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Systematic characterization of Rab GTPase cell type expression and subcellular localization in Drosophila melanogaster

Dunst, Sebastian 08 June 2015 (has links) (PDF)
The Rab family of small GTPases orchestrates intracellular endomembrane transport through the recruitment of diverse effector proteins. Since its first discovery in 1987, almost 70 Rab proteins have been identified in humans to date and their perturbed function is implicated in several hereditary and acquired diseases. In this Ph.D. thesis, I systematically characterize cell type expression and subcellular localization of all Rab proteins present in Drosophila melanogaster utilizing a genetic resource that represents a major advance for studying membrane trafficking in vivo: the ’Drosophila YRab library’. This collection comprises 27 different D. melanogaster knock-in lines that harbor YFPMyc fusions to each Rab protein, referred to as YRab. For each YRab, I present a comprehensive data set of quantitative and qualitative expression profiles across six larval and adult tissues that include 23 annotated cell types. The whole image data set, along with its annotations, is publicly accessible through the FLYtRAB database that links to CATMAID for online browsing of tissues. I exploit this data set to address basic cell biological questions. i) How do differentiating cells reorganize their transport machinery to perform cell type-specific functions? My data indicates that qualitative and quantitative changes in YRab protein expression facilitate the functional specialization of differentiated cells. I show that about half of the YRab complement is ubiquitously expressed across D. melanogaster tissues, while others are missing from some cell types or reflect strongly restricted cell type expression, e.g. in the nervous system. I also depict that relative YRab expression levels change as cells differentiate. ii) Are specific Rab proteins dedicated to apical or basolateral protein transport in all epithelia? My data suggests that the endomembrane architecture reflects specific tasks performed by particular epithelial tissues, rather than a generalized apicobasal organization. I demonstrate that there is no single YRab that is similarly polarized in all epithelia. Rather, different epithelial tissues dynamically polarize the subcellular localization of many YRab compartments, producing membrane trafficking architectures that are tissue- and stage-specific. I further discuss YRab cell type expression and subcellular localization in the context of Rab family evolution. I report that the conservation of YRab protein expression across D. melanogaster cell types reflects their evolutionary conservation in eukaryotes. In addition, my data supports the assumption that the flexible deployment of an expanded Rab family triggered cell differentiation in metazoans. The FLYtRAB database and the ’Drosophila Rab Library’ are complementary resources that facilitate functional predictions based on YRab cell type expression and subcellular localization, and to subsequently test them by genetic loss-of-function experiments. I demonstrate the power of this approach by revealing new and redundant functions for Rab23 and Rab35 in wing vein patterning. My data collectively highlight that in vivo studies of endomembrane transport pathways in different D. melanogaster cell types is a valuable approach to elucidate functions of Rab family proteins and their potential implications for human disease.
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Stofflich-energetische Gebäudesteckbriefe - Gebäudevergleiche und Hochrechnungen für Bebauungsstrukturen

Gruhler, Karin, Böhm, Ruth, Deilmann, Clemens, Schiller, Georg 23 September 2014 (has links) (PDF)
Durch die Nachhaltigkeitsdiskussion unterstützt, gewinnt in der Stadt- und Raumforschung die Betrachtung der ökologischen Effekte des Bauens und Wohnens zunehmend an Bedeutung. In diesem Zusammenhang sind Kenntnisse über stofflich-energetische Aufwendungen im Rahmen der Bewirtschaftung von Wohnungsbeständen von großer Bedeutung. Ziel einer am IÖR durchgeführten Forschungsarbeit war es, stofflich-energetische Kennwerte für Gebäudetypen und Bebauungsstrukturen als Grundlage für ein vorausschauendes Stoffstrommanagement zu erarbeiten. Zur Ermittlung der entsprechenden Kennwerte wurde ein EXCEL-gestütztes Baustoff-Berechnungs-Programm (BBP) erarbeitet. Mithilfe dieses Programms ist es möglich, Baustoffmengen von Gebäuden als Gesamtgröße oder z. B. nach Materialgruppen differenziert zu berechnen sowie damit verbundene Energie- und Emissionskennwerte zu bestimmen. Für 18 repräsentative Gebäudetypen der Wohnbebauung wurden stofflich-energetische Kennwerte ermittelt und in einer Gebäudetypen-Dokumentation zusammengefasst. Neben dem Vergleich unterschiedlicher Gebäuderepräsentanten wurden Analysen und Hochrechnungen auf der Ebene von Bebauungsstrukturen durchgeführt. Diese basierten auf einer Unterteilung in neun verschiedene, voneinander abgrenzbare Stadtstrukturtypen der Wohnbebauung. Es wurde deutlich, dass Stadtstrukturen charakteristische Stoffintensitätswerte aufweisen und Orientierungswerte für die Planung abgeleitet werden können.
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Analýza slabých stránek laserového 2D vibrometru a jeho vylepšení / Weaknesses analysis of a 2D laser vibrometer and its improvement

