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Filogenia molecular e biogeografia de Psomophis Myers & Cadle 1994 e a história da diagonal de áreas abertas neotropicais

Tedeschi, Leonardo Gonçalves 03 1900 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, 2013. / Submitted by Elna Araújo (elna@bce.unb.br) on 2013-07-30T00:36:52Z No. of bitstreams: 1 2013_LeonardoGoncalvesTedeschi.pdf: 6646655 bytes, checksum: 2b27d54032da35b51493f69bd3c4a3c3 (MD5) / Approved for entry into archive by Luanna Maia(luanna@bce.unb.br) on 2013-07-30T12:18:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_LeonardoGoncalvesTedeschi.pdf: 6646655 bytes, checksum: 2b27d54032da35b51493f69bd3c4a3c3 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-07-30T12:18:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_LeonardoGoncalvesTedeschi.pdf: 6646655 bytes, checksum: 2b27d54032da35b51493f69bd3c4a3c3 (MD5) / A diagonal de áreas abertas separa os dois grandes blocos de formações florestais da América do Sul, Floresta Amazônica e Mata Atlântica, e é formada pela união de três conjuntos de formações vegetacionais no centro do continente: Caatinga, Cerrado e Chaco. Estas regiões possuem uma herpetofauna diversa e com muitas espécies endêmicas. O gênero de serpentes Psomophis é composto por três espécies (P. joberti, P. genimaculatus e P. obtusus) e está amplamente distribuído nesta região. Entretanto, dados precisos de ocorrência dos organismos são escassos, e o processo de diversificação das biotas nestas regiões ainda é pouco compreendido. O presente trabalho objetiva estudar as relações de parentesco e a biogeografia de Psomophis, contribuindo para compreender a biogeografia da diagonal de áreas abertas neotropicais. As relações intra e interespecíficas do grupo foram inferidas a partir das sequências dos genes 12S, 16S, C-mos e NGFB. As análises filogenéticas foram realizadas pelos métodos de máxima verossimilhança e inferência bayesiana. Utilizamos os pontos de coordenadas geográficas das três espécies, obtidos de literatura taxonômica e de exemplares depositados em museus para elaboração de mapas e análises biogeográficas. Modelos de distribuição potencial foram realizados para cada espécie, utilizando as variáveis bioclimáticas recentes da região neotropical. A partir destes dados, foram confeccionados mapas de distribuições realizadas e potenciais das espécies e linhagens. Finalmente, analisamos as identidades de nicho para cada clado, assim como a existência de uma barreira biogeográfica atual em suas distribuições. Realizamos ainda uma análise de relógio molecular relaxado para estimar o tempo de divergência de cada espécie. As áreas ancestrais de cada clado foram obtidas com base em inferência bayesiana implementada no programa Rasp. Os principais parâmetros de diversidade genética foram calculados para P. joberti e a relação entre os haplótipos foi obtida por median-joining. As espécies de Psomophis apresentaram baixa diversidade intraespecífica, alta diferenciação interespecífica e monofiletismo recíproco. A divergência do gênero data do Oligoceno Médio (~30 Ma) e as divergências entre as espécies foram datadas entre o meio e final do Mioceno (~13-7 Ma). Psomophis é encontrado em toda a extensão da diagonal de áreas abertas e em áreas adjacentes, como a região dos Pampas. Cada espécie apresenta relação com uma ou duas grandes formações vegetacionais inseridas nesta diagonal. Pela análise de identidade de nicho, obtivemos divergências significativas entre cada espécie e a indicação da existência de barreiras entre a distribuição das espécies de Psomophis. Observamos que a possível área ancestral do grupo esta na região ao sul do Chaco e norte dos Pampas. Ainda, o segundo evento de cladogênese no grupo provavelmente se deu em razão do surgimento da depressão do alto Paraguai, entre o Cerrado e Chaco, onde atualmente se situam as baixadas do Pantanal. O padrão de distribuição e diferenciação do grupo corrobora a hipótese de regionalização que postula a inclusão dos Pampas e Monte como áreas da província Chaquenha, junto com Cerrado, Chaco e Caatinga. O padrão observado, também, indica uma maior relação do Cerrado com Chaco com populações relictuais na região da Caatinga. Finalmente, este trabalho inclui uma compilação completa de dados moleculares e de distribuição e portanto é o mais significativo sobre Psomophis desde a sua descrição. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The South American arid diagonal occurs between two large blocks of forest formations, Amazon and Atlantic Forest, and is formed by three open vegetation regions in the center of the continent: Caatinga, Cerrado and Chaco. These regions have a diverse herpetofauna and many endemic species. The genus of snakes Psomophis comprises three species (P. joberti, P. genimaculatus, and P. obtusus) and is widely distributed in this region. However, their relationships and distribution are still poorly understood. The present work aims to study the evolutionary relationships and biogeography of Psomophis to bring new data about the biogeography the South American open diagonal. For estimating the intra- and interspecific relationship we used molecular data from the genes 12S, 16S, C-mos and NGFB. Phylogenetic analyses were performed by maximum likelihood and Bayesian inference. We used geographic coordinates points of the three species for mapping and performing biogeographic analyses. These point locality records were obtained by checking taxonomic literature and localities of verified specimens deposited in museums. The estimation of potential distributions was performed for each species, using recent bioclimatic variables for the Neotropical region. Based on these models we built observed and potential distribution maps. Finally, we analyzed niche identities for each pair of species, as well as the presence of biogeographical barriers between current distributions. We also performed a relaxed molecular clock dating to estimate the divergence time of each species. The ancestral area of each clade was inferred based on Bayesian analyses implemented in the software Rasp. Measures of genetic diversity were estimated for P. joberti and the relationship between haplotypes was obtained by median-joining. The species of Psomophis showed low intraspecific diversity and high interspecific differences with high supported reciprocal monophyly. The divergence date of the genus was estimated in the Oligocene (~ 30 Ma) and the differences between species were dated from the middle to late Miocene (~ 13 - 7 Ma). Psomophis is found throughout the South American arid diagonal and in adjacent areas, such as the Pampas region. Each species is associated to one or two major vegetation formations included in this diagonal. We obtained significant niche identity differences between each species and indications that there are barriers between species distributions. The probable ancestral area of this group is between southern portions of the Chacos and northern part of the Pampas. The second divergence event in the group probably occurred between Cerrado and Chaco, after the subsidence of the Upper Paraguay depression, in the Pantanal lowlands. The distribution pattern and differentiation of the group supports the hypothesis that Pampas and Monte regions should be included as a biogeographical unit along with Cerrado, Chaco and Caatinga (the Chacoan region of Morrone). The observed pattern also indicates a close relationship between Cerrado and Chaco with only relictual, isolated populations in the Caatinga. Finally, we presented here a comprehensive compilation of molecular and distribution data, and therefore this is the most significant study about Psomophis since its description.
