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Addressing high dimensionality and lack of feature models in testing of software product linesSOUTO, Sabrina de Figueirêdo 31 March 2015 (has links)
Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2016-03-15T15:21:11Z
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Previous issue date: 2015-03-31 / Software Product Lines (SPLs) allow engineers to systematically build families of
software products, defined by a unique combination of features—increments in functionality,
improving both the efficiency of the software development process and the quality of the software
developed. However, testing these kinds of systems is challenging, as it may require running each
test against a combinatorial number of products. We call this problem the High Dimensionality
Problem. Another obstacle to product line testing is the absence of Feature Models (FMs),
making it difficult to discover the real causes for test failures. We call this problem the Lack of
Feature Model Problem.
The High Dimensionality Problem is associated to the large space of possible configurations
that an SPL can reach. If an SPL has n boolean features, for example, there are 2n
possible feature combinations. Therefore, systematically testing this kind of system may require
running each test against all those combinations, in the worst case. The Lack of Feature Model
Problem is related to the absence of feature models. The FM enables accurate categorization of
failing tests as failures of programs or the tests themselves, not as failures due to inconsistent
combinations of features. For this reason, the lack of FM presents a huge challenge to discover
the true causes for test failures.
Aiming to solve these problems, we propose two lightweight techniques: SPLat and
SPLif. SPLat is a new approach to dynamically prune irrelevant configurations: the configurations
to run for a test can be determined during test execution by monitoring accesses to
configuration variables. As a result, SPLat reduces the number of configurations. Consequently,
SPLat is lightweight compared to prior works that used static analysis and heavyweight dynamic
execution. SPLif is a technique for testing SPLs that does not require a priori availability of
feature models. Our insight is to use a profile of passing and failing test runs to quickly identify
test failures that are indicative of a problem (in test or code) as opposed to a manifestation of
execution against an inconsistent combination of features.
Experimental results show that SPLat effectively identifies relevant configurations with
a low overhead. We also apply SPLat on two large configurable systems (Groupon and GCC),
and it scaled without much engineering effort. Experimental results demonstrate that SPLif
is useful and effective to quickly find tests that fail on consistent configurations, regardless of
how complete the FMs are. Furthermore, we evaluated SPLif on one large extensively tested
configurable system, GCC, where it helped to reveal 5 new bugs, 3 of which have been fixed
after our bug reports. / Software Product Lines (SPLs) allow engineers to systematically build families of
software products, defined by a unique combination of features—increments in functionality,
improving both the efficiency of the software development process and the quality of the software
developed. However, testing these kinds of systems is challenging, as it may require running each
test against a combinatorial number of products. We call this problem the High Dimensionality
Problem. Another obstacle to product line testing is the absence of Feature Models (FMs),
making it difficult to discover the real causes for test failures. We call this problem the Lack of
Feature Model Problem.
The High Dimensionality Problem is associated to the large space of possible configurations
that an SPL can reach. If an SPL has n boolean features, for example, there are 2n
possible feature combinations. Therefore, systematically testing this kind of system may require
running each test against all those combinations, in the worst case. The Lack of Feature Model
Problem is related to the absence of feature models. The FM enables accurate categorization of
failing tests as failures of programs or the tests themselves, not as failures due to inconsistent
combinations of features. For this reason, the lack of FM presents a huge challenge to discover
the true causes for test failures.
Aiming to solve these problems, we propose two lightweight techniques: SPLat and
SPLif. SPLat is a new approach to dynamically prune irrelevant configurations: the configurations
to run for a test can be determined during test execution by monitoring accesses to
configuration variables. As a result, SPLat reduces the number of configurations. Consequently,
SPLat is lightweight compared to prior works that used static analysis and heavyweight dynamic
execution. SPLif is a technique for testing SPLs that does not require a priori availability of
feature models. Our insight is to use a profile of passing and failing test runs to quickly identify
test failures that are indicative of a problem (in test or code) as opposed to a manifestation of
execution against an inconsistent combination of features.
Experimental results show that SPLat effectively identifies relevant configurations with
a low overhead. We also apply SPLat on two large configurable systems (Groupon and GCC),
and it scaled without much engineering effort. Experimental results demonstrate that SPLif
is useful and effective to quickly find tests that fail on consistent configurations, regardless of
how complete the FMs are. Furthermore, we evaluated SPLif on one large extensively tested
configurable system, GCC, where it helped to reveal 5 new bugs, 3 of which have been fixed
after our bug reports.
