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Distribuição e ocorrência de aranhas de sub-bosque de quatro ambientes florestais no planalto do Rio Grande do Sul, BrasilBaldissera, Ronei January 2005 (has links)
Este trabalho teve como objetivo geral avaliar a riqueza, abundância e composição das assembléias de aranhas de sub-bosque em quatro ambientes florestais na FLONA de São Francisco de Paula, RS, Brasil. Essa reserva está situada no planalto do Rio Grande do Sul e, desde sua criação, explora madeira para corte. O tipo de manejo empregado é o de longo tempo de rotação dos talhões, com corte seletivo. A área se caracteriza como um mosaico da paisagem formado de quatro ambientes florestais: floresta ombrófila, plantação de araucária, plantação de Pinus e plantação de Eucalyptus. Essas diferenças na estrutura da paisagem poderiam se traduzir em diferenças na estrutura da vegetação, o que pode influenciar a distribuição e ocorrência das assembléias de aranhas na área. Portanto, os objetivos específicos desta pesquisa foram 1) comparar a estrutura das assembléias de aranhas de sub-bosque entre os diferentes ambientes e entre os talhões, assim como inferir possíveis processos que poderiam estar influenciando os padrões encontrados, 2) avaliar como características da estrutura da vegetação nos diferentes ambientes influenciam o padrão de distribuição encontrado e 3) verificar as respostas da abundância, riqueza e composição das assembléias de aranhas são diferentes levando-se em conta diferentes níveis taxonômicos. As aranhas presentes na vegetação entre 1 e 2,5 m de altura foram coletadas pelo método guarda-chuva entomológico em duas unidades amostrais (25 m 2 m) aleatorizadas dentro de cada um de três talhões de cada tipo florestal, em seis ocasiões durante 2003 e 2004. Todos indivíduos foram identificados em nível de família e os adultos em nível de gênero e espécie. A cobertura vegetal foi estimada através de 50 medidas dos toques da vegetação em uma vara de 2,5 m de altura dentro de cada unidade amostral no inverno e no verão de 2003. Os toques da vegetação foram separados em árvores, arbustos, lianas, pteridófitas e gramíneas. Foram coletadas um total de 8440 aranhas, divididas em sete guildas, 29 famílias, 80 gêneros e 132 espécies. A área de plantação de Eucalyptus apresentou a menor abundância de aranhas de sub-bosque em relação aos outros ambientes para a abordagem em nível de famílias, mas a plantação de Eucalyptus foi diferente somente da plantação de Pinus para a abordagem em nível de espécie. A abundância das aranhas de sub-bosque foi a característica estrutural que mais diferiu entre os diferentes tipos ambientais durante todo estudo. Os resultados, porém, foram influenciados pela abordagem taxonômica. A diversidade de aranhas de sub-bosque não apresentou diferenças entre os ambientes, porém, houve diferença entre talhões apenas em uma estação do ano para os níveis de gênero e espécie. A abundância de aranhas de sub-bosque teve correlação positiva com a idade dos talhões. A composição das assembléias de aranhas de sub-bosque teve maior relação com as características inter-talhões do que inter-ambientes, e os tipos de vegetação influenciaram na composição das famílias de aranhas. Além disso, a abordagem taxonômica alterou os padrões de agrupamento das assembléias. Processos locais como limitação de recursos para estabelecimento e ao crescimento das populações em nível local parecem estar atuando na estruturação das assembléias de aranhas de sub-bosque nessa área. Concluiu-se que o tipo de manejo empregado (longa rotação) na área para exploração de madeira não afeta negativamente a diversidade de aranhas do sub-bosque, provavelmente por que há o desenvolvimento de estruturas da vegetação do sub-bosque que proporcionam condições para a ocorrência e o estabelecimento das assembléias de aranhas nesse local.
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Genoma e diversidade genética de populações de Chrysodeixis includens nucleopolyhedrovirus (ChinNPV)Craveiro, Saluana Rocha 08 April 2016 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular, 2016. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2016-09-26T20:04:04Z
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2016_SaluanaRochaCraveiro.pdf: 3241510 bytes, checksum: 02323233a9f77526e278dded20e15f95 (MD5) / Chrysodeixis includens nucleopolyhedrovirus (ChinNPV) é um vírus patogênico à lagarta falsa-medideira, Chrysodeixis includens (Walker, 1858), uma praga polífaga que ataca 174 plantas hospedeiras, incluindo soja e algodão. Os baculovírus formam um grande grupo de vírus de DNA fita dupla circular, que infectam insetos da ordem Lepidoptera, Hymenoptera e Diptera. Para uma melhor compreensão da virulência, evolução e biologia molecular de ChinNPV, este trabalho teve como objetivo determinar a sequência completa do genoma e a diversidade genética de sete isolados de ChinNPV (IA a IG). A diversidade genética foi inicialmente investigada por meio de análise das variações presentes nos core genes pif-2, lef- 9 e helicase de isolados de ChinNPV e de outros Alphabaculovirus. O gene pif-2 de ChinNPV recebeu destaque por, em contraste com o esperado, apresentar um grande número de polimorfismos não-sinônimos com a identificação de dois sítios sob pressão diversificadora. Os genomas dos isolados de ChinNPV (IA a IG) possuem tamanho variando de 138.869 a 140.859 bp e conteúdo de CG ~ 39%. Um total de 142 ORFs foram identificadas incluindo 37 core genes, 102 genes encontrados em outros baculovírus, 3 genes bro e duas ORFs únicas (Psin5 e Psin8). Homologous repeats (hrs), típicas de baculovírus, estão ausentes no genoma de ChinNPV. Os genomas dos isolados de ChinNPV têm alta similaridade com identidade mínima de 96,4% e, polimorfismos, indels e pequenos fragmentos foram observados ao longo dos genomas. Dois homólogos ao gene p26 (p26a e p26b) foram encontrados em ChinNPV. O padrão de agrupamento observado no cladograma da proteína P26 de NPVs indica que a aquisição do gene ocorreu em três eventos independentes de captura dentro da família Baculoviridae. ChinNPV tem uma sequência genômica distinta comparada a outros baculovírus sequenciados. As sete novas