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Detecção de mutação no gene supressor de tumor p53 e associação e cepas patogênicas do Helicobacter pylori em câncer gástrico

Oliveira, Juliana Gonçalves de [UNESP] 25 February 2008 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:01Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-02-25Bitstream added on 2014-06-13T19:49:33Z : No. of bitstreams: 1 oliveira_jg_me_botfm.pdf: 1162046 bytes, checksum: 81511cad148a738a034b784dbc6eec91 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O câncer gástrico é o quarto tipo mais comum e o segundo em mortalidade. Apesar da diminuição do número de casos nos últimos tempos ainda é um grande problema mundial. E mais, sua associação com o Helicobacter pylori (HP) está cada vez mais preocupante, devido à alta prevalência de cepas patogênicas dessa bactéria. Além disso, mutações em genes que agem no ciclo celular podem levar ao câncer. O gene que codifica a proteína p53 é responsável pelo reparo de lesões no DNA durante o ciclo celular funcionando como um regulador transcricional. Quando o reparo não é viável a proteína p53 induz a entrada da célula danificada em apoptose. Mutações mais freqüentes ocorrem nos exons 5, 6, 7 8 e 9. No atual trabalho investigou-se a possível associação da mutação no gene p53, correlação com presença da cepa patogênica CagA+ e estadiamento do tumor. Foram estudadas 55 amostras de câncer gástrico extraídas por biópsia durante gastrectomia. PCR foi utilizada para os exons 5 ao 9, análise de mutação por sequenciamento automático e dados clínicos foram coletados incluindo infecção por Helicobacter pylori/CagA+. Trinta e dois casos apresentaram mutações em p53 sendo que 6 deles apresentaram mutação em mais de um exon. 53% apresentaram-se infectados por HP CagA+. 87% dos pacientes estavam em estadiamento avançado do tumor (II, III e IV) e 80% eram do tipo intestinal. Quanto a correlação de p53 e cagA+ a casuística é relativamente pequena, e assim a correlação de p53 e cagA não foi vista. Os resultados confirmam a relevância das mutações em p53 e da presença da cepa patogênica CagA nos casos de câncer gástrico, contudo estudos devem ser realizados com um maior número amostral. Neste caso, o uso da p53 mutada pode ser utilizada em diagnóstico indicando, assim um melhor tratamento, desde que há casos em que sua alteração impõe resistência... / The gastric cancer is the fourth most common type and the second in mortality. Despite the decrease in the number of cases in recent times is still a major problem worldwide. Moreover, its association with Helicobacter pylori (HP) is increasingly worrying, because of the high prevalence of pathogenic strains of this bacterium. Furthermore, mutations in genes that act in the cell cycle can lead to cancer. The gene encoding the p53 protein is responsible for repair of lesions in DNA during cell cycle working as a transcriptional regulator. When the repair is not viable in the p53 protein induces the entry of the cell into apoptosis damaged. Change frequently occur in exons 5, 6, 7 8 and 9. In the current work investigated is the possible association of the mutation in the p53 gene, correlation with the presence of pathogenic strain CagA + and staging of the tumor. We studied 55 samples of gastric cancer extracted by biopsy taken during gastrectomy. PCR was used to the exons 5 to 9, analysis of mutation by sequencing automatic and clinical data were collected including infection by Helicobacter pylori / CagA +. Thirty-two patients had mutations in p53 is that 6 of them had more than one mutation in exon. 53% showed up infected HP CagA +. 87% of the patients were in advanced staging of the tumor (II, III and IV) and 80% were of the intestinal type. As the correlation of p53 and cagA + the casuistic is relatively small, and thus the relationship of p53 and cagA was not seen. The results confirm the relevance of mutations in p53 in the presence of pathogenic strain CagA in cases of gastric cancer, but studies must be conducted with greater sample. In this case, the use of p53 mutant can be used in diagnosis indicating thus a better treatment, since there are cases where its amendment requires resistance to certain types of treatment, regardless of the presence of H pylori... (Complete abstract click electronic access below)
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Prospecção de candidatos a biomarcadores oncológicos de cânceres gástricos por espectrometria de massas

Aquino, Priscila Ferreira de 06 August 2012 (has links)