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Depuração automática de programas baseada em modelos: uma abordagem hierárquica para auxílio ao aprendizado de programação / Automated model based software debugging: a hierarchical approach to help programming learningWellington Ricardo Pinheiro 07 May 2010 (has links)
Diagnóstico baseado em modelos (Model Based Diagnosis - MBD) é uma técnica de Inteligência Artificial usada para encontrar componentes falhos em dispositivos físicos. MBD também tem sido utilizado para auxiliar programadores experientes a encontrarem falhas em seus programas, sendo essa técnica chamada de Depuração de Programas baseada em Modelos (Model Based Software Debugging - MBSD). Embora o MBSD possa auxiliar programadores experientes a entenderem e corrigirem suas falhas, essa abordagem precisa ser aprimorada para ser usada por aprendizes de programação. Esse trabalho propõe o uso da técnica de depuração hierárquica de programas, uma extensão da técnica MBSD, para que aprendizes de programação sejam capazes de depurar seus programas raciocinando sobre componentes abstratos, tais como: padrões elementares, funções e procedimentos. O depurador hierárquico de programas proposto foi integrado ao Dr. Java e avaliado com um grupo de alunos de uma disciplina de Introdução à Programação. Os resultados mostram que a maioria dos alunos foi capaz de compreender as hipóteses de falha geradas pelo depurador automático e usar essas informações para corrigirem seus programas. / Model Based Diagnosis (MBD) in Artificial Intelligence is a technique that has been used to detect faulty components in physical devices. MBD has also been used to help senior programmers to locate faults in software with a technique known as Model Based Software Debugging (MBSD). Although this approach can help experienced programmers to detect and correct faults in their programs, this approach must be improved to be used with novice programmers. This work proposes a hierarchical program diagnosis, a MBSD extension, to help novice programmers to debug programs by exploring the idea of abstract components, such as: elementary patterns, functions and procedures. The hierarchical program debugger proposed was integrated to the Dr. Java tool and evaluated with students of an introductory programming course. The results showed that most of the students were able to understand the hypotheses of failure presented by the automated debugger and use this information to provide a correction for their programs
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Desenvolvimento de um modelo experimental \"in vivo\" para o estudo do clearance mucociliar em camundongos normais e com inflamação de vias aéreas: estudo do efeito de medicamentos utilizados no tratamento da asma / In vivo evaluation of the airway epithelium in a murine model of allergic airway disease: effects of inhalatory drugs on ciliary beat frequencyAlessandra Choqueta de Toledo Arruda 06 December 2005 (has links)
O objetivo do presente trabalho foi propiciar o acesso in vivo ao epitélio respiratório e estudar a frequência de batimento ciliar (FBC) e a diferença de potencial transepitelial (DP) em um modelo murino de doença alérgica das vias aéreas induzida por ovoalbumina. Camundongos Swiss foram sensibilizados com ovoalbumina (OVA) através de duas injeções intraperitoneais de alérgico com o adjuvante hidróxido de alumínio (dias 0 e 14) e quatro inalações de OA 1% (dias 22, 24, 26 e 28). O grupo controle (S) foi tratado com salina 0,9 % seguindo o mesmo protocolo. Após 48h da última inalação, os camundongos foram anestesiados, a traquéia foi exposta longitudinalmente (1x4 mm) e o epitélio pode ser visualizado. A FBC foi mensurada pela técnica estroboscópica antes (basal) e logo após a administração inalatória das drogas (salbutamol e brometo de ipratrópio). A DP foi mensurada nos grupos S e OVA. Foram avaliados o lavado broncoalveolar e o remodelamento do epitélio da cavidade nasal, traquéia e vias aéreas distais. Nenhuma diferença foi encontrada na FBC basal entre os grupos (OVA e S), no entanto o grupo OVA mostrou uma DP basal significativamente menor. A inalação de salbutamol (3.5.10-3M ou 3.5.10-4M) elevou a FBC nos grupos estudados (p<0,05). O brometo de ipratrópio (10- 4M e 6.10-4M) não influenciou a FBC basal. Nossos resultados mostraram que é possível avaliar a FBC e a DP in vivo em um modelo murino de doença pulmonar alérgica crônica, e indicam que o processo inflamatório não afeta a FBC, mas contribui para o aumento de muco nas vias aéreas com conseqüências deletérias ao transporte mucociliar facilitando a retenção / The aim of the present work was to propitiate the in vivo assessment of the respiratory epithelium. The effects of salbutamol and ipratropium bromide on ciliary beat frequency (CBF) in a murine model of allergic airway disease were addressed. Transepithelial electric potential difference (PD) was also measured in order to verify the integrity of the epithelial barrier. Mice were sensitized with ovalbumin (OVA) by two intraperitoneal injections of allergen (days 0 and 14) and four inhalations of OVA 1% (days 22, 24, 26 and 28). The control group was treated with saline following the same procedures. After 48 hs of the last inhalation, mice were anesthetized, trachea was opened longitudinally (1 x 4 mm) and the ciliated epithelium could be visualized. CBF was measured by a modification on the videoscopic technique. We measured the CBF before and just after