadrados mínimos ponderados e corrigidos para estratificação populacional. Os marcadores apresentando maiores efeitos estimados foram considerados como indicativos de evidência da associação da região cromossômica com o fenótipo investigado. Realizou-se a prospecção de genes candidatos nas regiões detectadas por diferentes metodologias (busca de SNP intragênicos, mapeamento de genes potencialmente em LD com SNP e construção de redes de termos funcionais, além de revisão manual para evidência em processo reprodutivo baseado em literatura científica). Grande número de regiões genômicas foram indicadas pelos efeitos de substituição alélica estimados, os quais apresentaram distribuição esperada para uma característica poligênica. Os resultados obtidos revelaram funções biológicas relacionadas a processos reprodutivos e sugeriram os genes PRKCD (protein kinase C delta type), PRKCE (protein kinase C epsilon type), ITHI-1 (inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H1 precursor), ITHI-3 (inter-alphatrypsin inhibitor heavy chain H3), ITHI-4 (inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H4 precursor), BT.62377 (sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Genome-wide scans for age at first calving (AFC) and gestation length (GL) in Nellore cattle were performed using a panel of over 777,000 single nucleotide polymorphisms (SNP). Association analyses were carried out in three distinct sample groups and their respective phenotypic data: 1) AFC, in months, for 96 cows, 2) AFC and GL estimated breeding values (EBVs) for 831 sires, and 3) AFC and GL EBVs for 1,278 cows. For each dataset and each marker, allele substitution effects were estimated via ordinary least squares and corrected for population stratification. Markers exhibiting high estimated effects were considered as indicative of evidence of association between the chromosomal region and phenotype investigated. Different methodologies were applied for the prospection of candidate genes within the detected regions (intragenic SNP mining, mapping of genes potentially in linkage disequilibrium with SNP, networking of functional terms, and manual review of genes previously found to be involved in reproductive processes). Large amounts of genomic regions were indicated by the estimated allele substitution effects, which presented a distribution consistent with a polygenic trait. The results obtained revealed biological functions related to reproductive processes and suggested PRKCD (protein kinase C delta type), PRKCE (protein kinase C epsilon type), ITHI-1 (inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H1 precursor), ITHI-3 (interalpha- trypsin inhibitor heavy chain H3), ITHI-4 (inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H4 precursor), BT.62377 (sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3), EFCAB6 (uncharacterized gene), TPT1 (translationally-controlled tumor protein) and AMH (muellerian-inhibiting factor precursor), and ZBTB16 (zinc finger and BTB domain-containing protein 16) and PIK3R1 (Phosphatidylinositol 3-kinase... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Ricardo Andrade Reis / Banca: Odilon Gomes Pereira / Banca: Flávio Dutra de Resende / Resumo: Objetivou-se com este trabalho avaliar os efeitos da aplicação do Lactobacillus buchneri sobre as características fermentativas, dinâmica microbiológica e estabilidade aeróbia de silagens de milho. Avaliou-se também o desempenho de novilhos Nelore recebendo dietas com silagem de milho inoculada ou não com este microrganismo associado a duas relações volumoso:concentrado. Avaliaram-se quatro dietas em arranjo fatorial 2 (silagem de milho inoculada ou não com L. buchneri) x 2 (duas relações volumoso:concentrado: 60:40 e 40:60). Foram utilizados 28 novilhos da raça Nelore com peso corporal inicial médio de 322,7 ± 10,2 kg. Os animais permaneceram em adaptação por 18 dias, iniciando-se os períodos experimentais (quatro períodos de 28 dias cada) após este período. Utilizaram-se ainda quatro animais canulados no rúmen para avaliação dos parâmetros ruminais. Com relação às características das silagens, constatou-se redução no teor de fibras e na concentração de ácido lático pela utilização do L. buchneri. Do mesmo modo, este microrganismo reduziu a população de levedura presente na massa proveniente da camada superficial dos silos após abertura dos silos. A inoculação com L. buchneri associado a 60% de concentrado na dieta promoveu maior consumo de matéria seca (MS) e energia pelos animais que receberam esta dieta. A associação entre silagem inoculada e 60% de concentrado na dieta resulta em melhora na utilização do alimento, visto que esta dieta permitiu reduzir a relação acetato:propionato no rúmen dos animais