Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2016-01-07T15:35:40Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Fábio Martins Labecca - 2015.pdf: 2107333 bytes, checksum: cf5e7e0ac514e7f834e6ed7aab735b5d (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2016-01-07T15:37:02Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Fábio Martins Labecca - 2015.pdf: 2107333 bytes, checksum: cf5e7e0ac514e7f834e6ed7aab735b5d (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-07T15:37:02Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Fábio Martins Labecca - 2015.pdf: 2107333 bytes, checksum: cf5e7e0ac514e7f834e6ed7aab735b5d (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2015-04-29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The increasing demand for timber and pulpwood has triggered an increase in areas of tree monocultures. The effects of native vegetation conversion in such monocultures have been extensively debated, but the consequences of this land use change to functionality and evolutionary history conservation have been little studied. Here, we evaluated how the avifauna responds to nature ecosystem conversion in tree monocultures by quantifying changes in local diversity (alpha diversity) and in assemblage composition (beta diversity), in their functional and phylogenetic components. We compiled forty paired bird lists in native vegetation areas and in comparable tree monoculture areas. Changes in alpha diversity were quantified by paired tests of observed values in native vegetation and in tree monocultures, and changes in assemblages composition through additive partitioning of beta diversity in nestedness and turnover components. We observed that tree monocultures are impoverished in number of species, supporting lower functional richness and less functionally similar assemblages. This demonstrates that environmental filter selecting and limiting similarity processes concurrently modify functional structure of bird assemblages, resulting in loss of functional complementarity and redundancy. Species in tree monocultures are also evolutionary younger and less related to each other. We showed that bird assemblages in tree monoculture are composed largely by functionally and phylogenetic different species from that assemblages in native vegetation. Body size, diet and foraging traits were the major functional traits in predicting the absence of the species in tree monocultures. Alson, we show that annual average temperature, annual average pluviosity and stage of understory development in tree monocultures are important predictors of diversity loss in these type of monoculture. / A crescente demanda por madeira e celulose tem desencadeado um aumento das áreas de monocultura florestal. Os efeitos da conversão de áreas de vegetação nativa nesse tipo de monocultura, por sua vez, vêm sendo extensamente debatidos. As consequências dessa mudança no uso do solo para a funcionalidade e conservação da história evolutiva foram até agora pouco estudadas. Neste estudo, nós avaliamos como a avifauna responde a conversão de ecossistemas naturais em monoculturas florestais, quantificando mudanças na diversidade local (diversidade alfa) e na composição dessas assembleias (diversidade beta) em seus componentes funcional e filogenético. Para isto, compilamos quarenta listas pareadas de aves em áreas de vegetação nativa e em áreas comparáveis de monocultura florestal. As mudanças na diversidade alfa foram testadas por testes pareados dos valores observados em vegetação nativa e em monoculturas florestais, e as mudanças na composição das assembleias através da partição aditiva da diversidade beta nos componentes de aninhamento e substituição. Observamos que as áreas de monocultura florestal são empobrecidas no número de espécies, suportam menor riqueza funcional e são menos similares funcionalmente. Isto demonstra que os processos de filtro ambiental e de similaridade limitante modificam a estrutura funcional das assembleias de aves de forma concomitante, resultando em perda de complementaridade e também de redundância funcional. As espécies presentes em áreas de monocultura são também evolutivamente mais jovens e menos aparentadas entre si. Mostramos que as assembleias de monoculturas florestais são compostas em grande parte por espécies funcionalmente e filogeneticamente diferentes daquela avifauna em vegetação nativa. Tamanho corpóreo, dieta e estratégias de forrageamento se mostraram as características funcionais importantes na predição da ausência das espécies em monoculturas florestais. Ainda, mostramos que temperatura e pluviosidade média anual, e o estádio de desenvolvimento do sub-bosque são importantes preditores da perda de diversidade nesse tipo de monocultura.

