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Infecção oculta pelo virus da hepatite B em pacientes com infecção cronica pelo virus da hepatite C

Silva, Claudia da 26 November 2004 (has links)
Orientadores: Fernando Lopes Gonçales Junior, Neiva Sellan Lopes Gonçales / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-04T02:42:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Silva_Claudiada_M.pdf: 5366361 bytes, checksum: e07618e3f3502fa067dd078ba533e4fd (MD5) Previous issue date: 2004 / Resumo: A infecção pelo VHB em pacientes que não apresentam o antígeno de superficie do vírus da hepatite B (HBsAg) detectável pelos métodos usuais, é denominada de infecção oculta. Sua prevalência e significado clínico, não estão ainda, completamente esclarecidos. A proposta deste estudo foi o de investigar: a) a presença de infecção oculta pelo VHB em pacientes com infecção crônica pelo VHC; b) correlacionar a presença do DNA do VHB com fatores de riscos para aquisição da HVB e HVC ; c) correlacionar a presença do DNA do VHB com as alterações histológicas e hepáticas nos pacientes co- infectados pelo VHC e com a resposta ao tratamento da hepatite C. Foi utilizada a Reação em Cadeia da Polimerase para pesquisar o DNA do VHB em amostras de soro de 256 indivíduosHBsAg negativo e anti-HBc positivo: 150 eram doadores de sangue (100 eram anti-HBc isolado e 50 eram anti-HBc / anti-HBs positivo) e 106 eram pacientes com infecção crônica pelo vírus da hepatite C (HCV) (50 eram anti-HBc isolado e 56 eram anti-HBc / anti-HBs positivo). A prevalência da infecção oculta pelo VHB variou de 4% (6/150) nos doadores de sangue a 24% (12/50) nos pacientes com infecção crônica pelo VHC (anti-HBs negativo). A prevalência da infecção oculta pelo VHB em todos os pacientes co-infectados com o YHC foi de 14.2% (15/106). Foi observado que nos pacientes com infecção oculta pelo VHB, o anticorpo contra o antígeno de superficie do VHB (anti-HBs) não foi capaz de proteger os pacientes co-infectados pelo VHC (5,4, 3/56). Não houve correlação entre os diferentes genótipos do VHC e a presença de infecção oculta pelo VHB nem com o grau histológico de lesão hepática. A infecção oculta pelo VHB não influenciou na resposta ao interferon em pacientes com infecção crônica pelo VHC / Abstract: HBV infections in patients who lack levels of hepatitis B surface antigen (HBsAg) are called occult infections. Their prevalence and clinical significance are not yet fully understood. The purpose of this study was to investigate: a) the prevalence ofHBV occult infection in patients with chronic HCV infection; b) to correlate the presence ofHBV DNA with risk factor to acquire HBV and HCV infection; c) to correlate the presence of HBV DNA in serum with histopathologic al terations and the response to interferon therapy in patients with chronic HCV infection. We used the polymerase chain reaction to search for HBV DNA in serum samples from 256 HBsAg negative and anti-HBc positives subjects: 150 were blood donors (100 were anti-HBc alone and 50 were anti-HBc / anti-HBs positive), 106 were patients with chronic hepatitis C virus (HCV) infection (50 were anti-HBc alone and 56 were anti-HBc / anti-HBs positive). The prevalence of HBV occult infection ranged from 4% (6/150) in blood donors to 24% (12/50) in patients with chronic HCV infection anti-HBc / anti-HBs negative. The prevalence of HBV occult in the totality of patients co-Ínfected with HCV was 14.2% (15/106). It was observed that in our patients with HBV occult infection the antibodies to anti-HBs was not able to protect the patients co-Ínfected with HCV (5.4, 3/56). There was not correlation between different genotypes and the presence HBV occult infection neither with the lesion histological grade. The HBV occult infection did not influence in the response to interferon therapy in the patients with chronic HCV infection / Mestrado / Ciencias Biomedicas / Mestre em Ciências Médicas
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Detecção do DNA do Trypanosoma cruzi pela reação em cadeia da polimerase (PCR) em pacientes chagasicos cronicos

Marcon, Glaucia Elisete Barbosa 31 July 2001 (has links)