alimentados com esta dieta. O desempenho de bovinos de corte terminados em confinamento melhora devido à utilização de silagem de milho inoculada com L. buchneri associado ao maior nível de concentrado na dieta / Abstract: The aim of this research was to evaluate the effects of application of Lactobacillus buchneri on the fermentation, occurrence of microorganisms and aerobic stability of corn silages. The performance of Nellore young bulls also was evaluated when these animals fed with corn silage inoculated or not associated with two forage: concentrate ratios. The diets evaluated were: corn silage inoculated or not associated with 40 or 60% of concentrate. Twenty eight Nellore young bulls were used with average weight of 322.7 ± 10.2 kg. The animals kept 18 days in adaptation. After, four periods of 28 days each were conducted. Four canulated animals still used to evaluate the ruminal parameters. In relation the silage characteristics, observed lower fiber content, lactic acid concentration by L. buchneri application. Application of L. buchneri decreased the yeasts occurrence evaluated in the mass obtained of top silages after open the silos. L. buchneri inoculation combined with 60% of concentrate in the diet increased the dry matter (DM) intake and crude energy when the animals fed with this diet. Association between corn silage inoculated with 60% of concentrate resulted in lower acetic: propionic acid ratio in the rumen of the animals fed with this diet. Performance of beef cattle finished in feedlot is improved because of utilization corn silage inoculated with L. buchneri combined with higher level of concentrate in the diet / Mestre

Orientador: Danísio Prado Munari / Coorientador: Sabrina Luzia Caetano / Banca: Humberto Tonhati / Banca: João Ademir de Oliveira / Banca: José Bento Sterman Ferraz / Banca: Cláudia Cristina Paro de Paz / Resumo: A habilidade de permanência da vaca no rebanho é economicamente importante em gado de corte. Quanto mais tempo a vaca permanecer no rebanho, maiores serão as chances da vaca pagar seus custos de recria e gerar lucro ao produtor. Este trabalho teve dois objetivos: primeiro, avaliar a variável idade da vaca ao último parto (IVUP) como medida de habilidade de permanência da vaca no rebanho em diferentes critérios de censura; segundo, estimar parâmetros genéticos para a mesma para cada um dos diferentes critérios de censura considerados. Registros de 22312 vacas da raça Nelore provenientes de 13 fazendas foram utilizados neste estudo. As variáveis explanatórias utilizadas foram idade ao primeiro parto, número de partos, estação e ano de nascimento e fazenda. Três critérios de censura foram escolhidos: 16, 26 e 36 meses de idade. Metodologias de análise de sobrevivência foram utilizadas para a análise dos dados e estimação dos parâmetros das curvas de sobrevivência e risco. A variância de IVUP foi estudada considerando o efeito de cada variável explanatória proposta para os três critérios de censura. A metodologia dos estimadores de Kaplan-Meier foi empregada para estimar a probabilidade da vaca permanecer no rebanho. O modelo de riscos proporcionais de Cox foi utilizado para estimar o risco da vaca deixar o rebanho. Os valores genéticos dos animais e a herdabilidade do risco da vaca deixar o rebanho foram estimados por modelo de riscos proporcionais de Weibull. A análise da classificação dos reprodutores com base no valor genético foi realizada por meio do teste de correlação de Spearman. Quanto maior o valor do critério de censura adotado, maior foi o número de vacas com informações completas incluídas na análise. Há diferenças significativas (P<0,05) entre as funções de sobrevivência e risco dos três critérios adotados. A habilidade de permanência da ... / Abstract: Stayability is economically importante in the beef cattle industry. The longer the cow ramains in the herd, the greater are the chances it will pay for its costs and generate revenue. This study had two objectives: first, evaluate the variable age of cow at last calving (ALC) as a measurement of stayability considering diferent censoring criteria; second, to estimate genetic parameters for the same variable considering the diferent censoring criteria. Records of 22313 Nellore cows, from 13 farms were used in this study. The explanatory variables considered were age at first calving, number of calvings, season and year of birth and farm. Three censoring criteria were chosen: 16, 26 and 36 months of age. Survival analysis techniques were used to evaluate the variable and to estimate survival and risk curves. The variance of the ALC was studied considering the effect of each explanatory variable. The Kaplan-Meier method was used to estimate the cows'survival