Vybíral, Ondřej January 2021 (has links)
The master's thesis follows the work of Ing. Tomek, who briefly describes and analyzes the weaknesses of this original solution. Based on the analysis, fixes for vulnerabilities and proposals for new functionalities are proposed. It also describes their implementation and correction of other shortcomings found, including implementation into the original program. The result is better user friendliness of the program and its better functionality. Verification of the functionality of the new improvements is tested using a control measurement of a harmonically excited beam. The last chapter contains suggestions and recommendations for further software development.
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Utvärdering av felmeddelande i eMM Software Version 00-06 till SysmexXE-5000

Abrahamsson, Elina January 2011 (has links)
Sysmex XE-5000 är en automatiserad cellräknare som utför mätningar enligt olikamätprinciper, de två som tillämpats i projektet är RF/DC(Radio Frequency/DirectCurrent) samt Flödescytometri med halvledarlaser. RF/DC bygger på förändringari radiofrekventa resistansen och likspänningsresistansen. Förändringar i denradiofrekventa resistansen (RF) ger information om densiteten i cellernas inre(exempelvis kärnans storlek) och förändringar i likspänningsresistensen (DC) gerinformation om blodcellernas storlek. Flödescytometri definierar ett mått påcellers fysiologiska och kemiska egenskaper. Detektion av cellerna sker genom attde bestrålas med en laserstråle samtidigt som de passerar en och en i instrumentet.Informationen som fås ut från flödescytometri inkluderar spritt ljus ochfluorescens. Sysmex XE-5000 arbetar med flera olika felmeddelanden, så kalladelarm. Ett eller flera larm indikerar att det finns en ökad risk för förekomst avabnormala celler och kan enbart uteslutas genom en manuell differentialräkning. Istudien har tre larm, vilka indikerar närvaron av onormala leukocyter, undersökts:”Blasts?”, ”Atypical Lympho?” och ”Abn Lympho/L_Blasts?”. Syftet medprojektet är att jämföra nuvarande beräkningar med en ny mjukvara (eMM) förlarmen och utvärdera om de ger ett mindre antal falskt positiva larm frånhematologiinstrumentet Sysmex XE-5000. Prover med något av ovanstående larmvaldes ut och analyserades först med nuvarande inställningar på instrumentet ochdärefter med de nya beräkningarna för eMM. Resultatet visar på att antalet falsktpositiva prover minskar och även att antalet dubblettlarm minskar. / Sysmex XE-5000 is an automated cell counter that performs measurements withdifferent principles. The two applied in this project are RF/DC (RadioFrequency/Direct Current) and Flow cytometry with semiconductor laser. RF/DCis based on changes in radio frequency resistance and direct current voltage.Changes in RF provide information about the density of the cell’s internalstructure (e.g. the nucleus) and changes in DC provide information about the sizeof the blood cells. Flow Cytometry define as physiological and chemicalproperties of the cell. Detection of cells is achieved by the irradiation with a laserbeam while passing through one by one. The information obtained from flowcytometry includes scattered light and fluorescence. Sysmex XE-5000 works withseveral different error messages, so-called alarm. One or more alarm indicates thatthere is an increased risk for the presence of abnormal cells and this can only beruled out by a manual differential count. In this study three alarms, which indicatethe presence of abnormal white blood cells, were analyzed: “Blasts?”, AtypicalLympho?” and “Abn Lympho/L_Blasts?”. The project aims to compare thecurrent calculations with the new software (eMM) for the alarms and evaluate ifthey provide a smaller number of false positive alarms from the hematologyinstrument Sysmex XE-5000. Samples with one or two of the alarms wereselected and analyzed with the current settings and then with the new settings foreMM. The result showed that the number of false-positive samples was reducedand that the number of duplicate alarms decreased.
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Analýza dynamických parametrů laserových vibrometrů / Analysis of dynamic parameters of laser vibrometers