Orientador: Sandra Cecilia Botelho Costa / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-07-31T19:10:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Marcon_GlauciaEliseteBarbosa_M.pdf: 14060176 bytes, checksum: af649901dd029fcd8904eaa52639abe2 (MD5) Previous issue date: 2001 / Resumo: A doença de Chagas, causada pelo protozoário Trypanosoma cruzi é endêmica na América Latina, onde estima-se que 16 a 18 milhões de pessoas estejam cronicamente infectadas. A tripanosomíase americana é caracterizada por uma fase aguda, com elevado número de parasitas no sangue, detectados através de métodos parasitológicos; e uma fase crônica, onde os parasitas são pouco detectados no sangue periférico, o que toma o diagnóstico dificilneste estágio. Testes sorológicos para o diagnóstico da doença de Chagas são sensíveis, mas sua especificidade é insatisfatória. Por outro lado, a detecção direta do parasita no sangue, como o xenodiagnóstico e a hemocultura, são altamente específicos, mas apresentam baixa sensibilidade. Testes moleculares como a PCR (Reação em Cadeia da Polimerase), que amplifica seqüências repetitivas do cinetoplasto do T cruzi (k DNA) e DNA nuclear têm sido propostos como uma boa alternativa para a detecção de fragmentos do T cruzi no sangue humano. O presente estudo tem como principal objetivo testar o diagnóstico pela PCR em pacientes chagásicos crônicos e pacientes com sorologia duvidosa para a doença de Chagas atendidos no GEDoCh (Grupo de Estudos em Doença de Chagas) / HC / UNICAMP. O DNA extraído do sangue periférico dos pacientes foi amplificado pela PCR utilizando-se oligonucleotídeos do k DNA e DNA nuclear. Fragmentos de 330 pares de base e de 149 pares de base, amplificadospela PCR e PCR dupla a partir dessas regiões, foram detectados em pacientes chagásicos crônicos. Os resultados obtidos foram comparados com a sorologia e xenodiagnóstico, realizados a partir de técnicas já padronizadas. Entre os pacientes com sorologia negativa, não houve amplificação de DN positiva para a doença de Chagas, 43 apresentaram PCR dupla positiva. Dos 28 pacientes com sorologia duvidosa, 11 apresentaram PCR dupla positiva, dos quais um apresenta xenodiagnóstico negativo. Nossos resultados sugerem que a PCR dupla por nós padronizada, pode ser complementar a sorologia para o diagnóstico da doença de Chagas e contribui para o esclarecimento de casos com sorologia duvidosa / Abstract: Chagas disease, caused by Trypanosoma cruzi, is an important endemic illness in Latin America, where an estimated 16 to 18 million persons are chronically infected. The trypanosomiasis involves a characteristic acute phase with high levels of parasites in the bloodstream, allowing a diagnosis by parasitological methods, and a chronic phase in which parasites are not detectable in blood smears, makingthe diagnosis difficult at this stage. Serological tests for T. cruzi detection in blood are sensitive, but their specificity is generally unsatisfactory. On the other hand, direct detection of parasites in blood, either by xenodiagnosis or hemoculture, is highly specific but of low sensitivity. Molecular assays such as the Polymerase Chain Reaction (PCR), which amplify certain repetitive sequences of trypanosome kinetoplast DNA (kDNA), and DNA nuclear have been proposed as good altemative tools for detection of T. cruzi in human blood. The present study aimed to test PCR diagnosis in chagasic chronic patients and doubtful serological patients attended in GEDoCh (Grupo de Estudos em Doença de Chagas)/UNICAMP. The DNA prepared ITompatient's blood was amplified by the PCR using primers of the kinetoplast minicircles and DNA nuclear. A 330 bp and 149 bp Tagmentsoriginating ITomkinetoplast DNA and DNA nuclear was specifically detected in chronic chagasic. The results of these tests were compared with serological diagnosis performed using standard techniques and xenodiagnosis. We found that seven of the serologically negative individuaIs don't give specific amplification product, whereas 43 out of 53 patients previously serodiagnosed as chagasic were positive using the Nested - PCR (DNA nuclear) method. In addition, twelve of twenty-eight patients with doubtful serologic results were confirmed as positive by PCR. That two was negative xenadiagnosis. Our results suggest that the Nested - PCR may be a toei complementary to serology in the diagnosis af Chagas disease, and that it is available for parasite detection in patients with chronic disease and patients with doubtful serologic / Mestrado / Mestre em Farmacologia