sequências do genoma completo de ChinNPV determinadas aqui constituem uma importante ferramenta para o melhor entendimento dos fatores de virulência, interação inseto-hospedeiro e da variação fenotípica observada em populações de baculovírus. _________________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Chrysodeixis includens nucleopolyhedrovirus (ChinNPV) is a virus pathogenic to the soybean looper, Chrysodeixis includens (Walker, 1858), a polyphagous pest that attacks 174 host plants including soybean and cotton. Baculoviruses are a large group of circular doublestranded DNA viruses that infect insects of the orders Lepidoptera, Hymenoptera and Diptera. In order to better understanding the virulence, evolution and molecular biology of ChinNPV, this study aimed to determine the complete genome sequence and genetic diversity of seven ChinNPV (IA to IG) isolates. Genetic diversity was initially investigated by analyzing variation present in the pif-2, lef-9 and helicase core genes in ChinNPV and other Alphabaculovirus isolates. The pif-2 gene unexpectedly showed a large number of non-synonymous polymorphisms with two sites identified to be under diversifying selection. The ChinNPV (IA to IG) genomes range in length between 138,869 and 140,859 bp and GC content of ~39% A total of 142 ORFs were identified including 37 baculovirus core genes, 102 genes found in other baculoviruses, three bro genes and two ORFs unique to ChinNPV (Psin5 and Psin8). The typical baculoviral homologous repeats (hrs) are absent in the ChinNPV genome. The ChinNPV genomes have high similarity with minimal identity of 96.4% and polymorphisms, indels and small fragment insertions throughout the genome were observed. Two p26 gene homologs (p26a and p26b) were found in the ChinNPV genome. The clustering pattern seen in the cladogram of NPV P26 protein indicates that the acquisition of these genes occurred in three independent capture events within the family Baculoviridae. ChinNPV has a distinct genomic sequence compared to other baculoviruses sequenced so far. The seven new ChinNPV whole genome sequences determined herein constitute an important tool for a better understanding of virulence factors, insect-host interaction and phenotypic variation observed in baculovirus populations.
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Conservação da agrobiodiversidade : valor econômico das decisões de produtores ruraisOlsen, Leandro Borges 16 October 2014 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Economia, Administração e Contabilidade, Departamento de Economia, 2014. / Submitted by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2015-10-27T16:09:03Z
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2014_LeandroBorgesOlsen.pdf: 1143523 bytes, checksum: 9e424e16fc7b9457a5458e27cdb85642 (MD5) / O objetivo deste trabalho foi investigar a potencial utilidade dos métodos de valoração econômica do meio ambiente para mensuração econômica de recursos da agrobiodiversidade cultivados em estabelecimentos rurais cuja conservação depende das decisões de seus gestores (posseiros, parceiros, arrendatários ou proprietários). Para tanto foi feita a análise da aplicabilidade desses métodos na estimativa do valor monetário da conservação da diversidade biológica no estabelecimento rural – conservation on farm – em três trabalhos acadêmicos que tratam de recursos da agrobiodiversidade. No âmbito dos modos de conservação da biodiversidade, encontram-se as alternativas, complementares entre si, a ex situ e a in situ. Essa última por sua vez pode ser subdividida em áreas protegidas e terrenos privados – esses últimos envolvem a conservação on farm. Foi possível concluir a viabilidade dos métodos de valoração econômica do meio ambiente para a estimativa do valor monetário da conservação da diversidade biológica on farm, bem como seu potencial de uso para mensurar os recursos da agrobiodiversidade cultivados em estabelecimentos rurais. Entre os métodos sugeridos, o de Valoração Contingente e o de Custo de Oportunidade se adequaram a todos os casos analisados. Existem poucas publicações científicas que tratam da análise econômica das decisões dos produtores rurais nesta temática, em especial com uso de método empírico. Os resultados da aplicação da valoração econômica, portanto, são subsídios para compreender e colaborar com a tomada de decisão dos produtores de forma a reduzir os custos e maximizar os lucros de suas escolhas, além de servirem de orientação para gestores na condução de políticas de conservação de recursos naturais. ______________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The objective of this study was to investigate the usefulness of economic valuation methods to evaluate befefits of cultivated agricultural biodiversity resources in farms. Conservation depends on the decisions of its managers (squatters, partners, tenants or owners). Therefore, we analised the application of economic valuation methods of the environment to estimate the monetary value of the conservation on farm. We aplly those methods to three academic papers dealing with agro-biodiversity resources. Biodiversity conservation types alternatives, complementary to each other, are the ex situ and in situ. The latter in turn can be subdivided into conservation in protected and private land areas - which involve conservation on farm. Our conclusion emphasizes the viability of economic valuation methods of the environment to estimate the monetary value of the conservation of biological diversity on farm and the potential use of measuring the resource of the agrobiodiversity grown on farms. Among the suggested methods, the Contingent Valuation and the Opportunity Cost are suited to all cases analyzed. There are few scientific publications dealing with the economic analysis of the decisions of farmers in this subject, in particular with the use of valuation methods. The results of the application of economic valuation are therefore subsidies to understand and to cooperate with the decision making of producers in order to reduce costs and maximize profits of their choice, as well as serving as a guide for managers in conducting conservation policies of natural resources.
