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Unraveling important genetic associations and differential methylation profiles using reduced genome sequencing in chickens / Desvendando associações genéticas importantes e perfis de metilação diferenciais utilizando sequenciamento reduzido do genoma da galinha

Fábio Pértille 01 November 2016 (has links)
Chickens are ideal model organism to improve understanding of several research areas as phylogenetic, embryology, biomedicine, livestock, and have recently been suggested as a promising model for epigenetic studies. In the livestock area, chickens are source of protein to humans and had been selected to achieve a high production standards based on genetic breeding by the traditional selection. We are now in the genomics and epigenomics era and it is time be concern about the use of new tools to improve selection not only thinking about production, but also in the health and welfare of animals. The use of molecular approaches, have been a fundamental tool to understand biological models and improve selection strategies based on genomic information in breeding programs. Molecular approaches have also contributed to understanding of the evolutionary history of these models and the genetics and epigenetics mechanisms involved in evolution process and genetic diversification of chickens. In this context, many technologies have emerged to produce high-throughput data using Next-generation sequencing (NGS) approaches. NGS provided a large amount of information for diverse purposes such as to detect single nucleotide polymorphisms (SNPs), and methylated DNA profiles in chickens. In addition, NGS has allowed the development of pre-designed SNP arrays for genome-wide association studies (GWAS) with specific phenotypes of interest. Moreover, although NGS has enough power to detect informative polymorphisms, its high cost makes it impractical to be used in GWAS and Methylated DNA immunoprecipitation sequencing (MeDIPseq) studies. The demand for an economical, efficient, simple-step and reliable genome-wide method of SNPs discovery, validation and characterization, was the reason for the development of this study. We applied reduced representation sequence by restriction enzyme (RE) cleavage of target chicken genome to be applied in GWAS. Thereafter, to combine the reduced representation of the genome with MeDIPseq method, we developed a novel approach to perform differential methylation studies using reduced libraries. These works allowed us to identify SNPs associated with performance traits and differential methylation windows related to different stress conditions in chickens. / A galinha é um organismo modelo ideal para melhorar o entendimento de diversas áreas da pesquisa como: filogenética, embriologia, biomedicina, pecuária, e tem sido recentemente sugerida como um modelo promissor para estudos em epigenética. Na pecuária, as galinhas são fonte de proteína para os seres humanos e tem sido alvo de seleção para alcançar um alto padrão de produção com base no melhoramento genético tradicional. Mas agora, estamos na era genômica e epigenômica e as atenções devem ser voltadas para o uso de novas ferramentas para melhorar a seleção não só pensando em produção, mas também na saúde e bem-estar dos animais. O uso de abordagens moleculares, tem sido uma ferramenta fundamental para compreender modelos biológicos e melhorar as estratégias de seleção baseadas na informação genômica em programas de melhoramento. Abordagens moleculares, também tem contribuído para a compreensão da história evolutiva desses modelos e os mecanismos genéticos e epigenéticos envolvidos no processo de evolução e diversificação genética das galinhas. Neste contexto, tecnologias evoluíram para produção de dados de sequenciamento de alto rendimento por sequenciamento de próxima geração (NGS). NGS forneceu uma grande quantidade de informação a ser utilizado para diversos fins, como para detectar polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) e perfis de metilação diferencial do DNA em galinhas. NGS tem permitido também o desenvolvimento de painéis de SNP para testes de associações genômica ampla (GWAS) com fenótipos específicos de interesse. Embora NGS tem poder suficiente para detectar polimorfismos informativos, o seu elevado custo o torna impraticável para ser utilizado em GWAS ou estudos de metilação diferencial por sequenciamento de DNA metilado por imunoprecipitação (MeDIPseq). A procura de um método de genotipagem eficiente, simples, econômico e confiável para descoberta, caracterização e validação de SNPs, foi a razão para o desenvolvimento deste estudo. Utilizamos sequenciamento do genoma reduzido por enzima de restrição (RE) que cliva o genoma alvo para identificação de SNPs nestas bibliotecas reduzidas e aplicação deste método em GWAS. Em seguida, para combinar a representação reduzida do genoma com o método MeDIPS, desenvolvemos uma nova abordagem para a realização de estudos de metilação diferencial utilizando as bibliotecas reduzidas. Estes trabalhos permitiram a identificação de SNPs associados com características de desempenho e janelas de metilação diferencial relacionados a diferentes condições de manejo em galinhas.