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Primers desenvolvidos atraves de hibridização subtrativa e RAPD para a detecção de xylella fastidiosa

Ferreira, Henrique 23 July 2018 (has links)
Orientador: Yoko Bomura Rosato / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-23T19:16:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ferreira_Henrique_M.pdf: 2280796 bytes, checksum: 82e25720ea1b009fc1162dcc445725a2 (MD5) Previous issue date: 1988 / Mestrado
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Pneumovirus aviario (PVA): detecção por RT-PCR quimioluninescente e caracterização dos isolados brasileiros por analise com enzimas de restrição e sequenciamento

Dani, Maria Angela Gomes de Castro 22 June 1998 (has links)
Orientador: Clarice Weis Arns / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-23T20:36:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dani_MariaAngelaGomesdeCastro_M.pdf: 3584513 bytes, checksum: 44f0c60386e93a6a79298e7ba5df2fba (MD5) Previous issue date: 1998 / Resumo: Pneumovírus aviário (PVA) causa infecção aguda no trato respiratório em perus (rinotraqueítedos perus) e galinhas (síndrome da cabeça inchada) com início abrupto e disseminação rápida. Neste estudo, foi padronizada a reação de RT-PCR quimioluminescente para detecção de um transcrito do gene F do PVA em dois isolados europeus e dois isolados brasileiros. Foram realizadas PCRs de diluição limitante utilizando-se RT-PCR quimioluminescente e "nested PCR" (nPCR) para a comparação quanto à sensibilidade e especificidade entre as metodologias na detecção de PVA. A sensibilidade e especificidade da RT-PCR quimioluminescente foram semelhantes às da nPCR e 100 vezes mais sensível que uma única PCR. O seqüênciamento dos produtos de 175 pb do gene F revelaram 100% de homologia com seqüências depositadas no banco de dados. Em seguida foi realizada a caracterização dos isolados brasileiros através de RT-PCR, análise com enzimas de restrição e seqüênciamento automático de um fragmento do gene G. Os produtos de 600 pb correspondentes aos primeiros 600 nucleotídeos do gene G dos isolados SHS BR 119 e SHS BR 121 revelaram 99% de similaridade com 3 isolados do subgrupo A e 87% de similaridade com isolados do subgrupo B depositadas no banco de dados / Abstract: Avian Pneumovirus (APV) causes an acute respiratory tract infection both in turkeys (turkey rhinotracheitis) and chicken (swollen head syndrome) with sudden onset and rapid spread through the flocks. In this study, immunochemiluminescent Southern blot RT-PCR assay was employed to detect a F gene transcript of the avian pneumovirus (APV) in two European turkey isolates and two Brazilian chicken isolates. Limiting dilution PCR was performed to compare the sensitivity of immunochemiluminescent Southern blot assay and nested PCR (nPCR) assay. The sensitivity and specificity of immunochemiluminescent Southem blot RT-PCR assay were comparable to that of nPCR, and at least 100 fold more sensitive than a single PCR amplification. Sequence analysis of the 175 bp product ofthe F gene revealed 100% identity with earlier reported PVA sequences. We characterized the Brazilian isolates using restriction analysis and sequencing of a 600 bp fragment of the G gene and conclude that the isolates belong to the APV subgroup A / Mestrado / Microbiologia / Mestre em Ciências Biológicas
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Estudos de matrizes e inibidores nas reações catalisadas por DNA polimerases dependentes de RNA

Aoyama, Hiroshi, 1943- 18 July 2018 (has links)