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Diversidade e distribuição de trepadeiras em um mosaico de ambientes florestais de um morro granítico subtropical

Durigon, Jaqueline January 2010 (has links)
Com o objetivo de descrever a composição florística e avaliar a estrutura das comunidades de trepadeiras e os fatores ambientais que influenciam sua distribuição em escalas locais, foram realizadas análises qualitativas e quantitativas em um mosaico de ambientes florestais na região subtropical do Brasil. O estudo foi desenvolvido em um remanescente florestal com cerca de 100 ha que recobre as encostas de um morro granítico e está situado na porção centro-oeste do Rio Grande do Sul, no município de Guaíba. A área compreende quatro ambientes com fisionomias florestais distintas, dois deles situados na borda e, os outros dois, no interior. Os ambientes de borda se diferenciam principalmente pelo tipo de formação campestre do entorno em: borda com campo limpo e borda com campo rupestre, enquanto que os ambientes de interior apresentam distintas condições de drenagem: interior mal drenado e interior bem drenado. Para a análise biogeográfica, a partir da lista de espécies obtida no levantamento florístico, foram registradas a presença e ausência das mesmas em três áreas gradualmente mais distantes da área de estudo, ao longo de quatro linhas de expansão divergentes: nordeste, noroeste, centro-oeste e sudoeste. Já a variação das comunidades nos quatro ambientes característicos da área de estudo foi avaliada através da amostragem de 0,24 ha, com seis parcelas alocadas em cada ambiente. A flora total do remanescente compreendeu oitenta e duas espécies de trepadeiras, distribuídas em cinquenta e cinco gêneros e trinta e três famílias. O grande número de espécies compartilhadas com as linhas de expansão tropicais, em detrimento das subtropicais e temperadas, mostra que, mesmo situada fora dos trópicos, em uma região de transição climática e biogeográfica, a área de estudo apresenta muitos elementos de origem tropical. Quanto à distribuição nos quatro ambientes, as comunidades ocorrentes na borda e no interior se diferenciaram em relação à composição, riqueza , abundância e à proporção de indivíduos em cada modo de ascensão. Além disso, a borda e o interior demonstraram ser internamente heterogêneos, principalmente quanto à composição. As características químicas e disponibilidade de água do solo, a luminosidade e o tipo de ecótono nas áreas de borda se mostraram importantes fatores na diferenciação de comunidades de trepadeiras em escalas locais.
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A vegetação original de setor nordeste do Estado de São Paulo: uma representação cartográfica através de técnicas simplificadas

Ceturi, João Paulo Jorge [UNESP] 08 July 2003 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:52Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2003-07-08Bitstream added on 2014-06-13T20:57:05Z : No. of bitstreams: 1 ceturi_jpj_me_rcla.pdf: 868337 bytes, checksum: c7e31fb989e04cceed77661bb4e1a470 (MD5) / Esta é uma pesquisa Biogeográfica que utilizou três técnicas simplificadas para fazer o mapeamento da vegetação original de parte do setor nordeste do estado de São Paulo. As técnicas usadas nesta pesquisa são: a obtenção e análise dos dados através da interpretação das Toponímias; a leitura de antigos relatos de viagens e aferição dos dados em Trabalho de Campo. O objetivo da pesquisa é o de salientar que através de tais técnicas é possível obter bons resultados ao estudar a vegetação original de um lugar. / This is a Biogeography research which has used three simplyfieds tecnics to make a map of the original vegetation from one of the northeast parts from São Paulo State. The tecnics used in this research are: obtainment and data analyzis through that toponymy's interpretation ; the reading of the old travel reports and checking datas in the work field. The objective of this research is emphasize that through such tecnics it is possible to obtain good results at estudy the original vegetation of a place.