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Formulação, aplicação e avaliação de programa de educação em saúde em escola de Visconde de Mauá, distrito de Resende, Rio de Janeiro, RJ / Formulation, implementation and evaluation of health education program in school of Visconde de Mauá, district of Resende, Rio de Janeiro, RJ

Gabriela Nery Faria Guedes 27 July 2011 (has links)
Os cães já fazem parte do cotidiano do homem há milhares de anos. Atualmente, os cães assumem o papel de membros da família, apresentando um forte vínculo com os familiares, incluindo crianças. No entanto, as crianças, assim como a maioria dos adultos, pouco sabem ou aprendem sobre como cuidar de um animal, como prevenir zoonoses ou exercer a Guarda Responsável, propagando uma visão antropocêntrica. O presente trabalho visou mostrar de que maneira a Educação em Saúde pode trazer benefícios na formação ética e psicológica, por melhorar a relação criança-animal, ao mesmo tempo em que reduz a os riscos inerentes às doenças zoonóticas e o abandono de animais. As avaliações foram feitas com a utilização de questionários com questões abertas e fechadas em duas etapas, antes e após o projeto educativo. Para a comparação dos dados quantitativos obtidos nas duas fases, utilizou-se os testes de McNemar e de Homogeneidade Marginal, para análise qualitativa foram realizados grupos focais com crianças e professoras. O projeto educativo proporcionou a aquisição de conhecimento sobre os temas abordados e algumas mudanças de atitudes das crianças com seus animais de companhia, o que pode ser percebido pelo grupo focal e por algumas mudanças estatisticamente significantes entre as fases 1 e 2. / Dogs are already part of everyday life of man for thousands of years. Currently, the dogs take on the role of family members, showing a strong bond with them, including children. However, children as well as most adults know and learn little about caring for an animal, how to prevent zoonoses or promote Responsible Ownership, propagating an anthropocentric view. This study aims to show how health education can bring benefits in the ethical and psychological, by improving the child-animal relationship, while reducing the risks inherent in zoonotic diseases and the abandonment of animals. The evaluations were done with the use of questionnaires with open and closed questions in two stages, before and after the educational project. For comparison of quantitative data obtained in the two phases, we used the McNemar and Marginal Homogeneity tests, for the qualitative analysis was conducted focus groups with children and teachers. The educative project provided knowledge on the topics covered and some changes in attitudes of children with their pets, which could be perceived by the focus group and some statistically significant changes between phases 1 and 2.
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Ferramenta de gestão na pecuária leiteira: análise do investimento em melhorias para o bem-estar de vacas / Dairy Farming Management Tools: analysis of investment to the improvements of the cow\'s welfare

Ana Luiza Mendonça Pinto 30 July 2015 (has links)
Para suprir a crescente demanda pela produção de alimentos de origem animal baseada nos princípios do bem-estar, é importante que produtores de leite bovino se preocupem em identificar pontos fortes e fracos em seu sistema de produção, para que melhorias sejam realizadas, e sua manutenção neste mercado competitivo, favorecida. Sugere-se que há uma complementariedade entre aumento de produção causado por um melhor manejo (nutrição, instalações, controle sanitário etc.) e o aumento no nível de bem-estar animal - BEA. No entanto, percebe-se certa resistência dos pecuaristas para adoção de novas tecnologias e de instrumentos da administração e da gestão de empresas para proporcionar segurança nas tomadas de decisão de seu próprio negócio. Portanto, objetivou-se neste estudo, avaliar o retorno do investimento em melhorias para o bem-estar de vacas leiteiras em sistemas de produção em pasto e em confinamento. A partir da aplicação do protocolo de avaliação Welfare Quality® em seis unidades produtivas de leite bovino no estado de São Paulo, foram identificados pontos críticos de BEA a serem melhorados. Com base em um orçamento para realização dessas melhorias e em referências na literatura, foi estruturado um fluxo de caixa incremental para avaliação dos projetos de investimento em cada sistema produção. De acordo com os resultados obtidos para os parâmetros econômicos payback, valor presente líquido (VPL) e taxa interna de retorno (TIR), ambos os projetos de investimento foram considerados economicamente atrativos. Por fim, visando ao aprofundamento deste estudo, que relaciona aspectos técnicos com a viabilidade econômica na pecuária leiteira, utilizou-se da simulação de modelos de \"bioeconômicos\" para realização da análise de investimento em estratégias isoladas de melhorias. Pode-se concluir que o conjunto dos resultados obtidos de acordo com os três objetivos permitiu associar ferramentas de gestão que integram fatores técnicos, biológicos, sociais e econômicos em sistemas de produção de leite em pasto e em confinamento de acordo com esses estudos de caso. / To meet the growing demand for production of animal-based foods while emphasizing principles of animal welfare, dairy farmers should be motivated to identify the strengths and weaknesses in their production system. By analyzing their production system, improvements can be implemented in order to improve gains in a competitive market. It is suggested that there is a correlation between increased production due to better management of nutrition, facilities, sanitary control etc. with the increased levels of animal welfare (AW). Traditional dairy farmers are reluctant when trying to adopt new technologies and business-management tools which would aide in important decision-making to protect their most valued asset; their own business. Therefore, the objective of this study was to evaluate the return on investment in improvements to the welfare of dairy cows on pasture and in confinement systems. Based on the application of the Welfare Quality® evaluation protocol in six dairy farms in the state of São Paulo, critical points of AW for improvement were identified. Based on a budget to carry out these improvements and with references in available literature, an incremental cash flow for evaluation of investment projects in each of the two production systems was established. According to the results obtained through Payback economic parameters, net present value (NPV) and internal rate of return (IRR), both investment projects were considered economically attractive. Finally, in order to deepen this study which relates technical aspects with economic viability in dairy farming, bioeconomic simulation models were used to conduct the investment analysis in isolated strategies for improvement. Based on the three goas, it can be concluded that the use of tools that integrate technical, biological, social and economic aspects involved dairy production according with this study cases.
