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Role of bone marrow stromal antigen 2 (BST-2) in viral pathogenesis and breast cancer progressionMahauad Fernandez, Wadie Daniel 01 May 2016 (has links)
Bone marrow stromal antigen 2 (BST-2/tetherin) is a type II transmembrane protein that plays various roles, including protective and detrimental roles in the host. Cellular responses to BST-2 expression or the lack thereof, may be cell type and context-dependent and may vary with time. When protective, BST-2 functions as an antiviral factor, renowned for its ability to tether budding enveloped viruses to the membrane of infected cells. Tethering of budding virions prevents their release into the extracellular milieu limiting infection of naïve cells. The antiviral role of BST-2 has been predominantly studied using cultured cells. Insight into the role of BST-2 in inhibition of viral infection in vivo came from our study of the alphavirus Chikungunya virus (CHIKV) and the retrovirus mouse mammary tumor virus, (MMTV). BST-2 prevents the release of CHIKV and MMTV virions from infected cells and limits the replication of both viruses in mice. In the context of CHIKV infection, BST-2 protects the host in a tissue-type dependent manner. In lymphoid and most non-lymphoid tissues, expression of BST-2 limits CHIKV replication. In addition, BST-2 regulates CHIKV-induced inflammatory responses in mice, an indication that BST-2 may function to initiate and amplify innate immune responses. Host response to MMTV infection depends on the stage of the infection and disease sequela. Acute infection of immune cells with MMTV results in an initial increase in BST-2 expression followed by a sharp decline. In contrast, in MMTV-induced mammary tumors, BST-2 mRNA and protein are elevated, so is the viral load. This is an indication that the antiviral role of BST-2 is not operative once mammary tumors have developed. These data provided the initial evidence that BST-2 may promote breast cancer progression. Indeed, data from two mouse models of breast cancer show that expression of BST-2 is necessary for cell to cell and cell to extracellular matrix interactions. Thus, BST-2 expression in breast cancer cells enhances cancer cell adhesion, anchorage-independency, migration, and invasion, culminating in increased tumor mass, increased metastases, and reduced host survival. Structurally, BST-2 homodimerization is important for its cancer-promoting role as dimers of BST-2 regulate anchorage-independency, resistance to anoikis, and enhanced adhesion between cancer cells and components (proteins and cells) of the tumor microenvironment. How BST-2 is enriched in breast cancer cells was elusive until our in silico analyses of a large human breast cancer dataset that revealed the involvement of epigenetic regulation of BST-2 in breast tumors. In highly aggressive breast cancers, specific CpG sites in and at close proximity to the BST-2 promoter are hypomethylated. This is in sharp contrast to non-aggressive luminal cancers and normal breast epithelial cells. These data suggest that a progressive loss of methylation on the BST-2 gene may contribute to constitutive overexpression of BST-2 in tumors. Overall, these findings show that 1) BST-2 contributes to the emergence and progression of breast malignancies and may be used as a therapeutic target or as a biomarker for aggressive breast cancers; and, 2) BST-2 acts as a viral sensor to initiate antiviral inflammatory responses and could be exploited therapeutically to treat viral infections. We highlight the need for additional research on the antiviral and cancer-promoting roles of BST-2 to reconcile both functions for the purpose of therapeutics.