curves. The Cox proportional hazards model was used to estimate the hazard of the cow being culled. The breeding values and heritability of the hazard of being culled were estimated by a proportional hazards Weibull model. The Spearman correlation test was used to study the rank of the animals considering the three censoring criteria. The greater the censoring criterion addopted, the greater was the number of cows with complete records. The estimated survival curves and hazard functions differ among each other (P<0.05). The stayability estimated considering the 16 months of age criterion was the greater when compared with the other censoring criteria. The heritability estimates for the 16, 26 and 36 months criteria were 0.1020, 0.1002 and 0.0871, respectively. The Spearman correlation estimates for the 16 and 26, 16 and36 and 26 and 36 months of censoring criteria were -0.2124, 0.1348 and 0.1211, respectively (P>0.05). A big part of the ... / Doutor

Orientador: Gustavo Rezende Siqueira / Banca: Ricardo Andrade Reis / Banca: Joanis Tilemahos Zervoudakis / Resumo: Objetivou-se com o presente estudo avaliar o efeito da elevação do aporte proteico e também diferentes taxas de degradação proteica, aliados a utilização de energia, sobre o desempenho, parâmetros fermentativos, consumo de forragem e de suplemento em animais Nelore, recriados em pastagem de Brachiaria brizantha cv. Marandu durante a estação de transição seca-águas. Os suplementos foram: Suplemento proteico energético com 25% de PB (C-25), suplemento proteico energético com 40% de PB, sendo 1/3 da PB de origem vegetal e 2/3 de uréia (40-2/3NNP), suplemento proteico energético com 40% de PB, sendo 1/3 da PB de uréia e 2/3 de origem vegetal (40-1/3NNP), suplemento proteico energético com 40% de PB, sendo 1/2 da PB de uréia e 1/2 de origem vegetal (40-1/2NNP). As avaliações de pasto e as pesagens dos animais foram realizadas a cada 28 dias. A cada período também foram realizadas estimativas de consumo coletivo de suplemento além de parâmetros ruminais. O delineamento experimental foi o de blocos completos aos acaso para a avaliação de desempenho, sendo as áreas experimentais o fator de blocagem e o piquete como unidade experimental. Para as avaliações de parâmetros ruminais e consumo o delineamento adotado foi em quadrado latino (4X4). Não houve efeito dos suplementos sobre o pH ruminal, concentração de acetato, propionato e isobutirato, porém, os animais que consumiram suplemento com altos níveis de proteína e maiores taxa de degradação (40-2/3NNP), apresentaram maiores concentrações ruminais de butirato e isovalerato. Observou-se interação entre suplementos e períodos de avaliação sobre o desempenho animal. Os animais suplementados com maiores níveis de proteína aliados as menores taxas de degradação proteica (40-1/3NNP) apresentam desempenho superiores quando comparadas aos animais consumindo menores níveis de proteína (C-25) ou níveis elevados ... / Abstract: The objective of this study was to evaluate the effect of elevated protein intake and also different rates of protein degradation, coupled with the use of energy on performance, fermentation parameters, forage intake and supplement in Nellore, recreated in Brachiaria brizantha. Marandu during the dry season transition waters. The treatments were: energy protein supplement with 25% CP (C-25), energy protein supplement with 40% CP, 1/3 of the PB of vegetable and two thirds of urea (40-2/3 NNP) energy protein supplement with 40% CP, 1/3 of the PB urea and 2/3 of vegetable origin (40-1/3NNP), energy protein supplement with 40% CP, 1/2 PB of urea and 1/2 of vegetable origin (40-1/2 NNP). The pasture assessments and weights of animals were taken every 28 days. Each period also estimates individual and collective consumption of supplement and forage plus fermentation parameters were performed. The experimental design was a complete randomized to evaluate the performance blocks, experimental areas and the blocking factor paddock as the experimental unit. Evaluations of ruminal fermentation and the consumption design was a Latin square (4X4). There were no treatment effects on ruminal pH, acetate, propionate and isobutyrate, however, the animals fed supplement with high levels of protein and higher degradation rate (40-2/3NNP), have higher ruminal concentrations of butyrate and isovalerate. There was interaction between treatments and periods of assessment on animal performance. The animals supplemented with higher levels of protein combined with lower rates of protein degradation (40-1/3 NNP) exhibit superior performance when compared to animals consuming lower levels of protein (C- 25) or high levels of protein with high degradation rates (40-2/3 NNP) at the beginning of the transition dry waters . We conclude that elevated levels of protein combined with lower rates of degradation is an alternative ... / Mestre