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Diversidade genômica de begomovírus em tomateiros resistente (BRS SENA) e susceptível (H-9553)Rêgo, Camila de Moraes 19 February 2016 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2016. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2016-04-18T17:27:04Z
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Faça o uplod do arquivo desbloqueado. on 2016-04-18T20:15:02Z (GMT) / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2016-04-18T20:18:32Z
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2016_CamiladeMoraesRêgo.unlocked.pdf: 1287996 bytes, checksum: e3b9fd59779f32102638d15e8f57b636 (MD5) / O tomateiro (Solanum lycopersicum) é uma das principais hortaliças cultivadas no mundo. Entre as doenças que ocorrem nesta cultura, as viroses destacam-se pela dificuldade do seu controle. A begomovirose é uma das principais doenças virais do tomateiro, com alta incidência nas áreas produtoras do país. O uso de plantas resistentes é a estratégia mais eficiente e de baixo custo para minimizar as perdas causadas pelos begomovírus. Contudo, o crescente plantio de cultivares com resistência pode resultar na seleção de isolados virais específicos, acelerar a alteração da composição populacional dos begomovírus e culminar na quebra da resistência. Como ainda não há informações se essa seleção realmente ocorre nas condições brasileiras, este trabalho foi desenvolvido objetivando analisar e comparar as espécies de begomovírus presentes em amostras de tomateiro rasteiro das cultivares Heinz-9553 (suscetível a begomovirose) e BRS Sena (resistente a begomovirose) coletadas em Luziânia-GO, além de avaliar a diversidade genômica dentro de cada espécie encontrada. Verificou-se que nas plantas de BRS Sena a severidade da doença é menor e os sintomas são pouco evidentes. A diversidade de begomovírus nas amostras foi incialmente analisada através da técnica de RCA/RFLP e os resultados obtidos foram confirmados por PCR específica e clonagem. Duas espécies de begomovírus foram detectadas em ambas as cultivares estudadas, Tomato severe rugose virus (ToSRV) e Tomato mottle leaf curl virus (ToMoLCV), sendo ToSRV a mais predominante. Comparações entre as sequências mostraram que isolados virais (ToSRV ou ToMoLCV) obtidos de uma mesma planta são mais próximos, enquanto que isolados obtidos de cultivares diferentes são mais distantes. Nos dados de variação genética, avaliados pela ocorrência de mutações nos isolados de cada espécie, constatou-se a presença de inserções e deleções de nucleotídeos apenas em regiões intergênicas/não-codificantes do genoma de ToSRV e ToMoLCV. Mutações causadas por substituição de nucleotídeos foram observadas ao longo das ORFs do genoma de ambas as espécies. Um maior número de mutações por substituição ocorreu nas sequências do DNA-A de ToSRV e ToMoLCV obtidas de plantas resistentes. As ORFs AC1 (Rep) e AV1 (CP) das duas espécies de begomovírus apresentaram maior número de substituições de nucleotídeos. Quanto às análises filogenéticas, verificou-se que os begomovírus se agrupam com base na localização geográfica. O conjunto dos resultados indica que, possivelmente, os isolados virais obtidos da cultivar resistente estão passando por um processo inicial de variação genética decorrente da pressão seletiva imposta pelo uso de plantas resistentes. Contudo, para confirmar esta hipótese, novas análises precisam ser realizadas em populações maiores de ToSRV e ToMoLCV.
________________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Tomato plant (Solanum lycopersicum) is one of the main vegetables grown in the world. Among the diseases that affect this culture, virus infections are particularly important due to the difficulty in their control. From these, a begomovirus disease is one of the major diseases of tomato plants, occurring in high incidence in the growing areas of the country. The use of resistant plants is the most efficient and cost-effective strategy to minimize losses caused by begomoviruses. However, an increasing cultivation of resistant cultivars may result in selection of specific viral isolates, accelerate changes in the begomovirus population composition, and lead to the breakdown of resistance. Since it is not known whether this selection actually occurs in our conditions, the aim of this work was to analyze and compare the begomovirus species present in processing tomato plants on two cultivars, Heinz-9553 (susceptible to begomovirus infection) and BRS Sena (resistant to begomovirus infection) collected in Luziânia-GO, and to evaluate the genome diversity within each species. It was observed that infected BRS Sena plants are less severely infected, and symptoms are mild. The diversity of begomoviruses in the samples was initially analyzed by RCA/RFLP and the results were confirmed by species-specific PCR and cloning. Two begomovirus species were detected in both cultivars, Tomato severe rugose virus (ToSRV) and Tomato mottle leaf curl virus (ToMoLCV), being ToSRV the most prevalent. Based on sequence comparisons, it was observed that the viral isolates (ToSRV or ToMoLCV) are closer when isolated from the same plant, whereas isolates from different cultivars are more distant. In the genetic variation analyses, measured by mutation occurrence in the isolates of each species, the presence of nucleotide insertions and deletions was only found in intergenic/non-coding regions of both ToSRV and ToMoLCV genome, while mutations caused by nucleotide substitution were observed throughout the ORFs in the genome of both species. A higher number of substitutions was found in DNA-A sequences of ToSRV and ToMoLCV from resistant plants. Most of the nucleotide substitutions were seen in AC1 (Rep) and AV1 (CP) ORFs of the two begomoviruses. Following phylogenetic analysis, it was clear that the begomoviruses are grouped together based on their geographical origin. The results indicate that most possibly viral isolates present in a resistant cultivar are going through an initial process of genetic variation due to the selective pressure imposed by the use of resistant plants. However, to confirm this hypothesis, further analyses are needed on larger populations of ToSRV and ToMoLCV.