Submitted by Alisson Mota (alisson.davidbeckam@gmail.com) on 2015-07-16T19:00:01Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Priscila Ferreira de Aquino.pdf: 5652638 bytes, checksum: 2ba6118eee211cd155bc26326e843efd (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-07-17T14:18:20Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Priscila Ferreira de Aquino.pdf: 5652638 bytes, checksum: 2ba6118eee211cd155bc26326e843efd (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-07-17T14:25:06Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Priscila Ferreira de Aquino.pdf: 5652638 bytes, checksum: 2ba6118eee211cd155bc26326e843efd (MD5) / Made available in DSpace on 2015-07-17T14:25:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação - Priscila Ferreira de Aquino.pdf: 5652638 bytes, checksum: 2ba6118eee211cd155bc26326e843efd (MD5) Previous issue date: 2012-08-06 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / ancer is a disease in expansion, whose mortality is one of the highest in the world, motivating the scientific community to increasingly seek early diagnosis, as the chances of cure are higher in this case. Gastric cancer is of particular interest as it is the fourth most common in malignancy and the second leading cause of death worldwide. In this work, we compared tissue samples from control subjects (without the disease) and patients with gastric cancer and their corresponding ressection margin by using proteomics, metabolomics, and molecular biology. The proteomic analysis comprised an offline MudPIT shotgun proteomic approach with label-free quantitation by extracted ion chromatograms (XICs); it revealed that each of these tissue-types is very distinct. The resection margin presented several proteins previously correlated with cancer, but also several other proteins that could be related to tumor nourishment and metastasis. Some examples are: collagen alpha-1, ceruloplasmin, calpastatin, and E-cadherin. The multivariate analysis, according to Ward’s method and k-means clustering, of our metabolomics data revealed that was able to group the different samples according to their tissue type. Our metabolomic analysis results are aligned with those from the proteomics in that these tissue-types are very distinct, particularly the ressection margin which may be the result of an ongoing biochemical battle between the body and the cancer cells. Furthermore, a viral investigation of the samples by PCR (Polymerase Chain Reaction) showed that the Epstein-Barr virus (EBV) should be considered as a risk factor for gastric cancer in Manaus. In all, the proteomic results poses the ressection margin as playing a key role in the nutrition of the cancer cells. Regardless, we still need a better understanding of this disease at the molecular level to provide more effective treatments. / O câncer é uma doença em expansão, cuja mortalidade é elevada no mundo, fazendo com que a comunidade científica busque cada vez mais diagnosticar precocemente, visto que as chances de curá-lo neste caso são maiores. O câncer gástrico é de especial interesse devido ser o quarto em malignidade e o segundo que mais causa mortes no mundo. Neste trabalho, amostras de tecidos tumorais e respectivas margens de ressecção de pacientes com câncer gástrico, e de biópsia do estômago de indivíduos controles (sem essa doença), foram investigadas através de abordagens proteômica, metabolômica e por biologia molecular. A análise proteômica utilizando uma abordagem da proteômica shotgun, o MudPIT off-line e a quantificação label-free pelo cromatogramas de íons extraídos (XICS) demonstrou que cada tipo de tecido é bem distinto. A margem de ressecção apresentou várias proteínas previamente correlacionadas ao câncer, assim como algumas proteínas superexpressadas que podem estar relacionadas ao crescimento tumoral e a metástase. Alguns exemplos são: colágeno alfa-1, ceruloplasmina, calpastatina e E-caderina. A análise multivariada, segundo o método de Ward e o agrupamento de k-Means, dos dados de metabolômica revelou que foi capaz de agrupar os diferentes tipos de amostras de acordo com seu tipo de tecido. De maneira que os resultados da análise metabolômica estão alinhados com os da proteômica em que os tipos de tecidos são muito distintos, particularmente a margem de ressecção, o qual pode ser resultado de uma contínua batalha bioquímica entre o corpo e as células cancerígenas. Além disso, uma investigação viral das amostras mediante a técnica de PCR (Polymerase Chain Reaction) evidenciou que o virus Epstein-Barr (EBV) deve ser considerado um fator de risco para o câncer gástrico em Manaus. Os resultados proteômicos deste trabalho indicam que a margem de ressecção pode desempenhar um papel fundamental para a nutrição das células cancerígenas. O presente trabalho corrobora com a idéia de que é necessário um maior entendimento da doença em nível molecular, o que pode proporcionar tratamentos mais efetivos, e que o EBV deve ser levado em consideração para a incidência do câncer gástrico.