Tese (livre docencia) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-18T01:30:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Aoyama_Hiroshi_LD.pdf: 2543438 bytes, checksum: 566b31a0eee0dc208eb769e82e13509e (MD5) Previous issue date: 1985 / Resumo: Este trabalho contem alguns estudos fisico-quimicos de DNA polimerases dependentes, de RNA. Poliaminas, em presença de Mg2+, exercem um efeito ativador nas reações catalisadas por transcripta-se reversa de virus de mieloblastose de aves, mas não por DNA polimerase a de Xenopus laevis. Derivados de nucleotídeos e polinucleotídeos foram descritos como substratos e inibidores de transcriptase reversa. dCflTP pode ser incorporado parcialmente no DNA sintetisadqo por transcriptase reversa e por DNA polimerases celulares a e ?. Análogos de poli A e poli C, com substituintes 2'-fluor e 2'-O-metil, podem ser utilizados como matrizes de síntese de DNA catalisada por transcriptase reversa, em presença de Mg2+ ou Mn2+. O papel do Mn2+ na síntese de DNA e discutido neste trabalho. Diferentes compostos foram utilizados como inibidores de sintese de DNA. O antibiótico novobiocina diminui a formação do complexo entre Trp transcriptase reversa e o tRNA iniciador, ligando-se irreversivelmente à enzima. (dCfl)n é um inibidor de transcriptase reversa utilizando-se DNA ativado ou RNA 70 S como matrizes naturais e (dA)n ou (rA)n como matrizes sintéticas. Nas mesmas condições nenhum efeito é verificado nas reações catalisadas por DNA polimerase a . As reações de transcriptase reversa em presença de (dAfl)n.(dT)12 como matriz-iniciador são resistentes à ação de (dCfl)n e de outros polinucleotídeos inibidores como (rU)n e (rI)n. Entretanto, tais reações são inibidas por outros compostos como brometo de etideo, tetrametil brometo de etídeo, berenil e N-etilmaleiimida. DNA polimerase A de gérmen de trigo apresenta características de uma DNA polimerase dependente de RNA. Como a transcriptase reversa, a DNA polimerase A reconhece (rA)n com uma eficiência maior em presença de Mg2+, e é inibida por glicerol e actinomicina D. O reconhecimento de matrizes naturais do tipo RNA somente se verifica utilizando-se desoxinucleosídeos trifosfato de alta atividade específica. O processo do reverso da transcrição pode ser observado também em virus de DNA. DNA polimerases purificadas de folhas infectadas pelo vírus do mosaico da couve-flor reconhecera com eficiência (rA)n, (rC)n, (Cm)n como matrizes sintéticas; são resistentes à ação de afidicolina e são inibidas por brometo de etídeo. / Abstract: This work reports some physico-chemical studies on the RNA-dependent DNA polymerase. In the presence of Mg2+, poliamines have an activating effect on the reactions catalyzed by avian myeloblastosis virus reverse transcriptase, but not on those catllyzed by Xenopus laevis DNA polymerase a. Derivatives of nucleotides and polynucleotides have been described as substrates or inhibitors of reverse transcriptase. dCflTP could be partially incorporated in the DNA synthesized by reverse transcriptase and by cellular DNA polymerases a and ?. Poly A and poly C analogues, with 2'-fluoro and 2'-O-methyl as substituents, could be utilized as templates for the DNA synthesis catalyzed by reverse transcriptase, in the presence of Mg2+ or Mn2+, The role of Mn2+ on the DNA synthesis is discussed in this work. The antibiotic novobiocin reduces the complex formation between reverse transcriptase and the Trp primer tRNA binding irreversibly to the enzyme. It has been observed that (dCfl)n was an inhibitor of reverse transcriptase by using activated DNA or 70 S RNA as natural templates and (dA)n or (rA)n as synthetic templates. At the same conditions no effect was verified on the reactions catalyzed by DNA polymerase a. Reverse transcriptase reactions directed by (dAf1)n.(dT)12 as template-primer are resistant to (dCfl)n and to other inhibitor polynucleotides like (rU)n and (rI)n. However, these reactions were inhibited by other compounds like ethidium bromide, tetramethyl ethidium bromide, berenil and N-ethylmaleimide. Wheat germ DNA polymerase A has shown some RNA-dependent DNA polymerase characteristics. Like reverse transcriptase, DNA polymerase A could recognize (rA)n better in the presence of Mg2+ and was inhibited by glycerol and actinomycin D. RNA natural templates could be copied only when high specific activity deoxy-nucleoside triphosphate was used. The reverse of the transcription can also be observed in DNA virus. Synthetic templates like (rA)n, (rC)n, (Cm)n were efficiently recognized by DNA polymerases purified from cauliflower mosaic virus infected leaves; it has been observed that these enzymes were resistant to aphidicolin and inhibited by ethidium bromide. / Tese (livre docencia) - Univer / Livre-Docente em Ciencias Biologicas