the administration of aerosolized substances. The PD was also measured on groups OVA and S. Additionally, the eosinophil cell count was measured on broncoalveolar lavage (BAL) in order to access the magnitude of airway inflammation. No difference on baseline CBF was noticed between groups (OVA and S), however the OVA group had a significantly lower PD. The administration of aerosolized capsaicin (3.10-9M) and salbutamol (3.5.10-3M or 3.5.10-4M) increased CBF in all groups studied. Ipratropium bromide (10-4M and 6.10- 4M) did not influence the CBF. The eosinophil cell count in broncoalveolar lavage was higher in OVA group compared to S group. CBF and PD results indicate that the inflammatory process does not affect the ciliary beat frequency but augments the amount of mucus in the airway, with deleterious consequences to the mucociliary transport facilitating mucus retention. Our results demonstrated for the first time the possibiliy of studying airway epithelium in an in vivo murine model of allergic airway disease
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Avaliação da incorporação e depuração de radiotraçadores (54Mn, 57Co e 65Zn) pelo molusco Anomalocardia brasilianaLima, Felipe Braga 16 February 2017 (has links)
Submitted by Biblioteca de Pós-Graduação em Geoquímica BGQ (bgq@ndc.uff.br) on 2017-02-16T16:40:03Z
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DISSERTAÇÂO FELIPPE BRAGA.pdf: 3584465 bytes, checksum: 5a6e3d3041992e9cdde4fba139fbe982 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-16T16:40:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1
DISSERTAÇÂO FELIPPE BRAGA.pdf: 3584465 bytes, checksum: 5a6e3d3041992e9cdde4fba139fbe982 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Universidade Federal Fluminense. Instituto de Química. Programa de Pós-Graduação em Geociências- Geoquímica Ambiental. Niterói, RJ / Bivalves marinhos podem acumular altas concentrações de metais disponíveis no ambiente. Como consequência, eles têm sido utilizados como biomonitores de contaminação costeira. No presente estudo, bivalves marinhos da espécie Anomalocardia brasiliana coletados na Baía de Sepetiba (Rio de Janeiro, Brasil), foram aclimatados e submetidos a um conjunto de experimentos realizados em sistema fechado onde foram expostos à radiotraçadores por até 10 dias no Laboratório de Radioisótopos Aplicados ao Meio Ambiente (LARAMAM) na Universidade Federal Fluminense. A fim de avaliar a cinética de incorporação e de depuração de metais-traço foi adicionada concentração conhecida dos radioisótopos 54Mn, 57Co e 65Zn na água do mar coletada. Os radiotraçadores foram analisados por espectrometria da radiação γ. Neste estudo foi investigado o uso potencial da Anomalocardia brasiliana como biomonitor em eventos agudos de contaminação, uma vez que pouco se sabe sobre a dinâmica de acumulação de metais nesta espécie. Esta avaliação teve como finalidade fornecer subsídios para a futura aplicação desta abordagem metodológica no monitoramento de eventos de real contaminação por metais no Brasil. Os resultados observados mostraram que é possível aplicar esta metodologia para avaliar a dinâmica de depuração dos metais nesta espécie de bivalve, essencialmente em casos de contaminação aguda. Foi observado que o intervalos de tempo adotados para a amostragem, com base na literatura, não foram suficientes para a obtenção da cinética de incorporação dos radiotraçadores por esta espécie, além disso, observou-se que esta espécie foi capaz de depurar assim que a atividade de radioisótopos na água atingiu o equilíbrio. Em termos da distribuição dos radioisótopos na coluna sedimentar, as maiores concentrações de 57Co, 54Mn e 65Zn foram encontradas nas camadas mais superficiais dos sedimentos. / Marine bivalves can accumulate high metal concentration from the surrounding environment. Consequently, they have been used as biomonitors in processes of coastal contamination. In the present work marine bivalves from Anomalocardia brasiliana species were collected from the Sepetiba Bay (Rio de Janeiro State, Brazil), acclimated in laboratory conditions and exposed to radiotracers in a closed system experiment during 10 days. The experimental procedure was developed in the Laboratory of radioisotopes applied to the environment at the Fluminense Federal University (LARAMAM/UFF). The main objectives of this work were to evaluate the uptake and downtake kinetics of trace metals through the addition of 54Mn, 57Co and 65Zn to the collected sea water. The radiotracers were measured using gamma radiation spectrometry. In the present study the potential use of Anomalocardia brasiliana a biomonitor in events of contamination was investigated, since little is known the metal accumulation dynamics for such species. This evaluation had the objective of providing subsides for the future application of this methodology for monitoring actual metal contamination events in Brazil. The results have shown that it is possible to apply such methodology to evaluate the depuration dynamics in this bivalve species, essentially in acute contamination. It was observed that the time intervals adopted for the sampling based on literature were not enough for obtaining the radiotracers incorporation kinetics for this species. Also, it was able to depurate as soon as the water activity reached the equilibrium. In terms of radioisotpes distribution within the sedimentation column the highest concentrations of 57Co, 54Mn e 65Zn were found in the top layers.
