CABRAL, Paula Brito e. Perfil de marcadores sorológicos, salivares e moleculares de Mycobacterium leprae entre contatos intradomiciliares de pacientes com hanseníase. 2012. 82 f. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Médica) - Universidade Federal do Ceará. Faculdade de Medicina, Fortaleza, 2012. / Submitted by denise santos (denise.santos@ufc.br) on 2012-11-01T15:14:21Z No. of bitstreams: 1 2012_dis_pbcabral.pdf: 940316 bytes, checksum: 4e4b84a12cb3c19056d54bd626f283f9 (MD5) / Approved for entry into archive by Erika Fernandes(erikaleitefernandes@gmail.com) on 2012-11-06T13:53:36Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_dis_pbcabral.pdf: 940316 bytes, checksum: 4e4b84a12cb3c19056d54bd626f283f9 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-11-06T13:53:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_dis_pbcabral.pdf: 940316 bytes, checksum: 4e4b84a12cb3c19056d54bd626f283f9 (MD5) Previous issue date: 2012 / Leprosy household contacts are group at high risk of developing the disease. We investigated the presence M. leprae DNA in nasal mucosa and anti-PGL1 serum IgG/IgM and salivary IgA/IgM antibodies from leprosy household contacts (n=135) in two endemic regions, Ceara, Brazil. Good correlation between serum IgM and IgG isotypes was observed both in MB and in PB leprosy household contacts (r = 0.39, p <0.0001). However, their levels were much different (p <0.0001). Among the contacts positive for serum IgM, 74 (87%) were found to be negative for serum IgG. In respect to the salivary antibodies, PB leprosy household contacts showed correlation between IgA and IgM (r = 0.60, p <0.0001); the same was observed in MB leprosy contacts (r = 0.77, p <0.0001). It was observed that in 75.3% of the leprosy household contacts who were positive to serum anti-PGL1, their salivary antibodies were negative. On the other hand, 50% of the leprosy household contact who were negative to serum anti-PGL1 antibodies, their salivary antibodies were positive. M. leprae DNA was found in nasal swab in 9 MB household leprosy contacts (10.6%) and in 3 PB leprosy contacts (6.0%). We concluded that quantitative analysis of serum and salivary anti-PGL1 in leprosy contacts is necessary for mounting strategies to survey subclinical leprosy infections in order to prevent development of the disease. / Os contatos de pacientes com hanseníase é um grupo de alto risco de desenvolver a doença, logo a precocidade no diagnóstico é uma importante ferramenta para o controle da enfermidade. Nós investigamos a presença de DNA de Mycobacterium leprae, através da Reação em Cadeia Polimerase (PCR), na mucosa nasal e anticorpos anti-PGL1 séricos, IgG/IgM, e salivares, IgA/IgM, por meio do ensaio imunoenzimático ligado à fase sólida (ELISA), em contatos intradomiciliares de pacientes com hanseníase (n=135) e seus casos índices. O estudo foi realizado em duas cidades endêmicas para a doença no Ceará, Crato e Maracanaú. Uma boa correlação entre os isotipos IgA e IgM salivares e IgG sérico foi observada quando comparou-se os contatos intradomiciliares e seus casos índices (p<0,01, p<0,005 e p<0.0001, respectivamente). Entretanto, essa relação não foi observada para IgM sérico anti-PGL1 (p>0,05). Observou-se alta frequência de IgM sérico anti-PGL1 no grupo de contatos negativos para IgG sérico anti-PGL1 (71/121, 58,6%). Dentre os contatos positivos para IgG sérico anti-PGL1, o nível de anticorpos séricos IgM anti-PGL1 positivos também foi alto (10/14, 71,4%). Em relação aos anticorpos salivares, contatos de pacientes com a forma clínica PB mostraram boa correlação entre IgA e IgM (r = 0.54, p <0.0001); o mesmo foi verificado em contatos de pacientes com a forma clínica MB (r = 0.61, p <0.0001). Foi observado que dos contatos positivos para os anticorpos salivares anti-PGL1, 53,3% obtiveram níveis de anticorpos séricos negativos. Por outro lado, dos contatos que foram negativos para os anticorpos salivares, 71,1% obtiveram níveis de anticorpos séricos positivos. O DNA de Mycobacterium leprae foi encontrado em swabs nasais de 9 contatos de pacientes portadores da forma clínica MB da hanseníase (10,6%) e em 3 contatos de pacientes portadores da forma clínica PB (6.0%). Nós concluímos que análises quantitativas de anticorpos séricos e salivares anti-PGL1 em contatos de pacientes com hanseníase são necessárias para montar estratégias de levantamento de infecções subclínicas da hanseníase, a fim de prevenir o desenvolvimento da doença.