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Atividade anticâncer da Biflorina em células tumorais gástricas

Barbosa, Gleyce dos Santos 27 January 2012 (has links)
Submitted by Lúcia Brandão (lucia.elaine@live.com) on 2015-12-09T19:19:03Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Gleyce dos Santos Barbosa.pdf: 2917376 bytes, checksum: 06d23d301fe537d8d8c6b4a14c4689cf (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-01-19T20:34:33Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Gleyce dos Santos Barbosa.pdf: 2917376 bytes, checksum: 06d23d301fe537d8d8c6b4a14c4689cf (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-01-19T20:42:05Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Gleyce dos Santos Barbosa.pdf: 2917376 bytes, checksum: 06d23d301fe537d8d8c6b4a14c4689cf (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-19T20:42:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação - Gleyce dos Santos Barbosa.pdf: 2917376 bytes, checksum: 06d23d301fe537d8d8c6b4a14c4689cf (MD5) Previous issue date: 2012-01-27 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / In the northern Brazil, especially in the states of Amazonas and Pará, there is a high incidence of gastric cancer which available treatments are ineffective in most cases. The biflorin, a prenylated ortanaftoquinona obtained from the roots of Capraria biflora L., showed, in previous studies, an inhibition of the tumor growth in vivo and in vitro in several cell lines, without inducing mutagenicity. The ACP02, main cell line used in this work, was established from a primary diffuse gastric adenocarcinoma, removed from the stomach cardia region of a 66-year-old pacient born in Pará. Among the main karyotypes and genetic changes of this lineage are the trisomy of chromosome 8, with amplification of the MYC oncogene, and the deletion of the chromosome 17’s short arm, where the tumor suppressor gene TP53 is located. These characteristics observed in the established line correspond to those observed in the original tumor, what indicates that this line is a good alternative to the study of the human gastric cancer pathophysiology and the drug screening. Considering biflorin’s promising potencial and the necessity to regionalize the study of new anticancer drugs to answer genotype particularities of each group of patients, we evaluated the activity of biflorin on ACP02 through the morphological cell analysis, the cell viability assays, the clonogenic assay, scratch assay, the cell differentiation test by NBT, the evaluation of the MYC status and telomere length by FISH, in 0, 1.0, 2.5 and 5.0 M concentrations, after 24 and 72 hours of treatment. The morphological changes indicate cell death by necrosis, and suggest the occurrence of the differentiation process, due to change in the format of the attached cell. The biflorin showed a cytotoxic activity (IC50 1.92 M) and cytostatic, anticlonogenic and antimotility activities, statistically significant (p<0,05) since 1 M. There was a significant reduction in MYC amplification rate in cells treated with 2.5 e 5 M of the drug (p<0,05), which can explain the occurrence of cellular differentiation process, in view of the physiological role of this gene. This differentiation was confirmed by the results obtained during the NBT test, in which the cells showed the ability to metabolize salt from a treatment of 1.0 M. The telomere length was reduced in cells treated with 5.0 M of biflorina (p<0,05). These results showed that biflorin acts on important targets of anticancer therapy, when used on the gastric line ACP02, at concentrations around 2.5 M, which makes it a promising substance for the treatment of this tumor type. / No norte do Brasil, sobretudo nos Estados do Amazonas e Pará, há alta incidência de câncer gástrico, cujos tratamentos disponíveis são ineficazes, na maioria dos casos. A biflorina, uma ortonaftoquinona prenilada obtida das raízes de Capraria biflora L., demonstrou, em trabalhos prévios, inibir o crescimento tumoral in vivo e in vitro de várias linhagens celulares, sem induzir mutagenicidade. A ACP02, principal linhagem celular utilizada nesse trabalho, foi estabelecida a partir de um adenocarcinoma gástrico difuso primário, retirado da região cárdia estomacal de um paciente de 66 anos oriundo do Pará. Entre as principais alterações cariotípicas e genéticas dessa linhagem estão a trissomia do cromossomo 8, com amplificação do oncogene MYC, e a deleção do braço curto do cromossomo 17, onde estaria localizado o gene supressor de tumor TP53. Essas características observadas na linhagem estabelecida correspondem àquelas observadas no tumor que a deu origem, evidenciando que tal linhagem é uma boa alternativa para o estudo da fisiopatologia do câncer gástrico humano e triagem de drogas. Tendo em vista o potencial promissor da biflorina e a necessidade de regionalizar o estudo de novas drogas anticâncer para atender as particularidades genotípicas de cada grupo de pacientes, avaliamos a atividade da biflorina sobre ACP02 através da análise morfológica das células, dos ensaios de viabilidade celular, do ensaio clonogênico, do teste de motilidade, do teste de diferenciação celular pelo NBT e da avaliação do status de MYC e comprimento dos telômeros por FISH, nas concentrações de 0, 1,0, 2,5 e 5 M, após 24 e 72h de tratamento. As alterações morfológicas indicaram morte celular por necrose, além de sugerirem a ocorrência de processo de diferenciação, devido à alteração no formato da célula aderida. A biflorina apresentou atividade citotóxica (CI50 1,92 M) e atividades citostática, anticlonogênica e inibidora da motilidade in vitro, estatisticamente significativas (p<0,05) desde a concentração de 1 M. Houve redução significativa da taxa de amplificação de MYC, nas células tratadas com 2,5 e 5,0 M da droga (p<0,05), o que pode justificar a ocorrência de processo de diferenciação celular, tendo em vista o papel fisiológico desse gene. Essa diferenciação foi confirmada pelos resultados obtidos durante o teste do NBT, no qual as células apresentaram capacidade de metabolizar o sal a partir do tratamento de 1,0 M. O comprimento do telômero foi reduzido nas células tratadas com 5,0 M de biflorina (p<0,05). Esses resultados demonstram que a biflorina atua sobre importantes alvos da terapia anticâncer, quando utilizada sobre a linhagem gástrica ACP02 em concentrações em torno de 2,5 M, o que a torna uma substância promissora para o tratamento desse tipo de tumor.
