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Exploring the properties of the pure spinor b ghost /

Jusinskas, R. L., (Renann Lipinski) January 2014 (has links)
Orientador: Nathan Jacob Berkovits / Banca: Horatiu Nastase / Banca: Andrei Mikhailov / Banca: Victor de Oliveira Rivelles / Banca: Vladimir Perchin / Resumo: Esta tese é baseada em parte do meu trabalho de doutoramento e tem como objetivo apresentar uma análise detalhada de algumas propriedades recém abordadas do fantasma b composto no formalismo de espinores puros. Primeiramente será feita uma revisão dos formalismos mínimo e não-mínimo. Em seguida, será apresentada a construção do fantasma b passo a passo, inlcuindo correções quânticas. Por fim, serão estudadas em detalhes suas propriedades fundamentais, ue vão desde a nilpotência até a definição de um possível conjugado, o fantasma c / Abstract: This thesis is based in part of my work during the Ph.D. and aims to present a detailed analysis of some newly studied properties of the composite non-minimal pure spinor b ghost. First, a review of the minimal and non-minimal pure spinor formalisms will be presented. Then, the construction of the non-minimal b ghost will be done step-by-step, including quantum corrections. Finally, some of its fundamental properties will be studied i detail, ranging from nilpotency until the definition of a possible canonical conjugate, the c ghost / Doutor
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Expressão de genes de características agronômicas em Feijão-CAUPI

Citadin, Cristiane Teresinha 12 December 2011 (has links)
Tese(doutorado)—Universidade de Brasília, Departamento de Biologia Celular, Pós-Graduação em Biologia Molecular, 2011. / Submitted by Sabrina Silva de Macedo (sabrinamacedo@bce.unb.br) on 2012-07-03T15:45:44Z No. of bitstreams: 1 2011_CristianeTeresinhaCitadin.pdf: 2307833 bytes, checksum: 153d8486e61c946638efe8f3e173fc9b (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Ferreira de Souza(jaquefs.braz@gmail.com) on 2012-07-05T18:09:54Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_CristianeTeresinhaCitadin.pdf: 2307833 bytes, checksum: 153d8486e61c946638efe8f3e173fc9b (MD5) / Made available in DSpace on 2012-07-05T18:09:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_CristianeTeresinhaCitadin.pdf: 2307833 bytes, checksum: 153d8486e61c946638efe8f3e173fc9b (MD5) / O feijão-caupi (Vigna unguiculata L. Walp) é uma leguminosa de grande importância na alimentação humana, e tem sido alvo de melhoramento clássico por décadas, no entanto, algumas características, como resistência a estresses bióticos e teores de aminoácidos sulfurados em sementes, ainda não puderam ser incorporados. Nas últimas três décadas, uma série de tentativas foi realizada com intuito de desenvolver protocolos reprodutíveis na geração de feijão-caupi transgênico que permitam a expressão de genes de importância agronômica, especialmente aqueles que não foram incorporados pelo melhoramento clássico. No momento atual, vários pesquisadores têm estabelecido com sucesso procedimentos para transformação genética de feijão-caupi. Neste trabalho é relatada a obtenção de feijão-caupi transgênico resistente ao herbicida Imazapyr. Para isso, foram utilizados vetores contendo um cassete de expressão constitutivo da enzima AtAHAS. Estas plantas foram transformadas pela técnica de biobalística e um total de 16 linhagens transgênicas confirmadas por análises de Southern blot. Bioensaios para determinar a tolerância ao herbicida foram realizados usando diferentes concentrações de imazapyr. Algumas linhagens mostraram alta tolerância, sobrevivendo em até 400g/ha de imazapyr e não apresentando sintomas ao herbicida, demonstrando que o gene Atahas é capaz de gerar tolerância a herbicida a Imazapyr em feijão-caupi. Também é reportado neste trabalho, a introdução do gene de uma δ-zeína do milho (Zea mays) de 18 kDa (dzs18), que é rica em resíduos aminoácidos de metionina. Análises de Southern blot confirmaram a introdução do transgene no genoma da planta em múltiplos loci. No entanto, a segregação na progênie ficou próxima de uma razão de 1:1, sugerindo interferência na produção de gameta. Análises de expressão da proteína em sementes da única planta transgênica segregante foram negativas. Assim sendo, neste trabalho não foi possível analisar aumento dos níveis de metionina na semente. Não é possível concluir ainda o motivo da não expressão da δ-zeína em caupi, necessitando da geração de um número maior de eventos transgênicos segregantes. Dentre as plantas transformadas para expressar o gene dzs18, duas apresentaram fenótipo de esterilidade juntamente com multibrotação, multifloração e escasso número de folhas. Essas observações levaram a questionar se as mutações eram devido ao um efeito do transgene ou de mutagênese insercional, além de questionar que alterações nas flores poderiam estar levando ao fenótipo de esterilidade. Análises de Southern blot mostraram a presença de múltiplas cópias do transgene, aumentando as chances de que o fenótipo observado esteja relacionado com mutagênese insercional. Análise de polens e óvulos mostrou sérias alterações, além de indeiscência das anteras, explicando o fenótipo de esterilidade, concluindo tratar-se de alterações na maturação dos gametas. RT-PCR das folhas confirmou a presença de transcritos do transgene, sugerindo que as alterações podem estar relacionadas também com a expressão da δ-zeína. Os dados gerados não são capazes de confirmar se as mutações se devem ao transgene ou a mutagênese insercional, por isso mais análises precisam ser realizadas, incluindo a geração de mais eventos para esse transgene. Para isso também, bibliotecas de Genome walking foram confeccionadas para futura análise e correlação entre os lócus de inserção do transgene no genoma de feijão-caupi. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The cowpea (Vigna unguiculata L. Walp) is a legume of great importance for human nutrition. Some characteristics, such as resistance to biotic stress and levels of sulfur amino acids in seeds, have not yet been incorporated by the classical breeding. In the last three decades several attempts were made in order to develop reproducible protocols for generation of transgenic cowpea plants, allowing the expression of genes of agronomic importance. At the present, several researchers have successfully established procedures for genetic transformation of cowpea, presenting evidence of stable transgene integration, which segregated in a Mendelian fashion. In this work it is reported the obtaintion of transgenic cowpea lines resistant to the imidazolinone herbicide group. For this, we used vectors containing a cassette for the AtAHAS enzyme constitutive expression. These lines were transformed by the biolistic system and a total of 16 transgenic lines was confirmed by Southern blot analysis. Bioassays to determine the tolerance to herbicide was carried out using different concentrations of imazapyr. Some lines showed high tolerance, surviving to 400g/ha imazapyr and presenting no herbicide symptoms. Different levels of tolerance could not be associated to the integrity of the expression cassette. It is also reported in this paper, the introduction in cowpea of an 18 kDa δ-zein gene of maize (Zea mays), which is rich in methionine amino acid residues. Southern blot analysis confirmed the introduction of the transgene into the plant genome at multiple loci. However, the segregation in the progeny did not occurred as expected, being closed to a segregation ration of 1:1, suggesting interference with the production of gametes. Analysis of protein expression in transgenic seeds of single plant segregating was negative. Thus, was not possible to analyze increased levels of methionine in the seed. It is not yet possible to conclude the reason for the negative expression of δ-zein in cowpea, necessitating the generation more number of segregating transgenic events. Among the plants transformed to express the δ-zein gene, two of then showed a sterility phenotype with multiple formation of both shoots and flowers. In addition, a small number of leaves was also observed. These lines had multiple copies of the transgene integrated into the genome, as observed in the Southern blot analysis, increasing the chances that the observed phenotype is related to insertional mutagenesis. Analysis of pollen and ovules showed serious change, and indehiscence anthers, explaining the phenotype of sterility, concluding that it is changes in the gametes maturation. RT-PCR confirmed the presence of sheets of transcripts of the transgene, suggesting that the changes may also be related to the expression of δ-Zein. The data generated are not able to confirm if mutations are due to the transgene or insertional mutagenesis, so further analysis must be performed, including generation of more transgene events. Genome walking libraries were prepared for further analysis and correlation between the locus of insertion of the transgene in the genome of cowpea.
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Estudo físicoquímico da associação do inibidor de serinoproteases BTCI com fluido magnético

Xavier, Mary-Ann Elvina 16 May 2012 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, 2012. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2012-09-04T10:47:40Z No. of bitstreams: 1 MARY-ANN ELVINA XAVIER.pdf: 1811588 bytes, checksum: b6a72e0cbefad213d4d0806947b0b504 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2012-12-21T13:44:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 MARY-ANN ELVINA XAVIER.pdf: 1811588 bytes, checksum: b6a72e0cbefad213d4d0806947b0b504 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-12-21T13:44:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MARY-ANN ELVINA XAVIER.pdf: 1811588 bytes, checksum: b6a72e0cbefad213d4d0806947b0b504 (MD5) / Com o intuito de desenvolver novos materiais para tratamento do câncer, o objetivo deste trabalho foi associar dois componentes, sendo um com atividade anticarcinogênica comprovada: o BTCI e nanopartículas de maghemita recobertas por dextrana (MagDex) e caracterizar magnética e biofisicamente o complexo formado. A atividade antitumoral do BTCI foi comprovada contra células MCF-7 e essa molécula associada às nanopartículas biocompatíveis pode ser direcionada para um local sítio específico e lisar células tumorais no processo de magnetohipertermia. A caracterização do complexo foi feita pelos métodos: microscopia eletrônica de transmissão e de varredura, espalhamento de luz dinâmico (diâmetro hidrodinâmico, potencial zeta e polidispersividade), fluorescência (número de sítios e constante de associação), dicroismo circular, ensaios enzimáticos colorimétricos para avaliação da atividade inibitória do BTCI, birrefrigência magnética estática, ensaios de associação do inibidor. De acordo com análises de diâmetro hidrodinâmico, o BTCI complexou com as nanopartículas de MagDex. A constante de associação do complexo foi de 104 M-1 em pH 4,0 e 103 M-1 em pH 7,4 e pH 10,0. Segundo os parâmetros termodinâmicos, nessas três condições de pH, a associação do complexo foi espontânea, dirigida entropicamente com contribuições de associações hidrofóbicas e ligações de hidrogênio. A associação de BTCI a MagDex não alterou o conteúdo das estruturas secundárias, nem a atividade inibitória do BTCI complexado contra suas enzimas cognatas de forma expressiva. Adicionalmente, BTCI-MagDex manteve as características magnéticas de MagDex, como a maior resposta de susceptibilidade magnética a campos de (300 Oe), mesmo após diluições. O ensaio de sedimentação magnética sugere que 80% do BTCI associa às nanopartículas. Em conclusão, os