MARQUES, Lívia Érika Carlos. Quantificação por PCR em tempo real de Mycobacterium leprae em amostras de secreção nasal e biópsias de pele em hansenianos. 2013. 72 f. Dissertação (Mestrado em Patologia) - Universidade Federal do Ceará. Faculdade de Medicina, Fortaleza, 2013. / Submitted by denise santos (denise.santos@ufc.br) on 2013-05-10T13:45:20Z No. of bitstreams: 1 2013_dis_lecmarques.pdf: 1846913 bytes, checksum: d8b054eabf9baa0a616cbcbc29750b1d (MD5) / Approved for entry into archive by Erika Fernandes(erikaleitefernandes@gmail.com) on 2013-05-16T13:39:43Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_dis_lecmarques.pdf: 1846913 bytes, checksum: d8b054eabf9baa0a616cbcbc29750b1d (MD5) / Made available in DSpace on 2013-05-16T13:39:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_dis_lecmarques.pdf: 1846913 bytes, checksum: d8b054eabf9baa0a616cbcbc29750b1d (MD5) Previous issue date: 2013 / Mycobacterium leprae, the etiologic agent of leprosy, is not cultivable in axenic medium. The quantification of bacilli performed by skin bacilloscopy and histopathology is useful for the clinical classification of leprosy and treatment monitoring. However, this methodology yields low results regards to sensitivity and specificity. On the other way, the real-time quantitative PCR (qPCR) is a sensitive and specific assay that allows quantification of a varied of samples and also can be used for differential diagnosis of many pathogens. To this date, no studies have evaluated the sensitivity and specificity of qPCR for the diagnosis of leprosy from nasal secretion samples. Therefore, this study aimed at detecting and quantifying DNA from M. leprae by qPCR from nasal secretion and biopsy samples from leprosy cases, correlating with clinical and bacteriological index. We analyzed 61 samples of nasal secretion and 19 biopsy specimens of skin lesion (paired) from confirmed leprosy cases seen at the National Reference Center for Sanitary Dermatology Dona Libânia. All samples were subjected to DNA extraction followed by amplification by nested PCR of a region of 238 bp which targets a RLEP2 repetitive sequence. The samples were subjected to quantification of 16S rRNA region of the genome of M. leprae by qPCR, which specificity was verified by amplicon melting temperature (Tm = 79.5 ° C). The method was able to detect amounts over to 20 fg of M. leprae DNA, equivalent to four bacilli units. Nasal secretion assay was able to confirm the diagnosis in 89.7% of the multibacillary cases (MB) and 73.3% of the paucibacillary cases (PB). In addition, MB patient biopsies sensitivity was 100%. The number of bacilli detected in nasal secretion samples from leprosy patients ranged from 1.39 x 10³ to 8.02 x 105 bacilli, while detection in MB patient biopsy ranged from 1,87 x 103 to 1,50 x 106. The real-time PCR is more sensitive than conventional PCR and can be used as a complementary tool for the clinical and histopathological diagnosis of leprosy. / O Mycobacterium leprae, agente etiológico da hanseníase, não é cultivável em meio axênico. A quantificação do bacilo realizada pelo exame baciloscópico e histopatológico é útil para a classificação da hanseníase na escolha e monitoramento do tratamento. No entanto, esta metodologia produz resultados de especificidade e sensibilidade limitada. A PCR em tempo real (qPCR) é um ensaio sensível e específico que permite a quantificação a partir de diversas amostras e pode ser utilizada no diagnóstico diferencial de muitos patógenos. Até o momento, nenhum estudo avaliou a sensibilidade e especificidade da qPCR para o diagnóstico da hanseníase utilizando amostras de secreção nasal. Portanto, este estudo teve como objetivo detectar e quantificar o DNA de M. leprae por qPCR em amostras de secreção nasal e biópsias de pacientes com hanseníase, correlacionando com a avaliação clínica e o índice baciloscópico. Foram analisadas 61 amostras de muco nasal e 19 amostras de biópsia de lesão de pele (pareadas) de casos confirmados de hanseníase atendidos no Centro de Referência Nacional em Dermatologia Sanitária Dona Libânia. Todas as amostras foram submetidas à extração e amplificação de DNA por nested PCR da região de 238 pb da sequência RLEP2. Posteriormente as amostras foram submetidas à quantificação da região 16S rRNA do genoma de M. leprae pela qPCR, cuja especificidade foi verificada através da curva de dissociação (Tm=79,5ºC). O método foi suficientemente sensível para detectar 20 fg de DNA de M. leprae, o equivalente a quatro bacilos. Na análise da secreção nasal, o ensaio foi capaz de confirmar o diagnóstico em 89,7% dos casos multibacilares (MB), e 73,3% dos casos paucibacilares (PB). A sensibilidade foi de 100% na analise de biópsias de pacientes MB. O número de bacilos detectados nas amostras de secreção nasal de pacientes com hanseníase se manteve no intervalo de 1,39 x 103 a 8,02 x 105 bacilos, enquanto a detecção em biópsia de pacientes MB variou de 1,87 x103 a 1,50 x 106. A PCR em tempo real é mais sensível do que a PCR convencional e pode ser utilizada como uma ferramenta complementar para o diagnóstico clínico e histopatológico da hanseníase.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências da Saúde, Programa de Pós-Graduação em Farmácia, Florianópolis, 2017. / Made available in DSpace on 2018-02-06T03:15:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 345648.pdf: 6234456 bytes, checksum: fccac61f552ba2c7c05fce47c371eb28 (MD5) Previous issue date: 2017 / A técnica da Reação em Cadeia da Polimerase (PCR), que utiliza equipamentos termocicladores para sua execução, vem sendo amplamente utilizada em laboratórios e é um método acurado se realizado de forma criteriosa. Considerando a importância do desempenho dos termocicladores para a execução da técnica, este estudo pretende contribuir para a garantia da qualidade e confiança dos resultados obtidos por técnicas de PCR. Assim, os objetivos deste estudo foram verificar a homogeneidade térmica do bloco térmico do termociclador, a temperatura e a duração efetivamente executadas em cada ciclo da reação, bem como avaliar a eficiência de amplificação dos termocicladores por meio de uma PCR-controle, e avaliar a relação entre o desempenho dos termocicladores e suas condições de uso. A avaliação da temperatura foi realizada por meio de um protocolo de verificação da temperatura estática e por meio de um protocolo que mimetiza os ciclos térmicos de uma PCR, utilizando-se micro-termopares. A maioria dos termocicladores verificados apresentou algum tipo de distorção no seu perfil de temperatura, demonstrando perfil curvo ou com overshooting. Variações significativas de temperatura entre as posições verificadas nos blocos térmicos também foram observadas. As temperaturas efetivamente executadas desviaram pelo menos 0,5°C das programadas em todas as etapas avaliadas. A duração efetiva das etapas foi consideravelmente diminuída, chegando a não haver um platô na temperatura programada em alguns casos. Tais alterações não foram desprezíveis, pois resultaram em falhas nos resultados da PCR-controle pela maioria dos termocicladores. Portanto, não há posições melhores ou piores no bloco térmico, há termociclador com funcionamento adequado ou inadequado. Por fim, ressalta-se a importância de os usuários realizarem a verificação da qualidade dos seus termocicladores a fim de conhecerem melhor o desempenho dos equipamentos, contribuindo para maior reprodutibilidade das PCR principalmente nos laboratórios que utilizam diferentes modelos de termocicladores.<br> / Abstract : Polymerase Chain Reaction (PCR) has been widely used in clinical laboratories and in scientific research, being considered a well-established technique if carefully performed. Thermocyclers are essential equipments for PCR execution, which must show good performance. Considering the importance of thermocycler quality control, this research aims to contribute to quality assurance and reliability of the results obtained through PCR. In order to evaluate the quality of thermocyclers at UFSC laboratories, the research aimed to verify the thermal homogeneity in the thermal block, the temperature and duration obtained for each reaction cycle, as well as to evaluate the thermocycler amplification efficiency by means of a PCR control and the relationship between thermocycler performance and its maintenance conditions. Temperature evaluation was done using a protocol for verification of static temperature and another protocol that mimics PCR cycles, all of them using micro thermocouples. Most of the thermocyclers verified presented some type of distortion in their temperature profile, showing a curved profile or overshooting. Significant temperature variations among the positions verified in the thermal blocks were also observed. The effective temperatures deviated at least 0.5°C from those programmed in all stages evaluated. The actual duration of the stages was considerably reduced, not even reading a stable plateau at the programed temperature in some cases. Such changes were not negligible, as they resulted in flaws in the control-PCR in the majority of the thermocyclers. Finally, it is emphasized the importance of users to verify the quality of their thermocyclers in order to know the performance of the equipment, contributing to a greater reproducibility of the PCR, especially among the laboratories that use different models of thermocyclers.