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Interação humano-animal na produção de suínos / Human-animal interaction on pig production

Roberta Sommavilla 22 May 2015 (has links)
Objetivou-se comparar os parâmetros comportamentais indicativos de estresse, a qualidade da carne e a influência do enriquecimento ambiental em leitões criados no sistema intensivo confinado, de acordo com a qualidade dos tratamentos recebidos. Para isso, foram utilizados 144 leitões divididos em três grupos que receberam tratamentos distintos: 1) Tratamento Aversivo (TA): pessoa se dirigia aos leitões de forma rude, utilizando tom de voz agressivo e fazendo ameaças posturais; 2) Tratamento Controle (TC): pessoa foi cuidadosa ao se movimentar e usou tom de voz suave; 3) Tratamento Misto (TM): os animais receberam TA durante as fases de maternidade e creche e TC durante as fases de crescimento e terminação. Após o desmame, os leitões foram submetidos a testes para aferir medo e verificar se conseguiam reconhecer seu tratador habitual. Foram observados os comportamentos nas mudanças de ambiente, através de instantâneos de 5 min. Na fase de crescimento/terminação, metade dos animais recebeu enriquecimento ambiental. Após o abate foi realizada a análise da qualidade da carne com relação ao seu pH, temperatura, coloração, perda de água por cocção e exsudação. Variáveis como cortisol, lactato, creatina-fosfoquinase, ganho de peso, conversão alimentar e consumo de ração também foram aferidas. O delineamento experimental foi inteiramente casualizado e para a análise dos dados foi utilizado o procedimento PROC MIXED e GLM do programa estatístico SAS. Leitões que receberam tratamento aversivo apresentaram maior frequência de interações agonísticas na maternidade (P=0,01), creche (P=0,04), crescimento/terminação (P=0,0002) e no pré-abate (P=0,06); além de apresentarem maior frequência de belly-nosing no pós-desmame (P=0,001), maior atividade nos testes de medo (P=0,01), menor tempo (P=0,03) e menor frequência (P=0,005) de contato com o novo objeto. Animais que receberam enriquecimento ambiental apresentaram maior frequência do comportamento exploratório (P=0,01). Não houve diferença no ganho de peso, nas análises de qualidade de carne e de sangue (P>0,05), exceto para lactato que apresentou concentrações mais elevadas para animais tratados de forma aversiva (P<0,05). Leitões tratados de forma aversiva demonstraram um padrão comportamental indicando o elevado estresse. A simples cessação deste tratamento não parece ser suficiente para que os animais retomem o padrão comportamental comum à espécie, indicando um efeito residual do tratamento recebido anteriormente. Além disso, estes animais são mais medrosos à novidade, ao isolamento social e ao tratador aversivo. Mesmo não havendo diferença de desempenho e qualidade de carne, estes resultados indicam um empobrecimento do bem-estar desses animais. Por outro lado, quando cessado o tratamento aversivo e adicionado o enriquecimento ambiental, os efeitos residuais do estresse sofrido nas primeiras fases de vida foram suprimidos e os animais apresentaram uma melhoria na resposta ao estresse e no seu bem-estar. / The aim of this work was to compare the behavioral parameters indicative of stress, meat quality and the influence of enrichment in pigs housed in intensive confined system, according to the quality of the treatment received. For this, 144 piglets were separated in three groups with different treatment: 1) Aversive (TA): the person responsible for the treatment was rude with the animals, used an aggressive tone of voice and moved harshly and unpredictably; 2) Control (TC): the person responsible for this treatment was careful to move around as was using a soft tone of voice; 3) Mixed (TM): the animals received TA during farrowing room and nursery, and with TC during growing and finishing phase. After weaning, piglets were tested to assess fear and if they could recognize its usual handler. Behavioral time budgets at each change of phase, was registered by scan sampling every 5-min. In the growing-finishing phase half of the animals received environmental enrichment. After slaughter, meat quality was analysed in relation to their pH, temperature, colour, drip loss, water holding capacity e tenderness. Variables such as cortisol, creatine phosphokinase, weight gain, feed conversion and consumption of solid food were also assessed. The experimental design was randomized and to analyse the data, we used PROC MIXED and GLM procedure of SAS statistical program. Animals TA had more frequency of agonistics interactions at farrowing room (P=0.01), nursery (P=0.04), growing/finishing phase (P=0.0002) and at the day before the slaughter (P=0.06); in addition they had higher frequency of belly-nosing after weaning (P=0.001), higher activity on fear tests (P=0.01), lower time (P=0.03) and lower frequency (P=0.005) of a contact with the novel object. Animal that received environmental enrichment showed more frequency of exploratory behaviour (P=0.01). No difference was found on weight gain, meat quality and blood analysis (P>0.05), but to lactate that was higher to aversive treatment animals (P<0.05). Piglets that received an aversive treatment showed behavioral patterns indicative of higher stress. Finishing the aversive treatment was not enough to this animal restoring their behavioral pattern, indicating a residual effect of the aversive treatment. In addition, these animals were more fearful to novelty, social isolation and the aversive handling. Although there is no difference in performance and meat quality, the results show a poor animal welfare. In other hand, when the treatment was finished and an environmental enrichment was introduced, the residual effect of stress of the farrowing room and nursery were supressed and piglets showed an improvement of behavioral pattern and animal welfare.