resultados obtidos nesse trabalho sugerem que BTCI-MagDex apresenta características físico-químicas que favorecem a estabilidade e atividade do BTCI e a manutenção das propriedades magnéticas das nanopartículas, condição esta que é fundamental para estudos futuros que visem a aplicação desse sistema na terapia contra o câncer. / In order to develop new materials for the treatment of cancer, the objective was to associate two components, one with proven anticancer activity: the BTCI and maghemite nanoparticles coated with dextran (MagDex) and magnetic and biophysically characterize the complex formed. The antitumor activity of BTCI was proven against MCF-7 cells and this molecule associated with biocompatible nanoparticles can be targeted to a specific site location and kill tumor cells in the process of magnetohipertermia. The characterization of the complex was made by the methods: transmission electron microscopy and scanning electron microscopy, dynamic light scattering (hydrodynamic diameter, zeta potential and polydispersity), fluorescence (number of sites and association constant), circular dichroism, enzymatic colorimetric assays for assessment inhibitory activity of BTCI, static magnetic birefringence, tests of association of the inhibitor. According to analysis of hydrodynamic diameter, BTCI formed a complex with MagDex nanoparticles. The association constant of the complex was 104 M-1 at pH 4.0 and 103 M-1 at pH 7.4 and pH 10.0. According to the thermodynamic parameters, these three pH conditions, the association of the complex was spontaneous, entropically driven with contributions from hydrophobic associations and hydrogen bonding. The association of BTCI-MagDex did not alter the content of secondary structures, nor the inhibitory activity of the complexed BTCI against their cognate enzymes significantly. Additionally, BTCI-MagDex kept MagDex magnetic characteristics, such as susceptibility response to magnetic fields (300 Oe), even after dilution. The test of magnetic sedimentation suggests that 80% of BTCI associated with nanoparticles. In conclusion, the results suggest that BTCI-MagDex has physicochemical characteristics that favor the stability and activity of BTCI and maintenance of the magnetic properties of nanoparticles, a condition which is critical for future studies aimed at applying this system in therapy against cancer.
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Aplicações biotecnológicas em feijão-caupi [Vigna unguiculata (L.) Walp.] visando a obtenção de tolerância a estresses bióticos e abióticos

AZEVEDO, Hayana Millena de Arruda 23 August 2013 (has links)
Submitted by Fernanda Rodrigues de Lima (fernanda.rlima@ufpe.br) on 2018-08-01T22:32:58Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TESE Hayana Millena de Arruda Azevedo.pdf: 6064909 bytes, checksum: 10bd5990f9b0024b2cb4fac0db7716f6 (MD5) / Approved for entry into archive by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-08-03T18:37:26Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TESE Hayana Millena de Arruda Azevedo.pdf: 6064909 bytes, checksum: 10bd5990f9b0024b2cb4fac0db7716f6 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-03T18:37:26Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TESE Hayana Millena de Arruda Azevedo.pdf: 6064909 bytes, checksum: 10bd5990f9b0024b2cb4fac0db7716f6 (MD5) Previous issue date: 2013-08-23 / FACEPE / O feijão-caupi (Vigna unguiculata) vem aumentando gradativamente seu potencial produtivo. Contudo, a área colhida, a produção e a produtividade oscilam muito em virtude das variações climáticas, bem como os ataques de pragas e patógenos. Estudos moleculares aliados a ferramentas biotecnológicas, como a transgenia e a mutagênese, podem contribuir na redução dos problemas gerados pelos estresses. O presente trabalho teve como objetivo inserir um gene ligado à defesa na cultivar BRS Tumucumaque de feijão-caupi, conferindo-lhe maior tolerância a estresses bióticos. Para obtenção dos resultados, foi utilizada a metodologia de transferência direta de genes via Biobalística. Foram bombardeados cerca de 700 embriões e cinco exemplares (0,7%) passaram por todas as etapas da pressão de seleção, chegando à aclimatação. Uma vez aclimatadas, realizou-se a análise por PCR. Para confirmação da transformação foi feito uso do conjunto de primers pAHAS 124/pAHAS 500. Os primersforam utilizados para amplificar uma sequência de 624 pb e, em conjunto com a sequência codificante, cerca de 750 pb. Em um segundo momento, também objetivou-se gerar mutantes com características de tolerância a estresse salino, fazendo uso da mutagênese in vitro através de irradiação por raios gama sobre o desenvolvimento in vitro da cv. BR14-Mulato.Inicialmente, foi estabelecido um protocolo apropriado para pressão de seleção in vitro das sementes irradiadas, fazendo-se uso das concentrações de 172 mM, 258 mM, 344 mM e 0 mM, chegando-se, então, à conclusão de que a concentração de 172 mM seria a mais apropriada. Por fim, sementes foram irradiadas com três doses de radiação gama (100 Gy, 150 Gy e 200 Gy), além do material controle (0 Gy), e seus tecidos foram isolados e inoculados, simultaneamente, em meios de cultura com e sem sal. Como resultado, foi obtido um possível variante somaclonal advindo de material não irradiado e inoculado em meio não seletivo, sendo transferido, posteriormente, para meio contendo NaCl, sobrevivendo a este. Outro resultado de grande importância foi a obtenção de um provável mutante sólido provocado pela dose de 150 Gy que, inicialmente, formou calo embriogênico na ausência de NaCl, sendo posto sob pressão de seleção na etapa conseguinte. / Cowpea (Vigna unguiculata) is gradually increasing its productive potential. However, the harvested area, production and productivity of this crop oscillate due to climate changes, as well as attacks by