Visando contribuir para estratégias efetivas de conservação e manejo de espécies arbóreas do cerrado, cuja paisagem encontra-se altamente fragmentada, este trabalho objetivou estudar, por meio de oito locos microssatélites nucleares, a diversidade genética, a estrutura genética espacial intrapopulacional, o sistema de reprodução e o fluxo gênico em uma população de Copaifera langsdorffii Desf localizada na Estação Ecológica de Assis (EEA), oeste do Estado São Paulo. Copaifera langsdorffii é hermafrodita, polinizada por insetos e dispersa por barocoria e ornitocoria, com potencial econômico e de utilização na restauração florestal, além de apresentar ampla distribuição no cerrado. Neste estudo, o seguinte desenho amostral foi adotado: em uma parcela de 10,24 ha, estabelecida no interior da EEA foram mapeadas, amostradas e genotipadas todas as 57 árvores adultas. Para estudar a dispersão realizada de sementes, no centro da parcela foi estabelecida uma subparcela de 1,44 ha, onde todos os 147 jovens existentes também foram mapeados, amostrados e genotipados. Para comparar a diversidade genética, a endogamia e o sistema de reprodução entre árvores da parcela com árvores da borda do fragmento foram coletadas sementes de polinização aberta de 17 matrizes na parcela (340 sementes) e de 11 matrizes na borda (220 sementes). Os resultados mostraram que os adultos da parcela tinham maior heterozigosidade e menor endogamia do que a observada nos jovens e nas sementes, sugerindo mecanismos seletivos que favorecem indivíduos heterozigóticos. A população de jovens apresentou fraca estrutura genética espacial, porém significativa até 102 m de distância, indicando uma dispersão moderada de sementes, gerada provavelmente por ornitocoria. Em concordância, a análise de maternidade nos jovens mostrou alta freqüência de dispersão acima de 100 m e um padrão tendendo à normalidade, sugerindo o fenômeno de escape previsto na hipótese Janzen-Connell. Também foi detectada uma alta taxa de imigração de sementes (15%) e pólen (64%) na parcela, sugerindo intenso movimento de genes na população. Por outro lado, o pólen foi disperso em alta freqüência em distâncias relativamente curtas (65% até 150 m), embora tenha também atingido longas distâncias dentro da parcela (300 m). De acordo com a estimativa da taxa de cruzamento, a população apresentou um sistema misto de reprodução, com predominância de cruzamentos. Comparando-se matrizes da parcela com as da borda foi observada maior taxa de autofecundação e heterogeneidade no conjunto de pólen naquelas localizadas na borda, evidenciando um nítido efeito de borda no cerradão. A estimativa do tamanho efetivo dos adultos na parcela sugere que EEA tem área mínima viável para a conservação in situ da respectiva população. Contudo, é fundamental que a conectividade genética (fluxo gênico) entre esse fragmento e outros no entorno, seja mantida para a manutenção do potencial evolutivo da espécie no longo prazo. Visando a coleta de sementes na EEA para estratégias de conservação ex situ e restauração florestal, os resultados indicam que a coleta deve ser realizada preferencialmente no interior do fragmento, em matrizes distantes pelo menos 300 m entre si e em, no mínimo, 19 matrizes para reter um tamanho efetivo de aproximadamente 50. / Aiming to contribute to effective strategies for conservation and management of Savanna cerrado tree species, whose landscape is highly fragmented, this study investigated, through eight microsatellite nuclear loci, the genetic diversity, the intrapopulation spatial genetic structure, the mating system and gene flow in a population of Copaifera langsdorffii Desf located in the Ecological Station of Assis (ESA), west of São Paulo State. Copaifera langsdorffii is hermaphroditic, pollinated by insects and its seed dispersal is carried out by gravity and birds; it has economic potential and forest restoration use, while it has a wide distribution in the cerrado. In this study, the following sampling design was adopted: in a plot of 10.24 ha, established within the ESA all 57 adult trees were mapped, sampled and genotyped. To study seed dispersal in the center of the plot a subplot of 1.44 ha was established, where all 147 young trees also were mapped, sampled and genotyped. To compare the genetic diversity, inbreeding and the mating system of trees from the plot and the edge of the remnant, open-pollinated seed arrays were collected from 17 seed-trees in the plot (340 seeds) and 11 seed-trees at the edge (220 seeds). The results showed that adults had a higher proportion of heterozygosity and lower inbreeding levels than that observed in young trees and seeds, suggesting that selective mechanisms are favoring heterozygous individuals. The population of young trees reveled a weak, but significant spatial genetic structure up to 102 m of distance, indicating a moderate seed dispersal, probably due to bird dispersal. In agreement, the analysis of maternity in the young trees showed a high frequency dispersion over 100 m with a pattern tending to normality, suggesting the escape phenomenon according to Janzen-Connell hypothesis. A high rate of immigration of seeds (15%) and pollen (64%) in the plot was also detected, suggesting intense movement of genes in the population. Furthermore, the pollen was dispersed with high frequency at relatively short distances ( 65% up to 150 m), but it also achieved long distances within the plot (300 m). According to the estimate of the outcrossing rate, the population had a mixed mating system, with predominance of outcrosses. In the comparison of seed-trees from the plot with the ones on the edge, higher rate of selfing and pollen heterogeneity were detected on the edge, showing a clear edge effect on the dry forest cerradão. Estimates of the effective size of adults in the plot suggests that ESA has a minimum viable area for in situ conservation. However, the maintenance of genetic connectivity (gene flow) between this fragment and others in the neighborhood, is essential to assure the evolutionary potential of this species in the long-term. Aiming seed collection in the EEA for ex situ conservation and forest restoration strategies, the results indicate that the collection should be done preferably within the fragment, in seed-trees at least 300 m distant from each other and from at least 19 seed-trees to retain an effective size of about 50.