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Avaliação da presença de microrganismos da classe Mollicutes, Mycoplasma hyorhinis e Helicobacter pylori em biópsias de pacientes com e sem câncer gástrico. / Evaluation of the presence of microorganisms of the class Mollicutes, Mycoplasma hyorhinis and Helicobacter pylori in biopsies of patients with and without gastric cancer.

Araujo, Camila do Nascimento 01 December 2017 (has links)
O câncer gástrico já foi descrito associado com Helicobacter pylori e Mycoplasma hyorhnis. Em vista disso, este trabalho avaliou a presença de Mollicutes, M. hyorhinis e H. pylori e suas correlações com câncer gástrico. Foram obtidas 120 amostras de biopsias gástricas embebidas em parafina em Vitória da Conquista - BA, armazenadas no período de 2006-2016. Destes 80 eram de pacientes com câncer gástrico. Para a extração de DNA foi utilizado um kit comercial com desparafinização prévia. A PCR convencional foi aplicada para detecção de Mollicutes, H. pylori e M. hyorhinis, que também foi detectado por qPCR e imuno-histoquímica. Os dados obtidos foram avaliados pelos testes estatísticos de Pearson (X2) e de Mann-Whitney (p 0,05). O grupo controle apresentou maior frequência de Mollicutes (12,3%) e M. hyorhinis (11,0%). H. pylori foi detectado no grupo caso (8,2%) e mas teve maior frequência no grupo controle (22,5%). Não houve coinfecção de Mollicutes, M. hyorhinis e H. pylori no grupo caso, mas o grupo controle apresentou maior prevalência de H. pylori, com associação estatisticamente significativa (p < 0,001). Estes resultados podem direcionar para um aprimoramento de controle e conhecimento de micoplasmas e sua relevância em fenótipos malignos. / Gastric cancer has already been described associated with Helicobacter pylori and Mycoplasma hyorhnis. In view of this, this study evaluated the presence of Mollicutes, M. hyorhinis e H. pylori and its correlations with gastric cancer. 120 samples of gastric biopsies embedded in paraffin were obtained in Vitória da Conquista - BA, stored in the 2006-2016. Of these, 80 were patients with gastric cancer. For DNA extraction a commercial kit with prior dewaxing was used. Conventional PCR was applied for detection of Mollicutes, H. pylori and M. hyorhinis, it which was also detected by qPCR and immunohistochemistry. The data were evaluated by the Pearson (X2) and Mann-Whitney statistical tests (p 0,05). The control group had a higher frequency of Mollicutes (12,3%) and M. hyorhinis (11,0%). H. pylori was detected in the case group (8,2%), but had a higher frequency in the control group (22,5%). There was no coinfection of Mollicutes, M. hyorhinis and H. pylori in the case group, but the control group had a higher prevalence of H. pylori, with a statistically significant association (p < 0,001). These results may lead to improved control and knowledge of mycoplasmas and their relevance to malignant phenotypes.
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Influência do refluxo duodenogástrico nas alterações histológicas da mucosa gástrica em ratos infectados por Helicobacter pylori: modelo experimental / Duodengastric reflux influence in histological changes of the gastric mucosa in mice infected by Helicobacter pylori: experimental model

José Carlos Ribeiro de Araújo 26 March 2013 (has links)
O Helicobacter pylori, é tido como o principal fator de risco para o carcinoma gástrico. Diferentes estudos experimentais em animais procuram relacionar essa carcinogênese a outros fatores carcinógenos sem sucesso. Neste estudo, procurou-se avaliar-se em ratos, se há correlação entre o refluxo duodenogástrico, o Helicobacter pylori e o desenvolvimento do câncer gástrico ou de seus precursores. Para tal, realizou-se nos três grupos de ratos (n de dez por grupo) as técnicas de: piloroplastia precedida de infecção, gastrectomia subtotal precedida de infecção e um grupo no qual foi praticada apenas a infecção. Apois seis meses, analisou-se as alterações da mucosa, comparando-se os três grupos. As alterações da mucosa pesquisadas foram as seguintes: gastrites, metaplasias, displasias e neoplasias epiteliais. Ao término do estudo, foi encontrado, no grupo submetido a piloroplastia precedida de infecção um alto percentual de alterações epiteliais. Conclui-se que, no rato, a operação de piloroplastia, levou ao maior desenvolvimento da população do Helicobacter pylori, que se relaciona com as lesões pré- malignas e o adenocarcinoma gástrico. / Helicobacter pylori is considered the main risk factor for gastric carcinoma. Different experimental studies in animals seek to relate this carcinogenesis to other carcinogenic factors without success. This study sought to evaluate in rats, if there was a correlation between duodenogastric reflux, Helicobacter pylori and the development of gastric cancer or its precursors. To this end, it was carried out in three groups of rats the techniques: pyloroplasty, subtotal gastrectomy and only infection. After six months, the changes in mucosa were analyzed comparing the three groups. The mucosal changes reseached were: gastritis, metaplasia, dysplasia and epithelial neoplasms. At the end of the study, was found in the group that underwent pyloroplasty a high percentage of epithelial alterations and these correlated with the population of Helicobacter pylori. It is concluded that in the rat, the operation of pyloroplasty led to increased colonization of the population of Helicobacter pylori and is related with the development of benign lesions and gastric cancer.