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Análise crítica da prescrição de diálise peritoneal crônica em pacientes pediátricos / Critical analysis of chronic peritoneal dialysis prescription in pediatric patients.Watanabe, Andreia 10 March 2008 (has links)
Introdução: Diálise peritoneal (DP) é modalidade de terapia renal substitutiva útil em crianças em estágio final de doença renal. O estado nutricional e o crescimento são considerados como marcadores prognósticos na adequação em diálise pediátrica, que dependem da sua prescrição, do controle da volemia e pressão arterial e do manejo dos distúrbios metabólicos e eletrolíticos. Objetivo: Descrever a prescrição da DP e parâmetros de adequação dos pacientes seguidos na Unidade de Nefrologia Pediátrica do Instituto da Criança do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da USP; analisar os resultados hemodinâmicos e antropométricos iniciais e finais; comparar os parâmetros observados na adequação da DP com aqueles sugeridos pela literatura em DP Crônica pediátrica. Métodos: Análise retrospectiva baseada na avaliação de prontuário durante o período entre janeiro de 1998 e maio de 2005, incluindo pacientes em DP por mais de 6 meses. Dados antropométricos, pressão arterial sistêmica, volume de infusão, pressão intra-abdominal (PIA), Teste do Equilíbrio Peritoneal (PET) e Kt/V semanal de uréia e mudanças de prescrição dialítica peritoneal foram analisadas. Resultados: foram analisados dados de 30 pacientes pediátricos, 17/30 (56,7%) sexo masculino. Uropatia foi a etiologia de doença renal crônica em 66,7% dos pacientes. A membrana peritoneal foi caracterizada como alto transportador em 5/18 pacientes, médio/alto transportador em 9/18 pacientes, médio/baixo transportador em 1/18 pacientes e baixo transportador em 3/18 pacientes. O Kt/V de uréia semanal foi > 2,1 em todos os pacientes em que este índice foi coletado. Pressão arterial sistêmica acima do p95 foi observada em 5/30 pacientes. Quatro dos cinco pacientes com hipertensão arterial apresentavam glomerulopatia como etiologia de doença renal crônica. O índice de massa corpórea e o índice de peso para estatura iniciais e finais foram preservados na maioria dos pacientes. Conclusão: Manejo clínico ótimo parece ser mais importante para adequação de DP pediátrica que índices de adequação baseados em estimativa de remoção de pequenos solutos. / I ntroduction: Peritoneal dialysis (PD) is an useful modality of renal replacement therapy in pediatric end-stage renal disease. Growth and nutritional state are considered outcome markers of adequacy in pediatric dialysis, which depends on the dialysis prescription, volume and blood pressure control and management of metabolic and electrolyte disorders. Objective: To describe the PD prescription and adequacy parameters of patients followed by the Pediatric Nephrology Unit of \"Instituto da Criança\" of \"Hospital das Clínicas\" of University of São Paulo; to analyze initial and final anthropometric and hemodynamic results; to compare the observed PD adequacy parameters with those suggested by the pediatric chronic PD literature. Methods: Retrospective analysis based on patients\' files evaluation covering the period between January 1998 and May 2005 and including patients on PD for more than 6 months. Data on anthropometry, systemic blood pressure, infusion volume, intraperitoneal pressure (IPP), peritoneal equilibration test (PET), weekly Kt/V urea and changes in peritoneal dialysis prescription were analyzed. Results: Data from 30 pediatric patients were analyzed, 17/30 (56,7%) boys. Uropathy was the etiology of chronic renal disease in 66,7% patients. The infusion volume was > 1000 ml/m2 in 9 patients. The peritoneal membrane was characterized as a high transporter in 5/18 patients, high/average transporter in 9/18 patients, low/average transporter in 1/18 patients and low transporter in 3/18 patients. The weekly Kt/V urea was >2,1 in all patients for whom this parameter was collected. Systemic blood pressure was above p95 in 5/30 despite antihypertensive medication. Four of 5 patients with high blood pressure had chronic renal failure related to glomerulopathy. The initial and final body mass index and weight to height index were preserved in most of the patients. Conclusion: Optimal clinical management seems to be more important for pediatric PD adequacy than adequacy indexes based on estimation of small solute removal.