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Novel Functions of IL-27 in Innate Immunity: Characterization of IL-27-induced Inflammatory Responses in Human Monocytes and Impact of HIV Infection on IL-27 Expression and FunctionGuzzo, Christina 12 April 2012 (has links)
Interleukins, cytokines secreted by leukocytes, are predominant messengers modulating immune responses. Interleukin-27 (IL-27), a key immunomodulatory cytokine, functions to induce both pro- and anti-inflammatory effects in various immune cells. IL-27 is a heterodimeric cytokine, composed of IL-27p28 and Epstein-Bar virus induced gene 3 (EBI3) subunits, and binds to a receptor composed of IL-27Rα (WSX-1) and gp130. Initial studies focused on describing IL-27 functions in skewing T helper cell development to a Th1 response, with few reports on functions in monocytes. Thus, in this thesis, I aimed to characterize novel functions of IL-27 in innate immune responses of monocytes. I initially established that IL-27 induced a pro-inflammatory cytokine profile (IL-6, IP-10, MIP-1α, MIP-1β, and TNF-α) mediated via STAT1/3 and NF-κB signaling pathways. Further investigation led to the discovery that IL-27 could enhance LPS responses via upregulation of TLR4 expression and NF-κB signaling. Together, these studies described novel signaling mechanisms (NF-κB and JAK/STAT crosstalk) and gene targets (cytokines and TLR4) of IL-27 that drive inflammatory responses. In continuing the quest for novel IL-27 functions in innate immunity, I reported IL-27 can upregulate expression of the IFN-responsive, antiviral protein called BST-2. My results showing IL-27-induced expression of BST-2 mRNA and cell surface protein were supported by previous studies reporting IL-27-induced expression of other antiviral molecules. Furthermore, previous studies showed IL-27 could inhibit HIV replication via antiviral gene induction, pointing to potential for IL-27 immunotherapies. In light of the posited role for IL-27 in therapeutics, it became inherently critical to describe how IL-27 functions in the setting of HIV infection. Thus, in my final thesis chapters, I described the effect of HIV infection on IL-27 expression and functions, addressing a substantial void in literature. Interestingly, a trend of decreased IL-27 expression and significant impairment of IL-27-induced gene expression was observed in HIV infection. Therefore, decreased circulating IL-27 and decreased IL-27 responsiveness may collectively dysregulate IL-27 function in HIV. This thesis describes novel, IL-27-driven, proinflammatory responses, and highlights impairment of IL-27 function in HIV infection. This work bridged a gap in knowledge of IL-27 functions in monocytes and highlighted multifaceted mechanisms underlying immunoregulation by IL-27. / Thesis (Ph.D, Microbiology & Immunology) -- Queen's University, 2012-04-12 13:07:50.588
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HIV-2 infection in human primary macrophages / Infection par le VIH-2 dans les macrophages primaires humainsGea-Mallorquí, Ester 08 December 2017 (has links)
Les macrophages sont une cible cellulaire importante du VIH-1 et sont impliqués dans la propagation virale et la constitution du réservoir. Les patients infectés par le VIH-2 présentent un contrôle naturel de l'infection qui est généralement absent chez les patients infectés par le VIH-1. Nous avons étudié ici la relation entre les macrophages et le VIH-2 afin d'évaluer leur contribution à la physiopathologie de l'infection. L'assemblage de particules virales dans des macrophages dérivés de monocytes (MDM) infectés par le VIH-2 se fait au niveau de la membrane de compartiments internes semblables aux VCC documentés dans les MDM infectés par le VIH-1. Les VCC des MDM infectés par le VIH-1 et le VIH-2 partagent la même composition protéique, et la même morphologie. Contrairement à Gag du VIH-1, la protéine Gag du VIH-2 est absente du cytosol et presque exclusivement localisée dans les VCC, ce qui suggère que Gag du VIH-2 est rapidement transportée vers le VCC une fois synthétisée dans le cytosol. Les particules de VIH-2 produites de novo par les MDM peuvent mûrir, mais sont faiblement infectieuses et se transmettent inefficacement aux cellules T activés. Cette faible infectiosité n'est pas associée avec l'expression du facteur de restriction BST-2 et n'est pas non plus améliorée par une baisse des niveaux d'expression de BST-2 induite par Vpu. Nos données suggèrent que les macrophages infectés par le VIH-2 ne contribuent probablement pas à la production et à la dissémination du virus in vivo. Cependant, les macrophages infectés par le VIH-2 peuvent représenter une source potentielle d'antigènes viraux qui pourraient stimuler les réponses des cellules T spécifiques du virus. / Macrophages are an important cellular target of HIV-1 and are potentially involved in viral spreading and constitution of the viral reservoir. HIV-2-infected patients exhibit a natural virological control of the infection that is generally absent from HIV-1-infected patients. Here, we studied the relationship between macrophages and HIV-2 to approach their potential contribution to the physiopathology of HIV-2 infection. Viral particles assembly in HIV-2-infected monocyte-derived macrophages (MDMs) occurred at the limiting membrane of internal compartments similar to virus-containing compartments (VCCs) documented in HIV-1-infected MDMs. Indeed, VCCs from HIV-1 and HIV-2-infected MDMs shared protein composition, as seen by confocal microcopy, and morphology, as seen by electron microscopy. Strikingly, HIV-2 Gag was mostly absent from the cytosol and almost exclusively localized to the VCCs, whereas HIV-1 Gag was distributed in both locations, suggesting that HIV-2 Gag is rapidly transported to the VCC membranes once synthesized in the cytosol. HIV-2 particles produced de novo by MDMs can mature, but are poorly infectious and inefficiently transmitted to activated T cells. This low infectivity neither correlate with expression of the restriction factor BST-2, nor was improved by Vpu-induced down-modulation of BST-2 levels. Our data suggest that, HIV-2-infected macrophages are unlikely to contribute to viral production and dissemination in vivo. However, HIV-2-infected macrophages accumulate large amounts of intracellular virus that may represent a potential source of viral antigens that could stimulate virus specific T cell responses.