pests and pathogens. Molecular studies aiming the isolation of genes combined with biotechnological tools, such as transgenesis and mutagenesis, can contribute effectively in reducing the problems caused by stress. The present work aimed to insert a defense gene in thecowpea cultivar BRS Tumucumaque,conferring increased tolerance to biotic stresses. To obtain these results, we used the methodology of direct gene transfer via biolistic. About 700 embryos were bombarded and five samples (0.7%) went through all the stages of selection pressure, reaching acclimation. Once acclimated, they were analyzed by PCR. For confirmation of the transformation a set of primers (AHAS124/pAHAS500) were used. In conjunction with the coding sequence, the pair showed a band of approximately 750 bp.In a second moment, was also aimed to generate mutants with characteristics of salt stress tolerance, making use of in vitro mutagenesis through gamma irradiation on the development in vitro of the cv. BR14-Mulato, from determining the minimum concentration of sodium chloride (NaCl) capable of inhibiting in vitro regeneration of tissues and subsequent choice of the radiation level capable of generating genetic variation.Initially, was established an appropriate protocol for selection pressure of the irradiated seeds, making use of concentrations of 172 mM, 258 mM, 344 mM and 0 mM, coming then to the conclusion that the concentration of 172 mM would be more appropriate. Finally, seeds were irradiated with three doses of gamma radiation (100 Gy, 150 Gy and 200 Gy), and their tissues were isolated and inoculated simultaneously in culture media with and without salt. As a result, were obtained a possible somaclonal variation arising from non-irradiated materials and inoculated onto non-selective medium, being transferred later to medium containing NaCl, surviving this. Another was the achievementof a mutant caused by the dose of 150 Gy, which originally formed embryogenic callus in the absence of NaCl and later placed under selection pressure in the next step.
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Efeitos da extrusão termoplastica sobre as propriedades tecnologicas e nutritivas das proteinas da farinha integral do feijão caupi (Vigna unguilata (L.) Walp)

Lira Filho, Joaquim Francisco de 03 April 2002 (has links)
Orientador: Yoon Kil Chang / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-07-31T19:30:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 LiraFilho_JoaquimFranciscode_D.pdf: 43785258 bytes, checksum: 256319a9b0f0eeb110c8456c97e3d8dc (MD5) Previous issue date: 2002 / Resumo: Foram estudados os efeitos da extrusão tennoplástica sobre as propriedades tecnológicas e nutritivas da farinha da semente do caupi (Vigna unguiculata (L) Walp) variedade EPACE-I0. As amostras de caupi foram obtidas junto ao Departamento de Fitotecnia da Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, Brasil. A farinha integral do caupi foi obtida do grão inteiro através do emprego dos moinhos de rolos e de disco. Antes da extrusão, água destilada foi adicionada à farinha por meio de agitação mecânica até se atingir valores préestabelecidos de umidade. Os ensaios de extrusão foram executados em um extrusor Brabender de parafuso único. As variáveis independentes estudadas foram: temperatura de processamento, velocidade do parafuso e umidade de partida da farinha. Os seguintes parâmetros de extrusão permaneceram inalterados: temperatura da primeira zona do extrusor (800 C), diâmetro da matriz (3 mm) e relação de compressão do parafuso (3:1). O teor de umidade das farinhas variou de 18 % a 28 %, a temperatura das segunda e terceira zonas do extrusor, de 1160C a 1840 C e a velocidade do parafuso de 106 a 174 r.p.m. O produto final foi naturalmente esfuado e em seguida moído e armazenado em recipientes de vidro à temperatura ambiente. Os efeitos das variáveis do processamento por extrusão sobre as propriedades tecnológicas e nutritivas da matéria-prima foram avaliados por Metodologia de Superficie de Resposta utilizando-se um modelo composto rotacional de três níveis. A análise estatística dos resultados foi processada usando-se o programa SAS@e mostrou que a velocidade do parafuso, para um nível de significância de 5 % (p :::;; 0,05), não afetou as propriedades dos extrusados. A mais importante variável independente de extrusão foi a temperatura, seguida da umidade. Esses dois parâmetros afetaram significativamente as propriedades tecnológicas e nutritivas da farinha da semente do caupi. Os resultados indicaram que a temperatura do processo afetou linearmente e quadraticamente a taxa de expansão, a dureza e a densidade dos produtos. A umidade da matéria-prima afetou quadraticamente a taxa de expansão. Extrusados que teriam uma dureza apropriada para produtos tipo "snack" foram obtidos com um teor de umidade da matéria-prima de 23% e a uma temperatura de processamento de 1500 C. Produtos extrusados sob essas condições tinham a maior expansão radial e mais baixa dureza, o teor protéico total da matéria-prima foi largamente preservado após o processo de extrusão. Com o aumento da severidade do tratamento térmico, alguns produtos apresentaram uma digestibilidade in vitro diminuída, e uma mais pronunciada perda de lisina disponível. Uma redução na temperatura de processamento e uma elevação no teor de água da matéria-prima, durante a extrusão, mostrou-se como a melhor maneira prática para melhorar as propriedades tecnológicas e nutritivas dos produtos. / Abstract: Effects of thermoplastic extrusion on the technological and nutritive properties of cowpea (Vigna unguiculata (L) Walp) seed flour variety EPACE-l Owere studied. Samples of cowpea were obtained at the Phytotechny Department of the Federal University of Ceará, Fortaleza, Brazil. Cowpea flour was obtained by the whole seeds using roller and disk