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Produção do macrofungo Schizophyllum commune e modulação redox e mitocondrial em células Ea.hy926 em condição hiperglicêmica

Basso, Vanessa 28 April 2017 (has links)
Submitted by Ana Guimarães Pereira (agpereir@ucs.br) on 2017-12-22T11:57:55Z No. of bitstreams: 1 Dissertacao Vanessa Basso .pdf: 2297921 bytes, checksum: e69f38398d8dc884af4123c75c3c977f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-22T11:57:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Vanessa Basso .pdf: 2297921 bytes, checksum: e69f38398d8dc884af4123c75c3c977f (MD5) Previous issue date: 2017-12-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES.
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Produção do macrofungo Schizophyllum commune e modulação redox e mitocondrial em células Ea.hy926 em condição hiperglicêmica

Basso, Vanessa 28 April 2017 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES.
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Produção de fenol-oxidases e degradação de corantes têxteis por políporos (basidiomycota) isolados na Região Sul do Brasil. / Produção de fenol-oxidases e descoloração de corantes têxteis por políporos (basidiomycota) isolados na Região Sul do Brasil

Carrascoza, Lígia Soares 27 April 2018 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES
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Estudos taxonômicos e filogenéticos de fungos boletoides (BOLETALES) no Brasil / Taxonomic and phylogenetic studies of boletoid fungi (Boletales) in Brazil

Magnago, Altielys Casale January 2018 (has links)
As regiões tropicais são consideradas importantes hotspots da biodiversidade do planeta. No entanto, o conhecimento da diversidade de fungos, incluindo os fungos boletoides nessas regiões ainda é muito limitado, e muitos estudos ainda devem ser realizados. Fungos boletoides são considerados um agrupamento morfológico não suportado filogeneticamente como monofilético. São representados por macrofungos com basidiomas epígeos, “carnudos” putrescentes, pileado-estipitados, com himenóforo tubular. Para este estudo foram utilizados materiais de herbário assim como novas coletas realizadas em várias localidades do Brasil nos últimos anos. As análises morfológicas e filogenéticas seguiram a metodologia tradicional para macrofungos. Duzentos e trinta e sete espécimes boletoides foram estudados e 104 sequências de DNA foram geradas, sendo 69 da região nrITS e 35 da região nrLSU. Cinquenta e duas espécies de fungos boletoides (representando 15 gêneros) têm registro nas florestas brasileiras. Duas espécies novas de Tylopilus foram descritas para o nordeste brasileiro; uma espécie nova de Fistulinella foi descrita para a Mata Atlântica e o primeiro registro de Fistulinella campinaranae var. scrobiculata foi feito para a Mata Atlântica; uma espécie nova de Singerocomus foi descrita para o Brasil e Singerocomus rubriflavus foi registrado pela primeira vez para o Brasil; uma espécie nova de Gyroporus foi descrita para o extremo sul da Mata Atlântica; uma espécie de Boletellus foi descrita para o nordeste brasileiro. Também foi proposta a sinonímia de Phlebopus brasiliensis com Phlebopus beniensis. Uma lista com dados geográficos e comentários dos fungos boletoides da Mata Atlântica brasileira é apresentada. O trabalho inclui chaves de identificação, fotografias coloridas e ilustrações da maioria das espécies apresentadas. / Tropical regions are considered the greatest biodiversity hotspots of the planet. However, the knowledge about fungi diversity, including boletoid fungi, is still very limited. Boletoid fungi are considered a morphological grouping not supported phylogenetically as monophyletic. They are represented by pileate-stipitate macrofungi with tubular hymenophore, epigial basidiomata, and a putrescent context. For this study was used herbaria collections as well as collections from new field trips in many locations in Brazil in the last years. Morphological and phylogenetic analyses followed the traditional methodology for macrofungi. Two hundred and thirty-seven specimens were studied, and 104 DNA sequences were generated, 69 from the nrITS region and 35 from the nrLSU region. Fifty-two species of boletoid fungi (within 15 genera) occur in the Brazilian forests. Two new species of Tylopilus were described for the Brazilian Northeastern region, one new species of Fistulinella was described for the Atlantic Forest and the first record of Fistulinella campinaranae var. scrobiculata for the Atlantic Forest was registered; a new species of Singerocomus was described and the first record of Singerocomus rubriflavus for Brazil was made; a new species of Gyroporus was described for the south of the Atlantic Forest; a new species of Boletellus was described for the Brazilian Northeastern. The synonymia of Phlebopus brasiliensis with Phlebopus beniensis was proposed. A list with geographic data and comments of boletoid fungi registered in the Brazilian Atlantic Forest is provided. This work also includes identification keys, pictures and illustrations for the majority of the species.
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Studies on synthetic and naturally occurring glycosidase inhibitors from mushrooms.

