Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Departamento de Biologia Molecular, 2012. / Submitted by Gomes Neide (neide@bce.unb.br) on 2014-07-03T16:05:56Z No. of bitstreams: 1 2012_BrunoBenolielRocha.pdf: 6758229 bytes, checksum: 54ff8a4fee8a06cc51e9b37706664923 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2014-07-07T11:26:14Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_BrunoBenolielRocha.pdf: 6758229 bytes, checksum: 54ff8a4fee8a06cc51e9b37706664923 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-07-07T11:26:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_BrunoBenolielRocha.pdf: 6758229 bytes, checksum: 54ff8a4fee8a06cc51e9b37706664923 (MD5) / O Brasil é um grande produtor de resíduos agroindustriais, como o bagaço de cana. Esse substrato poderia ser usado como matéria-prima para produção microbiana de celulases com a finalidade de desenvolver processos sustentáveis como a produção de etanol de segunda geração. Para isso, este trabalho teve como objetivo a triagem de cepas fúngicas isoladas do Cerrado brasileiro com atividades celulolíticas. Entre os 13 isolados analisados o Trichoderma harzianum (L04) foi identificado como um promissor candidato para a produção de celulase quando cultivado em bagaço de cana in natura. A linhagem L04 revelou um complexo celulolítico bem equilibrado, apresentando uma rápida cinética de produção de endoglucanases, exoglucanases e β-glucosidases, obtendo valores máximos de atividades de 4022 UL - 1 (72 h), 1228 UL - 1 (120 h) e 1968 UL - 1 (48 h), respectivamente. Cerca de 60 % de rendimento de glicose foram obtidos a partir do bagaço de cana após 18 horas de hidrólise. Esta nova linhagem representa um candidato em potencial para a produção de celulases utilizando bagaço de cana como fonte de carbono. __________________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Brazil is a major producer of agro-industrial residues, such as sugarcane bagasse, which could be used as raw material for microbial production of cellulases as an important strategy for the development of sustainable processes of second generation ethanol production. For this purpose, this work aimed at screening for glycosyl hydrolase activities of fungal strains isolated from the Brazilian Cerrado. Among 13 isolates, a Trichoderma harzianum strain (L04) was identified as a promising candidate for cellulase production when cultured on in natura sugarcane bagasse. Strain L04 revealed a well-balanced cellulolytic complex, presenting fast kinetic production of endoglucanases, exoglucanases and β-glucosidases, achieving 4,022, U.L-1 (72 h), 1,228 U.L-1 (120 h) and 1,968 U.L-1 (48 h) as the highest activities, respectively. About 60% glucose yields were obtained from sugarcane bagasse after 18 hours hydrolysis. This new strain represents a potential candidate for on-site enzyme production using sugarcane bagasse as carbon source.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Tecnologia, Departamento de Engenharia Florestal, 2011. / Submitted by Rafael Barcelos Santos (rafabarcelosdf@hotmail.com) on 2011-06-22T20:47:32Z No. of bitstreams: 1 2011_JuliadeAlmeidaCosta.pdf: 1510926 bytes, checksum: 979a7fb90f8099b88f138112d3e3ab11 (MD5) / Approved for entry into archive by Elna Araújo(elna@bce.unb.br) on 2011-06-22T23:15:59Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_JuliadeAlmeidaCosta.pdf: 1510926 bytes, checksum: 979a7fb90f8099b88f138112d3e3ab11 (MD5) / Made available in DSpace on 2011-06-22T23:15:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_JuliadeAlmeidaCosta.pdf: 1510926 bytes, checksum: 979a7fb90f8099b88f138112d3e3ab11 (MD5) / No presente estudo, foi realizada a caracterização tecnológica e a produção de polpa celulósica não branqueável da madeira de Eucalyptus urograndis com 6 anos de idade, proveniente de um plantio localizado na Fazenda Água Limpa – FAL (DF). O objetivo do trabalho foi caracterizar a qualidade da madeira de Eucalyptus urograndis para a produção de celulose utilizando-se o processo kraft convencional. A carga de álcali ativo utilizada nos cozimentos kraft foi de 19, 21, 23 e 25%. O delineamento experimental adotado foi o inteiramente casualizado. Os resultados indicaram que as fibras do material apresentaram boa flexibilidade e podem ser consideradas boas para a produção de papel. A composição química e a densidade básica da madeira representam o material comercialmente utilizado no Brasil para produção de polpa celulósica de fibra curta, com exceção do elevado teor de extrativos. O rendimento depurado variou de 48,7 a 51,5%; e o número kappa e a viscosidade tradicionalmente utilizados no processo de polpação kraft não branqueada foram alcançados com as cargas alcalinas aplicadas nos cozimentos, destacando-se a carga de 19%, que mostrou melhor performance em termos de deslignificação e rendimento. O álcali ativo residual e o Ph do licor negro atingiram os valores recomendados para a prevenção da re-precipitação da lignina. Os parâmetros obtidos no processo de polpação revelaram um bom nível de deslignificação da polpa em cozimentos brandos, apresentaram valores próximos aos encontrados na literatura e qualidades tecnológicas apropriadas para a produção de polpa celulósica. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / In this study, it was performed the technological characterization and production of not blanchable pulp in wood of 6 years old Eucalyptus urograndis, from a plantation located in Fazenda Água Limpa - FAL (DF). This research aimed to characterize the wood quality of Eucalyptus urograndis for pulp production using the conventional kraft process. The active alkali charge used in kraft baking was 19, 21, 23 and 25%. The experimental design was completely randomized. The results indicate that the fibers of the material presented good flexibility and can be considered good for paper production. The chemical composition and density wood represent the material used commercially in Brazil for production of hardwood pulp, with the exception of the high content of extractives. The pulp yield ranged from 48.7 to 51.5%, and the kappa number and viscosity traditionally used for not blanchable kraft pulping were achieved with the alkaline loads applied in the kraft baking, highlighting the charge of 19%, which showed better performance in terms of delignification and yield. The residual active alkali and pH of the black liquor reach the values recommended for the prevention of re-precipitation of the lignin. The parameters obtained in the pulping process showed a good level of pulp delignification in mild baking, presented similar values to those found in the literature and suitable technological qualities for pulp production.

Este trabalho tem como objetivo contribuir para o entendimento da interação entre duas substâncias de natureza hidrofílica água e celulose cujas propriedades são fortemente influenciadas pelas pontes ou ligações de hidrogênio. As ligações de hidrogênio, LH, estão presentes nas fibras de celulose reforçando tanto o interior da cadeia polimérica como proporcionando alta aderência entre essas cadeias. A existência de efeitos cooperativos entre essas LH tem sido considerada por alguns autores como um fator que contribui para a grande estabilidade mecânica das fibras de celulose. As propriedades da água são únicas entre os líquidos de baixo peso molecular: alto ponto de ebulição, menor densidade em fase sólida do que em fase líquida, existência de uma fase líquida metaestável água super-resfriada abaixo de 0ºC, etc. Em espaços restritos de natureza hidrofílica a água confinada se comporta de forma análoga a água super-resfriada e atua como um excelente adesivo. O entendimento de sistemas envolvendo materiais hidrofílicos tais como sólidos, géis e macromoléculas e a água, contribui para o desenvolvimento de novos materiais e para o entendimento dos sistemas vivos. Neste trabalho são abordados a adesão entre água e fibras de celulose de diferentes comprimentos e o efeito de determinados íons sobre a viscosidade de suspensões de celulose em água. Os resultados obtidos com celulose de fibras curtas e finas evidenciam a presença de água confinada, através da transição característica da mesma observada em -45ºC(228K). Esta evidência é corroborada pela ausência dessa transição quando os sais, que quebram as LHs e impedem o confinamento da água, estão presentes no sistema formado pela celulose e a água. / This dissertation aims to contribute to understand the interaction between two hydrophilic substances water and cellulose whose properties are strongly influenced by hydrogen bonding. Hydrogen bonds, HB, are present in cellulose fibers reinforcing the interior of the polymeric chain and allowing for high adherence among these chains. These intra and inter HB has been considered by some authors as a factor that contributes to the high mechanical stability of cellulose fibers. The water properties are unique among liquids with low molecular weight: high boiling point, lower density in the solid state phase than in the liquid phase and even at temperatures above 273K, water does not behave as a liquid in restricted space. If confined by two surfaces, the confined water behaves as an excellent adhesive. The understanding of systems involving hydrophilic materials, such as solids, gels, macromolecules, and water contributes to both the development of new materials and the understanding of live systems. This dissertation is a contribution to the understanding of the interaction among cellulose fibers and water. The results obtained with short and fine cellulose fibers show the presence of confined water exhibiting its characteristic transition in -45 º C (228K). This evidence is corroborated by the absence of this transition when the salts which breaks the LHs and thus, prevent the formation of confined water are present in the system formed by the cellulose and water.