Utilizaram-se duas onças-pintadas (Panthera onca) e um puma (Puma concolor) provenientes de natureza e 44 sincrânios das mesmas espécies. Estes animais de vida livre foram capturados respectivamente na Amazônia (Sul do Pará), na Mata Atlântica (Zona da Mata de Minas Gerais) e no Pantanal sul mato-grossense (Mato Grosso do Sul). Os animais foram avaliados mediante anestesia geral injetável, exame físico geral, exame físico da cavidade oral, documentação dos achados clínicos em fichas-odontogramas e fotografia. As duas onças-pintadas apresentaram algum tipo de enfermidade na cavidade oral variando de graus de pouco grave quanto à função do sistema estomatognático a grau severo (desgaste dental, traumatismo dental e doença periodontal), que podem levar o indivíduo a sofrer distúrbios da homeostase e possível alteração de comportamento predatório. O puma capturado no Pantanal não apresentou lesões macroscópicas que pudessem comprometer a função e higidez do sistema estomatognático. Após as observações serem feitas, todos os animais foram soltos no mesmo local da captura. Foram avaliados ainda 17 sincrânios (crânio + mandíbula) de Panthera onca e 27 de Puma concolor, todos de animais coletados na natureza ao longo de décadas, em diferentes biomas brasileiros e depositados na coleção de Mastozoologia do Museu de Zoologia da Universidade de São Paulo (MZUSP). Verificaram-se algumas evidências de lesões no sistema estomatognático envolvendo dentes, ossos alveolares, arco zigomático, ossos nasais, ossos frontais e palatinos, todas acontecidas em vida, fazendo com que os indivíduos tivessem que se adaptar a esta condição até a formação de processos reparativos. / Two jaguars (Panthera onca) and one puma (Puma concolor) proceeding from nature and 44 sincraniuns of the same species. These animals of free wildlife had been captured respectively in the Amazonia (South of Pará), in Atlantic Forest (Zona da Mata de Minas Gerais) and in the south Pantanal (Mato Grosso do Sul). The animals had been evaluated after injectable general anesthesia, general physical examination, physical examination of the oral cavity, documentation of the clinical findings in dental-charts and photograph. The two jaguars presented some type of disease in the oral cavity varying from mild degree according to the function of the stomatognathic system severe degree (dental wearing, dental trauma and periodontal disease), which can lead the individual to have its homeostasis and possibly the of predatory behavior altered. The puma captured in the Pantanal did not present macrocospic injuries that could compromise the function and healthiness of the stomatognathic system. After the examinatis, all the animals were released in the same local of the capture. 17 sincraniuns (skull + jaw) of Panthera onca had were evaluated and 27 of Puma concolor, all animals were collected in the nature through decades, from different Brazilian biomas and kept in the collection of Mastozoology of the Museum of Zoology of the University of São Paulo (MZUSP). Some evidences of injuries in the stomatognathic system were verified involving alveolar teeth, bones, zigomatic arch, nasal bones, frontals and palatine bones. All these variables occurred while the animal, forcing the individuals to adapt themselves to these conditions until the formation of reparative processes. Such findings possible were not the cause of death of the animals.

Orientador: João Vasconcellos Neto / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-19T19:51:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Alves_TatianeGisele_M.pdf: 798527 bytes, checksum: 1a4e43c431da929637d06a17913050d8 (MD5) Previous issue date: 2011 / Resumo: A maior parte dos ambientes naturais têm sido convertidos para uso humano. Estas mudanças estão ocorrendo num ritmo nunca antes experimentado pela natureza. O aumento do conhecimento sobre a estrutura e o funcionamento dos ecossistemas auxilia na busca de respostas de como e que forma estas ações estão afetando os sistemas naturais, e consequentemente no planejamento de melhores estratégias de conservação. Uma das maneiras de acessar os processos ecológicos que são difíceis de monitorar é buscar grupos ou organismos que facilitem o entendimento destas intervenções. A sensibilidade das assembleias de formigas, combinada com a sua importância funcional e amostragem fácil, fazem delas bons organismos para estudos de conservação. O estudo avaliou a estrutura das assembleias de formigas em três unidades de conservação na Floresta Atlântica. As formigas foram amostradas em uma floresta contínua no Parque Estadual da Serra do Mar, sudeste do Brasil, em áreas mais preservadas e menos preservadas. O objetivo foi determinar se a riqueza, a composição e a abundância destes organismos diferem entre as áreas contrastantes em relação ao grau de perturbação antrópica. Os resultados mostraram que a riqueza não foi afetada nas áreas com diferentes históricos de perturbação, mas a composição mudou drasticamente em duas das três áreas. A abundância de formigas cortadeiras foi baixa em todas as áreas e não mostrou diferenças significativas, e a abundância de Ponerinae foi semelhante entre os diferentes contrastes. Os resultados do estudo sugerem que nos sistemas estudados, os efeitos nas assembleias são dependentes da intensidade e da frequência da perturbação, e do tempo de recuperação da área alterada / Abstract: The majority of the natural environments have been converted for human use. These changes are occurring in a level never experienced before by nature. Increased the knowledge about the structure and functioning of ecosystems helps in finding answers about how to and in what way these actions can affecting natural systems, and consequently in the planning of better conservation strategies. One way to access the ecological processes that are difficult to monitor is to find groups of organisms that are affect by these changes. The sensitivity of ant assemblages, combined with their functional importance and easy of sampling makes them excellent organisms for conservation studies. The present study evaluated the structure of ant assemblages in three protect areas in the Brazilian Atlantic Forest. Ants were sampled within a continuous forest in the Serra do Mar State Park, southeastern Brazil, in disturbed and undisturbed areas. The objective was to determine if richness, composition and abundance of ant assemblages differ between contrasting areas in relation to the degree of human disturbance. Results showed that ant richness has not changed between areas with different disturbance history, while the composition has changed dramatically in two of the three areas. The abundance of leaf-cutting ants was low in all sites and showed no significant differences, and the abundance of Ponerinae was similar across the contrasting areas surveyed. Results suggest that in the studied systems, the effects are dependent of the intensity and frequency of disturbance, and also of the recovery time of disturbed area / Mestrado / Ecologia / Mestre em Ecologia