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Variabilidad en genes de respuesta inmune : papel en la infección por VIH-1 y envejecimiento naturalLaplana Lafaja, Marina 17 July 2012 (has links)
La modulació inadequada o el manteniment de forma crònica de la resposta immune poden provocar efectes adversos a sistemes i òrgans i donar lloc a la manifestació de patologies. En aquest context, els mecanismes de regulació de la resposta immune són un element clau per mantenir un estat òptim de salut i un envelliment saludable. La capacitat d'organitzar una resposta immune contra agents patògens o cèl·lules tumorals està en part determinada pel fons genètic de cada individu. Els estudis d'associació genètica han resultat d'utilitat per identificar variants de gens de resposta immune implicades en patologies que van des del càncer o les malalties cardiovasculars a infeccions com la tuberculosi o el VIH-‐1. En la present tesi s'ha estudiat la variabilitat de gens de resposta immune i el seu paper en dos models diferents: la infecció per VIH-‐1 i el procés d'envelliment natural. En el primer model s'ha estudiat la variabilitat del gen BST-‐2, factor de restricció en la infecció per VIH-‐1, i dels gens CYP27B1, GC i VDR, implicats en la síntesi, transport i acció genòmica de la vitamina D, hormona implicada en la modulació de la resposta immune. Així mateix, al segon model s'ha avaluat l'efecte de la variabilitat del gen VDR i dels gens RANTES i CCR5, implicats en la mediació de la resposta inflamatòria. En el model d'infecció per VIH-‐1 s'han identificat 2 variants del gen BST-‐2 associades amb progressió, una captura la variabilitat de la regió genòmica i l’altra amb potencial efecte funcional. En l'estudi de la relació de variants dels gens VDR, CYP27B1 i GC amb el ritme de progressió de la infecció s'han confirmat i ampliat el nombre de marcadors del gen VDR que mostren associació amb progressió. Les combinacions haplotípiques del gen VDR que s'associen amb progressió són aquelles que optimitzen la resposta a la vitamina D. Aquests resultats poden interpretar-‐se en funció del paper dual de la vitamina D en la modulació de la resposta immune. L'associació amb progressió de les variants identificades és més significativa en els pacients reclutats en el període pre-‐ TARGA (anterior a 1997). En el model d'envelliment natural, variants del gen VDR mostren associació amb envelliment saludable en homes. Les variants associades són aquelles que confereixen una capacitat de resposta intermèdia a la vitamina D. Això emfatitza el paper de la vitamina D en envelliment i posa de manifest la importància del fons genètic a l’hora d’establir els nivells òptims de vitamina D per a un envelliment saludable. En relació als polimorfismes dels gens CCR5 i RANTES no s'ha trobat associació significativa pel locus CCR5, encara que els resultats mostren una major prevalença de la variant no funcional, i per tant pitjor mediadora de la resposta inflamatòria, en individus longeus. Quant a les variants del gen RANTES, els resultats indiquen una associació específica de sexe que suggereix l'existència d'un determinant genètic de RANTES que predisposa a un fenotip proinflamatori en homes i a un fenotip antiinflamatori en dones / La modulación inadecuada o el mantenimiento de forma crónica de la respuesta inmune puede provocar efectos adversos en sistemas y órganos y dar lugar a la manifestación de patologías. Por ello, los mecanismos de regulación de la respuesta inmune son un elemento clave para el mantenimiento de un estado de salud óptimo y un envejecimiento saludable. La capacidad de organizar una respuesta inmune contra agentes patógenos o células tumorales está en parte determinada por la fondo genético de cada individuo. Los estudios de asociación genética han resultado de utilidad para identificar variantes de genes de respuesta inmune implicadas en patologías que van desde el cáncer o las enfermedades cardiovasculares a infecciones como la tuberculosis o el VIH-‐1. En la presente tesis se ha estudiado la variabilidad de genes de respuesta inmune y su papel en dos modelos distintos: la infección por VIH-‐1 y el proceso de envejecimiento natural. En el primer modelo se ha estudiado la variabilidad del gen BST-‐2, factor de restricción en la infección por VIH-‐1, y de los genes CYP27B1, GC y VDR, implicados en la síntesis, transporte y acción genómica de la vitamina D, hormona implicada en la modulación de la respuesta inmune. Asimismo, en el segundo modelo, se ha evaluado el efecto de la variabilidad del gen VDR y de los genes RANTES y CCR5, implicados en la mediación de la respuesta inflamatoria. En el modelo de infección por VIH-‐1, se han identificado 2 variantes del gen BST-‐ 2 asociadas con progresión, una que captura la variabilidad de la región genómica y otra con potencial efecto funcional. En el estudio de variantes de los genes VDR, CYP27B1 y GC