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Sexualidade: diversidade e (in)visibilidade no espaço escolarSilva, Elisana Alves da 04 November 2015 (has links)
Submitted by Jordan (jordanbiblio@gmail.com) on 2016-08-26T11:10:24Z
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Previous issue date: 2015 / Os percursos de transformações ideológicas e estruturais que se tem notado nos debates sobre o processo educacional emergem como um anseio próprio da sociedade contemporânea, compreendendo esta como precursora de um contexto que visa a atenção no seio escolar às variedades de indivíduos que ao seu espaço se dispõem em compor. Estas multiplicidades são de ordens variadas, sejam culturais, sociais, intelectuais, sexuais e muitas outras. Neste trabalho, interessa-nos a pluralidade sediada nos contornos da diversidade sexual, em especial, às sexualidades não normativas, ou seja, as que se alijam de uma heterossexualidade compulsória. Esta necessidade surge a partir do momento em que o debate sobre o respeito à condição humana é posto em tela, em especial, na medida em que, ainda, o sobrepeso de moralidades configura os contornos dos estudos e reflexões sobre sexualidade e corpo, para além de seus correlatos medicalizantes. Tendo como método o Survey de amostra não-probabilística, do tipo “por conveniência”, pela disponibilidade e identificação de elementos, a pesquisa se volta ao cenário educacional de uma unidade escolar localizada na cidade de Cáceres, interior de Mato Grosso. Foram aplicados questionários ao corpo docente e discente de modo a nos permitir o traçado de uma linha de tendência perceptiva dessas categorias no que tange as suas visões sobre a diversidade sexual e sua (in)visibilidade no cenário escolar. O que se constata, a partir da contribuição dos alunos e alunas que desta pesquisa tomaram parte, é o fato de que estes compreendem a importância da abordagem das temáticas relacionadas à diversidade e demonstram abertura para o debate e reflexão, desde que conduzido por seus professores e professoras; no entanto, dentre estes profissionais, percebemos que ainda existe resistência para abordar tais temáticas em seu cotidiano escolar, foi, então, possível perceber a presença do discurso ainda higienizante, anatômico e biológico, assim como um “desconforto” que a maioria do grupo de profissionais da educação alega para a (não) abordagem das temáticas relacionadas à sexualidade. Apesar das tímidas conjecturações sobre o debate, não se pode perder de vista sua emergência no contexto atual, em especial, ante um cenário contemporâneo que aspira por uma educação inclusiva e que atente e respeite à diversidade sexual como elemento próprio e constitutivo do tecido social que também se estende e aporta ao cenário escolar. / The ideological and structural changes that have been noticed in the discussions about educational process emerge as a proper desire of contemporary society, understanding this as a precursor to a context that aims attention to the school, mainly to varieties of individuals. These varieties comprise cultural, social, intellectual, sexual and many others topics. In this work, we are interested in the plurality based on the contours of sexual diversity, mainly the non-normative sexualities those jettison a compulsory heterosexuality. This need arises from the moment the debate on respect sets in question, in particular the extent that even the morals of overweight shape the contours of studies and reflections on sexuality and body, beyond its medicalized related. With the method the sample Survey non-probabilistic, like "for convenience", the availability and identification data, research turns to the educational scene of a school unit in the city of Caceres, Mato Grosso. Questionnaires were administered to university students in order to allow us to trace a perceptive trend line of these categories regarding their perceptions about sexual diversity and its (in) visibility in the school setting. What it turns out, from the contribution of pupils that this research took part, is the fact that they understand the importance of the theme of the approach related to diversity and demonstrate to be open to debate and reflection led by teachers. Among these professionals, we realize that there’s still resistance to include this issues in their school routine, the sampling that we bring this research was possible to perceive the presence of speech even sanitizing, anatomical and biological as well as realize the "discomfort" that most of the professional education group claims for (not) addressing issues related to sexuality of their students, despite those who present themselves as their best defining at a contemporary setting that aspires to inclusive education and to watch out and observe the sexual diversity as its own and a constitutive element of the social fabric that also extends and brings the school setting.
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Perlidae (Plecoptera) da Serra de Paranapiacaba, Estado de São Paulo: integrando informações morfológicas e moleculares na identificação de espécies / Perlidae (Plecoptera) from Serra de Paranapiacaba, São Paulo State: integrating morphological and molecular information to identify speciesAlmeida, Lucas Henrique de 28 February 2018 (has links)
Submitted by Lucas Henrique De Almeida null (lucasalmeida768@yahoo.com.br) on 2018-03-08T16:03:26Z
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Dissertação - Final FInal.pdf: 4152416 bytes, checksum: f411bb9ed807163a2ae24c13db2d4aee (MD5) / Approved for entry into archive by Maria Luiza Carpi Semeghini (luiza@assis.unesp.br) on 2018-03-08T18:09:21Z (GMT) No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2018-02-28 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Plecoptera compreende uma ordem de insetos aquáticos com aproximadamente 3500 espécies conhecidas, sendo distribuídas em 16 famílias. No Brasil são registradas apenas duas famílias, sendo Gripopterygidae e Perlidae. Neste trabalho foram estudadas as espécies de Perlidae da Serra de Paranapiacaba, incluindo os Parques Estaduais Carlos Botelho (PECB), Intervales (PEI) e Turístico do Alto Ribeira (PETAR), Estado de São Paulo. Com o objetivo de integrar o conhecimento taxonômico ao molecular, obtendo identificações de adultos e a associação adulto-ninfa utilizando DNA Barcode. Foram registradas 14 espécies, sendo Anacroneuria representado por nove espécies: A. boraceiensis, A. debilis, A. fiorentini, A. flintorum, A. iporanga, A. itajaimirim, A. polita, A. subcostalis e A. tupi. Kempnyia por quatro espécies: K. auberti, K. colossica, K. flava e K. neotropica. Macrogynoplax por apenas uma espécie: M. veneranda. Foram realizados dois novos registros (Anacroneuria debilis e A. fiorentini), duas descrições de imaturos (A. flintorum e A. tupi) e uma sinonimização (Kempnyia petersorum). Adicionalmente, é fornecida uma chave de identificação de adultos da região. / Plecoptera comprises an order of aquatic insects with aproximately 3500 species, distributed in 16 families. In Brazil, only two families are recorded, being Gripopterygidae and Perlidae. In this work, were studied the species of Perlidae from Paranapiacaba mountains, including the Carlos Botelho State Park (PECB), Intervales State Park (PEI), and Alto Ribeira Tourist State Park (PETAR), São Paulo State. With the objective of integrating the taxonomic knowledge to the molecular, obtaining identifications of adults and the adult-nymph association using the DNA Barcode. Were recorded fourteen species, being Anacroneuria represented by nine species: A. boraceiensis, A. debilis, A. fiorentini, A. flintorum, A. iporanga, A. itajaimirim, A. polita, A. subcostalis and A. tupi. Kempnyia by four species: K. auberti, K. colossica, K. flava and K. neotropica. Macrogynoplax by only one species: M. veneranda. Were made two new records (Anacroneuria debilis and A. fiorentini), two descriptions of nymphs (A. flintorum and A. tupi), and one synonymization (Kempnyia petersorum). In addition, a key is provided for the identification of adults from the region / FAPESP: 2015/22008-9
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Fungos de solos da Antártica: prospecção de L-asparaginase e protease e caracterização taxonômica / Antarctic soil fungi: prospecting L- asparaginase and protease and taxonomic characterizationVianna, Marina Vitti [UNESP] 04 July 2016 (has links)
Submitted by MARINA VITTI VIANNA null (marinavvianna@gmail.com) on 2016-07-18T13:13:27Z
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Previous issue date: 2016-07-04 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Ambientes extremos são fontes potenciais para a descoberta de novos produtos naturais com propriedades específicas para aplicação biotecnológica, devido ao pouco conhecimento sobre a diversidade e os recursos genéticos dos micro-organismos que habitam esses locais. Micro-organismos do ambiente Antártico têm demonstrado potencial para produção de enzimas ativas em temperaturas brandas com aplicação em diversos setores de importância econômica. Neste contexto, o presente trabalho avaliou a produção de L-asparaginase e proteases produzidas por fungos filamentosos (n=161) e leveduras (n=137), isolados de oito diferentes amostras de solos da Antártica (coletados na expedição Antártica de nov/dez de 2013 no âmbito do INCT Criosfera). Os fungos filamentosos e as leveduras encontram-se preservados na coleção de pesquisa vinculada à Central de Recursos Microbianos da UNESP (CRM-UNESP). Um total de 101 (62,7%) fungos filamentosos apresentou potencial para produção da enzima L-asparaginase em meio sólido (triagem qualitativa), porém nos testes quantitativos em meio líquido a enzima não foi produzida nas condições utilizadas. Com relação às proteases, 121 (75,1%) fungos apresentaram halo de degradação em meio sólido e 30 (18.6%) isolados apresentaram resultados de atividade de proteases acima de 45,0 U/mL. Dentre eles, 13 (8,7%) foram capazes de produzir proteases acima 100,0 U/mL: sete isolados apresentaram atividade de proteases alcalina e seis de proteases ácidas. Os isolados 5BI (Aspergillus sp.) e 6 MP (Thelebolus sp.) se destacaram na produção de proteases ácidas e alcalinas, respectivamente, e foram submetidos ao planejamento experimental. Os resultados indicaram um aumento significativo na produção de proteases a 10ºC e 150 rpm: 7,41 vezes para a produção de proteases ácidas pelo fungo 5BI (1.810,0 U/mL) e 5,38 vezes (1.542,5 U/mL) para a produção de proteases alcalinas pelo fungo 6MP. Para ambos os isolados as condições aplicadas que resultaram nos valores máximos de produção de proteases foram validadas. Os resultados da avaliação da diversidade das 137 leveduras (MSP-PCR) revelaram a ocorrência de 22 táxons distintos distribuídos em 8 gêneros, com predominância de Cryptococcus (21,1%), Rhodotorula e Candida (20,4%). Outros gêneros menos predominantes encontrados foram: Cystofilobasidium (13,8%), Rhodosporidium (13,1%), Leucosporidium (8,7%), Guehomyces (6,5%), Debaryomyces (3,6%), Bulleromyces (2,9%) e Malassezia (2,1%). Com base nos índices de Simpson,
Shannon e Chao o solo BI (solo de biofilme, Deception) foi o mais diverso e o que apresentou a maior riqueza. Análises dos parâmetros físico-quimicos dos solos e de diversidade revelaram proximidade entre os solos MP (solo embaixo de madeira podre, Deception), FE (solo embaixo de barra de ferro, Deception) e CG 4.0 (solo embaixo de camada de gelo, Rei George). O presente trabalho apresenta uma visão geral da diversidade de leveduras nos diferentes tipos de solos de Ilhas Antárticas e revela o potencial biotecnológico de fungos filamentosos para produção de proteases ácidas e alcalinas. / Extreme environments are potential sources for the discovery of new natural products with specific properties for biotechnological applications due to little knowledge about the diversity and genetic resources of microorganisms that inhabit these places. Microorganisms from the Antarctic environment have shown potential for producing active enzymes in mild temperatures with application in various sectors of economic importance. In this context, the present study evaluated the production of proteases and L-asparaginase by filamentous fungi (n= 161) and yeasts (n= 137) isolated from seven different samples of the Antarctic soils (collected in the Antarctic expedition Nov/Dec 2013 - INCT Cryosphere Project). The isolates are being maintained in the research collection linked to the Microbial Resource Center of UNESP (CRM-UNESP). A total of 101 (62.7%) filamentous fungi showed potential for production of L-asparaginase on solid medium (qualitative screening), but in the quantitative screening in liquid medium the enzyme was not produced. Concerning proteases production, 121 (75.1%) filamentous fungi presented halo of degradation on solid medium and 30 (18.6%) isolates showed protease activity above 45.0 U/mL Among them, thirteen (8.7%) isolates were able to produce protease above 100.0 U/mL: seven isolates produced alkaline proteases and six acid proteases. The isolates 5BI (Aspergillus sp.) and 6 MP (Thelebolus sp.) showed the best results in the production