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Bagaço de cana como enriquecimento ambiental para leitões recém desmamados / Sugarcane bagasse as environmental enrichment for recently weaned piglets

Lina Fernanda Pulido Rodríguez 12 February 2016 (has links)
O objetivo do estudo foi avaliar o uso de bagaço de cana como enriquecimento ambiental para suínos a partir do comportamento e respostas fisiológicas do estresse causado pelo confinamento e mudança de ambiente, na fase de creche. O projeto foi conduzido no Laboratório de Biometeorologia e Etologia, da Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos da Universidade de São Paulo, Pirassununga-SP, e no setor da Suinocultura da Prefeitura do Campus Administrativo Fernando Costa (PUSP-FC), entre os meses de abril e junho de 2015. Foram utilizados 66 leitões (NK75 X Naïma), machos e fêmeas desmamados aos 28 dias, separados em grupos homogêneos com relação ao peso, transferidos para baias da creche e distribuídos em dois tratamentos: Tratamento Enriquecido (TE) onde as baias foram fornecidas com cama profunda de bagaço de cana, de até 15 cm de profundidade e Tratamento Não Enriquecido (TNE) as baias foram utilizadas da forma convencional, sem cobertura no piso cimentado. Foram avaliadas diferentes respostas fisiológicas, especificamente, níveis de cortisol salivar, temperatura superficial por meio de um termómetro infravermelho e temperatura ocular a través de fotos termográficas. O comportamento dos leitões foi registrado e as análises das observações das atividades foram realizadas pelo efeito dos tratamentos e a interação do tempo. Os dados de desempenho dos animais foram analisados, igualmente como o Ganho de peso diário (GPD) e a conversão alimentar (CA). Animais que receberam enriquecimento ambiental apresentaram concentrações de cortisol mais baixas (P&LT;0,001) durante a primeira semana pós-desmama. A partir da segunda semana pós desmama até o final da fase da creche houve efeito do tratamento (P&LT;0,05), encontrando níveis de cortisol até quatro vezes mais altos para o TNE referentes aos níveis basais, enquanto o TE continua tendo níveis mais baixos (P&LT;0,05). Animais que receberam enriquecimento ambiental tiveram maior frequência em comportamentos exploratórios (P&LT;0,05) e maior atividade brincando (P&LT;0,05) durante toda a fase experimental. Leitões que foram criados em baias pobres manifestaram maior frequência em comportamentos agonísticos (P&LT;0,05) e em repouso (P&LT;0,05). A correlação entre a temperatura superficial do dorso e termografia ocular indicou uma associação moderada positiva (P&LT;0,0001) com a temperatura ocular mínima (r=0,43) e máxima (r=0,41). Apesar de não existir diferença estatística para o desempenho entre tratamentos (P&GT;0,05), o TE apresentou maior ganho de peso diário (0,47±0,015 kg.dia-1) e total (23,47±0,73 kg.dia-1). A conversão alimentar foi maior no TE (2,88±0,25), provavelmente porque os leitões precisavam de mais alimento para compensar a energia gasta pela sua atividade de fuçar e brincar. Ambientes enriquecidos durante a fase da creche melhoram o bem-estar dos animais em confinamento, diminuindo o estresse pela desmama, motivando o animal a expressar comportamentos próprios da espécie suína, tais como fuçar e explorar. / The aim of the study was to evaluate the use of sugarcane bagasse as environmental enrichment for pigs by analyzing the behavioral and physiological responses to stress caused by confinement and change of environment at the nursery phase. The project was conducted in Biometeorology and Ethology Laboratory, Faculty of Animal Science and Food Engineering, University of São Paulo, Pirassununga-SP, in the Swine sector of the Administrative Campus of Fernando Costa (PUSP-FC), from April to June, 2015. Sixty-six piglets (NK75 X Naïma), males and females weaned at 28 days were used in the study. the animals were separated in homogeneous groups respecting the weight, transferred to the nursery stalls and distributed into two treatments: Enriched Treatment (TE) the stalls were provided with deep bed of sugarcane bagasse, up to 15 cm deep and Enriched Treatment (TNE) the stalls were used in the conventional way, without coverage in the cemented floor. Different physiological responses were evaluated, specifically salivary cortisol levels, surface temperature by means of an infrared thermometer and temperature eyepiece through thermography images. The behavior of piglets were recorded and analysis of observations of the activities were carried out by the effect of the treatments and the interaction time. The animal performance data were analyzed also as daily weight gain (ADG) and feed conversion (CA).The animals that received environmental enrichment showed lower cortisol concentrations (P&LT;0.001) during the first post-weaning. From the second week after weaning until the end of the nursery phase, there was effect of treatment (P&LT;0.05), with four times higher cortisol levels to NET related to the baseline, and the ET for this phase continues to have lower levels (P&LT;0.05). The ones that received environmental enrichment had higher frequency in exploratory behaviors (P&LT;0.05) and playing activity (P&LT;0.05) throughout the whole experimental period. The piglets created in poor stalls had higher frequency of agonistic behavior (P&LT;0.05) and at rest (P&LT;0.05). The correlation between the dorsal\' surface temperature and ocular thermography indicated a moderate positive association (P&LT;0.0001) with the minimal eye temperature (r = 0.43) and maximum (r = 0.41). Although there is no difference statistical in performance between treatments (P&GT;0.05), ET showed higher daily gain (0,47±0,015 kg.dia-1) and total (23,47±0,73 kg.dia-1). weight. Feed conversion was higher in ET (2,88±0,25), probably because the piglets needed more food to compensate the energy used for its poke around and exploratory activities. Enriched environments during the nursery phase improve the animals\' welfare in confinement, reducing stress by weaning, prompting the animal to express specific behaviors of the species such as poke around and explore.