mill. Before extrusion, distilled water was added to the flour to reach a pre-determined moisture values, with mechanical agitation. Extrusion experiments were perfonned in a Brabender single-screw cookingforming extruder. The independent variables examined were: process temperature, screw speed, and starting moisture content. The following extrusion parameters remained constant: temperature of first zone (800 C), diameter of die (3 mm), and screw compression ratio (3:1). Flour moisture contents varied between 18 % and 28 %, second and third zones temperature of the extruder between 1160C and 1840C, and screw speed between 106 and 174 rpm. The end product was naturally cooled, then ground and stored in glass recipients at ambient temperature. The effects of extrusion processing variables on the technological and nutritive properties of raw material was evaluated by Response Surface Methodology (RSM) utilizing a rotatable three leveI composite designoThe statistical analysis of the results was processed using the software SAS@and shows that the screw speed, at the 5 % leveI of significance (p S 0,05) does not affected the extrudate properties. The most important independent variable of extrusion was temperature, followed by moisture. These two parameters significantly affected technological and nutritive properties of cowpea seed flour. Results indicated that process temperature linearly and quadratically affected expansion ratio, texture, and bulk density products. Feed moisture quadratically affected expansion ratio. Extrudates that would have suitable texture for snack products were produced at 23% initial moisture content and 1500 C processing temperature. Products extruded under these conditions had the greater radial expansion and lower texture. Total protein content of the raw material was widely preserved after the extrusion process. With increasing severity of heat treatment, some products presented an in vitro digestibility decreased, and a more pronounced loss of available lysine. A decrease in the processing temperature and an increase in the raw material water content, during extrusion, appears as the best practical way to improve both technological and nutritive properties of the products. / Doutorado / Doutor em Ciência de Alimentos
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Comparação entre a absorção de vicilinas de sementes suscetíveis e resistentes do feijão-de-corda, vigna unguiculata pelo epitélio intestinal de larvas do caruncho callosobruchus maculatus e o processamento de vicilinas no corpo gorduroso após absorção

Oliveira, Gabriel Braga 05 December 2013 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Bioquímica, Florianópolis, 2013 / Made available in DSpace on 2013-12-05T23:44:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 318592.pdf: 7780213 bytes, checksum: df174715f61701c67a6b2e8d1f2520d7 (MD5) / Os animais pertencentes à subfamília Bruchinae são os principais predadores das sementes de leguminosas, destacando-se pela restrição na dieta alimentar ocorrendo especificidade ao nível de gênero ou família. O caruncho do feijão-de-corda (Callosobruchus maculatus) é o maior predador de sementes de Vigna unguiculata (feijão-de-corda) tanto no campo quanto de grãos armazenados. O feijão-de-corda apresenta em sua composição uma família de proteínas multifuncionais chamadas de vicilinas (globulina 7S), possuindo uma massa molecular de aproximadamente 190 kDa. Vicilinas variantes expressas em sementes de V. unguiculata vem sendo associadas diretamente aos efeitos tóxicos causados nas larvas dos bruchideos. Aqui relata-se o valor adaptativo envolvido na absorção das vicilinas e o mecanismo da resistência associado ao C. maculatus. O genótipo (IT81D-1053) de V. unguiculata mostrou-se resistente ao bruchideo (C. maculatus), não havendo emergência de adultos no período de 90 dias, enquanto sementes suscetíveis (fradinho) apresentaram emergência média de 36,42±0,59 dias. O destino das vicilinas foi acompanhado por microscopia de fluorescência, através de cortes por congelamento (criostato), ao alimentaram-se as larvas do bruchideo com vicilina suscetível/FITC, vicilina variante/FITC e com faseolina/FITC (Phaseolus vulgaris) notando-se diferença no processo absortivo entre as dietas testadas. O epitélio intestinal das larvas alimentadas com vicilina variante/FITC e faseolina/FITC apresentou por fluorescência maior quantidade de vicilina. Por microscopia eletrônica foi possível verificar a presença da proteína suscetível (fradinho) no interior das células do epitélio intestinal das larvas de C. maculatus. Evidenciando que as vicilinas se ligam aos receptores na membrana das microvilosidades e posteriormente, são absorvidas em forma de vesículas no interior das células epiteliais do intestino médio das larvas, sendo possivelmente, mediado por processo de endocitose. As moléculas de vicilinas nas vesículas formadas no epitélio intestinal são encaminhadas ao corpo gorduroso das larvas, onde foram isoladas por ultracentrifugação em gradiente descontínuo de sacarose. Essas foram caracterizadas parcialmente com a utilização do substrato vicilina 0,1% (m/m) juntamente com os inibidores EDTA (ácido etileno diamino tetra acético), pepstatina A, PMSF (fluoreto de fenilmetilsulfonil) e E-64 (trans-epoxisuccinil 4-guanidino butano), onde a Pespatina A e PMSF inibiram o processamento da vicilina, sugerindo há uma combinação de enzimas, possivelmente proteinases serínicas e aspárticas, atuando na hidrólise da vicilina, porém não foi possível identificar qual classe mecanística é responsável pelo início do processo <br> / Abstract: The animals of the Bruchinae subfamily are the main predators of legume seeds, which are distinguished by the food diet restriction, occurring specificity on genus or family level. The cowpea beetle (Callosobruchus maculatus) is