Made available in DSpace on 2015-12-06T23:46:57Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Encefalite causada por Toxoplasma gondii e a causa mais frequente de lesao em Sistema Nervoso Central no paciente com sindrome da imunodefiCiência adquirida (aids) (LUFT et ai, 1992). Toxoplasma pode infectar qualquer celula cerebral. Portanto, a clinica da neurotoxoplasmose (NT) nao e especifica e pode incluir sinais e sintomas focais ou nao de disfuncao do sistema nervoso central. A apresentacao clinica varia de uma apresentacao insidiosa, que envolve semanas, a um estado confusional agudo ou mesmo fulminante. A toxoplasmose ocorre em estagios avancados da doenca e a ausencia de anticorpos anti-toxoplasma pelo metodo da imunotluorescencia nao exclui o diagnostico (PORTER et ai, 1992). O tratamento geralmente e baseado no diagnostico presuntivo e a terapia padrao e a combinacao de sulfadiazina, pirimetamina e leucovorim (LUFT et al, 1992). Apos o inicio da terapia especifica, a resposta clinica e radiologica e utilizada como confirmacao diagnostica. Ha uma grande dificuldade de metodos diagnosticos acurados para confirmacao dos casos. O objetivo do presente estudo e apresentar um metodo para deteccao do DNA de T.gondii por PCR-Multiplex em tempo real. Resultados: Entre as 51 amostras de liquores colhidos, obtivemos uma sensibilidade de 68,8 por cento, especificidade de 100 por cento, valor preditivo positivo de 100 por cento e um valor preditivo negativo de 87,8 por cento. Conclusao: O PCR em tempo real em LCR apresentou uma elevada especificidade e sensibilidade em pacientes com suspeita de toxoplasmose cerebral. Sendo um metodo pouco invasivo, poderia ser incluido no algoritmo diagnostico em pacientes com sida com lesao em SNC / Toxoplasmosis Encephalitis (TE) is the main cause of focal disease in Central Nervous System in patients with acquired immunodeficiency syndrome (AIDS) (LUFT et al, 1992). Toxoplasma can infect any brain cell. However, the clinical signs aren’t specific and present or not signs and focal symptoms of central nervous system dysfunction. Clinical presentation varies from insidiousis forms to an acute mental status change or to a fulminant form. Toxoplasmosis occurs in advanced stages of human immunodeficiency virus infection, and the absence of antitoxoplasma antibodies on immunofluorescence assay does not exclude the diagnosis (PORTER et al, 1992). Treatment is often based in presumptive diagnosis and the standard treatment is the combination of pyrimethamine plus sulfadiazine plus folinic acid (LUFT et al, 1992). After the beginning of the specific therapy, the clinic and radiologic response is the way to confirm the diagnosis. However, there is a great difficult in diagnosis method to confirm the cases. In this study, we‘ve aim to present a method to detect T.gondii DNA by Real-Time polymerase chain reaction (PCR) Multiplex. Results: Among 51 cerebrospinal fluid samples, we had 68,8% of sensibility, 100% of specificity, 100% of positive predictive value and 87,8% of negative predictive value. Conclusions: The real time PCR in LCR presented a high specificity and sensibility in patients under suspicion of encephalitis toxoplasmosis. Being a less invasive method, we could include it in the algorithmic diagnosis in HIV-infected patients with CNS focal lesion. / CNPq: 132682/2004 -4 / BV UNIFESP: Teses e dissertações

Made available in DSpace on 2015-07-22T20:49:34Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-05-28. Added 1 bitstream(s) on 2015-08-11T03:25:43Z : No. of bitstreams: 1 Publico-10760.pdf: 1064252 bytes, checksum: 004a25425d1ff48cb7008d70c5c93c7e (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / As técnicas mais utilizadas no diagnóstico laboratorial de rotina para tuberculose pulmonar (TBP) apresentam sensibilidade variável. Diversos testes de amplificação de ácidos nucléicos têm sido propostos para o diagnóstico rápido da tuberculose pulmonar em associação com a pesquisa de BAAR, cultura e o diagnóstico clínico. Neste estudo avaliamos o desempenho de um teste in house de PCR colorimétrico utilizando a seqüência IS6110 em amostras de escarro, lavado brônquio alveolar e aspirado traqueal de 150 pacientes internados com suspeita clínica de TBP em um Hospital Geral Universitário no período de março a dezembro de 2005. Foi realizada a PCR colorimétrica em amostras não processadas (ANP) e em sedimentos. A validade do teste foi estimada em comparação com a baciloscopia, cultura e diagnóstico clínico de TBP. A sensibilidade do teste in house PCR colorimétrico foi de 41,93% (ANP) e 48,38% (sedimento) e a especificidade de 98,21% (ANP) e 97,67% (sedimento) em comparação com a cultura. O teste in house PCR colorimétrico teve uma boa concordância, kappa = 0,6, em comparação com a baciloscopia e kappa = 0,5 quando comparado à cultura. Com respeito ao diagnóstico clínico a sensibilidade foi de 28,6% (ANP e sedimento) e a especificidade de 98,2% (ANP) e 97,3% (sedimento) Os valores preditivos positivo e negativo obtidos foram de 83,3% e 81,1% para ANP e de 76,9% e 81,2% para sedimento, respectivamente. O teste in house de PCR colorimétrico apresentou baixa sensibilidade, mas demonstrou ser altamente específico para o diagnóstico de TBP, além de apresentar boa concordância com os demais métodos utilizados na rotina laboratorial em um Hospital Geral Universitário para o diagnóstico de TBP. Em relação ao diagnóstico clínico observamos alto valor preditivo (positivo e negativo) e alta probabilidade positiva pós-teste. / The techniques most widely used in the routine laboratory diagnosis of pulmonary tuberculosis (PTB) show variable sensitivities. Various nucleic acids amplification tests have been proposed for the rapid diagnosis of PTB in association with the acid-fast