Submitted by Geyciane Santos (geyciane_thamires@hotmail.com) on 2015-12-07T20:38:11Z No. of bitstreams: 1 Tese - Ítalo Thiago Silveira Rocha Matos.pdf: 4852204 bytes, checksum: 26dcb8f7e9bee43bd7db644ef480f8c2 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-01-19T18:27:20Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese - Ítalo Thiago Silveira Rocha Matos.pdf: 4852204 bytes, checksum: 26dcb8f7e9bee43bd7db644ef480f8c2 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-01-19T18:28:50Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese - Ítalo Thiago Silveira Rocha Matos.pdf: 4852204 bytes, checksum: 26dcb8f7e9bee43bd7db644ef480f8c2 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-19T18:28:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese - Ítalo Thiago Silveira Rocha Matos.pdf: 4852204 bytes, checksum: 26dcb8f7e9bee43bd7db644ef480f8c2 (MD5) Previous issue date: 2015-02-27 / Não Informada / Microorganisms and animal association was too important for evolutive success of Metazoa, principally for wood-feeding insects. Assuming that: i) xylophagous insects have symbiotic association to its intestinal microbiota; ii) microbial community of insects gut is a hyperdiverse habitat, with high richness in undescribed strains and species; iii) the knowledge about this microbiota can to provide tools for producing biofuels and other value-added chemical compounds; the aim of this work was to isolate and identify yeasts associated to intestinal content of Veturius transversus (Passalidae, Coleoptera, Insecta, Arthropoda, Metazoa), able to metabolize sugarcane bagasse hemicellulosic hydrolyzate (SBHH) with xylitol production. After this, one of the isolates was selected to have its cultivation in SBHH characterized. Sugarcane bagasse hydrolysis was evaluated about obtaining total reducing sugar and D-xylose. Then, the yeasts were isolated and identified using biochemical profile and the nucleotide sequences of ribosomal genes (ITS). Each isolated strain was evaluated for ethanol and xylitol production, and lastly, the strain named VT01 had its growing in SBHH characterized. The hydrolysis method employed leads to obtaining, on average, 60,59 g/L of total reducing sugar, of which 71,13% is D-xylose. A total of 20 colonies were isolated, being 11 distinct biochemical profiles distributed at 3 clades. Except VT12 and VT13 strains, all isolates are able to producing xylitol, with high yield (average of 45,37%) observed to Geotrichum sp. (VT01). Futhermore, Geotrichum sp. (VT01) was able to consume the microbial inhibitors acetic acid (78,88 %), hydroxymethyl-furfural (83,47%) and furfural (98,78%). These results allow to conclude that: i) the isolated strains exhibit phenotypic variation, occurring differents biochemical profiles for the same species; ii) Geotrichum sp. (VT01) is the most promising isolate for xylitol production, showing high tolerance against microbial inhibitors; iii) furfural consumption by Geotrichum sp. (VT01) is performed in co-metabolism with glucose, being not used as carbon source for cell growth. / A associação entre micro-organismos e metazoários foi decisiva para o sucesso evolutivo destes últimos, sobretudo no que se refere a capacidade de digerir e assimilar substratos poliméricos complexos. Admitindo que: i) insetos xilófagos apresentam alta dependência de sua microbiota intestinal; ii) o conteúdo intestinal destes insetos é abundante em espécies ou linhagens ainda não descritas; iii) o conhecimento desta microbiota poderá fornecer ferramentas para obtenção de combustíveis e outros produtos com valor agregado a partir da biomassa lignocelulósica; o objetivo deste trabalho foi isolar e identificar leveduras, associadas ao conteúdo intestinal do besouro Veturius transversus (Passalidae, Coleoptera, Insecta, Artrhopoda, Metazoa), hábeis em metabolizar hidrolisado hemicelulósico de bagaço de cana-de-açúcar (HACA), investigando a seguir a capacidade destas em produzir xilitol neste substrato. Por fim, um dos isolados foi selecionado para caracterização do seu crescimento quando cultivado em HACA. Inicialmente, o processo de hidrólise do bagaço foi analisado quanto à obtenção de açúcar redutor total e D-xilose. A seguir, as leveduras foram isoladas e identificadas segundo o perfil bioquímico e sequências de nucleotídeos de genes ribossomais (ITS). Todos os isolados foram submetidos a teste de produção de etanol e xilitol e, por fim, o isolado VT01 teve seu crescimento em HACA caracterizado. O protocolo de hidrólise de bagaço empregado conduziu, em média, a obtenção de 60,59 g/L de açúcar redutor total, sendo a maior parte deste (71,13%) D-xilose. Um total de 20 colônias de leveduras foram isoladas, distribuídas em 11 perfis bioquímicos e três clados distintos. Exceto os isolados VT12 e VT13 (Geotrichum sp.), todos foram hábeis em produzir xilitol. O cultivo de Geotrichum sp. (isolado VT01) indicou a habilidade deste em produzir xilitol com rendimento médio de 45,37%, sendo ainda hábil em consumir inibidores do crescimento microbiano gerados durante o processo de hidrólise, a saber, hidroximetil-furfural (83,47%), ácido acético (78,88%) e, principalmente, furfural (98,78%). Face aos resultados, se conclui que: i) os isolados apresentam variedade fisiológica, havendo indivíduos da mesma espécie com perfis bioquímicos divergentes; ii) Geotrichum sp. (VT01) é o isolado com maior potencial para produção de xilitol, apresentando maior tolerância aos inibidores do crescimento microbiano; iii) o consumo de furfural por Geotrichum sp. (VT01) ocorre em co-metabolismo com glicose, sendo que este inibidor não é utilizado como fonte de carbono para produção de biomassa.

