Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-10T16:33:56Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_EpidemiologiaLeishmanioseTegumentar.pdf: 2943387 bytes, checksum: bdad5034fef1859cb0d6d16086a10724 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2014-04-07T16:57:36Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_EpidemiologiaLeishmanioseTegumentar.pdf: 2943387 bytes, checksum: bdad5034fef1859cb0d6d16086a10724 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-04-07T16:57:36Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_EpidemiologiaLeishmanioseTegumentar.pdf: 2943387 bytes, checksum: bdad5034fef1859cb0d6d16086a10724 (MD5) Previous issue date: 2008 / IEC - Instituto Evandro Chagas / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / ALCOA / A leishmaniose tegumentar (LT) encontra-se em expansão no Estado do Pará, Brasil. Juruti é um dos 143 municípios desse Estado e atualmente cenário de grandes transformações ambientais devido à mineração de bauxita, o que poderá influenciar o padrão de transmissão. Objetivo: Este estudo buscou elucidar aspectos epidemiológicos relevantes para o controle da LT em Juruti. Materiais e Métodos: A frequência de LT e o perfil dos pacientes no hospital municipal "Francisco Barros" foram determinados de janeiro a dezembro/2007. Espécies de flebotomíneos silvestres existentes no entorno de uma área de prospecção da bauxita foram também descritas, durante levantamento entomológico em janeiro/2008 (armadilha Shannon/18h às 20h/2 noites). Em 21 indivíduos, portadores de lesão cutânea suspeita de LT, biópsias de pele foram realizadas entre fevereiro e junho de 2007. Neste grupo procedeu-se ao diagnóstico parasitológico (esfregaço corado e cultura), molecular e teste intradérmico de Montenegro. Utilizaram-se sondas de DNA ribossomal (PCR-SSUrDNA) gênero específicas (S4, S12; S17, S18) e de G6PD, para distinguir o subgênero Viannia (ISVC, ISVA: ISVC, ISVG) e a espécie L. (V.) braziliensis (ISVC, ISVA; ISVC, ISVB). Resultados: No ano de 2007 foram confirmados 42 casos novos de LT, com média mensal inferior a quatro (3,5 ± 0,8), maior frequência em julho (11) e menor em junho e novembro (0). A maioria dos pacientes foi de homens (41/42, 98%) com menos de 20 anos (<10 anos: 30%; 10-20: 57%; 20-40: 12%). A maioria também residia em localidades rurais (33/42, 79%), incluindo áreas impactadas pela mineração (19/42, 45%), e exercia atividades de risco (28/42, 67%). Doze eram funcionários de empresas (29%). A análise molecular das 21 amostras identificou 12 resultados positivos para o gênero Leishmania (57%), sendo 11 (52%) parasitologicamente confirmados. A PCRG6PD identificou 75% das amostras como sendo L. (V.) braziliensis. As demais (3/12, 25%) não hibridizaram com os oligonucleotídeos da PCR-G6PD e, por isso, os produtos da reação de nested-PCR SSUrDNA foram clonados e sequenciados, confirmando que se tratavam de Leishmania (Viannia) sp. Apenas 9/12 (75%) casos confirmados pelos métodos parasitológico e/ou olecular tiveram reações de hipersensibilidade tardia em resposta ao antígeno de Montenegro, cujos diâmetros variaram de 7 a 40mm (16,3 ± 3,2). Capturaram-se 105 flebotomíneos de 13 espécies nas seguintes frequências: 1- Lutzomyia (Ps.) geniculata (23, 22%), 2- Lutzomyia (Ps.) paraensis (21, 20%), 3- Lutzomyia (Ps.) complexa (18, 17%), 4-Lutzomyia (Ps.) davisi (10, 10%), 5- Lutzomyia (N.) flaviscutellata (13, 13%) e outras oito espécies (20, 18%). Discussão: Espécies de Leishmania do subgênero Viannia, sobretudo L. (V.) braziliensis predominam em Juruti, o que é compatível com o extenso diâmetro das reações cutâneas observadas ao antígeno de Montenegro e com os relatos comuns de persistência e recidiva, apesar do tratamento específico. Entre os flebotomíneos antropófilos destacam-se L. (Ps.) complexa (17%) e L. (Ps.) flaviscutellata (13%) por serem vetores de L. (V.) braziliensis e L. (L.) amazonensis respectivamente, associadas às formas severas da LT humana. Conclusão: Medidas de controle em Juruti devem priorizar a redução da morbidade, diagnóstico precoce, busca ativa de LT humana, vigilância entomológica e de microambientes no entorno da área de impacto de mineração. / The tegumentary leishmaniasis (TL) is expanding in Pará State, Brazil. Juruti is one of its 143 municipalities and current scenery of huge environmental changes due to bauxite mining, what can influence the transmission patterns. The aim of this study was to elucidate epidemiological features relevant for the TL control in Juruti. The TL frequency and patients profile in the Municipal Hospital Francisco Barros were determined from January to December/2007. Silvatic phlebotomines species around an area of bauxite prospection were also described during an entomological screening in January, 2008 (Shannon trap/6:00pm to 8:00pm/2 nights). In 21 individuals having cutaneous lesions suspected of TL, skin biopsies were done among February and June, 2007. In this group the parasitological (stained smear and culture), molecular diagnosis (PCR; nested-PCR) and Montenegro Skin Test were done. Primers of ribossomal enusspecific (S4, S12; S17, S18) and of G6PD DNA were used for distinguish subgenus Viannia (ISVC, ISVG) and L. (V.) braziliensis species (ISVC, ISVA; ISVC, ISVB). In 2007, there were confirmed 42 new cases of LT, with mensal average lower than four (3,5 + 0,8), highest frequency in July (11) and lowest in June and November (0). Most patients were represented by men (41/42, 98%) younger than 20 years old (<10 years old: 30%; 10-20: 57%; 20-40: 12%). Most were also resident in rural localities (33/42, 79%) including impact mining area (19/42, 45%) and performed activities of risk (28/42, 67%). The companies’ workers were 12 (29%). The molecular analyses of the 21 samples identified 12 positive for the genus Leishmania (57%), within 11(52%) were parasitologically confirmed. Most positives hybridized extracted DNA with species specific primers (9/12, 75%), while the others were incompatible with primers for subgenus Viannia and for L. (V.) braziliensis species, so the samples were cloned and sequencing, what confirmed L. Viannia) sp. Only 9/12 (75%) confirmed cases by parasitological and/or molecular methods had delayed hipersensibility in response to Montenegro antigen, which diameter varied from 7 to 40mm (16,3 + 3,2). There were captured 105 phlebotomines of 13 species in the following frequency: 1-Lutzomyia geniculata (23, 22%), 2-Lutzomyia paraensis (21, 20%), 3-Lutzomyia complexa (18, 17%), 4-Lutzomyia davisi (10, 10%), 5-Lutzomyia flaviscutellata (13, 13%) and other eight species (20, 18%). Leishmania species of the subgenus Viannia, particularly L. (V.) braziliensis, predominate in Juruti, what is compatible with the large diameter of the cutaneous lesions observed in response to Montenegro antigen and with the common reports of persistence and reactivation even though the specific treatment. Within the antropophilic phlebotomines highlighted Lu. complexa (17%) e Lu. flaviscutellata (13%) since are vectors of L. (V.) braziliensis and L. (L.) amazonensis respectively, associated to the severe forms of human TL. Control measures in Juruti should focus morbidity reduction, early diagnosis, active surveillance of human TL, entomological and microenvironmental surveillance around the impact mining area.

Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-10T15:34:24Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_DescricaoTaxonomicaCruzia.pdf: 2823268 bytes, checksum: 2a504904c9474b3d9d7131ab92ae0688 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2014-04-10T14:53:13Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertacao_DescricaoTaxonomicaCruzia.pdf: 2823268 bytes, checksum: 2a504904c9474b3d9d7131ab92ae0688 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-04-10T14:53:13Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_DescricaoTaxonomicaCruzia.pdf: 2823268 bytes, checksum: 2a504904c9474b3d9d7131ab92ae0688 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Previous issue date: 2011 / O Brasil possui a maior biodiversidade do planeta, apresentando ecossistemas importantes como a Floresta Amazônica, Mata Atlântica, Cerrado, Pantanal e a Caatinga. A Região Amazônica por suas características geográficas e sócio-econômicas, propicia a ocorrência de várias doenças infecciosas e parasitárias emergentes e re-emergentes. O objetivo deste trabalho é realizar estudo taxonômico dos helmintos encontrados no sistema digestivo de marsupiais da espécie Philander opossum, oriundos da Floresta Nacional de Tapirapé-Aquiri – Serra dos Carajás. Este animal silvestre da ordem Didelphimorfia e Família Didelphidae apresenta hábitos noturnos, alimenta-se de frutos pequenos; importante para dispersão das sementes e é comum em ambientes urbanos. O P. opossum é um reservatório silvestre de protozoários (Trypanosoma cruzi e Nuttallia brasiliensis) e vários helmintos. Análises preliminares do intestino deste hospedeiro, mostraram numerosos nematódeos, que foram analisados por microscopia de luz e microscopia eletrônica de varredura para identificação de espécies. A colheita dos nematódeos foi realizada em PBS (Phosphate Buffer Saline) e os parasitos foram transferidos para solução fixadora de AFA (Álcool 70%, Formol P.A. e Ácido acético P.A.), posteriormente estes helmintos foram processados por desidratação em série etanólica crescente, clarificação com Lactofenol de Aman, montagem entre lâmina e lamínula. Realização de análises, desenhos e fotografias foram feitas no microscópio Olympus BX 41 com câmara clara e também processados para microscopia Eletrônica de Varredura (MEV). Os resultados indicaram a presença de parasitos do filo nematoda de intestino grosso de P. opossum de Carajás-PA, pertencentes às famílias Kathlaniidae e Aspidoderidae, sendo que pelos dados morfológicos estes parasitos são espécies novas dos gêneros Cruzia e Aspidodera, respectivamente. / The Brazil possesses the biggest biodiversity of the planet, presenting important ecosystems, such as the Amazonian Forest, Atlantic Forest, Cerrado, Pantanal and the Caatinga. The Amazon region for its geographic and partner-economic characteristics propitiates the occurrence of some „emerging‟ and „re-emerging‟ infectious and parasitic illnesses. The objective of this work is to carry taxonomic studies on the helminthes found in the digestive system of marsupials of the Philander opossum species, deriving from the National Forest of Tapirapé-Aquiri - Mountain range of the Carajás. This wild animal from the Didelphimorfia order and Didelphidae family presents nocturnal habits; it fed on small fruits; is important for dispersion of the seeds and it is common in urban environments. The Philander opossum is a wild reservoir of pathogenic protozoa, such as Trypanosoma cruzi, Nuttallia brasiliensis and many worms. Preliminary analyses of the intestine of this host, showed numerous nematodes that had been analyzed by light Scanning Electronic Microscopy for species identification. The capture of nematodes was made in PBS (Phosphate Buffer Saline) and the parasites were transferred to fixing solution (EAGERNESS) (Alcohol 70%, Formol P.A and ascetic acid P.A.), posteriormenty these helminthes were processed with: dehydration in increasing etanolic series, clarification with Lactophenol of Aman, mounting between blade and coverslip. Analyses, desingns and photographs were made in the microscope Olympus BX 41 with draying and also processed in Scanning Electronic microscopy (SEM). The results indicated the presence of parasites from the thick intestine of P. opossum from Carajás-Pará, belowging to Kathlaniidae and Aspidoderidae families, and according the morphologic data, these parasites are new species from the genus Cruzia and Aspidodera.

Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-10T15:22:06Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_CaracterizacaoNiveisPlasmaticos.pdf: 2770640 bytes, checksum: 31bb1f84b90ba05eca8f3c098f62777a (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2014-04-10T15:34:19Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertacao_CaracterizacaoNiveisPlasmaticos.pdf: 2770640 bytes, checksum: 31bb1f84b90ba05eca8f3c098f62777a (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-04-10T15:34:19Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_CaracterizacaoNiveisPlasmaticos.pdf: 2770640 bytes, checksum: 31bb1f84b90ba05eca8f3c098f62777a (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Previous issue date: 2009 / Considerando a importância do interferon gama (IFN-γ) na imunidade protetora contra o Mycobacterium tuberculosis e o papel funcional do polimorfismo de nucleotídeo único (SNP) IFNG +874T/A na produção de IFN-γ, no presente estudo investigamos a relação desse polimorfismo genético com suscetibilidade à tuberculose. Fizeram parte do estudo um total de 129 pacientes com tuberculose pulmonar (TBP), 33 com tuberculose extrapulmonar (TBEP) e em 156 profissionais da saúde, negativos para tuberculose, com resultados tuberculínicos (PPD+ e PPD-) dos quais foi coletada uma amostra de 5 mL de sangue total. As concentrações séricas de IFN-g foram mensuradas usando um ensaio imunoenzimático. O polimorfismo na posição +874A no gene IFN-g foi investigado por meio da técnica de ASO-PCR (allele specific oligonucleotide – polymerase chain reaction). Verificamos uma associação entre a presença do alelo +874A e do genótipo +874AA com a tuberculose ativa (p<0.0001, CI=95%, 1.64 - 3.22), ao mesmo tempo em que o alelo +874Te genótipo +874TT estiveram em maior freqüência nos indivíduos do grupo controle. A média das concentrações plasmáticas de IFN-g nos pacientes com tuberculose foi significativamente menor que aquela observada no grupo controle, como também foi menor no grupo com TBEP do que no grupo com TBP, sugerindo uma relação dos baixos níveis séricos dessa citocina na tuberculose ativa, bem como na progressão para as formas mais graves da doença. Ademais, foi observada a associação dos genótipos +874TT e +874AA com altas e baixas concentrações de IFN-γ, respectivamente, tanto nos pacientes com tuberculose quanto no grupo controle. Assim sendo, os resultados sugerem uma associação do polimorfismo do gene IFNG +874T/A com suscetibilidade à infecção pelo M. tuberculosis na população estudada. / Regarding the importance of interferon gamma (IFN-γ) in protective immunity against Mycobacterium tuberculosis and the functional role of the single nucleotide polymorphism (SNP) IFNG +874T/A in the IFN-γ production, in the present study, it was investigated the relationship of this genetic polymorphism with susceptibility to tuberculosis. A total of 129 subjects with pulmonary TB (TBP), 33 with extrapulmonary tuberculosis (TBEP) and 156 control group were investigated. Five microliters of blood sample was collected and the plasma was used to measure IFN-g serum concentration by enzyme-linked immunoassay. DNA samples were extracted from leucocytes and used to investigate the polymorphism +874T/A in the IFN-g gene using ASO-PCR (allele specific oligonucleotide - polymerase chain reaction). It was found an association between the presence of the allele +874 A and the genotype +874 AA with the active tuberculosis (p<0.0001, CI = 95%, 1.64 - 3.22), at the same time that, the allele + 874T and genotype +874 TT were more frequent in the control group. The average IFN-g plasma concentrations in patient was significantly lower than that one observed in the control group, as well it was lower in the group with TBEP than in the group with TBP, suggesting a relationship of the low serum levels of this cytokine with the active tuberculosis and the progression to more serious forms of the disease. Furthermore, we observed the association of the +874 TT and +874 AA genotypes with high and low concentrations of IFN-γ, respectively, both in TB patients and control groups. Thus, the results suggest an association of polymorphism +874T/A with the susceptibility to M. tuberculosis infection in the studied population.

Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-10T16:00:13Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_DistribuicaoEspacialCriadouros.pdf: 9854071 bytes, checksum: 59f48d4fa7c46e8e1c891bdf68b13e50 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2014-04-14T17:09:50Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertacao_DistribuicaoEspacialCriadouros.pdf: 9854071 bytes, checksum: 59f48d4fa7c46e8e1c891bdf68b13e50 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-04-14T17:09:50Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_DistribuicaoEspacialCriadouros.pdf: 9854071 bytes, checksum: 59f48d4fa7c46e8e1c891bdf68b13e50 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Previous issue date: 2007 / O presente trabalho teve como objetivo estudar a distribuição espacial dos criadouros de Aedes (Stegomyia) aegypti Linnaeus 1762 Diptera: Culicidae) em pontos georreferenciados de dois bairros da cidade de Macapá-AP. Os espécimes foram coletados em dois períodos (seco e chuvoso) e analisados qualitativa e quantitativamente. Realizou-se mapeamento dos imóveis inspecionados, destacando-se aqueles com criadouros positivos para formas imaturas de A. aegypti, além de entrevistas com os residentes locais, a fim de se avaliar aspectos sócio-econômicos relacionados à ocorrência da espécie em questão. No bairro do Trem os depósitos móveis, detiveram 21,90% das larvas coletadas no período seco e 24,60% no período chuvoso; depósitos fixos 22,38% no período seco e 20,59% no período chuvoso; e depósitos removíveis 49,05% no período seco e 48,93% no período chuvoso. No Bairro Cidade Nova as fossas e depósitos de água para consumo, detiveram 26,79% e 18,66% no período seco respectivamente. No período chuvoso, os depósitos de água para consumo subiram para 34,16 %, as fossas se mantiveram inalteradas, sugerindo que esse último seja considerado um recipiente preferencial para a desova do mosquito. Constatou-se que o abastecimento de água encanada cobre 93% das residências do bairro do Trem, e 73% do bairro Cidade Nova, o qual não dispõe de rede de esgoto sanitário. No bairro do Trem houve variabilidade regular na distribuição dos criadouros nos dois períodos estudados. No bairro Cidade Nova o comportamento espacial apresentou uma tendência de variabilidade irregular, sendo possível caracterizar as áreas de risco existentes em relação ao tipo de criadouro. De modo geral, conclui-se que uma das grandes capacidades da análise de dados georeferenciados é a sua manipulação para produzir novas informações que contribuam para uma melhor gestão das medidas de controle. / The present work had as objective to study the spatial distribution of the breeding places of the Aedes (Stegomyia) aegypti Linnaeus 1762 Diptera: Culicidae) at geo referenced places of two districts of the Macapá-AP city. The specimens were collected in two periods (dry and rainy) and analyzed qualitatively and quantitatively. It was done mapping of buildings inspected, emphasizing those with positive breeding places for immature ways of A. aegypti, besides interviews with the local residents, in order to avaliate social economic aspects related to the occurrence of the species in question. In the “Trem” district, the moveable deposits, detained 21,90% of the worms collected at the dry period and 24,60% at the rainy period; fixed deposits 22,38% at the dry period and 20,59% at the rainy period; and the moveable deposits 49,05% at the dry period and 48,93% at the rainy period. In the “Cidade Nova” district the cesspools and deposits of water for consumption, detained 26,79% and 18,66% respectively. At the rainy period, the deposits of water for consumption increased to 34,16%, the cesspools maintained unaltered; suggesting that the latter is considered a preferred container for the spawning of the mosquito. It was evidenced that the canalized water supply covers 93% of the residences in the “Trem” district and 73% for the “Cidade Nova” district, which has no network of sanitary sewage. In the “Trem” district there were regular variability in the distribution of breeding places in the two periods studied. In the “Cidade Nova” district the spatial behavior presented a tendency of irregular variability, being possible to define the existing risk areas in relation to the type of breeding places. In a general run, it was concluded that one of the greatest capabilities of the analysis of geo referenced data is its manipulation to produce new information that contribute to a better management of the measures of control.

Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-10T14:19:02Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_CaracterizacaoMolecularResistencia.pdf: 1315015 bytes, checksum: 33f232486bd4059ca72f021147a46b39 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2014-04-16T14:47:41Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertacao_CaracterizacaoMolecularResistencia.pdf: 1315015 bytes, checksum: 33f232486bd4059ca72f021147a46b39 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-04-16T14:47:41Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_CaracterizacaoMolecularResistencia.pdf: 1315015 bytes, checksum: 33f232486bd4059ca72f021147a46b39 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Previous issue date: 2010 / A resistência às drogas antirretrovirais é o inevitável resultado da incompleta supressão da replicação do HIV-1. No presente estudo foi caracterizado o perfil de resistência genética aos antirretrovirais em amostras sorológicas provenientes dos estados do Amazonas e Pará, Região Norte do Brasil, no período de 2002 a 2006. Um total de 127 amostras de plasmas obtidas de pacientes HIV positivos e/ou Aids foram submetidas ao teste de resistência pelo ViroSeqTM Genotyping System (Celera Diagnostic-Abbott, USA). Considerando a informação genética derivada das regiões da protease e/ou transcriptase reversa do HIV-1, o subtipo B foi observado em 85% dos casos; seguido por ambos subtipo F1 e forma recombinante BF1 (4,6%) e CF1 (0,8%). A mutação M184V (81,1%) foi a mais comumente observada associada aos NRTI, em indivíduos positivos com TARV no estado do Pará, e a mutação T215F/Y (56,3%) em indivíduos do estado do Amazonas. A mutação K103N foi a mais prevalente (em torno de 33,5%) para os NNRTI em ambos os estados. O perfil de mutação de resistência associado ao gene da protease mostrou a mutação minor L63P como a mais frequente em ambos os estados. O estudo revelou a importância da identificação de mutações associadas com resistência às drogas antirretrovirais para o uso em futuros esquemas terapêuticos. Os resultados deste estudo foram similares aos outros realizados em várias regiões do Brasil. / Drug resistance is a major consequence of the incomplete suppression of HIV-1 replication. In this study we characterized the HIV-1 genetic resistance profile in blood samples obtained from patients of the Amazonas and Pará states, in the Northern region of Brazil, between 2002 and 2006. A total of 127 plasma samples were collected from HIV positive/Aids patients and submitted to the analyses of resistance by ViroSeqTM Genotyping System test (Celera Diagnostic-Abbott, USA). Regarding the genetic data obtained from protease (PR) and/or reverse transcriptase (RT) genes, the subtype B was the most observed with prevalence of 85% of the cases, followed by F1 subtype and BF1 recombinant forms (4.6%) and CF1 recombinant form (0.8%). The M184V (81.1%) mutation was the most commonly observed NRTI-associated mutation in positive individuals failing HAART from Pará state, and T215F/Y mutation (56,3%) in individuals from Amazonas state. The K103N mutation was the most prevalent (about 33.5%) for non-nucleoside RT inhibitor in both states. The profile of resistance mutation associated with the PR gene displayed the minor protease mutation L63P as the most frequent in both states. This study revealed the importance of identifying mutations associated with viral resistance to antiretroviral drugs to be used in future therapeutic schemes and the results were similar to other performed in different Brazilian regions.

Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-12T15:36:04Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_PrevalenciaInfeccaoPapiloma.pdf: 852513 bytes, checksum: f84c00f90f7ca96bb2dce362120d31ba (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2014-02-13T12:57:46Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_PrevalenciaInfeccaoPapiloma.pdf: 852513 bytes, checksum: f84c00f90f7ca96bb2dce362120d31ba (MD5) / Made available in DSpace on 2014-02-13T12:57:47Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_PrevalenciaInfeccaoPapiloma.pdf: 852513 bytes, checksum: f84c00f90f7ca96bb2dce362120d31ba (MD5) Previous issue date: 2009 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O Papilomavírus humano infecta as células basais do epitélio estratificado, induzindo o desenvolvimento de lesões proliferativas benignas na pele ou mucosas. As infecções apresentam distribuição universal. Muitos estudos têm demonstrado a forte associação da infecção por espécies de alto risco com casos de câncer cervical. Sendo assim, o presente estudo visou determinar a prevalência da infecção pelo HPV em um grupo de mulheres investigadas para o câncer cervical. No período de janeiro de 2008 a dezembro de 2009 foram coletadas amostras cervicais de 180 mulheres atendidas no Laboratório de Citopatologia da UFPA, sendo 162 elegíveis para o estudo. De cada participante foi coletada duas amostras, uma destinada à confecção do esfregaço para posterior análise citológica, através do Método de Papanicolaou e a outra destinada à análise por biologia molecular a fim de se investigar a presença do HPV, na qual utilizou-se os iniciadores MY09 e MY11. As espécies de HPV foram identificadas através da técnica de seqüenciamento de bases nucelotídicas da ORF L1 do HPV. A análise do perfil epidemiológico do grupo estudado demonstrou que a média de idade correspondia a 37,5 anos. A maioria (49,38%) era casada, 37,65% havia iniciado a atividade sexual entre 13 e 17 anos de idade e 58,64% não usava preservativos durante as relações sexuais. A prevalência global do HPV encontrada foi de 18,52%. Treze espécies diferentes foram identificadas, sendo que a maioria (66,67%) pertencia ao grupo de baixo risco, no qual o HPV-11 foi mais freqüente. Dentre o grupo de alto risco (30%) o HPV-31 foi encontrado em quatro casos. A distribuição das espécies de HPV de acordo com o resultado citológico demonstrou que a ocorrência da infecção foi maior no grupo de mulheres cujo esfregaço era livre de alterações citológicas (43,33%). No grupo de mulheres com alterações pré-malignas só observou-se infecções por espécies de baixo risco (10%). A infecção pelo HPV mostrou associação estatisticamente significativa com a atividade sexual e com a freqüência na realização do exame preventivo. A prevalência encontrada no estudo corrobora com outros achados descritos na literatura. A predominância da infecção em mulheres com citologia normal reforça a idéia de que a infecção é, em sua maioria, assintomática e que o método de Papanicolaou é menos eficiente na detecção da infecção em relação às técnicas de biologia molecular. Entretanto, ao se tratar de detecção de doença pré-maligna ou maligna, a biologia molecular não se aplica e, portanto não deve substituir o PCCU. / The human Papillomavirus infects basal cells of stratified epithelium, inducing the development of benign proliferative lesions in the skin or mucous membranes. The infections have universal distribution. Many studies have demonstrated the strong association of infection by species of high-risk cervical cancer. Therefore, this study sought to determine the prevalence of HPV infection in a group of women screened for cervical cancer. From january 2008 to december 2009 were collected cervical samples from 180 women seen at the Laboratory of Cytopathology of Universidade Federal do Pará (UFPA), with 162 eligible for the study. Each participant was collected two samples, one for the manufacture of cytological smears for subsequent analysis by the Papanicolaou method and the other for analysis of molecular biology, in order to investigate the presence of HPV, using the primers MY09 and MY11. The species of HPV have been identified by PCR sequencing of nucleotide bases of the L1 ORF of HPV. The analysis of the epidemiological profile of the study group showed that the average age accounted for 37.5 years. The majority (49.38%) were married, 37.65% had initiated sexual activity between 13 and 17 years old and 58.64% did not use condoms during sex. The overall prevalence of HPV was found to be 18.52%. Thirteen different types were identified, with the majority (66.67%) was a low-risk group, in which HPV-11 was more frequent. Among the high risk group (30%) HPV-31 was found in four cases. The species distribution of HPV according to the cytology showed that the prevalence of infection was higher in the group of women whose smear was free of abnormal cytology (43.33%). In the group of women with premalignant changes only observed infections by species of low risk (10%). HPV infection was significantly associated with sexual activity and the frequency in the completion of screening. The prevalence in this study corroborates other findings in the medical literature. The prevalence of infection in women with normal cytology reinforces the idea that the infection is mostly asymptomatic and the Papanicolaou method is less efficient in detecting the infection than the techniques of molecular biology. However, when dealing with disease detection premalignant or malignant, molecular biology is not applicable and therefore should not replace the PCCU.

Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-11T16:24:52Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_InvestigacaoPolimorfismoExon.pdf: 618216 bytes, checksum: cb612123b280ea32c1c13811553b9357 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2014-02-14T16:17:28Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_InvestigacaoPolimorfismoExon.pdf: 618216 bytes, checksum: cb612123b280ea32c1c13811553b9357 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-02-14T16:17:28Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_InvestigacaoPolimorfismoExon.pdf: 618216 bytes, checksum: cb612123b280ea32c1c13811553b9357 (MD5) Previous issue date: 2009 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A lectina ligante de manose (MBL) é uma proteína considerada de fase aguda com importante papel na primeira linha de defesa do sistema imune inato, cujos níveis séricos são determinados geneticamente. A MBL ativa a via da lectina do complemento, além de mediar a opsonização e fagocitose de microrganismos. Vários estudos associam os níveis séricos de MBL à suscetibilidade ou resistência a agentes infecciosos entre eles o Mycobacterium tuberculosis, agente causador da tuberculose humana. Neste estudo, com o objetivo de avaliar a ocorrência de uma possível associação entre os polimorfismos e a tuberculose, avaliamos as freqüências das mutações no éxon 1 do gene MBL em um grupo de 167 pacientes com tuberculose, subdivididos em 3 grupos: pacientes com tuberculose pulmonar, pacientes com tuberculose extrapulmonar, pacientes com tuberculose multirresistente a drogas, e grupo controle com 159 profissionais da saúde, negativos para tuberculose. A identificação dos alelos MBL *A, *B, *C e *D foi realizada por meio da reação em cadeia da polimerase, utilizando seqüências de iniciadores específicos e posterior digestão enzimática. As análises das freqüências alélicas e genotípicas do éxon 1 não mostraram qualquer diferença significativa entre pacientes com tuberculose e grupo controle (p>0,05). Não foram observadas associações significativas entre os grupos de tuberculose pulmonar, extrapulmonar e tuberculose multirresistente a drogas, quando relacionados entre si e ao grupo controle. Os dados obtidos em nosso estudo não demonstraram evidencias de qualquer influência das variações do éxon 1 do gene MBL na tuberculose ativa, sugerindo que os polimorfismos nessa região do gene não tem nenhuma influencia na susceptibilidade à tuberculose. / Mannose-binding lectin (MBL) is considered an acute phase protein with important role in the first line of defense of the innate immune system, whose serum levels are genetically determined. The MBL activates the lectin pathway of complement, and mediate the phagocytosis of microorganisms and opsonization. Several studies have associated serum levels of MBL to susceptibility or resistance to infectious agents including the Mycobacterium tuberculosis, causative agent of human tuberculosis. Aiming to evaluate the occurrence of a possible association between MBL gene polymorphisms and tuberculosis, it was evaluated the frequencies of mutations in exon 1 of MBL gene in a group of 167 TB patients, divided into 3 groups: patients with pulmonary tuberculosis, with extrapulmonary tuberculosis, patients with multiresistant tuberculosis to drugs and the control group with 159 health professionals. The identification of alleles MBL*A, *B, *C and *D was performed by polymerase chain reaction, using specific sequences of primers and subsequent enzymatic digestion. The analysis of allelic and genotypic frequencies of exon 1 did not show any significant difference between patients with tuberculosis and control group (p> 0.05). There were no significant associations between groups of pulmonary tuberculosis, extrapulmonary tuberculosis and multidrug drug among themselves and when connected to the control group. Data from our study showed no evidence of any influence of variations in the exon 1 of MBL gene in active tuberculosis, suggesting that the gene polymorphism has no influence on susceptibility to tuberculosis.

Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-13T13:07:51Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_VerificacaoAssociacaoVariabilidade.pdf: 1628183 bytes, checksum: 55fc26df5908aacccaa7561b8a2faab9 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2014-03-31T13:17:59Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertacao_VerificacaoAssociacaoVariabilidade.pdf: 1628183 bytes, checksum: 55fc26df5908aacccaa7561b8a2faab9 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-03-31T13:17:59Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_VerificacaoAssociacaoVariabilidade.pdf: 1628183 bytes, checksum: 55fc26df5908aacccaa7561b8a2faab9 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Previous issue date: 2004 / A asma brônquica é uma desordem inflamatória crônica, complexa, na qual estão envolvidos fatores genéticos e ambientais. A inflamação das vias aéreas na asma é regulada, predominantemente, por células do sistema imunológico e por uma vasta rede de citocinas que interagem mutuamente e com as vias aéreas. O exato desempenho funcional de cada citocina na fisiopatologia da asma ainda necessita ser completamente estabelecido. A presente investigação teve como objetivo comparar a distribuição dos alelos S e Z do gene da A1AT e do polimorfismo do gene do TNF-α (-308 G/A) em uma população de 110 asmáticos, divididos em dois níveis de severidade da asma (com 54 pacientes no nível da doença moderada persistente e 56 pacientes no nível da doença severa persistente). Os genótipos da A1AT e do TNF-α (-308 G/A) foram determinados pela técnica de digestão enzimática (polimorfismo no comprimento dos fragmentos de restrição). O polimorfismo no promotor do gene do fator de necrose tumoral TNF-α (-308G/A), citocina pro-inflamatória que participa da reação inflamatória em pacientes com asma, contribuindo para a hiperreatividade brônquica, não foi na presente investigação, associado com a doença ou com o aumento da hiperreatividade brônquica, nos níveis de severidade sintomática mais graves da doença. / Asthma is a complex chronic inflammatory disorder in which genetic and environmental factors are involved with the remodeling extracelullar matrix. The present study had aim to describe, through genetic methods, the prevalence of both S and Z alpha 1-antitrypsin alleles and the TNF-α (-308) genetic polymorphism, associated with the spectrum of asthma severity levels. A total of 110 asthmatics recruited random sample fora physical examination, determination of cutaneous sensibility with prick test, determination of respiratory parameters (forced expiratory volume in the first second and vital capacity) and DNA analysis by polymerase chain reaction and RFLP, completed this study. The patients was divided in two groups, 54 with moderated asthma and 56 with severe asthma. The genotype distribution of the deleterious variants of alpha 1 - antitrypsin may contribute to the severe persistent level of asthma. The TNF-α (-308 G/A) heterozygotes is not significantly associated with asthma.

Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-11T16:33:10Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_InvestigacaoPolimorfismosExon.pdf: 1535534 bytes, checksum: b86ae2c45bbee081ed98e730a5d77b7f (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2014-03-31T14:58:32Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertacao_InvestigacaoPolimorfismosExon.pdf: 1535534 bytes, checksum: b86ae2c45bbee081ed98e730a5d77b7f (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-03-31T14:58:32Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_InvestigacaoPolimorfismosExon.pdf: 1535534 bytes, checksum: b86ae2c45bbee081ed98e730a5d77b7f (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Previous issue date: 2008 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / UNESCO - Organização das Nações Unidas para a Educação, a Ciência e a Cultura / No presente estudo foram investigadas as freqüências das mutações no éxon 1 do gene MBL em um grupo de 128 pacientes com Aids, 116 portadores assintomáticos da infecção pelo HIV-1, 84 mulheres soronegativas profissionais do sexo, com comportamentos de alto risco e 99 indivíduos controles soronegativos, com o objetivo de avaliar a ocorrência de uma possível associação entre os polimorfismos neste gene e a infecção pelo HIV-1. A identificação dos alelos MBL *A, *B, *C e *D foi realizada por meio da reação em cadeia mediada pela polimerase, utilizando sequências de iniciadores específicos e posterior digestão enzimática (RFLP). As análises das frequências alélicas e genotípicas do éxon 1 não mostraram qualquer diferença significativa entre pacientes soropositivos (assintomáticos e Aids) e soronegativos (controle e controle de alto risco) (p>0,05). Não foram observadas associações significativas entre a presença de co-infecções e as variantes alélicas. Entretanto, tuberculose, neurotoxoplasmose, candidíase, neurocriptococose e pneumonia foram as co-infecções com maior prevalência. As associações entre o número de linfócitos TCD4+, a carga viral plasmática e os polimorfismos no éxon 1 do gene MBL nos pacientes com Aids e portadores assintomáticos não foram estatisticamente significante. Desse modo, pode-se sugerir a ausência de associação entre estes polimorfismos e a susceptibilidade à infecção pelo HIV-1, destacando a necessidade de estudos adicionais para determinar se estes polimorfismos apresentam qualquer impacto associado à infecção ou a progressão para a Aids. / The present study investigated the frequency of the mutations in the exon 1 of the MBL gene in a sample of 128 Aids patients, 116 HIV-1 infected asymptomatic individuals, 84 healthy sex worker women with high risk behavior and 99 healthy control individuals, in order to evaluate the occurrence of a possible association between the polymorphisms and HIV-1 infection. The MBL*A, *B, *C and *D alleles identification was performed through a polymerase chain reaction (PCR) followed by restriction endonucleases analyses (RFLP). The analysis of allele and genotype frequencies in the exon 1 of MBL gene did not show any differences between seropositives patients (asymptomatic and Aids individuals) and seronegatives individuals (healthy and high risk controls) (p>0,05). It was not show significant associations between the presences of other related infections and the presence of the alleles variant. However, tuberculosis, toxoplasmosis of the brain, candidosis, meningitis by cryptococcos and pneumonia was the most prevalent co-infections. Associations between the MBL gene polymorphisms and the number of CD4+ T-cells and plasma viral load in the Aids and asymptomatic patients were not statistically significant. Therefore, it has been suggested the absence of association between the polymorphisms and the HIV-1 infection susceptibility, emphasizing the need for further studies to determinate if the present polymorphisms have any impact associated with infection or the progression to Aids.

Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-12T14:44:00Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_PolimorfismosComplexoGenes.pdf: 927640 bytes, checksum: bd6afda9c1ca1e9607125629c5be9466 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2014-04-03T17:11:13Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_PolimorfismosComplexoGenes.pdf: 927640 bytes, checksum: bd6afda9c1ca1e9607125629c5be9466 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-04-03T17:11:13Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_PolimorfismosComplexoGenes.pdf: 927640 bytes, checksum: bd6afda9c1ca1e9607125629c5be9466 (MD5) Previous issue date: 2008 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A hanseníase é uma infecção crônica e granulomatosa da pele e nervos periféricos, que infecta principalmente macrófagos e células de Schwann. A Organização Mundial de Saúde classifica a hanseníase em duas formas polares: multibacilar e paucibacilar, de acordo com o índice baciloscópico e a resposta imune do hospedeiro. As células natural killer (NK) têm um importante papel na infecção, sendo a primeira forma de defesa contra organismos intracelulares. As células NK utilizam muitos tipos de receptores de superfície celular, como os receptores imunoglobulina-símiles de célula NK (KIR), que podem inibir ou ativar a resposta citolítica de NK, através do reconhecimento de moléculas do complexo de histocompatibilidade principal (MHC) de classe I na célula alvo. Nesse estudo caso controle, a presença ou ausência de 15 genes KIR e seus ligantes HLA-C foram investigadas, na intenção de se descrever sua variabilidade genotípica, associação com a hanseníase e sua evolução clínica. A genotipagem do complexo de genes KIR e dos grupos NK1 e NK2 de HLA-C foi feita por PCR-SSP em 105 pacientes e 104 controles. KIR2DL2 e KIR2DL3, na presença do seu ligante HLA-Cw parece predispor à hanseníase (p=0,046; X²= 3,97; OR=1,99; IC 95%= 1,00-3,97). Além disso, a prevalência da hanseníase ao redor do mundo e as freqüências de KIR2DL2 se correlacionaram positivamente. Esse achado, juntamente com a associação entre KIR2DL3 e a tuberculose, descrita por outros autores, sugere que esses genes de receptores inibitórios predispõem à doença. Adicionalmente, o gene KIR2DS2 foi associado com o desenvolvimento da hanseníase paucibacilar (p=0,009; X²= 7,23; OR=3,97; IC 95%= 1,37-9,96), possivelmente modulando o desenvolvimento para a forma mais branda da doença. / Leprosy is a chronic and granulomatous disease of the skin and peripheral nerves, that infects mainly macrophages and Schwann cells. The World Health Organization classifies leprosy in two polar forms: multibacillary and paucibacillary, according to the bacillary index and the immune response from the host. Natural killer (NK) cells play an important role during infection, since it constitutes the first defense against intracellular organisms. NK cells utilize many types of cellular surface receptors, as killer immunoglobulin-like receptors (KIR) that may inhibit or activate NK cytolytic response, through recognizing major histocompatibility complex (MHC) class I molecules on the target cell. In this case-control study, the presence o absence of 15 KIR genes and their HLA-C ligands were investigated, aiming to describe their genotypic variability, association with leprosy infection and clinical progression. Genotyping of KIR repertoire and HLA-C NK1 and NK2 groups was performed by PCR-SSP in 105 patients and 104 controls. KIR2DL2 and KIR2DL3, in the presence of its HLA-Cw ligand, may predispose to leprosy (p=0,046; X²= 3,97; OR=1.99; 95% CI=1.00-3.97). Additionally, worldwide leprosy prevalence and KIR2DL2 frequencies were positively correlated. This find, along with the association between KIR2DL3 and tuberculosis described by other authors, suggests that these inhibitory receptor genes predispose to the disease. Besides, KIR2DS2 was associated with the development paucibacillary leprosy (p=0,009; X²= 7,23; OR=3,7; 95% CI=1,37-9,96), possibly modulating the development toward the mild form of the disease.