La prise de conscience récente de la menace qui pèse sur les océans, réceptacle final de la pollution plastique, a donné lieu à une effervescence dans le domaine scientifique. On estime que plus de 5,25 milliards de particules plastiques flottent dans les océans. Ces travaux de thèse s’inscrivent dans le cadre de cette préoccupation environnementale de premier ordre, en apportant de nouvelles connaissances sur le compartiment bactérien qui se développe sur les débris plastiques en mer, appelé « plastisphère ». L’analyse des prélèvements effectués pendant l’expédition Tara-Méditerranée a permis de caractériser, pour la première fois dans cette zone, un biofilm abondant et spécifique des plastiques par comparaison aux communautés bactériennes attachées aux particules organiques ou libres dans l’eau de mer. Ensuite, la cinétique de colonisation bactérienne sur différents polymères a été étudiée grâce à la mise en place de microcosmes en circulation ouverte sur le milieu naturel. Le couplage original de données biologiques et physico-chimiques des surfaces plastiques a permis de constater un développement bactérien plus important sur des plastiques « biodégradables » (notamment des espèces hydrocarbonoclastes) par rapport aux polymères conventionnels. Enfin, de fortes activités hétérotrophes et ectoenzymatiques ont été constatées sur les polymères par rapport à l’eau de mer. Encore une fois, des différences en fonction des types de plastiques et du stade de formation du biofilm ont été observées. Les travaux menés pendant cette thèse mettent en lumière l’existence d’une nouvelle niche écologique sur les plastiques, distincte de celle de l’eau de mer environnante. / The increasing awareness on the impact of plastic pollution within the marine environment has stimulated countless of scientific studies. For the past decade, researchers have quantified plastic waste and assessed its fate at sea. It is estimated that more than 5.25 billion plastic particles float within the world’s oceans today. This PhD work is a result in part of this major environmental concern. It brings with it new knowledge about the marine bacterial communities that develop on plastic debris, also termed as the "plastisphere". The analysis of samples taken from the Tara-Mediterranean expedition allowed us, for the first time, to characterize, and quantify communities specific towards plastic biofilms in comparison to the communities attached to organic matter in surrounding seawater. Bacterial colonization and its evolution on different types of polymers was studied using microcosm experiments with open seawater circulation. The unusual coupling of biological and physicochemical data of plastic surfaces revealed a greater bacterial development on "biodegradable" polymers compared to conventional polymer types (especially hydrocarbonoclastic species). We showed that the composition of the polymer, together with its hydrophobicity and roughness, influences the diversity of bacterial communities during the early colonization steps. Finally, a greater bacterial biofilm activity (e.g. heterotrophic productions) was observed on polymer surfaces compared to seawater. Once again, differences according to plastic types have been observed. This present work highlights the existence of a new ecological niche on plastics that are distinct from the surrounding seawater.

L’objectif de cette étude était de contribuer à une meilleure connaissance des espèces démersales dans les eaux côtières libanaises en Méditerranée orientale. Différents aspects relatifs à la distribution, la diversité, et la biologie de ces espèces ont été étudiés. Les données ont été collectées à partir de captures expérimentales dans le cadre du projet ‘CIHEAM-PESCA Libano’. Un mélange hautement diversifié d'espèces de poissons (téléostéens et sélaciens), de céphalopodes et de crustacés, ainsi que de organismes macro-benthiques ont été échantillonnés. La distribution spatio-temporelle et la diversité ont été évaluées respectivement à l'aide de la ‘capture par unité d'effort’ qui a été assimilée à un indice d’abondance et du nombre total d'espèces capturées dans les relevés.Des relations longueur-poids ont été établies pour plusieurs espèces présentant un nombre d’individus suffisant. Finalement, l'accent a été porté sur la biologie et l'écologie d'une espèce lesseptienne et exploitée, l’holocentre rouge, Sargocentron rubrum. Cette étude constitue une première étape dans la gestion des pêches et la conservation dans cette région. / The aim of this study was to contribute to a better knowledge of demersal species in the Lebanese coastal waters, Eastern Mediterranean. Various aspect related to the distribution, diversity and biology of these species were studied. The data were collected from a three-year experimental survey in the framework of the ‘CIHEAM-PESCA Libano project’. A highly diversified mix of fish species (teleosteans and selaceans), cephalopods and crustaceans were sampled. Spatio-temporal distribution and diversity was evaluated respectively using the ‘Catch Per Unit Effort’ which was considered as an approximation of an abundance index and the total number of species caught in the surveys.