con el ritmo de progresión de la infección se ha confirmado y ampliado el número de marcadores del gen VDR que muestran asociación con progresión. Las combinaciones haplotípicas del gen VDR que se asocian con progresión son aquellas que optimizan la respuesta a la vitamina D. Estos resultados pueden interpretarse en función del papel dual de la vitamina D en la modulación de la respuesta inmune. La asociación con progresión de las variantes identificadas incrementa su significación en los pacientes reclutados en el periodo pre-‐TARGA (anterior a 1997). En el modelo de envejecimiento natural, variantes del gen VDR muestran asociación con envejecimiento saludable en hombres. Las variantes asociadas son aquellas que confieren una capacidad de respuesta intermedia a la vitamina D. Ello revela el papel de la vitamina D en envejecimiento y enfatiza la importancia del fondo genético al establecer los niveles óptimos de vitamina D para un envejecimiento saludable. En relación a los polimorfismos de los genes CCR5 y RANTES no se ha encontrado asociación significativa para el locus CCR5, aunque los resultados muestran una mayor prevalencia de la variante no funcional, y por lo tanto peor mediadora de la respuesta inflamatoria, en individuos longevos. En cuanto a las variantes del gen RANTES, los resultados indican una asociación específica de sexo que sugiere la existencia de un determinante genético de RANTES que predispone a un fenotipo proinflamatorio en los varones y a un fenotipo anti-‐inflamatorio en las mujeres. / The improper balance or the maintenance of a chronic immune response can produce adverse effects on organs and systems and prone to diseases. Therefore, the regulatory mechanisms of the immune response are key factors to maintain an optimal health status and to follow a healthy aging. The capacity to produce an immune response against pathogens or tumour cells is partially determined by the genetic background of the individual. Genetic association studies have been useful to identify variants of immune response genes involved in diseases ranging from cancer or cardiovascular disease to infections such as tuberculosis or HIV-‐1. In this thesis we have studied the variability of immune response genes and their role in two models: the HIV-‐1 infection and the natural aging process. In the first model it has been studied the variability of BST-‐2 gene, which is an HIV restriction factor, and CYP27B1, GC and VDR genes, that are involved in the synthesis, transport and genomic action of vitamin D, hormone that modulates the immune response. In the second model, we have also evaluated the effect of VDR gene variability as well as RANTES and CCR5 gene variants, both involved in mediating the inflammatory response. In the model of the HIV-‐1 infection we have identified two variants of BST-‐2 gene associated with progression, one that captures the variability of the genomic region and the other with potential functional effect. In the study of VDR, CYP27B1 and GC gene variants related to progression rates we have confirmed and extended the number of VDR gene markers showing association with progression. The VDR gene haplotype combinations that are associated with progression are those that optimize the response to vitamin D. These results should be interpreted as a con to the dual role of vitamin D in the modulation of the immune response. The association with progression of the identified variants is significantly increased in patients enrolled in the pre-‐HAART (before 1997). In the model of aging, VDR gene variants were most associated with healthy aging in men. The associated variants are those that confer an intermediate responsiveness to vitamin D. This reveals the role of vitamin D in aging and emphasizes the role of genetic background in determining optimal levels of vitamin D for healthy aging. In relation to polymorphisms of CCR5 and RANTES genes we do not found significant association for the CCR5 locus, although the results show a higher prevalence of non-‐functional variant, and thus a poorer mediator of the inflammatory response, in long-‐lived individuals. In relation to RANTES gene variants, the results indicate a sex-‐specific association suggesting the existence of a genetic determinant of RANTES that predisposes to a proinflammatory phenotype in males and an anti-‐inflammatory phenotype in females.
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Variavilidad en genes de respuesta inmune : papel en la infección por VIH-1 y envejecimiento naturalLaplana Lafaja, Marina 17 July 2012 (has links)
La modulació inadequada o el manteniment de forma crònica
de
la
resposta
immune
poden
provocar
efectes
adversos
a
sistemes
i
òrgans
i
donar
lloc
a
la
manifestació
de
patologies.
En
aquest
context,
els
mecanismes
de
regulació
de
la
resposta
immune
són
un
element
clau
per
mantenir
un
estat
òptim
de
salut
i
un
envelliment
saludable.