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Avaliação microbiológica e molecular de isolados de Mycoplasma spp. a partir do leite de mastite clínica bovina

Salina, Anelise. January 2018 (has links)
Orientador: Helio Langoni / Resumo: O gênero Mycoplasma inclui mais de 200 espécies responsáveis por causar doenças nos animais. Apresenta células de tamanho reduzido e em formatos variáveis. Ocasiona mastite em bovinos, podendo também, estar relacionado a outras manifestações como artrite e pneumonia em bezerros e novilhas. Neste estudo, objetivou-se o isolamento de espécies de micoplasmas a partir de amostras de leite de mastite clínica bovina, bem como, a detecção de Mycoplasma (M.) bovis pelas técnicas moleculares de PCR convencional e PCR em tempo real. Um total de 1166 amostras de leite de casos de mastite clínica, provenientes de nove propriedades leiteiras da região da bacia leiteira ABCW – Paraná e de uma propriedade situada na região de São Pedro – São Paulo foram avaliadas para a presença do DNA de Mollicutes. Desse total, em 100 amostras de leite que foram positivas à PCR para a classe Mollicutes, realizou-se a PCR para detecção de M. bovis obtendo-se positividade de 13% (13/100). Na análise pela PCR em tempo real obteve-se 11% (11/100) de amostras positivas para M. bovis. No cultivo microbiológico, obteve-se 6% (6/100) de crescimento ao se utilizar o meio Hayflick e, 11% (11/100) de crescimento ao se utilizar o meio SP4 (incluindo as positivas ao primeiro). A partir desses isolados em caldo PPLO, nove deles foram positivos à PCR convencional para M. bovis e dois, negativos. Na análise filogenética dos isolados, a partir dos resultados do sequenciamento, obteve-se 100% de M. bovis para todos os isol... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The Mycoplasma genus includes more than 200 species responsible for causing diseases in animals. It presents cells of reduced size and in variable shapes. It may cause mastitis in cattle, and may also be related to other manifestations such as arthritis and pneumonia in calves and heifers. The objective of this study was to isolate mycoplasma species from bovine clinical mastitis milk samples, as well as the detection by molecular techniques of conventional PCR and real-time PCR of M. bovis. A total of 1166 milk samples from clinical mastitis cases from nine dairy farms in the ABCW - Paraná dairy region and from a property located in the São Pedro region - São Paulo were evaluated for the presence of Mollicutes DNA. From this total, 100 milk samples that were PCR positive for the Mollicutes class, the PCR was performed to detect the M. bovis, obtaining 13% positivity (13/100). Real-time PCR analysis yielded 11% (11/100) of positive samples for M. bovis. In the microbiological culture, 6% (6/100) of growth was obtained when using the Hayflick medium and 11% (11/100) growth when using SP4 medium (including positive ones in the first one). From these isolates in PPLO broth, nine of them were positive to conventional PCR for M. bovis and two, negative. In the phylogenetic analysis of the isolates, from the results of the sequencing, 100% of M. bovis was obtained for all the isolates. In view of the results obtained, the importance of further studies for the elucidation of other s... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Padronização da reação de trans-splicing in vitro em tripanosomas utilizando a técnica de RT-PCR /

Polverari, Fernanda Silva. January 2013 (has links)