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-08-16T19:39:33Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_João Filho_REDE BIONORTE.pdf: 2326815 bytes, checksum: e33f835eebcfc5d61454aae8ec076e58 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-08-16T19:56:06Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_João Filho_REDE BIONORTE.pdf: 2326815 bytes, checksum: e33f835eebcfc5d61454aae8ec076e58 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-16T19:56:06Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_João Filho_REDE BIONORTE.pdf: 2326815 bytes, checksum: e33f835eebcfc5d61454aae8ec076e58 (MD5) Previous issue date: 2017-03-27 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / Studies of the factors that promoter the distribution of species' are one of the most accepted ways of science for understanding of organization and stability of natural populations. Unveiling these mechanisms is crucial to adopt preservation's actions, which intend ensures permanence of populations on natural ecosystems. Hence, we investigated for five years the ichthyofauna of the Madeira River Basin. Our aim was to understand the origin of the factors involved on organization and stability of fish assemblage along this basin. Therefore, this thesis is divided into three chapters. The first one refers to distribution of the alpha, beta and gamma diversity of fish assemblage from Madeira River, before and after construction of Santo Antonio Hydroelectric Plant. In this chapter, we investigated of hierarchical partitioning of diversity, as a way of understanding the origin of the regional diversity, the division of extension spatial of the study area in sub scales. As a result, we noticed the gamma diversity composition, originated on micro spatial scales and regulated by beta diversity. The second chapter shows a test of the Unified Neutral Theory of Biodiversity on the distribution of abundance of fish species from Madeira River. We investigated the capacity of prediction of this theory on abundance of fish species in a high diversity place. We also compared the adjustment of abundances distribution between the model neutral and model lognormal, which is largely known by your high capacity on natural assemblage. The final chapter refers to functional organization of fish assemblage from Madeira River, published on "Ecology and Biology of fish from Madeira River", a book which compiles ecological and biological informations of the ichthyofauna from Madeira River. In this chapter, we investigated the organization of the species according to their trophic guilds and geomorphological characteristics of the sites where they are inserted. This thesis reveals the way and the mains mechanisms that are responsible for organization and stability of the ichthyofauna from Madeira River Basin, as it proposes measures that can be used for fish species' preservation. / O estudo dos fatores que promovem a distribuição das espécies é um dos caminhos mais aceitos atualmente pela ciência, para o entendimento da estruturação e estabilidade das populações naturais. Desvendar estes mecanismos é essencial para adotar medidas de preservação, garantindo a permanências das populações nos ecossistemas naturais. Neste propósito, nós investigamos intensamente por cinco anos a ictiofauna do rio Madeira, procurando entender a origem dos fatores envolvidos no processo de estruturação e estabilidade das populações de peixes de sua bacia. Como produto final da pesquisa, é apresentado a tese subdividida em três capítulos. O primeiro testa a hipótese de que a diversidade alfa e beta de peixes são aleatoriamente distribuídas na bacia do rio Madeira, assim como a origem da diversidade alfa é evidenciada em curtas escalas espaciais (micro-escalas). Como resultado desta investigação, confirmamos a existência de forte hierarquia na composição da diversidade, originada em micro escalas espacial. O segundo capítulo apresenta um teste da Teoria Neutra Unificada da Biodiversidade sobre a distribuição de abundâncias das espécies ícticas do rio Madeira. Neste artigo, investigamos o poder de predição da teoria neutra para determinar o padrão de distribuição de abundâncias de espécies ícticas, em um local de alta diversidade de espécies. Concomitantemente, testamos também a hipótese de que o modelo neutro é melhor ajustado a distribuições de abundância e riqueza de peixes amazônicos, quando comparado a modelos de alta capacidade preditiva (modelo lognormal). O terceiro e último capítulo refere-se ao estudo da organização funcional da assembléia íctica do rio Madeira, publicado na obra: "Ecologia e Biologia de Peixes do Rio Madeira", um livro que compila informações ecobiológicas das populações ícticas da bacia do rio Madeira. Neste capítulo, investigou-se a estruturação das espécies de acordo com suas respectivas guildas tróficas, baseado nas características geomorfológicas dos locais em que estão inseridos. Através deste estudo foi possível confirmar a estruturação funcional da ictiofauna do rio Madeira como dependente da geomorfologia local do habitat em que estão inseridos. Como conclusão geral da tese, observamos que os peixes amazônicos pertencentes a bacia do rio Madeira apresentam estreitas ligações com seus micro-habitats, que fornecem de forma hierárquica toda a base para alta diversidade de espécies observada na bacia, assim como sua estabilidade temporal. Com estes resultados revelados, é possível executar medidas no âmbito da biologia da conservação, a serem utilizadas na preservação das espécies.