Resumo: Os peixes apresentam uma grande diversidade de espécies, sendo na região Neotropical onde se encontra o maior número de espécies de água doce. Entretanto, esta grande diversidade encontra-se ameaçada devido à degradação dos ecossistemas lóticos, principalmente pela alteração do habitat devido à destruição das florestas e fragmentação da rede hidrográfica. As florestas, principalmente as florestas ripárias, possuem funções ecológicas importantes para a estruturação dos riachos e das comunidades aquáticas. Por muito tempo, as florestas têm sido extensamente destruídas, sendo substituídas principalmente pelos usos agrícolas, ocasionando a destruição dos ecossistemas e da biodiversidade aquática. Além das alterações nas florestas, a presença de represamentos e cruzamentos de estradas gera impactos adicionais para os peixes ao romper a conectividade existente na rede hidrográfica. Os peixes possuem ciclos de vida complexos que dependem da complexidade estrutural do riacho e da conectividade entre trechos montante e jusante da rede. Portanto, a conservação das florestas e a manutenção da conectividade hidrológica são fatores importantes para a conservação das comunidades de peixes. Neste trabalho, avaliou-se a diversidade das comunidades de peixes de riachos em função das alterações na estrutura da paisagem florestal (composição e configuração) e da conectividade da rede hidrográfica em paisagens agrícolas. O estudo foi realizado em microbacias de 1ª a 4ª ordem pertencentes à bacia do rio Corumbataí. Diferenças nos índices de diversidade das comunidades foram testadas a partir da Análise de Variância considerando a estrutura da paisagem florestal em diferentes escalas espaciais (microbacia, rede de drenagem e trecho de coleta) e a conectividade da rede hidrográfica. As relações entre as variáveis da paisagem (estrutura da paisagem... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Fish exhibit great species diversity, and the Neotropical region holds the largest number of freshwater fish species . However, this great diversity is threatened due to lotic ecosystems degradation, mainly through forest destruction and stream network fragmentation. Forests, mainly riparian forests, have important ecological functions for stream and aquatic communities structuring. For a long time, forests have been extensively destroyed and replaced mainly by agricultural uses, causing stream and aquatic biodiversity destruction. Besides the alterations in forests, the presence of dams and road crossings generates additional impacts to fish by disrupting existing connectivity to the stream network. Fish have complex life cycles that depend of the stream structural complexity and the connectivity between upstream and downstream sections of the stream network. Hence, forest conservation and maintenance of hydrological connectivity are important factors for the conservation of fish communities. In this study, we evaluated stream fish community diversity in relation to changes in forest landscape structure (composition and configuration) and the stream network connectivity in agricultural landscapes. The study was conducted in 1st and 4th order catchments belonging to the Corumbatai river basin. Differences in diversity indices were tested by Analyses of Variance considering forest landscape structure at different spatial scales (whole catchment, stream network and stream sampled reach) and stream network connectivity. The relationship between landscape variables (forest landscape structure, riparian forest landscape structure and physical and hydrological hierarchy variables) and aquatic environment variables (channel structure and limnology and fish diversity indices) were evaluated using Redundancy Analysis (RDA) and Multiple Regression Analysis. These relationships were also assessed... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Silvio Frosini de Barros Ferraz / Coorientador: Pedro Gerhard / Banca: Lílian Casatti / Banca: Maurício Cetra / Mestre

Apesar de ocupar cerca de 25% do território nacional e abrigar, potencialmente, um terço da fauna e flora brasileira, o bioma cerrado é classificado como um “hotspot" por apresentar expressiva redução de biodiversidade. Perante este quadro, este trabalho teve por objetivo comparar os métodos de amostragem de parcelas de área fixa e de ponto quadrante em uma área com predominância da fisionomia cerradão (savana florestada) na Estação Ecológica de Assis (SP), estando inserido no projeto temático “Métodos de Inventário da Biodiversidade de Espécies Arbóreas\", do Programa BIOTA/FAPESP. A área estudada é representada por uma grade amostral sistemática que contém 64 parcelas de 90 x 10 m (900 m2), inseridas em 8 linhas distantes 100 m entre si, com 8 parcelas em cada linha. Estas foram subdivididas em 9 subparcelas de 10 x 10 m, com um intervalo de 10 m não amostrado entre as parcelas nas linhas. Os pontos quadrantes foram instalados em cada limite entre as subparcelas. Os indivíduos arbóreos com DAP maior ou igual a 4,77 cm foram inseridos nesta amostragem, sendo posteriormente identificados. Partindo-se deste delineamento amostral e, diante da ocorrência de fragmentos de cerrado strictu sensu juntamente com áreas de cerradão, simulou-se a existência de nove tamanhos de parcela, variando de 100 a 900 m2, a fim de avaliar como esses diferentes tamanhos, bem como o método do ponto quadrante, interferem no esforço amostral, na estimativa da densidade e nos índices fitossociológicos e de diversidade. Ao final do levantamento, o método de parcelas de 900 m2 incluiu 102 espécies, distribuídas em 45 famílias, enquanto que o método do ponto quadrante amostrou 71 espécies, distribuídas em 37 famílias. Os resultados encontrados em ambos os métodos quanto ao Índice de Valor de Importância apontaram as espécies Copaifera langsdorffii, Vochysia tucanorum e Ocotea corymbosa como as mais importantes; já a família Myrtaceae se destacou nestes dois métodos quanto à riqueza de espécies. A curva de esforço amostral do método do