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Análise das alterações genéticas e epigenéticas dos tumores gástricos infectados por Helicobacter pylori e v rus Epstein-Barr

Ferrasi, Adriana Camargo [UNESP] January 2007 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:55Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007Bitstream added on 2014-06-13T20:01:07Z : No. of bitstreams: 1 ferrasi_ac_dr_rcla.pdf: 1030993 bytes, checksum: 9a0fbcc4634e2697322fd343cddaa074 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Gastric cancer (GC) is one of the most common cancer types and it is associated with high mortality frequencies. Although a decrease in the worldwide incidence is observed, the prognosis of this disease still remains poor, mainly when the diagnosis is carried out at advanced stages. Recent evidences have identified DNA methylation as an important mechanism for tumor suppressor gene inactivation. Helicobacter pylori infection is considered one of the most important etiological factors and the CagA gene is associated with more severe pathologies including cancer. Likewise, EBV is another infectious agent that has been associated with gastric carcinoma in at least 10% of the cases. In this study, we determined the promoter methylation status of the CDH1, DAPK, COX2, hMLH1 and CDKN2A and MSI frequency in 89 primary gastric carcinomas and correlated the findings with the presence of H. pylori and EBV infections and also with clinicopathological features of gastric carcinomas. COX2 was the most frequently hypermethylated gene (63.5%) in these patients, followed by DAPK (55.7%), CDH1 (51%), CDKN2A (36%) and hMLH1 (30.3%). In this study, MSI was correlated with hMLH1 methylation, as shown before, and there was an inverse correlation between DAPK hypermethylation and MSI. Also, MSI was inversely correlated with H. pylori CagA+, providing new evidence for the association of MSI and better prognosis.
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Análise da expressão de hsa-miR-9 e CDH1 em adenocarcinoma gástrico / Expression analisys of hsa-miR-9 and CDH1 in gastric adenocarcinoma

OLIVEIRA, Kelly Cristina da Silva 02 June 2016 (has links)
Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-01-06T14:23:26Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_AnaliseExpressaoAdenocarcinoma.pdf: 1904046 bytes, checksum: 657a7af0ca7087667eedd1e253ebcdc9 (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2017-01-10T13:59:42Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_AnaliseExpressaoAdenocarcinoma.pdf: 1904046 bytes, checksum: 657a7af0ca7087667eedd1e253ebcdc9 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-10T13:59:42Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_AnaliseExpressaoAdenocarcinoma.pdf: 1904046 bytes, checksum: 657a7af0ca7087667eedd1e253ebcdc9 (MD5) Previous issue date: 2016-06-02 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A perda de expressão de CDH1 é um evento frequente no câncer gástrico (CG), na manifestação esporádica e hereditária, importante no processo de invasão e metástase. Aproximadamente, 15-50% das famílias afetadas pela síndrome do câncer gástrico difuso hereditário (CGDH) apresentam mutações germinativas no gene CDH1. Evidências demonstraram que hsa-miR-9 participa da regulação negativa desta proteína em câncer de mama e carcinoma hepatocelular. No presente estudo, foi investigada a possibilidade do hsa-miR-9 ser um mecanismo envolvido na perda de função de CDH1 em CGDH e CG esporádico. Para a quantificação relativa da expressão de hsa-miR-9 por PCR em tempo real, foram utilizadas amostras de 9 pacientes portadores de CGDH e amostras pareadas de CG esporádico e tecido não neoplásico adjacente de 138 pacientes. Adicionalmente, foi realizada a análise do número de cópias do gene MYC, um regulador positivo do hsa-miR-9, nas amostras de CGDH. A expressão de RNAm de CDH1 e da sua proteína nas amostras de CG esporádico foram realizadas por PCR em tempo real e Western-Blot, respectivamente. Nas amostras de CGDH, foi observado um aumento da expressão de hsa-miR-9 e do número de cópias do gene MYC (≥3 cópias) independente da presença de mutação germinativa no gene CDH1. No CG esporádico, foi observado uma redução da expressão de RNAm de CDH1, CDH1 e hsa-miR-9 no tumor em relação ao tecido não-neoplásico. Além disso, foi encontrada uma associação significativa da redução da expressão de CDH1 no tipo difuso e nos tumores avançados. A redução da expressão de RNAm CDH1, CDH1 e hsa-miR-9 também foi associada significativamente com a presença de metástase em linfonodo e estadiamento tumoral III-IV. Na análise de correlação, foi identificado uma correlação muito forte entre a expressão do RNAm e proteica de CDH1, e uma correlação forte entre a expressão de RNAm de CDH1 e hsa-miR-9, e a expressão proteica de CDH1 e hsa-miR-9. O hsa-miR-9 assume um caráter controverso em CG de acordo com o tipo de manifestação, ora desempenhando papel de oncomiR (CGDH), ora se comportando como tsmiR (esporádico). No CGDH, o aumento da expressão de hsa-miR-9 pode ser influenciado pela amplificação do gene MYC e sugerimos que funcione como mecanismo de segundo evento em portadores da síndrome CGDH com mutação germinativa no gene CDH1. Em relação ao CG