A celulose é o biopolímero de maior abundância no mundo e tem potencial para se tornar fonte de energia renovável através de sua transformação em açúcares fermentáveis, que por sua vez serão transformados em etanol. A recalcitrância da celulose, principal dificuldade encontrada no processo, pode ser superada com o auxílio de enzimas (celulases). Ao menos três enzimas celulolíticas são necessárias para a degradação total da celulose, incluindo as celobioidrolases, que hidrolisam as ligações glicosídicas das extremidades redutoras e não redutoras da cadeia, as endoglucanases, que clivam a cadeia de celulose amorfa randomicamente, e as beta-glicosidases, que produzem glicose através dos celo-oligômeros. Mas para que esse processo se torne financeiramente viável é necessário conhecer o funcionamento, otimizar a atividade e aumentar a produção dessas celulases. Com o intuito de avançar na compreensão da função e estrutura dessas enzimas, o presente trabalho teve como objetivo o estudo estrutural de beta-glicosidases da família GH1 e endoglucanases da família GH5. Na primeira parte do trabalho, a expressão da endoglucanase II de Trichoderma reesei não foi alcançada, mesmo utilizando diferentes organismos e condições de expressão. Porém, na segunda etapa, foi obtida a expressão, purificação e os primeiros ensaios de cristalização de 11 beta-glicosidases bacterianas da família GH1 e 8 endoglucanases bacterianas da família GH5. Dentre elas, três beta-glicosidases e uma endoglucanase de Bacillus licheniformis foram cristalizadas e tiveram sua estrutura resolvida. As beta-glicosidases, apesar de possuírem o enovelamente similar, apresentaram variações no tamanho e posição das alças formadoras da fenda catalítica e divergem em relação a um dos aminoácidos importantes para a estabilização do substrato. Essas diferenças podem ajudar a explicar o mecanismo dessas enzimas para reconhecer substratos distintos. A endoglucanase da família GH5, possuindo dois módulos acessórios, foi cristalizada tanto na forma apo quanto complexada ao substrato celotetraose. O segundo módulo acessório possivelmente é um domínio de ligação à celulose (CBM) e seus resíduos aromáticos, que são responsáveis pela interação com o substrato, parecem complementar o sítio catalítico, sendo assim um novo mecanismo de auxílio enzimático de um CBM. O primeiro módulo acessório não possui um aparente sítio de interação com carboidratos e provavelmente funciona como um conector entre domínio catalítico e o CBM. O posicionamento do substrato no sítio de ligação é parecido com outras estruturas já determinadas, porém, suscita algumas dúvidas sobre a função dos resíduos catalíticos que é conservada na família. O carbono anomérico do substrato possui uma densidade eletrônica contínua com o glutamato da fita β4 (que deveria ser o ácido/base) e está mais próximo dele que do glutamato da fita β7 (que deveria ser o nucleófilo). / Cellulose is the most abundant biopolymer in the world and can become a renewable energy source through its transformation in fermentable sugars, which will be converted in bioethanol. The cellulose recalcitrance, main difficulty in the process, can be overcome with the aid of enzymes (cellulases). At least three cellulolytic enzymes are required for complete hydrolysis of cellulose, including cellobiohydrolases for hydrolyzing the glycosidic linkages from the reducing and non-reducing chain ends, endoglucanases for randomly cleaving cellulose chains in the amorphous regions, and beta-glucosidases for producing glucose from the solubilized cello-oligomers. But, to become a financially viable process it is necessary to know the mechanism, optimize the activity and improve the production of these cellulases. In order to advance the understanding of the structure and function of these enzymes, the present work intended to study the structure of beta-glucosidases from family GH1 and endoglucanases from family GH5. In the first part of the work, the expression of endoglucanase II from Trichoderma reesei was not achieved, even using different organisms and expression conditions. However, in the second part, the expression, purification and the crystallization first trials of eleven bacterial beta-glucosidases and eight bacterial endoglucanases were achieved. Among them, three beta-glucosidases and one endoglucanase from Bacillus licheniformis were crystallized and had their structures solved. Beta-glucosidases, although having a similar folding, showed variations in the length and position of the loops that form the catalytic cleft and diverge in relation to one of the amino acids that are important in substrate stabilization. These differences may help explain the mechanism of these enzymes to recognize distinct substrates. The endoglucanase, which has two accessory modules, was crystallized in the apo form and complexed with the substrate celotetraose. The second accessory module probably is a cellulose binding domain (CBM) and its aromatic residues, which are responsible for the substrate interaction, seem to complement the catalytic site. Therefore it can be a new mechanism of CBM assistance in the enzymatic activity. The first accessory module has no apparent interaction site with carbohydrates and probably works as a connector between the catalytic domain and CBM. The positioning of the substrate in the binding site is similar to other structures already solved but raises some questions about the role of the catalytic residues, that are conserved in the family. The anomeric carbon of the substrate has a continuous electron density with glutamate from sheet-β4 (which should be the acid/base) and is closer to it than to glutamate from sheet-β7 (which should be the nucleophile).