January 1994 (has links)
Fung Pik Ha. / Thesis (M.Phil.)--Chinese University of Hong Kong, 1994. / Includes bibliographical references (leaves 116-121). / Acknowledgments --- p.i / Table of Contents --- p.ii / List of Figures --- p.v / List of Tables --- p.x / Abstract --- p.xi / Chapter Chapter I --- Introduction --- p.1 / Chapter Chapter II --- Literature Reviews / Chapter II.l --- Glycosidase --- p.3 / Chapter II.2 --- Biosynthesis of N-linked Glycoprotein --- p.4 / Chapter II.3 --- Mechanism of Enzyme Catalysed Reaction --- p.8 / Chapter II.4 --- Types of Glycosidase Inhibitors --- p.12 / Chapter II.5 --- Cyclophellitol and Aminocyclitols / Chapter II.5.1 --- General background on cyclophellitol --- p.17 / Chapter II.5.2 --- Mode of inhibition of cyclophellitol --- p.20 / Chapter II.5.3 --- General background on aminocyclitols --- p.24 / Chapter Chapter III --- Characterization of Synthetic Glycosidase Inhibitors / Chapter III.1 --- Covalent-based Inactivator (Cyclophellitol and its Analogues) / Chapter III.1.1 --- Introduction --- p.28 / Chapter III.1.2 --- Materials --- p.32 / Chapter III.1.3 --- Methods / Chapter III.1.3.1 --- Inhibitory assay of commercially available glycosidases --- p.33 / Chapter III.1.3.2 --- Partial purification of β-D-mannosidase from A. oryzae --- p.34 / Chapter III.1.3.3 --- Protein assay in purification of β-D-mannosidase --- p.38 / Chapter III.1.3.4 --- Inhibitory assay for partially purified β-D- mannosidase (A . oryzae) --- p.38 / Chapter III.1.3.5 --- Influence of dialysis on glycosidase inhibition --- p.39 / Chapter III.1.3.6 --- Inactivation experiment on glycosidases --- p.39 / Chapter III.1.4 --- Results / Chapter III.1.4.1 --- Inhibitory activities of cyclophellitol and its analogues against glycosidases --- p.41 / Chapter III.1.4.2 --- Effect of dialysis on glycosidase inhibition --- p.44 / Chapter III.1.4.3 --- The kinetic studies of glycosidase inactivation --- p.47 / Chapter III. 1.5 --- Discussion --- p.50 / Chapter III.1.6 --- Further studies --- p.55 / Chapter III.2 --- Reversible Competitive Inhibitors (Aminocyclitols) / Chapter III.2.1 --- Introduction --- p.56 / Chapter III.2.2 --- Materials --- p.58 / Chapter III.2.3 --- Methods / Chapter III.2.3.1 --- Assay of glucoside hydrolase inhibition activity --- p.60 / Chapter III.2.3.2 --- Glucose oxidase method for determination of released D-glucose --- p.60 / Chapter III.2.3.3 --- Inhibitory assay of aminocyclitols on other glycosidases --- p.61 / Chapter III.2.3.4 --- Influence of dialysis on the glycosidase inhibition --- p.62 / Chapter III.2.3.5 --- Lineweaver-Burk plot --- p.63 / Chapter III.2.4 --- Results / Chapter III.2.4.1 --- Inhibitory activities of valiolamine and related aminocyclitols against six glycosidases --- p.64 / Chapter III.2.4.2 --- Characterization the aminocyclitols as reversible competitive inhibitors --- p.69 / Chapter III.2.5 --- Discussion --- p.80 / Chapter Chapter IV --- Isolation of the Naturally Occurring Glycosidase Inhibitor from Mushrooms / Chapter IV.1 --- Introduction --- p.83 / Chapter IV.2 --- Materials --- p.84 / Chapter IV.3 --- Methods / Chapter IV.3.1 --- Preparation of Ganoderma lucidum --- p.86 / Chapter IV.3.2 --- Preparation of V. volvacea --- p.86 / Chapter IV.3.3 --- Inhibitory assay of aqueous extract of mushrooms on glycosidases --- p.87 / Chapter IV.3.4 --- Anthrone method for determination of reducing sugars --- p.87 / Chapter IV.3.5 --- Flash liquid chromatography for purification of putative inhibitors in G. lucidum --- p.88 / Chapter IV.4 --- Results / Chapter IV.4.1 --- Prescreening of Inhibitory effects of Various Fungal Extracts --- p.90 / Chapter IV.4.2 --- Inhibitory Effects of Partially Purified G. lucidum Extract on Glycosidase --- p.92 / Chapter IV.4.3 --- Effect of Endogenous Substrates on Glycosidase Activities --- p.93 / Chapter IV.4.4 --- Results of Liquid Column Chromatography --- p.93 / Chapter IV.4.5 --- Structure Determination and Characterization of purified compounds --- p.95 / Chapter IV.4.6 --- Inhibitory Activities of Compounds A and B against Brewers yeast a- glucosidase --- p.96 / Chapter IV.5 --- Discussion --- p.98 / Chapter Chapter V --- Conclusions --- p.113 / References --- p.116
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Contribuições à sistemática de Phellinotus (Basidiomycota, Hymenochaetales) com ênfase na delimitação filogenética e filogeografia preliminar de P. piptadeniae