La
capacitat
d'organitzar
una
resposta
immune
contra
agents
patògens
o
cèl·lules
tumorals
està
en
part
determinada
pel
fons
genètic
de
cada
individu.
Els
estudis
d'associació
genètica
han
resultat
d'utilitat
per
identificar
variants
de
gens
de
resposta
immune
implicades
en
patologies
que
van
des
del
càncer
o
les
malalties
cardiovasculars
a
infeccions
com
la
tuberculosi
o el
VIH-‐1.
En
la
present
tesi
s'ha
estudiat
la
variabilitat
de
gens
de
resposta
immune
i
el
seu
paper
en
dos
models
diferents:
la
infecció
per
VIH-‐1
i
el
procés
d'envelliment
natural.
En
el
primer
model
s'ha
estudiat
la
variabilitat
del
gen
BST-‐2,
factor
de
restricció
en
la
infecció
per
VIH-‐1,
i
dels
gens
CYP27B1,
GC
i
VDR,
implicats
en
la
síntesi,
transport
i
acció
genòmica
de
la
vitamina
D,
hormona
implicada
en
la
modulació
de
la
resposta
immune.
Així
mateix,
al
segon
model
s'ha
avaluat
l'efecte
de
la
variabilitat
del
gen
VDR
i
dels
gens
RANTES
i
CCR5,
implicats
en
la
mediació
de
la
resposta
inflamatòria.
En
el
model
d'infecció
per
VIH-‐1
s'han
identificat
2
variants
del
gen
BST-‐2
associades
amb
progressió,
una
captura
la
variabilitat
de
la
regió
genòmica
i
l’altra
amb
potencial
efecte
funcional.
En
l'estudi
de
la
relació
de
variants
dels
gens
VDR,
CYP27B1
i
GC
amb
el
ritme
de
progressió
de
la
infecció
s'han
confirmat
i
ampliat
el
nombre
de
marcadors
del
gen
VDR
que
mostren
associació
amb
progressió.
Les
combinacions
haplotípiques
del
gen
VDR
que
s'associen
amb
progressió
són
aquelles
que
optimitzen
la
resposta
a
la
vitamina
D.
Aquests
resultats
poden
interpretar-‐se
en
funció
del
paper
dual
de
la
vitamina
D
en
la
modulació
de
la
resposta
immune.
L'associació
amb
progressió
de
les
variants
identificades
és
més
significativa
en
els
pacients
reclutats
en
el
període
pre-‐
TARGA
(anterior
a
1997).
En
el
model
d'envelliment
natural,
variants
del
gen
VDR
mostren
associació
amb
envelliment
saludable
en
homes.
Les
variants
associades
són
aquelles
que
confereixen
una
capacitat
de
resposta
intermèdia
a
la
vitamina
D.
Això
emfatitza
el
paper
de
la
vitamina
D
en
envelliment
i
posa
de
manifest
la
importància
del
fons
genètic
a
l’hora
d’establir
els
nivells
òptims
de
vitamina
D
per
a
un
envelliment
saludable.
En
relació
als
polimorfismes
dels
gens
CCR5
i
RANTES
no
s'ha
trobat
associació
significativa
pel
locus
CCR5,
encara
que
els
resultats
mostren
una
major
prevalença
de
la
variant
no
funcional,
i
per
tant
pitjor
mediadora
de
la
resposta
inflamatòria,
en
individus
longeus.
Quant
a
les
variants
del
gen
RANTES,
els
resultats
indiquen
una
associació
específica
de
sexe
que
suggereix
l'existència
d'un
determinant
genètic
de
RANTES
que
predisposa
a
un
fenotip
proinflamatori
en
homes
i
a
un
fenotip
antiinflamatori
en
dones. / La
modulación
inadecuada
o
el
mantenimiento
de
forma
crónica
de
la
respuesta
inmune
puede
provocar
efectos
adversos
en
sistemas
y
órganos
y
dar
lugar
a
la
manifestación
de
patologías.
Por
ello,
los
mecanismos
de
regulación
de
la
respuesta
inmune
son
un
elemento
clave
para
el
mantenimiento
de
un
estado
de
salud
óptimo
y
un
envejecimiento
saludable.
La
capacidad
de
organizar
una
respuesta
inmune
contra
agentes
patógenos
o
células
tumorales
está
en
parte
determinada
por
la
fondo
genético
de
cada
individuo.