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Dinâmica da comunidade microbiana entre múltiplas escalas espaciais e temporais em lagos rasos costeiros do extremo sul do Brasil

Lima, Marla Sonaira January 2016 (has links)
A comunidade bacteriana aquática foi estudada quanto à composição, biomassa e à atividade de consumo de carbono (perfil de consumo potencial de substratos orgânicos através de Ecoplates Biolog™) ao longo de diferentes escalas espaciais e temporais em 26 lagoas costeiras do sul do Brasil. Com o objetivo de investigar a influência de distintos padrões temporais e espaciais na dinâmica da comunidade, investigou-se i) a variação da composição da comunidade bacteriana (CCB) e de seus atributos funcionais (AF) em função de efeitos exclusivos do ambiente, do espaço, do tempo, ou de todos os fatores na Lagoa Mangueira; ii) os padrões espaciais de distribuição da diversidade beta bacteriana aquática e os fatores influenciando tais variações ao longo de 25 lagoas com diferentes graus de conectividade, no Sistema do rio Tramandaí; e iii) a dinâmica temporal da composição e biomassa bacteriana ao longo de um distúrbio provocado por frentes frias na Lagoa Mangueira. Dessa forma, três perguntas principais foram compostas: i) há variação da composição da comunidade bacteriana (CCB) e de seus atributos funcionais (AF) em função de efeitos exclusivos do ambiente, do espaço, do tempo, ou de todos os fatores? ii) a diversidade beta bacteriana aquática apresenta padrão de distribuição aninhado ou turnover e quais processos influenciam tais padrões? iii) a composição e biomassa da comunidade bacteriana muda em resposta a distúrbios de curta duração ocorridos pela entrada de frente fria polar? Como resultados consistentes observaram-se que: i) a CCB e seus AF variam temporal e espacialmente, sendo sua distribuição explicada principalmente pelos filtros ambientais (speciessorting) e pela distância espacial, respectivamente; ii) a diversidade beta bacteriana entre e dentro das lagoas é principalmente o resultado da substituição de espécies (turnover), sendo que a relação entre a diversidade beta bacteriana e a heterogeneidade ambiental entre as lagoas parece ser resultado de species-sorting, enquanto que dentro das lagoas pode ser o resultado do efeito de massa, devido à alta conectividade e dispersão dentro das lagoas; iii) a comunidade bacteriana em termos de biomassa apresenta-se resiliente ao distúrbio, enquanto que a composição da comunidade apresenta-se resistente ao distúrbio provocado por frente fria. Assim, esta tese contribui no incremento de discussões acerca dos padrões ecológicos da comunidade bacteriana entre múltiplas escalas espaciais e temporais, mostrando que a menor escala de heterogeneidade bacteriana detectada pode estar positivamente relacionada ao tamanho do lago. Além disso a comunidade apresenta distintas respostas de estabilidade em termos composicionais e biomassa em eventos que causam distúrbios ao sistema. Finalmente, esse estudo conseguiu verificar variação espacial e temporal da comunidade bacteriana entre multiplas escalas no sistema aquático, em resposta às variações nas características ambientais nas diferentes escalas estudadas. Portanto, esse estudo identifica a resposta bacteriana aos distintos padrões espaciais e temporais, e quais mecanismos influenciam a comunidade bacteriana, evidenciando a importância em se considerar múltiplas escalas para a compreensão da biogeografia microbiana e a sua habilidade de responder a perturbações. / The aquatic bacterial community was studied in terms of composition, biomass and carbon consumption activity (physiological profile - Ecoplate) over different spatial and temporal scales in 26 coastal lagoons in southern Brazil. In order to investigate the influence of different spatial and temporal patterns in community dynamics, we investigated i) the variation of the bacterial community composition (CBB) and its functional traits (FT) as a function of exclusive effects of the environment, of the space, of the time, or of all the factors in Lake Mangueira; ii) the patterns of distribution of the aquatic bacterial beta diversity and the factors influencing such variations along 25 lakes with different degrees of connectivity in the Tramandaí River System; and iii) temporal dynamics of bacterial composition and biomass along a disturbance provoked by cold fronts in Lake Mangueira. In this way, three mainly questions were made: i) is there variation in the BCC and its FT as a function of the sole purpose of environment, of space, time, or all of the factors? ii) Does aquatic bacterial beta diversity presents a nested pattern of distribution or turnover and which processes influence these patterns? iii) Do the composition and biomass of the bacterial community change in response to short-term disturbs due to the polar cold front event? As a consistent result, it was observed that: i) the BCC and its FT varied temporally and spatially, and its distribution is explained mainly by environmental filters (species-sorting) and spatial distance, respectively; ii) the bacterial beta diversity between and within lake is primarily the result of species turnover, and the bacterial beta diversity-environmental heterogeneity relationship (BDEHR) among lakes appears to result from species-sorting, while withinlake the beta diversity should be a result of the mass effect, due to the high connectivity and dispersion within-lake; iii) the bacterial community, in terms of biomass is resilient to the disturbance, whereas the bacterial composition is resistant to the disturbance. Thus, this thesis contributes in increasing discussions about the ecological patterns of the bacterial community between multiple scales showing that the smaller scale of bacterial heterogeneity detected can be positively related to the lake size. In addition, the community presents distinct stability responses in terms of composition and biomass over events that cause disturbances to the system. This study was able to verify spatial and temporal variation of the bacterial community among multiple scales in the aquatic system, in response to different environmental factors among the multiple scales studied. Therefore, this study identified the bacterial response to the different spatial and temporal patterns, and the mechanisms that influence the bacterial community, evidencing the importance in considering multiple scales for the understanding of microbial biogeography and its ability to respond to disturbs.
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Revisão de Pleonotoma Miers (Gignonieae, Bignoniaceae)

Gomes, Beatriz Machado 29 June 2006 (has links)
Dissertação (mestrado)-Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Botânica, 2006. / Submitted by Diogo Trindade Fóis (diogo_fois@hotmail.com) on 2009-10-30T13:51:23Z No. of bitstreams: 1 2006_Beatriz Machado Gomes.pdf: 1999157 bytes, checksum: d52177e200435a6a6816a01e53fe41dc (MD5) / Approved for entry into archive by Gomes Neide(nagomes2005@gmail.com) on 2010-10-22T18:23:50Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2006_Beatriz Machado Gomes.pdf: 1999157 bytes, checksum: d52177e200435a6a6816a01e53fe41dc (MD5) / Made available in DSpace on 2010-10-22T18:23:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2006_Beatriz Machado Gomes.pdf: 1999157 bytes, checksum: d52177e200435a6a6816a01e53fe41dc (MD5) Previous issue date: 2006-06-29 / Pleonotoma Miers (Bignonieae, Bignoniaceae) é um gênero neotropical, monofilético, que se distribui da Guatemala ao Brasil e Bolívia, incluindo Trindade e Tobago, com centro de diversidade na região norte do Brasil. Ocorre em florestas tropicais úmidas centro e sul-americanas, transições floresta-pantanal mato-grossense, matas secas do Brasil Central e sudeste brasileiro e em caatingas e transições cerrado-caatinga do nordeste brasileiro. Analisou-se a coleção de 40 herbários nacionais e internacionais. O gênero caracteriza-se, vegetativamente, pela forma de vida escandente, ramos quadrangulares sem campos de glândulas interpeciolares, profilos da gema axilar foliáceos ou não, folhas bi a tri-ternadas ou mais vezes pinadas, folíolo terminal normalmente substituído por gavinha trífida. As inflorescências são do tipo racemo ou, muito raramente, as flores não estão agrupadas em inflorescências e se apresentam de maneira isolada. As flores têm cálice cupuliforme a tubuloso, corola normalmente branca a amarelo-pálida, infundibuliforme ou hipocrateriforme, androceu inserto ou exserto, estames didínamos ou homodínamos, anteras divergentes ou divaricadas, ovário assentado em disco nectarífero e óvulos 2-8-seriados por lóculo. Os frutos são geralmente lineares, menos comumente oblongos, e as sementes são bialadas. O tratamento taxonômico dado às espécies incluiu chaves de identificação para as espécies, atualização nomenclatural, sinonimizações, descrições morfológicas, mapas das distribuições geográficas, nomes populares e usos, comentários para todas as espécies e ilustrações para cinco espécies. Foram reconhecidas 12 espécies no gênero, das quais duas são espécies novas para a ciência da região norte do Brasil, estados do Amazonas e Pará: Pleonotoma bracteata A.H. Gentry, P. castelnaei (Bureau) Sandwith, P. clematis (Kunth) Miers, P. echitidea Sandwith, P. jasminifolia (Kunth) Miers, P. melioides (S. Moore) A.H. Gentry, P. orientalis Sandwith, P. pavettiflora Sandwith, P. tetraquetra (Cham.) Bureau, P. variabilis (Jacq.) Miers, Pleonotoma sp. nov. 1, Pleonotoma sp. nov. 2. Foram, ainda, propostas duas novas variedades: Pleonotoma orientalis Sandwith var. ratteriana Proença & Farias e P. tetraquetra (Cham.) Bureau var. nov. Foi proposta, também, uma mudança de status taxonômico de Pleonotoma exserta A.H. Gentry do nível de espécie para o nível de variedade de P. echitidea Sandwith. Além disso, foi proposto que P. dendrotricha Sandwith seja sinonimizada a P. variabilis (Jacq.) Miers. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Pleonotoma Miers (Bignonieae, Bignoniaceae) is a monophyletic genus of neotropical distribution ranging from Guatemala to Brazil and Bolivia, including Trinidad and Tobago, with its center of diversity in northern Brazil. It is distributed in tropical rain forests in Central and South America, transitional forests between rain forests and the hyperseasonal Pantanal, dry forests of central and southeastern Brazil, and in the arid caatingas and cerrado-caatinga transition in the Brazilian Northeast. The collections from 40 Brazilian and international herbaria were examined. The genus is characterized vegetatively by its scandent habit, quadrangular branches lacking glandular fields, prophylls of the axillary buds sometimes leafy, and leaves that are biternate, tri-ternate or pinnately compounded, with terminal leaflets usually substituted by trifid tendrils. The inflorescences are racemes, or, very rarely, the flowers are solitary. Flowers have cupuliform to tubular calices, white to pale yellow, infundibuliform to hipocrateriform corolas, included to exserted stamens which are didynamous to homodynamos, divergent to divaricate anthers, ovary with a nectariferous disk and ovules that are 2-8-seriate per locule. The fruits are lineares, sometimes oblong, and the seeds are bialate. The taxonomic treatment includes identification keys to the species, nomenclatural revision, synonymy, morphological descriptions, distribution maps, popular names and use, and notes for all the species and illustrations for five species. 12 species are recognized in the genus, of which two are new to science and occur in Amazonian Brazil, states of Amazonas and Pará: Pleonotoma bracteata A.H. Gentry, P. castelnaei (Bureau) Sandwith, P. clematis (Kunth) Miers, P. echitidea Sandwith, P. jasminifolia (Kunth) Miers, P. melioides (S. Moore) A.H. Gentry, P. orientalis Sandwith, P. pavettiflora Sandwith, P. tetraquetra (Cham.) Bureau, P. variabilis (Jacq.) Miers, Pleonotoma sp. nov. 1 and Pleonotoma sp. nov. 2. Two new varieties are also proposed: P. orientalis Sandwith var. ratteriana Proença & Farias, and P. tetraquetra (Cham.) Bureau var. nov. A change in taxonomic status is also proposed for Pleonotoma exserta A.H. Gentry, from species to variety of P. echitidea Sandwith, and that P. dendrotricha Sandwith be sinonimized to P. variabilis (Jacq.) Miers.
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Distribuição potencial de espécies de isoptera e conservação do cerrado

Schmidt, Karen 27 February 2007 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, 2007. / Submitted by mariana castro (nanacastro0107@hotmail.com) on 2009-12-14T17:52:22Z No. of bitstreams: 1 2008_KarenSchmidt.pdf: 3628310 bytes, checksum: fdb207148194d02497d6c015d81fa54c (MD5) / Approved for entry into archive by Lucila Saraiva(lucilasaraiva1@gmail.com) on 2009-12-22T21:56:13Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2008_KarenSchmidt.pdf: 3628310 bytes, checksum: fdb207148194d02497d6c015d81fa54c (MD5) / Made available in DSpace on 2009-12-22T21:56:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008_KarenSchmidt.pdf: 3628310 bytes, checksum: fdb207148194d02497d6c015d81fa54c (MD5) Previous issue date: 2007-02-27 / O Cerrado é considerado um dos 25 hotspots de biodiversidade do planeta, com cerca de 30% da diversidade biológica do Brasil. É também uma importante fronteira agrícola e vem sendo destruído rapidamente. Desse modo, é necessária a definição de prioridades para conservação com base na endemicidade da biota. A delimitação de padrões de endemismo depende da análise da distribuição geográfica das espécies, o que por sua vez depende de inventários e estudos taxonômicos detalhados, inexistentes para muitos grupos. Como não é possível amostrar toda a biota, é necessária a seleção de grupos considerados chave, como os cupins que além de serem bioindicadores ainda apresentam uma alta taxa de endemismo para o Cerrado. Porém, a distribuição real completa para cada espécie é difícil de ser determinada, visto que não há inventários suficientes. Neste trabalho, a distribuição potencial das espécies de cupins do Cerrado foi estimada utilizando o programa Desktop GARP. Os registros de ocorrência das espécies foram obtidos através de dados disponíveis em coleções e na literatura. Ao todo 19 espécies foram analisadas: seis endêmicas, oito características e cinco não endêmicas. Todos os modelos foram altamente significativos e mostraram-se eficientes na determinação de áreas prioritárias para inventário, sendo as áreas de Cerrado no sul do estado do Maranhão, norte do Mato Grosso do Sul e oeste da Bahia as que apresentam maior potencial de ocorrência para as espécies de cupins. Os modelos não foram eficientes para a delimitação de centros de endemismo, mas a sobreposição dos modelos gerados para as espécies endêmicas e características sugere que o sul do estado de Goiás apresenta um alto potencial de ocorrência para estas espécies, indicando um possível centro de alta diversidade. Dois padões de distribuição foram observados: o padrão centro-norte, representado por Cornitermes silvestrii, Nasutitermes kemneri e Serritermes serrifer, e o padrão sudeste representado por Cyrilliotermes strictinasus, Labiotermes brevilabius e Procornitermes araujoi. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The Brazilian Cerrado is one of the 25 biodiversity hotspots, with about 30% of the biological diversity of Brazil. The Cerrado is also an important agricultural region and it has been quickly destroyed. The definition of conservation priorities is, therefore, urgent and should be based on endemicity patterns, which depends on geographical distribution data. This kind of information is limited due to the lack of surveys and taxonomic studie for most groups. Because it is impossible to sample all groups of organisms it is necessa to select indicator or key-groups. Termites comprise a good indicator group and present high endemicity in the Cerrado. In this work, the potential geographical distribution of termite species was estimated using the Genetic Algorithm for Rule-set Production (GARP). The occurrence records were obtained from collections and the literature. Nineteen species of termites were analyzed: six endemic, eight characteristic, and five no endemic. All the models were highly significant and efficient to show the areas that are priorities for new surveys: the south of the state of Maranhão, north of Mato Grosso do Sul and west of Bahia. The GARP models were not efficient for the delimitation of cent of endemism. The map overlaying for the endemic species showed that the south of the state of Goiás presents the highest potential for the occurrence of the endemic and characteristic species, indicating a possible center of high diversity. Two patterns of distribution for the species in the biome were observed: the center-west pattern represented by Cornitermes silvestrii, Nasutitermes kemneri and Serritermes serrifer and the southeast pattern represented by Cyrilliotermes strictinasus, Labiotermes brevilabius e Procornitermes araujoi.