bacillus staining, culture and clinical diagnosis. We evaluated the performance of an in-house colorimetric PCR test using the IS6110 sequence in samples of sputum, broncho-alveolar lavage and tracheal aspirate from 150 patients with clinical suspicion of PTB admitted to a General University Hospital in the period from March to December 2005. The colorimetric PCR test was applied to non-processed samples (NPS) and to the sediment. The validity of the test was estimated in comparison with culture and clinical diagnosis of PTB. The sensitivity of the in house colorimetric PCR test was 41.93% (NPS) and 48.38% (sediment) and specificity 98.21% (NPS) and 97.67% (sediment). The in house colorimetric PCR test had a good agreement, kappa = 0.6, in comparison to the acid-fast staining and kappa = 0.5 when compared to culture. Considering the clinical diagnosis, sensitivity was 28.6% (NPS and sediment) and specificity 98.2% (NPS) and 97.3% (sediment). The positive and negative predictive values were 83.3% and 81.1% for NPS and 76.9% and 81.2% for sediment, respectively. The in house colorimetric PCR test showed low sensitivity, high specificity and good agreement compared with acid-fast bacillus staining and culture used for diagnosis of PTB in a routine microbiology laboratory at a General University Hospital The test also showed high predictive values (positive and negative) and high positive post-test probability when the clinical diagnosis was considered. / TEDE / BV UNIFESP: Teses e dissertações

Fernando Henrique Azevedo Lopes. Níveis séricos de interleucina-6 e polimorfismo - 174G>C em infecção latente pelo Mycobacterium tuberculosis. 2012. 70 f. Dissertação (Mestrado em Patologia) - Universidade Federal do Ceará. Faculdade de Medicina, Fortaleza, 2012. / Submitted by denise santos (denise.santos@ufc.br) on 2013-12-03T13:15:49Z No. of bitstreams: 1 2012_dis_fhalopes.pdf: 6329480 bytes, checksum: 293198c77f20aefef6e6e1fef618297a (MD5) / Approved for entry into archive by denise santos(denise.santos@ufc.br) on 2013-12-03T13:16:08Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_dis_fhalopes.pdf: 6329480 bytes, checksum: 293198c77f20aefef6e6e1fef618297a (MD5) / Made available in DSpace on 2013-12-03T13:16:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_dis_fhalopes.pdf: 6329480 bytes, checksum: 293198c77f20aefef6e6e1fef618297a (MD5) Previous issue date: 2012 / Interleukin-6 (IL-6) is an important cytokine involved in the pathogenesis of multiple infectious diseases. The aim of this study was to investigate the levels of IL-6 production and to correlate to the -174G>C polymorphism at the IL-6 gene in latent infection with M. tuberculosis (ILTB). As controls, two groups were used. One of them with active pulmonary tuberculosis (TB) patients and the other with healthy blood donors. ILTB group was composed by 15 individuals, selected among active pulmonary TB contacts seen at the Hospital São José de Doenças Infecciosas and the Centro de Saúde da Família Anastácio Magalhães. TB group had 38 patients with active pulmonary disease seen at the Hospital de Messejana, Hospital de Maracanaú and the Hospital Geral Dr. César Cals. The third group was composed by 63 healthy blood donors from the Centro de Hematologia e Hemoterapia do Ceará. Serum levels of IL-6 were measured by an ELISA using specific kits from Invitrogen Corporation. For DNA purification a GFX Genomic Blood DNA Purification kit (GE Healthcare) was used. The -174GC polymorphism was analyzed by a SSP-PCR method using One-Lambda kits. Median values of serum levels of IL-6 from ILTB, TB and healthy groups were, respectively, 1.7 pg/mL, 4.3 pg/mL and 0.5 pg/mL (p < 0.0001). For the three studied group, the most frequent genotype found was the G/G (ILTB = 80%; TB = 58.9%; saudáveis = 62.8%). In conclusion, it is possible to consider that IL-6 should play an important role in the maintenance of latent infection state as its concentrations were 3.4 fold higher in ILTB group than that of healthy controls. Moreover, the -174GC polymorpism was not functional in the ILTB group. / A interleucina-6 (IL-6) é uma importante citocina que exerce papel fundamental na imunopatogênese de diversas doenças infecciosas. O objetivo deste estudo foi investigar o nível de produção sistêmica de IL-6 e aferir o papel funcional do polimorfismo -174 G>C do gene dessa citocina em indivíduos diagnosticados como portadores de infecção latente pelo Mycobacterium tuberculosis (ILTB). Para controle, foram utilizados dois grupos de comparação: um deles composto por portadores de tuberculose pulmonar ativa (TB) e o outro formado por indivíduos saudáveis, doadores de sangue. O grupo ILTB foi composto por 15 indivíduos, selecionados dentre os contactantes de portadores de TB pulmonar ativa, atendidos no Hospital São José de Doenças Infecciosas e no Centro de Saúde da Família Anastácio Magalhães. O grupo TB foi formado por 38 pacientes com TB pulmonar ativa, procedentes do Hospital de Messejana, Hospital de Maracanaú e Hospital Geral Dr. César Cals. O grupo de indivíduos saudáveis contava com 63 doadores voluntários de sangue do Centro de Hematologia e Hemoterapia do Ceará. A dosagem sérica de IL-6 foi realizada por meio de um ensaio imunoenzimático (ELISA), com kit específico fornecido pela Invitrogen Corporation. Para purificação do DNA, foi utilizado o kit GFX Genomic Blood DNA Purification, da GE Healthcare. O polimorfismo -174GC do gene da IL – 6 foi tipificado pela técnica de reação em cadeia da polimerase (PCR), utilizando-se iniciadores de sequência específica (PCR-SSP) (One-Lambda). As medianas de concentrações séricas de IL-6 para os grupos ILTB, TB e saudáveis foram de, respectivamente, 1,7 pg/mL, 4,3 pg/mL e 0,5 pg/mL (p < 0,0001). Nos três grupos estudados, o genótipo encontrado com maior frequência foi o G/G [ILTB = (80%); TB = (58,9%); saudáveis = (62,8%)]. Em conclusão, podemos inferir que a IL-6 deve desempenhar um papel importante na manutenção do estado de latência, haja vista que sua concentração, nos indivíduos com ILTB, foi 3,4 vezes maior que no grupo saudável. Ademais, constatamos que, na população estudada, o polimorfismo -174GC não se mostrou funcional no âmbito da infecção latente pelo Mycobacterium tuberculosis.