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Comportamento de tamanduá-mirim, Tamandua tetradactyla (Linnaeus,1758) (Pilosa, Myrmecophagidae) em condições de cativeiro: implicações ao bem-estar

Catapani, Mariana Labão 29 September 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T19:32:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 6437.pdf: 1304228 bytes, checksum: 6a94b74cbfe10355838841d18bf0acf6 (MD5) Previous issue date: 2014-09-29 / Universidade Federal de Sao Carlos / Modern zoos have an important role to play in conservation and there is a growing concern for animal welfare, not only by the expectation of the public , but also by increasing knowledge about the needs of animals in captivity . Increase the available alternatives of choice for the animal, the richness of his social life , the availability of new items in the room, the opportunities it has to perform more natural behaviors for the species are some of the strategies that are assumed to promote high levels welfare ( Young, 2003) .In this context, environmental enrichment techniques are developed . The social enrichment is one of the most durable types of enrichment, since the predictability and habituation are less likely to happen than with most other types of enrichment. The social environment of many species is a constant source of mental stimulation, with a complex and hard to be replaced by any other form of environmental enrichment ( Humphrey , 1976) variety. Thus, a factor considered important for the welfare of captive social animals is the presence of conspecifics sharing the same enclosure, but the social housing solitary species has received little attention from scientists in terms of their implications for the welfare. This study investigated the effect of different conditions of social housing on the behavior s display for 10 lesser anteaters ( Tamandua tetradactyla ) on captivity. It was found that paired animals were more active, showed more records of typical behavior and a greater variety of behaviors than the animals housed individually. These results suggest that contact with conspecifics in captive conditions can promote higher levels of psychological well -being for these animals. / Os zoológicos modernos têm uma função importante a desempenhar na conservação e há uma preocupação cada vez maior com o bem-estar animal, não só pela expectativa do público, como também pelo aumento do conhecimento sobre as necessidades dos animais em cativeiro. Aumentar as alternativas disponíveis de escolha para o animal, a riqueza de sua vida social, a disponibilidade de novos itens no recinto, as oportunidades que ele tem para executar comportamentos mais naturais para a espécie são algumas das estratégias que são assumidas para se promover altos níveis de bem-estar (Young, 2003). Nesse contexto, são desenvolvidas técnicas de enriquecimento ambiental. O enriquecimento social é um dos mais duradouros tipos de enriquecimento, já que a previsibilidade e a habituação são menos prováveis de acontecerem do que ocorre com a maioria dos outros tipos de enriquecimento. O meio social de muitas espécies representa uma fonte constante de estimulação mental, com uma complexidade e variedade difícil de ser substituída por qualquer outra forma de enriquecimento ambiental (Humphrey, 1976). Assim, um fator considerado importante para o bem-estar de animais sociais cativos é a presença de coespecíficos compartilhando o mesmo recinto, mas o alojamento social de espécies solitárias tem recebido pouca atenção por parte dos cientistas em termos de suas implicações para o bem-estar. Este estudo investigou o efeito de diferentes condições de alojamento social sobre o comportamento exibido por 10 tamanduás-mirins (Tamandua tetradactyla) cativos. Verificou-se que os tamanduás pareados se mostraram mais ativos, apresentaram mais registros de comportamentos típicos da espécie e uma variedade maior de comportamentos executados do que os animais alojados individualmente. Estes resultados sugerem que o convívio com coespecíficos em condições de cativeiro pode promover melhores níveis de bem-estar psicológico para estes animais.
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Ambiência em galpões de criação de frangos de corte na região de Fortaleza – CE / Ambience in sheds creation of broiler chickens in the region of Fortaleza - CE

Brasil, Daniel de Freitas January 2013 (has links)
BRASIL, Daniel de Freitas.Ambiência em galpões de criação de frangos de corte na região de Fortaleza – CE. 2013. 114 f. : Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Ceará, Centro de Ciências Agrárias, Departamento de Engenharia Agrícola, Programa de Pós-Graduação em Engenharia Agrícola, Fortaleza-CE, 2013. / Submitted by demia Maia (demiamlm@gmail.com) on 2016-06-17T16:43:45Z No. of bitstreams: 1 2013_dis_dfbrasil.pdf: 3730477 bytes, checksum: 18b21d1ad2d7cd2ba6a4fd405f0c54f9 (MD5) / Approved for entry into archive by demia Maia (demiamlm@gmail.com) on 2016-06-17T16:44:37Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_dis_dfbrasil.pdf: 3730477 bytes, checksum: 18b21d1ad2d7cd2ba6a4fd405f0c54f9 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-17T16:44:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_dis_dfbrasil.pdf: 3730477 bytes, checksum: 18b21d1ad2d7cd2ba6a4fd405f0c54f9 (MD5) Previous issue date: 2013 / The Brazilian poultry production has been highlighted among the other areas of the national agribusiness. This enhanced notoriety is the result of research in genetic improvement, nutrition and reproduction, which in recent years are being integrated into studies of ambience and animal welfare. So, the interactions that occur between animals and the different production environments are fundamental factors in order to have better production rates. Therefore, the main objective of this research was to monitor, in real production conditions, two different commercial sheds in their dimensions during the two main seasons in the Northeast (wet and dry), through the constant monitoring of environmental variables (temperature and humidity relative air) and rectal temperature check, beyond a verification of artificial shading techniques for improving the productive environment. The two sheds were monitored since the arrival until exit of the animals, being considered the morning and afternoon as those that generate the greatest comfort and thermal stress, respectively. To obtain a profile of environmental variables over the facilities, mini-stations and data loggers were installed on both sheds, allowing to know the microclimate for which the birds were subjected, as well as viewing of the profile of enthalpy Comfort Index (IEC), which allowed the classification of sheds in accordance with the limits of thermal comfort for broilers from first to sixth week of life. The data of temperature, relative humidity and IEC over the sheds were statistically analyzed and the means compared by Tukey test at 5% of significance. Thus, it was possible to observe that in both seasons, the first two weeks of bird life, the sheds had similar characteristics and along the production chain the different facilities perform distinct influences on animals, and the larger shed the most feasible