Elias, Samuel Galvão January 2017 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2017. / Made available in DSpace on 2017-12-05T03:14:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 348750.pdf: 1454780 bytes, checksum: 26c81ce3f4363786a7aec4b40f4060fb (MD5) Previous issue date: 2017 / Phellinotus, um gênero de Hymenochaetaceae representa um táxon restrito à região Neotropical. Atualmente, duas espécies são descritas para o gênero, P. neoaridus, com populações atualmente somente registradas no semi-árido brasileiro e associadas exclusivamente a espécies do gênero Caesalpinia (Fabaceae) e P. piptadeniae, com populações possívelmente distribuídas ao longo de diferentes grupos florísticos (GF) das florestas tropicais sazonalmente secas da América do Sul e associado a diferentes gêneros de leguminosas, como Piptadenia, Senegalia, Mimosa, Pithecellobium, Libidibia e Pityrocarpa. Até o momento, apenas as populações de P. piptadeniae ocorrentes no GF Caatinga foram testadas filogenéticamente. No presente trabalho, com o intuito de delimitar filogeneticamente P. piptadeniae considerando os diferentes hospedeiros e sua distribuição geográfica, foram realizadas reconstruções filogenéticas baseadas nos marcadores moleculares nucleares ITS e nLSU do rDNA, incluindo espécimes pertencentes a todas as populações conhecidas do táxon, assim como espécimes adicionais. Os resultados demonstram que P. piptadeniae possui duas populações ocorrentes de forma alopátrica no GF Caatinga e florestas estacional semidecidual e ombrófila densa na porção sul da Mata Atlântica. Os espécimes do GF Caatinga e GF Costa Central dos Andes e um único exemplar coletado no GF Missiones (nordeste da Argentina), previamente determinados como P. piptadeniae, ficaram agrupados em um clado distinto de P. piptadeniae e aqui é proposta como a espécie nova P. teixeirae sp. nov. Ad int. Adicionalmente, uma nova espécie de Phellinotus é descrita, P. magnoporatu sp. Noc. Ad Int., um táxon até o momento registrado somente no GF Costa Central dos Andes. Baseando-se nos resultados das análises filogenéticas, um estudo preliminar da filogeografia de P. piptadeniae foi realizado, utilizando-se o marcador molecular ITS. Nossos resultados evidenciam que as populações de P. piptadeniae associadas à P. gonoacantha, que ocorrem na Mata Atlântica, juntamente com novos registros de populações localizadas na porção central do Cerrado, possuem alta diversidade genética em comparação com as populações associada aos demais hospedeiros conhecidos. Adicionalmente, sinais de recente expansão demográfica foram evidenciados através do marcador nuclear ITS. / Abstract : The Hymenochaetoid genus Phellinotus, represents a restricted taxa to the Neotropical Region. Currentlly, two species are described from the genus, ?P. neoaridus, with populations occurring on the brasilian semi-arid region and excluvelly associated to species of Caesalpinia (Fabceae) and P. piptadeniae, with populations possibly distributed througouth different floristic groups (FG) of the Seazonally Dry Tropical Forests of South America and associated to different genera of Fabeceae, as Piptadenia, Senegalia, Mimosa, Pithecellobium, Libidibia and Pityrocarpa. At this moment only the populations of P. piptadeniae that occur on the Caatinga FG were phylogenetucally tested. In this work, to address the phylogeny of P. piptadeniae considering different hosts and full geographical distribution, were performed phylogenetical reconstructions based on nuclear molecular markers ITS and LSU of rDNA, including specimes belong to all know populations to this taxon, and additional specimens. Our results show that P. piptadeniae has two populations that allopathically occur in the Caatinga FG and in the Semidecidious Forest of south portion of Atlantic Forest. Specimens collected on the Caatinga FG and Central Andes Coast FG and only one specimens collected on Missiones FG (northeast of Argentina), previously identified as P. piptadeniae, clustered on distinct clade of P. piptadeniae, and here we propose a new taxa P. teixeirae sp. nov. Ad int. Additionaly, a new species of Phellinotus are proposed, P. magnoporatus sp. Nov. Ad int., a species at this moment recorded only on Central Andes Coast FG. Based in our results of phylogenetic analisis, a preliminary phylogeographic study of P. piptadeniae was conducted based on the ITS marker. Ouer results indicate that populations of P. piptadeniae associated to P. gonoacantha, and that occur in Atlantic Forest, together the populations located on the central portion of Cerrado, has high genetic diversity em comparison with populations associated to the other know hosts. Adictionally, signs of recent demographic expancion were evidenced trougthout the nuclear marker ITS.
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Taxonomia de russulaceae lotsy agaricoides do semi?rido brasileiro