esporádico, baseados na teoria do campo de cancerização, sugerimos que ocorre um aumento da expressão de hsa-miR-9 no tecido gástrico adjacente em relação ao tecido sem neoplasia, sendo essa elevação maior que no tumor, o que levaria a regulação negativa de CDH1, importante para transição epitélio-mesenquimal e iniciação do tumor. / The loss of CDH1 expression is a frequent event in gastric cancer (GC), in sporadic and hereditary manifestation, important in the invasion and metastasis process. Approximately, 15-50% of families affected by hereditary diffuse gastric cancer syndrome (HDGC) have germline mutations in the CDH1 gene. Evidences established that hsa-miR-9 participates of this protein downregulation in breast cancer and hepatocellular carcinoma. In the present study, we investigated the possibility of hsa-miR-9 is involved in CDH1 negative regulation in HDGC and sporadic GC. For the relative quantification of hsa-miR-9 expression by real-time PCR, was used samples from 9 patients with HDGC and paired samples of sporadic GC and adjacent non-neoplasic gastric tissue of 138 patients. Additionally, was performed copy number variation analysis of the MYC gene, a positive regulator of has-miR-9, in HDGC samples. The expression of CDH1 mRNA and its protein in sporadic GC samples were performed by real time PCR and Western Blot, respectively. All HDGC samples, exhibited increased of hsa-miR-9 expression and copies number of MYC (≥3 copies) independent of the presence of germline mutation in CDH1 gene. In sporadic GC it was detected a reduction of CDH1 mRNA expression, CDH1 and hsa-miR-9. Moreover, was found a significant association of CDH1 reduced expression in diffuse-type tumors and advanced. The reduction of CDH1 mRNA expression, CDH1 and hsa-miR-9 was significantly associated with lymph node metastasis and tumor stage III-IV. In correlation analysis, was identified a very strong correlation between the expression of mRNA and protein of CDH1, and a strong correlation between the CDH1 mRNA expression and hsa-miR-9, and the protein expression of CDH1 and hsa-miR-9. The hsa-miR-9 takes a controversial role in CG according to the type of manifestation, playing oncomiR paper in HDGC, occasionally behaving like tsmiR in sporadic. In HDGC, we suggest that hsa-miR-9 overexpression could be influenced by MYC amplification and that it functions as a second event mechanism in patients with germline mutation in the gene CDH1. Regarding sporadic GC, as an alternative hypothesis based on the theory of field cancerization, we suggest that there is an increased expression of hsa-miR-9 in the adjacent stomach tissue compared to the gastric tissue without cancer. This overexpression would be higher in adjacent tissue than in the tumor, leading to downregulation of CDH1, important for epithelial-mesenchymal transition and tumor initiation.
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Identificação de polimorfismos de nucleotídeo único com efeitos deletérios em transcriptomas de câncer gástrico

SILVA, Viviane Santos da 29 September 2015 (has links)
Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-01-26T13:40:39Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_IdentificacaoPolimorfismosNucleotideo.pdf: 959646 bytes, checksum: 9c0bce2785c66213bb6b72ebda2ae1e9 (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2017-01-27T13:27:58Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_IdentificacaoPolimorfismosNucleotideo.pdf: 959646 bytes, checksum: 9c0bce2785c66213bb6b72ebda2ae1e9 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-27T13:27:58Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_IdentificacaoPolimorfismosNucleotideo.pdf: 959646 bytes, checksum: 9c0bce2785c66213bb6b72ebda2ae1e9 (MD5) Previous issue date: 2015-09-29 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O câncer gástrico é uma das principais causas de mortalidade por câncer no mundo. Seu desenvolvimento está associado a fatores relacionados ao estilo de vida e a alterações genéticas que podem modificar genes e/ou vias biossintéticas e metabólicas importantes para a manutenção da integridade celular e tecidual. Pesquisas envolvendo câncer têm sido realizadas com o intuito de identificar genes e mutações que possam ser utilizados como marcadores genéticos e possíveis alvos terapêuticos. Estudos realizados com genes codificantes de proteínas da via dos hormônios esteroides já identificaram polimorfismos que podem estar relacionadas ao risco de câncer. Por tratar-se de uma via importante para processos fisiológicos e patológicos, estudos de identificação de polimorfismos genéticos nesta via, e na via de biossíntese do colesterol poderão contribuir com o entendimento da carcinogênese gástrica. Diante disso, foi realizada uma análise bioinformática em transcriptomas de tecidos gástricos com câncer e sem câncer, com o objetivo de identificar SNPs em genes codificantes de enzimas das vias de biossíntese dos hormônios esteroides, do colesterol e do receptor de progesterona que possam estar relacionadas ao desenvolvimento do câncer gástrico. A análise foi realizada por meio da Plataforma Galaxy, da ferramenta de alinhamento BOWTIE e do software de análise funcional de variações PROVEAN Genome Variants. SNPs deletérios foram