RESUMO A Ãgua constitui o recurso de maior importÃncia para o homem, no entanto parece nÃo existir nenhuma preocupaÃÃo do ser humano em preservÃ-la, uma vez que as atividades diÃrias estÃo prejudicando cada vez mais, a qualidade deste recurso. Este trabalho teve por objetivo analisar a estrutura da comunidade fitoplanctÃnica e a qualidade da Ãgua de ecossistemas aquÃticos do Estado do Cearà (Brasil). Foram realizadas coletas mensais nas estaÃÃes chuvosa e seca, entre 2004 e 2007, nos seguintes ecossistemas: estuÃrios dos rios CauÃpe, MundaÃ, Cearà e Malcozinhado; lagoas de Jijoca, PecÃm, Uruaà e Maraponga; bicas do Ipu e das AndrÃas e aÃudes Favelas, da Corte e Campus do Itaperi. Os resultados mostraram mudanÃa significativa na estrutura da comunidade fitoplanctÃnica, influenciada principalmente pelos nÃveis de precipitaÃÃes pluviomÃtricas. As Bacillariophyceae foram predominantes nos ecossistemas analisados, exceto nos aÃudes Favelas, da Corte e do Campus do Itaperi, que apresentaram elevados nÃveis de eutrofizaÃÃo, com dominÃncia de Cyanophyceae, Zygnematophyceae e Chlorophyceae, respectivamente. As espÃcies raras, a grande maioria, formaram um grupo totalmente isolado daquelas consideradas dominantes, abundantes e pouco abundantes, constituÃdas por um nÃmero reduzido de espÃcies, confirmando a grande influÃncia sazonal da regiÃo, sobre a comunidade fitoplanctÃnica. Os ecossistemas apresentaram grande variaÃÃo na diversidade, riqueza e equitabilidade das espÃcies, no entanto a diversidade foi maior durante a estaÃÃo chuvosa. Com base nos teores de O2 e CO2 dissolvidos, amÃnia total, nitrito, fosfato, bem como, nos Ãndices do estado trÃfico do fosfato e/ou da transparÃncia da Ãgua e na presenÃa de bioindicadores, os estuÃrios dos rios MundaÃ, CauÃpe e CearÃ, a lagoa da Maraponga e os aÃudes Favelas, da Corte e Campus do Itaperi foram classificados como ambientes eutrÃficos; o estuÃrio do Rio Malcozinhado e as lagoas do PecÃm e de Uruaà como mesotrÃficos; e a lagoa de Jijoca e as bicas do Ipu e das AndrÃas como oligotrÃficos. Foram registrados diversos bioindicadores de Ãguas eutrofizadas e/ou poluÃdas, destacando-se a presenÃa de Cyanophyceae potencialmente tÃxicas nos diversos ecossistemas, com blooms no estuÃrio do Rio Cearà e no aÃude Favelas, nÃo sendo registrada uma biomassa significativa nos outros ambientes, mesmo naqueles que apresentaram elevado estado trÃfico, como o aÃude do Campus do Itaperi, com ocorrÃncia de bloom de Chlorophyceae e, no aÃude da Corte, cujo bloom foi de Zygnematophyceae, mostrando que na anÃlise de sanidade dos ecossistemas aquÃticos, a anÃlise conjunta dos parÃmetros biolÃgicos e fÃsico-quÃmicos do ecossistema à de suma importÃncia para um parecer ambiental adequado. / Water is the most important resource for humans, though it s eems there is no concern of human beings in preserving it, because daily activities increasingly under mine the quality of this resource. This study aimed to analyze the phytoplankton community structure and water quality in aquatic ecosystems of Cearà State (Brazil). Monthly collections were made during the rainy and dry seasons between 2004 and 2007 in the following ecosystems: the CauÃpe, MundaÃ, Cearà and Malcozinhado river estuarie s; the Jijoca, PecÃm, Uruaà and Maraponga lakes; the Ipu and Andreas waterspouts and the Favelas, Corte and Campus do Itaperi dams. The results showed significant changes in phytoplankton community structure, mainly influenced by levels of rainfall. The Bacillariophyceae were predominant in the ecosystems studied, except in the Favelas, Corte and Campus do Itaperi dams, which showed high levels of eutrophication, with dominance of Cyanophyceae, Zygnematophyceae and Chlorophyceae, respectively. Rare species, the great majorit y, formed a group totally isolated from those considered dominant, abundant and little abundant, consisting of a small number of species, confirming the major seasonal influence of the region's on the phytoplankton community. Ecosystems showed great variation in diversity, richness and evenness of species, however, diversity was highest during the rainy season. The following environments were classified according to the concentration of dissolved O 2 and CO2, total ammonia, nitrite, phosphate, as well as on trophic status indices of phosphate and/or water transparency and on the presence of bioindicators: the MundaÃ, CauÃpe and Cearà river estuaries, Maraponga lake and the Favelas, Corte and Campus do Itaperi dams as eutrophic environments; the Malcozinhado river estuary and PecÃm and Uruaà lakes as mesotrophic environments; and Jijoca lake and the Ipu and AndrÃas waterspouts as oligotrophic environment. Several bioindicators of eutrophic and/or polluted waters were recorded, in partic ular the presence of potentially toxic cyanobacteria in various ecosystems, with blooms in the Cearà river estuary and Favelas dam, while significant biomass was not recorded in other environments, even those showing a high trophic status, such as the Campus do Itaperi dam, with a Chlorophyceae bloom, and the Corte dam, with a Zygnematophyceae bloom, showing that the joint analysis of biological and physicochemical parameters of the ecosystem is of paramount importance for an appropriate environmental assessment of the health of aquatic cosystems.

Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2017-07-03T21:32:32Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Luiz Carlos Catein Filho - 2017.pdf: 1871747 bytes, checksum: b8df9683b9300705a329266d56b95d25 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-07-10T14:27:30Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Luiz Carlos Catein Filho - 2017.pdf: 1871747 bytes, checksum: b8df9683b9300705a329266d56b95d25 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-10T14:27:31Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Luiz Carlos Catein Filho - 2017.pdf: 1871747 bytes, checksum: b8df9683b9300705a329266d56b95d25 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-05-29 / Existem dois tipos de conectividade, estrutural e funcional. Conectividade funcional indica como o comportamento de um indivíduo que está se dispersando pode ser afetado pela estrutura da paisagem e seus elementos. Conectividade estrutural é a conectividade física entre os fragmentos e manchas. A conectividade da mata ciliar é estrutural, porém tem implicações funcionais. Ela é uma característica fundamental dos ecossistemas aquáticos e também é importante para a conservação da biodiversidade, pois facilita a dispersão entre as populações. Ambientes conectados permitem uma maior migração de indivíduos entre os locais e isto resulta em maior riqueza de espécies, visto que espécies extintas localmente podem rapidamente recolonizar o local. A conectividade também pode afetar a diversidade beta, ou seja, a variabilidade na composição de espécies entre manchas de hábitats. A maior dispersão entre ambientes conectados resulta em faunas mais similares, com menor diversidade beta, do que entre ambientes desconectados. Neste trabalho avaliei i) a diversidade alfa em trechos conectados e desconectados por mata ciliar, ii) a diferença na composição de espécies (diversidade beta) entre ambientes conectados e entre não conectados e iii) o efeito da distância entre os trechos desconectados de riachos na diversidade beta. Hipotetizei que a diversidade alfa é reduzida conforme se aumenta o isolamento por desconexão, uma vez que é mais difícil dispersar entre grandes distâncias, que a diversidade beta entre trechos mais desconectados é maior do que entre trechos conectados ao restante da bacia e que trechos mais distantes entre si tendem a possuir maiores valores de diversidade beta, sendo, portanto, mais diferentes. Foram amostrados 13 riachos com três trechos em cada, se dividindo em J1, M1, M2, um mais a jusante dos riachos após a desconexão (J1) e dois conectados à montante antes da desconexão (M1 e M2). Trechos conectados possuem mata ciliar bem preservada em toda sua extensão, enquanto que trechos desconectados possuem uma interrupção da mata ciliar . Dados de sedimento e cobertura vegetal foram coletados para avaliar sua influencia na comunidade. Os trechos desconectados tiveram maior quantidade de sedimento no trecho após a desconexão (J1), já os trechos conectados tiveram em média a mesma quantidade de sedimento. A influência do sedimento explica-se por sua entrada no leito dos córregos e rios modificar os microhabitats e afetar as comunidades tornando-as homogêneas. Houve diferença em relação à diversidade alfa entre os trechos J1e M2 (desconectados), mas não houve diferença significativa entre os trechos J1 e M1 (desconectados) e M1 e M2 (conectados). Os trechos J1-M2 tiveram uma comunidade mais heterogênea do que os trechos J1-M1 e M1-M2, sendo que em relação à abundância, os trechos à baixo da desconexão tiveram uma menor quantidade de indivíduos do que os trechos à cima da desconexão. Os trechos à baixo da desconexão tiveram maior riqueza do que os trechos à cima da desconexão. Entre os conectados não houve diferença na riqueza. Não houve diferença entre os trechos em relação ao dossel. Houve influência da desconexão na diversidade beta, sendo que os trechos desconectados J1-M1 têm maior diversidade beta do que os trechos conectados M1-M2 tanto quando analisados através do índice de Bray-Curtis quanto quando analisados através do índice de Sorensen. Isso ocorre devido à ausência de mata ciliar que impede a dispersão dos insetos entre os trechos realizada pelos adultos através do voo ativo pela mata. Não houve relação entre o aumento da distância de desconexão e a diversidade beta, dessa forma apenas o fato de existir a desconexão já torna as comunidades diferentes, independente da distância de desconexão. Este resultado contradiz diversos estudos recorrentes em que paisagens mais fragmentadas com maiores distâncias entre seus hábitats torna as comunidades mais distintas. / Existem dois tipos de conectividade, estrutural e funcional. Conectividade funcional indica como o comportamento de um indivíduo que está se dispersando pode ser afetado pela estrutura da paisagem e seus elementos. Conectividade estrutural é a conectividade física entre os fragmentos e manchas. A conectividade da mata ciliar é estrutural, porém tem implicações funcionais. Ela é uma característica fundamental dos ecossistemas aquáticos e também é importante para a conservação da biodiversidade, pois facilita a dispersão entre as populações. Ambientes conectados permitem uma maior migração de indivíduos entre os locais e isto resulta em maior riqueza de espécies, visto que espécies extintas localmente podem rapidamente recolonizar o local. A conectividade também pode afetar a diversidade beta, ou seja, a variabilidade na composição de espécies entre manchas de hábitats. A maior dispersão entre