of acid and alkaline proteases, respectively, and were submitted to the experimental design. Results indicated a significant increase in protease production at 10 °C and 150 rpm: 7.41 times for the production of acid proteases by the fungus 5BI (1,810.0 U/mL) and 5.38 times (1,542.5 U/mL) for the production of alkaline proteases by the fungus 6MP. For both isolates the conditions applied for the maximum production of proteases were validated. Results related to the assessment of the diversity of the 137 yeasts (MSP-PCR) revealed the presence of 22 different taxa, especially the genera Cryptococcus (21.1%), Rhodotorula e Candida (20.4%). Other less prevalent genera found were: Cystofilobasidium (13.8%), Rhodosporidium (13.1%), Leucosporidium (8.7%), Guehomyces (6.5%), Debaryomyces (3.6%), Bulleromyces (2.9%), and Malassezia (2.1%). Based on the Simpson, Shannon and Chao indexes, the soil BI (biofilm soil, Deception Island) was the most diverse and presented the greatest richness. Analysis of physicochemical parameters of the soils and their diversity revealed that MP (soil under rotten wood, Deception), FE (soil under iron bar, Deception), and GC 4.0 (soil under layer ice, King George) are closed related. The present work presents an overview of the diversity of yeast in different types of soils from Antarctic Islands and reveals the biotechnological potential of filamentous fungi for the production of acid and alkaline proteases. / FAPESP: 2014/10207-4
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Comunidades de vespas sociais (Hymenoptera, Vespidae, Polistinae) em dois gradientes altitudinais na Serra da Mantiqueira / Social wasps communities (Hymenoptera, Vespidae, Polistinae) in two altitudinal gradients in the Mantiqueira mountain rangeLocher, Gabriela de Almeida [UNESP] 23 September 2016 (has links)
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Previous issue date: 2016-09-23 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Vespas sociais são insetos da ordem Hymenoptera de grande importância ecológica, atuando principalmente como predadores no ambiente. O bioma Mata Atlântica vem sendo recentemente bastante estudado quanto à diversidade de vespas sociais, no entanto ainda existem lacunas que devem ser preenchidas. Este trabalho teve como objetivo realizar um inventário de vespas sociais (Vespidae, Polistinae) em uma área de Mata Atlântica na Serra da Mantiqueira. O estudo abrangeu diferentes fitofisionomias típicas de altitude em Campos do Jordão, assim como áreas no forte da Serra, em Pindamonhangaba, de forma a proporcionar comparações entre as comunidades amostradas tanto nas diferentes fitofisionomias, como em dois gradientes de altitude (500 e 1.000 metros e 1.500 e 2.000 metros de altitude, respectivamente). Em Campos do Jordão coletou-se um total de 17 espécies de vespas sociais, sendo que nas trilhas amostradas foram coletadas 15 espécies. Em Pindamonhangaba foram amostradas 35 espécies de vespas sociais, sendo que apenas nas trilhas foram coletadas 34 espécies. A riqueza amostrada em Pindamonhangaba é a segunda maior encontrada em uma área de Mata Atlântica, e, ao se somar as espécies amostradas em Campos do Jordão e Pindamonhangaba, tanto nas coletas efetivas quanto nas coletas preliminares, obtêm-se um total de 40 espécies, sendo esta a maior riqueza descrita em um inventário de fauna de vespas sociais para este Bioma. Na comparação entre a riqueza dos inventários em regiões próximas, o realizado na Serra do Papagaio apresentou maior similaridade ao de Campos do Jordão, enquanto que o que apresentou o maior índice de similaridade de Jaccard com Pindamonhangaba foi o inventário de São Gonçalo do Sapucaí. Estes dois inventários foram realizados em cotas altitudinais muito semelhantes às aqui analisadas, abrangendo fisionomias vegetais também semelhantes. A ocorrência exclusiva de poucas espécies no gradiente mais elevado e de muitas no gradiente que abrange de 500 a 1.000 metros de altitude indicam que as condições ambientais propiciadas pela elevada altitude é um fator limitante na ocorrência de algumas espécies de vespas, principalmente para as pertencentes às tribos Mischocyttarini e Polistini, que ocorreram com elevada riqueza no gradiente de menor altitude. Conclui-se que a altitude apresenta influência na composição da comunidade de vespas sociais por gerar diferentes micro-habitat e microclimas nos gradientes, características importantes tanto para a utilização de distintos substratos para nidificação quanto para a manutenção da temperatura da colônia. / Social wasps are insects of the Hymenoptera order of great ecological importance, mainly acting as predators in the environment. The diversity of social wasps has been recently extensively studied in the Atlantic Forest biome, however gaps remain to be fulfilled. This study aimed to establish an inventory of social wasps (Vespidae, Polistinae) in an Atlantic Forest area on the Mantiqueira Mountains range (Serra da Mantiqueira). The study covered different typical altitudinal vegetation types in the municipality of Campos do Jordão, as well as areas in the fort of the Mountain range, in Pindamonhangaba, in order to provide comparisons between the communities sampled in different vegetation types and between two elevation gradients (from 500 to 1,000 meters and from 1,500 to 2,000 meters). In Campos do Jordão a total of 17 species of social wasps were assembled, and just in the sampled trails 15 species were collected. In Pindamonhangaba 35 species of social wasps were sampled, and only on the trails 34 species were collected. The sampled richness in Pindamonhangaba is the second largest found in an Atlantic Forest area, and when the species sampled in Campos do Jordao and Pindamonhangaba are added, with both effective the preliminary samplings, we obtain a total of 40 species, and this is the greatest richness described in a social wasp fauna inventory for this biome. When comparing the richness of inventories in nearby regions, the one held in the Papagaio Mountains range (Serra do Papagaio) showed a greater similarity to the Campos do Jordão sample, while the one with the highest Jaccard similarity index with Pindamonhangaba was the inventory of São Goncalo do Sapucaí. These two surveys were conducted at quotas altitudinal closely resembling those analyzed here, as well as similar vegetation types. The occurrence of few exclusive species at the higher gradient and many in the gradient covering from 500 to 1,000 meters indicate that the environmental conditions afforded by the high altitude is a limiting factor in the occurrence of some species of wasps, especially for those belonging to Mischocyttarini and Polistini tribes, which occurred with high richness in the lower elevation gradient. We conclude that the elevation has influence on the social wasps community composition, since it generate different micro-habitats and microclimate in the gradients, important features for the use of different substrates for nesting and for the maintenance of temperature of the colony. / CNPq: 141975/2012-1
