Foram isoladas 169 colônias de bactérias endofíticas de folhas de diferentes genótipos de plantas de milho sadias, pertencentes às populações BR-105, BR-106 e população de híbridos simples entre essas, em duas localidades e coletas distintas. Trinta isolados foram identificados por não de testes morfológicos e bioquímicos clássicos, definindo-se a ocorrência e porcentagem relativa dos gêneros: Bacillus (55%), Corynebacterium (15%), Micrococcus (12%), Listeria (9%), Pseudomonas (6%) e Erwinia (3%). A técnica de RAPD foi aplicada a treze isolados do gênero Bacillus, o mais ocorrente, para medir o grau de similaridade genética entre esses e linhagens de referência, não endofíticas de Bacillus megaterium e Bacillus subtilis, e relacionar a origem dos isolados com o local de coleta e número da coleta. A análise de RAPD permitiu a diferenciação de quatro grupos entre Bacillus sp. endofíticos e as linhagens de referência, com aproximadamente de 32% de similaridade entre si. Revelou-se grande variabilidade dentro do grupo, havendo relação dentro de dois grupos com o local de coleta e o número de coleta. Foi realizado um ensaio in vitro de antagonismo fungo-bactéria endofítica, entre dez isolados de bactérias, sendo os principais gêneros testados, Bacillus e Micrococcus e os fungos endofíticos Penicillium purpurogenum, P. spinulosum e Fusarium moniliforme, todos isolados de milho, e duas linhagens produtoras de antibióticos não endofíticas de P. chrysogenum IFO-4626 e IZ1671. Este ensaio revelou não haver inibição do crescimento das bactérias pelos fungos endofíticos. Entretanto dois isolados endofíticos foram inibidos pelas linhagens de P. chrysogenum, indicando um tipo de associação diferente da que ocorreu entre os endofíticos, caracterizada por uma antibiose / Endophytic bacteria were isolated in healthy maize leaves from different genotypes of BR-105 and BR-106 populations and from their simple hybrids population. Isolation was performed on two experimental areas by two distinct harvests. The total number of isolated bacteria colonies was 169. Thirty isolates were identified by classic morphologic and biochemical tests, and defined the genus occurence and relative percentage: Bacillus (55%), Corynebacterium (15%), Micrococcus (12%), Listeria (9%), Pseudomonas (6%) and Erwinia (3%). RAPD technique was performed to measure the genetic similarities among the thirteen main occurring Bacillus endophytes, and the reference strains not endophytes Bacillus megaterium and Bacillus subtilis, also relating the endophyte origins with the harvest area and harvest number. RAPD analysis allowed to differentiate four groups among Bacillus endophytes and Bacillus reference strains, presenting nearly 32% of similarity themselves. High variability was detected within the group, being detected within two groups relationships with harvest area and harvest number. It was performed an in vitro endophyte bacteria- fungi antagonism assay, with ten bacteria isolates, being the major genus assayed Bacillus and Micrococcus, and the endophytes Penicillium purpurogenum, P. spinulosum and Fusarium moniliforme, all of them isolated from maize, and two antibiotic producers, not endophytes, P. chrysogenum IF04626 and IZ1671. Such assay has shown that endophytic fungi was not able to inhibit endophytic bacteria growth. Althoug, two endophytes were inhibited by antibiotic producers lineages P. chrysogenum, indicating a different kind of association from that occuring among endophytes, characterized by antibiosis

Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-06-12T12:02:35Z No. of bitstreams: 1 resumo.pdf: 14000 bytes, checksum: ebd4fe85d7e24a2a3f9b533f85bb2296 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-12T12:02:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 resumo.pdf: 14000 bytes, checksum: ebd4fe85d7e24a2a3f9b533f85bb2296 (MD5) Previous issue date: 2001-07-15 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Os protocolos de esterilização superficial e de isolamento de bactérias endofíticas foram estabelecidos para frutos e caules de café arábica. Um isolado bacteriano produtor de pectina liase extracelular foi fisiologicamente e fenotipicamente caracterizado. A incidência de microbiota epifítica e endofítica foi constatada em amostras de frutos de café arábica oriundas de diferentes localidades. Bactérias, leveduras e fungos filamentosos foram isolados, sendo em Viçosa 1.042 isolados epifíticos e 282 potencialmente endofíticos, em Serra do Salitre 71 isolados epifíticos e 28 potencialmente endofíticos e em Patrocínio 85 isolados epifíticos e 33 potencialmente endofíticos. As bactérias foram isoladas em maior número, sendo que os bastonetes predominaram sobre os cocos e, dentre os bastonetes, as bactérias Gram negativas. A colonização de explantes de Coffea arabica L. por bactérias endofíticas foi demonstrada in situ pela técnica de imunofluorescência e comprovada pela recuperação das bactérias após sua reintrodução. Cinco isolados de bactérias endofíticas promoveram o crescimento de explantes de Coffea arabica e Coffea canephora, indicando que a sua interação não é espécie-específica. / Endophytic bacteria isolation and superficial sterilization protocols were established for fruit and stem of Arabica coffee. An extracellular pectin lyase producing bacterium was physiologically and phenotypically characterized. The epiphytic and endophytic microbiota was detected from different coffee fruits samples: 1.042 epiphytic and 282 potentially endophytic isolates from Viçosa, 71 epiphytic and 28 potentially endophytic isolates from Serra do Salitre, and 85 epiphytic and 33 potentially endophytic isolates from Patrocínio. The number of bacteria isolates was higher than yeasts or molds, and Gram negative rods were predominant. The endophytic colonization of Coffea arabica L. seedlings was observed in situ by inmunofluorescence technique and the bacteria were recovered upon seedling reintroduction. Five endophytic bacteria isolates showed plant growth-promotion in both Coffea arabica and Coffea canephora, indicating a non species-specific interaction.

No interior das plantas, existem bactérias e fungos que vivem em colonização assintomática, sendo denominados microrganismos endofíticos. Esses microrganismos podem ser utilizados no controle de fitonematóides. No presente trabalho, isolaram-se, pelo método de fragmentos do tecido vegetal, 161 bactérias endofíticas do sistema radicular de cafeeiros em três regiões do estado de São Paulo. Após análise morfológica das colônias isoladas, foram selecionadas 54 bactérias para serem avaliadas quanto ao potencial de controle biológico de fitonematóides, por meio de testes in vitro em que se verificou seu efeito sobre a mortalidade de juvenis de Meloidogyne incógnita. Dos isolados testados, vinte e três (TR1Ig, TR5IIId, TR9IIIc, TRlIId, TR3IIb, TR1IIe, TRlId, TR5Ia2, TR5Id, TR4IIa, TR7IIb, TR8IIc, TR8IIId, TR3a, TR7IIIa, TR7IIIb, TR8IIIb, TR8IIIa, TR9IE, TR9IIIE, TR9IIIb3, TRIOlb, TR9IIc) provocaram maior porcentagem de morte dos nematóides, quando comparado com a testemunha sem bactéria. Portanto, os isolados de bactérias endofíticas testados demonstraram potencial para controle biológico do nematóide. / not available

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-08-24T15:34:59Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Aryana P. Nascimento.pdf: 2567352 bytes, checksum: 9063d58d52a3f2ea23c51851087c23ef (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-08-24T15:35:15Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Aryana P. Nascimento.pdf: 2567352 bytes, checksum: 9063d58d52a3f2ea23c51851087c23ef (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-24T15:35:15Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Aryana P. Nascimento.pdf: 2567352 bytes, checksum: 9063d58d52a3f2ea23c51851087c23ef (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-02-10 