Los
estudios
de
asociación
genética
han
resultado
de
utilidad
para
identificar
variantes
de
genes
de
respuesta
inmune
implicadas
en
patologías
que
van
desde
el
cáncer
o
las
enfermedades
cardiovasculares
a
infecciones
como
la
tuberculosis
o
el
VIH-‐1.
En
la
presente
tesis
se
ha
estudiado
la
variabilidad
de
genes
de
respuesta
inmune
y
su
papel
en
dos
modelos
distintos:
la
infección
por
VIH-‐1
y
el
proceso
de
envejecimiento
natural.
En
el
primer
modelo
se
ha
estudiado
la
variabilidad
del
gen
BST-‐2,
factor
de
restricción
en
la
infección
por
VIH-‐1,
y
de
los
genes
CYP27B1,
GC
y
VDR,
implicados
en
la
síntesis,
transporte
y
acción
genómica
de
la
vitamina
D,
hormona
implicada
en
la
modulación
de
la
respuesta
inmune.
Asimismo,
en
el
segundo
modelo,
se
ha
evaluado
el
efecto
de
la
variabilidad
del
gen
VDR
y
de
los
genes
RANTES
y
CCR5,
implicados
en
la
mediación
de
la
respuesta
inflamatoria.
En
el
modelo
de
infección
por
VIH-‐1,
se
han
identificado
2
variantes
del
gen
BST-‐
2
asociadas
con
progresión,
una
que
captura
la
variabilidad
de
la
región
genómica
y
otra
con
potencial
efecto
funcional.
En
el
estudio
de
variantes
de
los
genes
VDR,
CYP27B1
y
GC
con
el
ritmo
de
progresión
de
la
infección
se
ha
confirmado
y
ampliado
el
número
de
marcadores
del
gen
VDR
que
muestran
asociación
con
progresión.
Las
combinaciones
haplotípicas
del
gen
VDR
que
se
asocian
con
progresión
son
aquellas
que
optimizan
la
respuesta
a
la
vitamina
D.
Estos
resultados
pueden
interpretarse
en
función
del
papel
dual
de
la
vitamina
D
en
la
modulación
de
la
respuesta
inmune.
La
asociación
con
progresión
de
las
variantes
identificadas
incrementa
su
significación
en
los
pacientes
reclutados
en
el
periodo
pre-‐TARGA
(anterior
a
1997).
En
el
modelo
de
envejecimiento
natural,
variantes
del
gen
VDR
muestran
asociación
con
envejecimiento
saludable
en
hombres.
Las
variantes
asociadas
son
aquellas
que
confieren
una
capacidad
de
respuesta
intermedia
a
la
vitamina
D.
Ello
revela
el
papel
de
la
vitamina
D
en
envejecimiento
y
enfatiza
la
importancia
del
fondo
genético
al
establecer
los
niveles
óptimos
de
vitamina
D
para
un
envejecimiento
saludable.
En
relación
a
los
polimorfismos
de
los
genes
CCR5
y
RANTES
no
se
ha
encontrado
asociación
significativa
para
el
locus
CCR5,
aunque
los
resultados
muestran
una
mayor
prevalencia
de
la
variante
no
funcional,
y
por
lo
tanto
peor
mediadora
de
la
respuesta
inflamatoria,
en
individuos
longevos.
En
cuanto
a
las
variantes
del
gen
RANTES,
los
resultados
indican
una
asociación
específica
de
sexo
que
sugiere
la
existencia
de
un
determinante
genético
de
RANTES
que
predispone
a
un
fenotipo
proinflamatorio
en
los
varones
y
a
un
fenotipo
anti-‐inflamatorio
en
las
mujeres. / The
improper
balance
or
the
maintenance
of
a
chronic
immune
response
can
produce
adverse
effects
on
organs
and
systems
and
prone
to
diseases.
Therefore,
the
regulatory
mechanisms
of
the
immune
response
are
key
factors
to
maintain
an
optimal
health
status
and
to
follow
a
healthy
aging.
The
capacity
to
produce
an
immune
response
against
pathogens
or
tumour
cells
is
partially
determined
by
the
genetic
background
of
the
individual.
Genetic
association
studies
have
been
useful
to
identify
variants
of
immune
response
genes
involved
in
diseases
ranging
from
cancer
or
cardiovascular
disease
to
infections
such
as
tuberculosis
or
HIV-‐1.
In
this
thesis
we
have
studied
the
variability
of
immune
response
genes
and
their
role
in
two
models:
the
HIV-‐1
infection
and
the
natural
aging
process.