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Taxonomia de Ascidae, Blattisociidae e Melicharidae (Acari: Mesostigmata), ácaros potencialmente úteis para o controle de pragas agrícolas / Taxonomy of Ascidae, Blattisociidae and Melicharidae (Acari: Mesostigmata), mites potentially useful for the control of agricultural pestsSantos, Jandir Cruz [UNESP] 20 April 2017 (has links)
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Previous issue date: 2017-04-20 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Em diversos países, muitas empresas têm investido valores significativos na viabilização do uso do controle biológico de pragas, em função da demanda do mercado por produtos alimentícios saudáveis, livres de resíduos químicos. O uso de ácaros predadores tem crescido significativamente nos últimos anos principalmente com ácaros das famílias Phytoseiidae, Laelapidae e Macrochelidae, no entanto outras famílias como Ascidae, Blattisociidae e Melicharidae têm demonstrado bons resultados em laboratório no controle de pragas. Dentro da linha de trabalho priorizada pelas instituições em que o presente trabalho foi conduzido (FCAV/UNESP e ESALQ/USP), o objetivo deste trabalho foi conhecer a fauna de ácaros das famílias Ascidae, Blattisociidae e Melicharidae nas diferentes regiões do Brasil e estabelecer bases de dados sobre a ocorrência destes no Globo Terrestre. Espécimes disponíveis na Coleção de Referência de Ácaros da ESALQ/USP e coletados pelo autor deste documento foram analisados e identificados, descrevendo-se três espécies novas para a ciência e redescrevendose uma espécie (Leioseius basis Karg, 1994). Foram também criadas bases de dados sobre a distribuição de ácaros destas três famílias e sobre os substratos em que foram encontrados, para disponibilização “on-line”. No total, foram examinados 1657 exemplares, de 76 espécies de 19 gêneros. Vinte e seis espécies e três dos gêneros encontrados eram novos para a ciência e destes taxa, três espécies novas (uma de Leioseius e duas de Cheiroseius) foram descritas. Duas chaves dicotômicas taxonômicas foram elaboradas, uma para as espécies de Leioseius do Globo e uma para as espécies de Cheiroseius conhecidas no Brasil. As bases de dados estabelecidas correspondem a uma complementação das informações taxonômicas constantes do catálogo destas famílias publicado em 2016. Cerca de 820 publicações foram obtidas e analisadas, correspondendo a cerca de 1,3 vezes o número de publicações citadas naquele catálogo. As bases de dados permitem o rápido acesso às informações sobre a distribuição por país (por estado ou divisão política correspondente nos sete maiores países) e sobre os substratos em que estes ácaros foram relatados. As bases constam de aproximadamente 2200 registros, cada um correspondente ao número de pontos de constatação citados em cada publicação de dados primários, para cada uma das quase 1000 espécies distribuídas em 45 gêneros destas famílias. Os países com maior diversidade conhecida em cada família são: Ascidae – Rússia (56), Estados Unidos da América (42), China (37) e Polônia (36); Blattisociidae – China (47), Estados Unidos da América (41), Equador (38), Índia (33) e Polônia (32); Melicharidae – Estados Unidos da América (46), Brasil (23), Equador (20) e Polônia e Alemanha (15). No entanto, nenhuma espécie destas famílias é conhecida em cerca de 44% dos países. / In several countries, many companies have invested significant amounts in making viable the use of biological control of pest organisms, due to the demand for healthy food products, free of chemical residues. The use of predatory mites have grown significantly in recent years especially with mites Phytoseiidae families, and Laelapidae Macrochelidae, however other families like Ascidae, Blattisociidae Melicharidae and have shown good results in the laboratory to control pests. In line the research priorities of the institutions in which this work was conducted (FCAV/UNESP and ESALQ/USP), the objective of this work was to investigate the mite fauna of the families Ascidae, Blattisociidae and Melicharidae in different regions of Brazil and to establish databases on the world occurrence and substrates of these mites. Specimens available at ESALQ/USP Mite Reference Collection and specimens collected by the author of this document were analyzed and identified, describing three species new to science and redescribing a species (Leioseius basis Karg, 1994). The work also involved the establishment of databases on the distribution of mites of these three families and on substrates that have been found, for online availability. In total, 1657 specimens from 76 species of 19 genera were examined. Six species and three genera found were new to science and from these taxa, three new species (one Leioseius and two Cheiroseius) were described. Two dichotomous taxonomic keys were elaborated, one for the species of Leioseius of the world and one for the species of Cheiroseius known in Brazil. The established databases correspond to a complementation of the taxonomic information included in the catalog of these families published in 2016. About 820 publications were obtained and analyzed, corresponding to about 1.3 times the number of publications cited in that catalog. The databases allow rapid access to information on the distribution by country (by state or corresponding political division in the seven largest countries) and on the substrates in which these mites have been reported. The bases contain approximately 2200 records, each corresponding to the number of observation points in each publication of primary data, for each of the nearly 1000 species in 45 genera of these families. The countries with the highest known diversity in each family are: Ascidae - Russia (56), United States of America (42), China (37) and Poland (36); Blattisociidae - China (47), United States of America (41), Ecuador (38), India (33) and Poland (32); Melicharidae - United States of America (46), Brazil (23), Ecuador (20) and Poland and Germany (15). However, no species of these families is known in about 44% of the countries.