S?, Mariana Cavalcante e Almeida 19 February 2014 (has links)
Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2015-10-26T20:38:30Z No. of bitstreams: 1 MarianaCavalcanteEAlmeidaSa_DISSERT.pdf: 20786761 bytes, checksum: e554bb9a44d1b1dc1b21b408a89d0d4c (MD5) / Approved for entry into archive by Elisangela Moura (lilaalves@gmail.com) on 2015-10-26T20:58:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 MarianaCavalcanteEAlmeidaSa_DISSERT.pdf: 20786761 bytes, checksum: e554bb9a44d1b1dc1b21b408a89d0d4c (MD5) / Made available in DSpace on 2015-10-26T20:58:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MarianaCavalcanteEAlmeidaSa_DISSERT.pdf: 20786761 bytes, checksum: e554bb9a44d1b1dc1b21b408a89d0d4c (MD5) Previous issue date: 2014-02-19 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / O Brasil ? um pa?s de grande biodiversidade e possui potencialmente 20% de toda biodiversidade mundial. Diante deste quadro, o conhecimento sobre a micobiota brasileira ? escasso e isso se agrava em regi?es como o semi?rido brasileiro. O presente trabalho teve como objetivo investigar as esp?cies de fungos da fam?lia Russulaceae para o semi?rido, atrav?s de estudos taxon?micos. As coletas foram realizadas durante o per?odo chuvoso, em ?reas de conserva??o de alguns estados do Nordeste. Os materiais foram descritos, ilustrados macro e microscopicamente, juntamente com as an?lises da ornamenta??o de esporos, estes foram obtidos com microsc?pio eletr?nico de varredura e outras microestruturas de cunho taxon?mico. Como resultado foram encontradas 12 esp?cies. O g?nero mais rico ? Russula com sete esp?cies, Lactifluus com quatro e por fim Lactarius com uma esp?cie. Todas as esp?cies s?o novas para a ci?ncia, aumentando o conhecimento sobre a riquesa de Russulaceae no Brasil de 41 para 52 esp?cies, este presente trabalho representa 4,5% da riqueza de t?xons conhecidos para o Brasil e evidencia que o semi?rido ? uma ?rea rica para estudos taxon?micos desta fam?lia. / Brazil is a country with a big biodiversity and has a 20% of all biodiversity of the world. Therefore the knowledge of the brasilian mycobiota e scarce and it?s worse in the semiarid region. The present study intended to investigate the species of fungi of the Russulaceae of Caatinga through taxonomic studies. The collections were made during the rainy season in areas of conservation of some Northeastern states. The species were discribed, ilustraded macro- and microscopically, microstructures of taxonomic aspects and spores ornamentations, these were also observed in scanning electron microscopy. As result were described 12 species. The most representative were Russula with 7 species, Lactifluus with 4 species and Lactarius with 1 species. All the species are new to science, this rase de diversity of Russulaceae from 41 to 52 species, this work represents 4,5% of de diversity of t?xons known for Brazil and shows that the semiarid region is relevant in study of this family. / 2018-06-20
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Diversidade de fungos poróides (Agaricomycetes) na Amazônia brasileira