Pavloň, Martin January 2017 (has links)
This diploma thesis deals with the theoretical description of interference methods used to measure vibrations, examines main parasitic effects and analyses its contribution to achievable the resolution. In the practical part, it uses several measurements to verify the effects of the level of reflected beam, stand-off distance and speckle noise. It also proposes a practical experiment for measuring dynamic parameters and signal-noise ratio. Results show that, the noise is exponentially dependent on the level of the reflected beam. The visible maximum of the vibrometer proved to be critical in terms of time stability of the measured signal level in two of the three measurements. Results of the dynamic measurement show that, the measured deviations were not degraded or significantly disturbed by the noise signal. From the measurement of the speckle noise, it emerged that the lowest level of noise is achieved with smooth and highly reflective materials.
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Jämförelse av natrium-resultat mellan patientnära instrument (GEM Premier 5000) och central laboratoriet instrument (Advia Chemistry XPT) på Universitetssjukhus Örebro. Finns det signifikant skillnad? / Comparison of sodium results between point of care analyzer (GEM Premier 5000) and central laboratory analyzer (Advia Chemistry XPT) at Örebro University Hospital. Is there a significant level difference?

Bonilla Guerrero, Jader Alfredo January 2021 (has links)
Bakgrund: Natrium (Na+) är en viktig elektrolyt i kroppen, och analyseras bland annat för att kunna bedöma patientens tillstånd och för att avgöra om akut behandling är nödvändigt. Analysen av Na+ på intensivvårdsavdelningen (IVA) i Örebro sker med hjälp av GEM Premier 5000, vilket är ett patientnära instrument som använder direkt metod för analys av helblod. Vid patientprovsjämförelse skickas provet vidare till centrallaboratoriet där plasman analyseras genom indirekt metod på Advia Chemistry XPT. Avvikelse mellan metoderna får inte överstiga 3%, annars måste orsaken utredas.  Syfte: Syftet med arbetet är att undersöka om det finns en systematisk skillnad på natrium-resultat mellan patientnära instrument, Gem Premier 5000 och centrallaboratoriets instrument, Advia Chemistry XPT hos olika patientgrupper. Metod: Mätning utfördes på blodprover tagna i litium-heparin rör på 60 deltagare, varav 30 var friska blodgivare (grupp 1) och resterande 30 bestod av inneliggande patienter (IVA) samt njurdialys-patienter, (grupp 2). Proverna analyserades för natrium i helblod på GEM Premier 5000 och strax därefter analyserades natrium, albumin, totalt protein, C-reaktivt protein (CRP), glukos och triglycerider i plasma på Advia Chemistry XPT. Resultat: Advia Chemistry XPT gav en högre medelkoncentration av Na+ (139 mmol/L) än GEM Premier 5000 (138 mmol/L) sett till samtliga deltagare. Procentuella skillnaden för natrium mellan metoderna översteg 3% för 3 deltagare i grupp 1 respektive hos hälften av deltagarna i grupp 2.   Slutsats: Na+ resultat på Advia Chemistry XPT var högre än på GEM Premier 5000 för alla deltagare. Skillnaden var större hos patienter med hög grad av sjuklighet. Detta antyder att nuvarande acceptabla avvikelse på 3% bör höjas till 5%, för att antal avvikande värden ska reduceras till nästan samma för båda grupper. Detta måste övervägas och implementeras i verksamheten. / Background: Sodium (Na +) is an important electrolyte in the body, and is analyzed, among other things, to be able to assess the patient's condition in the intensive care unit (IVA) and to determine if emergency treatment is necessary. The analysis of Na + on IVA is done with the help of GEM Premier 5000, which is a patient-centered instrument and uses a direct method for analysis of whole blood. For patient sample comparison, the sample is sent to the central laboratory where the plasma is analyzed by indirect method on Advia Chemistry XPT. Deviation between the methods must not exceed 3%, otherwise the cause must be investigated. Aim: The aim of the study is to investigate whether there is a systematic difference in Sodium results between patient-related instruments, Gem Premier 5000 and the central laboratory's instrument, Advia Chemistry XPT in different patient groups. Method: Measurement was performed on blood samples taken in Lithium Heparin tubes of 60 participants, of which 30 were healthy blood donors (group 1) and the remaining 30 consisted of inpatients (IVA) and kidney dialysis patients, (group 2). The samples were analyzed for sodium on GEM Premier 5000 and shortly thereafter for sodium, albumin, total protein, C-reactive protein (CRP), glucose and triglycerides on Advia Chemistry XPT. Results: Advia Chemistry XPT gave a higher concentration of Na + (139 mmol / L) than GEM Premier 5000 (138 mmol / L) for all participants. The percentage difference of Na between the methods differed for 3 participants in group 1 while it differed for half of the participants in group 2. Conclusion: Na + results on Advia Chemistry XPT were higher than on GEM Premier 5000 for all participants. The difference was greater in patients with a high degree of morbidity. This suggests that the current acceptable deviation of 3% should be increased to 5%, in order to reduce the number of deviating values ​​to almost the same for both groups. This must be taken into account and implemented in the business.
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Checkliste zur objektiven Analyse und Optimierung der psychischen Arbeitsbelastung (COPA 2.0)