to the creation of these birds. In addition, it was also found that the use of shading techniques may be a good way to improve the ambience of the sheds causing the locations considered lethal may transform into a suitable microclimatic, reducing the amount of dead birds, increasing productivity and animal welfare, which consequently improves the quality of the final product. / A produção avícola brasileira vem se destacando dentre as demais áreas do agronegócio nacional, este sucesso é fruto de pesquisas em ambiência que estão cada vez mais integradas aos estudos em melhoramento genético, nutrição e reprodução. Hoje se sabe que as interações que ocorrem entre os animais e os diferentes ambientes de produção são fatores fundamentais para o desempenho produtivo. Desta forma, o objetivo principal desta pesquisa foi comparar, em condições reais de produção, dois galpões comerciais distintos quanto suas dimensões, nas duas principais estações do ano nordestinas (chuvosa e seca). Esta comparação foi realizada através do monitoramento constante das variáveis ambientais (temperatura e umidade relativa do ar) e da verificação da temperatura retal das aves. Técnicas de sombreamento artificial visando a melhoria do ambiente produtivo também foram analisadas neste estudo. Para a obtenção de um perfil das variáveis ambientais nas instalações, miniestações meteorológicas e data loggers foram instalados ao longo dos galpões, o que permitiu conhecer o microclima e o perfil do Índice Entalpia de Conforto (IEC), possibilitando assim a classificação das instalações de acordo com os limites de conforto térmico da primeira à sexta semana de vida dos animais. Os dados de temperatura, umidade relativa e do IEC ao longo dos galpões foram analisados estatisticamente sendo as médias comparadas pelo teste de Tukey a 5% de significância. Com isto, foi possível observar que a ambiência dos galpões se altera de acordo com o dimensionamento, nível de interação com o ambiente e idade dos animais. O menor galpão obteve um melhor desempenho térmico para aves jovens e o maior galpão se mostrou mais confortável termicamente para aves que se encontravam ao final do ciclo produtivo. Foi possível concluir também que a temperatura retal é uma boa ferramenta para análise do ambiente ao qual os animais estão sujeitos, além de constatar que o sombreamento artificial é um bom artifício para a melhoria do ambiente interno da instalação.
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Comportamento animal e atributos fisiológicos de vacas leiteiras submetidas a ambientes com e sem sombreamento durante a estação quente / Animal behavior and physiological attributes of dairy cows subjected to environments with and without shade during the warm season

Vizzotto, Elissa Forgiarini January 2014 (has links)
O ambiente físico tem grande importância na fisiologia do animal, influenciando a reprodução e produção. Com as mudanças climáticas e o melhoramento genético dos animais, com ênfase no aumento da produtividade por animal, os animais passaram a sofrer mais com as altas temperaturas, alterando seu comportamento e seu bem estar. O objetivo deste trabalho foi avaliar o comportamento social e ingestivo e atributos fisiológicos de vacas leiteiras durante a estação quente, com ou sem acesso à sombra. O estudo foi conduzido em Lages, SC, utilizando 14 vacas lactantes em pastejo, as quais foram divididas em dois grupos, permanecendo um grupo somente no sol sem acesso à sombra e o outro em ambiente com sombreamento. Foram observados os comportamentos ingestivo e social dos animais das 07:30 ( GMT -2:00) às 23:00h (GMT-2:00), em intervalos de 10 minutos, totalizando 650min. As frequências respiratória e cardíaca, temperatura corporal das vacas e número de movimentos ruminais foram avaliados diariamente. Os dados do comportamento animal foram previamente padronizados e posteriormente, submetidos à análise multivariada, incluindo as análises de fatores principais de agrupamento, avaliação das variáveis que determinaram os agrupamentos por análise discriminante e canônica, utilizando o programa estatístico SAS 9.2. Os grupos diferiram principalmente quanto ao número de eventos de ingestão de água, competição por sombra e número de interações agressivas, aos tempos despendidos em ócio total, ócio em pé, de permanência perto do bebedouro, frequência respiratória e cardíaca, temperatura corporal, número de movimentos ruminais, escores de ofegação às 15 (GMT -2:00) e às 19 (GMT -2:00) horas e tolerância ao calor. No entanto os grupos de animais não diferiram quanto aos tempos gastos caminhando de cabeça alta, caminhando de cabeça baixa, em estação, número de eventos de competição por água no bebedor e os dados zootécnicos de dias em lactação, ordem de parto e produção de leiteira. O fornecimento de sombra na área de pastejo mesmo em condições moderadas de estresse térmico alterou positivamente os atributos fisiológicos e comportamentais. A severidade do estresse, percebida pela alteração dos atributos fisiológicos, alterou distintamente o comportamento social e ingestivo. / The physical environment, has a great importance on animal physiology affecting breeding and production. Due to climate change and animal breeding, which enphasizes higher production per animal, animals might get heat stressed from high temperatures, changing their behavior and their welfare. This study was performed to assess the social and feeding behavior and physiological attributes of dairy cows during the warm season with or without access to shade. The study was conducted in Lages, SC, using 14 lactating cows at grazing. These animals were divided into two groups, one group remained under the sunlight, without access to shade, while the other group was kept in shade-provided environment. Ingestive and social behavior of animals was observed from 7:30 (GMT -2:00) to 23:00 (GMT -2:00), registered at 10-minutes interval totaling 650 minutes. Respiratory and heart rate, body temperature and number of ruminal movements were assessed daily. The data of animal behavior were standardized using the standard procedure and then were subjected to multivariate analysis, including the analysis of key factors (PROC FACTOR), cluster analysis (PROC FATSCLUSTER AND PROC CLUSTER), evaluation of variables that determined groups by discriminant analysis and canonical, using SAS 9.2 statistical software. The groups differed mainly on the number of events of swallowing water, shade and competition for number of aggressive interactions, the time spent in complete idleness, loitering foot, staying near the water cooler, respiratory and heart rate, body temperature, number of ruminal movements, panting scores at 15 (GMT-2:00) and 9 (GMT-2:00) hours, heat tolerance. However animal groups did not differ regarding time spent walking head high, walking head down, season, number of events per water drinker and competition in the production data of days in milk, parity order and production of milk. The provision of shade in the paddocks, even under moderate heat stress, altered positively physiological and behavioral attributes. The stress severity, noticed by the change of physiological attributes, changed distinctly social and feeding behavior.