identificadas nos genes CYP51A1, DHCR24 e SQLE da via de biossíntese de hormônios esteroides e nos genes CYP3A5, HSD17B12, UGT1A1, UGT1A5, UGT1A6 e AKR1C3 da via biossintética do colesterol. O gene CYP3A5 apresentou o maior número de SNPs deletérios. Estes resultados indicam uma possível participação dos genes analisados nos mecanismos moleculares envolvido no desenvolvimento do câncer gástrico. / Gastric cancer is one of the leading causes of cancer mortality in the world. Its development is associated with factors related to lifestyle and genetic alterations that can modify genes and important biosynthetic and metabolic pathways that help maintaining cellular and tissue integrity. One of the main cancer research objectives is identify genes and mutations that may be used as genetic markers and potential therapeutic targets. Studies with genes related to the pathway of steroid hormones proteins have already identified polymorphisms that may be related to the risk of cancer. Because it is an important route for physiological and pathological processes identification of genetic polymorphisms in this and cholesterol biosynthesis pathway may contribute to the understanding of gastric carcinogenesis. Therefore, we performed a comprehensive bioinformatics analysis of transcriptome datasets from gastric tissues with and without cancer, in order to identify SNPs in genes associated to enzymes of biosynthetic pathways of steroid hormones, cholesterol and progesterone receptor that may be related to gastric cancer. The analysis was performed using the Galaxy Platform, the Bowtie alignment tool and the Provean software for functional analysis of variations. Deleterious mutations have been identified in CYP51A1, DHCR24 and SQLE genes in the steroid hormone biosynthesis pathway, and in CYP3A5, HSD17B12, UGT1A1, UGT1A5, UGT1A6 and AKR1C3 genes in the cholesterol biosynthetic pathway. The CYP3A5 gene had the highest number of deleterious SNPs. These results indicate a possible participation of genes analyzed in the molecular mechanisms involved in the development of gastric cancer.
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EXPRESSÃO IMUNOISTOQUÍMICA DE HER2 EM ADENOCARCINOMA DO ESTÔMAGO NA REGIÃO CENTRAL DO RIO GRANDE DO SUL

Carli, Diego Michelon de 30 July 2013 (has links)
Introduction: Worldwide, Gastric Cancer (GC) is the fourth cancer in incidence and the second most common cause of cancer death. Because it is asymptomatic in the early stages, it is often diagnosed in advanced stages. HER2 gene expression has been identified in about 20% of GC. Its expression is associated with a worse prognosis for GC patients. Objectives: To study HER2 immunoexpression in specimens of gastric adenocarcinoma and its association with histological classification and anatomical location. Patients and methods: We conduct a cross-sectional study, where we analyzed HER2 immunoexpression in 48 specimens of gastric adenocarcinoma. We use avidin-biotin method with primary antibody peroxidase C-erb B2, clone EP1045Y (Biocare Medical, USA). Results: We found seven positive cases. HER2 was expressed in 5 intestinal type and 2 in the intestinal component of mixed type. There was no expression of HER2 in diffuse type. HER2 expression was associated with the intestinal component of gastric adenocarcinoma (p = 0.003). Regarding the anatomical site, 1 in 6 (16.6%) proximal cases was positive for HER2, and 6 in 42 (14.28%) distal were positive for HER2. We did not find an association between HER2 expression and the anatomical site of GC. Conclusion: HER2 immunoexpression was found in 14.6% of the sample and it showed significant association with Lauren's intestinal subtype. / Introdução: O Câncer Gástrico (CG) ocupa o quarto lugar em incidência no mundo, sendo a segunda causa de óbito por neoplasia maligna. Por ser assintomático nas fases iniciais, na maioria das vezes, é diagnosticado em fases avançadas. A expressão do gene HER2 tem sido identificada em cerca de 20% dos CG, e sua hiper-expressão está associada a um pior prognóstico nestes pacientes. Objetivo: Investigar a expressão imunoistoquímica do HER2 em espécimes de adenocarcinoma gástrico, e sua relação com a classificação histológica e localização anatômica. Pacientes e métodos: Estudo transversal, retrospectivo, onde foi analisada a expressão imunoistoquímica para o HER2, em uma amostra de 48 espécimes de CG, através da técnica de imunoistoquímica, pelo método avidina-biotina-peroxidase, utilizando anticorpo primário C-erb B2, clone EP1045Y (Biocare Medical, USA). Resultados: Foram encontrados 7 casos com expressão positiva de HER2; destes, 5 eram casos de adenocarcinoma do tipo intestinal e 2 eram casos do tipo misto, porém, nestes, a expressão ocorreu no componente intestinal, o que determinou uma associação significante da expressão de HER2 com o componente intestinal do adenocarcinoma gástrico (p=0,003). Quanto ao sítio anatômico, dos 6 casos proximais, somente 1 (16,6%) foi positivo para o HER2, e nos 42 casos distais 6 (14,28%) foram positivos para o HER2. Não foi demonstrada associação da expressão de HER2 com o sítio anatômico das lesões. Conclusão: A expressão de HER2 ocorreu em 14,6% da amostra, associada significativamente ao subtipo intestinal de Lauren.