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Assessment of spectrum-based fault localization for practical use / Avaliação de localização de defeitos baseada em espectro para uso práticoSouza, Higor Amario de 17 April 2018 (has links)
Debugging is one of the most time-consuming activities in software development. Several fault localization techniques have been proposed in the last years, aiming to reduce development costs. A promising approach, called Spectrum-based Fault localization (SFL), consists of techniques that provide a list of suspicious program elements (e.g., statements, basic blocks, methods) more likely to be faulty. Developers should inspect a suspiciousness list to search for faults. However, these fault localization techniques are not yet used in practice. These techniques are based on assumptions about the developer\'s behavior when inspecting such lists that may not hold in practice. A developer is supposed to inspect an SFL list from the most to the least suspicious program elements (e.g., statements) until reaching the faulty one. This assumption leads to some implications: the techniques are assessed only by the position of a bug in a list; a bug is deemed as found when the faulty element is reached. SFL techniques should pinpoint the faulty program elements among the first picks to be useful in practice. Most techniques use ranking metrics to assign suspiciousness values to program elements executed by the tests. These ranking metrics have presented similar modest results, which indicates the need for different strategies to improve the effectiveness of SFL. Moreover, most techniques use only control-flow spectra due to the high execution costs associated with other spectra, such as data-flow. Also, little research has investigated the use of SFL techniques by practitioners. Understanding how developers use SFL may help to clarify the theoretical assumptions about their behavior, which in turn can collaborate with the proposal of techniques more feasible for practical use. Therefore, user studies are a valuable tool for the development of the area. The goal of this thesis research was to propose strategies to improve spectrum-based fault localization, focusing on its practical use. This thesis presents the following contributions. First, we investigate strategies to provide contextual information for SFL. These strategies helped to reduce the amount of code to be inspected until reaching the faults. Second, we carried out a user study to understand how developers use SFL in practice. The results show that developers can benefit from SFL to locate bugs. Third, we explore the use of data-flow spectrum for SFL. Data-flow spectrum singles out faults significantly better than control-flow spectrum, improving the fault localization effectiveness. / Depuração é uma das atividades mais custosas durante o desenvolvimento de programas. Diversas técnicas de localização de defeitos têm sido propostas nos últimos anos com o objetivo de reduzir custos de desenvolvimento. Uma abordagem promissora, chamada Localização de Defeitos baseada em Espectro (LDE), é formada por técnicas que fornecem listas contendo elementos de código (comandos, blocos básicos, métodos) mais suspeitos de conter defeitos. Desenvolvedores deveriam inspecionar uma lista de suspeição para procurar por defeitos. No entanto, essas técnicas de localização de defeitos ainda não são usadas na prática. Essas técnicas baseiam-se em suposições sobre o comportamento de desenvolvedores durante a inspeção de tais listas que podem não ocorrer na prática. Um desenvolvedor supostamente inspeciona uma lista de LDE a partir do elemento mais suspeito para o menos suspeito até atingir o elemento defeituoso. Essa suposição leva a algumas implicações: as técnicas são avaliadas somente pela posição dos defeitos nas listas; um defeito é considerado como encontrado quando o elemento defeituoso é atingido. Técnicas de LDE deveriam posicionar os elementos de código defeituosos entre as primeiras posições para serem úteis na prática. A maioria das técnicas usa métricas de ranqueamento para atribuir valores de suspeição aos elementos executados pelos testes. Essas métricas de ranqueamento têm apresentado resultados semelhantes, o que indica a necessidade de estratégias diferentes para melhorar a eficácia de LDE. Além disso, a maioria das técnicas usa somente espectros de fluxo de controle devido ao alto custo de execução associado a outros espectros, tais como fluxo de dados. Também, poucas pesquisas têm investigado o uso de técnicas de LDE por programadores. Entender como desenvolvedores usam LDE pode ajudar a esclarecer as suposições teóricas sobre seu comportamento, o que por sua vez pode para colaborar para a proposição de técnicas mais viáveis para uso prático. Portanto, estudos com usuários são importantes para o desenvolvimento da área. O objetivo desta pesquisa de doutorado foi propor estratégias para melhorar a localização de defeitos baseada em espectro focando em seu uso prático. Esta tese apresenta as seguintes contribuições originais. Primeiro, nós investigamos estratégias para fornecer informação de contexto para LDE. Essas estratégias ajudaram a reduzir quantidade de código a ser inspecionado até atingir os defeitos. Segundo, nós realizamos um estudo com usuários para entender como desenvolvedores usam LDE na prática. Os resultados mostram que desenvolvedores podem beneficiar-se de LDE para localizar defeitos. Terceiro, nós exploramos o uso de espectros de fluxo de dados para LDE. Mostramos que o espectro de fluxo de dados seleciona defeitos significamente melhor que espectro de fluxo de controle, aumentando a eficácia de localização de defeitos.