O presente trabalho buscou o desenvolvimento da discussão acerca do tema da expansão das florestas plantadas para produção de celulose no país e a inserção do fomento florestal neste contexto. Para tanto, enfocou os seguintes objetivos: avaliar o crescimento da indústria de celulose brasileira e a questão dos conflitos sociais relacionados à expansão florestal; analisar os modelos de propriedade e posse de terras na formação da base florestal no Brasil e em outras regiões do mundo; estudar, os conceitos e iniciativas que possam fortalecer o fomento florestal como um modelo de produção capaz de atender às necessidades de expansão e interesses das empresas, dos produtores, e da sociedade. A pesquisa permitiu verificar que as empresas de celulose no país, ao mesmo tempo em que desenvolveram sua capacidade produtiva e competitividade comercial em escala mundial, tem procurado também desenvolver sua administração com notada preocupação quanto ao nível de adequação de seus mecanismos de governança corporativa. Contudo, os conflitos que se verificam em várias situações indicam que o modelo de desenvolvimento adotado ainda carece de aperfeiçoamentos em aspectos específicos tal qual o das questões sociais. Notou-se no trabalho, que há no Brasil um nível de concentração das florestas plantadas, para fins de produção de celulose, maior que o verificado em outros importantes países produtores. Neste cenário, a análise do fomento florestal permitiu a conclusão de que este pode se apresentar como um mecanismo alternativo de crescimento da base florestal útil para as empresas de celulose e para a sociedade como um todo se baseado em princípios que levam em conta a participação social como elemento essencial. Nesta perspectiva, os plantios florestais são ainda, para o fomento florestal, um vasto campo necessitando de pesquisas, estudos e desenvolvimento de modelos de manejo que sejam apropriados para esta situação. A utilização das noções da multifuncionalidade da agricultura e a função socioambiental da propriedade apresentam-se como referência a ser explorada para tais trabalhos. Outra questão importante foi o reconhecimento da necessidade da apropriação do contexto ambiental e social em que se desenvolvem os projetos florestais indicando que tais programas de fomento devem se firmar como instrumentos para busca das soluções destes grandes problemas tal qual a do necessário esforço para recuperação do bioma da Mata Atlântica e ao mesmo tempo participando da organização social para busca do desenvolvimento rural das comunidades. As experiências da Votorantim Celulose e Papel com o programa de Poupança Florestal, outros trabalhos de fomento, estudos e relatos de profissionais ligados à realidade do fomento florestal e extensão rural indicam que o envolvimento das universidades e instituições públicas e privadas no desenvolvimento de pesquisas e trabalhos científicos que sustentem o desenvolvimento de práticas e políticas sobre o tema do fomento florestal mostra toda sua pertinência para proporcionar um debate fecundo e inovador. / The present work tried to establish a discussion about the expansion of the planted forests for pulp production in the country and the insertion of the forest partnership programs in this context. To achieve this goal, the work focus in the following objectives: Analyze the social conflicts related to the expansion of the planted forests; Analyze the types of land ownership and land tenure that constitute the planted forest areas in Brazil and in the world, with emphasis in the pulp companies; Study some sustainability concepts and initiatives used to enhance the role of the forest partnership programs as an alternative wood supply model that attend the demands for forest base expansion by the companies and also the needs of farmers and society. This work established that the pulp companies in the country work at the same time developing their productive capacity, competitive commerce in global scale and management, with noted concern in adapting their corporative governance mechanisms. Although, the many existing conflict situations shows that the development model used still lacks improvements in some specific themes, like social aspects. In Brazil most of the planted forests are established to supply pulp companies, more than verified in some important forest productions countries. The analysis shown that the forest partnership programs can be seen as an alternative and useful tool by the pulp companies to expand their forest areas with benefits to society, if based in a participative process. In this perspective, the planted forests areas, that in the companies owned areas shown a high technology level and very developed process, in partnership areas still lacks studies and researches in the development of models that are appropriated to that situation. Multifunctional character of agriculture and the environmental and social function of the properties are the key lines to be followed in these researches. Another important question is that the forest partnership programs must incorporate in their development the environmental and social contexts, establishing themselves as a tool to asses some important problems, like the efforts to restore the Atlantic Rainforest and its environmental services and at the same time working together with communities in the search for the rural development. The experience in the Votorantim cellulose e Papel with the Poupança Florestal partnership program, other programs experiences, researches and descriptions made by professionals involved in partnership programs and extension activities shown that the involvement of the universities and government and private institutions in the research and development of practices and policies about the forest partnership programs shows the importance of the theme as a requisite to a profound and innovative debate.