the main predator of the Vigna unguiculata seeds (cowpea) in the field and stored grains. These beans present in their composition a family of multifunctional proteins called vicilins (7S globulin), with around 190 kDa as molecular weight. Variant vicilins expressed in the seeds of V. unguiculata have been directly associated to the toxic effects caused in bruchid larvae. Here we report the adaptive value involved in the uptake of vicilin and resistance mechanisms associated with C. maculatus. The genotype (IT81D-1053) of V. unguiculata was resistant to bruchid (C. maculatus) without adult emergence in a period of 90 days, while susceptible seeds (fradinho) presented emergency of 36.42 ± 0.59 days on average. The fate of vicilin was followed by fluorescence microscopy, cutting the gel (cryostate), where bruchid the larvae are fed with vicilin susceptible/FITC, vicilin variant/FITC and phaseolin/FITC (from Phaseolus vulgaris) noticing the difference in the absorptive process. The intestinal epithelium of larvae fed on vicilin variant / FITC and phaseolin / FITC fluorescence showed a greater amount of vicilin. By using electron microscopy, it was possible to verify the presence of the susceptible vicilin (fradinho) in the cells of the intestinal epithelium of larval C. maculatus. Vicilins seem to bind to receptors in the membrane of the microvilli and subsequently are absorbed in the form of vesicles inside the cells of the epithelium of the gut of the larvae, and optionally mediated endocytosis. The vicilin molecules present in the vesicles formed in the intestinal epithelium are transferred to the fat body larvae, where they could be isolated by discontinuous sucrose gradient after ultracentrifugation. They were partially characterized using 0.1% (w / w) vicilin as the substrate in the presence or not of following inhibitors EDTA (ethylene diamine tetra acetic acid), pepstatin A, PMSF (phenylmethylsulfonyl fluoride) and E-64 (trans epoxisuccinil -4 guanidino-butane), wherein pepstatin A and PMSF inhibited the processing of vicilin, suggesting that it is a combination of enzymes, perhaps aspartic and serine proteinases, acting on the hydrolysis of vicilin. However, it was not possible to identify the mechanistic class which is responsible for initiating the process.
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Fundamental Attacks on Ethereum Oracles and How to Prevent Them

Jafari, Mikael January 2023 (has links)
Many applications and protocols on blockchain platforms are reliant on real-world data which exists outside the blockchain, something which is not directly accessible through these platforms. To bridge this gap, blockchain oracles help these applications and protocols by providing them with this data. As different data used by these applications and protocols can result in different outcomes occurring, one way for attackers to attack these applications and protocols is to attack the oracles they rely on. This thesis investigates what types of fundamental attacks are possible on oracles hosted on Ethereum, potential ways to protect against them and how these attacks can be categorized. It also investigates if the different attributes of Solana or Corda provides any protection against these attacks in some way. In order to answer these questions, the different blockchain platforms are researched and investigated, along with different oracles and attacks on oracles. A framework which describes the different states data in a oracle can be in was also created in order to help find attacks. In total, eleven different fundamental attacks on Ethereum oracles were found along with different methods to protect against them. A majority of these attacks were deemed to be able to be done in full capability by both independent and nation-state attackers. Both Solana and Corda were found to provide some inherent protection against some of these attacks. Solana was found to be able to almost fully eliminate one type of attack due to its execution environment. Corda was found to make many of the found attacks harder to execute for an attacker, mainly due to its lack of anonymity. / Många applikationer och protokoll på blockkedje-plattformar är beroende av verklig data som existerar utanför blockkedjan, något som inte är direkt nåbart genom dessa plattformar. I syfte att göra denna data nåbar, så hjälper orakel på blockkedjor dessa applikationer och protokoll genom att tillhandahålla dem denna data. Eftersom dessa applikationer och protokoll kan ha olika utfall beroende på vilken data de använder sig av, så är en metod att attackera dem genom att attackera dem orakel som de använder sig av. Denna avhandling undersöker vilka typer av fundamentala attacker som är möjliga mot orakel som körs på Ethereum, potentiella sätt att skydda mot attackerna samt hur dessa attacker kan kategoriseras. Den undersöker även ifall de olika attributen som finns hos Solana eller Corda ger något skydd mot dessa attacker på något sätt. För att besvara dessa frågor har de olika blockkedjeplattformarna undersökts. Även olika orakel samt attacker mot orakel har undersökts. Ett ramverk som beskriver de olika tillstånden som data i ett orakel kan befinna sig i skapades med syfte att underlätta hittandet av attacker. Totalt så hittades elva olika fundamentala attacker mot orakel som körs på Ethereum tillsammans med tillhörande skyddsmetoder. Majoriteten av dessa attacker bedömdes kunna genomföras i full förmåga av både självständiga angripare samt nationssponsrade angripare. Både Solana och Corda visade sig ge skydd mot vissa av de elva attackerna genom sina attribut. Solana kan genom sin exekveringsmiljö nästan helt eliminera möjligheten av en av attackerna. Corda visade sig göra flera av de olika attackerna svårare att genomföra för angripare, främst på grund av sin avsaknad av anonymitet i plattformen.