ambientes conectados resulta em faunas mais similares, com menor diversidade beta, do que entre ambientes desconectados. Neste trabalho avaliei i) a diversidade alfa em trechos conectados e desconectados por mata ciliar, ii) a diferença na composição de espécies (diversidade beta) entre ambientes conectados e entre não conectados e iii) o efeito da distância entre os trechos desconectados de riachos na diversidade beta. Hipotetizei que a diversidade alfa é reduzida conforme se aumenta o isolamento por desconexão, uma vez que é mais difícil dispersar entre grandes distâncias, que a diversidade beta entre trechos mais desconectados é maior do que entre trechos conectados ao restante da bacia e que trechos mais distantes entre si tendem a possuir maiores valores de diversidade beta, sendo, portanto, mais diferentes. Foram amostrados 13 riachos com três trechos em cada, se dividindo em J1, M1, M2, um mais a jusante dos riachos após a desconexão (J1) e dois conectados à montante antes da desconexão (M1 e M2). Trechos conectados possuem mata ciliar bem preservada em toda sua extensão, enquanto que trechos desconectados possuem uma interrupção da mata ciliar . Dados de sedimento e cobertura vegetal foram coletados para avaliar sua influencia na comunidade. Os trechos desconectados tiveram maior quantidade de sedimento no trecho após a desconexão (J1), já os trechos conectados tiveram em média a mesma quantidade de sedimento. A influência do sedimento explica-se por sua entrada no leito dos córregos e rios modificar os microhabitats e afetar as comunidades tornando-as homogêneas. Houve diferença em relação à diversidade alfa entre os trechos J1e M2 (desconectados), mas não houve diferença significativa entre os trechos J1 e M1 (desconectados) e M1 e M2 (conectados). Os trechos J1-M2 tiveram uma comunidade mais heterogênea do que os trechos J1-M1 e M1-M2, sendo que em relação à abundância, os trechos à baixo da desconexão tiveram uma menor quantidade de indivíduos do que os trechos à cima da desconexão. Os trechos à baixo da desconexão tiveram maior riqueza do que os trechos à cima da desconexão. Entre os conectados não houve diferença na riqueza. Não houve diferença entre os trechos em relação ao dossel. Houve influência da desconexão na diversidade beta, sendo que os trechos desconectados J1-M1 têm maior diversidade beta do que os trechos conectados M1-M2 tanto quando analisados através do índice de Bray-Curtis quanto quando analisados através do índice de Sorensen. Isso ocorre devido à ausência de mata ciliar que impede a dispersão dos insetos entre os trechos realizada pelos adultos através do voo ativo pela mata. Não houve relação entre o aumento da distância de desconexão e a diversidade beta, dessa forma apenas o fato de existir a desconexão já torna as comunidades diferentes, independente da distância de desconexão. Este resultado contradiz diversos estudos recorrentes em que paisagens mais fragmentadas com maiores distâncias entre seus hábitats torna as comunidades mais distintas.

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Tendo em vista a progressiva degradação e perda de habitats naturais, que resultam em declínios populacionais e extinções locais de espécies, torna-se imprescindível e urgente a realização de trabalhos de levantamento faunístico. Inventários são essenciais para melhorar a nossa compreensão da biogeografia da herpetofauna brasileira e para delinear estratégias de conservação efetivas que garantam a preservação do potencial evolutivo das espécies existentes. O nível de conhecimento acerca da biologia e da diversidade de anfíbios e répteis no Brasil, e particularmente no estado de São Paulo, ainda não é satisfatório e uma parcela significativa do que restou de seus ecossistemas foi pouco estudada. Este estudo visou determinar a composição de espécies das comunidades de serpentes, lagartos e anuros do Mosaico de Unidades de Conservação do Jacupiranga (SP) com base em dados coletados em duas localidades e em registros de museus. Foi obtida uma lista com 39 espécies de anuros, uma anfisbena, nove lagartos e 39 serpentes, que provavelmente compõem a herpetofauna do Mosaico. As espécies de anuros capturadas em armadilhas de interceptação e queda e por procura visual foram utilizadas para analisar a eficiência da amostragem. As análises indicaram que, provavelmente, em ambas as localidades e com os dois métodos utilizados, todas as espécies que compõem a comunidade local foram registradas. Com os dados de anuros coletados em armadilhas foram realizadas ainda análises comparando os diferentes ambientes amostrados. Os testes revelaram que há diferenças significativas entre ambientes antropizados e marginais com relação aos ambientes situados em mata melhor preservada. O pequeno número de espécies de répteis amostrados não permitiu que fossem feitas as mesmas análises realizadas para os anuros. A baixa abundância desses animais na natureza e as limitações dos métodos de captura utilizados impossibilitaram a realização de análises de desempenho da amostragem, de estimativas de riqueza e de uso de ambiente. A composição de espécies de anuros, lagartos e serpentes do Mosaico foi comparada com outras localidades a partir de dados disponíveis na literatura e as análises revelaram que, para todos os grupos, as espécies do Mosaico estão mais relacionadas com as comunidades ocorrentes na Floresta Ombrófilo Densa da encosta brasileira, em especial, com aquelas conhecidas para o contínuo de remanescentes florestais do estado de São Paulo que se inicia