Submitted by Tatiana Oliveira (tsilva@icict.fiocruz.br) on 2012-06-06T15:32:21Z No. of bitstreams: 1 denise_gj_batista_ioc_bp_0023_2009.pdf: 5405466 bytes, checksum: 0bb4fce7e31b0593bb33cff01fa3e688 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-06-06T15:32:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 denise_gj_batista_ioc_bp_0023_2009.pdf: 5405466 bytes, checksum: 0bb4fce7e31b0593bb33cff01fa3e688 (MD5) Previous issue date: 2009 / Fundação Oswaldo Cruz.Instituto Oswaldo Cruz. Rio de janeiro, RJ, Brasil / No centenario da descoberta da doenca de Chagas (DC), esta parasitose negligenciada causada pelo Trypanosoma cruzi e importante causa de mortalidade e morbidade na America Latina, sem vacinas ou agentes quimioterapicos satisfatorios. Esta tese objetivou analisar atividade, seletividade e mecanismos de acao sobre o T.cruzi de 04 classes de compostos (fluorquinolonas - FQ, tiossemicarbazonas - TS, diamidinas aromaticas - DA e arilimidamidas – AIA – uma nova classe a partir de DA) in vitro e in vivo. FQ como NOR e SPAR sao antibioticos com ampla acao bactericida, atuando sobre o DNA via toposoimerases. Embora SPAR e NOR nao tenham sido ativas, seus complexos metalicos de cobre-fenantrolina foram efetivos sobre tripomastigotas e formas intracelulares de T.cruzi, (IC50 1,62 a 4,65µM). TS sao agentes anti-tumorais e microbicidas que atuam sobre ribonucleotideo redutases e cisteina proteases. Todas TS apresentaram baixa toxicidade (>200µM) sobre celulas de mamiferos. Embora N4-metil-4-nitrobenzaldeido-tiossemicarbazona, N4-metill-4-nitroacetofenona-tiossemicarbazona e seus complexos metalicos de manganes (Mn) não tenham sido ativos, o complexo de Mn da N4-metil-4-nitrobenzofenona-tiossemicarbazona revelou-se moderadamente ativo sobre formas sanguineas (IC50 19µM). A terceira classe foi DA, ligantes de DNA com excelente atividade sobre diversos patogenos. Embora todas tenham baixa toxicidade sobre cardiomiocitos, somente tres (DB1645, DB1582 e DB1651) foram ativas contra formas sanguineas e intracelulares (IC50 entre 0,15 a 13,3µM), com atividade relacionada a curvatura das moleculas (sendo as moleculas lineares as nao efetivas). Todas DA localizam-se no nucleo e kDNA dos parasitos, com maior acumulo na ulti Analise in vitro da AIA DB766 sobre T.cruzi revelou: (i) excelente atividade sobre formas sanguineas (60nM) e intracelulares (25nM), mantendo otima acao mesmo quando o parasito e incubado com 96% de sangue de camundongo, sugerindo assim, um potencial uso profilatico, (ii) ação sobre diferentes cepas (peridomiciliares/silvestres), incluindo as naturalmente resistentes ao benznidazole (BZ), com superior eficacia que BZ, (iii) localizacao em compartimentos ricos em DNA, induzindo danos ultra-estruturais na mitocondria. Com base no excelente indice de seletividade (>533 e 714), ensaios foram conduzidos durante a infeccao aguda experimental por T.cruzi (cepas Y e Colombiana), em doses diarias ou alternadas =100mg/kg/dia da DB766 sozinha ou associada ao BZ, administradas via ip ou p.o. por ate 20 dias, com primeira dose no inicio da parasitemia. DB766 (25 e 50mg/kg/dia ip e 100mg/kg/dia p.o.) reduziu (>90%) a carga parasitaria (sangue e tecido cardiaco) e protegeu 90-100% contra mortalidade, com semelhante eficacia ao BZ. AIA reverteu inflamacao e alteracoes eletricas cardiacas e protegeu contra lesoes hepaticas e musculares induzidas pela infeccao. Doses sub-otimas de BZ associado com a DB289 (DA - pro-droga da DB75 – via p.o.) ou com a DB766 (ip) resultaram em =99% reducao de parasitemia e 100% de protecao sobre mortalidade. BZ (p.o)+DB766 (ip) resultou em cura parasitologica (2 em 15 animais) avaliada por hemocultivo e PCR. AIA foi a mais ativa e seletiva sobre T. cruzi, estimulando a continuidade de ensaios pre-clinicos com representantes desta classe visando identificacao de novos farmacos para a DC / In the centenary of the discovery of Chagas' disease (AD), this parasitosis caused by Trypanosoma cruzi neglected and important cause of morbidity and mortality in Latin America, no vaccines or chemotherapeutic agents satisfactory. This thesis aims to analyze activity, selectivity and mechanisms of action of T. cruzi on the 04 classes of compounds (fluoroquinolones - CF thiosemicarbazones - TS, aromatic diamidines - DA and arilimidamidas - AIA - a new class from DA) in vitro and in vivo. CF as NOR and SPAR are antibiotics with broad antibacterial action, acting on the DNA via toposoimerases. Although SPAR and NOR have not been active, their metallic complexes of copper-phenanthroline were effective on trypomastigotes and intracellular forms of T. cruzi (IC50 1.62 to 4.65 mM). TS are anti-tumor agents and microbicides that act on ribonucleotide reductase and cysteine ​​proteases. All TS showed low toxicity (> 200μM) on cells of mammals. Although N4-methyl-4-nitrobenzaldehyde thiosemicarbazone, N4-methyl-4-nitroacetophenone thiosemicarbazone and its metal complex of manganese (Mn) were not active, the complex of Mn N4-methyl-4-nitrobenzophenone thiosemicarbazone revealed was moderately active on blood forms (IC50 19μM). The third class was DA, DNA binders with excellent activity against many pathogens. Although all have low toxicity cardiomyocyte, only three (DB1645, DB1582 and DB1651) were active against blood forms and intracellular (IC 50 from 0.15 to 13.3 mM), activity related to the curvature of the molecules (the molecules being the non-linear effective). OF all located in the nucleus and kDNA from parasites, with greater accumulation in the ulti In vitro analysis of EIA DB766 on T.cruzi revealed: (i) excellent activity against bloodstream forms (60nm) and intracellular (25nm), while maintaining optimal action even when the parasite and incubated with 96% blood of mice, thus suggesting a potential prophylactic use, (ii) act on different strains (peridomestic / wild), including naturally resistant to benznidazole (BZ), with higher efficacy than BZ, (iii) location compartments rich DNA damage inducing ultrastructural the mitochondria . Based on the excellent selectivity index (> 533 and 714), tests were conducted during experimental acute infection by T. cruzi (Y and Colombian strains) in daily doses or alternate = 100mg/kg/day of DB766 alone or associated with BZ, administered ip or po for up to 20 days with the first dose at the onset of parasitaemia. DB766 (25 100mg/kg/day and 50mg/kg/day ip and po) reduced (> 90%) the parasite load (blood and cardiac tissue) and 90-100% protected against mortality, with similar efficacy to the BZ. EIA reversed inflammation and cardiac electrical changes and protected against liver injury induced by infection and muscle. Sub-optimal doses of BZ associated with DB289 (DA - pro-drug of DB75 - via po) or DB766 (ip) resulted in ≥ 99% reduction of parasitemia and 100% protective on mortality. BZ (po) + DB766 (ip) resulted in parasitological cure (2, 15 dogs) assessed by blood culture and PCR. EIA was the most active and selective against T. cruzi, encouraging the continuation of pre-clinical trials with representatives of this class in order to identification of new drugs for AD

Made available in DSpace on 2014-08-26T17:15:00Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) 60.pdf: 1087420 bytes, checksum: d43c3b6da28a66b2ee5f2ae5c11fc7ae (MD5) Previous issue date: 2010 / Cronobacter spp. (Enterobacter sakazakii) são patógenos emergentes associados a surtos de meningite, enterocolite necrosante e septicemia em neonatos em diversos países. A taxa de mortalidade relatada varia de 40 a 80% e os sobreviventes apresentam seqüelas neurológicas severas. O desenvolvimento da infecção está associado ao consumo de fórmulas infantis desidratadas. As metodologias atualmente disponíveis para o isolamento de Cronobacter spp. apresentam discrepâncias e a identificação bioquímica não é esclarecedora. Assim, torna-se necessário que metodologias confiáveis para o isolamento e identificação desses micro-organismos estejam disponíveis. Outro ponto ainda não esclarecido são os mecanismos de virulência utilizados por esses patógenos para o desenvolvimento de infecções em humanos. Os objetivos desse estudo foram o desenvolvimento de um método rápido e eficiente para a identificação de Cronobacter spp., a avaliação do perfil de resistência a antimicrobianos e a avaliação da presença de alguns fatores de virulência. Foram utilizadas inicialmente cepas de referência de Cronobacter spp e 37 isolados previamente identificados como pertencentes ao gênero. O novo protocolo foi considerado 100% sensível e específico quando comparado aos demais métodos utilizados, indicando sua utlidade. O estudo de fatores de virulência revelou que Cronobacter spp. tem desenvolvido resistência aos β-lactâmicos e cefalosporinas, é capaz de formar cápsula, biofilme, e apresentar atividade de protease e atividade hemolítica. Nesse estudo relata-se pela primeira vez a presença de hemaglutininas associadas a pili tipo 3, enquanto algumas cepas apresentaram hemaglutininas associadas a pili tipo 1. Também foi demonstrada a atividade citotóxica em células Vero e a capacidade de invasão dessas células por Cronobacter spp. Os resultados desse estudo sugerem que todas as espécies do gênero Cronobacter apresentam potencial patogênico e que autoridades de saúde pública, produtores de alimentos e pessoas responsáveis pelo cuidado de indivíduos que fazem parte dos grupos de risco devem dedicar especial atenção ao controle de ambientes e à qualidade microbiológica de produtos destinados a esses grupos de modo a minimizar o risco de infecção por esses micro-organismos. / Cronobacter spp. (Enterobacter sakazakii) is an emerging foodborne pathogen associated with outbreaks of meningitis, necrotizing enterocolitis and sepsis in neonates in different countries. The reported mortality rate ranges from 40 to 80% and the survivors present severe neurological sequela. Development of the infection is associated with the consumption of powdered infant formula. The available methodologies employed for the isolation of Cronobacter spp. lack the necessary specificity and the biochemical identification remains non-conclusive. For these reasons, it is necessary to develop reliable methodologies for the isolation and identification of these microorganisms. Another issue still to be clarified refers to the virulence mechanisms associated with human infections. The objectives of this study were to develop a rapid and efficient method to identify Cronobacter, to evaluate the antimicrobial resistance of the strains, and to evaluate the presence of some virulence factors. Initially, reference strains of Cronobacter, and 37 isolates that had been previously identified as members of the genus were used. The proposed protocol showed 100% sensitivity and specificity when compared to the other methods used, indicating its usefulness. Studies on virulence factors revealed that Cronobacter spp. has developed resistance to β-lactams and cephalosporins, is able to form capsule, biofilm, and presents protease and hemolytic activities. This study reports, for the first time in literature, the presence of hemagglutinins associated with type 3 pili and it was also shown that some strains presented previously described hemagglutinins associated with type 1 pili. Cytotoxic activity in Vero cells and the invasiveness of these cells by Cronobacter spp were also demonstrated. The results of this study suggest that all species of the genus Cronobacter have pathogenic potential and public health authorities, food producers and caregivers should pay careful attention to issues associated with environment control and with the microbial quality of the products associated with the risk groups in order to minimize the risk of infection with these microorganisms.