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Efeitos de genótipos de feijão caupi e de espécies botânicas em diferentes formulações sobre Callosobruchus maculatus (FABR.) /

Castro, Maria de Jesus Passos de, 1977- January 2013 (has links)
Orientador: Edson Luiz Lopes Baldin / Coorientador: Carlos Frederico Wilcken / Banca: José Djair Vendramim / Banca: Carlos Gilberto Raetano / Banca: Wagner Antonio Bernardes / Banca: André Luiz Lourenção / Resumo: O caruncho Callosobruchus maculatus (Fabr.) (Coleoptera: Chrysomelidae: Bruchinae) é considerado a principal praga durante o armazenamento de grãos de feijão-caupi, Vigna unguiculata (L.) Walp. Devido à necessidade de desenvolvimento de estratégias de controle mais eficientes e menos agressivas ao meio ambiente, o uso de genótipos resistentes e/ou produtos provenientes de plantas surgem como alternativas bastante promissoras. Neste trabalho avaliou-se o efeito isolado e associado de genótipos de feijão-caupi e de espécies vegetais (pó, sachê e óleo essencial) sobre o comportamento e biologia de C. maculatus. Inicialmente, foi realizado um teste preliminar com 50 genótipos de feijão-caupi, avaliando-se a preferência para oviposição e o desenvolvimento do caruncho. Foram selecionados nove genótipos, que foram novamente avaliados quanto à oviposição (com e sem chance de escolha) e biologia do inseto. Posteriormente, avaliou-se o efeito de 14 plantas nas formulações pó (aplicado puro e dentro de sachês) e óleo essencial (extraído da planta fresca e da planta desidratada) sobre a atratividade, oviposição e mortalidade dos insetos adultos. Com base nestes resultados, foram selecionados três genótipos (dois resistentes e um suscetível) e seis espécies vegetais na forma de óleo essencial extraído da planta fresca, para os quais foi avaliado o efeito associado sobre a atratividade e mortalidade dos adultos, preferência para oviposição e biologia do inseto. Os genótipos IT85 F-2687, MNC-510-8 e MN05-841 B-49 foram caracterizados como portadores de resistência do tipo não-preferência para oviposição e o IT81 D-1045 Ereto como portador de antibiose contra C. maculatus; opostamente, BRS-Urubuquara foi caracterizado como suscetível. As espécies vegetais Lippia sidoides Cham., Vitex agnus castus L., Mansoa alliacea... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The cowpea weevil Callosobruchus maculatus (Fabr.) (Coleoptera: Chrysomelidae: Bruchinae) has been described as the most important post-harvest storage pest of Vigna unguiculata (L.) Walp. Due to the need of development of more efficient and less harmful strategies for controlling this pest, the use of resistant genotypes and/or botanical products emerges as a very promising alternative. This study evaluated the isolated and associated effects of cowpea genotypes and plant species (powder, sachet and essential oil) on the behavior and biology of C. maculatus. Initially, 50 cowpea genotypes were evaluated for oviposition preference and its effects on the weevil development. Nine selected cowpea genotypes were again evaluated for oviposition (free and no-choice tests) and insect biology. Next, the effect of fourteen plants as powder formulations (mixed with de grains and within sachets) and essential oil (from fresh plant and dried plant) were evaluated on attractiveness, mortality and oviposition. Based on these results, three genotypes (two resistant and one susceptible) and six plant species as essential oil extracted from fresh plant were chosen for assessment of the associated effect on the attractiveness and adults mortality, oviposition preference and insect biology. The genotypes IT85 F-2687, MNC-510-8 e MN05-841 B-49 were characterized as having resistance of nonpreference for oviposition and IT81 D-1045 Ereto expressing antibiosis to C. maculatus. On the other hand, the genotype BRS-Urubuquara was the most susceptible. The plant species Lippia sidoides Cham., Vitex agnus castus L., Mansoa alliacea (Lam.) A. Gentry and Chenopodium ambrosioides L. caused high levels of insect mortality, reduced and/or prevented oviposition and emergence, while Piper marginatum Jacq. and Piper callosum Ruiz & Pav., besides reducing... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Efeitos de genótipos de feijão caupi e de espécies botânicas em diferentes formulações sobre Callosobruchus maculatus (FABR.)

