As mutações de resistência aos anti-retrovirais e a diversidade genética do HIV-1 são os principais obstáculos na luta contra a AIDS. O objetivo deste estudo foi descrever a diversidade genética do gene pol do HIV-1 bem como determinar o perfil de mutação de resistência às drogas em indivíduos infectados e sob falha terapêutica no estado do Rio Grande do Sul. Foram colhidas 183 amostras de plasma de pacientes infectados com HIV-1 durante o período de outubro de 2004 a setembro de 2005 para a realização do teste de resistência genotípica no Laboratório da Rede Nacional de Genotipagem do Rio Grande do Sul (Fundação Estadual de Produção e Pesquisa em Saúde). Para a genotipagem foi utilizado o sistema ViroseqTM (Celera Diagnostic-Abbott, EUA). A subtipagem e a avaliação das mutações de resistência para o HIV-1 foram baseadas no gene pol (região da protease e da transcriptase reversa). O subtipo B (53,2%) foi o mais prevalente nos pacientes HIV-1 acompanhados para avaliação de falha terapêutica no Rio Grande do Sul, seguido pelo subtipo C (31.6%) e subtipo F (6.5%). Dos genomas que formaram um grupo monofilético com o subtipo C, 32% tiveram um segmento curto do subtipo B na região da transcriptase reversa, formando um subgrupo com um padrão similar de recombinação e carreando uma nova assinatura de aminoácidos para a região da transcriptase reversa. Outros padrões de recombinação também foram observados (8.2%). Nenhum parâmetro laboratorial ou características sócio-demográficas foi associado a qualquer subtipo específico. Todos os pacientes infectados com vírus recombinantes foram provenientes da região metropolitana. O perfil genotípico das mutações de resistência associadas aos inibidores da transcriptase reversa mostrou uma alta freqüência da mutação M184V seguida das mutações associadas à timidina. A mutação K103N foi a mais prevalente para os inibidores da transcriptase reversa não nucleosídicos e o perfil de mutações associado aos inibidores da protease, mostrou as mutações L63P, M36I/V, e L10V/I como as mais prevalentes. Uma clara associação entre os subtipos e mutações de resistência e polimorfismos associados aos inibidores da protease e da transcriptase reversa foi observada. A manutenção do programa de genotipagem para pacientes infectados pelo HIV-1 é importante para o manejo da terapia anti-retroviral e para o monitoramento da peculiar epidemia molecular do HIV-1 nesta região do Brasil. / The anti-retroviral resistance mutations and viral genetic diversity are the main obstacles in the fight against AIDS. The objectives of the present study are to describe the genetic diversity of HIV-1 pol gene and to determine the drug resistance profile among infected individuals failing highly active antiretoviral therapy in the state of Rio Grande do Sul, Brasil. Plasma samples from 183 patients were collected during the years 2004 and 2005 to perform the viral resistance genotyping at RENAGENO Laboratory from Rio Grande do Sul (Fundação de Produção e Pesquisa em Saúde). Viral resistance genotyping was performed using ViroseqTM Genotyping System (Celera Diagnostic-Abbott, US). The subtyping and evaluation of the anti-retroviral resistance mutations were based on polymerase gene (pol) sequences (protease and reverse transcriptase- RT regions). The subtype B was the most prevalente (53.2%) in HIV-1 patients from Rio Grande do Sul failing HAART, followed by subtype C (31.6%) and subtype F (6.5%). Thirty-two percent of the genomes clustering in clade C have a small clade B segment at the reverse transcriptase, forming a sub-cluster within clade C with a similar CB recombinant structure and carrying new amino acid signatures. Other mosaic genomes were also observed (8,2%). No laboratory parameter or social-demographic issues was associated with any specific subtype. However the infected individuals whit pol recombinants viruses were founded only in metropolitan region. The genotyping profile associated to the reverse transcriptase inhibitors showed a high frequency of the M184V mutation followed by the timidine-associated mutations. The K103N mutation was the most prevalent for the non-nucleoside RT inhibitor and the resistance associated to protease inhibitor showed the minor L63P, M36I/V and L10V/I mutations as the most prevalent. A clear association between subtype and drug resistance mutations or molecular polymorphisms was observed in this study at protease and transcriptase genes. The maintenance of resistance genotyping programs for HIV-1 patients failing HAART is of great importance for the management of ARV therapies and to monitor the peculiar HIV-1 molecular epidemy in this region of Brazil.

Este trabalho visa contribuir para o levantamento sistemático e o conhecimento da fauna de percevejos-do-mato do bioma campos sulinos, avaliando sua riqueza de espécies, abundância e similaridade da fauna entre os ambientes amostrados. Para tal, foram realizadas saídas de campo bimestrais para os municípios de Canguçu e Caçapava do Sul, RS. As amostragens foram realizadas com a utilização de duas redes de varredura e um guarda-chuva entomológico. Foram selecionados 3 pontos de coleta por município, sendo amostrados os ambientes campo, interior e borda de mata. As áreas de estudo estão situadas na região fisiográfica da Serra do Sudeste, possuindo cobertura vegetal bem diversificada, pertencendo ao bioma Campos Sulinos. O relevo é fortemente ondulado, com altitudes que variam de 200 a 500 m. Um total de 210 horas de amostragem resultou em 444 espécimens (110 imaturos e 334 adultos) distribuídos em cinco famílias, sete subfamílias, 23 gêneros e 47 espécies. Entre as espécies registradas, 32 (68,08%) pertencem à família Pentatomidae, 8 (17,02%) a Scutelleridae, 4 (8,51%) a Corimelaenidae, 2 (4,25%) a Megarididae e 1 (2,21%) a Acanthosomatidae. Foram encontrados 3 registros de espécies novos para o estado, um registro de família novo para o estado e uma espécie nova para a Ciência. As espécies mais abundantes foram Mormidea cornicollis Stål, 1860, com 13,17% de abundância relativa registrada ao longo do ano e Thyanta humilis Fabricius, 1794 com 11,07%. As estimativas gerais de diversidade foram de S = 47, H’ = 3,22 (índice de Shannon-Wiener) e D = 0,058 (índice de Simpson). Abundância, riqueza de espécies e composição foram relativamente homogêneas entre as trilhas e nos ambientes campo e borda. Canguçu e Caçapava do Sul tiveram cada uma o mesmo número de espécies exclusivas (13); dentre as trilhas, a Pedra do Segredo obteve o maior número de espécies exclusivas (9). A fauna apresentou marcada sazonalidade com picos de riqueza de espécies e abundância no outono e verão, sendo tempo o principal fator significativo numa MANOVA da riqueza de espécies e abundância. As curvas de distribuição de abundância seguem o padrão da série logarítmica, tanto para o total da comunidade quanto para os ambientes campos e borda de mata, indicando uma possível influência antrópica nas áreas amostradas, ou comunidades pioneiras. O grau de suficiência amostral foi elevado tendo em vista a duração e abrangência do trabalho, o que é corroborado pelos resultados das performances dos estimadores de riqueza de espécies: Bootstrap=54,1 spp.; Chao 1=52,2 spp.; M.Menten=62,6 spp. e Jacknife 1=61,5 spp. A ANOSIM constatou que apesar da presença de espécies exclusivas nas trilhas, isto não foi suficiente para diferenciar a composição entre as trilhas, indicando a presença de comunidades similares. Este trabalho representa uma primeira avaliação da diversidade da superfamília Pentatomoidea no país, tendo permitido identificar os primeiros padrões ecológicos para o grupo em ambientes naturais. / This work presents a systematic survey of the stinkbug fauna of the Southern Fields biome, evaluating species richness, abundance and faunal similarity among sampled environments. Bimonthly field trips were done to the municipalities of Canguçu and Caçapava do Sul, RS. Sampling employed sweeping nets and beating tray. Two sampling points (trails) per municipality were chosen, with grasslands, forest edge and forest included. The study areas are in the physiographic region of the “Serra do Sudeste”, having a diverse plant cover. The region varies in altitude from 200 to 500 m. A total of 210 hours of sampling resulted in 444 specimens (110 imatures and 334 adults) distributed among five families, seven subfamilies, 23 genera and 47 species. Among the species recorded, 32 (68,08%) belonged to the Pentatomidae family, 8 (17,02%) to Scutelleridae, 4 (8,51%) to Corimelaenidae, 2 (4,25%) to Megarididae and a single one (2,21%) to Acanthosomatidae. There were 3 new species records to the State, one new family record to the State and one species new for Science. The most abundant species were Mormidea cornicollis Stål, 1860, with 13,17% of relative abundance recorded across the year and Thyanta humilis Fabricius 1794 with 11,07%. The general diversity indexes were S = 47, H’ = 3,22 (Shannon-Wiener index) e D = 0,058 (Simpson index). Abundance, species richness and composition were relatively homogeneous among trails and for the grassland and edge environments. Canguçu and Caçapava do Sul had the same number of exclusive species each (13); among the trails, “Pedra do Segredo” had the higher number of exclusive species (9). The fauna shows a marked seasonality with species richness and abundance peaks in autumn and summer, with time the main factor in a MANOVA for species richness and abundance. The abundance distribution curves follow the logseries, both for the community overall and grasslands and forest edges separately, indicating a possible anthropic influence in the sampling areas, or pioneer communities. The degree of sampling sufficiency was high given the duration and width of the work developed here, which is corroborated by the results of the species richness estimators: Bootstrap=54,1 spp.; Chao 1=52,2 spp.; M.Menten=62,6 spp. e Jacknife 1=61,5 spp. The ANOSIM showed that despite the presence of exclusive species on the trails, this was not enough to differentiate the trails in terms of species composition, indicating the existence of similar communities. This work represents the first evaluation of the diversity of the Pentatomoidea superfamily in this country, allowing the identification of the first ecological patterns for this group in natural environments.

Vriesea gigantea é uma espécie endêmica da Mata Atlântica, podendo ser encontrada desde o estado do Espírito Santo até o Rio Grande do Sul. A espécie é perene, diplóide e autocompatível. Suas populações naturais estão sendo rapidamente reduzidas por dois motivos principais: pela ação antrópica, que modifica seu habitat natural, e pela coleta predatória e ilegal de plantas da natureza. Os processos que formaram a extraordinária diversidade de espécies nas regiões Neotropicais ainda são pouco conhecidos. A Mata Atlântica tem sido considerada um dos maiores centros de biodiversidade, o que torna a sua conservação prioritária. A variabilidade intra-específica tem sido aceita como foco para a conservação. Além disto, a fertilidade das plantas tem grande importância conservacionista, sendo a viabilidade do pólen (qualidade do pólen) um importante componente do sucesso reprodutivo. Com o objetivo de estudar a diversidade genética em Vriesea gigantea, 11 marcadores de microssatélites foram desenvolvidos e os resultados publicados conjuntamente com aqueles obtidos para outros quatro loci caracterizados para uma espécie próxima, Alcantarea imperialis (Capítulo 2). Treze novos pares de primers de microssatélites nucleares foram testados em 22 espécies de bromélias, indicando que estes marcadores serão úteis em inúmeros estudos com outras espécies desta mesma família. Os marcadores nucleares de microssatélites foram utilizados para estudar os padrões de diversidade genética de Vriesea gigantea ao longo de toda a distribuição geográfica da espécie, em 429 indivíduos, amostrados em 13 populações (Capítulo 3). Os resultados indicaram uma tendência latitudinal de diminuição da diversidade genética do Norte para o Sul, consistente com o padrão histórico de expansão da Floresta Atlântica. A expansão da espécie parece ter sido impedida pela diminuição do fluxo gênico nas populações marginais. Além disso, a história evolutiva das populações marginais difere muito. O centro de diversidade genética para V. gigantea (São Paulo e Rio de Janeiro) coincidiu com o centro de diversidade e centro de endemismo de muitas espécies de animais e plantas da mata Atlântica. A correlação entre a diversidade genética de V. gigantea e a de espécies do gênero Vriesea indicou que ambas foram moldadas pelas mesmas forças históricas: alterações climáticas do Pleistoceno. As análises de distância genética revelaram três grupos geograficamente separados e as análises bayesianas revelaram a presença de outros dois grupos, referentes às populações marginais, os quais são de grande importância para estabelecer estratégias de conservação da espécie. Complementando as análises do genoma nuclear, foram seqüenciadas 21 regiões do genoma de cloroplasto, produzindo um total de cinco regiões plastidiais polimórficas (quatro microssatélites e um SNP – Single Nucleotide Polymorphism). As regiões de microssatélites de cloroplastos polimórficas foram isoladas pela primeira vez em Bromeliaceae. Os cinco marcadores plastidiais foram examinados em 192 indivíduos de 13 populações, com objetivo de inferir a história filogeográfica da espécie (Capítulo 4). Os principais resultados indicaram uma forte estrutura filogeográfica e um reduzido fluxo gênico entre as populações de V. gigantea. A razão de 3,3 indicou assimetria entre o fluxo de pólen e sementes, sendo o fluxo gênico via semente menos eficaz do que via pólen, resultando em uma maior estruturação do genoma do cloroplasto do que do genoma nuclear (microssatélites nucleares). A rede de haplótipos revelou dois grupos filogeográficos distintos: Norte e Centro-Sul. A análise da distribuição de mismatch mostrou que populações da região Norte são mais estáveis e devem ter tido um crescimento ancestral (antigas), enquanto que as populações da porção Centro-sul estão em expansão (jovens). No Capítulo 5, a fertilidade de plantas das populações do sul foi analisada através do número cromossômico, comportamento meiótico e viabilidade do pólen. A maioria das células-mãe-de-pólen apresentou comportamento meiótico regular, o que está de acordo com a alta viabilidade dos grãos de pólen (84 - 98%) registrada para todas as populações investigadas. Estes resultados indicaram que as plantas das populações analisadas são potencialmente férteis. Apesar da alta viabilidade dos grãos de pólen observada, foram constatadas diferenças significantes entre populações. / V. gigantea is a diploid, perennial and self-compatible bromeliad species endemic to Atlantic Rainforest of southeastern and southern Brazil. Its wild populations have been reduced by anthropogenic disturbance such as habitat destruction and illegal collection. The processes that have shaped the extraordinary species diversity in Neotropical rainforests are poorly understood, and knowledge about patterns of genetic diversity across species’ ranges is scarce. Brazilian Atlantic Rainforest has been considered one of the major biodiversity hotspots for conservation. Intraspecific variation has increasingly been accepted as a focus for conservation. Another issue also of conservation meaning is plant fertility. The quality of pollen produced by a plant is an important component of reproductive success. In order to start studying genetic diversity in Vriesea gigantea a set of 11 nuclear microsatellite markers were developed, and the results published together with four loci characterized for a closed-related species, Alcantharea imperialis (Chapter 2). These fifteen new nuclear microsatellite pair primers were tested in 22 bromeliads species indicating that these markers will be useful in numerous other taxa. Using nuclear microsatellite markers patterns of genetic diversity on V. gigantea were studied all across its geographic distribution in Atlantic Rainforest in a large sampling of 429 plants from 13 populations (Chapter 3). The main results indicated latitudinal trend of decreasing diversity from North to South away from the equator, consistent with historical range expansion from the Northern half of the present distribution range. Further species expansion appears to be impeded by lack of gene flow at the current range margins, and the nature of range limits differs greatly between North and South. The center of genetic diversity for V. gigantea (São Paulo and Rio de Janeiro) coincided with centers of species diversity and endemism for most animals and plants of the Atlantic Rainforest. Significant correlation between genetic diversity in V. gigantea and species diversity in the Vriesea genus suggested that both were shaped by the same historical forces: climatic changes of the Pleistocene. Distance-based genetic analysis revealed three geographically defined clusters, and a Bayesian analysis revealed two additional genetic clusters of conservation relevance. To obtain a more ancient scenario, 21 chloroplast regions were sequenced and screened producing a total of five polymorphic plastid regions (four microsatellites and one SNP - Single Nucleotide Polymorphism). Polymorphic chloroplast microsatellites markers were isolated for Bromeliaceae for the first time. The five cpDNA markers were examined in 192 individuals from 13 populations to infer the phylogeographical history of the species (Chapter 4). The key results indicated a strong phylogeographic structure and a reduced gene flow among populations of Vriesea gigantea. A ratio of 3.3 indicated an asymmetry between pollen and seed flow, being gene flow via seed less efficient than via pollen, resulting in a stronger genetic structure for chloroplast genome than nuclear genome (inferred by nuclear SSR). Haplotype network revealed two major phylogeographic groups: Northern and Central- Southern. Mismatch distribution analysis showed that populations from the Northern region are stable and should have an ancestral growth (“older”), while the populations from Central-Southern region are in expansion range (“younger”). In Chapter 5, the plant fertility of southern populations was analyzed by assessing: chromosome number, meiotic behavior, and pollen viability. Most of pollen mother cells showed a regular meiotic behavior. In accordance, high pollen viability (84-98%) was recorded for all investigated populations. These results indicated that plants from all populations analyzed are fertile. Despite the overall high pollen viability, significant differences were detected among populations.

Este trabalho teve como principais objetivos conhecer a composição quali-quantitativa da ictiofauna do arroio Taquarembó através da freqüência de ocorrência e abundância relativa das espécies numa escala espaço-temporal; analisar a diversidade de espécies de peixes do ambiente no que diz respeito à riqueza, dominância e equitabilidade; conhecer a similaridade da ictiofauna em diferentes trechos do arroio Taquarembó, avaliando o grau de substituição de espécies em um gradiente espacial e reconhecer possíveis relações entre os fatores ambientais como: fotoperíodo, pluviosidade, temperatura da água, condutividade e concentração de oxigênio dissolvido na água com a estrutura da comunidade de peixes. Este estudo foi realizado no Arroio Taquarembó, afluente da margem direita do rio Santa Maria, que faz parte da bacia do rio Ibicuí, que por sua vez pertence ao sistema hidrográfico do rio Uruguai. O estudo foi desenvolvido em três pontos sendo dois na área do futuro reservatório, e um à jusante da área prevista para o barramento. Foram realizadas 13 amostragens no arroio Taquarembó, no período entre junho de 2006 e julho de 2007. Ao total foram coletadas 85 espécies de peixes, pertencentes a 8 ordens e 23 famílias. Destas 85 espécies, 33 (38,82%) foram consideradas constantes, 13 (15,29%) foram acessórias e 39 (45,88%) acidentais. Foram coletados 21.125 espécimes e a biomassa total obtida foi de aproximadamente 195kg de peixes. Os Characiformes e Siluriformes foram os principais grupos formadores da ictiofauna do arroio Taquarembó com 41,17% e 40% respectivamente. Outro grupo importante na caracterização sistemática da comunidade foi a família Cichlidae de Perciformes com 11,74% das espécies. As espécies constantes mais importantes em termos de abundância numérica foram: Heterocheirodon yatai; Characidae Gênero novo espécie nova; Bryconamericus iheringii; Diapoma terofali; Cyanocharax alegretensis; Gymnogeophagus gymnogenys; Pachyurus bonariensis; Cyphocharax voga; Gymnogeophagus rhabdotus; Loricariichthys anus; Astyanax jacuhiensis; Steindachnerina brevipinna; Acestrorhynchus pantaneiro e Hypostomus commersoni. As espécies constantes mais importantes em termos de biomassa foram: Loricariichthys anus; H. commersoni; Hoplias lacerdae; P. bonariensis; A. pantaneiro; Schizodon nasutus; Apareiodon affinnis; Astyanax aff. fasciatus; B. iheringii; Crenicichla scottii; C. voga; H. yatai; Iheringichthys labrosus; Oligosarcus oligolepis; Pimelodus maculatus; Serrasalmus maculatus e S. brevipinna. Os métodos de captura ativa foram mais relevantes em relação à abundância numérica enquanto que as redes de espera foram mais importantes para o item biomassa. O índice de diversidade foi mais destacado quando calculado para biomassa. Os pontos amostrais apresentaram baixa similaridade quanto à abundância e apenas 20 espécies foram comuns aos três pontos. Com o aumento da complexidade do ambiente houve considerável aporte de espécies no sentido montante - jusante.

Dyckia distachya Hassler é uma espécie rara, endêmica e exclusiva de ambientes reofíticos. Originalmente, essa bromélia ocorria em ilhas e margens rochosas da bacia do rio Uruguai, possuindo distribuição disjunta ao longo de 617 km, nos rios Pelotas e Uruguai, na divisa dos estados do Rio Grande do Sul e de Santa Catarina. Entretanto, devido ao aproveitamento do potencial hidrelétrico dessa bacia hidrográfica, sete das oito populações de D. distachya foram extintas, sendo conhecida atualmente apenas uma população na natureza. Visando a preservação dessa espécie, indivíduos foram coletados durante a construção das hidrelétricas e mantidos em coleções ex situ. Posteriormente, parte desses indivíduos resgatados foi introduzida em locais semelhantes aos de sua ocorrência natural. Neste contexto, este estudo foi realizado com o objetivo de avaliar o sucesso reprodutivo e aspectos genéticos da única população natural e de populações introduzidas, para obter informações que auxiliem na elaboração de estratégias de conservação para essa espécie. No Capítulo II é apresentado o estudo do sucesso reprodutivo da única população natural conhecida e de quatro populações introduzidas de D. distachya. Também foram avaliados a produção média de flores, frutos e sementes; o número médio de indivíduos reprodutivos e vegetativos; a germinação das sementes e a viabilidade do pólen; o tamanho médio dos genets e o número médio de ramets por genet. Os resultados mostraram diferenças significativas entre as populações introduzidas e a natural para todas as variáveis analisadas, sendo observado maior investimento em reprodução sexual nas populações introduzidas e maior investimento em propagação clonal na população natural. A produção média de flores, frutos e sementes foi superior nas populações introduzidas (34,1; 37,5; 87; respectivamente) quando comparadas com a população natural (2,7; 5,9; 31; respectivamente). A viabilidade do pólen também foi superior nas populações introduzidas (92 %) em relação a natural (47,9 %). Entretanto, o número médio de ramets por genet e o tamanho médio dos genets foi superior na população natural (297,6 e 2,172 m², respectivamente) quando comparado com a média das populações introduzidas (5,9 e 0,122 m², respectivamente). A introdução dessa bromélia deve ser levada em consideração em programas de conservação, visto que as populações introduzidas estudadas parecem estar conseguindo se estabelecer em seu novo habitat, tendo sido observado inclusive o recrutamento de novos indivíduos através de sementes. No Capítulo III foram investigados a diversidade genética, o sistema de cruzamento e o fluxo de pólen da espécie em estudo, nas quatro populações introduzidas e na natural, utilizando marcadores moleculares microssatélites. Para as cinco populações, foram coletadas amostras de 130 indivíduos reprodutivos, das quais 50 foram utilizadas como plantas-mãe, provendo 700 plântulas. As populações introduzidas apresentaram altos níveis de diversidade genética ( O = 0,466) comparadas com a natural ( O = 0,167). A estimativa da taxa de fecundação cruzada nas populações introduzidas não diferiu de um ( m = 0,965), indicando que D. distachya é uma bromélia alógama. Porém, na população natural, esse valor foi diferente ( m = 0,520), sugerindo a ocorrência de algum tipo de perturbação nesse ambiente. O fluxo de pólen é mais restrito na população natural ( FT = 0,296) do que nas introduzidas ( FT = 0,089). A dispersão de pólen ocorre a curtas distâncias, parecendo ser influenciada pela combinação da densidade e da distribuição espacial dos indivíduos reprodutivos. Baseado nestes resultados, sugerimos que os índices de diversidade genética e fluxo de pólen sejam monitorados em longo prazo, na tentativa de evitar a redução da diversidade genética, a seleção local e a deriva genética. Além disso, recomendamos a criação de novas áreas de introdução, intermediárias as existentes, promovendo a formação de metapopulações. Um estudo mais aprofundado na população natural também deve ser realizado para saber o que realmente está ocorrendo naquele ambiente para serem tomadas medidas efetivas de conservação. / Dyckia distachya Hassler is a rare, endemic and exclusive species of rheophytic environments. Originally, this bromeliad occurred on islands and rocky shores of the Uruguay River basin, having disjunct distribution over 617 km in Pelotas and Uruguay rivers, bordering the states of Rio Grande do Sul and Santa Catarina. However, due to the exploitation of the hydroelectric potential of this basin, seven of the eight populations of D. distachya were extinguished, being currently known only one population in nature. Aiming the preservation of this species, individuals were collected during the construction of hydroelectric and maintained in ex situ collections. Later, some of these rescued individuals were introduced in similar places to their natural occurrence. In this context, this study was carried out to evaluate the reproductive success and genetic aspects of the only natural population and introduced populations, to obtain information to assist in the development of conservation strategies for this species. In Chapter II is presented the study of reproductive success of the only known natural population and four introduced populations of D. distachya. Were also evaluated the average production of flowers, fruits and seeds; the average number of reproductive and vegetative individuals; seed germination and pollen viability; the average size of genets and the average number of ramets per genet. The results showed significant differences between natural and introduced populations for all variables analyzed, being observed higher investment in sexual reproduction in the introduced populations and greater investment in clonal propagation in the natural. The average production of flowers, fruits and seeds were higher in introduced populations (34.1; 37.5; 87; respectively) when compared with the natural population (2.7; 5.9; 31; respectively). Pollen viability was also higher in introduced populations (92 %) in relation to natural (47.9 %). However, the average number of ramets per genet and the average size of the genets were higher in the wild population (297.6 and 2,172 m², respectively) when compared to the average of the introduced populations (5.9 and 0.122 m², respectively). The introduction of this bromeliad should be considered in conservation programs, since the introduced populations studied seem to be getting to settle in their new habitat, having been observed including the recruitment of new individuals from seeds. In Chapter III were investigated the genetic diversity, mating system and pollen flow of this species in the four introduced populations and natural one, utilizing microsatellite markers. For the five populations, samples from 130 reproductive individuals were collected, of which 50 were used as mother plants, providing 700 seedlings. Introduced populations showed high levels of genetic diversity ( O = 0.466) compared with the natural ( O = 0.167). The estimated outcrossing rate in introduced populations did not differ from one ( m = 0.965), indicating that D. distachya is an alogamous bromeliad. However, in natural population, this value was different ( m = 0.520), suggesting the occurrence of some kind of disturbance in this environment. Pollen flow is more restricted in natural population ( FT = 0.296) than in introduced ( FT = 0.089). The pollen dispersal occurs over short distances, appearing to be influenced by the combination of density and spatial distribution of reproductive individuals. Based on these results, we suggest that the rates of genetic diversity and pollen flow should be monitored in the long term, in an attempt to avoid a reduction in genetic diversity, site selection and genetic drift. Additionally, we recommend the creation of new areas of introduction, intermediate of those already existing, promoting the formation of metapopulations. A further study in natural population must also be done to find out what is really occurring in that environment for effective conservation measures are taken.

Melanophryniscus dorsalis, conhecido popularmente por flamenguinho, pertence à família Bufonidae (Anura) e apresenta coloração aposemática, com uma linha vermelha médio-dorsal num fundo preto e manchas vermelhas na parte ventral. A espécie possui tamanho pequeno, hábito de vida diurno e reprodução explosiva ligada a grandes precipitações. Seu habitat é caracterizado por campos ou vegetação baixa de dunas em solo arenoso nas zonas costeiras do Rio Grande do Sul e sul de Santa Catarina. É considerada como vulnerável nas listas vermelhas da IUCN, brasileira e do estado do Rio Grande do Sul e em perigo no estado de Santa Catarina. Acredita-se que a espécie tenha sofrido declínios populacionais e sua principal ameaça seja a perda e degradação do habitat devido à urbanização. A fragmentação causada pela degradação do habitat pode levar a um isolamento das populações, e consequente diminuição na dispersão, aumento da endogamia e redução da variabilidade genética, podendo ocasionar diminuição do fitness, bem como a capacidade de adaptação a mudanças ambientais. Com o objetivo de avaliar a diversidade genética e estruturação populacional de M. dorsalis, foram desenvolvidos marcadores microssatélites e aplicados em populações da espécie ao longo de sua distribuição. Primers foram desenhados para nove loci de microssatélites desenvolvidos, e caracterizados em 35 indivíduos pertencentes a duas populações. Estes nove loci foram utilizados em 80 espécimes, oriundos de 10 locais amostrados entre Laguna (SC) e Rio Grande (RS) englobando toda a distribuição conhecida. A heterozigosidade média observada variou entre 0,47 e 0,64 e o número médio de alelos entre 3,33 e 6,44 nas populações amostradas. Os resultados obtidos mostraram um indício na estruturação genética influenciada por canais d’água como barreiras geográficas ao fluxo gênico, proporcional à distância entre as margens de cada rio ou canal avaliado. O isolamento por distância também foi um fator de diferenciação genética entre as populações amostradas. Foi observada evidência de endogamia em várias localidades, que pode estar relacionada ao modo de reprodução explosiva da espécie. Porém, as três populações testadas para gargalo de garrafa não apresentaram resultados significativos com exceção da localidade de Ilha dos Marinheiros para um dos modelos de mutação testados, podendo estar relacionado ao isolamento de uma pequena população num ambiente insular e a uma distância considerável das demais populações. Mesmo não demonstrando efeitos de gargalo, é necessária especial atenção à espécie pela constante degradação e fragmentação de seu habitat. As populações devem ser tratadas como diferentes unidades de manejo devido a sua estruturação genética apresentada e vê-se a necessidade da criação de mais unidades de conservação ao longo da distribuição de M. dorsalis, para a conservação efetiva da diversidade genética. / Melanophryniscus dorsalis, known as “flamenguinho”, belongs to the Bufonidae Family (Anura), has aposematic color with a red middorsal line in a black background and red spots on their ventral portion. The species has small body size, diurnal habits and explosive breeding during heavy rainfalls. Its habitat is characterized by restricted dunes environment with little vegetation cover, along the seacoast of Rio Grande do Sul and south of Santa Catarina states. The species is considered as vulnerable in IUCN’s, Brasilian’s and Rio Grande do Sul state’s Red Lists and endangered in the Red List of Santa Catarina state. It is believed that M. dorsalis has undergone population declines and is being threatened mainly for the loss and decline of its habitat due to urbanization. Fragmentation caused by these factors may lead to populations’ isolation and less migration between populations, higher levels of inbreeding and genetic variability reduction, and may cause lower fitness, as also less adaptability toward climate changes. The objective in this study was to evaluate genetic diversity and population structure of M. dorsalis, throughout its distribution. For that, microsatellite markers were developed and characterized into 35 individuals belonging to two populations. Primers were designed for nine microsatellite loci, which were used into 80 specimens from ten distinct localities between Laguna (SC) and Rio Grande (RS). Mean observed heterozygosity ranged from 0.47 to 0.64 while the mean number of alleles, from 3.33 to 6.44 on sampled populations. Results recovered showed an evidence of genetic structure influenced by water channels as geographic barriers for gene flow, according to their range between shores. Isolation by distance was also a factor of genetic differentiation among populations sampled. Evidence of inbreeding was observed in several localities, which might be related to species’ explosive breeding behavior. Although, the three populations tested for bottlenecks didn’t show significant results with exception of Ilha dos Marinheiros locality for one of mutational models tested. This may be connected to the isolation of a small population in an island. Even without demonstrating bottleneck effects, careful attention toward the species is necessary. Populations must be treated separately as different management units due to the genetic structure observed and there’s a need for the creation of more conservation units throughout M. dorsalis distribution in order to conserve genetic diversity effectively.

Submitted by Amanda Silva (amanda.osilva2@ufpe.br) on 2015-03-11T14:26:54Z No. of bitstreams: 2 Tese Josiane Santana Monteiro.pdf: 10955046 bytes, checksum: 4e405851eeac883e7daa917660adff42 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-11T14:26:54Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese Josiane Santana Monteiro.pdf: 10955046 bytes, checksum: 4e405851eeac883e7daa917660adff42 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2014-02-24 / CAPES / Os fungos são importantes componentes da cadeia trófica nos ambientes aquáticos, atuando como decompositores da matéria orgânica que é levada para estes sistemas, além de contribuírem para aumentar a palatabilidade do material vegetal utilizado por organismos de outros níveis tróficos. Diversos representantes do reino Fungi estão presentes nos ambientes aquáticos e, dentre esses, os fungos conidias são os mais comuns e bem adaptados a estes ambientes. Ecologicamente, são classificados em três grupos distintos de acordo com seus ciclos de vida: fungos aeroaquáticos, fungos aquáticofacultativos e fungos ingoldianos. Para o Bioma Amazônia os estudos sobre fungos presentes no ambiente aquático ainda são escassos. Assim, o presente trabalho teve por objetivo realizar um estudo taxonômico das espécies de fungos conidiais associadas a substratos vegetais em decomposição submersos em corpos d’água de três fragmentos florestais na região metropolitana de Belém, Estado do Pará. Expedições de coleta foram realizadas na Área de Proteção Ambiental Ilha do Combu, Parque Ecológico de Gunma e Parque Estadual do Utinga, entre abril de 2011 a janeiro de 2013. As amostras de substratos vegetais (folhas e galhos) coletadas foram levadas ao Laboratório de Micologia da Universidade Estadual de Feira de Santana, e submetidas à técnica de lavagem em água corrente. Os substratos foram colocados em câmaras-úmidas e incubados à temperatura ambiente por um período de 30 dias e, diariamente, foram analisados em estereomicroscópio. Lâminas permanentes foram confeccionadas com as estruturas reprodutivas e a identificação dos espécimes baseou-se em estudos morfológicos. As lâminas foram incorporadas ao Herbário da Universidade Estadual de Feira de Santana (HUEFS) e Herbário Padre Camille Torrend (URM). Os resultados deste estudo incluem o registro de 235 espécies fúngicas com a descrição de dois novos gêneros (Helicodochium e Atrogeniculata) e dez novas espécies incluídas em Arachnophora, Ceratosporella, Dictyochaeta, Fusichalara, Fusticeps, Nigrolentilocus e Thozetella. Vários novos registros foram encontrados e, dentre estes, 22 para o Brasil; 23 para América do Sul; três para o Neotrópico e 21 para o Continente Americano. Este estudo contribui para ampliar o conhecimento da diversidade de fungos conidiais presentes em ambientes aquáticos no Brasil, particularmente na Amazônia brasileira, ressaltando a importância de se explorar novos habitats em pesquisas micológicas.

Submitted by Chaylane Marques (chaylane.marques@ufpe.br) on 2015-03-13T18:44:16Z No. of bitstreams: 2 Dissert. Camila Tenorio França PPGCB.pdf: 5895108 bytes, checksum: daba019b5bd4acf2d9d72976ba7c959f (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-13T18:44:16Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissert. Camila Tenorio França PPGCB.pdf: 5895108 bytes, checksum: daba019b5bd4acf2d9d72976ba7c959f (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2012-08-08 / CAPES / Yersinia pestis é o agente causador da peste, doença primária de roedores transmitida por pulgas, que pode afetar o homem e outros mamíferos. A subtipagem molecular das cepas de Y. pestis tem sido dificultada pela grande similaridade genética entre os isolados. A análise dos locos CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) trouxe avanços em estudos filogenéticos e tipagem de cepas de Y. pestis dos numerosos focos dos diversos países. O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade intraespecífica em cepas brasileiras de Y. pestis através do estudo dos locos CRISPR. As três sequências CRISPR (YPa, YPb e YPc) reconhecidas da Y. pestis foram amplificadas nas 98 cepas analisadas, originadas de diferentes fontes, focos e momentos epidemiológicos. Os amplicons obtidos por PCR foram analisados em gel de agarose e sequenciados. O loco YPa se mostrou o mais polimórfico, apresentando seis alelos de 449 a 630 pares de base (pb), seguido pelo YPb, com quatro alelos de 271 a 392 pb. O loco YPc, monomórfico, apresentou apenas um alelo de 331 pb em toda as cepas. Foi observado que as repetições diretas (DRA) são compostas de 28 pb, separadas por sequências espaçadoras únicas de 32 ou 33 pb em todos os locos. Dos 137 espaçadores já conhecidos 18 foram encontrados nas cepas analisadas e, adicionalmente, 19 novos espaçadores foram observados, 15 no loco YPa e quatro no loco YPb. A análise da distribuição dos espaçadores definiu 20 perfis genotípicos, refletindo a diversidade intraespecífica das cepas brasileiras, e evidenciou uma correlação entre a presença de alguns conjuntos de sequências espaçadoras e os focos de origem das cepas. A maioria dos perfis é exclusiva de uma cepa de um foco, e alguns são dispersos em vários focos e períodos. As incorporações/perdas de motivos observadas nos locos YPa e YPb sugerem que estes estão ativos e a ausência de alterações no loco YPc sugere inatividade. Em conclusão, a análise dos locos CRISPR revelou heterogeneidade e identificou características genéticas exclusivas nas cepas brasileiras que podem ser atribuídas à microevolução da bactéria após sua introdução no país.

Submitted by Leonardo Freitas (leonardo.hfreitas@ufpe.br) on 2015-04-09T18:53:23Z No. of bitstreams: 2 Tese Michelle Silva.pdf: 1263837 bytes, checksum: d0c870e1adc5b9222b3441e165742228 (MD5) license_rdf: 9 bytes, checksum: 42dd12a06de379d3ffa39b67dc9c7aff (MD5) / Made available in DSpace on 2015-04-09T18:53:23Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese Michelle Silva.pdf: 1263837 bytes, checksum: d0c870e1adc5b9222b3441e165742228 (MD5) license_rdf: 9 bytes, checksum: 42dd12a06de379d3ffa39b67dc9c7aff (MD5) Previous issue date: 2009-07-01 / Fungos endofíticos são reconhecidos pela sua relevância ecológica, habilidade para produzir metabólitos secundários com diferentes estruturas químicas e importância biotecnológica. A proposta deste trabalho foi estimar a riqueza, abundância e diversidade dos fungos endofíticos de Laguncularia racemosa (L.) Gaertn., bem como avaliar a atividade antibacteriana e isolar o princípio ativo. As folhas de L. racemosa foram coletadas no estuário do rio Paripe, Vila Velha, Itamaracá, Pernambuco. Setenta linhagens de fungos endofíticos foram obtidas a partir de 140 fragmentos de folhas, resultando numa colonização de 50%. A espécie Paecilomyces variotii foi a mais representativa com 19,3% de colonização, seguida por Mycelia Sterilia (8,6%), Penicillium sp. (7,2%), Trichoderma sp. (5%) e Aspergillus niger (4,3%) e espécies que foram pouco expressivas como Fusarium sp., Guignardia bidwellii e Basidiomycota com 1,4%, enquanto Curvularia pallescens e Periconia sp. com 0,7%. O teste de atividade antibacteriana foi realizado pelo método de difusão em disco de papel e, dentre as 70 linhagens de fungos, apenas 34 (48,6%) foram capazes de produzir metabólitos secundários com atividade antibacteriana. Micrococcus luteus foi o microrganismo mais sensível, seguido por Bacillus subtilis (10 a 23,5 mm), Staphylococcus aureus (10 a 21 mm), Enterococcus faecalis (10,5 a 20 mm) e Escherichia coli (10,5 a 16,75 mm). O extrato bruto de P. variotii FEL32 foi submetido à cromatografia e camada delgada usando o sistema de solvente AcOEt:MeOH (9:1,v/v) e resultou em duas bandas de Rf 0,48 e 0,70. A bioatividade frente à B. subtilis foi confirmada ao redor das bandas. O extrato foi submetido à cromatografia em coluna de sílica gel eluído com CHCl3/MeOH e o princípio ativo identificado por ressonância magnética nuclear e espectroscopia de massa, sendo identificada como viriditoxina (6-6’-binafto-α-pirona). A concentração mínima inibitória de viriditoxina resultou em valores de 0,5 μg/mL para Staphylococcus aureus, 1 μg/mL para Staphylococcus sp. coagulase negativa, 1 μg/mL para Micrococcus sp. e 2 μg/mL para Enterococcus sp. Nossos resultados confirmam o grande potencial dos fungos endofíticos, especialmente de ambiente estuarino. Este trabalho é o primeiro relato do isolamento de viriditoxina pelo fungo de ambiente estuarino P. variotii. Como perspectiva, muitos grupos de fungos de diferentes biomas estão esperando para serem explorados.

Submitted by Felipe Lapenda (felipe.lapenda@ufpe.br) on 2015-04-10T12:40:08Z No. of bitstreams: 2 Dissertação Auristela Rocha.pdf: 1403825 bytes, checksum: 4780ab1f109e532f0d37fd71e3a7c89a (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-04-10T12:40:08Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação Auristela Rocha.pdf: 1403825 bytes, checksum: 4780ab1f109e532f0d37fd71e3a7c89a (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2013-08-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A pesquisa desenvolvida teve como objetivo compreender como as propostas de formação continuada de professores, oferecidas pela Secretaria de Educação, Esporte e Lazer da Prefeitura da Cidade do Recife (SEEL/PCR), vêm se constituindo para atender à diversidade do alunado na escola. Neste estudo, buscamos não apenas delinear as propostas de formação continuada, como também analisar as concepções emergentes das propostas de formação de professores da rede municipal, além de compreender o percurso realizado e o desenvolvimento das ações formativas, no período de 2009 a 2012. A formação continuada de professores é entendida neste estudo como uma possibilidade de ressignificar a prática educacional em direção à chamada Educação para todos, a partir da qual acreditamos que “a formação não se constrói por acumulação de cursos, mas sim através de um trabalho de reflexividade crítica sobre as práticas” (NÓVOA, 2002, p. 57). Para tanto, delineamos nossa pesquisa com enfoque na abordagem qualitativa, do tipo estudo de caso, em que realizamos tanto análise documental, como também aplicamos entrevistas semiestruturadas com os responsáveis pelo planejamento e execução das propostas de formação continuada, ou seja, o diretor de ensino e os gerentes da SEEL/PCR. Tomamos como base para a análise dos dados o procedimento de Análise de Conteúdo descrito por Bardin (1977), onde adotamos a análise temática na qual delimitamos as unidades de significação (frases, palavras ou parágrafos) expressas nos dados coletados. O estudo revelou que as propostas formativas oferecidas por cada unidade gerencial da Secretaria de Educação, pressionadas pelas políticas de avaliação e desempenho educacional, através de ações formativas aos professores da rede, buscam obter resultados que respondam satisfatoriamente aos índices avaliativos a contento. Com isso, ofertam massivamente cursos pontuais, direcionados ao ensino de língua portuguesa e matemática, colocando à margem temas que discutam a pluralidade cultural, social, psicológica e física dos alunos. Diante disso, os temas que elevam a compreensão do professor sobre seus alunos, limites e possibilidades de aprendizagem, bem como a presença de temas como cultura, diversidade e inclusão, ainda são vistos como questões periféricas na formação continuada dos professores. Desta forma, nosso estudo revela a necessidade de investimentos mais incisivos por parte dos gerentes da educação municipal, com vistas à disposição de tempo, espaços, temas e metodologias que favoreçam a reflexão-crítica dos educadores, onde os mesmos sejam capazes de banir, definitivamente, todo e qualquer episódio de exclusão e discriminação do contexto educacional.