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Padrões ecológicos globais de dois clados de serpentes, Viperidae e Elapidae (Serpentes, Squamata)

Terribile, Levi Carina 02 1900 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, 2009. / Submitted by Larissa Ferreira dos Angelos (ferreirangelos@gmail.com) on 2010-03-30T16:18:31Z No. of bitstreams: 1 2009_LeviCarinaTerribile.pdf: 6485192 bytes, checksum: d3b81bdb8bcb6b131928445f33568b80 (MD5) / Approved for entry into archive by Daniel Ribeiro(daniel@bce.unb.br) on 2010-05-12T17:41:02Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2009_LeviCarinaTerribile.pdf: 6485192 bytes, checksum: d3b81bdb8bcb6b131928445f33568b80 (MD5) / Made available in DSpace on 2010-05-12T17:41:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2009_LeviCarinaTerribile.pdf: 6485192 bytes, checksum: d3b81bdb8bcb6b131928445f33568b80 (MD5) Previous issue date: 2009-02 / O estudo dos padrões ecológicos em grandes escalas geográficas é de grande interesse atual para ecólogos e biogeógrafos. Em especial, o gradiente latitudinal de riqueza de espécies e a variação geográfica no tamanho do corpo dos organismos são os dois padrões emergentes que tem recebido bastante ênfase nos últimos anos dentro do programa de pesquisa de macroecologia. O conhecimento efetivo dos padrões de diversidade em grandes escalas e dos processos envolvidos em sua origem e manutenção é vital para estabelecer programas mais eficientes de conservação da biodiversidade. O presente trabalho propõe estudar o padrão global de riqueza e de tamanho corpóreo das espécies de serpentes das famílias Viperidae e Elapidae, além de propor estratégias globais para a conservação da diversidade de espécies de ambas as famílias. Para tanto, foram obtidos dados macroecológicos de extensão de ocorrência e de comprimento total máximo de 228 espécies de Viperidae e 224 espécies de Elapidae. As análises dos fatores ecológicos e evolutivos envolvidos nesses padrões mostraram que as variações geográficas na riqueza e tamanho do corpo de Viperidae são determinadas primeiramente por fatores climáticos contemporâneos, enquanto que para as espécies de Elapidae esses padrões estão mais associados a fatores histórico/evolutivos do grupo. Esses resultados também mostram a importância de se utilizar abordagens desconstrutivas, como é o caso do princípio de desconstrução extrema proposto no presente trabalho, para as análises dos padrões de diversidade. Finalmente, as análises mostraram a existência de estratégias viáveis para a conservação da diversidade de Viperidae e Elapidae em escala global. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The study of ecological patterns in large geographical scales is currently of great interest in ecology and biogeography. Particularly, the latitudinal gradient of species richness and the geographical variation in body size of organisms are the two emerging patterns that have received special attention in recent years within the research program of macroecology. It is clear that an effective knowledge of the processes involved in the origin and maintenance of biodiversity patterns in large scale is important to design efficient strategies for biodiversity conservation. The aim of this study is to evaluate the global pattern of richness and body size of the species of two snake families, Viperidae and Elapidae, and propose conservation strategies for both families. For this, macroecological data of occurrence and maximum total body length were obtained for 228 species of Viperidae and 224 species of Elapidae. The evaluation of the ecological and evolutionary factors involved in these patterns showed that geographical variations in richness and body size of Viperidae are mainly determined by contemporary climate, while for Elapidae these patterns are more related to the evolutionary history of this group. These results also showed the importance of using deconstructive approaches, such as the "principle of extreme deconstruction" proposed in this study for the analysis of diversity patterns. Finally, the analyses of conservation priorities indicated the existence of viable conservation opportunities to preserve Viperidae and Elapidae diversity in global scale.
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Filogenia e evolução de Teiidae (Squamata: Reptilia) com ênfase em Cnemidophorus

Giugliano, Lilian Gimenes 04 1900 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, 2009. / Submitted by Larissa Ferreira dos Angelos (ferreirangelos@gmail.com) on 2010-03-31T15:25:29Z No. of bitstreams: 1 2009_LilianGimenesGiugliano.pdf: 2620487 bytes, checksum: 248da5643e1b56e519f1884597c68416 (MD5) / Approved for entry into archive by Daniel Ribeiro(daniel@bce.unb.br) on 2010-05-12T17:47:31Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2009_LilianGimenesGiugliano.pdf: 2620487 bytes, checksum: 248da5643e1b56e519f1884597c68416 (MD5) / Made available in DSpace on 2010-05-12T17:47:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2009_LilianGimenesGiugliano.pdf: 2620487 bytes, checksum: 248da5643e1b56e519f1884597c68416 (MD5) Previous issue date: 2009-04 / Este estudo visa à busca de uma melhor compreensão da filogenia, biogeografia e diversidade de Teiidae. O primeiro capítulo apresenta uma análise das relações filogenéticas entre os gêneros de Teiidae baseada em dados moleculares e morfológicos. O resultado da análise combinada total corrobora o monofiletismo de Tupinambinae, Teiinae e cnemidophorinos. É apresentada, também, uma proposta de cenário evolutivo para o grupo baseada na datação molecular, análise de áreas ancestrais, registro fóssil, distribuição geográfica atual dos gêneros e nas mudanças ambientais e geológicas ocorridas no Terciário. De acordo com este cenário, (1) todos os gêneros atuais de Teiidae, com exceção de Aspidoscelis, se originaram por isolamento na América do Sul, (2) a maioria dos gêneros de Teiidae se originou durante o Eoceno e (3) os Cnemidophorus se originaram na América do Sul e, posteriormente, algumas populações dispersaram para a América Central no Mioceno. O segundo capítulo apresenta uma reconstrução das relações filogenéticas de Kentropyx baseada em dados de DNA mitocondrial e morfologia e uma avaliação dos cenários biogeográficos suportada pela análise das áreas ancestrais e pela datação molecular por métodos bayesianos. Nossos resultados indicam a existência de três grupos monofiléticos em Kentropyx, sendo K. striata a primeira a divergir em oposição a propostas anteriores. Além disso, a análise do tempo de divergência indica que Kentropyx deve ter se originado no Eoceno/Oligoceno e, portanto, a Hipótese dos Refúgios Pleistocênicos teve pouca influência na diversificação das espécies do grupo. Baseado na análise das áreas ancestrais e na datação molecular, é sugerido um ancestral savânico para o grupo e que eventos históricos do Terciário promoveram a diferenciação do gênero. O terceiro capítulo trata da descrição de uma nova espécie de Cnemidophorus do complexo ocellifer encontrada no Jalapão, na região nordeste do Cerrado. Finalmente, o quarto capítulo trata das relações filogenéticas de Cnemidophorus baseadas na combinação de dados moleculares e morfológicos, incluindo os demais cnemidophorinos como grupo interno. O tempo de divergência entre as espécies é estimado por métodos bayesianos. Os resultados desse capítulo indicam que (1) as espécies de cnemidophorinos formam oito grupos monofiléticos, (2) Aspidoscelis e Kentropyx são monofiléticos, (3) Cnemidophorus e Ameiva são parafiléticos, (4) a origem dos grupos ocorreu principalmente durante o Oligoceno e a diversificação dentro dos grupos ocorreu principalmente durante o Mioceno, (5) C. parecis é mais aparentado com Ameiva do continente do que com as demais espécies de Cnemidophorus e (6) a diversificação do complexo lemniscatus ocorreu no Mioceno, não tendo sido, portanto, fortemente influenciada pelas flutuações climáticas do Quaternário como proposto anteriormente. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / This study aims to improve the knowledge of phylogeny, biogeography and diversity of Teiidae. The first chapter provides an analysis of phylogenetic relationships among teiid genera based on molecular and morphological data. The total combined analysis corroborated the monophyly of Tupinambinae, Teiinae, and cnemidophorines. We present an evolutionary scenario for Teiidae, based on molecular dating of evolutionary events using Bayesian methods, ancestral areas analysis, the fossil record, the geographic distribution of genera, and environmental and geologic changes during the Tertiary. According to this scenario, (1) all current teiid genera, except Aspidoscelis, originated in isolation in South America, (2) most teiid genera originated during the Eocene, a period characterized by savanna expansion in South America, and (3) Cnemidophorus originated in South America, after which some populations dispersed to Central America during the Late Miocene. The second chapter presents a reconstruction of phylogenetic relationships among species of Kentropyx, based on morphology and mitochondrial DNA data, and evaluated biogeographic scenarios based on ancestral areas analyses and molecular dating by Bayesian methods. Our results showed that Kentropyx comprises three monophyletic groups, with K. striata occupying a basal position in opposition to previous suggestions of relationships. Additionally, Bayesian analysis of divergence time sugested that Kentropyx may have originated during the Tertiary (Eocene/Oligocene) and the Pleistocene Refuge Hypothesis may not explain the species diversification. Based on ancestral reconstruction and molecular dating, we argued that a savanna ancestor is more likely and that historical events during the Tertiary of South America promoted the differentiation of the genus. The third chapter deals with the description of a new species of Cnemidophorus found in Jalapão in the northeast Cerrado biome. Finally, the fourth chapter deals with an analysis of the phylogenetic relationships of Cnemidophorus based on a combination of mitochondrial and nuclear DNA sequences and morphological data, including others cnemidophorines as internal group. The divergence time among species was estimated by Bayesian methods. The results of this chapter indicate that (1) cnemidophorines includes eight monophyletic groups, (2) Aspidoscelis and Kentropyx are monophyletic, (3) Cnemidophorus and Ameiva are paraphyletic, (4) the origin of the group occurred mainly during Oligocene and diversification within the group occurred mainly during the Miocene, (5) C. parecis is more closely related to Ameiva from the continent than to other species of Cnemidophorus and (6) diversification of the lemniscatus complex occurred during the Miocene and, therefore, was not strongly influenced by Quaternary climatic fluctuations as previously proposed.
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Filogeografia de Micrablepharus atticolus (Squamata, Gymnophthalmidae) no cerrado brasileiro / Landscape evolution and the phylogegraphy of micrablepharus atticolus squamata gymnophthalmidae). an endemic lizard of the Brazilian Cerrado

Santos, Marcella Gonçalves 03 October 2011 (has links)
Dissertação (mestrado)-Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, 2011. / Submitted by Patrícia Nunes da Silva (patricia@bce.unb.br) on 2012-03-30T20:47:58Z No. of bitstreams: 1 2011_MarcellaGonçalvesSantos.pdf: 7251634 bytes, checksum: 911fb91089729e5226948b5cb2cd56dd (MD5) / Approved for entry into archive by Leila Fernandes (leilabiblio@yahoo.com.br) on 2012-04-03T12:43:23Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_MarcellaGonçalvesSantos.pdf: 7251634 bytes, checksum: 911fb91089729e5226948b5cb2cd56dd (MD5) / Made available in DSpace on 2012-04-03T12:43:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_MarcellaGonçalvesSantos.pdf: 7251634 bytes, checksum: 911fb91089729e5226948b5cb2cd56dd (MD5) / A filogeografia é uma disciplina que vem se tornando cada vez mais relevante para a compreensão da história evolutiva no nível intraespecífico, trazendo contribuições valiosas para o conhecimento sobre a biogeografia de uma região. No Cerrado, esta abordagem pode ajudar a resolver questões acerca dos padrões e processos envolvidos na diversificação de sua biota. Neste trabalho, foi realizada uma análise filogeográfica de Micrablepharus atticolus, um lagarto endêmico do Cerrado. Foram utilizados dados de distribuição e sequências do citocromo b para investigar uma possível estruturação populacional dentro da espécie e confrontá-la com hipóteses relacionadas à diferenciação entre platôs/depressões, áreas de estabilidade/instabilidade histórica derivadas de modelos de distribuição potencial no Pleistoceno e Holoceno e regiões de centro/periferia da distribuição. Os dados de distribuição geográfica confirmaram a forte associação de M. atticolus com o Cerrado e foi encontrada alta variação no marcador utilizado, que está geograficamente estruturada e associada à distância entre as localidades amostradas. Foram identificados quatro agrupamentos de populações, separados por barreiras genéticas situadas principalmente na região entre os estados de Goiás e Mato Grosso. Foi estimado que a diversificação entre as linhagens de M. atticolus se iniciou há aproximadamente 3 milhões de anos, coincidindo com o soerguimento final do Planalto Central. Os modelos paleoclimáticos indicam grandes mudanças na distribuição da espécie nos últimos 130 mil anos, porém, ao contrário do esperado, as áreas de estabilidade não estão associadas à alta diversidade genética. As predições das hipóteses investigadas não foram suportadas pela topologia da filogenia a pelos índices de diversidade nas localidades bem amostradas, sugerindo uma história biogeográfica complexa na paisagem do Cerrado. ____________________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The search of an explanation for the origin of high biodiversity in the Neotropics has traditionally focused on forest biomes. Here we investigate the effects of geoclimatic events that putatively shaped the evolution of organisms inhabiting South American open biomes. We conducted a phylogeographic analysis of Micrablepharus atticolus, an endemic lizard from the Cerrado of Brazil. We used distributional data and cytochrome b sequences to investigate a possible structuring within the species, and confront it with hypotheses related to differentiation on plateaus/depressions, historical stability/instability areas derived from potential distribution models from the Pleistocene and Holocene, and core/periphery regions of the distribution. Geographic distribution data confirm the strong association o Matticolus with Cerrado and we found high variation in cytochrome b sequences, which was geographically structured and associated with distance among sampled localities. Four groups of populations were identified, separated by genetic barriers mainly located in the region between Goiás and Mato Grosso states. Diversification of M. atticolus lineages was estimated to have started around 3 mya, coinciding with final Centreal Plateau uplift. Paleoclimatic models indicate great shifts on the species distribution during the last 130,000 years, but contrary to our expectation stable areas are not associated with high genetic diversity. Predictions for investigated hypotheses were not supported by phylogeny topology and diversity indexes on well sampled localities, suggesting a complex biogeographical history on the Cerrado landscape.