Castro, Maria de Jesus Passos de [UNESP] 21 March 2013 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:01Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-03-21Bitstream added on 2014-06-13T19:24:12Z : No. of bitstreams: 1 castro_mjp_dr_botfca.pdf: 2188458 bytes, checksum: 7494bc21723d9ff5f6eed9c3fbda18be (MD5) / O caruncho Callosobruchus maculatus (Fabr.) (Coleoptera: Chrysomelidae: Bruchinae) é considerado a principal praga durante o armazenamento de grãos de feijão-caupi, Vigna unguiculata (L.) Walp. Devido à necessidade de desenvolvimento de estratégias de controle mais eficientes e menos agressivas ao meio ambiente, o uso de genótipos resistentes e/ou produtos provenientes de plantas surgem como alternativas bastante promissoras. Neste trabalho avaliou-se o efeito isolado e associado de genótipos de feijão-caupi e de espécies vegetais (pó, sachê e óleo essencial) sobre o comportamento e biologia de C. maculatus. Inicialmente, foi realizado um teste preliminar com 50 genótipos de feijão-caupi, avaliando-se a preferência para oviposição e o desenvolvimento do caruncho. Foram selecionados nove genótipos, que foram novamente avaliados quanto à oviposição (com e sem chance de escolha) e biologia do inseto. Posteriormente, avaliou-se o efeito de 14 plantas nas formulações pó (aplicado puro e dentro de sachês) e óleo essencial (extraído da planta fresca e da planta desidratada) sobre a atratividade, oviposição e mortalidade dos insetos adultos. Com base nestes resultados, foram selecionados três genótipos (dois resistentes e um suscetível) e seis espécies vegetais na forma de óleo essencial extraído da planta fresca, para os quais foi avaliado o efeito associado sobre a atratividade e mortalidade dos adultos, preferência para oviposição e biologia do inseto. Os genótipos IT85 F-2687, MNC-510-8 e MN05-841 B-49 foram caracterizados como portadores de resistência do tipo não-preferência para oviposição e o IT81 D-1045 Ereto como portador de antibiose contra C. maculatus; opostamente, BRS-Urubuquara foi caracterizado como suscetível. As espécies vegetais Lippia sidoides Cham., Vitex agnus castus L., Mansoa alliacea... / The cowpea weevil Callosobruchus maculatus (Fabr.) (Coleoptera: Chrysomelidae: Bruchinae) has been described as the most important post-harvest storage pest of Vigna unguiculata (L.) Walp. Due to the need of development of more efficient and less harmful strategies for controlling this pest, the use of resistant genotypes and/or botanical products emerges as a very promising alternative. This study evaluated the isolated and associated effects of cowpea genotypes and plant species (powder, sachet and essential oil) on the behavior and biology of C. maculatus. Initially, 50 cowpea genotypes were evaluated for oviposition preference and its effects on the weevil development. Nine selected cowpea genotypes were again evaluated for oviposition (free and no-choice tests) and insect biology. Next, the effect of fourteen plants as powder formulations (mixed with de grains and within sachets) and essential oil (from fresh plant and dried plant) were evaluated on attractiveness, mortality and oviposition. Based on these results, three genotypes (two resistant and one susceptible) and six plant species as essential oil extracted from fresh plant were chosen for assessment of the associated effect on the attractiveness and adults mortality, oviposition preference and insect biology. The genotypes IT85 F-2687, MNC-510-8 e MN05-841 B-49 were characterized as having resistance of nonpreference for oviposition and IT81 D-1045 Ereto expressing antibiosis to C. maculatus. On the other hand, the genotype BRS-Urubuquara was the most susceptible. The plant species Lippia sidoides Cham., Vitex agnus castus L., Mansoa alliacea (Lam.) A. Gentry and Chenopodium ambrosioides L. caused high levels of insect mortality, reduced and/or prevented oviposition and emergence, while Piper marginatum Jacq. and Piper callosum Ruiz & Pav., besides reducing... (Complete abstract click electronic access below)
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O mecanismo atrator e a função entropia de Sen para buracos negros /

Santos, Prieslei Estefânio Dominik Goulart. January 2013 (has links)
Orientador: Horatiu Stefan Nastase / Banca: Rogério Rosenfeld / Banca: Victor Rivelles / Resumo: Nesta dissertação estudamos o mecanismo atrator e a função entropia para buracos negros. Depois de revisarmos alguns aspectos de Relatividade Geral e buracos negros do tipo Schwarzschild, Reissner-Nordstrom e Kerr-Neumann demonstraremos detalhadamente como são deduzidas a lei zero e a primeira lei das chamadas Leis da Termodinâmica de Buracos Negros. Apresentaremos também a segunda e a terceira destas leis e discutiremos a relação entre as Leis da Termodinâmica e as Leis da Termodinâmica de Buracos Negros. Após isso, apresentaremos um exemplo para demonstrar como ocorre o chamado fenômeno atrator, que faz com que todos os campos escalares admitam o mesmo valor sobre o horizonte de eventos do buraco negro, fazendo-os então perder toda a memória de suas condições iniciais no infinito. Finalmente, apresentaremos a dedução da chamada função entropia de Sen, e demonstraremos sua importância no que se refere ao estudo dos campos escalares de um buraco negro para a geometria próxima ao horizonte de eventos, ou seja, para o mecanismo atrator. Demonstraremos a validade deste formalismo através da solução de Reissner-Nordstrom usual em 4 dimensões e de uma teoria correspondendo à parte bosônica de uma ação da supergravidade à baixas energias / Abstract: In this Master Thesis we study the attracto rmechanism and the entrop yfunction for black holes. After reviewing some aspects of General Relativity and black holes solutions of the Schwarzschild, Reissner-Nordstrom and Kerr-Newmann type, we give a detailed derivation of the zeroth and first of the so-called Laws of Black Hole Thermodynamics. We will also present the second and third laws and discuss the relation between The Laws of Thermodynamics and The Laws of Black Hole Thermodynamics. Then we will present an example of how the so-called attractor phenomena occurs, which makes all the scalar fields assume the same value on the black hole event horizon, forcing them to lose all the memory of their initial conditions at the infinity. Finally, we will present the derivation of the so-called Sen's entropy function, and we will show its importance concerning the study of scalar fields of a black hole for the near horizon geometry, or in other words, for the attractor mechanism. We will show the validity of this formalism through the usual Reissner-Nordstrom solution in 4 dimensions and a theory corresponding to the bosonic part of a low energy supergravity action / Mestre

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