In
the
first
model
it
has
been
studied
the
variability
of
BST-‐2
gene,
which
is
an
HIV
restriction
factor,
and
CYP27B1,
GC
and
VDR
genes,
that
are
involved
in
the
synthesis,
transport
and
genomic
action
of
vitamin
D,
hormone
that
modulates
the
immune
response.
In
the
second
model,
we
have
also
evaluated
the
effect
of
VDR
gene
variability
as
well
as
RANTES
and
CCR5
gene
variants,
both
involved
in
mediating
the
inflammatory
response.
In
the
model
of
the
HIV-‐1
infection
we
have
identified
two
variants
of
BST-‐2
gene
associated
with
progression,
one
that
captures
the
variability
of
the
genomic
region
and
the
other
with
potential
functional
effect.
In
the
study
of
VDR,
CYP27B1
and
GC
gene
variants
related
to
progression
rates
we
have
confirmed
and
extended
the
number
of
VDR
gene
markers
showing
association
with
progression.
The
VDR
gene
haplotype
combinations
that
are
associated
with
progression
are
those
that
optimize
the
response
to
vitamin
D.
These
results
should
be
interpreted
as
a
con
to
the
dual
role
of
vitamin
D
in
the
modulation
of
the
immune
response.
The
association
with
progression
of
the
identified
variants
is
significantly
increased
in
patients
enrolled
in
the
pre-‐HAART
(before
1997).
In
the
model
of
aging,
VDR
gene
variants
were
most
associated
with
healthy
aging
in
men.
The
associated
variants
are
those
that
confer
an
intermediate
responsiveness
to
vitamin
D.
This
reveals
the
role
of
vitamin
D
in
aging
and
emphasizes
the
role
of
genetic
background
in
determining
optimal
levels
of
vitamin
D
for
healthy
aging.
In
relation
to
polymorphisms
of
CCR5
and
RANTES
genes
we
do
not
found
significant
association
for
the
CCR5
locus,
although
the
results
show
a
higher
prevalence
of
non-‐functional
variant,
and
thus
a
poorer
mediator
of
the
inflammatory
response,
in
long-‐lived
individuals.
In
relation
to
RANTES
gene
variants,
the
results
indicate
a
sex-‐specific
association
suggesting
the
existence
of
a
genetic
determinant
of
RANTES
that
predisposes
to
a
proinflammatory
phenotype
in
males
and
an
anti-‐inflammatory
phenotype
in
females.
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Étude du rôle de la conformation des glycoprotéines de l'enveloppe du VIH-1 dans la réponse cytotoxique cellulaire dépendante des anticorpsPrévost, Jérémie 06 1900 (has links)
En l'absence d'un vaccin efficace et avec des thérapies antirétrovirales incapables d'éradiquer le virus, le VIH-1 reste un problème de santé publique mondial. Des immunothérapies à base d'anticorps sont à l'étude pour éliminer les réservoirs cellulaires, qui représentent un obstacle incontournable à la guérison du VIH-1. Les glycoprotéines d'enveloppe du VIH-1 (Env) représentent le seul antigène du virus exposé à la surface des cellules infectées et constituent donc la principale cible des anticorps. L’Env non-liée adopte sa conformation « fermée », reconnue préférentiellement par les anticorps neutralisants. L'interaction avec CD4 fait passer Env dans sa conformation « ouverte », exposant des épitopes conservés reconnus par les anticorps non-neutralisants (nnAbs) présents dans le sérum d’individus infectés par le VIH-1 (sérums VIH+). Les nnAbs peuvent éliminer les cellules infectées par la cytotoxicité cellulaire dépendante des anticorps (ADCC). Cependant, les protéines accessoires Nef et Vpu diminuent l’expression de surface de CD4 et BST-2 afin d’évader à la reconnaissance et l'élimination des cellules infectées par les nnAbs. Dans cette thèse, nous caractérisons en détail la contribution d’Env, Nef et Vpu pour échapper aux réponses humorales et explorons de nouvelles stratégies pour sensibiliser les cellules infectées à l’ADCC.
Pour quantifier plus adéquatement la réponse ADCC, nous avons identifié des biais dans les tests largement utilisés, notamment pour évaluer les corrélats de protection vaccinale. Il s'agit de l'incapacité à faire la distinction entre l'élimination des cellules infectées et des cellules non-infectées, et l'utilisation de constructions virales comportant un gène rapporteur empêchant l’expression de Nef. En utilisant un nouveau marquage intracellulaire, nous avons confirmé l’effet protecteur de Nef et Vpu contre l’ADCC.