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Padrões de diversidade (riqueza, filogenética e funcional) de quelônios continentais da América do Sul, seus processos geradores e suas consequências para a conservação

Rodrigues, Guth Berger Falcon 27 February 2014 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, 2014. / Submitted by Vinícius Cordeiro Galhardo (viniciuscg123@gmail.com) on 2014-05-15T17:06:09Z No. of bitstreams: 1 2014_GuthBergerFalconRodrigues.pdf: 1881062 bytes, checksum: fcb145bcb0bcc9606308e705e00603e5 (MD5) / Approved for entry into archive by Patrícia Nunes da Silva(patricia@bce.unb.br) on 2014-05-20T15:59:14Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_GuthBergerFalconRodrigues.pdf: 1881062 bytes, checksum: fcb145bcb0bcc9606308e705e00603e5 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-05-20T15:59:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_GuthBergerFalconRodrigues.pdf: 1881062 bytes, checksum: fcb145bcb0bcc9606308e705e00603e5 (MD5) / Compreender os padrões e os determinantes da distribuição da biodiversidade é uma questão central em ecologia, que deixou de ser somente teórica para se tornar subsídio para tomadores de decisão, em especial pela necessidade de medidas urgentes para conter a crise da biodiversidade de forma planejada e sistemática. O presente estudo investiga padrões de diversidade de quelônios continentais da América do Sul, bem com suas singularidades e determinantes. Foram compilados da literatura registros de ocorrência e informações biológicas (filogenia e traços funcionais) de 46 espécies, para identificar padrões de riqueza, diversidade filogenética e diversidade funcional. Essas três métricas tiveram sua estruturação espacial definida por mapeamento de autovetores espaciais, para retirar o viés da autocorrelação espacial. Foram empregadas regressões lineares para investigar as relações entre as métricas; regressões múltiplas de cada métrica com preditores ambientais para testar hipóteses de processos contemporâneos que determinam a diversidade; e regressões parciais para definir a contribuição espacial, ambiental e residual dos modelos. As três métricas seguiram o gradiente latitudinal de diversidade e foram fortemente correlacionadas entre si. A análise dos preditores ambientais corroborou as hipóteses dinâmica água-energia e disponibilidade de energia como determinante das três métricas de diversidade. Preditores de importância secundária corroboraram as hipóteses de estresse e estabilidade ambiental como responsáveis pela distinção dos três componentes da diversidade. Singularidades observadas pela espacialização dos resíduos das regressões lineares indicaram locais onde as métricas diferem do esperado, sugerindo prioridades secundárias para a conservação. Os preditores ambientais e espaciais explicaram grande parte dos padrões de diversidade, mas indícios da influência de aspectos históricos devem ser considerados para a compreensão da diversidade de uma linhagem antiga e com baixas taxas evolutivas. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Understanding the biodiversity distribution patterns and process is a central issue in ecology, that is no longer merely theoretical to be a source for decision makers, especially because the necessity of urgent measures to contain the biodiversity conservation crisis in a systematic and plain way. This present study investigates patterns of diversity of continental South American turtles, as well as their singularities and determinants. Occurrence records and biological information (phylogenies and functional traits) were compiled from literature of 46 species of turtles to find patterns of richness, phylogenetic diversity and functional diversity. These three diversity metrics were spatially structured by spatial eigenvector mapping which allowed removing the spatial autocorrelation bias, the linear regression between metrics and of the multiple regressions of each metric explained by environment predictors that represent the hypothesis of the determinants contemporary process of the diversity; and partial regressions to define environmental, spatial and residuals contribution of the models. The three metrics followed the latitudinal gradient and were strongly correlated. The environment predictors corroborate the hypothesis water-energy dynamic and availability-of-energy as determinants of South American turtles diversity. The predictors of secondary representativity indicate that the hypothesis of the environmental stress and stability are the reason of distinction among the three metrics of diversity. These singularities have been observed with spatialization of the residuals of the linear regression, indicating where the metrics differ of the richness expected for the continent, and suggest secondary priorities for turtles conservation, the most threatened vertebrates group in the world on the continent over the strong anthropic impact. The environmental and spatial predictors explained the most part of diversity patterns. Anyhow evidences of the influence of historical aspects should be considered for understanding the biodiversity patterns of an ancient lineage with low evolutionary rates.

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