Úlceras crônicas são algumas das principais causas de morbi-mortalidade, devido a sua alta probabilidade de infecção e sepse; por esse motivo, elas tem um impacto significativo na saúde pública e no dispêndio de recursos com assistência médica. Úlceras (ou feridas) são caracterizadas por uma perda de substância tecidual, provocando a descontinuidade do tecido cutâneo e adjacentes, alterando a estrutura anatômica e fisiológica das regiões afetadas. As mais comuns são: cirúrgicas, venosas (de estase, varicosa), arteriais, neurotróficas (hanseníase, diabetes, alcoolismo), por pressão ou mistas. A membrana de celulose bacteriana (CB) é utilizada como curativo temporário para tratamento dessas úlceras de pele de diversas origens, devido à excelente conformação no corpo, manutenção da umidade local, redução da dor e aceleração da regeneração do epitélio. A própolis tem mostrado possuir efeitos antibacteriano, antifúngico, antiviral, anti-inflamatório, hepatoprotetor, antioxidante, antitumoral e imunomodulatórios. Outro tratamento para úlceras muito utilizado é a laserterapia de baixa intensidade (LBI), cujos efeitos regenerativos são comprovados; além de promover a cicatrização de úlceras, promove o alívio da dor, melhora da circulação local e diminuição da inflamação. O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficácia da aplicação de curativos temporários de CB pura ou com própolis associados ou não a aplicação de LBI em indivíduos que apresentavam úlceras crônicas. A amostra conteve 8 pacientes, num total de 12 úlceras, divididos aleatoriamente em 05 grupos: Grupo Membrana de CB Pura (G1), Grupo Membrana de CB com Própolis (G2), Grupo Laser (G3), Grupo Membrana de CB Pura + Laser (G4), Grupo de Membrana de CB com própolis + Laser (G5). Sessenta e sete por cento das úlceras tratadas evoluíram para cicatrização total, apresentando aumento da velocidade de cicatrização em comparação com o tempo de existência da úlcera. Do restante das úlceras tratadas, somente uma teve sua área final aumentada devido a fatores como diabetes descompensada e infecção bacteriana; as outras tiveram uma grande evolução e chegaram próximas da reepitelização total. Todos os tratamentos se mostraram efetivos no tratamento de úlceras crônicas, porém o diferencial na cura foi a utilização de membranas de CB pura e com própolis. / Chronic skin ulcers are a major source of morbidity-mortality due to their high probability of infection and sepsis; for this reason, they have a significant impact on public health and the expenditure of healthcare resources. Skin ulcers (or wounds) are characterized by a loss of tecidual substance, interrupting cutaneous tissue and changing their anatomic and physiologic structures. The most commom ulcers are: cirurgical, venous, arterials, neurotrophics, pressure ulcers or mixed factors. Bacterial cellulose (BC) membrane is used as a temporary curative for the treatment of several types of skin ulcers due to its amazing body conformation, keeping the humidity, reducing the pain and accelerating the ephitelium healing process. Propolis have shown antimicrobial, antifungal, antiviral, anti-inflammatory, hepatoprotective, antioxidant, antitumor and immunity modulation effects. Another treatment for skin ulcers is low-level laser therapy (LLLT), who have regenerative effects, and it also promoves the ulcer cicatrization, pain relief, better local circulation and reduces the inflammation. The aim of this study was to evaluate the effectiveness of pure BC and propolis BC membrane curative application, associated or not to LLLT in individuals who had chronic ulcers. The sample contained 8 patients and 12 ulcers, randomly divided in 5 groups: Pure BC Membrane Group (G1), Propolis BC Membrane Group (G2), Laser Group (G3), Pure BC Membrane + Laser Group (G4) and Propolis BC Membrane + Laser (G5). Sixty seven per cent of the treated ulcers progressed to full cicatrization, increasing the speed of cicatrization when compared to the existent period of the ulcer. The resto of treated ulcers had a great evolution and got close to the total reepithelization, except for one that had increased its final area because of decompensated diabetes and bacterial infection. All treatments had shown effectiveness for the treatment of chronic skin ulcers, however the differential on healing process was the use of pure BC membranes and propolis BC membranes.