Orientador: Roberto Carvalheiro / Coorientador: Henrique Nunes de Oliveira / Banca: Lúcia Galvão de Albuquerque / Banca: Rúsbel Raúl Aspilcueta Borquis / Resumo: A seleção genômica tem sido apontada como uma tecnologia que propiciará aumentos expressivos nas taxas de progresso genético em programas de melhoramento animal. Um dos fatores limitantes para a aplicação da seleção genômica é o custo associado à necessidade de genotipagem de um número grande de animais, com painéis de alta densidade, para a obtenção de boa habilidade de predição dos valores genéticos. Uma alternativa para reduzir custos seria genotipar parte dos animais com painéis menos densos e utilizar técnicas de imputação de genótipos. Em bovinos da raça Nelore, ainda não há consenso quanto à densidade dos painéis a serem utilizados e quanto à estratégia de genotipagem e imputação. Assim, objetivou-se com o presente projeto avaliar a habilidade de predição da seleção genômica utilizando painéis de marcadores moleculares de diferentes densidades, assim como o efeito da utilização de genótipos imputados na habilidade de predição da seleção genômica, em bovinos da raça Nelore. A característica considerada foi precocidade de terminação. Um total de 2035 animais geneticamente avaliados para essa característica e genotipados com o chip Ilumina ® HD Bovina (780k) foram utilizados nas análises, simulando uma situação em que os animais teriam sido genotipados com chips de densidade mais baixa. Análises de seleção genômica também foram executadas utilizando parte dos marcadores do painel de 780k , disponibilizando apenas os SNPs em comum com as seguintes painéis: Illumina® BovineLD (7K), Illumina® BovineSNP50 v2 (50K) e GeneSeek® Genomic Profiler 20K e 75K para Bos indicus. A imputação dos genótipos foi feita com o uso do programa FImpute e as predições genômicas foram conduzidas utilizando os métodos GBLUP e LASSO Bayesiano. Ambas análises, de imputação e de predição genômica, foram conduzidas de forma repetida, seguindo um esquema de validação cruzada, com a formação ... / Abstract: Genomic selection has been considered as a technique that will allow significant increase in the genetic progress of animal breeding programs. A constrain for genomic selection application is the cost of genotyping several animals with high density chips in order to obtain a good prediction equation. An alternative to reduce costs is to genotype part of the animals with a lower density chip and to impute the unobserved genotypes. In Nelore cattle, there is no consensus about which chip and genotyping strategy should be adopted. Therefore, the aim of the present study was to evaluate the predictive ability of genomic selection in Nelore cattle using chips with different densities, and also to assess the effect of using imputed genotypes. The trait considered was finishing precocity. A total of 2,035 animals genetically evaluated for this trait and genotyped with the Illumina® Bovine HD chip (780K) were used in the analyses, mimicking a situation where the animals would have been genotyped with lower density chips. Genomic selection analyses were also run masking part of the 780K genotypes, making available just the SNPs in common with the following chips: Illumina® BovineLD (7K), Illumina® BovineSNP50 v2 (50K), GeneSeek® Genomic Profiler 20K and 75K for Bos indicus. Genomic prediction analyses were run with or without imputing the masked genotypes, using the software FImpute, and under the GBLUP and Bayesian LASSO methods. A 5- fold cross-validation scheme was adopted to perform the analyses, randomly assigning the groups. Results showed that the 50K and 75K chips presented the same predictive ability as the 780K chip. The results also indicated that if the 780K was considered as the target chip for applying genomic selection in the Nelore breed, its cost effectiveness could be improved with the strategy of genotyping part of the animals with a lower density chip (7K or 20K) and imputing their 780K missing genotypes. Further studies ... / Mestre