Made available in DSpace on 2014-12-05T18:41:18Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) carla_cunha_ioc_dout_2007.pdf: 1656140 bytes, checksum: 90fb142cec8bf557fc5a27f8df2af732 (MD5) Previous issue date: 2014-11-18 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Relógios biológicos são mecanismos endógenos de marcar a passagem do tempo e podem ser encontrados em animais, plantas, fungos e até organismos unicelulares. No modelo Drosophila, o mecanismo molecular que controla os ritmos circadianos (~24 horas) funciona através de alças de retroalimentação negativa envolvendo alguns genes, sendo os principais: period, timeless, cycle e Clock. Os homólogos destes genes já foram encontrados em várias espécies de animais, apontando para uma origem ancestral comum. Mosquitos são vetores de diversos agentes causadores de doenças a humanos e animais, mas apesar da sua importância epidemiológica pouco se conhece sobre os mecanismos moleculares que controlam os ritmos de atividade e hematofagia neste grupo de insetos. O presente trabalho objetivou o estudo do relógio biológico circadiano em mosquitos, usando como modelos a espécie diurna Aedes aegypti e a noturna Culex quinquefasciatus Os estudos moleculares foram sempre acompanhados de experimentos de monitoramento da atividade/repouso dos insetos. A primeira etapa da pesquisa compreendeu a obtenção em Ae. aegypti da seqüência codificante integral do gene homologo a timeless de Drosophila melanogaster e o estudo comparativo da seqüência do mesmo entre as duas espécies. Os resultados apontaram para uma alta similaridade em regiões de timeless conhecidas como importantes em Drosophila para manutenção do relógio biológico, sugerindo conservação de sua função nos mosquitos. A segunda etapa da pesquisa envolveu a determinação do padrão de expressão circadiana de period, timeless, cycle e Clock em mosquitos. Após estudos preliminares sobre a expressão de timeless e cycle em machos de Aedes aegypti, foram obtidas as curvas de expressão circadiana de period, timeless, cycle e Clock na cabeça de fêmeas de Ae. aegypti e Cx. quinquefasciatus Os resultados sugerem que o relógio central funcione de forma muito semelhante nas duas espécies. Análise da expressão desses genes nos corpos decapitados das fêmeas de Ae. aegypti, entretanto, aponta para padrões diferentes de expressão em relação à cabeça. Foi analisado também o efeito da inseminação e da hematofagia na expressão dos genes de relógio em Ae. aegypti. Apesar de dados da literatura mostrarem que a inseminação e a alimentação com sangue (após inseminação), causam alteração no comportamento das fêmeas de mosquito, apenas a hematofagia parece exercer alteração significativa na expressão dos genes de relógio. Finalizando, foi efetuado o silenciamento de timeless em Ae. aegypti por técnica de RNA de interferência, através da injeção de RNA dupla-fita de timeless no tórax de fêmeas adultas. O silenciamento da expressão foi detectado tanto na cabeça quanto no corpo das fêmeas no quarto dia após a injeção do RNA dupla-fita, mesmo dia em que foi detectada alteração no padrão de comportamento. Esse resultado confirma o papel de timeless no controle da atividade em mosquitos / Biological clocks are endogenous time keepi ng systems that can be found in animals, plants, fungi and even unicellular organisms. In the Drosophila model, the molecular mechanism that controls the circadian rhythm (~24 hours) works through negative feedback loops composed of a number of genes, among which the principal genes are: period, timeless , cycle and Clock. The homologues of these genes have been found in many animal species and their comparison points to a common ancestral origin. Mosquitoes ar e vectors of several organisms and viruses that cause diseases in hu mans and other animals, however despite their epidemiological relevance not much is known about the molecular mechanisms controlling their activity rhythms and bloodfeedin g behaviour. The purpose of the present work was to investigate the molecular regulati on of the biological clock in mo squitoes, using as models the diurnal species Aedes aegypti and the nocturnal species Culex quinquefasciatus . Analysis of the mosquitoes’ activity/rest behaviour was performed in parallel to the molecular studies. The first stage of this research was to obtain, in Aedes aegypti , the full coding sequence of the gene homologue to the timeless gene of Drosophila melanogaster and to perform comparative analysis between them. The results s howed high similarities between the timeless gene of the two species, mainly in regions known, in Drosophila , to have a crucial involvement in the operation of the biological clock, thus sugg esting function conservation of the gene in mosquitoes. The second stage of the research involved the determination of the patterns of expression of the clock genes period, timeless , cycle and Clock in mosquitoes. After preliminary studies of male Ae. aegypti , in which the temporal pattern of the expression of timeless and cycle was determined, the circadian expression of period, timeless , cycle and