ponto quadrante incluiu um número de espécies semelhante à curva das parcelas de 200 m2, com a vantagem de apresentar maior praticidade de instalação no campo. Os valores do Índice de Diversidade de Shannon foram inferiores a outros biomas, enquanto que o Índice de Diversidade de Simpson não pôde ser o mais indicado para o cerradão estudado, por não ser sensível à ocorrência de espécies com apenas um indivíduo na parcela. Para a determinação da diversidade arbórea do cerradão da E. E. Assis, recomendou-se o uso da parcela de 400 m2. Já na estimativa da densidade, as parcelas de 700 m2 foram as mais adequadas; entretanto, devido à grande variabilidade deste parâmetro na área, sugeriu-se uma estratificação da área de amostragem. / Cerrado biome is classified as a hotspot, because it presents an expressive reduction on the biodiversity, despite of occupying around 25% of the national territory and potentially sheltering one third of the Brazilian fauna and flora. In this scenario, this work had as objective to compare the fixed area plots and the point-centered quarter sampling methods in an area with a cerradão (savanna woodland) physiognomy at the Ecological Study Station in the city of Assis (SP), which is part of the “Tree Species Biodiversity Inventory Methods", a thematic project of BIOTA/FAPESP Program. The studied area is represented by a systematic sampling frame containing 64 plots, measuring 90 x 10 m (900 m2), inserted in 8 lines, which is 100 m away from each other, with 8 plots in each line. They were divided into 9 sub-plots measuring 10 x 10 m, with a 10-m non-sampled gap between the plots in the lines. The point-centered points were installed in each limit between the sub-plots. The arboreal individuals with DBH equal or larger than 4.77 cm were set in this sampling and identified later. From this sampling design and due to the presence of fragments of cerrado strictu sensu together with areas of cerradão, it was simulated the existence of nine size samples varying from 100 to 900 m2 aiming evaluating how these different sizes and the point-centered quarter method interfere in the sampling effort, in the density estimates, and in the phytossociological and diversity indexes. At the end of the surveying, the 900-m2-plot method included 102 species, distributed in 45 families, whereas in the center-pointed quarter method 71 species were sampled, distributed in 37 families. The results found in both methods in relation to the Importance Value Index showed Copaifera langsdorffii, Vochysia tucanorum, and Ocotea corymbosa as the most important ones; Myrtaceae family stood out on both methods in relation to species richness. The sampling effort curve of the point-center quarter method included a number of species similar to the 200-m2 plots’ curve, with an advantage of being easier to be installed in the field. The Shannon Index values were lower than in the other biomes, whereas the Simpson Index could not be the best indicated for the cerradão under study, because it was not sensitive to the presence of species with only one individual in the plot. It was recommended the use of 400-m2 plots in order to determine the tree diversity in the cerradão at the Ecological Study Station in the city of Assis. The most adequate plots to estimate the density were the 700-m2 ones. However, stratification on the sampling area was suggested due to the great variability of this parameter in the area.

O avanço agrícola é uma das maiores causas da fragmentação de habitats, levando à diminuição e ao isolamento de áreas naturais. Assim, torna-se importante compreender qual papel da estrutura e dinâmica da paisagem na manutenção da biodiversidade local. Este estudo teve como objetivo descrever a estrutura de uma comunidade de mamíferos de médio e grande porte em paisagem fragmentada agrícola, considerando a estrutura e dinâmica da paisagem. O estudo foi realizado em unidades de paisagem (16 Km2) com matriz predominante de pasto (n = 2) e cana-de-açúcar (n = 3) (bacia do rio Corumbataí, São Paulo) de maio a outubro de 2010. O levantamento da comunidade de mamíferos foi realizado através de busca ativa por pegadas, em 15 transectos alocados nas margens de riachos, com distância percorrida padronizada em 200 m. No entorno de cada transecto foram gerados buffers (250, 500, 1000 e 2000 m de raio), para o cálculo de índices de estrutura (porcentagens dos usos do solo, densidade de drenagem, densidade de estradas e proximidade entre fragmentos) e de dinâmica (taxa anual de mudança e perfil da curva de mudança florestal) para cinco anos (1962, 1978, 1995, 2000 e 2008). A relação entre os índices de paisagem e a riqueza de espécies foi analisada através de um teste PCA (Análise de Componentes Principais), gerando um gráfico Biplot. Posteriormente, foi realizada regressão linear múltipla, para análise da influência da estrutura e dinâmica da paisagem sobre a riqueza de espécies e frequência de registros. Foram registradas 19 espécies, sendo 17 em unidades de cana-de-açúcar e 13 em unidades de pasto. A comunidade de mamíferos de médio e grande porte, presente nestas matrizes da bacia do rio Corumbataí, é representada, em grande parte, por espécies tolerantes a alterações ambientais da região. A espécie com maior frequência de registros foi Procyon cancrivorus, de hábito generalista, como a maior parte dos animais registrados. Pelo gráfico Biplot, o buffer de 1000 m foi o que melhor distinguiu os sítios amostrais em relação às matrizes de cana-de-açúcar e pasto. A riqueza apresentou relação positiva com a porcentagem de áreas florestais e densidade de drenagem. Em contrapartida, a riqueza mostrou relação negativa com a porcentagem de pasto. A riqueza e a frequência de registros não apresentaram diferença estatística significativa entre as matrizes e também não houve relação significativa entre os índices de paisagem e as variáveis dependentes. A similaridade entre a composição de espécies das comunidades amostradas nas matrizes foi de 57%. As relações entre a estrutura desta comunidade e a paisagem necessitam de mais esforços para serem melhor compreendidas, já que o método de levantamento utilizado neste estudo, assim como a escala espaço-temporal, não permitiram descrever tais relações. / Agricultural expansion is a major cause of habitat fragmentation, leading to a reduction and isolation of natural areas. It is therefore important to understand the role of agricultural landscape structure and dynamics in maintaining local biodiversity. We aimed to describe how the structure and