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Efeitos da imunossupressão sobre a depuração mucociliar de ratos: comparação entre dois esquemas de terapia tríplice / Effects of immunosuppression on mucociliary clearance of rats: comparison between two triple therapy regimensSilva, Maristela Prado e 05 April 2016 (has links)
INTRODUÇÃO: O transplante de pulmão é parte fundamental no tratamento das doenças terminais do pulmão, constituindo uma modalidade terapêutica eficaz para pacientes com doença pulmonar incapacitante, progressiva e em estágio final. No entanto, as drogas imunossupressoras usadas para evitar a rejeição do enxerto podem causar efeitos colaterais em diversos tecidos. O sistema mucociliar, presente nas vias aéreas, é um dos principais mecanismos de defesa do trato respiratório e pode ser alterado por ação das drogas imunossupressoras. Desta forma, o objetivo deste estudo foi avaliar o sistema mucociliar traqueobrônquico de ratos submetidos a dois esquemas de terapia tríplice imunossupressora. MÉTODOS: Foram utilizados 90 ratos machos Wistar distribuídos em 3 grupos conforme o tratamento: controle (C) = solução salina; terapia 1 (TI) = tacrolimus + micofenolato de mofetil + prednisona; terapia 2 (TII) = ciclosporina + azatioprina + prednisona. Após o período de tratamento (7, 15 ou 30 dias), os animais foram sacrificados e realizadas as seguintes medidas: transportabilidade do muco (TM), frequência de batimento ciliar (FBC), quantificação de muco neutro e ácido, velocidade de transporte mucociliar (VTMC), e contagem total e diferencial de células no lavado broncoalveolar (LBA). RESULTADOS: A TM não foi afetada pelas terapias em nenhum dos tempos estudados. Ambas as terapias causaram significativa redução da FBC dos animais tratados por 7 e 15 dias. A produção de muco neutro foi menor nos animais tratados com a TI por 7, 15 e 30 dias. Porém, com a TII, essa redução ocorreu apenas aos 7 dias. Por outro lado, a quantidade de muco ácido foi significativamente maior em todos os animais tratados com as duas terapias. Todos os animais tratados com as terapias imunossupressoras apresentaram redução da VTMC nos três tempos. Houve aumento do número total de células e de macrófagos e neutrófilos no grupo TI em 7 dias. CONCLUSÕES: Ambas as terapias imunossupressoras foram prejudiciais ao transporte mucociliar das vias aéreas de ratos, tanto pela redução da FBC e da VTMC, quanto pela maior produção de muco ácido e menor produção de muco neutro. A TI foi mais prejudicial ao sistema mucociliar em comparação à TII / INTRODUCTION: Lung transplantation is an essential part in the treatment of terminal lung diseases, providing an effective therapeutic modality for patients with disabling, progressive and final stage lung disease. However, the immunosuppressant drugs used to prevent graft rejection may cause side effects in several tissues. The mucociliary system, present in the airways, is a major defense mechanism of the respiratory tract and can be changed by action of immunosuppressive drugs. Thus, the aim of this study was to evaluate the tracheobronchial mucociliary system of rats submitted to two triple immunosuppressive therapy regimens. METHODS: We used 90 male Wistar rats divided into 3 groups according to treatment: control (C) = saline solution; therapy 1 (TI) = tacrolimus + mycophenolate mofetil + prednisone therapy; therapy 2 (TII) = cyclosporine + azathioprine + prednisone. After the period of treatment (7, 15, or 30 days), the animals were sacrificed and the following measures taken: mucus transportability (MT), ciliary beating frequency (CBF), quantification of neutral and acid mucus, mucociliary transport velocity (MCTV), and total and differential counting of cells in bronchoalveolar lavage (BAL). RESULTS: MT was not affected by treatments in any of the periods studied. Both therapies have caused significant reduction of CBF of animals treated for 7 and 15 days. The neutral mucus production was lower in animals treated with TI for 7, 15 and 30 days. But with TII, this reduction occurred only at 7 days. Moreover, the amount of acid mucus was significantly higher in all animals treated with both therapies. All animals treated with immunosuppressive therapies had reduced MCTV at the three times. There was an increase of total cells and macrophages and neutrophils in the TI group in 7 days. CONCLUSIONS: Both immunosuppressive therapies were harmful to the mucociliary clearance of the airways of rats, either by reducing the CBF and MCTV, as by the increased production of acid mucus and decreased production of neutral mucus. TI was more harmful to the mucociliary system in comparison to TII
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Detecção e controle do off flavor em tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus), por meio de depuração e defumação. / Off flavor detection and control in nile tilapia (Oreochromis niloticus) through depuration and smoking.Biato, Denise Oliveira 11 March 2005 (has links)