Orientador: Telma Teresinha Berchielli / Coorientador: Jackson Antônio Marcondes de Souza / Coorientador: Juliana Duarte Messana / Banca: Izabelle Auxiliadora Molina de Almeida Teixeira / Banca: Roberta Carrilho Canesin / Resumo: O rúmen é um ecossistema aberto, no qual o alimento consumido pelos ruminantes é fermentado a ácidos graxos de cadeia curta e proteína microbiana, os quais servem respectivamente como fonte de energia e de proteína para o animal. Espécies de micro-organismos têm desenvolvido no rúmen uma série de interações complexas, o qual é um dos melhores exemplos de simbiose entre micro-organismos na natureza. Os métodos convencionais para a taxonomia baseada em técnicas de cultivo vêm sendo substituídas por técnicas moleculares, que são rápidas e mais precisas. O fundamento das técnicas moleculares está na sequência do 16S rRNA que fornece a classificação filogenética usadas na identificação e quantificação da comunidade bacteriana. Para avaliar a diversidade bacteriana ruminal neste estudo, foram utilizados 3 bovinos da raça Nelore, canulados no rúmen. As frações líquida e sólida do conteúdo ruminal foram processadas para extração de DNA metagenômico, após a extração foi verificado a quantidade e integridade das amostras. Em seguida, foi feita a PCR baseada nas regiões hipervariáveis V1 e V2 do 16S rRNA, e em sequência procedeu-se a construção da biblioteca e sequenciamento utilizando a plataforma Illumina. Os dados foram analisados pelos softwares MG-RAST e MOTHUR para filiações bacterianas. Aproximadamente 11.407.000 reads foram geradas com qualidade e 812 e 752 UTOs foram encontrados no nível de espécie e gênero respectivamente. Foram identificados 27 filos no conteúdo ruminal de bovinos Nelore através do sequenciamento do gene 16S rRNA pela plataforma Illumina. Os conhecimentos gerados a partir do presente estudo são informações primárias e primordiais para o entendimento da composição bacteriana ruminal. Assim, nos proporciona vislumbrar futuro promissor no desenvolvimento de novos métodos e tecnologias aplicáveis na nutrição animal / Abstract: The rumen is an open ecosystem in which the food consumed by ruminant is fermented to yield short-chain fatty acids and microbial protein, that in turn serve as a source of energy and protein for the animal, respectively. Species of microorganisms into rumen have developed a series of complex interactions that become one of the best examples of symbiosis between microorganisms in nature. Conventional methods for microbial taxonomy based on culture techniques have been replaced by molecular techniques which are quickly and more accurate. The majority of phylogenetic molecular tools for bacteria classification are based on ribosomal 16S rRNA gene that provides resources for identification and also quantification of bacterial communities. In order to evaluate the ruminal bacterial diversity present in three Nelore cannulated cattle, the rumen content was fractionated in liquid and solid samples after its collect. Both parts were processed for metagenomic DNA extraction which in turn was evaluated according quantity and integrity parameters. Next stage consisted in PCR technique based on V1 and V2 hypervariable 16S rRNA regions to generate amplicons used for DNA sequencing performed at Illumina platform. Data were processed by MG-RAST and MOTHUR softwares to deduce bacterial affiliations. Approximately 11,407,000 reads were generated showing quality for indication of 812 and 752 OTUs at the level of species and genus, respectively. Twenty-seven phyla were successfully identified in Nellore ruminal contents by 16S rRNA sequencing in the powerful Illumina platform. The knowledge generated from this study are primary and essential for the wide understanding of rumen bacterial composition information. Thus, it provides us resources to be explored in a promising future focusing the development of new methods and technologies applied to animal nutrition / Mestre

Orientador: Marion Burkhardt de Koivisto / Banca: Gisele Mingoti / Banca: Cássia Orlandi / Resumo: O objetivo deste estudo foi avaliar o empacotamento da cromatina e morfometria da cabeça de espermatozoides criopreservados de touros Bos taurus indicus da raça Nelore de diferentes idades e a influência do grau de compactação da cromatina na produção in vitro de embriões (PIV). Foram utilizados 40 animais mantidos em centro de coleta e processamento de sêmen (CCPS) e distribuídos em três grupos: Grupo Jovens (entre 1,8 e 2 anos), Grupo Adultos (entre 3,5 e 7 anos) e Grupo Senis (entre 8 e 14,3 anos). Os ejaculados foram congelados de acordo com os padrões pré-estabelecidos do CCPS. Utilizou-se a coloração de azul de toluidina, que permite a avaliação simultânea da cromatina e morfometria da cabeça espermática, a cromomicina A3 (CMA3) para analisar a protaminação espermática e a PIV para o desenvolvimento embrionário. O azul de toluidina foi avaliado pela microscopia óptica e a CMA3 pelo citômetro de fluxo. Na PIV foram realizadas quatro repetições por grupo, com 25 a 30 oócitos em cada repetição. A análise seminal revelou que espermatozoides de touros jovens obtiveram maiores valores de área (A), perímetro (P) e largura (L) quando comparados a adultos e senis (Jovens: A=1848,5±119,79, P=10,23±0,29, L=1,95±0,1; Adultos: A=1672,9±104,46, P=9,86±0,33, L=1,81±0,06; Senis: A=1723,1±124,41, P=9,97±0,33, L=1,83±0,09; P<0,0001) e apresentaram maior deficiência de protaminação quando analisado pela CMA3 (Jovens: 1,57±0,76; Adultos: 1,09±0,63, Senis: 0,90±0,59; P<0,05). Da mesma forma, variáveis de tamanho (A, P, L) e protaminação espermática, avaliado pela CMA3, obtiveram correlação negativa com a idade e positiva com a elipsidade (P<0,05). Espermatozoides com anormalidades na cromatina obtiveram maior área quando comparado àqueles sem alteração de cromatina (P<0,0001). Não houve diferença significativa na PIV quando sêmen com maior e menor parcela de alteração de cromatina foi ... / Abstract: The aim of this study was to evaluate chromatin condensation and sperm head morphometry of cryopreserved semen samples from Bos taurus indicus bulls of different ages and the influence of the degree of chromatin condensation on in vitro embryo production (IVP). A total of 40 animals kept in an Artificial Insemination Centre were divided into three groups: Young Group (1.8 to 2 years), Adult Group (3.5 to 7 years) and Senile Group (8 to 14.3 years). The ejaculates were frozen in accordance with established standards of the Artificial Insemination Centre. The thawed semen samples were evaluated with toluidine blue, which analyzes the chromatin condensation and sperm head morphometry simultaneosly, chromomicin A3 (CMA3) to analyze the protamination and in vitro embryo production to analyze the embryonic development. The toluidine blue was evaluated by optical microscopy and the CMA3 by flow cytometry. Semen analyses revealed that spermatozoa of young bulls had higher values of area (A), perimeter (P) and width (W) when compared to adults and senile (Young: A = 1848.5 ± 119.79, P = 10. 23 ± 0.29, W = 1.95 ± 0.1; Adults: A = 1672.9 ± 104.46, P = 9.86 ± 0.33, W = 1.81 ± 0.06; Senile: A = 1723.1 ± 124.41, P = 9.97 ± 0.33, W = 1.83 ± 0.09; P<0.0001) and had higher protamination deficiency when analyzed with CMA3 (Young: 1.57 ± 0.76, Adults: 1.09 ± 0.63, Senile: 0.90 ± 0.59, P<0.05). Variable size (A, P, W) and sperm protamination evaluated by CMA3 showed negative correlation with age and a positive with ellipticity (P<0.05). Spermatozoa with abnormal chromatin obtained larger area when compared to those with normal chromatin (P<0.0001). There was no significant difference in IVP using semen with higher and lower altered chromatin condensation, evidencing that the proportion of spermatozoa with abnormal chromatin (4 to 16.15%) did not affect the embryonic development. Our results indicate that sperm head of young bulls are ... / Mestre

Orientador: Lucia Galvão de Albuquerque / Coorientador: Renata Helena Branco / Coorientador: Ana Claudia Ruggieri / Banca: Juliana Duarte Messana / Banca: Maria Eugênia Zerlotti Mercadante / Banca: Alexandre Berndt / Banca: Roberta Canesin / Resumo: Este trabalho foi conduzido com o objetivo de desenvolver equações de predição da emissão metano entérico além de avaliar equações descritas na literatura quanto a sua acurácia, estimar a herdabilidade da emissão de metano e estabelecer relações entre esta emissão e eficiência alimentar de bovinos Nelore em crescimento sob condições de clima tropical. Quarenta e oito bovinos Nelore foram avaliados quanto ao consumo de matéria seca, consumo de nutrientes e emissão de metano e equações foram geradas com base nos dados de consumo e avaliadas pela raiz quadrada do quadrado médio do erro de predição (RQME) e por regressão residual. A partir dos dados de emissão de metano obtidos in vivo, foram validadas equações descritas na literatura, avaliadas de acordo com os mesmos critérios utilizados para as novas equações geradas. Para a estimativa da herdabilidade foram utilizados dados de consumo individual e peso corporal de 896 bovinos Nelore (541 machos e 355 fêmeas) com peso corporal inicial médio de 276 ± 53 kg, nascidos entre 2004 e 2012 (286 ± 39 dias de idade inicial) e avaliados quanto ao consumo alimentar residual (CAR). Uma equação gerada a partir do consumo de matéria seca dos 48 animais avaliados foi utilizada para estimar a emissão de metano dos demais 896 animais, sendo outras duas equações descritas por Ellis e colaboradores também utilizadas com a mesma finalidade. A herdabilidade da emissão de metano foi estimada para cada equação. Equações incluindo as variáveis consumo de matéria seca e consumo de hemicelulose, consumo de matéria seca e consumo de carboidratos totais, consumo de energia metabolizável e consumo de celulose e consumo de carboidratos não fibrosos apresentaram os menores valores de RQME, sendo consideradas as mais ajustadas para o conjunto de dados estudado. Cinco das 17 equações descritas na