dynamics of an agricultural landscape influenced the community of mid and large bodied mammals in the south of Brazil. From May to October 2010 we studied the mammal community in five 16 km2 landscape units located within the Corumbatai river basin, São Paulo. Landscape units contained a matrix of predominantly pasture (n = 2) and cane sugar (n = 3). We used track surveys along 15 transects (200m each) to sample the mammal community along river banks. To calculate indices of habitat structure and dynamics we generated buffers (250, 500, 1000 and 2000 m radius) around each of the transects. Within each of these distance buffers we calculated habitat structure indices (percentage of land use, drainage density, road density and proximity of fragments) and indices of habitat dynamics (annual rate of change and profile of the forest change curve) for five years (1962, 1978, 1995, 2000 and 2008). The relationship between landscape indices and species richness was analyzed through a PCA (Principal Component Analysis) and associated Biplot. Subsequently, multiple linear regression was performed to analyze the influence of landscape structure and dynamics on species richness and frequency of records. We recorded 19 species, 17 in cane sugar units and 13 in pasture units. The community of mid and large bodied mammals present in the habitat matrices of the Corumbataí river basin was represented mostly by generalist species tolerant of environmental changes. The most frequently recorded species was Procyon cancrivorus, a habit generalist. The PCA Biplot showed that the 1000m buffer was the one that best distinguished the sampling sites in relation to the sugar cane and pasture matrices. Species richness was positively related with the percentage of forested areas and drainage density. In contrast, richness was negatively related with the percentage of pasture. The richness and frequency of records showed no statistically significant difference between the two matrix types and there was no significant relationship between landscape indices and the dependent variables. The similarity between the species composition of the sampled communities in the matrices was 57%. Understanding the relationships between the composition of this community and the landscape structure and dynamics requires more efforts, as the survey method used in this study, and the spatiotemporal scale, do not permit the description of these relationships.

O projeto BIOTA “Diversidade, dinâmica e conservação de florestas do Estado de São Paulo: 40 ha de parcelas permanentes" vem sendo conduzido para o conhecimento dos processos geradores, mantenedores e reguladores da biodiversidade nas principais formações vegetacionais do Estado. Uma parcela permanente de 10 ha foi instalada na unidade de conservação correspondente à Floresta Ombrófila Densa (Mata Atlântica) para a caracterização completa do ecossistema. A investigação de elementos químicos nesse ecossistema altamente ameaçado foi desenvolvida nesta Tese de Doutoramento. Diversos processos são responsáveis pela manutenção de ecossistemas naturais. À ciclagem mineral corresponde o caminhamento dos elementos químicos, que fluem entre os compartimentos bióticos (folha e serrapilheira) e abióticos (atmosfera e solo). A complexidade desse mecanismo regulatório está relacionada com a deficiência, a toxicidade, a fitodisponibilidade e as interações dos elementos químicos, além das condições ambientais de crescimento como luminosidade, temperatura e umidade. Devido à sua adaptabilidade, as plantas absorvem elementos químicos, acumulando-os nos seus tecidos. A acumulação é ativa, ou seja, independentemente do meio, as plantas mantêm as concentrações de determinados elementos. Essa característica corrobora o uso desses organismos para a quantificação da qualidade do ambiente a partir dos estudos de biomonitoração de poluição atmosférica. A análise por ativação neutrônica instrumental – INAA foi a técnica analítica empregada para a biomonitoração devido ao seu nível metrológico elevado e sua capacidade de determinação simultânea de diversos elementos. Para a comparabilidade dos resultados gerados, a qualidade do procedimento analítico, a representatividade das amostras e o efeito da contaminação com particulados de terra aderida à superfície das folhas foram também estudados. Os compartimentos solo, serrapilheira e folha tiveram sua composição química avaliada por INAA. De modo geral, foram detectadas concentrações totais de elementos químicos mais elevadas nos solos de vales (baixa altitude) do que nas regiões de alta altitude (solos mais desenvolvidos). Essa variabilidade não foi determinante das concentrações encontradas nas folhas, indicando a composição química elementar intrínseca das plantas. As concentrações nas folhas também não se alteraram significativamente (nível de 95% de confiança) de acordo com os resultados provenientes de quatro épocas de coleta diferenciadas. Foram identificadas espécies acumuladoras dos nutrientes Ca, Co, K, Na, Se e Zn, dos elementos traços Br, Ba, Cs, Hg, Rb, Sc, Sr e dos lantanídeos Ce, La e Sm. A utilização das espécies arbóreas para a biomonitoração da parcela permanente proporcionou o conhecimento das concentrações naturais dos elementos químicos. O trecho de Mata Atlântica avaliado foi considerado de baixo nível de poluição, pois a maior parte das espécies estudadas apresentou concentrações dos elementos químicos dentro da faixa esperada, com exceção das espécies naturalmente acumuladoras. Elementos traços como As, Cd, Cr e Ni ficaram abaixo dos limites de detecção. O trabalho concentrou esforços para o estabelecimento de padrões de referência para estudos de impacto ambiental considerando a composição química da parcela permanente da Mata Atlântica. O reservatório de elementos químicos no ecossistema foi estimado, evidenciando-se a importância desse conhecimento para a conservação da biodiversidade. / The BIOTA Project “Diversity, dynamic and conservation of forests from the São Paulo State: 40 ha of permanent parcels" has been conducted to provide the knowledge on the generation, sustainability and regulation processes of the biodiversity of the State. A long-term plot (permanent parcel) was installed in the conservation unit corresponding to the Dense Ombrophilous Forest (Atlantic Forest) for the environmental characterization of the ecosystem. The investigation of chemical elements in this highly threatened forest was performed in this Doctorate Thesis. Several processes are responsible for the sustainability of the