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / In the search for sustainable alternatives of disease management, biocontrol agents as well as their antagonistic relations, appear as important source for the applied biological control. In this context, the use of endophytic microorganisms for biological control purposes has been extensively studied. They mainly comprise fungi and bacteria that inhabit the interior of plants without apparently causing damage to their hosts. Their ability to biocontrol can come from several mechanisms, such as the production of deleterious substances to phytopathogens or competing for space and nutrients. Indirectly, inducing systemic resistance in the host or by the production of growth promoting substances. In this sense, this work aimed at the isolation, biochemical and molecular characterization and the search for endophytic bacteria that act to reduce diseases such as anthracnose or are associated with the promotion of plant growth, reducing production costs and the environmental impact caused by the inputs Chemicals. A total of 416 bacterial isolates were obtained from H. sucuuba, representing 73.08% of the leaf, 10.10% of the petiole and 16.82% of the peel. From the total of 308 bacteria analyzed, 48.78% fixed atmospheric nitrogen, 83.77% were able to produce AIA and 96.42% solubilized inorganic phosphate. As for the in vitro antagonistic assay, 219 bacteria were selected by mass selection for the paired culture and thermostability tests. In the direct comparison, 68.49% were able to substantially inhibit the growth of phytopathogens by antibiosis, with different levels of toxicity to the challenging pathogens , With respect to thermostability, 33.79% of the lineages were highlighted because they were able to inhibit the growth of the phytopathogens of the three tropical hosts, revealing a great range of action, and, showing that the metabolites produced proved to be thermostable, maintaining their activities even after Autoclaving. / Na busca por alternativas sustentáveis de manejo de doenças, agentes de biocontrole bem como suas relações antagônicas, surgem como fonte importante para o controle biológico aplicado. Neste contexto, o emprego de micro-organismos endofíticos para fins de controle biológico vem sendo amplamente estudado. Eles compreendem, principalmente, fungos e bactérias que habitam o interior das plantas sem causar, aparentemente, danos aos seus hospedeiros. Sua capacidade de biocontrole pode advir de vários mecanismos, como a produção de substâncias deletérias a fitopatógenos ou competindo por espaço e nutrientes. Indiretamente, induzindo resistência sistêmica no hospedeiro ou pela produção de substâncias promotoras de crescimento. Neste sentido, este trabalho visou o isolamento, a caracterização bioquímica e molecular e a busca de bactérias endofíticas que atuem na redução de doenças como a antracnose ou estejam associados à promoção de crescimento vegetal, diminuindo os custos de produção e o impacto ambiental causados pelos insumos químicos. Foram obtidos 416 isolados bacterianos de H. sucuuba, representando 73,08% isoladas da folha, 10,10% do pecíolo e 16,82% da casca. Do total de 308 bactérias analisadas, 48,78% fixaram nitrogênio atmosférico, 83,77% foram capazes de produzir AIA e 96,42% solubilizaram fosfato inorgânico. Quanto ao ensaio de antagonismo in vitro, 219 bactérias foram selecionadas por seleção massal para os testes de cultura pareada e termoestabilidade, no confronto direto 68,49% conseguiram inibir substancialmente o crescimento dos fitopatógenos agindo por antibiose, com diferentes níveis de toxicidade aos patógenos desafiantes, quanto à termoestabilidade 33,79% das linhagens destacaram-se pois conseguiram inibir o crescimento dos fitopatógenos das três hospedeiras tropicais, revelando um grande espectro de ação, e, mostrando que os metabólitos produzidos demonstraram-se termoestáveis, mantendo suas atividades mesmo após a autoclavagem.