Clock was characterised in the heads of females of the species Ae. aegypti and Cx. quinquefasciatus . The results suggest that the central clock works in a very similar way in both species. The expression of the same four genes in the behead ed bodies of females of Ae. aegypti , however, showed a pattern different from that of the head. The effect s of insemination and blood meal intake upon the expression of clock genes in Ae. aegypti were also analysed. In spite of the data in the literature showing that insemination drives important change s in the behaviour of the female mosquito, in this study only the intake of blood seemed to cau se significant changes in the expression of the clock genes. To finalize the st udy of the biological clock in mosquitoes, silencing of the timeless gene in the head and body of Ae. aegypti mosquitoes was performed using an interference RNA technique in which the thoraxes of adult females were injected with timeless double-stranded RNA. Silencing of gene expre ssion was achieved on the fourth da y after injection, the same day in which a significant alteration of the activity pattern of these females was detected. This result confirms the role of timeless in the control of activity behaviour in mosquitoes

Made available in DSpace on 2014-07-28T18:09:56Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) 109.pdf: 1338749 bytes, checksum: dced83f0e7a2d55b58777971825adce2 (MD5) Previous issue date: 2008 / Made available in DSpace on 2014-12-22T16:56:31Z (GMT). No. of bitstreams: 2 109.pdf: 1338749 bytes, checksum: dced83f0e7a2d55b58777971825adce2 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2008 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde / Durante o período de 1996 a 2006, a proporção da área global de lavouras biotecnológicas plantadas por países em desenvolvimento aumentou consistentemente a cada ano. Nos últimos dez anos, mais de 40 países adotaram políticas de rotulagem para alimentos geneticamente modificados, mas as características das regulamentações e seu grau de execução variam enormemente. Os efeitos observados dessas políticas sobre a escolha dos consumidores, a informação para os consumidores, comércio dos alimentos, comércio internacional também variam significativamente. No Brasil, o Decreto n. 4.680/03 regulamenta o direito à informação, assegurado pela Lei n. 8.078/90, quanto aos alimentos e ingredientes alimentares destinados ao consumo humano ou animal que contenham ou sejam produzidos a partir de organismos geneticamente modificados (OGMs). O cumprimento da legislação que regulamenta a comercialização de alimentos e ingredientes contendo OGMs é totalmente dependente da sensibilidade e confiabilidade dos métodos de detecção e quantificação de OGMs. . Entre os métodos existentes, a reação em cadeia da polimerase (PCR) é o mais aceito, por ser sensível e confiável para detecção de material geneticamente modificado em análises de rotina. A padronização da técnica de PCR multiplex para a detecção de vários transgênicos em produtos alimentícios facilita o monitoramento destes, pois além de diminuir o tempo de diagnóstico, utiliza uma menor quantidade de reagentes, barateando o processo de detecção. No presente estudo, foi utilizada uma duplex PCR para a detecção de soja geneticamente modificada tolerante ao herbicida glifosato (Roundup Ready) e uma PCR multiplex para a detecção simultânea de três linhagens de milho transgênico (MON810, Bt11 e Bt176) em amostras de alimentos humano e animal. Foram utilizadas duas metodologias para extração do DNA das amostras: o método CTAB (já utilizado pelo INCQS) e o kit DNeasy Mini. [...] / From 1996 to 2006, the proportion of the global area of biotech crops growing in developing countries has increased consistently. In the last ten years, over 40 countries have adopted policies for the labeling of genetically modified food, but the regulations characteristics and their degree of implementation varies greatly. The effects of these policies on consumer choice and information, on food trade and international trade also vary significantly. In Brazil, the Decree No. 4.680/03 regulates the right to consumers information, provided by Law No. 8078/90, on food and food ingredients intended for human or animal consumption containing or produced from genetically modified organisms (GMOs). Compliance with regulation on the marketing of foods and ingredients containing GMOs is totally dependent on the sensitivity and reliability of methods of detection and quantification of GMOs. Among the existing methods, the polymerase chain reaction (PCR) is the most accepted, sensitive and reliable for the detection of genetically modified material in routine. The multiplex PCR is used on the screening of GMO in food because its able to detect simultaneously several transgenic, being a less time and reagents consuming method, making the process of detection cheaper. In the present study, duplex PCR was tested for the detection of genetically modified soybeans tolerant to the herbicide glyphosate (Roundup Ready) and a multiplex PCR was tested for the simultaneous detection of three lineages of transgenic maize (MON810, Bt11 and Bt176) in samples of human food and feed. Two methodologies were used for extraction of DNA from samples: the CTAB method (already used by INCQS) and DNeasy® Mini kit. The results were compared to the standard method used by INCQS. Out of the fourty samples, thirty samples were positive for the presence of Roundup Ready soybeans, fourteen were positive for at least one of the GM corn studied. Nine were positive for MON 810 maize, three were positive for Bt 11 maize, and five were positive for Bt 176 maize. The method proved to be robust and can be used on a routine for the detection of GMOs in food.