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Detecção de mutação no gene supressor de tumor p53 e associação e cepas patogênicas do Helicobacter pylori em câncer gástrico /

Oliveira, Juliana Gonçalves de. January 2008 (has links)
Orientador: Nídia Alice Pinheiro / Banca: Elaine Sbroggio de Oliveira Rodini / Banca: Daniel Araki Ribeiro / Resumo: O câncer gástrico é o quarto tipo mais comum e o segundo em mortalidade. Apesar da diminuição do número de casos nos últimos tempos ainda é um grande problema mundial. E mais, sua associação com o Helicobacter pylori (HP) está cada vez mais preocupante, devido à alta prevalência de cepas patogênicas dessa bactéria. Além disso, mutações em genes que agem no ciclo celular podem levar ao câncer. O gene que codifica a proteína p53 é responsável pelo reparo de lesões no DNA durante o ciclo celular funcionando como um regulador transcricional. Quando o reparo não é viável a proteína p53 induz a entrada da célula danificada em apoptose. Mutações mais freqüentes ocorrem nos exons 5, 6, 7 8 e 9. No atual trabalho investigou-se a possível associação da mutação no gene p53, correlação com presença da cepa patogênica CagA+ e estadiamento do tumor. Foram estudadas 55 amostras de câncer gástrico extraídas por biópsia durante gastrectomia. PCR foi utilizada para os exons 5 ao 9, análise de mutação por sequenciamento automático e dados clínicos foram coletados incluindo infecção por Helicobacter pylori/CagA+. Trinta e dois casos apresentaram mutações em p53 sendo que 6 deles apresentaram mutação em mais de um exon. 53% apresentaram-se infectados por HP CagA+. 87% dos pacientes estavam em estadiamento avançado do tumor (II, III e IV) e 80% eram do tipo intestinal. Quanto a correlação de p53 e cagA+ a casuística é relativamente pequena, e assim a correlação de p53 e cagA não foi vista. Os resultados confirmam a relevância das mutações em p53 e da presença da cepa patogênica CagA nos casos de câncer gástrico, contudo estudos devem ser realizados com um maior número amostral. Neste caso, o uso da p53 mutada pode ser utilizada em diagnóstico indicando, assim um melhor tratamento, desde que há casos em que sua alteração impõe resistência... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The gastric cancer is the fourth most common type and the second in mortality. Despite the decrease in the number of cases in recent times is still a major problem worldwide. Moreover, its association with Helicobacter pylori (HP) is increasingly worrying, because of the high prevalence of pathogenic strains of this bacterium. Furthermore, mutations in genes that act in the cell cycle can lead to cancer. The gene encoding the p53 protein is responsible for repair of lesions in DNA during cell cycle working as a transcriptional regulator. When the repair is not viable in the p53 protein induces the entry of the cell into apoptosis damaged. Change frequently occur in exons 5, 6, 7 8 and 9. In the current work investigated is the possible association of the mutation in the p53 gene, correlation with the presence of pathogenic strain CagA + and staging of the tumor. We studied 55 samples of gastric cancer extracted by biopsy taken during gastrectomy. PCR was used to the exons 5 to 9, analysis of mutation by sequencing automatic and clinical data were collected including infection by Helicobacter pylori / CagA +. Thirty-two patients had mutations in p53 is that 6 of them had more than one mutation in exon. 53% showed up infected HP CagA +. 87% of the patients were in advanced staging of the tumor (II, III and IV) and 80% were of the intestinal type. As the correlation of p53 and cagA + the casuistic is relatively small, and thus the relationship of p53 and cagA was not seen. The results confirm the relevance of mutations in p53 in the presence of pathogenic strain CagA in cases of gastric cancer, but studies must be conducted with greater sample. In this case, the use of p53 mutant can be used in diagnosis indicating thus a better treatment, since there are cases where its amendment requires resistance to certain types of treatment, regardless of the presence of H pylori... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

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