No interior das plantas, existem bactérias e fungos que vivem em colonização assintomática, sendo denominados microrganismos endofíticos. Esses microrganismos podem ser utilizados no controle de fitonematóides. No presente trabalho, isolaram-se, pelo método de fragmentos do tecido vegetal, 161 bactérias endofíticas do sistema radicular de cafeeiros em três regiões do estado de São Paulo. Após análise morfológica das colônias isoladas, foram selecionadas 54 bactérias para serem avaliadas quanto ao potencial de controle biológico de fitonematóides, por meio de testes in vitro em que se verificou seu efeito sobre a mortalidade de juvenis de Meloidogyne incógnita. Dos isolados testados, vinte e três (TR1Ig, TR5IIId, TR9IIIc, TRlIId, TR3IIb, TR1IIe, TRlId, TR5Ia2, TR5Id, TR4IIa, TR7IIb, TR8IIc, TR8IIId, TR3a, TR7IIIa, TR7IIIb, TR8IIIb, TR8IIIa, TR9IE, TR9IIIE, TR9IIIb3, TRIOlb, TR9IIc) provocaram maior porcentagem de morte dos nematóides, quando comparado com a testemunha sem bactéria. Portanto, os isolados de bactérias endofíticas testados demonstraram potencial para controle biológico do nematóide. / not available

A presença de bactérias no cultivo in vitro de plantas é normalmente relacionada à contaminação, acarretando o descarte de microplantas de alto valor comercial. No entanto, essa presença pode ser caracterizada como \"manifestações\", decorrentes de possíveis estresses físicos ou nutricionais, da microbiota endofítica, que coloniza ativamente os tecidos vegetais, e que não necessariamente, afeta o desenvolvimento da planta. Sendo assim, o objetivo deste trabalho foi controlar a manifestação bacteriana, preservando as microcepas de Eucalyptus cloeziana em desenvolvimento in vitro, adicionando-se ao meio de cultura, os antibióticos gentamicina, ciprofloxacina, rifampicina, timentin (isolados ou combinados entre si) e o biocida clorometil-isotiazolinona + metil-isotiazolinona. O monitoramento do trabalho foi realizado por meio de avaliações semanais, visando verificar possíveis influências dos agentes antimicrobianos na morfofisiologia do vegetal e a eficiência no controle das manifestações bacterianas. Para tanto, foram avaliados parâmetros referentes ao incremento de massa seca, número de brotações, teor de acúmulo de nutrientes, análises histológicas e histoquímicas das microcepas. Para verificar possíveis flutuações das comunidades bacterianas endofíticas nas microcepas, utilizou-se a técnica de DGGE. Todas as análises foram realizadas aos 15 e 30 dias após a adição dos agentes antimicrobianos no meio de cultura, exceto a avaliação nutricional que foi feita apenas no final do experimento (30 dias). Os resultados obtidos permitiram inferir que ao longo dos 30 dias de cultivo, o antibiótico gentamicina, ocasionou queda no desenvolvimento das microcepas e não foi eficiente no controle das manifestações bacterianas. Os antibióticos rifampicina e ciprofloxacina apesar de não serem efetivos no controle da manifestação bacteriana, não afetaram o desenvolvimento das microcepas. Conclui-se que, o biocida clorometil-isotiazolinona + metil-isotiazolinona efetivamente controlou as manifestações bacterianas, sem alterar a morfofisiologia das microcepas, bem como o timentin, que além de controlar as manifestações, proporcionou maior vigor das microcepas em função da melhor assimilação dos nutrientes. / The in vitro bacterial presence in plant cultivation, usually is related to contamination, resulting in the elimination of the microplants with high commercial value. However, this presence can be characterized as \"manifestations\" arising from possible physical or nutritional stresses, from microbial endophytic that actively colonize plant tissues, and do not necessarily affect plant development. Therefore, the purpose of this study was to control the bacterial manifestation, preserving in vitro developing of Eucalyptus cloeziana microstumps, by adding to the culture medium, the antibiotics gentamicin, ciprofloxacin, rifampicin, timentin (alone or combined) and biocide + chloromethyl isothiazolinone methyl-isothiazolinone. The monitoring work was conducted through weekly evaluations, to verify the possible influence of antimicrobial agents in the plant morphophysiology and the efficient control of bacterial manifestations. Therefore, were evaluated parameters related to the increase in dry weight, number of buds, content of nutrient accumulation, histological and histochemical the microstumps. DGGE technique was used to check possible fluctuations of endophytic bacterial communities in microstumps. All analyzes were performed at 15 and 30 days after the addition of antimicrobial agents in the culture medium, except for the nutritional assessment that was made only at the end of the experiment (30 days). The results allow to infer that over the 30 days of culture, the antibiotic gentamicin, resulted in the microstumps development decrease and was not effective in controlling bacterial manifestations. The antibiotics rifampicin and ciprofloxacin although were not effective in controlling the bacterial manifestation, affected the development of microstumps. It was concluded that the biocide chloromethyl-methyl-Isothiazolinone + Isothiazolinone effectively controlled the bacterial manifestations without modifying the morphophysiology of the microstumps, well as the timentin, which besides controlling the manifestations, provided greater vigor of microstumps due to better assimilation of nutrients.