natural ecosystems. Mineral cycling defines the pathway of chemical elements from non-biotic compartments (soil and atmosphere) to biotic compartments (leaf and litter). The complexity of this regulatory mechanism is related to the deficiency, toxicity, phytoavailability and the interactions of the chemical elements, in addition to environmental growth conditions like luminosity, temperature and humidity. Due to its adaptability, plants are able to uptake and accumulate chemical elements in their tissues. This accumulation is an active process in which the plants tend to maintain the concentrations of some chemical elements independently of the environmental conditions. Such characteristic corroborates the use of these organisms for quantifying the environmental quality by biomonitoring studies of atmospheric pollution. Instrumental neutron activation analysis – INAA was the analytical technique employed for biomonitoring due to its high metrological level and its capability for simultaneous determination of several chemical elements. For the comparability of the results, the quality of analytical procedure, the representativeness of samples and the effect of contamination with earth particles adhered to the leaf surface were also studied. The chemical composition of the soil, litter and leaf compartments was evaluated by INAA. The concentrations of some elements were higher for the soils of the valleys and considerably lower for the soils at higher altitudes. Such variability was not observed for the concentrations found in leaves, indicating the intrinsic chemical composition in plants. The concentrations in leaf did not change significantly (at the 95% confidence level) as demonstrated by the results from four different periods of sampling. Some tree species were able to accumulate the nutrients Ca, Co, K, Na, Se and Zn, the trace elements Br, Ba, Cs, Rb, Sc and Sr and the lanthanides Ce, Eu, La, Sm, Tb and Yb. The use of plants species for biomonitoring the long-term plot provided knowledge on the background concentrations of chemical elements. The Atlantic Forest can be considered to have a low status of pollution since most plants have shown concentrations within the expected range with exception of the accumulator species. Concentrations of some trace elements like As, Cd, Cr and Ni were below the detection limits. This work concentrated efforts to establish reference standards for studies on environmental impact considering the chemical composition in the long-term plot of the Atlantic Forest. The reservoir of chemical elements in the ecosystem was estimated, evidencing the importance of such knowledge for the biodiversity conservation.

Apesar do estado de São Paulo ter uma área de vegetação nativa pequena e, em sua maioria, altamente fragmentada, isolada e imersa em matrizes agrícolas em propriedades privadas, seu território ainda alberga um número considerável de espécies silvestres, inclusive nessas áreas comerciais. Para a elaboração de planos de manejo ecologicamente corretos, é necessário selecionar (1) espécies-chave, como os mamíferos carnívoros; (2) fatores ecológicos primários das espécies, como a dieta e o uso do espaço; e (3) locais com histórico de uso do solo representativos da exploração espaço-temporal, como, por exemplo, Angatuba (SP) em São Paulo. Essa dissertação foi desenvolvida na Fazenda Três Lagoas e seus arredores, entre maio de 2008 e junho de 2010 e abrange três temas distintos, mas interligados. No primeiro capítulo fez-se uma introdução geral sobre os temas. No segundo avaliou-se, em quatro fazendas adjacentes, a exposição de carnívoros domésticos aos agentes infecciosos da parvovirose, raiva, cinomose e leptospirose através de exames sorológicos. Verificou-se que as prevalências de contato dos 13 cães amostrados com esses agentes patológicos, foram, respectivamente, 100%, 80%, 23% e 15,4%. As reações positivas a alguns desses agentes e sorovares, mostram que os cães domésticos tiveram contato com os agentes através de outros hospedeiros, pois esses agentes não estão presentes em vacinas. Isso demostra a importância de sua detecção na vida silvestre e no ambiente visando elaborar um manejo sanitário efetivo para a economia e saúde humana e para a vida silvestre. No terceiro capítulo estudou-se a dieta de 12 espécies de mamíferos carnívoros através da análise de 524 amostras de fezes coletadas nas Fazendas Três Lagoas e Arca. Pode-se verificar que os carnívoros presentes na área possuem hábitos onívoros, com algumas alterações da dieta em comparação com áreas mais preservadas, consumindo em grande quantidade pequenos roedores, frutos e insetos. A competição, apesar de pequena, foi constadada entre as espécies domésticas e silvestres. Verificou-se, de forma complementar, que as espécies usam mais as áreas próximas da vegetação nativa que dentro da matriz, sendo que algumas espécies estiveram restritas ao ambiente nativo. Esse estudo sugere que essas paisagens albergam somente espécies com hábitos mais plásticos e que a matriz silvicultural é permeável a alguns predadores. No quarto capítulo, estudou-se a prevalência de ectoparasitas naquelas amostras de fezes, que mostrou-se de 42,17% para ácaros, dentre eles carrapatos, e 4% de pulgas. As prevalências desses artrópodes variaram entre as espécies de carnívoros. Os ácaros foram encontrados nas fezes de todas as espécies amostradas, e as pulgas estiveram presentes em fezes de todos os canídeos, de todos os felídeos, com exceção do gato-mourisco, e do quati. Foram detectados carrapatos em fezes de espécies de hospedeiros ainda não relatadas na literatura, mostrando serem hospedeiros não-usuais, o que poderia demonstrar um aumento de sua prevalência no ambiente como consequência provável da mudança da paisagem. Essa maior carga de parasitas, juntamente com o contato frequente da fauna silvestre com os humanos e seus animais domésticos, atesta a necessidade de estudos epidemiológicos de maior amplitude nessas paisagens agrícolas. / Although the state of Sao Paulo has a small area of native vegetation, mainly fragmented, isolated and highly immersed in agricultural matrices on private properties, it still lodges a considerable number of wild species, also on these commercial areas. For elaboration of ecologically correct manegement plans, it´s necessary to select (1) key-species, as carnivore mammals; (2) species primary ecological factors, as diet and space use; and (3) representative areas of space-temporal exploration of the land, as Angatuba does on Sao Paulo. This study was