Gomes-Silva, Allyne Christina 22 February 2013 (has links)
Submitted by Daniella Sodre (daniella.sodre@ufpe.br) on 2015-03-17T14:19:53Z No. of bitstreams: 2 Tese Allyne Silva.pdf: 4941442 bytes, checksum: 50b2e8bcec71a4c3d568843d1a90f396 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-17T14:19:53Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese Allyne Silva.pdf: 4941442 bytes, checksum: 50b2e8bcec71a4c3d568843d1a90f396 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2013-02-22 / CNPq e CAPES / Os fungos poróides são popularmente chamados de “orelhas-de-pau” devido ao hábito do basidioma, onde produzem holobasídios clavados, em himênio geralmente tubular bem definido. A maioria das espécies desse grupo de fungos apresenta um papel particularmente importante devido à capacidade de degradação de madeira nos diferentes ecossistemas. Para ampliar o conhecimento sobre a diversidade e aspectos ecológicos de fungos poróides na Amazônia brasileira, foram realizadas revisão de exsicatas de fungos poróides coletados na Amazônia e depositados em herbários e coletas em duas áreas de terra firme no município de Porto Velho, Rondônia: Parque Natural Municipal (PNM) e Estação Ecológica de Cuniã (ESEC), em julho de 2009 (período seco), fevereiro (chuvoso) e julho de 2010 (seco) e fevereiro de 2011 (chuvoso), totalizando oito visitas. Foram coletados 398 espécimes de fungos poróides, representantes de seis famílias, 32 gêneros e 77 espécies, das quais nove são novas para a ciência. Todas as famílias estiveram presentes nas duas áreas de estudo. Vinte espécies foram comuns para ambas as áreas; o PNM apresentou o maior número de espécies exclusivas (37, 19 para a ESEC). A riqueza de espécies não diferiu significativamente entre as áreas de coleta, mas maior abundância foi encontrada no PNM. Maior riqueza e abundância foram encontradas no período chuvoso. Cento e oitenta e oito espécimes foram coletados em áreas adicionais localizadas em Porto Velho e representaram 52 espécies, das quais quatro são novas para a ciência e 20 exclusivas a essas áreas. Desse modo, foram identificadas, ao todo, 97 espécies provenientes de coletas. A partir da revisão de 5.933 exsicatas de fungos poróides coletados na Amazônia e depositados nos Herbários INPA, SP, UFACPZ e URM foram encontradas 212 espécies, distribuídas nos diferentes Estados da Amazônia brasileira, das quais quatro espécies novas para a ciência e 137 encontradas exclusivamente nesses herbários. No total, 238 espécies são registradas para a Amazônia brasileira. Dezessete espécies são novas para a ciência, enquanto 17 são novos registros para o Brasil e 40 para Amazônia brasileira. Onze famílias foram registradas, sendo Polyporaceae com maior número de gêneros e espécies (27 e 104, respectivamente), seguida por Hymenochaetaceae (nove e 46) e Ganodermataceae (quatro e 42). Baseado em análises morfológicas e/ou moleculares da região ITS rDNA, 27 espécies de Amauroderma, muitas morfologicamente semelhantes, foram delimitadas, das quais nove (A. albostipitatum, A. floriforme, A. laccatostiptatum, A. lemoniforme, A minimum, A. ovisporum, A. paraelegantissimum, A. subsessile e A. sessile) são propostas como novas para a ciência.
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Diversidade de fungos poróides (Agaricomycetes) na amazônia brasileira