Submitted by Luiz Felipe Barbosa (luiz.fbabreu2@ufpe.br) on 2015-03-13T13:17:33Z No. of bitstreams: 2 Dissertação Biblioteca.pdf: 708752 bytes, checksum: df7cba1e43069bfc51896d1a153c8993 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-13T13:17:33Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação Biblioteca.pdf: 708752 bytes, checksum: df7cba1e43069bfc51896d1a153c8993 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2012 / O bagaço da cana-de-açúcar é constituído por celulose, hemicelulose e lignina. A celulose, quando hidrolisada, é transformada em celobiose que por sua vez pode ser hidrolisada em duas moléculas de glicose. A enzima ß-glucosidase é a proteína responsável pela hidrolise de celobiose em glicose. Entretanto, o bagaço é, na maioria das vezes, queimado para a produção de energia elétrica para ser utilizada no processo industrial não sendo utilizado para a produção de etanol. Por ter um crescimento mais rápido do que a levedura Saccharomyces cerevisiae em condições industriais de fermentação alcoólica apresentando uma maior resistências a altas concentrações de etanol, altas temperaturas e baixo pH têm feito da Dekkera bruxellensis alvo de pesquisas e melhoramentos genéticos. O presente trabalho teve como objetivo identificar e analisar in silico o gene codificante da ß-glucosidase no genoma da levedura D. bruxellensis através das ferramentas de bioinformática. Os resultados mostraram que a partir do alinhamento BLASTp, uma seqüência curta da levedura D. bruxellensis apresentou similaridade com seqüências codificantes para a enzima ß-glucosidase de espécies da divisão ascomiceto. A seqüência da espécie Kluyveromyces marxianus obteve o maior percentual de similaridade com a seqüência de D. bruxellensis. Foram identificados no alinhamento múltiplo, através de conhecimento prévio da literatura, os resíduos do sitio ativo da enzima ß-glucosidase presentes na seqüência de D. bruxellensis mostrando ser sítios bastante conservados

Submitted by Caroline Falcao (caroline.rfalcao@ufpe.br) on 2017-04-10T16:51:06Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) 2012-Dissertação-RochaneTorres.pdf: 692913 bytes, checksum: 7cd4864091015b6ca287e445f2eb5c7a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-10T16:51:06Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) 2012-Dissertação-RochaneTorres.pdf: 692913 bytes, checksum: 7cd4864091015b6ca287e445f2eb5c7a (MD5) Previous issue date: 2012 / O bagaço da cana-de-açúcar é constituído por celulose, hemicelulose e lignina. A celulose, quando hidrolisada, é transformada em celobiose que por sua vez pode ser hidrolisada em duas moléculas de glicose. A enzima ß-glucosidase é a proteína responsável pela hidrolise de celobiose em glicose. Entretanto, o bagaço é, na maioria das vezes, queimado para a produção de energia elétrica para ser utilizada no processo industrial não sendo utilizado para a produção de etanol. Por ter um crescimento mais rápido do que a levedura Saccharomyces cerevisiae em condições industriais de fermentação alcoólica apresentando uma maior resistências a altas concentrações de etanol, altas temperaturas e baixo pH têm feito da Dekkera bruxellensis alvo de pesquisas e melhoramentos genéticos. O presente trabalho teve como objetivo identificar e analisar in silico o gene codificante da ß-glucosidase no genoma da levedura D. bruxellensis através das ferramentas de bioinformática. Os resultados mostraram que a partir do alinhamento BLASTp, uma seqüência curta da levedura D. bruxellensis apresentou similaridade com seqüências codificantes para a enzima ß-glucosidase de espécies da divisão ascomiceto. A seqüência da espécie Kluyveromyces marxianus obteve o maior percentual de similaridade com a seqüência de D. bruxellensis. Foram identificados no alinhamento múltiplo, através de conhecimento prévio da literatura, os resíduos do sitio ativo da enzima ß-glucosidase presentes na seqüência de D. bruxellensis