Atualmente, as perdas econômicas são uma realidade devido ao problema de off flavor em pescado, ocasionados pela qualidade da água dos criatórios e pelo manejo empregado no cultivo, nem sempre satisfatórios. Buscou-se a avaliação microbiológica, físico-química e sensorial dos peixes, com a finalidade de detectar prováveis alterações que estivessem comprometendo a qualidade do pescado. Com o objetivo de detectar e controlar o off flavor em tilápias cultivadas foi sugerido a depuração antes da distribuição e venda e a utilização da defumação como meio de mascarar este problema. O monitoramento da qualidade do pescado iniciou-se com as análises microbiológicas, físico-químicas e biológica da água dos tanques de cultivo e de depuração. Os peixes provenientes de área de cultivo do Estado de São Paulo, região de Artur Nogueira, da espécie tilápia do Nilo, Oreochromis niloticus, foram submetidos à depuração (3, 5 e 7 dias) e a seguir foram eviscerados e filetados. Os peixes submetidos à depuração e o controle foram comparados entre si para posterior escolha do melhor tempo para depuração; estes, não apresentaram diferenças significativas (p>0,05) para composição centesimal, nitrogênio não protéico - NNP, bases nitrogenadas voláteis totais - BNVT e pH nos tempos de depuração. O processo de depuração provocou perda de peso mais intensa nos três primeiros dias de depuração. Através das análises sensoriais verificou-se que os peixes, que corresponderam ao controle, apresentaram maior intensidade de off flavor quando comparados aos demais. A depuração por 3 dias para o atributo odor apresentou eficiência semelhante, estatisticamente (Teste F), ao tratamento por 5 dias porém, foi considerada diferente do tratamento por 7 dias. Para o atributo sabor os tratamentos de 3, 5 e 7 dias não diferiram, estatisticamente, entre si. A água do tanque de cultivo apresentou problemas de eutrofização e presença de geosmina, ao contrário da água do tanque de depuração que apresentou-se límpida e ausente de geosmina. Os peixes que não sofreram depuração (controle), foram submetidos à defumação. Os filés de peixe in natura e os defumados foram comparados entre si, quanto a composição centesimal e verificou-se que estes foram afetados significativamente (Teste F). Para o nitrogênio não protéico - NNP, as bases nitrogenadas voláteis totais - BNVT e o pH não houve alteração significativa (p>0,05) quanto aos tratamentos. Através das análises sensoriais verificou-se que os peixes in natura apresentaram maior intensidade de off flavor quando comparados aos defumados. Para os atributos odor e sabor houve diferença significativa (p>0,05) entre os tratamentos. O processo de depuração permitiu bons resultados quanto a eliminação de off flavor da tilápia, pois, através das análises realizadas, pode-se aferir o tempo ideal de 5 dias de depuração conduzida em um tanque com água corrente e limpa. Quando se comparou o pescado defumado com o pescado in natura, o primeiro recebeu uma maior aceitação pelos degustadores. O processo de defumação é uma forma de mascarar a presença do off flavor; é um processo simples, pouco oneroso e que pode ser adotado prontamente pelos produtores como forma de agregar valor ao pescado. / Currently, economic losses are a reality due to the fish off flavor provoked by the handling used in the culture and by the water quality of the fish tanks, which are not always satisfactory. Microbiological, physical-chemical and sensory evaluations of the fish were carried out in order to detect probable alterations that would compromise the fish quality. The off flavor detection, as well as, the suggestion for depuration before distribution and sale, and the use of the smoking as a way of disguising this problem were the objectives of this research. Microbiological, physical-chemical and biological analyses of the waters in the fish and the depuration ponds were performed to monitor the quality of the fish. The fish- Nile Tilapias (Oreochromis niloticus) from the area of Arthur Nogueira, in the State of São Paulo - was submitted to the depuration (3, 5 and 7 days). The fish submitted to the depuration and the control fish were compared in order to find the best depuration period. No significant differences (p>0.05) for centesimal composition, non-protein nitrogen - NNP, total base volatile nitrogen BNVT, and pH were found among the depuration periods. The depuration process provoked a more intense weight loss in the first three days for depuration. Through the sensory analyses, we could verify that the control fish presented a greater off flavor intensity than the others. The three-day depuration showed a similar statistical efficiency (F Test) than that of the five-day treatment, but differed from that of the 7-day treatment. As for the flavor attribute, the 3, 5, and 7-day treatments did not show a significant difference, statistically. The water in the fish pond presented eutrophization problems and presence of geosmine, whereas the water in the depuration pond was clear and geosmine-free. The fish that did not go through depuration (control) were submitted to smoking. Fresh fish fillets were compared to the smoked ones. As to the centesimal composition, we verified that they were significantly affected (F Test). As to non-protein nitrogen - NNP, total base volatile nitrogen - BNVT and pH, there were no significant changes (p>0.05) either among the treatments. Through sensory analysis, we verified that the fresh fish presented a more intense off flavor than the smoked ones. As to odor and flavor, there was a significant (p>0.05) difference among the treatments. The depuration process was efficient in the elimination of the off-flavor in the tilapia, for, according to our analyses, we could conclude that the ideal period for this elimination was 5 days of depuration, carried out in a pond with clean running water. When compared to the fresh fish, the smoked fish was better accepted by the panelists. The smoking process is a way of disguising the off flavor; it is a simple, inexpensive process, which can be readily adopted by producers a way of adding value to the fish.