Orientador: Regina Maria Barretto Cicarelli / Banca: Otávio Henrique Thiemann / Banca: Márcia Regina Brochetto Braga / Resumo: A família Trypanosomatidae compreende um grande número de protozoários parasitas, incluindo importantes agentes etiológicos de doenças humanas. Entre os causadores de doenças, destacam-se Trypanosoma brucei (responsável pela doença do sono), Trypanosoma cruzi (agente causador da doença de Chagas) e Leishmanias sp (causadoras de leishmanioses). Esses parasitas possuem como mecanismo para formação de seus mRNAs, a reação de trans-splicing, que envolve a excisão de íntrons (regiões intergênicas) e a união dos éxons de dois transcritos independentes, SL RNA (spliced leader) e pré-mRNA aceptor. Em outro trabalho realizado no laboratório, a reação de trans-splicing in vitro foi estabelecida utilizando extratos nucleares (livre de células) de formas epimastigotas de T. cruzi e/ou formas procíclicas de T. brucei e como pré-mRNA aceptor, a sequência parcial de alfa tubulina (contendo a região intrônica, splice site e parte do éxon da alfa tubulina) de T. cruzi marcada radioativamente (dados ainda não publicados). O uso de material radioativo é fator limitante, devido a sua alta periculosidade (extremamente nocivo ao homem e ao meio ambiente) e, também, pelo alto custo relativo aos trâmites burocráticos atuais para sua importação. Portanto, neste trabalho reproduziu-se a reação sem o uso de material radioativo, utilizando-se a transcrição reversa/ reação em cadeia da polimerase (RT-PCR) e gel de agarose corado por brometo de etídeo para a análise dos produtos formados. A metodologia permitirá a avaliação da interferência de substâncias tripanocidas, buscando potenciais alvos terapêuticos nas ribonucleoproteínas de parasitas, preservando as células do hospedeiro. / Abstract: The Trypanosomatidae family includes a large number of protozoan parasites, with importants etiological agents of human diseases. Among the causes of diseases stand out Trypanosoma brucei (responsible for sleeping sickness), Trypanosoma cruzi (Chagas disease causative agent) and Leishmania sp (causing leishmaniasis). These parasites have a mechanism that form their mRNAs, the trans-splicing reaction, which involves the introns (intergenic regions) excision and two exons union of the independent transcripts, RNA SL (spliced leader) and pre-mRNA acceptor. In another laboratory study, the trans-splicing in vitro reaction was established using nuclear extracts (cell-free) from epimastigotes forms of T. cruzi and / or procyclic forms of T. brucei, and as pre-mRNA aceptor was used the alpha tubulin partial sequence (containing the intronic region, splice site and a radiolabelled part of alpha tubulin exon from T. cruzi (unpublished data). The use of radioactive material is a limiting factor, due to its high hazard (extremely harmful to humans and environment), and also by the high cost relative to the current bureaucratic procedures for importation. Therefore, in this work the reaction was reproduced without the use of radioactive material, using the reverse transcription / polymerase chain reaction (RT-PCR) and agarose gel stained with ethidium bromide for analysis of the formed products. The method allows the evaluation of trypanocidal substances interference searching potential therapeutic targets in the parasite ribonucleoprotein, preserving the host cells. / Mestre
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Desenvolvimento de métodos moleculares baseados em PCR para a detecção de Schistosoma mansoni / Development of PCR-based molecular methods for the detection of Schistosoma mansoni

Melo, Fábio Lopes de January 2006 (has links)
Made available in DSpace on 2012-05-07T14:40:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) 000001.pdf: 929030 bytes, checksum: 36fd99d525cb996da9f8a47244cc4509 (MD5) Previous issue date: 2006 / Os primers que apresentam como alvo o gene que codifica o rDNA de SSU foram projetados para amplificar com elevada especificidade DNA de Schistossoma mansoni. Cinco sistemas de PCR foram desenvolvidos: PCR convencional, nested-PCR (NPCR) convencional, single tube nested PCR (STNPCR), hemi-nested PCR (HNPCR) convencional, e single tube hemi-nested PCR (STHNPCR). A nested-PCR é o modelo mais sensível de PCR. Entretanto, o risco da contaminação é muito alto, já que é necessário ajustar a reação em dois tubos diferentes. O objeto principal deste trabalho é o desenvolvimento de um sistema de STNPCR (patente depositada), visando diminuir o risco de contaminação cruzada, embora mantendo a sensibilidade elevada. O sistema de STNPCR compreendeu 60 ciclos em que concentrações