Hacker, Winfried 04 November 2015 (has links)
Die psychische Belastung im Arbeitsprozess wurde international und national zu einem Kernproblem für den Arbeitsmarkt. Das deutsche Arbeitsschutzgesetz fordert nunmehr ausdrücklich auch das Vermeiden von Gefährdungen durch psychische Belastung. Diese Checkliste hilft als Orientierungsverfahren zu ermitteln, ob in Betrieben und Einrichtungen eine eingehendere Untersuchung psychischer Belastung erforderlich ist und welche Schwerpunkte gegebenenfalls vorliegen. Für eingehendere Untersuchungen existieren zahlreiche Verfahren. Die Checkliste ist branchenübergreifend einsetzbar, nicht zutreffende Sachverhalte sind gegebenenfalls zu überspringen.
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Lern-, gesundheits- und leistungsförderliche Arbeitsgestaltung in kleinen und mittleren Unternehmen – Warum und wie?

Hacker, Winfried 16 June 2015 (has links) (PDF)
Dieser Aufsatz ist auf der Grundlage des Vortrags entstanden, der auf der Auftaktveranstalung des Projektes "Arbeitslebensbegleitendes Lernen im Betrieb und mitarbeiterorientierte Förderung der Arbeitsfähigkeit" (ALBAf) am 01.04.2015 vom Autor gehalten wurde.
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Individuelle Unterschiede in der Gesichterkognition im Kindes- und Jugendalter/Individual Differences in Face Cognition across Childhood and Adolescence

Petrakova, Anastasia 23 October 2018 (has links)
Gesichterwahrnehmung und –gedächtnis («Gesichterkognition») sind wesentliche Facetten der sozialen Intelligenz, und deren Entwicklung gehört zu einem zentralen Forschungsthema. Jedoch besteht eine Kontroverse über die Frage der frühen oder späten Reifung diesen Fähigkeiten. Die Varianz wird dabei meist ignoriert, wodurch die Fragestellung "frühe vs späte Reifung" möglicherweise verkürzt wird, denn in den unterschiedlichen Kohorten können sich starke individuelle Unterschiede in Gesichterkognition zeigen. Außerdem machen es Lücken in der Untersuchung der Varianz unmöglich, die Assoziation der Gesichterkognition mit allgemeinen kognitiven Prozessen zu verfolgen, und die Spezifität der Gesichterkognition in der Kindheit und Adoleszenz bleibt offen. Basierend auf den früheren differenzialpsychologischen Untersuchungen der Struktur der Gesichterkognition und der Varianz bei Erwachsenen wurde in Rahmen der aktuellen Dissertation dieser Ansatz für die Kindheit und Adoleszenz adaptiert. Basierend auf den Ergebnissen von 338 Kindern und Jugendlichen wurden folgende Schlussfolgerungen formuliert: a) der Ansatz für die Untersuchung der Varianz ermöglichte das 2-faktorielle Modell der Gesichterkognition (Gesichterwahrnehmung und Gesichtergedächtnis) zu replizieren und die Invarianz dieser Struktur über Kindheit und Adoleszenz zu demonstrieren; b) aktueller Ansatz ermöglichte es, signifikante altersbedingte Leistungsunterschiede in beiden latenten Faktoren zu zeigen; c) Obwohl das Niveau der Reifung der Gesichterkognition in hohem Maße mit der allgemeinen kognitiven Entwicklung verbunden ist, sind die Gesichterwahrnehmung und das Gesichtergedächtnis im Vergleich zur Objekterkennung spezifisch und haben einen besonderen sozialen Charakter. Die aktuelle Dissertation enthält eine Reihe von methodischen Empfehlungen, die mit der Messung der Gesichterkognition in der Kindheit und Adoleszenz verbunden sind, insbesondere - die Entwicklung der multivariaten Messung. / Face perception and memory ("face cognition") are basic facets of social intelligence, and their development is a central topic for developmental science. Nevertheless, there is acute controversy over the issue of early or late maturation of these abilities. In addition, variance in face cognition abilities was ignored so far, leading to the absence of information, how children in a given age cohort differ in these abilities and making it impossible to investigate the association of face cognition abilities with general cognitive abilities; hence, the question about the specificity of face cognition abilities in childhood and adolescence remains open. Based on the earlier differential psychological studies of the structure of face cognition and variance in adulthood, within the current dissertation this approach was adopted to childhood and adolescence. Based on the results of 338 children and adolescents, the following conclusions were formulated: a) the individual differences approach allowed to establish the 2-factorial model of face cognition abilities (face perception and face memory) and to demonstrate invariance of this structure across childhood and adolescence; b) current approach allowed to demonstrate substantial age-related performance differences in both latent factors; c) although the level of maturation of face cognition is highly associated with general cognitive development, face perception and face memory are specific and have a social character compared to object recognition. The current dissertation contains a number of methodological recommendations related to the measurement of face cognition in childhood and adolescence, most important - the development of multivariate measurement.
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Opening up the cuebox

Ruggeri, Azzurra 21 December 2012 (has links)
Die Dissertation untersucht 1) welche Cues Kinder und Erwachsene in ihrer Cuebox haben, d.h. welche Cues für Inferenzen herangezogen wird, 2) wie Intuition über die Wichtigkeit von Cues die Informationssuche beeinflusst, und 3) wie das Framing eines Problems und das experimentelle Design die Intuition beeinflussen. Das erste Projekt untersucht den Effekt verschiedener Domänen und Objektrepräsentationen auf Erfragungsstrategien von Kindern und Erwachsenen in einer Kategorisierungsaufgabe. Ergebnisse zeigen, dass eine Basis-Level-Repräsentation (z.B. Hund) das Generieren von höher geordneten Merkmalen, welche die Objekte innerhalb einer übergeordneten Kategorie unterscheiden, für Kinder erleichtern und dadurch benutzt werden können, um effektive Fragen zu stellen. Dieser Effekt wurde nicht gefunden, wenn Kinder nicht selbst solche Merkmale generierten, sondern aus einem vordefinierten Set auswählen mussten. Das zweite Projekt untersuchte Kinder und junge Erwachsene bezüglich zweier Inferenzprobleme. In einer Bedingung mussten Cues selbst generiert werden, in einer anderen wurde ein Set von Cues vorgegeben. Ergebnisse zeigen, dass nur, wenn Cue selbst generiert wurden, junge Kinder gleich gut oder besser als ältere Kinder oder Erwachsene abschnitten, da sie Cues generierten, die ebenso informativ waren wie die der anderen beiden Altersgruppen. In dem dritten Projekt wurde getestet, wie die Art, Anzahl und Qualität der Cues die Fähigkeit von Kindern und jungen Erwachsenen beeinflusst, die informativsten Cues zu generieren bzw. auszuwählen. Ergebnisse zeigen, dass die Cuebox von Kindern mehr perzeptuelle Cues beinhaltet als jene junger Erwachsener. Dennoch war der Informationsgehalt der generierten Cues in beiden Gruppen gleich. Junge Erwachsene zeigten die Tendenz, nicht-perzeptuelle Cues systematisch als informativer zu erachten als perzeptuelle Cues. Kinder zeigten die gleiche Tendenz nur dann, wenn sie aus einem vordefinierten Set auswählen mussten. / My dissertation addresses the questions 1) what cues children and adults have in their cuebox (i.e., the set of cues available for making inferences or categorizing), 2) how people’s intuition about the importance of the cues drives their information search, and 3) how the framing of a problem and the experimental design influence these intuitions. A first project investigated developmental differences in how children and adults solve a sequential binary categorization task. Results show that, apart from age-related differences, children’s but not adults’ inquiry strategies improve if objects are represented at the basic level (e.g., dog) but not if represented at the subordinate level (e.g., Dalmatian) or when the basic level is specified by additional features (e.g., dog, kennel, to wag, collar). Explanations are that, unlike other representations, basic level objects trigger features that are useful for categorization, and therefore help children ask more effective questions. A second project tested children and young adults on two inference problems, by manipulating whether cues were generated or given. Results show that, only when generating their own cues, younger children matched or even outperformed the accuracy of older children and young adults, by generating cues that were as informative as the those generated by older children and young adults. A third project examined the type, amount and informativeness of the cues in people’s cuebox. Further, it investigated the influence of the type of cues on the ability of children and young adults to generate or select the most informative cue available. Results show that children’s cuebox contains more perceptual cues than young adults’. We found no difference between the two age groups in terms of informativeness of the cues generated. Young adults showed the tendency to systematically consider non-perceptual cues more informative than perceptual cues. Children showed such tendency only in a cue-selection task.

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