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Cortisol sanguíneo e qualidade de carcaças de frangos abatidos pelo método halal ou com insensibilização por eletronarcose / Blood cortisol and carcass quality of broilers slaughtered by halal method or stunned by electronarcosis

Mendes, Paulo Vinícius da Costa [UNESP] 18 December 2015 (has links)
Submitted by PAULO VINICIUS DA COSTA MENDES null (paulo.vinicius@agricultura.gov.br) on 2016-01-12T15:07:48Z No. of bitstreams: 1 Tese_Paulo_Vinícius_da_Costa_Mendes Final.pdf: 1356940 bytes, checksum: c8fc9784d2919dca33f00dfd2e245cf6 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Paula Grisoto (grisotoana@reitoria.unesp.br) on 2016-01-12T15:43:57Z (GMT) No. of bitstreams: 1 mendes_pvc_dr_jabo_int.pdf: 1356940 bytes, checksum: c8fc9784d2919dca33f00dfd2e245cf6 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-12T15:43:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 mendes_pvc_dr_jabo_int.pdf: 1356940 bytes, checksum: c8fc9784d2919dca33f00dfd2e245cf6 (MD5) Previous issue date: 2015-12-18 / O Brasil é o maior exportador e terceiro maior produtor de frangos de corte, posição de destaque decorrente do atendimento das demandas de mercados consumidores que possuem exigências incisivas, com investimentos em sustentabilidade ambiental e bem-estar animal. Os países de religião islâmica têm considerável importância para as exportações brasileiras. Este trabalho teve por objetivo avaliar o cortisol sanguíneo e a qualidade da carcaça de frangos abatidos pelo método Halal – próprio ao atendimento desse mercado, sem insensibilização, conforme requerido pela religião islâmica e compará-los aos insensibilizados por eletronarcose, de acordo com normais humanitárias de abate. Foram realizadas dosagens séricas de cortisol sanguíneo utilizando kit comercial, em frangos abatidos em frigorífico com SIF na região sudoeste do estado de Goiás, para avaliar o estresse imediato, ou seja, no momento do abate, e o delineamento experimental foi inteiramente casualizado. Avaliou-se também a qualidade de carcaça dos animais abatidos por ambos os métodos, procurando identificar alterações da pele, anexos, musculatura, ossos e articulações que evidenciem o não atendimento das normas de bem-estar animal, depreciando, portanto a qualidade da carcaça. Verificou-se que houve diferença estatística entre os diferentes métodos de abate, evidenciando menor nível de estresse dos animais, pelo método Halal e superior qualidade de carcaças com a utilização de prévia insensibilização por eletronarcose, seguido de sangria automática. Conclui-se que do ponto de vista de bem-estar animal, ambos os métodos de abate ainda oferecem desafios a serem compreendidos e superados. O método tradicional de abate parece atender mais adequadamente os preceitos de bem-estar animal devido o emprego da insensibilização dos animais, embora uma série de tecnopatias possa depreciar a qualidade de carcaças. / Brazil is the largest exporter and third largest producer of broiler chickens, prominent position due to the meet the demands of consumers markets with incisive requirements, with investments in environmental sustainability and animal welfare. The countries of Islam have considerable importance for Brazilian exports. This study aimed to assess blood cortisol and chicken carcass quality slaughtered by the Halal method - own service this market without stunning, as required by Islam and compare them to numb by electro, according to humanitarian normal slaughter. Serum levels of blood cortisol using a commercial kit was performed in chickens slaughtered in fridge with SIF in the southwest region of the state of Goiás, to assess the immediate stress, ie at the time of slaughter, and the experimental design was completely randomized. Also evaluated the quality of animal housing slaughtered by both methods, trying to identify skin changes, attachments, muscles, bones and joints that show non-compliance with the animal welfare standards, depreciating therefore the carcass quality. It was found that there was a statistical difference between the different methods of slaughter, presenting a lower stress level of the animals, the method Halal and higher quality castings with the use of prior stunning for electro, followed by automatic sangria. We conclude that the animal welfare point of view, both slaughter methods still offer challenges to be understood and overcome. The traditional method of killing seems to take better account of animal welfare provisions due to the use of stunning animals, although a number of tecnopatias can depreciate the quality of carcasses.