Gomes-Silva, Allyne Christina 22 February 2013 (has links)
Submitted by Leonardo Freitas (leonardo.hfreitas@ufpe.br) on 2015-04-08T18:40:04Z No. of bitstreams: 2 Tese Allyne Silva.pdf: 4941442 bytes, checksum: 50b2e8bcec71a4c3d568843d1a90f396 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-04-08T18:40:04Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese Allyne Silva.pdf: 4941442 bytes, checksum: 50b2e8bcec71a4c3d568843d1a90f396 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2013-02-22 / CNPq; CAPES / Os fungos poróides são popularmente chamados de “orelhas-de-pau” devido ao hábito do basidioma, onde produzem holobasídios clavados, em himênio geralmente tubular bem definido. A maioria das espécies desse grupo de fungos apresenta um papel particularmente importante devido à capacidade de degradação de madeira nos diferentes ecossistemas. Para ampliar o conhecimento sobre a diversidade e aspectos ecológicos de fungos poróides na Amazônia brasileira, foram realizadas revisão de exsicatas de fungos poróides coletados na Amazônia e depositados em herbários e coletas em duas áreas de terra firme no município de Porto Velho, Rondônia: Parque Natural Municipal (PNM) e Estação Ecológica de Cuniã (ESEC), em julho de 2009 (período seco), fevereiro (chuvoso) e julho de 2010 (seco) e fevereiro de 2011 (chuvoso), totalizando oito visitas. Foram coletados 398 espécimes de fungos poróides, representantes de seis famílias, 32 gêneros e 77 espécies, das quais nove são novas para a ciência. Todas as famílias estiveram presentes nas duas áreas de estudo. Vinte espécies foram comuns para ambas as áreas; o PNM apresentou o maior número de espécies exclusivas (37, 19 para a ESEC). A riqueza de espécies não diferiu significativamente entre as áreas de coleta, mas maior abundância foi encontrada no PNM. Maior riqueza e abundância foram encontradas no período chuvoso. Cento e oitenta e oito espécimes foram coletados em áreas adicionais localizadas em Porto Velho e representaram 52 espécies, das quais quatro são novas para a ciência e 20 exclusivas a essas áreas. Desse modo, foram identificadas, ao todo, 97 espécies provenientes de coletas. A partir da revisão de 5.933 exsicatas de fungos poróides coletados na Amazônia e depositados nos Herbários INPA, SP, UFACPZ e URM foram encontradas 212 espécies, distribuídas nos diferentes Estados da Amazônia brasileira, das quais quatro espécies novas para a ciência e 137 encontradas exclusivamente nesses herbários. No total, 238 espécies são registradas para a Amazônia brasileira. Dezessete espécies são novas para a ciência, enquanto 17 são novos registros para o Brasil e 40 para Amazônia brasileira. Onze famílias foram registradas, sendo Polyporaceae com maior número de gêneros e espécies (27 e 104, respectivamente), seguida por Hymenochaetaceae (nove e 46) e Ganodermataceae (quatro e 42). Baseado em análises morfológicas e/ou moleculares da região ITS rDNA, 27 espécies de Amauroderma, muitas morfologicamente semelhantes, foram delimitadas, das quais nove (A. albostipitatum, A. floriforme, A. laccatostiptatum, A. lemoniforme, A minimum, A. ovisporum, A. paraelegantissimum, A. subsessile e A. sessile) são propostas como novas para a ciência.
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Evolution of Telomerase RNA

January 2019 (has links)
abstract: The highly specialized telomerase ribonucleoprotein enzyme is composed minimally of telomerase reverse transcriptase (TERT) and telomerase RNA (TR) for catalytic activity. Telomerase is an RNA-dependent DNA polymerase that syntheizes DNA repeats at chromosome ends to maintain genome stability. While TERT is highly conserved among various groups of species, the TR subunit exhibits remarkable divergence in primary sequence, length, secondary structure and biogenesis, making TR identification extremely challenging even among closely related groups of organisms. A unique computational approach combined with in vitro telomerase activity reconstitution studies was used to identify 83 novel TRs from 10 animal kingdom phyla spanning 18 diverse classes from the most basal sponges to the late evolving vertebrates. This revealed that three structural domains, pseudoknot, a distal stem-loop moiety and box H/ACA, are conserved within TRs from basal groups to vertebrates, while group-specific elements emerge or disappear during animal TR evolution along different lineages. Next the corn-smut fungus Ustilago maydis TR was identified using an RNA-immunoprecipitation and next-generation sequencing approach followed by computational identification of TRs from 19 additional class Ustilaginomycetes fungi, leveraging conserved gene synteny among TR genes. Phylogenetic comparative analysis, in vitro telomerase activity and TR mutagenesis studies reveal a secondary structure of TRs from higher fungi, which is also conserved with vertebrates and filamentous fungi, providing a crucial link in TR evolution within the opisthokonta super-kingdom. Lastly, work by collabarotors from Texas A&M university and others identified the first bona fide TR from the model plant Arabidopsis thaliana. Computational analysis was performed to identify 85 novel AtTR orthologs from three major plant clades: angiosperms, gymnosperms and lycophytes, which facilitated phylogenetic comparative analysis to infer the first plant TR secondary structural model. This model was confirmed using site-specific mutagenesis and telomerase activity assays of in vitro reconstituted enzyme. The structures of plant TRs are conserved across land plants providing an evolutionary bridge that unites the disparate structures of previously characterized TRs from ciliates and vertebrates. / Dissertation/Thesis / Doctoral Dissertation Biochemistry 2019

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