This present research aimed to evaluate the effects of different endophytic bacteria species regarding the tolerance of sugarcane water stress in the initial growth phase. With that purpose, an experiment was installed, in the greenhouse at the Centro de Ciências Agrárias of Universidade Federal de Alagoas, located in the city of Rio Largo, in the state of Alagoas (9° 28 S, 35° 49 W, altitude 127 m), completely ramdomized on a factorial arrengement 4x2 (endophytic bacteria and levels of water stress in this order), with 8 replications. The levels of the first factor were composed of: non-inoculated plants; inoculated plants with complete inoculant (mix of Gluconacetobacter diazotrophicus, Burkholderia tropica, Herbaspirillum seropedicae, Herbaspirillum rubrisubalbicans e Azospirillum amazonense); inoculated plants with G. diazotrophicus; inoculated plants with B. tropica. The levels of the second factor were: plants kept on the soil with moisture next to field capacity (without stress); plants under water deficit due to irrigation suspension. The morphological and physiological variables analyzed were plant height, stalk diameter, number of green leaves, leaf area, dry mass analyze, leaf water potential (ψwf), potential and effective quantic efficiency and chlorophyll content. The bacteria application didn t interfer in stalk diameter, plants height and estimated leaf area. When the plants average growth was evaluated, it was verified that plants treated without bacteria (control) and with inoculum B. tropica presented showed greater aerial part mass, whereas the bacteria application G. diazotrophicus and the control treatment presented greater root mass. The water stress has significantly affected the potential quantic efficiency (Fv/Fm) on the irrigated plants (control) which the Fv/Fm values were above 0,79 statistically differing of water stress (draught) and rehydratation, wherein the values were below 0,79. Apparently, the damages presented on the photosystem II at midday were recovered during nighttime, showing higher Fv/Fm values at predawn. The presence of bacteria hasn t significantly affected the biometric characteristics of sugarcane plants grown in vases at 114 days after planting (DAP). The leaf area ratio (LAR) utilized the measured leaf area, being greater on control and complete inoculant treatments. On these, the plant developed more leaves and was less efficient on carbon fixation, which refleced on dry mass increase. / A presente pesquisa teve como objetivo avaliar os efeitos de diferentes espécies de bactérias endofíticas sobre a tolerância ao déficit hídrico de cana-de-açúcar em sua fase inicial de crescimento. Para tanto, instalou-se um experimento, em casa de vegetação no Centro de Ciências Agrárias da Universidade Federal de Alagoas, localizado no município de Rio Largo - AL (9° 28 S, 35° 49 W, a 127 m de altitude), em delineamento inteiramente ao acaso em arranjo fatorial, 4 x 2 (tipos de bactérias endofíticas e níveis de déficit hídrico respectivamente), com oito repetições. Os níveis do primeiro fator foram compostos por: plantas não inoculadas; plantas inoculadas com inoculante completo (mistura das Gluconacetobacter diazotrophicus, Burkholderia tropica, Herbaspirillum seropedicae, Herbaspirillum rubrisubalbicans e Azospirillum amazonense); plantas inoculadas com a G. diazotrophicus; plantas inoculadas com a B. tropica. Os níveis do segundo fator foram: plantas mantidas em solo com umidade a próxima da capacidade de campo (sem estresse); plantas submetidas ao déficit hídrico pela suspensão da rega. As variáveis morfológicas e fisiológicas analisadas foram: altura, diâmetro do colmo, número de folhas verdes, área foliar, análise da massa seca, potencial hídrico foliar (ψwf), eficiência quântica potencial e efetiva e estimativa do teor de clorofila. A aplicação de bactéria não afetou o diâmetro do colmo, altura de plantas e área foliar estimada. Quando avaliado o crescimento médio das plantas, verificou-se que plantas tratadas sem bactérias (controle) e com o inoculado B. tropica apresentavam maior massa de parte aérea, enquanto que a aplicação da bactéria G. diazotrophicus e o tratamento controle apresentaram maior massa de raiz. O estresse hídrico afetou significativamente a eficiência quântica potencial (Fv/Fm), nas plantas irrigadas (controle) os valores Fv/Fm estavam acima de 0,79 diferindo estatisticamente do estresse hídrico (seca) e reidratação, em que os valores estavam abaixo de 0,79. Aparentemente os danos apresentados no fotossistema II ao meio-dia foram recuperados durante o período noturno, mostrando valores de Fv/Fm mais elevados na antemanhã. A presença de bactérias não efetou significativamente as características biométricas das plantas de cana-de-açúcar crescidas em vasos aos 114 DAP. A Razão da Área Foliar (RAF) utilizou a AF mensurada, sendo maior nos tratamentos controle e inoculante completo. Nestes, a planta desenvolveu mais folhas e foi menos eficiente na fixação de carbono, refletido no aumento de massa seca.