limitadas de primers externos participam da PCR sem competir com os primers internos durante os primeiros 15 ciclos da reação, e os primers internos (imobilizados na face interna da tampa do microtubo) fossem introduzidos no sistema de PCR no décimo sexto ciclo por inversão do microtubo. As concentrações dos outros componentes da reação seriam as mesmas usadas em reações padrão de PCR. A avaliação do limite de detecção das PCRs foi realizada utilizando-se quantidades conhecidas de DNA genômico de S. mansoni, que variou de 10 ng a 0,001 fg. O limiar de detecção da PCR simples foi de 10 pg enquanto, a quantidade mínima detectada pelas PCRs nested convencional e STNPCR foram de 0,1 fg e 1 fg de DNA, respectivamente. Por sua vez o limite de detecção da HNPCR convencional também foi de 0,1 fg, e o da STHNPCR foi de 10 fg. Os sistemas desenvolvidos foram testados em pools de caramujos sadios e infectados com S. mansoni, apresentando resultados bastante satisfatórios em relação à especificidade e sensibilidade. A detecção rápida e precisa da infecção do caramujo pelo S. mansoni é de grande importância para o controle da transmissão da esquistossomose, Diante das dificuldades para se realizar esse diagnóstico pelos métodos convencionais. Sendo assim, o presente estudo buscou avaliar a utilidade das abordagens moleculares para identificar focosx de transmissão da esquistossomose por meio da detecção do S. mansoni emm pools de caramujos vetores
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Fatores associados à presença de microrganismos superinfectantes ou oportunistas na cavidade bucal: relações com próteses totais, condições periodontais e susceptibilidade a antimicrobianos

Gaetti-Jardim, Ellen Cristina [UNESP] 19 January 2009 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:25:20Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-01-19Bitstream added on 2014-06-13T20:53:07Z : No. of bitstreams: 1 jardim_ecg_me_araca.pdf: 223411 bytes, checksum: b3dc50334b0186d7da6f430f36a2eeaa (MD5) / Este estudo avaliou a ocorrência de bactéria entérica na cavidade oral em pacientes com periodontite, pacientes com gengivite, indivíduos periodontalmente saudáveis e pacientes edentados submetidos a tratamento odontológico com reabilitação protética na Faculdade de Odontologia de Araçatuba – UNESP. Quarenta e um edentados portadores de próteses totais, 89 pacientes com gengivite, 70 pacientes com periodontite e 50 indivíduos periodontalmente saudáveis foram submetidos a exame clínico, e as condições periodontais e bucais foram registradas. Foram coletadas amostras de saliva, mucosa bucal, gengiva e biofilme supra e subgengival e bactérias foram detectados por cultura e PCR. Os microrganismos-alvo foram isolados de 75,61% dos pacientes edentados, 25,84% dos pacientes com gengivite, 30% dos pacientes com periodontite e de 18% dos indivíduos saudáveis. Por PCR, as frequências de detecção foram 87,8%, 38,2%, 64,295 e 18%, respectivamente. Significativa resistência aos antimicrobianos foi observada na maioria dos isolados, e verificou-se uma grande heterogeneidade dos marcadores resistentes à ampicilina e tetraciclina. / This study evaluated the occurrence of enteric bacteria in oral cavity of periodontitis patients, gingivitis patients, periodontally healthy subjects and edentulous patients wearing complete denture undergoing dental treatment in Araçatuba School of Dentistry. Forty one edentulous wearing complete dentures, 89 gengivitis patients, 70 periodontitis patients and 50 periodontally realthy subjects were submitted to clinical examination, and periodontal and oral conditions were registred. Saliva, oral mucosa, subgingival and supra gingival biofilm samples were colleted and enteric bacteria were detected by culture and PCR. Targeted microorganisms were isolated from 75,61% of edentulous patients, 25,84% of gingivitis patients, 30% of periodontitis patients and from 18% of healthy individuos. By PCR, the detection frequencies were 87,8%, 38,2%, 64,29% and 18%, respectively. Significant resistance to antimicrobial agents was observed in most of isolates, and it was veriied a great heterogeneity of resistance markers to ampicillin and tetracycline.