literatura puderam predizer a emissão de metano adequadamente apresentando ... / Abstract: This work was conducted with the objective of developing enteric methane (CH4) emission prediction equations and to evaluate equations described in the literature as to accuracy, estimate the heritability of methane emission and linking this issue and feed efficiency of Nellore in growth under tropical conditions. Forty-eight Nellore were evaluated for dry matter intake, nutrient intake and methane emission and equations were generated based on consumption data and evaluated by the square root of the mean square prediction error (RMSE) and residual regression. From the methane emission in vivo data, equations described in the literature were validated, assessed according to the same criteria used for the new generated equations. To estimate the heritability of individual consumption, data were used and body weight of 896 Nellore (541 males and 355 females) with an average initial body weight of 276±53 kg, born between 2004 and 2012 (286±39 days old) and assessed for residual feed intake (RFI). An equation generated from dry matter intake of 48 animals evaluated was used to estimate methane emissions from the other 896 animals, and two other equations described by Ellis et al also used for the same purpose. The heritability of methane emission was estimated for each equation. Equations including the variables dry matter intake and consumption of hemicellulose, dry matter intake and intake of total carbohydrates, metabolizable energy intake and consumption of pulp and consumption of non-fiber carbohydrates had the lowest RMSE values, are considered the most adjusted to the data set studied. Five of the 17 equations described in the literature could predict methane emissions properly to the lowest RMSE values among the evaluated equations. However, the equations developed in this study were more accurate in predicting the methane emission evaluating under the same parameter. The heritability estimate (h2) of CH4 showed high magnitude ... / Doutor

Orientador: Ricardo Andrade Reis / Banca: Gustavo Rezende Siqueira / Banca: Giovani Fiorentini / Banca: Renata Helena Branco Arnandes / Banca: Otávio Rodrigues Machado Neto / Resumo: O correto manejo do pastejo e o uso estratégico da suplementação são os principais caminhos quando se visa aumentar a produção animal e/ou o ganho de área no sistema a pasto. No entanto, dados divergentes sobre o correto manejo em forrageiras tropicais e o efeito da suplementação com soja diferente disponível no rúmen ainda são encontrados. Nesse sentido, três experimentos foram realizados para avaliar o efeito da suplementação de touros jovens da raça Nelore em pastagem de Brachiaria brizantha cv. Marandu manejado em diferentes alturas. No primeiro experimento os tratamentos consistiram de três alturas do dossel (15, 25 e 35 cm) do pasto e foram estudadas as características de forragem, consumo de matéria seca, digestibilidade, desempenho animal e ganho por área durante a estação chuvosa. Foram utilizados trinta e seis animais tourinhos Nelore. Aumentar a altura do dossel refletiu em aumento da massa de forragem, enquanto diminuiu a taxa de lotação. Não houve diferença na composição química de PB, FDN e concentração DIVMS entre os tratamentos. No segundo experimento, foi avaliado o efeito da suplementação (sal mineral; suplemento com gordura protegida; suplemento com soja grão) no desempenho e produção de metano de bovinos mantidos em pastos de Brachiaria brizantha cv. Marandu manejados a 25 cm. Animais suplementados apresentaram valores de consumo e digestibilidade superior para todos os nutrientes, exceto proteína quando comparado ao tratamento controle. No entanto, a suplementação não afetou a produção de CH4, expressos em g CH4 / dia. O aumento no ganho de peso vivo dos animais suplementados refletiu em diminuição na produção de CH4 / kg de produto e g CH4 / kg CMS. No terceiro experimento foi avaliado um fatorial 3x3 - três alturas do dossel (15, 25 e 35 cm) e três suplementos (sal mineral; suplemento com gordura protegida; suplemento com soja grão) no desempenho, consumo e ... / Abstract: Canopy height and supplementation is the mainly strategies to increase animal production or area gain in system on pasture. However, some reporter diverge about the correct management in tropical forages, furthermore, the effect of supplementation with soybean differently available in rumen in pasture still inconclusively. By this sense, two trials were conducted to evaluate the effect of supplementation for young Nellore bulls grazing Brachiaria brizantha cv. Marandu with different sward height on herbage characteristics, dry matter intake, digestibility, animal performance