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Efeitos do tabagismo e da cessação do tabagismo nos mecanismos de defesa de via aérea, propriedades do muco e inflamação nasal / The effects of smoking and smoking cessation on nasal mucociliary clearance, mucus properties and nasal inflammationUtiyama, Daniela Mitiyo Odagiri 31 March 2017 (has links)
O tabagismo é um problema mundial de saúde pública e é considerado a principal causa de morte evitável no mundo associado com câncer de pulmão, doença pulmonar obstrutiva crônica e infarto agudo do miocárdio. O tabagismo induz alterações morfológicas e funcionais no sistema respiratório. O transporte mucociliar (TMC) é um dos principais mecanismos de defesa do sistema respiratório que pode ser alterado com a fumaça e outros produtos do cigarro. O objetivo desse estudo foi avaliar os efeitos do tabagismo e da cessação do tabagismo no TMC nasal, nas propriedades do muco e sobre marcadores inflamatórios. Trinta e três indivíduos tabagistas foram incluídos no estudo após concordância com o termo de consentimento livre e esclarecido. O recrutamento de voluntários foi realizado na Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP) e no Ambulatório de Cessação do Tabagismo da Disciplina de Pneumologia do Hospital das Clínicas da FMUSP. As variáveis desfecho foram o TMC nasal analisado por meio do teste de trânsito da sacarina, as propriedades do muco por meio do ângulo de contato e da transportabilidade da tosse por alto fluxo e a quantificação de células inflamatórias e concentração de interleucinas (IL)-6 e IL-8 em lavado nasal. Vinte cessadores (idade média: 51 anos, 9 do sexo masculino) foram avaliados no tempo basal do estudo, 1o mês, 3o mês e 12o mês de cessação do tabagismo e 13 tabagistas (média de idade: 52 anos, 6 do sexo masculino) foram avaliados no tempo basal e 12 meses após o basal. As características demográficas, hábito tabágico inicial e morbidades de tabagistas e de cessadores foram similares. No tempo basal do estudo, os tabagistas e cessadores apresentaram disfunção do TMC nasal (17,9 ± 10,1 min e 17,4 ± 7,7 min, respectivamente, p=0,880). A cessação do tabagismo induziu melhora significativa do TMC nasal no 1o mês, 3º mês e 12o mês em 63%, 76% e 85% dos indivíduos, respectivamente. Somente aos 12 meses, foi possível observar melhora na transportabilidade do muco por alto fluxo (~ 23%), porém com aumento do número de macrófagos (2x) em lavado nasal. Não observamos alterações no ângulo de contato do muco e nas concentrações de citocinas em lavado nasal. Concluímos que a cessação do tabagismo induz melhora rápida no TMC nasal, porém melhora nas propriedades do muco foi observada somente após 12 meses de cessação do tabagismo / Smoking is a health problem in the world. It is considered a main cause of preventable death and is associated with lung cancer, chronic obstructive pulmonary disease and myocardium infarction. Smoking induces morphological and functional changes in the respiratory system. Mucociliary clearance (MCC) is one of the main defense mechanisms of the respiratory system that can be affected by smoke and other cigarette products. The aim of this study was to assess the effects of smoking and smoking cessation on nasal MCC, mucus properties and inflammatory biomarkers. Thirty three smokers were included in this study after agreement with the written informed consent. Subject´s recruitment was performed at Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP) and Ambulatório de Cessação do Tabagismo da Disciplina de Pneumologia do Hospital das Clínicas da FMUSP. The outcome variables were nasal MCC evaluated by saccharin transit test, mucus properties using contact angle and mucus transportability by high airflow and quantification of inflammatory cells number and interleukin (IL)-6 and IL-8 in the nasal lavage fluid. Twenty volunteers in the smoking cessation program (mean age: 51 years, 9 male) were assessed at baseline, month 1, month 3 and month 12 after of the smoking cessation and 13 smokers (mean age: 52 years, 6 male) were assessed at baseline and 12 months after baseline. Demographic characteristics, smoking history and morbidities were similar between the two groups. At baseline, smokers showed impaired nasal MCC (17.9 ± 10.1 min and 17.4 ± 7.7 min, respectively, p=0.880). Smoking cessation significantly improved nasal MCC at 1 month, 3 months and 12 months in 63%, 76% and 85% of the subjects, respectively. Only after 12 months of smoking cessation, improvement in mucus transportability by high airflow (~ 23%) was observed, however, with increased number of macrophages (2-fold) in nasal lavage fluid. No changes were observed in mucus contact angle and cytokines concentrations in nasal lavage fluid. We concluded that smoking cessation induces rapid improvement in nasal MCC, however, improvement in mucus properties were observed only after 12 months of smoking cessation
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Revisão de crenças em lógicas de descrição - um plug-in para o Protégé / Belif revision in description logics - a Plug-in for ProtégéResina, Fillipe Manoel Xavier 07 April 2014 (has links)
As Lógicas de Descrição são usadas como base para a linguagem OWL, padrão para representação de ontologias na web. No entanto, conhecimento não é estático e, com tal dinamismo, o estudo de revisão de crenças e sua correta e adequada aplicação tornam-se muito importantes. Neste trabalho, pretendemos desenvolver uma ferramenta para revisão de ontologias como um plug-in para o Protégé, o editor de ontologias mais utilizado atualmente. / Description Logics are the basis for OWL language, which is the standard to represent ontologies on the web. However, knowledge is usually not satic and its dynamics brings the importance of belief revision and its correct and proper application. In this work, we intend to develop a tool for revising ontologies as a plug-in for Protégé, the most used ontology editor nowadays.
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