na Serra do Mar e termina na região do Vale do Ribeira. As informações de história natural, padrões de distribuição, composição de espécies e de seu estado de conservação geradas por esse trabalho podem ser utilizadas como base para o manejo da fauna estudada e para o estabelecimento de medidas conservacionistas pautadas em dados concretos. / Field surveys are urgently in need due to the continuing loss of natural habitats and resulting populational decline and local species extinction. Herpetofaunal surveys are essential to improve our understanding of biogeographical issues concerning this group, and to delineate effective conservation strategies to preserve the evolutionary potential of existing lineages. The knowledge of amphibian and reptile biology and diversity in Brazil, and particulary in the state of São Paulo, is still unsatisfactory. Additionally, a significative portion of the remaining natural areas of this state have been poorly studied. This study aims to determine species composition of anuran, lizard and snake communities from the biological reserve known as Mosaico de Unidades de Conservação do Jacupiranga (SP), and it is based on data collected in two localities as well as on records of museum specimens. As a result, a list with 39 anurans, 1 amphisbaenian, 9 lizards and 39 snakes was produced for the Mosaico. The specimens of anurans recorded during the study were used to analyze sampling effectiveness. This analysis indicated a high probability that all species composing the local community were actually registered. The data of anurans collected in pitfall traps were also used to compare the different environments sampled. The tests showed significant differences among secondary environments, modified by human activities, and mature forests. The same tests could not be done with reptiles due to the small samples captured in pitfall traps. The anuran, lizard and snake assemblages of the Mosaico were compared with other localities assemblages based on data from the literature. Analyses show that the herpetological fauna of the Mosaico resembles more closely to communites present in coastal Atlantic Rainforest, particulary to fauna of the remnants of this ecossistem located between Serra do Mar and Vale do Ribeira in the state of São Paulo. Information on natural history, distribution patterns, species composition and conservation status provided in the present work can be used for faunal management and lead to efficient species conservation planning.

O objetivo principal deste trabalho foi a caracterização e quantificação da variabilidade isoenzimática observada no germoplasma de mandioca (M. esculenta) na agricultura autóctone do sul do estado de São Paulo. A técnica utilizada foi a de eletroforese de isoenzimas em gel de penetrose 30 à 13%. Foram determinados e estudados 12 locos isoenzimáticos, sendo 9 polimórficos, pertencentes a cinco sistemas: malato desidrogenase (MDH - E.C. 1.1.1.37), leucina aminopeptidase (LAP - E.C. 3.4.11.1), xiquimato desidrogenase (SKDH - E.C. 1.1.1.25), alfa-esterase (Alfa-EST - E.C. 3.1.1.1) e aspartato aminotransferase (AAT - E.C. 2.6.1.1). O sistema da peroxidase (PER - E. C. 1. 1 1 .1.7) foi descartado por não apresentar polimorfismo de bandas. O polimorfismo isoenzimático observado nas populações estudadas é função da distribuição geográfica, uma vez que as populações do Litoral sul de São Paulo apresentam maior variabilidade que as populações do Vale do Ribeira. Nas análises dos dados foram estimados os parâmetros de variabilidade entre e dentro de populações, índice de similaridade genética pelos métodos de"Simple Matching"e"Jaccard", obtendo feno gramas pelo método de agrupamento U.P.G.M.A. (Unweighted pair-group method average), entre outros. O sistema de agricultura autóctone praticado pelos agricultores das comunidades negras e caiçaras matem e amplifica o nível de variabilidade intraespecífica, através de processos de hibridação introgressiva, troca de material entre agricultores, fluxo gênico, recombinação, introdução de variedades novas e mutação. Entre as principais conclusões destacam-se as seguintes: Os parâmetros de heterozigosidade média estimados demostraram altos níveis de variação genética para as roças de mandioca (Ho=O,242), sendo superiores à média de dados observados na literatura (Ho=O,225). Os resultados mostraram maior grau de variabilidade dentro das roças, sendo a roça 1 (roça Pedrinhas-1) a mais polimórfica (75,0% de variabilidade ). A diversidade intraespecífica está diretamente relacionada com a estrutura sócio-cultural do local. As etnovariedades foram agrupadas em quatro grupos fenéticos, sendo que a de número 27 (Gema de ovo) formou um único grupo. As etnovariedades pertencentes às populações do litoral apresentaram maior variabilidade do que as populações do vale. Nas análises dos dados foram estimados os parâmetros de variabilidade entre e dentro de populações, índice de similaridade genética pelos métodos de"Simple Matching"e"Jaccard", obtendo fonogramas pelo método de agrupamento U.P.G.M.A., entre outros. As etnovariedades foram agrupadas em quatro grupos fenéticos. O sistema AAT mostrou-se um bom marcador bioquímico para a identificação das etnovariedades. Parâmetros heterozigosidade média estimados demonstraram altos níveis de variação genética para as roças de mandioca (Ho=0,242), sendo superiores ao da literatura (Ho=0,225). A diversidade intraespecífica está diretamente relacionada com a estrutura sócio-cultural-local . As etnovariedades foram agrupadas em quatro grupos fenéticos, sendo que a de número 27 (Gema de ovo) formou um único grupo. Dados de isoenzimas servem para auxiliar os melhoristas nas estratégias de melhoramento genético da mandioca nas roças de agricultura autóctone, no sentido de detectar a distribuição da variabilidade genética presente nas populações. / not available