and gain per area during the rainy season. Hundred and eight animal young Nellore bulls were used. Treatments corresponded to three different canopy height (15, 25 and 35 cm) when years where analyzed and the combined with sward height and supplementation with mineral salt, supplement with soybean grain or supplement with protect fat. The level of supplementation was 0.5% of BW. Pastures were fertilizer according to local recommendations following soil analysis plus 135 and 90 kg of nitrogen by urea during first and second year, respectively. Increase the canopy height increased herbage mass whilst decreased stocking rate. There was no difference in hand-plucked herbage CP, NDF and IVDMD concentration among treatments. Supplemented animals had higher DM intake and digestibility values of all nutrients except protein when compared to the control treatment. However, the supplements did not affect the production of CH4 expressed as g CH4/day. The increase in liveweight gain using either supplement caused a decrease in the production CH4/ kg product and g CH4/kg DMI. Considering that relation between animal performance and stocking rate, marandu pastures should be not be grazed below 20-cm stubble or above 30-cm for greater productivity. By other hand, supplementation with lipid of low ruminal degradation can increase performance with higher effect of protect fat source ... / Doutor

Orientador: Henrique Nunes de Oliveira / Coorientador: Luis Artur Loyola Chardulo / Banca: Saulo da luz e Silva / Banca: Josineudson Augusto II de Vasconcelos Silva / Banca: Humberto Tonhati / Banca: Fernando Sebastian Baldi Rey / Resumo: A atuação das enzimas proteolíticas durante o post-mortem é um dos principais fatores que determinam a qualidade da carne, sendo as enzimas calpaína e calpastatina uma das principais atuantes neste processo. O objetivo deste estudo foi avaliar a relação entre a expressão gênica dos genes CAPN1, CAPN2 e CAST, a quantificação das enzimas µ-calpaína, m-calpaína e calpastatina, dentro de grupos contrastantes para maciez e crescimento animal. Foram utilizados dados de 90 animais machos não castrados da raça Nelore, com idade aproximada de 24 meses, permanecendo em confinamento por 95 dias. Após o abate foram colhidas amostras do músculo Longissimus thoracis entre a 9ª e 13ª costelas, da meia-carcaça esquerda. As amostras coletadas foram utilizadas para medir a área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea (EGS), índice de marmorização (IM), perdas por cozimento, coloração instrumental da carne e força de cisalhamento (FC). A partir do restante da carne, foram coletadas alíquotas para a realização das análises de índice de fragmentação miofibrilar (MFI) e lipídeos totais (LT). Foram coletadas alíquotas para a análise da expressão gênica e quantificação das enzimas. Os dados de força de cisalhamento foram utilizados como critério para a separação em carne macia e dura. Também foram utilizadas o ganho de peso para a separação quanto ao crescimento animal. Os seguintes grupos (n=10) foram formados: Leve, Pesado, Duro e Macio. As análises estatísticas foram realizadas ut... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The role of proteolytic enzymes during the post-mortem is one of the main factors that determine the quality of the meat, and the enzymes calpain and calpastatin are one of the main factors in this process. The aim of this study was to evaluate the gene expression of the genes CAPN1, CAPN2 and CAST, and quantify the enzymes μ-calpain, m-calpain and calpastatin within contrasting groups animal growth, and thougness. 90 animals data were used uncastrated male Nellore, aged approximately 24 months remaining in confinement for 95 days. After slaughter were harvested Longissimus muscle samples thoracis between the 9th and 13th ribs, the left half-carcase. The samples were used to measure the ribeye area (REA), subcutaneous fat thickness (SFT), marbling index (MI), cooking loss, instrumental color of the meat and shear force (SF). From the rest of the meat, aliquots were collected to perform the myofibrillar fragmentation index analysis (MFI) and total lipids (TL). Were collected aliquots for the analysis of gene expression and quantification of enzymes. The data of shear force were used as criteria for the separation of tender and tough meat. The characteristics of weight gain for the separation on the animal growth were also used. The following groups (n=10) were formed: lightweight, Heavy, tough meat and tender meat. Statistical analyzes were performed using the GLM and MIXED procedure of Statistical Analysis System program. In this study there was no difference in the expressio... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor