Made available in DSpace on 2016-12-08T16:24:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGCA12MA038.pdf: 2912659 bytes, checksum: a707fa201b75de04c816893aa22d474d (MD5) Previous issue date: 2012-06-15 / It has been described the epidemiological, clinical signs and lesions of a disease of cattle characterized by seasonal occurrence of outbreaks of diarrhea, chronic fever, responsive to treatment with copper sulfate. The disease occurs on properties with steeply sloping topography of the different regions of the state of Santa Catarina, with greater frequency in the west Highlands and Serra, in the months from October to January and after periods of heavy rain. Morbidity ranged from 6.16 to 66.6% and mortality from 2,1 to 20%. Besides of diarrhea, the animals showed weight loss, the bristling, sometimes with discoloration around the eye, culminating in death. In the necropsy of animals that died from disease was observed cachexia, pale mucous membranes, spleen and intestine with brown liquid content. Microscopically the only significant finding was splenic hemosiderosis. The dosage of the liver concentrations of copper and molybdenum by mass spectrometry method of inductively coupled plasma source ICP-MS, with introduction of the sample by pneumatic spraying of the animals were necropsied showed low levels of copper (4.70 to 70.35 ppm) of molybdenum and normal (from 0.07 to 1.35 ppm). In the experimental treatment was administered orally copper sulphate for two animals with clinical signs of disease during a period of 30 days, the animals had clinical improvement and body weight gain. The epidemiological, clinical and pathological, low concentrations of copper found in liver samples and the positive response to treatment with copper sulphate define the disease as deficiency disease by copper deficiency / Descrevem-se os dados epidemiológicos, sinais clínicos e lesões de uma enfermidade de bovinos de ocorrência sazonal caracterizada por surtos de diarreia crônica, afebril, responsiva ao tratamento com sulfato de cobre. A enfermidade ocorre em propriedades com topografia de declive acentuado nas diferentes regiões do estado de Santa Catarina, com maior frequência na região Oeste e Planalto Serrano, nos meses de outubro a janeiro e posterior a períodos de chuva intensa. A morbidade oscilou de 6,16 a 66,6% e mortalidade de 2,1 a 20%. Além da diarréia os animais apresentam emagrecimento progressivo, pelos arrepiados, às vezes com descoloração dos pelos ao redor dos olhos, culminando com a morte. Através da necropsia de animais que morreram pela enfermidade foi observado caquexia, palidez das mucosas, baço de coloração marrom e intestino com conteúdo líquido. Na microscopia o único achado significativo foi hemossiderose esplênica. A dosagem da concentração hepática de cobre e molibdênio através do método espectrometria de massa com fonte de plasma indutivamente acoplado ICP-MS, com introdução da amostra por nebulização pneumática dos animais que foram necropsiados revelou baixos valores de cobre (4,70 a 70,35 ppm) e normais de molibdênio (0,07 a 1,35 ppm). No tratamento experimental foi administrado sulfato de cobre via oral a dois bovinos, com os sinais clínicos da doença durante um período de 30 dias, os animais obtiveram melhora do quadro clínico e ganho de peso corporal. O quadro epidemiológico, clínico e patológico, as baixas concentrações de cobre encontradas nas amostras de fígado e a resposta positiva ao tratamento com sulfato de cobre definem a enfermidade como doença carencial por deficiência de cobre

Submitted by GIOVANI MARCO STINGELIN null (giovani_44@hotmail.com) on 2017-04-19T04:16:09Z No. of bitstreams: 1 Dissertação de Mestrado Giovani M. Stingelin.pdf: 1323487 bytes, checksum: 714dbbed6afc25d765018a23a47264a0 (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-04-19T13:55:36Z (GMT) No. of bitstreams: 1 stingelin_gm_me_bot.pdf: 1323487 bytes, checksum: 714dbbed6afc25d765018a23a47264a0 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-19T13:55:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 stingelin_gm_me_bot.pdf: 1323487 bytes, checksum: 714dbbed6afc25d765018a23a47264a0 (MD5) Previous issue date: 2017-03-09 / A coccidiose é uma das doenças mais importantes que acometem leitões lactentes no Brasil. A administração de toltrazuril é usada no mundo todo para a prevenção de coccidiose em leitões, entretanto, não foram encontradas pesquisas sobre a correta profilaxia da doença no Brasil. Sendo assim, este estudo tem como objetivo investigar diferentes protocolos de administração de toltrazuril (FARMACOX® 5%, suspensão oral, Farmabase Saúde Animal, SP, Brasil) sob as condições de campo no estado de São Paulo. Para isso, 495 leitões foram aleatoriamente divididos em quatro diferentes grupos: 125 leitões (grupo controle) que não receberam toltrazuril; 127 leitões que receberam toltrazuril no terceiro dia de vida (grupo dois); 116 leitões que receberam toltrazuril no quinto dia de vida (grupo três), e 127 leitões que receberam duas doses de toltrazuril, uma com três e outra com sete dias de idade (grupo quatro). A excreção de oocistos foi avaliada por análises coproparasitológicas quando os animais tinham cinco, sete, 12, 21 e 63 dias de idade e as pesagens individuais foram realizadas aos três, 21 e 132 dias de idade. Os dados foram analisados usando o peso ao terceiro dia como uma covariável independente. Os resultados foram separados por médias e ajustados por Tukey (p ≤ 0,05). Os animais dos grupos dois e quatro não excretaram Cystoisospora suis, mas um animal do grupo controle e um do grupo três (aos 63 dias de idade) excretaram oocistos de C. suis. Os leitões do grupo controle apresentaram menor peso ao desmame quando comparado com os do grupo quatro. Quando os leitões do grupo controle tinham 132 dias de idade, o peso corporal foi significativamente menor quando comparado com os grupos dois e quatro. Os animais do grupo controle tiveram menor ganho de peso diário (GPD) que os do grupo quatro no período de três a 21 dias e menor GPD dos três aos 132 dias de idade que os animais dos grupos dois e quatro. Estes resultados sugeriram que a administração de toltrazuril ao terceiro dia de vida é o protocolo recomendado para controle da coccidiose e para melhoria do peso e GPD dos leitões. / Coccidiosis is one of the most important diseases affecting suckling piglets. It causes diarrhea, dehydration, weight loss, low performance and significant economic losses. Toltrazuril administration is used worldwide for coccidiosis prevention in piglets, however, no research was found on the correct prophylaxis of the disease in field conditions in Brazil. Thus, this study is aimed at evaluating different protocols of toltrazuril administration (FARMACOX® 5%, oral suspension, Farmabase Animal Health, SP, Brazil). These protocols were used for specific conditions of production in the state of São Paulo for controlling coccidiosis under field conditions. For that, 495 piglets were randomly allocated. The animals were divided into four different groups: 125 piglets (control group) which did not receive toltrazuril; 127 piglets that received toltrazuril on the third day of life (group two); 116 piglets which received toltrazuril on the fifth day (group three), and 127 piglets that received two dosages of toltrazuril when the animals were 3 and 7 days-old (group four). Excretion of oocysts was evaluated by coproparasitological analysis when the animals were 5, 7, 12, 21 and 63 days-old. They were individually weighed at 3, 21 and 132 days-old to evaluate the growth performance between treatments. Data was analyzed using the MIXED procedure of SAS, using the third day weight as an independent covariate. Results were separated with PDIFF adjusted by Tukey (P ≤ 0.05). Groups 2 and 4 did not excrete C. suis. One animal from the control group and group three (63 days-old) excreted C. suis oocysts. The control group demonstrated lower weight at weaning when compared to group 4. When the piglets from the control group were 132 days-old the body weight was significant lower when compared to groups 2 and 4. The control group also demonstrated significant lower average daily weight gain (ADG) then group 4 at weaning and lower significant ADG at 132 days-old then groups 2 and 4. These results suggested that the administration of toltrazuril by the third day of life is the recommended protocol to control coccidiosis and to improve the weight and ADG of piglets.

Orientador: Luís Guilherme de Oliveira / Coorientador: Samir Issa Samara / Banca: Hélio José Montassier / Banca: José Carlos Figueiredo Pantoja / Resumo: Os membros do gênero Pestivirus apresentam grande semelhança antigênica entre si. A reação sorológica cruzada entre o Vírus da Peste Suína Clássica (CSFV) e o Vírus da Diarreia Viral Bovina (BVDV) é de grande importância, e interfere em programas de erradicação da Peste Suína Clássica (PSC). Este trabalho teve como objetivos determinar a prevalência de anticorpos anti-BVDV em suínos de criações não tecnificadas, associar fatores de risco e buscar vínculos epidemiológicos entre rebanhos através do geoprocessaemento. Para tal, 360 amostras de soro de suínos provenientes de 56 propriedades rurais da região nordeste do Estado de São Paulo foram submetidas ao teste de virusneutralização (VN) utilizando os genótipos BVDV-1 estirpe Singer e BVDV-2 estirpe VS253. Foram detectados 4,72% (17) de amostras reagentes na VN, e 26,79% (15) rebanhos apresentaram pelo menos um animal reagente. Não foi possível associar fatores de risco. O estimador de intensidade de Kernel indicou áreas de alto risco de ocorrência da enfermidade e, juntamente com a análise de correspondência múltipla apontou associação com a presença de rebanhos de bovinos, quantidade mediana de leitões e rebanho suíno mediano nas propriedades da região. Ressalta-se a importância dos bovinos na ocorrência de infecções pelo BVDV em suínos, assim como a problemática no diagnóstico e levantamento epidemiológico para vigilância de PSC devido a presença de anticorpos anti-BVDV nos animais / Abstract: The members of the Pestivirus gender have great antigenic similarity. The serological cross-reaction between the Classical Swine Fever Virus (CSFV) and the Bovine Viral Diarrhea Virus (BVDV) usually interferes with Classical Swine Fever (CSF) eradications programs. This study focused on establishing the prevalence of antibodies for the BVDV in pigs of non-technified rearing farms, associate risk factors and use geospatial analysis tools to correlate positive herds. A set of 360 serum samples from 56 herds located in the northeastern region of the state of São Paulo were analyzed by the virusneutralization test (VN), using the genotypes BVDV-1 strain Singer and BVDV-2 strain VS253. During the sample collection, a questionnaire was applied to the farmers in order to obtain epidemiological information of the herd. 4,72% (17) of the samples were positive in the VN and 26,79% (15) of the herds had at least one positive animal. It was not possible to associate risk factors; however, the variable "use of milk serum in the feed" showed a tendency to be associated with the occurence of the disease. The Kernel intensity estimator showed three high risk of occurence areas, which were associated with the presence of bovine herds, medium quantity of piglets in the herd and medium size of total swine herd. The results highlight the importance of bovines in the prevalence of swine BVDV infections and the difficulties in diagnostic tests and CSF surveillance actions due to the serological cross-reaction between BVDV and CSFV antibodies / Mestre

Orientador: Dirlei Antônio Berto / Banca: Fábio Enrique Lemos Budiño / Banca: Messias Alves da Trindade Neto / Banca: José Roberto Sartori / Banca: Antonio Celso Pezzato / Resumo: Foram utilizados 54 leitões de genética comercial, desmamados com idade média de 24 dias e peso médio de 7,35 kg, num delineamento experimental de blocos ao acaso com dois tratamentos, nove repetições e três animais por parcela. Os tratamentos foram rações suplementadas com minerais de fontes orgânicas e inorgânicas (Cu, Zn, Fe, Mn e Se) nas fases pré- inicial, inicial I e inicial II. Foram avaliados os dados médios de consumo diário de ração, ganho diário de peso e conversão alimentar nos períodos de 24 a 28, 24 a 50 e 24 a 57 dias de idade, bem como a incidência de diarréia nos primeiros 14 dias do período experimental. Após a última pesagem foi coletada uma amostra de sangue de cada animal para avaliação dos parâmetros hematológicos e em seguida os leitões foram abatidos para avaliação da deposição de minerais em tecidos e órgãos. As fontes orgânicas de minerais nas rações fornecidas dos 24 aos 57 dias de idade dos melhoraram o ganho diário de peso (P = 0,06), a conversão alimentar (P = 0,05) e aumentaram o número de hemácias (P = 0,10), contudo, não influenciaram a incidência de diarréia ou a deposição de minerais no músculo masseter, fígado, coração, baço e rim. Portanto, o uso de suplemento de minerais de fontes orgânicas pode ser recomendado nas rações por ter sido mais eficiente para leitões na fase de creche. / Abstract: This experiment used 54 piglets from a commercial line, which were weaned at the mean age of 24 days and mean weight of 7.35 kg, in a randomized block design having two treatments, nine replicates and three animals per replicate. The treatments consisted of rations supplemented with either organic or inorganic mineral sources (Cu, Zn, Fe, Mn and Se) during the pre-initial, initial I and initial II phases. Daily ration intake, daily weight gain and feed conversion were computed for three periods: 24-28, 24-50 and 24-57 days of age. Also diarrhea incidence during the first 14 days of the experimental period was evaluated. After the last weighing a blood sample was collected from each animal to evaluate hematological parameters, and then all piglets were slaughtered to evaluate mineral deposition in tissues and organs. The organic mineral sources fed from 24 to 57 days of age improved daily weight gain (P = 0.06) and feed conversion (P = 0.05) and also raised red blood cell count (P = 0.10); however, no evidence was found of any effect on diarrhea incidence or on mineral deposition in the masseter muscle, liver, heart, spleen or kidneys. Therefore, organic mineral supplements can be recommended, as they proved more effective than inorganic sources for nursery piglets. / Doutor

Orientador: Alexandre Secorun Borges / Banca: Francisco Armando de Azevedo Souza / Banca: Júlio Augusto Naylor Lisboa / Resumo: A diarréia é considerada uma das principais causas de doença e mortalidade de bezerros neonatos. Foram colhidas 100 amostras fecais diarréicas e 30 amostras fecais não diarréicas, de bezerros da raça Nelore com até 60 dias de idade para a detecção dos enteropatógenos Salmonella sp., Escherichia coli, rotavírus, coronavírus, Cryptosporidium spp. e ovos de helmintos. O diagnóstico foi realizado respectivamente, pela semeadura em Ágar Salmonella Shigella, Ágar sangue ovino, MacConkey e aglutinação em látex para detecção das E. coliK99+, eletroforese em gel de poliacrilamida, semi-nested PCR, Ziehl-Nielsen modificado e McMaster. Detectaram-se enteropatógenos em 79% das amostras diarréicas e 70% das amostras sem diarréia. No grupo com diarréia, a E. coli (69%) foi o agente mais isolado, seguido do Cryptosporidium spp. (30%), coronavírus (16%) e rotavírus (11%). No grupo controle, a E. coli, Cryptosporidium spp e o coronavírus foram detectados respectivamente em 66,66%, 10% e 3,33% das amostras. A Salmonella sp. e estrongilídeos não foram encontrados em nenhum dos grupos. A fímbria K99 só foi verificada nas cepas de E. coli isoladas de bezerros com diarréia (5.8%). Entre os antimicrobianos testados a enrofloxacina, norfloxacina e gentamicina foram os mais efetivos. Onfalopatias estavam presentes em 43% dos bezerros com diarréia e ausentes nos bezerros do grupo controle. O peso aos 210 dias de vida dos bezerros foi similar nos grupos com e sem diarréia. / Abstract: Diarrhea is considered as one of the main causes of disease and mortality in newborn calves. Fecal samples from 100 diarrheic and 30 fecal samples from non-diarrheic Nelore calves less than 60 days old were collected to detect Salmonella sp, Escherichia coli, rotavirus, coronavirus, Cryptosporidium ssp. and helminthes eggs. The diagnostic techniques employed were, respectively, culture in agar Salmonella Shigella, ovine blood-agar, McConkey and latex agglutination test to detected E. coliK99+, polyacrylamide gel eletroforesis, semi-nested PCR, Ziehl-Nielsen and McMaster tets. Enteropathogens were detected in 79% diarrheic samples and 70% non diarrheic samples. Among diarrheic calves the Escherichia coli (69%) was the most common agent found, following the Cryptosporidium spp. (30%), coronavirus (16%) and rotavirus (11%). In the control group, E. coli, Cryptosporidium spp and coronavirus were detect in 66,66%, 10% and 3,33% of samples respectivelly. Salmonella sp. and strongylids weren’t found on any groups. The K99 fimbrial only was detected only in E. coli strain isolated from diarrheic calves (5,8%). Among the antimicrobials tested, enrofloxacin, norfloxacin and gentamicin, were most effective. Umbilical diseases were detected in 43% of diarrheic calves and not detected in calves of control group. The weight at 210 days old calves was similar in diarrheic and non diarrheic calves. / Mestre

Orientador: Márcia Garcia Ribeiro / Banca: Antonio Carlos Paes / Banca: Lisiane de Almeida Martins / Resumo: A diarreia é causa comum de morbimortalidade em potros neonatos. Os principais agentes causais de origem bacteriana na enterite em potros são: Salmonella spp., Escherichia coli, Clostridium difficile, Clostridium perfringens e Rhodococcus equi. Foram colhidas 80 amostras de fezes de potros com diarreia e 26 sem diarreia, perfazendo 106 animais com idade até três meses de idade, de diferentes raças, provenientes de propriedades do interior do estado de São Paulo. Foi investigado fatores de virulência de Escherichia coli, caracterização dos sorotipos de Salmonella spp., detecção de toxinas de Clostridium difficille e Clostridium perfringens, e perfil de sensibilidade microbiana das linhagens de E. coli e Salmonella spp. Foram isoladas 64 (60,3%) estirpes de Escherichia coli, o gene fimH em 34 (53,9%) linhagens, o gene ag43 em 33 (52,3%) estirpes e o gene papC em seis (9,5%) isolados. Foram isoladas 17 (16,0%) linhagens do gênero Salmonella. Foram identificadas 20 linhagens de Clostridium perfringens,17 positivos para toxina A e três a toxina A beta 2. Duas amostras de fezes foi isolado Clostridium difficile, produtores das toxinas A/B. Infere-se no presente estudo a complexidade etiológica na enterite de potros até três meses de idade, a baixa relação dos fatores de virulência de E. coli pesquisados com linhagens isoladas de animais com diarreia, a relevância em saúde pública dos sorotipos de Salmonella spp. identificados nos potros, o predomínio da toxina A nos isolados de C. perfringens e C. difficile, e a necessidade da adoção de tratamento das enterites com respaldo dos testes de sensibilidade microbiana / Abstract: Diarrhea is a common cause of morbidity and mortality in neonatal foals. The main causative agents of bacterial of enteritis in foals are: Salmonella spp., Escherichia coli, Clostridium difficile, Clostridium perfringens and Rhodococcus equi. Were collected 80 stool samples from foals with diarrhea and 26 without diarrhea, totaling 106 animals, aged three months old, different races and from properties in the state of São Paulo. Were investigated virulence factors from E. coli, characterization of the serotypes of Salmonella spp., detection of toxins of Clostridium perfringens and Clostridium difficille, and antimicrobial susceptibility to E. coli and Salmonella spp. strains. Were isolated 64 (60.3%) E. coli strains, the detection of the fimH gene in 34 (53.9%) strains, the gene ag43 in 33 (52.3%) strains and gene papC in six (9 , 5%) isolated. We isolated 17 (16.0%) strains of Salmonella. Were identified 20 strains of Clostridium perfringens, 17 detected the toxin A and three the toxin A beta 2. Two stool specimens was isolated Clostridium difficile toxin producer A / B. It is inferred in the present study the complexity enteritis in foals up to three months, the low ratio of virulence factors of E. coli strains isolated from animals with diarrhea, the public health relevance of the serotypes of Salmonella spp. identified in foals, the prevalence of toxin A in isolates of C. perfringens and C. difficile, and the need to adopt the treatment of bacterial enteritis in foals with the backing of microbial sensitivity tests / Mestre

Orientador: José Jurandir Fagliari / Banca: Mario Roberto Hatayde / Banca: Roberto Calderon Gonçalves / Resumo: O estudo teve como objetivo avaliar as alterações clínicas e laboratoriais de bezerros infectados experimentalmente com Salmonella Typhimurium e verificar o efeito do tratamento desses bezerros com antibiótico florfenicol associado ou não à fluidoterapia. Para isso, foram constituídos quatro grupos experimentais, compostos por seis bezerros cada, os quais receberam, por via oral, aproximadamente 109 UFC de Salmonella Typhimurium (exceto o grupo 1) e que foram submetidos aos seguintes procedimentos: controle (grupo 1); infectados, mas sem tratamento (grupo 2); tratamento apenas com florfenicol (grupo 3) e tratamento com florfenicol associado à fluidoterapia (grupo 4). Todos os bezerros foram submetidos ao exame físico imediatamente antes da inoculação experimental e a cada 12 horas, até o sexto dia após a inoculação. Foram coletadas amostras de sangue, uma vez ao dia, para a realização de exames hematológicos, hemogasométricos, bioquímicos e proteinograma. Foram também coletadas, diariamente, amostras de fezes por meio de suabes retais para o isolamento de Salmonella através de exames microbiológicos. Durante a fase experimental, os animais foram alojados em bezerreiros individuais e não houve a ocorrência de óbito em nenhum dos grupos, mostrando que este sorotipo tem importância epidemiológica devido à eliminação do agente no ambiente ter ocorrido de forma intermitente ou contínua. A S. Typhimurium foi capaz de causar febre, diarréia de grau variável, tendência a leucocitose, diminuição do teor sérico de ferro, hipoglicemia e hiperfibrinogenemia. Os bezerros que receberam tratamento à base de florfenicol associado ou não à fluidoterapia tiveram menos dias de diarréia e febre e apresentaram menor período de excreção do agente etiológico pelas fezes. / Abstract: The aim of the study was to evaluate clinical and laboratorial changes in experimentally Salmonella Typhimurium-infected calves and the effect of florfenicol antibiotic treatment associated or not to fluid therapy. Four experimental groups, comprising six calves, were formed. With the exception of group 1, animals orally received about 109 CFU of S. Typhimurium and underwent the following procedures: control (group 1), without any treatment (group 2), treatment with florfenicol only (group 3) and treatment with florfenicol associated to fluid therapy (group 4). All calves were submitted to physical examination before experimental inoculation and at every 24 hours up to the 6th day after infection. Blood samples were collected for hematological, hemogasometric, biochemical and protein analysis. Rectal swabs were performed for the isolation of Salmonella by standard microbiological techniques. The calves were maintained individually and there were no deaths during the experiment, which means that this sorovar has an epidemiological importance related to the intermitent or continuous elimination of the bacteria. S. Typhimurium experimental infection was able to cause fever, different degrees of diarrhea, increased values of leukocytes and fibrinogen concentration and decreased values of seric iron and glicemia. The groups treated with antibiotic associated or not to fluid therapy had a shorter period of diarrhea and elimination of the bacteria in the feces. / Mestre

Resumo:Até o momento, a doença causada pelo coronavirus canino (CCoV) não foi totalmente elucidada, e o papel que o CCoV desempenha na patogenia da enfermidade não está bem estabelecido. Somente após o aparecimento da SARS (Síndrome Respiratória Aguda) em seres humanos causada por um coronavirus em 2002 isolado de um mamífero selvagem, foram desenvolvidos vários estudos com coronavirus de diversas espécies na busca de variantes circulantes. Poucos estudos têm reportado a presença dos CCoV e suas variabilidades no Brasil. Enterites virais são responsáveis por altas taxas de morbidade e mortalidade na clínica de pequenos animais e, embora existam diversos agentes etiológicos descritos, o CCoV e o CPV ainda são considerados uns dos principais patógenos causadores de gastroenterite aguda em cães jovens. Para o presente estudo, foram colhidas 100 amostras de fezes de cães atendidos em uma rotina hospitalar veterinária com sinais clínicos de gastroenterite (hemorrágica ou não). Foram amplificados RNA do CCoV e o DNA do CPV nas amostras testadas. Alguns dos produtos da amplificação para CPV foram purificados, sequenciados, alinhados e submetidos ao GenBank para detecção do CPV-2c e caracterização do CCoV. O CCoV mostrou-se presente em 6% das amostras analisadas, enquanto o CPV-2a foi identificado em 43% das amostras e o CPV- 2b em 18% do total. Um pool de amostras submetidas ao sequenciamento e análise filogenética identificou o CPV-2c, revelando que a nova variante já está presente em Araçatuba - SP. A análise filogenética para o CCoV evidenciou que as amostras analisadas pertencem ao subtipo CCoV-IIa (pantrópica), reforçando a importância da identificação desse agente na população canina, uma vez que as vacinas disponíveis atualmente não possuem as novas variantes e de modo que os cães do Brasil estão susceptíveis a graves surtos, como já descritos em outros países / Abstract:Until now, the disease caused by the canine coronavirus (CCoV) was not fully elucidated, the CCoV role in the pathogenesis of the illness is not quite established. Only after the SARS (Severe Acute Respiratory Syndrome) appearance in human beings caused by a coronavirus in 2002, isolated of a wild mammal, many studies were developed with coronavirus of different species in search of circulating variants. Few studies had reported the presence of CCoV and his variability's in Brazil. Viral enteritis are responsible by high morbidity taxes and mortality in the small animals clinic and, although there are several etiologic agents described, the CCoV and the CPV are not yet considered a major cause of acute gastroenteritis pathogens in young dogs. For the present study, were collected 100 stool samples from dogs attended in a veterinary hospital routine with clinical signs of gastroenteritis (hemorrhagic or not). The CCoV and CPV RNA were amplified in the tested samples. Some of the by-products from the CPV amplification were purified, sequenced, aligned and subjected to the GenBank for the detection of CPV-2c and characterization of CCoV. The CCoV was present in 6% of the analyzed samples, while CPV-2a was identified in 43% of samples and CPV-2b in 18% of the total. A sample pool submitted to the sequencing and filogenetic analysis identified the CPV-2c, reveling that the new variant is already present in Araçatuba - SP. The phylogenetic analyses for CCoV revealed that the studied samples belong to the Subtype CCoV-IIa (pantropic), strengthening the agent identification importance in the canine population, once that the actual available vaccines don't have the new variants so that the dogs from Brazil are susceptible to severe outbreaks, as described in other countries. / Orientador:Tereza Cristina Cardoso da Silva / Banca:Roberto Gameiro de Carvalho / Banca:Andrea Fontes Garcia / Mestre

O vírus da diarreia viral bovina (BVDV) causa uma das doenças mais importantes de bovinos em termos de custos econômicos e sociais, uma vez que é largamente disseminado na população de gado leiteiro. Os objetivos do trabalho foram estimar a prevalência em nível de rebanho e investigar fatores associados aos níveis de anticorpos em leite de tanque através de um estudo transversal, bem como discutir e comparar diferentes técnicas de modelagem, as tradicionais como regressão e as menos usuais para este fim, como as de Machine learning (ML) como Random Forest. O estudo transversal foi realizado no estado do Rio Grande do Sul para a estimação da prevalência de doenças reprodutivas baseados em amostras de tanque de leite, partindo de uma população total de 81.307 rebanhos. Foram coletadas 388 amostras de tanque de leite, e nas propriedades selecionadas foi aplicado um questionário epidemiológico. Como resultados se identificou uma prevalência de 23,9% (IC95% = 19,8 - 28,1) de propriedades positivas. Através de análise de regressão de Poisson se identificou como fatores associados o BVDV: o exame retal como rotina para o diagnóstico de prenhes, Razão de Prevalência [PR] = 2,73 (IC 95%: 1.87-3.98), contato direto entre animais (contato via cerca de propriedades lindeiras) (PR=1,63, IC 95%: 1.13-2.95) e propriedades que não utilizavam inseminação artificial (PR=2.07, IC 95%: 1.38-3.09) Na técnica de Random Forest pôde-se identificar uma dependência na ocorrência de BVDV devido a: inseminação artificial quando realizada pelo proprietário da propriedade ou capataz, o número de vizinhos que também possuem criação de bovinos, e em concordância com os resultados da regressão quanto a dependência da ocorrência de BVDV devido a palpação retal. Como resultado, pôde-se perceber que o BVDV está distribuído no estado do RS e caso seja de interesse do poder público, o desenvolvimento de um programa de controle da doença pode ser baseado nos resultados encontrados. Por outro lado, a contribuição deste estudo vai além das tradicionais análises realizadas em epidemiologia veterinária, principalmente devido os bons resultados obtidos com a abordagem por ML neste estudo transversal. Por fim, a utilização de técnicas estatísticas mais avançadas contribuiu para elucidar melhor os fatores possivelmente envolvidos com a ocorrência de BVDV no rebanho leiteiro gaúcho. / The bovine viral diarrhea virus (BVDV) causes one of the most important disease of cattle in terms of economic and social costs, since it is widely disseminated in dairy cattle population. The objectives were to estimate the herd level prevalence at and investigate factors associated with antibody levels in bulk tank milk through a cross sectional study, discuss and compare different modeling techniques such as the traditional regression with the ones less used for this approach machine learning (ML). The cross sectional study was conducted in Rio Grande do Sul state to estimate the prevalence of reproductive diseases based on bulk tank milk samples, from a total population of 81,307 herds. Milk samples from 388 bulk tank were sampled, and an epidemiological questionnaire was applied in each farm. The prevalence was 23.9% (95% CI 19.8 - 28.1). Through the Poisson regression analysis, the following factors associated with BVDV were found: routine use of rectal examination for pregnancy (Prevalence Ratio [PR] = 2.73 (IC 95%: 1.87-3.98), direct contact between/among animals (contact over the fence of neighboring farms) (PR = 1.63, IC 95%: 1.13-2.95) and properties that did not use artificial insemination (PR = 2.07, IC 95%: 1.38-3.09). On the other hand, using ML techniques, it was identify a dependency upon the occurrence of BVDV due to: artificial insemination when carried out by the owner of the property or foreman; the number of neighbors who also have cattle, and in accordance with the regression results as the dependence of the occurrence of BVDV due to routine use of rectal examination for pregnancy. BVDV is spread across the State and if the government's interest to launch a disease control program measures should be focusing mainly on better conditions and care in reproduction. On the other hand, the contribution of this study goes beyond traditional analyzes in veterinary epidemiology, mainly due to the good results obtained with the approach by ML in this cross-sectional study. Finally, the use of advances statistics techniques it has been made progress to better elucidate the factors possibly involved in the occurrence of BVDV in state dairy herds.

Introdução. O Ambulatório de Viajantes (DMIP/HC/FMUSP) foi criado em São Paulo em fevereiro de 2001. Atualmente, os viajantes comparecem à clínica para consulta pré-viagem e em caso de doença, quando voltam à cidade. Avaliação pós- viagem não é feita rotineiramente. Esta pesquisa tem como objetivo ampliar as informações sobre as viagens realizadas e avaliar a adequação e a adesão às orientações pré-viagem. Métodos. No período de 03/02/2011 a 31/12/2011 foram convidados a participar do estudo os viajantes que procuraram o ambulatório para consulta pré-viagem. Os viajantes que concordaram em participar assinaram o Termo de Consentimento Livre e Esclarecido. O estudo foi realizado em duas etapas. Orientação pré-viagem: coleta de dados sobre as medidas de prevenção gerais recomendadas em relação a doenças transmitidas por vetores, água e alimentos, exposição acidental a animais; e dados individuais sobre as condições da viagem, vacinação prévia e histórico de saúde. Avaliação Pósviagem: Um questionário foi enviado aos participantes 15 dias após a data prevista de retorno. As respostas foram armazenadas na base de dados Excel. Foi utilizada estatística descritiva para apresentar todas as variáveis relevantes, utilizando Epi Info (CDC) e SPSS. Regressão logística multivariada foi usada para detectar fatores de risco independentes associados com o desenvolvimento de diarréia. Resultados. Foram obtidas 150 respostas (taxa de resposta de 52,8%), sendo 94 % dos participantes brasileiros, 89% com nível universitário, 55,1% do sexo feminino, a maioria entre 25 e 44 anos (54,5%). O tempo desde a consulta até a viagem foi menor de 28 dias em 60,1 %. Os destinos mais frequentes foram África em 58 viajantes (38,7%), seguida pela Ásia em 43 (28,7%). Demanda por serviços de saúde: 10,9% durante a viagem, e 6% no retorno. Causa da procura de atenção médica, diarréia (31,2%), seguido de acidentes em 18,7% e suspeita de malária em 12,5%. Entre os pacientes com diarréia ficar em casa de nativos (RR = 2,38; P = 0,004) e ter várias acomodações (RR 1,93; P = 0,02) foram fatores de risco na análise univariada. Viagem à Ásia foi também fator de risco (P= 0,024). Na análise multivariada a associação não se manteve. Em relação à adesão às medidas profiláticas recomendadas, a utilização de água mineral foi elevada entre todos os viajantes (94,1%), uso de hipoclorito, água fervida e limpeza dos alimentos antes do consumo foi maior no grupo de viajantes com diarréia. Hipoclorito para o consumo de água foi fator de risco (P = 0,003), independentemente do país visitado. Adesão à quimioprofilaxia da malária foi baixa, no entanto, apenas 9,6 % dos viajantes em risco apresentou malária. Exposição acidental a outros animais ocorreu em 4,7% dos viajantes. Relação sexual com conhecidos durante a viagem foi relatada por 20 % dos viajantes; 43,3 % não usaram preservativos; 46,1 % dos viajantes fizeram comentários favoráveis ao atendimento recebido e a utilidade durante a viagem. Conclusões. A principal causa de doença e procura por assistência médica foi diarreia. Adesão à quimioprofilaxia da malária e outras medidas recomendadas foi baixa. A procura por atendimento médico durante e após a viagem foi alta nessa série. Propõe-se aumentar a divulgação do serviço de forma a atingir outros setores da população / Background. The Travelers Outpatient Clinic (DMIP/HC /FMUSP) was established in São Paulo in February 2001. Currently, patients attend the clinic for pre-travel consultation and in case of illness when return to the city. Post-travel evaluation is not done routinely. This research aims to expand the information about the trips; profile occurrences; assess pre-trip orientations; adherence and adequacy, impact on disease prevention, and may be used to improve the pre-travel orientation and quality of care. Methods. In the period from 03/02/2011 to 31/12/2011 were invited to participate in the study travelers seeking outpatient care for pre-travel consultation. Travelers who agreed to participate signed the informed consent form. The study was conducted in two stages. Pre-travel orientation: collecting data on general prevention measures recommended in relation to vector-borne diseases, food and water, accidental exposure to animals, and individual data on the conditions of travel, prior vaccination and health. Post-travel evaluation: A questionnaire was sent to participants 15 days after the expected travel return date. The responses were stored in Excel database. Descriptive statistics were used to present all relevant variables using Epi Info (CDC) and SPSS. Multivariate logistic regression was used to detect independent risk factors associated with the development of diarrhea. Results. Were obtained 150 responses (52.81% response rate); 94% of participants were Brazilians, (89%) had college education, 54.5% of the participants were between 25 and 44 years and 55.1% were female. The time from consultation until the trip was less than 28 days in 60.1%. Travel destination: Africa in 58 travelers (38.7%), followed by Asia in 43 (28.7%). Demand for medical services: 10.9% during the trip, and 6% in return. Cause of seeking medical care: diarrhea (31.2 %) followed by accidents in 18.7% and suspected malaria in 12.5%. Among the patients with diarrhea the accommodation in native houses (RR=2.38 P = 0.004) and multiple accommodations (RR=2.006 P = 0.020) were risk factors. Travel to Asia was also a risk (RR 1.93 P = 0.024). In multivariate analysis the association was not maintained. Regarding adherence to prophylactic measures recommended; the use of mineral water was high among all travelers (94.1%); use of hypochlorite, boiled water and cleaning food before consumption were higher in the group of travelers with diarrhea; finding hypochlorite for water consumption as a risk factor (P = 0.003) regardless of the country visited. Adherence to chemoprophylaxis for malaria was low, however only 9.6% of travelers at risk had malaria. Reporting of accidental exposure to other animals occurred in 4.7% of our travelers. The sexual relationship with acquaintances during the trip was reported by 20% of travelers; of these 43.3% did not use condoms. 46.1% of travelers made favorable comments to the care received and the utility during the trip. Conclusions. The leading cause of illness and demand for medical care was diarrhea. Adherence to chemoprophylaxis for malaria and other recommended measures was low. Looking for medical service during and after the trip was high in this series.Proposes to increase the disclosure of the service in order to reach other sectors of the population .