Agricultores tradicionais autóctones são responsáveis por manter etnovariedades conservadas in situ, e são responsável por processos dinâmicos de amplificação de variabilidade genética. A variabilidade manipulada por estes agricultores pode ser maior do que a variabilidade reconhecida e nomeada sob a forma de etnovariedades. Através da avaliação da variabilidade de mandioca (Manihot esculenta Crantz) manejada por agricultores tradicionais autóctones do sul do litoral paulista e do Vale do Ribeira de Iguape, foram estudadas 10 roças, com os seguintes objetivos: a) Determinar a variabilidade intraespecífica de mandioca, ao nível das etnovariedades, presente num sistema agrícola de corte e queima, através do uso de marcadores bioquímicos (isoenzimas), e de caracteres morfológicos; b) Avaliar e comparar a variabilidade reconhecida e nomeada pelo agricultor e a variabilidade intra-roça presente e não necessariamente reconhecida; c) Interpretar os padrões de variabilidade sob um modelo de dinâmica evolutiva da mandioca. Foram utilizadas para estes fins, 3 técnicas de amostragem em 10 roças em locais diferentes, e em ciclos agrícolas diferentes: 1) coleta de amostras de etnovariedades nomeadas pelo agricultor com interferência dele na escolha de cada amostra; 2) coleta de amostras de etnovariedades nomeadas pelo agricultor sem interferência dele na escolha de cada amostra; 3) amostragem aleatória dentro da roça sem nomeação individualizada. Ao todo foram estudados 356 indivíduos, sendo avaliados 21 caracteres e sendo feitas posteriormente as seguintes análises: cálculo de distância euclidiana média entre amostras, análise de agrupamento, e análise de componentes principais (PCA). Os indivíduos foram submetidos à eletroforese de isoenzimas, sendo então utilizada presença e ausência de bandas isoenzimáticas, cálculo do índice de similaridade genética (coeficiente de semelhança simples,"Simple Matching'), análise de agrupamento e análise de coordenadas principais (PCO). As distâncias obtidas a partir de cada conjunto de dados foram comparadas através de correlação de Mantel. A partir dos resultados, foi possível concluir que os agricultores subestimam a variabilidade presente intra-roça, dando o mesmo nome a genótipos diferentes. Além disso, foi possível concluir que cada etnovariedade de mandioca é constituída por genótipos distintos, com grande semelhança na morfologia, compondo uma população heterogênea. Através da interpretação dos resultados sob o modelo de dinâmica evolutiva de mandioca é possível inferir sobre a origem destes genótipos via hibridação intraespecífica. Sendo assim, os processos sexuais existentes amplificam a variabilidade de mandioca dentro das roças, interagindo com as técnicas de manejo empregadas secularmente. / not available

Visando caracterizar e aglomerar variedades em grupos de diversidade, foram avaliadas as variações quantitativas nas proteínas de grão, separadas por SDS-PAGE entre 67 germoplasmas de arroz (Oryza sativa L.) (59 brasileiros e 8 japoneses). A avaliação quantitativa foi desenvolvida através de análise densitométrica dos padrões eletroforéticos. Os dados obtidos permitiram determinação de distância genética entre pares de variedades, utilizando-se a distância euclidiana média e a formação de 10 grupos de diversidade (método de Tocher) e um dendograma (método do vizinho mais próximo). Foi observado, que em termos gerais, o gradiente de diferenciação está relacionado com a procedência dos materiais e com o nível de melhoramento das variedades. A análise de função discriminante confirmou que é possível uma clara discriminação entre variedades brasileiras e japonesas. Entretanto, a diferenciação entre variedades melhoradas e não melhoradas não foi tão manifesta. As técnicas estatísticas aplicadas aos componentes proteicos mencionados indicam que o conhecimento das proteínas de semente permite a avaliação da afinidade genética entre variedades e facilita a formação de grupos de diversidade e a diferenciação entre variedades de backgrounds genéticos similares / Variation among 67 rice cultivars (Oryza sativa L.) was evaluted comparing their soluble grain proteins profiles on SDS-PAGE gels. The protein fractions were quantitatively analysed by densitometric scanning of the gels. Utilizations of this methodology allowed an evaluation of genetic distances among pairs of cultivars by estimation of the mean distances. Ten groups of diversity were formed by the Tocher's method of conglomeration analysis, which were confirmed by the dendrogram of afinity relations (single linkage method). In general, the results showed that differentiation grades were related to the origin of the materials and their level of improvement. Graphic analysis of discriminant function showed a clear discrimination between brazilian and japonese cultivars. However, differenciation between improved (M) and non improved (O) cultivars was not so clear, showing a transition range between them. Statistical techniques applied to protein components indicate that knowledge of seed proteins allows to evaluate the genetic affinity among varieties and enables to from diversity groups and to discriminate them with similar genetic backgroung