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Diversidade genética de Babesia bovis em bezerros naturalmente infectados das regiões de São Paulo e Rio de Janeiro, Brasil / Genetic diversity of Babesia bovis in calves naturally infected of the São Paulo and Rio de Janeiro regions, BrazilMatos, Carlos António [UNESP] 19 April 2017 (has links)
Submitted by CARLOS ANTÓNIO MATOS null (cmatos62@yahoo.com.br) on 2017-05-23T17:44:16Z
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Previous issue date: 2017-04-19 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / A babesiose é uma doença infecciosa economicamente importante que afeta o gado bovino em todo o mundo, endêmica e importante causa de morbidade e mortalidade em bovinos no Brasil. A doença é causada por Babesia bigemina e B. bovis, protozoários parasitas intraeritrocíticos do filo Apicomplexa, agentes de enorme importância econômica em regiões tropicais e subtropicais. Merozoitos de B. bovis possuem em sua superfície, pelo menos, cinco glico-proteínas, que pertencem à família de antígenos variáveis de superfície do merozoíto (VMSA). A família VMSA de B. bovis inclui os genes msa-1, msa-2a1, msa-2a2, msa-2b e msa-2c. Estes antígenos são altamente imunogênicos e contêm epítopos sensíveis à neutralização e, por conseguinte, têm sido considerados como antígenos candidatos para o desenvolvimento de vacinas de subunidades contra B. bovis. No entanto, estes antígenos de superfície são geneticamente diversificados entre diferentes isolados de B. bovis, O que resulta em diferenças antigénicas entre vários isolados de B. bovis. A fim de avaliar a resposta imune humoral contra B. bovis e a diversidade genética de antígenos de superfície de merozoítos de B. bovis, amostras de soro e DNA de sangue de 30 bezerras, sendo 15 da Fazenda Pesagro, Seropédica, Rio de Janeiro, e outras 15 da Fazenda Germânia, Taiaçu, São Paulo, foram obtidas trimestralmente, desde o nascimento até aos 12 meses de idade. Os Anticorpos IgG para B. bovis foram detectados pelos testes de Imunofluorescência Indireta (RIFI) e Ensaio de Imunoadsorção Enzimático Indireto (IELISA). A Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) foi utilizada com o objetivo de avaliar a diversidade genética de B. bovis, com base em genes que codificam antígenos de superfície de merozoítos (MSAs). Os resultados da sorologia demonstram que, a partir dos seis meses de idade, todas as bezerras foram soropositivas para B. bovis. Entre as 150 amostras de DNA testadas para a presença de três fragmentos de genes de msa de B. bovis, amplicons positivos foram obtidos em 14 amostras para msa-1, 24 para msa-2b e 34 para msa-2c de bezerras da Fazenda Pesagro e em 9 amostras para msa-1, 28 para msa-2b e 34 para msa-2c em amostras de bezerras da Fazenda Germânia. O sequenciamento foi realizado pelo método de Sanger para os fragmentos de genes msa-2b (n = 3), msa- 2c (n = 5) de Seropédica e msa-1 (n = 2), msa-2b (n = 5), msa-2c (n = 5) de Taiaçu. A análise filogenética foi realizada pelo método de Máxima verossimilhança e modelos GTR + G, GTR + G + I e GTR + G+ I para MSA-1, MSA-2b e MSA-2c, respectivamente. As sequências de MSAs dos genes msa-2b e msa-2c de Seropédica posicionaram-se em dois clados, enquanto que as sequências de MSAs dos genes msa-1 e msa-2b de Taiaçu posicionaram-se em dois clados, e sequências do gene msa-2c agruparam-se em um único clado. Os resultados da sorologia mostram que foi atingida a estabilidade endêmica em ambas as fazendas. Com base nas sequências do gene msa-2b, amplificadas no presente estudo, e a análise filogenética, pode-se afirmar que as amostras de B. bovis das fazendas Pesagro e Germânia dividem-se em dois grupos genotipicos, havendo um genótipo compartilhado por ambas as fazendas. / Babesiosis, an economically important infectious disease that affects cattle worldwide, is endemic and important cause of morbidity and mortality of cattle in Brazil. The disease is caused by Babesia bigemina and B. bovis, apicomplexan intraerythrocytic protozoa parasites, which are agents of huge economic importance in tropical and subtropical regions. B. bovis merozoites present at least five (glyco-) proteins on their surfaces, which belong to a family of variable merozoite surface antigens (VMSA). The members of the VMSA family consist of merozoite surface antigen msa-1, msa-2a1, msa-2a2, msa-2b, and msa-2c. These antigens are highly immunogenic and contain neutralization-sensitive epitopes, and therefore have been considered as candidate antigens for developing subunit vaccines against B. bovis. However, these surface antigens are genetically diverse among different isolates of B. bovis, which results in antigenic differences among various B. bovis isolates. In order to evaluate the humoral immune response against B. bovis and genetic diversity of merozoite surface antigens of B. bovis, serum and DNA blood samples of 30 dairy calves, 15 from Seropedica, state of Rio de Janeiro, and the other 15 from a herd located in Taiaçu, state of São Paulo were obtained quarterly, since the birth up to 12 months of age. IgG antibodies to B. bovis were detected by Indirect Fluorescent Antibody Test (IFAT) and Enzyme-Linked Immunoadsorbent Assay (ELISA) tests. Polymerase Chain Reaction (PCR) was used aiming to assess the genetic diversity of B. bovis, based on genes that encode merozoite surface antigens (MSAs). The serology results demonstrate that up to six months of age all calves were seropositive to B. bovis. Among the 150 DNA blood samples tested for the presence of three B. bovis-msa gene fragments, positive amplicons were obtained in 14 samples for msa-1, 24 samples for msa-2b and 34 for msa-2c from calves of Pesagro herd, 9 samples for msa-1, 28 for msa-2b and 34 for msa-2c from calves of Germânia herd. Sequencing, by Sanger method, was performed for msa-2b (n=3), and msa-2c (n=5), genes fragments of Seropedica and msa-1(n=2), msa-2b (n=5), and msa-2c (n=5), genes fragments of Taiaçu. The phylogenetic analysis was performed by Maximum Likelihood method and models GTR+G, GTR+G+I and GTR+G+I for MSA-1, MSA-2b and MSA-2c, respectively. The Seropedica MSAs sequences namely msa-2b and msa-2c were positioned in two clades, and a Taiaçu MSAs sequence, that is msa-1 and msa-2b, were positioned in two clades, while msa-2c sequences were all grouped in only one clade. Serology results show that endemic stability has been achieved in both farms. Based on the msa-2b gene sequences amplified in the present study, and the phylogenetic analysis, it can be stated that the B. bovis samples from the Pesagro and Germânia farms are classified into two genotypic groups, having one genotype shared by both farms.
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