carried out at Fazenda Três Lagoas and its surrounding between May 2008 and June 2010, and encloses three distinct but linked subjects. The first chapter is a general introduction of those subjects. The second one evaluates, in those four adjacent farms, domestic carnivores exposition to infectious agents of parvovirosis, rabies, canine distemper and leptospirosis through serologic examinations. The prevalence of contact of those pathological agents, in the 13 dogs, were 100%, 80%, 23% and 15.4%, respectively. The positive reactions to some of these agents and serovares show that those domestic dogs had contact to other hosts, as some of them do not compose vaccines. It shows the importance of its detention in wildlife and in the environment aiming to elaborate an effective sanitary management for economy and human health and for wildlife conservation. In the third chapter the diet of 12 species of carnivorous mammals were investigated through analysis of 524 scats collected on Fazenda Três Lagoas and Fazenda Arca. Carnivore mammals on these area have omnivores\' food habits, with some modifications on diet in comparison with those in preserved areas, consuming in a great amount small rodents, fruits and insects. The competition, although weak, occurs among the domestic and wild species. In a complementary way, it was verified that the animals use more areas closer to native vegetation than inside matrix and that some species use areas restricted to native environment. This study suggests that these landscapes only lodge species with more plastic habits and that silvicultural matrix is permeable to some predators. In the forthy chapter, it was investigated the ectoparasites prevalence in those excrement samples and revealed a prevalence of 42,17% for mites, amongst them ticks, and 4% of fleas. The prevalence of those arthropods varied between carnivore species. Mites were found in excrements of all sampled species, and fleas were found in all wild dogs and wild cats faeces, but jaguarundi, and coati. Some carnivore scats contenied different ticks showing that those mammals are non-usual hosts of them and that, possibly, there is an increase of its prevalence in the environment as probable effect of the landscape modifications. A higher parasitic load with direct contact of wildlife to humans and livestock request to carry out a more in-depth epidemiologic investigation into these agricultural landscapes.

As Unidades de Conservação (UCs) foram criadas para proteger e manter os remanescentes de ecossistemas naturais a fim de reduzir a perda da biodiversidade e garantir sua manutenção em longo prazo. Atualmente, muitas UCs se encontram na forma de pequenos fragmentos isolados e sob forte pressão antrópica, exigindo um manejo na forma de uma rede de fragmentos, visando reduzir as pressões das atividades do entorno. O presente trabalho teve como objetivo gerar subsídios para a criação de uma zona de amortecimento (ZA) comum para o Parque Estadual de Vassununga e para a Estação Ecológica de Jataí, visando reduzir as pressões antrópicas sobre as UCs e facilitar o fluxo biológico entre os fragmentos. Foi realizado o mapeamento da paisagem para identificar as principais formas de uso, as fontes de impactos ambientais e verificar o cumprimento da legislação de áreas de preservação permanente. Foram utilizadas métricas de paisagens para analisar a configuração espacial dos remanescentes de vegetação arbórea e selecionar fragmentos importantes para a facilitação do fluxo biológico. Foram utilizados modelos de previsão de riqueza e probabilidade de ocorrência de espécies-alvo de aves para selecionar áreas potencialmente importantes para a manutenção da biodiversidade. A paisagem da área de estudo apresenta menos de 30% de remanescentes de vegetação natural, distribuídos em pequenos fragmentos, imersos em uma matriz de cana-de-açúcar e eucalipto. O desrespeito à legislação e numerosas fontes de impacto ambiental contribuem para aumentar a pressão sobre os recursos naturais. O incremento da conectividade dos fragmentos, principalmente com a restauração das florestas ribeirinhas mostrou ser uma estratégia importante para restabelecer a conectividade funcional entre as UCs e entre os remanescentes da paisagem. Na região existem fragmentos com potencial para facilitar os fluxos biológicos, atuando como uma rede de fragmentos, e auxiliar na manutenção da biodiversidade. Porém, grande parte deles está localizada no interior de propriedades particulares, exigindo esforços para conscientização dos proprietários para proteção e incremento da conectividade destes fragmentos. / Natural reserves have been created to protect and maintain natural ecosystems remnants in order to reduce biodiversity loss and to ensure their maintenance in the long run. Nowadays, most of these reserves are small and isolated fragments under anthropogenic pressure. Such small remnants must be managed and protected as a fragment network to reduce the human pressure and to promote biological fluxes among fragments. This study aimed at producing information to help on the process of designing a common buffer zone for three public natural reserves: Vassununga State Park, Jataí Ecological Station and Luís Antônio Experimental Station. An up to date land cover/land use map was generated to identify the main activities and sources of anthropogenic impacts in the study area, their possible consequences to the environment, and also if and how much the environmental legislation is being followed. To select the most important natural fragments which could facilitate biological fluxes and maintain the regional biodiversity, two approaches were used: analysis of the spatial arrangement of the fragments in the landscape applying landscape metrics, and the use of models to predict bird species richness and occurrence. The studied area presently has less than 30% of remnant natural vegetation, spread as small fragments in a sugar cane and eucalyptus matrix. Environmental legislation is not being obeyed and, together with several sources of impact, produce negative pressures on the natural resources. The restoration of riparian forests would be a good strategy to reestablish the landscape functional connectivity. Fragments able to facilitate biological fluxes and to maintain biological diversity still exist in the region, but a great deal of them are located in private properties. Therefore, efforts to warn and educate the owners are needed to increase the landscape connectivity and to conserve the regional biodiversity.