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Impacto do estresse no bem-estar dos animais e na qualidade da carcaça e da carne / Stress impact on animal welfare, carcass and meat quality

Borges, Tâmara Duarte [UNESP] 22 January 2016 (has links)
Submitted by TÂMARA DUARTE BORGES null (tamaratdb@hotmail.com) on 2016-02-22T11:38:12Z No. of bitstreams: 1 Tese_Tâmara Duarte Borges.pdf: 2330017 bytes, checksum: 40cdedc15a0e965079344e45edef95e9 (MD5) / Approved for entry into archive by Juliano Benedito Ferreira (julianoferreira@reitoria.unesp.br) on 2016-02-22T20:01:09Z (GMT) No. of bitstreams: 1 borges_td_dr_jabo.pdf: 2330017 bytes, checksum: 40cdedc15a0e965079344e45edef95e9 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-02-22T20:01:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 borges_td_dr_jabo.pdf: 2330017 bytes, checksum: 40cdedc15a0e965079344e45edef95e9 (MD5) Previous issue date: 2016-01-22 / No primeiro capítulo da tese é apresentada uma revisão bibliográfica sobre o assunto, trazendo à tona conceitos importantes sobre estresse e bem-estar animal juntamente com resultados práticos de pesquisas que servem como exemplos dos efeitos do manejo pré-abate de bovinos e do estresse térmico em suínos. O capítulo dois tem como objetivo principal apresentar os fatores de risco associados ao manejo pré-abate de bovinos que estariam relacionados à presença de hematomas e alto pH da carne. As avaliações foram realizadas em dois frigoríficos da região sudeste do Brasil, considerando 15 variáveis medidas durante o manejo pré-abate, utilizando-se 27 661 bovinos. Para transporte, o tipo de veículo, duração da viagem e condições das rodovias foram mensuradas. No desembarque, o tempo de espera para desembarcar os animais, o número de animais que chegaram deitados no caminhão, as batidas lateral e dorsal dos animais contra estruturas do caminhão, a frequência de quedas e o uso de bastão elétrico foram avaliados. Durante o manejo de condução dentro do frigorífico avaliou-se as frequências de quedas dos animais, batidas contra os portões de manejo, uso do bastão elétrico, animais feridos e pisoteados e tamanho do lote conduzido. A frequência e localização dos hematomas nas carcaças e os valores de pH também foram mensurados, juntamente com as categorias animais. Os resultados indicaram alta porcentagem de hematoma nas carcaças (64,14% no frigorífico 1 [F1] e 72,16% no frigorífico 2 [F2]). Também foi encontrada alta porcentagem de pH24 acima de 5,8 (17,67% (F1); 20,30% (F2)). A categoria animal vaca obteve maiores médias de hematomas. Animais transportados por caminhões dois andares, por longas distâncias (mais de 5 horas de viagem) e em condições ruins de estrada obtiveram maiores médias de hematomas também. Durante o desembarque e manejo dos animais dentro do frigorífico, quedas demostraram um efeito claro em hematomas e a utilização de bastão elétrico, juntamente com o tamanho do grupo de manejo causaram efeito negativo no pH da carne. O capítulo três teve por objetivo estudar o efeito do estresse por calor em suínos na fase de crescimento e terminação, avaliando o desempenho, sujidade e qualidade da carcaça e carne, testando dois tipos de competição por alimento (um ou dois comedouros para quatro animais) e dois tipos diferentes de piso (30% slat ou 100% slat). Os principais resultados encontrados foram que animais em situações de estresse por calor ou alojados em pisos 100% slat tiveram menor ganho de peso na fase final de terminação. Animais em baias com comedouro simples tiveram maiores ganhos de peso nas fases de crescimento e terminação. Quanto à sujidade, animais alojados em pisos 30% slat e em situações de estresse por calor foram os mais sujos. A porcentagem de magro foi maior em animais sobre condições térmicas de controle em comparação aos sob estresse térmico. Escatol e indol foram mais altos em carnes de animais previamente alojados em situações de estresse e o indol também foi mais alto em animais alojados em pisos 30% slat. / The first chapter presents a literature review, bringing up important concepts about stress and animal welfare using practical results of pre-slaughter handling in cattle and thermal stress management in pigs. Chapter two presents the risk factors associated with transport and pre-slaughter handling in cattle with impact on presence of bruising and high pH meat. The evaluations were performed on two slaughterhouses located in southeastern of Brazil, considering 15 variables measured using 27,661 cattle. For transport, the type of vehicle, journey duration and road condition were assessed. For unloading, the time spent in the queue to unload the animals, number of animals lying in the truck, back and lateral hits at the truck´s door, frequency of animals that fell down and were electric prodded were evaluated. During handling procedures the frequencies of animals that fell down, that were hit by the gate, that were electric prodded and the occurrence (yes or no) of injured and trampled animals in the lot, and the number of animals per handling group were measured. Frequency and location of bruises in the carcasses and meat pH were assessed, as well the animal´s categories.The results indicated a high percentage of carcass with at least one bruise (64.14% [S1] and 72.16% [S2]) and a high percentage of meat pH greater than 5.8 (17.67% [S1] and 20.30% [S2]). Cows were the category with higher number of bruises. Double decker was the type of vehicle with high risk of bruises. Animals transported for long journeys (up to 5 hours) and in poor road conditions had higher number of bruises too. During unloading and driving procedures, falls had a clear effect in bruises, and electric prod use had an effect in meat pH. Number of animals per handling group also affected meat pH. In chapter three a pig heat stress study was performed during growing and finishing period, evaluating performance, dirt and meat quality, testing two types of feeders (single or double feeder for 8 animals) and two different types of floor (30% slat or slat 100%). The main findings were that animals under heat stress and housed in floors 100% slat had less weight gain in the finishing phase. Animals in pens with one feeder had greater weight gain during growing and finishing period. Animals housed under heat stress and 30% slat floors were dirtiest than the other treatments. Lean meat percentage was high for animals on thermal control conditions than heat stress. Skatole and indole were higher in meat from animals previously housed in stressful situations and indole was also higher in animals housed in 30% slat floors.

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