Submitted by Geyciane Santos (geyciane_thamires@hotmail.com) on 2015-12-07T20:08:17Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Adriana Spirotto Stein Mesquita.pdf: 3914675 bytes, checksum: a98f72f70f2e72b3c17fddd0248824e7 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-01-19T17:58:08Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Adriana Spirotto Stein Mesquita.pdf: 3914675 bytes, checksum: a98f72f70f2e72b3c17fddd0248824e7 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-01-19T17:59:14Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Adriana Spirotto Stein Mesquita.pdf: 3914675 bytes, checksum: a98f72f70f2e72b3c17fddd0248824e7 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-19T17:59:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação - Adriana Spirotto Stein Mesquita.pdf: 3914675 bytes, checksum: a98f72f70f2e72b3c17fddd0248824e7 (MD5) Previous issue date: 2015-09-15 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The endophytic microrganisms, particularly bacteria and fungi live in the plants, including thein roots apparently cause no harm. Bacteria and fungi are potentially useful in agriculture and industry, particularly in the food and pharmaceutical industries, as they produce different chemical classes and can participate in various industrial biotechnological processes. Among the compounds produced by bacteria, lipopeptides belong to a class that has attracted great interest for its antifungal, antibiotic and surfactant among others. In this stud 50 strains were selected of Amazonian endophytic bacteria for antimicrobial evoluction and the production of lipopeptides by ESI-ITMS2. Of these, 25 strains produced lipopeptides, six plant isolated from Gustavia genus, nine Macrophyte, five Duguetia, one Pothomorpha, two Rollina and one Bryophyllum. The fragmentation analysis by ESI-MS2 in negative mode identified eight extracts the lipopeptide surfactin homologs of C11 - C18, including C11, C17 and C18 not been reported in the literature. In biological assays paired cultures, 48 strains showed mycoparasitism antimicrobial activity against Gram-negative bacteria P. aeruginosa and E. coli, 27 strains against Gram-positive bacteria S. aureus, E. faecalis, 29 strains against and 28 against C. albicans, also presenting competition activity against E. faecalis 21 strains and C. albicans strains against 23 S. aureus strains and 2 against P.aeruginosas and E. coli. No strain with antibiotic activity observed. In assessing the bioactivity of lipopeptide extracts, 13 of the extracts strains showed antibiosis against S. aureus, P. aeruginosa and C.albicans. / Os microrganismos endofíticos, especialmente bactérias e fungos, são assim denominados por viverem no interior das plantas, habitando inclusive suas raízes, sem lhes causar aparentemente nenhum dano. As bactérias e os fungos são potencialmente úteis na agricultura e na indústria, particularmente na alimentícia e farmacêutica, pois produzem inúmeras classes de substâncias e podem participar de processos biotecnológicos industriais diversos. Entre as substâncias produzidas por bactérias, os lipopeptídeos são uma classe que tem atraído grande interesse por suas atividades antifúngica, antibiótica e surfactante entre outras. No presente trabalho foram selecionadas 50 linhagens de bactérias endofíticas amazônicas para serem avaliadas por ensaios antimicrobianos e quanto à produção de lipopeptídeos por ESI-ITMS2. Destas, 25 linhagens produziram lipopeptídeos, sendo seis isoladas de planta do gênero Gustavia, nove de Macrofita, cinco de Duguetia, uma de Pothomorpha, duas de Rollina e uma de Bryophyllum. As análises de fragmentação por ESI-MS2 no modo negativo dos extratos lipopeptídicos identificaram oito homólogos da surfactina de C11 - C18, entre os quais o C11, C17 e C18 ainda não foram relatados na literatura. Em ensaios biológicos de culturas pareadas, 48 linhagens apresentaram atividade antimicrobiana de microparasitismo contra as bactérias Gram-negativas P. aeruginosa e E. coli, 27 linhagens contra as bactérias Gram-positiva S. aureus, 29 linhagens contra E. faecalis e 28 contra C. albicans, apresentando também atividade de competição frente a 21 linhagens contra E. faecalis e C. albicans, 23 linhagens contra S. aureus e 2 linhagens contra P.aeruginosa e E. coli. Não foi observada nenhuma linhagem com atividade antibiótica. Na avaliação da bioatividade dos extratos lipopeptídicos, 13 extratos destas linhagens apresentaram antibiose frente a S. aureus, P. aeruginosa e C. albicans.