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Avaliação da microbiota associada a osteomielite crônica dos maxilares através de meio de cultura e PCR

Costa, Iracy [UNESP] 26 February 2010 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:06Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-02-26Bitstream added on 2014-06-13T21:03:22Z : No. of bitstreams: 1 costa_i_dr_araca.pdf: 404352 bytes, checksum: f6cd3645b1babe03a670530063260f21 (MD5) / A osteomielite crônica de maxila e mandíbula é rara em países industrializados e sua ocorrência, nos países em desenvolvimento, está associada a trauma e procedimentos cirúrgicos, sendo que sua etiologia não foi estudada profundamente. O objetivo desse estudo foi avaliar a microbiota associada com a osteomielite de mandíbula e maxila em pacientes brasileiros. Após exames clínicos e radiográficos, amostras de seqüestros ósseos, secreção purulenta e biopsias de tecido granulomatoso de vinte e dois pacientes com osteomielite crônica da mandíbula e maxila foram cultivadas e submetidas à detecção de um conjunto de patógenos através do método do PCR. O isolamento bacteriano foi realizado em ágar “fastidious anaerobe” suplementado com hemina, menadiona e sangue de cavalo, para os microrganismos anaeróbios, e em ágar de tripticaseína de soja suplementado com extrato de levedura e sangue de cavalo, para os aeróbios e anaeróbios facultativos. Cada paciente apresentava uma única lesão. As placas foram incubadas em anaerobiose e aerobiose, a 37oC, por 14 e 3 dias, respectivamente. Bactérias foram cultivadas de 10 amostras de pacientes e os gêneros Actinomyces, Fusobacterium, Parvimonas e Staphylococcus foram os mais freqüentes. Através do PCR, DNA bacteriano foi detectado em amostras de 20 pacientes. Os resultados sugerem que as osteomielites crônicas dos maxilares geralmente são infecções anaeróbias mistas, reforçando o conceito de que estão relacionadas principalmente aos microrganismos do ecossistema bucal e que as infecções periapicais e periodontais podem atuar como fatores predisponentes. / Chronic osteomyelitis of the maxilla and mandible is rare in industrialized countries and its occurrence in developing countries is associated with trauma and surgery, and its microbial etiology has not been studied thoroughly. The aim of this investigation was to evaluate the microbiota associated with osteomyelitis of the mandible and maxilla from some Brazilian patients. After clinical and radiographic evaluation, samples of bone sequestra, purulent secretion, and biopsies of granulomatous tissues from twenty-two patients with chronic osteomyelitis of the mandible and maxilla were cultivated and submitted for pathogen detection by using a PCR method. Each patient harbored a single lesion. Bacterial isolation was performed on fastidious anaerobe agar supplemented with hemin, menadione and horse blood for anaerobes; and on tryptic soy agar supplemented with yeast extract and horse blood for facultative bacteria and aerobes. Plates were incubated in anaerobiosis and aerobiosis, at 37oC during 14 and 3 days, respectively. Bacteria were cultivated from ten patient samples; and genera Actinomyces, Fusobacterium, Parvimonas, and Staphylococcus were the most frequent. By PCR, bacterial DNA was detected from thirteen patient samples. The results suggest that cases of chronic osteomyelitis of the jaws are usually mixed anaerobic infections, reinforcing the concept that osteomyelitis of the jaws are mainly related to microorganisms from the oral environment, and periapical and periodontal infections may act as predisposing factors.

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