Ensuite, nous avons étudié les déterminants d’Env et Vpu modulant la susceptibilité des cellules infectées à l’ADCC médiée par les nnAbs. Certaines caractéristiques structurelles d'Env modulent ses transitions conformationnelles, incluant le domaine d'association du trimère, le site de clivage de la furine et la cavité Phe43. L’altération de ces composantes augmente la sensibilité des cellules infectées à l'ADCC par les sérums VIH+. Outre l’inhibition de CD4 et BST-2, Vpu cible également NTB-A et PVR, des ligands de récepteurs activateurs des cellules NK. Cependant, la polyfonctionnalité de Vpu est compromise par l’augmentation de BST-2 par les interférons de type I (IFN-I), sensibilisant ainsi les cellules infectées aux réponses NK. En utilisant un modèle de souris humanisée, nous validons l'importance de Vpu pour échapper à la pression immunitaire des nnAbs in vivo.
Enfin, nous avons exploré de nouvelles stratégies pour sensibiliser les cellules infectées à l'ADCC en modulant la conformation d’Env avec des mimétiques moléculaires de CD4 (CD4mc). Nous avons identifié des résidus bordant la cavité Phe43 modulant la sensibilité au CD4mc. L’accumulation d’Env induite par les IFN-I augmente la capacité du CD4mc à sensibiliser les cellules infectées à l'ADCC par les sérums VIH+.
Globalement, cette thèse dévoile une caractérisation approfondie des déterminants viraux et cellulaires modulant la susceptibilité des cellules infectées par le VIH-1 aux réponses humorales. Une meilleure compréhension de ces mécanismes est nécessaire pour développer des nouvelles stratégies capables d’éradiquer les réservoirs viraux. / In the absence of an effective vaccine and with antiretroviral therapies unable to eradicate the virus, HIV-1 remains a global public health problem. Antibody-based immunotherapies are currently being investigated to eliminate cellular reservoirs, which represent a major obstacle towards an HIV-1 cure. HIV-1 envelope glycoproteins (Env) represent the only virus-specific antigen exposed at the surface of infected cells and therefore is the main target for antibodies. In its unliganded form, Env samples a ‘closed’ conformation, preferentially recognized by neutralizing antibodies. Interaction with CD4 drives Env into its ‘open’ conformation, exposing conserved epitopes recognized by non-neutralizing antibodies (nnAbs) present in sera from HIV-1 infected individuals (HIV+ sera). NnAbs can eliminate infected cells by antibody-dependent cellular cytotoxicity (ADCC). However, HIV-1 encodes for the accessory proteins Nef and Vpu which decrease cell surface levels of CD4 and BST-2, thus avoiding recognition and elimination of infected cells by nnAbs. In this thesis, we characterize in detail the contribution of Env, Nef, and Vpu to evade humoral responses and explore new strategies for sensitizing infected cells to ADCC. In an effort to develop a more adequate quantification of ADCC responses, we identified major biases in widely used assays, including the ones used to assess correlates of vaccine protection. These include the inability to distinguish between the elimination of infected and uninfected cells and the use of viral constructs coding for a reporter gene that prevents Nef expression. Using a novel intracellular staining, we confirmed the protective effect of Nef and Vpu against ADCC responses. Next, we studied the different Env and Vpu determinants modulating the susceptibility of infected cells to nnAbs-mediated ADCC responses. Certain Env structural features modulate its conformational transitions, including the trimer association domain, the furin cleavage site and the Phe43 cavity. Alterations of these components increase the susceptibility of HIV-1-infected cells to ADCC mediated by HIV+ sera. In addition to inhibiting CD4 and BST-2, Vpu also targets NTB-A and PVR, which act as ligands for NK cell activating receptors. However, we found that the polyfunctionality of Vpu can be compromised by the upregulation of BST-2 by type I interferons (IFN-I), thereby sensitizing infected cells to NK cell responses. Using a humanized mouse model, we validate the importance of Vpu to escape the immune pressure of nnAbs in vivo. Finally, we explored new strategies to bypass the protective effect of Vpu and Nef and sensitize HIV-1-infected cells to ADCC by modulating Env conformation using small CD4-mimetic compounds (CD4mc). We identified a network of residue lining the Phe43 cavity that modulates Env sensitivity to CD4mc. The enhanced surface expression of Env by type I IFNs boosts the ability of CD4mc to sensitize HIV-1-infected cells to ADCC by HIV+ sera. Overall, this thesis sheds light on a thorough characterization of viral and cellular determinants modulating the susceptibility of HIV-1-infected cells to humoral responses. A better understanding of these mechanisms is needed to develop new strategies able to eradicate viral reservoirs.
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