A presença de bactérias no cultivo in vitro de plantas é normalmente relacionada à contaminação, acarretando o descarte de microplantas de alto valor comercial. No entanto, essa presença pode ser caracterizada como \"manifestações\", decorrentes de possíveis estresses físicos ou nutricionais, da microbiota endofítica, que coloniza ativamente os tecidos vegetais, e que não necessariamente, afeta o desenvolvimento da planta. Sendo assim, o objetivo deste trabalho foi controlar a manifestação bacteriana, preservando as microcepas de Eucalyptus cloeziana em desenvolvimento in vitro, adicionando-se ao meio de cultura, os antibióticos gentamicina, ciprofloxacina, rifampicina, timentin (isolados ou combinados entre si) e o biocida clorometil-isotiazolinona + metil-isotiazolinona. O monitoramento do trabalho foi realizado por meio de avaliações semanais, visando verificar possíveis influências dos agentes antimicrobianos na morfofisiologia do vegetal e a eficiência no controle das manifestações bacterianas. Para tanto, foram avaliados parâmetros referentes ao incremento de massa seca, número de brotações, teor de acúmulo de nutrientes, análises histológicas e histoquímicas das microcepas. Para verificar possíveis flutuações das comunidades bacterianas endofíticas nas microcepas, utilizou-se a técnica de DGGE. Todas as análises foram realizadas aos 15 e 30 dias após a adição dos agentes antimicrobianos no meio de cultura, exceto a avaliação nutricional que foi feita apenas no final do experimento (30 dias). Os resultados obtidos permitiram inferir que ao longo dos 30 dias de cultivo, o antibiótico gentamicina, ocasionou queda no desenvolvimento das microcepas e não foi eficiente no controle das manifestações bacterianas. Os antibióticos rifampicina e ciprofloxacina apesar de não serem efetivos no controle da manifestação bacteriana, não afetaram o desenvolvimento das microcepas. Conclui-se que, o biocida clorometil-isotiazolinona + metil-isotiazolinona efetivamente controlou as manifestações bacterianas, sem alterar a morfofisiologia das microcepas, bem como o timentin, que além de controlar as manifestações, proporcionou maior vigor das microcepas em função da melhor assimilação dos nutrientes. / The in vitro bacterial presence in plant cultivation, usually is related to contamination, resulting in the elimination of the microplants with high commercial value. However, this presence can be characterized as \"manifestations\" arising from possible physical or nutritional stresses, from microbial endophytic that actively colonize plant tissues, and do not necessarily affect plant development. Therefore, the purpose of this study was to control the bacterial manifestation, preserving in vitro developing of Eucalyptus cloeziana microstumps, by adding to the culture medium, the antibiotics gentamicin, ciprofloxacin, rifampicin, timentin (alone or combined) and biocide + chloromethyl isothiazolinone methyl-isothiazolinone. The monitoring work was conducted through weekly evaluations, to verify the possible influence of antimicrobial agents in the plant morphophysiology and the efficient control of bacterial manifestations. Therefore, were evaluated parameters related to the increase in dry weight, number of buds, content of nutrient accumulation, histological and histochemical the microstumps. DGGE technique was used to check possible fluctuations of endophytic bacterial communities in microstumps. All analyzes were performed at 15 and 30 days after the addition of antimicrobial agents in the culture medium, except for the nutritional assessment that was made only at the end of the experiment (30 days). The results allow to infer that over the 30 days of culture, the antibiotic gentamicin, resulted in the microstumps development decrease and was not effective in controlling bacterial manifestations. The antibiotics rifampicin and ciprofloxacin although were not effective in controlling the bacterial manifestation, affected the development of microstumps. It was concluded that the biocide chloromethyl-methyl-Isothiazolinone + Isothiazolinone effectively controlled the bacterial manifestations without modifying the morphophysiology of the microstumps, well as the timentin, which besides controlling the manifestations, provided greater vigor of microstumps due to better assimilation of nutrients.

No presente estudo, a diversidade bacteriana endofítica fixadora de nitrogênio foi pesquisada utilizando métodos microbiológicos e moleculares. Isolaram-se microrganismos de raiz, caule e folha de cana-de-açúcar. Análises por seqüenciamento do 16S rDNA identificaram 150 endófitos. No total, foram identificados 18 gêneros. Destes, apenas 4 estavam presentes em cana-de-açúcar submetida aos 3 tratamentos. A maior diversidade de gêneros foi encontrada em cana sob adubação orgânica: 10 gêneros, em cana sob adubação inorgânica foram 11 gêneros e 8 em cana sem adubação. A maior parte dos gêneros pertence à família Enterobacteriaceae, como Klebsiella, Pantoea e Enterobacter. A enzima endoglicanase foi produzida por 82% dos isolados de cana sob adubação orgânica, (54%) inorgânica e (48%) sem adubação. Quanto à atividade de pectinase: 42%, 60% e 36% foram apresentadas por isolados de cana orgânica, inorgânica e sem adubação, respectivamente. A capacidade de solubilizar fosfatos inorgânicos foi detectada em 76,6% dos isolados, sendo a maior capacidade de solubilização de fosfatos encontrada em bactérias isoladas de cana-de-açúcar sob adubação orgânica (71%), de cana submetida a adubação convencional (78%) e sem adubação (88%). Foram realizados estudos de colonização em plântulas de cana-de-açúcar com 4 endofitos geneticamente modificados (EGMs) capazes de expressar os genes gfp e dsred. A avaliação da colonização na cana pela microscopia de fluorescência, mostrou que os (EGMs) gfp e dsred colonizaram as raízes e caules das plantas inoculadas, sem causar qualquer sintoma de doença. / In the present study, endophytic bacterial diversity has been searched using both microbiologic and molecular methods. Microorganisms were isolated from sugarcane root, shoot and leaf. 150 isolates were identified by 16S rDNA sequencing. 18 genera were found and only 4 were present in sugarcane submitted to the three treatments. The greatest genera diversity was found in sugarcane submited to organic fertlization: 10 genera in sugarcane submitted to inorganic fertilization were found 11 genera and 8 genera in sugarcane without fertilization. Great part of the found genera belongs to the Enterobacteriaceae family: Klebsiella, Pantoea and Enterobacter. Some physiological characteristics were determined in the isolates. Endoglucanase was produced by 82% of the isolates from sugarcane submitted to organic fertilization. Lower activities were found in bacteria isolated from inorganic fertilization and no fertilization, respectively 54% and 48%. As far as pectinase activity is concerned, a percentage of 42%, 60% and 36% was presented by the isolates from organic fertilization, inorganic fertilization and no fertilization, respectively. The hability of phosphate solubilization was detected in 76.6% of the isolates. In sugarcane under organic fertilization a percentage of 71% was found, in bacteria from inorganic fertilization, 78%, and without fertilization, 88%. Plant colonization was determined using sugarcane plantlets inoculated with four genetically modified bactéria (GMEs), able to express the genes gfp and dsred. The colonization was evaluated by fluorescence microscopy, which showed that the endophytic bacteria expressing gfp and dsred genes had invaded roots and shoots from inoculated plants, without causing any disease symptom.