mostrando ser sítios bastante conservados. / Bagasse of cane sugar is composed of cellulose, hemicellulose and lignin. Cellulose, when hydrolyzed, is transformed into cellobiose which can be hydrolyzed to two glucose molecules. The enzyme ß-glucosidase is the protein responsible for the hydrolysis of cellobiose to glucose. However, the bagasse is, in most cases, burned to produce electricity to be used in the industrial process and it is not used for ethanol production. Due to have a faster growth than Saccharomyces cerevisiae yeast in industrial fermentation conditions and presenting a greater resistance to high concentrations of ethanol, low pH and high temperatures have made the Dekkera bruxellensis subject of research and genetic manipulations. This study aimed to identify and analyze in silico gene encoding ß-glucosidase in the D. bruxellensis yeast genome through the computational tools of bioinformatics. The results showed that in the blastp alignment, a short sequence of D. bruxellensis yeast showed similarity with sequences coding for the ß-glucosidase enzyme in the ascomycete division species. The Kluyveromyces marxianus sequence had the highest percentage in similarity with D. bruxellensis sequence. The multiple alignment tool was able to identify, using prior knowledge of the literature, the active site residues of the ß-glucosidase enzyme in the sequence of D. bruxellensis. Sites showed to be very conserved.

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio Grande do Sul.

Made available in DSpace on 2018-08-01T22:35:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_11319_Dissertação MARCIA CARNEIRO 2017-Final.pdf: 3314049 bytes, checksum: 89a6f97472eaf3e8f6cf3ee53b0cfcbd (MD5) Previous issue date: 2017-08-30 / Cultivado em larga extensão territorial no Brasil, o gênero Eucalyptus ganha destaque na economia nacional, sendo a principal fonte de matéria prima para a indústria de papel e celulose. Em decorrência de a madeira ser um material complexo e heterogêneo, o conjunto das suas propriedades varia em nível de gênero, espécie, indivíduo e também em nível celular. Alguns indicadores são comumente utilizados para definir a qualidade da madeira, dentre eles, destaca-se a densidade básica. Todavia, ressalta-se que as propriedades anatômicas devem ser estudadas a fim de se obter um melhor diagnóstico acerca da adequação da madeira para as mais diversas formas de uso. O objetivo geral desta pesquisa foi avaliar as propriedades físicas e anatômicas da madeira de clones de Eucalyptus grandis x Eucalyptus urophylla utilizados na produção de celulose. Foram avaliadas as propriedades da madeira de 12 clones, aos 6 anos de idade, oriundos de testes clonais localizados em Aracruz, ES, pertencentes a empresa Fibria Celulose S.A. Foram avaliadas 5 árvores por clone, perfazendo um total de 60 árvores. Os resultados indicaram a ocorrência de variações da densidade básica na direção base-topo, na direção medula-casca e entre os clones. Tendo sido observada uma variação da densidade básica média de 0,47 g.cm-3 a 0,59 g.cm-3 para os clones dois e nove, respectivamente. No sentido medula-casca, esta propriedade apresentou valores baixos nos primeiros centímetros a partir da medula, aumentando conforme proximidade com a periferia do tronco. O clone seis apresentou a maior média de velocidade de propagação da onda de tensão no sentido longitudinal do tronco, na região do diâmetro a altura do peito - DAP, diferindo estatisticamente dos demais. Quanto a anatomia da madeira, foram observadas variações nos aspectos quantitativos e qualitativos do lenho dos clones. As correlações foram elevadas e significativas entre altura total e DAP; densidade básica e espessura da parede celular das fibras; diâmetro do lume e frequência vascular; e ângulo microfibrilar - AMF e espessura da parede celular das fibras. Palavras-Chave: Densidade básica, anatomia da madeira, variabilidade, clones de eucalipto.