As palmeiras figuram entre as espécies vegetais mais importantes aos animais, já que seus frutos são bastante nutritivos e estão disponíveis geralmente em épocas de escassez de alimentos. Uma gama de animais alimentam-se de seus frutos, incluindo aves, morcegos, mamíferos não voadores, répteis, peixes e insetos. As palmeiras com frutos grandes apresentam, entretanto, limitação na dispersão de suas sementes, pois apenas poucas espécies animais podem atuar como dispersoras. As florestas tropicais vêm sofrendo da chamada “síndrome de florestas vazias", onde interações mutualísticas e agonísticas entre animais e plantas já foram perdidas, pela ausência de dispersores e predadores de sementes e herbívoros de grande porte. O primeiro capítulo teve como objetivo verificar os frugívoros que dispersam e predam as sementes da palmeira brejaúva, Astrocaryum aculeatissimum, bem como avaliar as proporções de predação das sementes por invertebrados e o recrutamento de plântulas próximos às plantas-mãe. No segundo capítulo foi avaliado o efeito da defaunação, relacionado a abundância de cutias, na remoção e na distância de dispersão das sementes. A predação por invertebrados e o recrutamento de plântulas e jovens ao redor da planta mãe também foram comparados em cinco áreas na Mata Atlântica com diferentes abundâncias de cutias. As hipóteses testadas foram que as áreas com baixas abundâncias de cutias apresentariam uma menor remoção das sementes, uma maior predação por invertebrados e um menor recrutamento de plântulas. Além das cutias (Dasyprocta spp.), ratos de espinho (Trynomis iheringi) e esquilos (Sciurus aestuans) também foram os responsáveis pela remoção de sementes e atuaram mais como dispersores do que predadores nos cinco dias de exposição das sementes. A massa das sementes não mostrou relação com a remoção pelas espécies animais. Sementes mais pesadas foram levadas a maiores distâncias da planta-mãe e as sementes predadas foram levadas a maiores distâncias do que as sementes dispersas. As áreas mais defaunadas mostraram uma menor porcentagem de remoção de sementes, bem como de predação e dispersão. A proporção de endocarpos predados por vertebrados foi maior na área com maior abundância de cutias (Ilha Anchieta) e as proporções de endocarpos intactos e predados por invertebrados foram maiores na área com menor abundância (Xixová Japuí). O recrutamento de plântulas embaixo das plantas-mãe amostradas não mostrou diferença significativa entre as áreas. O número de plântulas de Astrocaryum aculeatissimum nos 0,8 ha amostrados em cada área foi maior na Ilha do Cardoso, onde há também uma alta densidade de cutias e o menor recrutamento foi encontrado em Xixová Japuí, a área mais defaunada. Como a espécie estudada não é dispersa por uma grande diversidade de frugívoros, mudanças sutis na composição faunística do local podem ter efeitos cruciais na população da brejaúva a longo prazo. O estudo mostrou que o decréscimo populacional de cutias diminui a remoção, a predação e a dispersão de sementes, aumenta a proporção de sementes predadas por invertebrados embaixo das plantas-mãe, diminuindo o recrutamento das plântulas de Astrocaryum aculeatissimum. / The palms are among the most important plant species to the animals, because their fruits are nutritive and are available in periods of fruit scarcity. Lots of animals feed on palm fruits, including birds, bats, non-volant mammals, reptiles, fishes and insects. The palm species with big fruits show, however, limitation in seed dispersal because only a few animal`s species can act as dispersers. The tropical forest has suffered the “Empty Forest Syndrome", where mutualistic and agonistic interactions between animals and plants have just gone due to the absence of seed dispersers and predators and large size herbivores. The first chapter has as an objective study the frugivores responsible to disperse and predate the seeds of the palm brejaúva Astrocaryum aculeatissimum and evaluate the proportion of seed predation by invertebrates and the seedling recruitment close to the mother-plant. In the second chapter, the defaunation effect was evaluated, related to the agoutis’ abundance, on the removal and on the seed dispersal distance. The seed predation by invertebrates and the seedling and juvenile recruitment near the mother-plant were compared in five study sites with different agoutis`abundance. The principal hypothesis was that in areas with low agoutis’ abundance, the seed removal and the seedling recruitment were lower and the seed predation by invertebrates were higher. Besides agoutis (Dasyprocta spp.), spiny rats (Trynomis iheringi) and squirrels (Sciurus aestuans) were also responsible for the seed removal and acted more as seed dispersers than seed predators, during the five days of the experiment. The seed mass didn`t show relation with the seed removal by each of the animal species. Heavier seeds were carried to long distances, and the predated seeds were carried longer than the dispersed seeds. The most defaunated study site showed less seed removal, seed dispersal and seed predation. The proportion of seed predation by vertebrates was higher in study site with higher agoutis` abundance (Ilha Anchieta) and the proportion of intacts endocarps and predated by invertebrates were higher in the study site with less agoutis’ abundance (Xixová Japuí). The seedling recruitment near the mother plant didn`t show difference among the areas. The number of Astrocaryum aculeatissimum seedlings in the 0,8 hectares sampled in each area was higher at Ilha do Cardoso, where we have a high agoutis’ abundance and the smaller recruitment was found in Xixová Japuí, the more defaunated area. The study showed that the decrease in agoutis` population, decrease the Astrocaryum aculeatissimum seed removal, dispersal and predation and increase the seed predation by invertebrates, decreasing the seedling recruitment.