L’aquaculture de la crevette bleue Litopenaeus stylirostris représente une activité profitable enNouvelle-Calédonie. Cependant, elle doit faire face à deux maladies bactériennes saisonnières quidiminuent les rendements et menacent le développement aquacole. D'après la littérature, lapolyculture avec des poissons pourrait diminuer l'occurrence des maladies, prévenir la dégradation del'environnement et au final augmenter la production des bassins. Cette étude porte sur la faisabilitéd'élever en bassins L. stylirostris avec Siganus lineatus. Les objectifs majeurs ont été 1) d’estimer lacapacité de S. lineatus à s’adapter aux bassins et d’évaluer les performances de croissance, 2)d’estimer la faisabilité technique de la polyculture de L. stylirostris avec S. lineatus et 3) d’estimer leseffets de cette polyculture sur les performances zootechniques des deux espèces et sur lefonctionnement écologiques des bassins par comparaison avec leur monoculture.Pour répondre au premier objectif, Siganus lineatus (5.7g) a été mis en culture à des densités de 7, 14et 21 poissons.m-2 en système clos. Après 8 semaines de culture, les performances de croissance de S.lineatus ont été similaires quelles que soient les densités. S. lineatus peut donc bien s’adapter etcroître dans ces systèmes clos, même à des températures basses, proches de 20°C, et à forte densité.Les fortes densités n’ont pas eu d’effets négatifs sur la croissance, mais sont à l’origine d’unedétérioration des conditions environnementales suite à un apport plus marqué en aliment générantdavantage de déchets organiques. En conséquence, une mortalité de S. lineatus peut apparaître lorsquela concentration en oxygène descend en dessous des 2 mg.L-1.Pour atteindre le 2ème et le 3ème objectif, une seconde expérience a montré que l’ajout de S. lineatus(25.5 g) à une culture de crevettes (2.9 g; 15 crevettes.m-2) à des densités de 0, 1.2 et 2.4 poissons.m-2n’a pas affecté les performances zooetchniques de L. stylirostris sur cette première phase d'élevage.La survie de S. lineatus a été de 100% et sa croissance a été similaire quelle que soit sa densité. Laproduction combinée totale pour les traitements polyculture a augmenté de 47 – 106 % et les indicesde conversions diminuent de 31.6 – 47.7% en comparaison avec le traitement "monoculture decrevettes". L'ajout de S. Lineatus n'a pas eu d'effets significatifs sur la production primaire, larespiration, les flux dissous et particulaires à l'interface eau-sédiment de l'écosystème bassin.Dans une troisième expérience, avec des biomasses initiales plus élevées de L. stylirostris (14 g) de156 g.m-2 en polyculture avec S. lineatus (19 g) (80 g.m-2) et de 237 g.m-2 en monoculture, nous avonsobservé une forte mortalité des crevettes. Inversement, avec des biomasses initiales de S. lineatus (19g) de 155 g.m-2 en polyculture avec L. stylirostris (14 g) (81 g.m-2) et de 235 g.m-2 en monoculture,nous avons montré une augmentation de la biomasse de S. lineatus. En utilisant l'aliment pour sapropre croissance non utilisé par les crevettes, S. lineatus est ainsi capable de limiter l'impact dû àl'eutrophisation de l'écosystème bassin.Les résultats des analyses isotopiques montrent que l'aliment n'est pas une source majeure de carbonepour L. stylirostris et S. lineatus alors qu'il l'est pour l'azote. Le biotope, en y incluant la matièreorganique des sédiments et la matière organique particulaire dans la colonne d'eau est la principalesource de carbone pour les deux espèces et une source secondaire pour l'azote.Pour conclure, S. lineatus est un candidat potentiel pour la culture commerciale / Blue shrimp Litopenaeus stylirostris farming is a major and profitable activity of aquaculture industryin New Caledonia. However, it is facing two seasonal bacterial diseases, which decrease rearedshrimp yield and threaten the sustainability of the aquaculture development. As reported by theliterature, polyculture with fish would have the potential to decrease the impact of these kind ofdiseases, prevent the deterioration of the environment and to increase the production of the ponds. Thefeasibility of L. stylirostris and Siganus lineatus polyculture in earthen ponds was carried out in thisstudy. The main objectives were 1) to estimate the adaptive capacity and growth performance of S.lineatus, and the environmental variations in a closed culture system, 2) to estimate the technicalfeasibility of L. stylirostris and S. lineatus polyculture, and 3) to estimate the effects of L. stylirostrisand S. lineatus polyculture on zootechnical performances and pond ecology in comparison withmonoculture of these species.To answer to the first objective, Siganus lineatus (5.7g) was stocked at 7, 14 and 21 fish.m-2 in aclosed culture system. After 8 weeks of culture period, S. lineatus growth performance was similarbetween all densities. S. lineatus could well adapt and grow in a closed system, even at lowtemperature, ca. 20oC and high stocking density, 21 fish.m-2. High stocking density did not havenegative effects on S. lineatus growth performance, but could cause the environmental deteriorationdue to increased nutrient input and accumulated organic wastes in the culture system. Asconsequence, S. lineatus could die when water oxygen depleted to below 2 mg.L-1.To reach the second and the third objective, a second experiment showed that adding S. lineatus (25.5g) to L. stylirostris (2.9 g) culture system (15 shrimp.m-2) at 1.2 and 2.4 fish.m-2 did not affect L.stylirostris zootechnical performance during the first stage of the rearing. S. lineatus gained 100% ofsurvival and similar growth performance in all densities. The polyculture system increased totalcombined production by 47 – 106 % and reduced FCR by 31.6 – 47.7% compared with those inshrimp monoculture. The addition of S. lineatus to the culture system did not have significantlyeffects on the gross primary productivity, the respiration, the nutrient and particulates fluxes at thewater-sediment interface of the pond ecosystem.In a third experiment, using higher stocking biomasses of L. stylirostris (14 g) at 156 g.m-2 in apolyculture with S. lineatus (19 g) (80 g.m-2) and at 237 g.m-2 in shrimp monoculture, we observed ahigh shrimp mortality. Conversely, stocking biomasses of S. lineatus (19 g) at 155 g.m-2 in apolyculture with L. stylirostris (14 g) (81 g.m-2) and at 235 g.m-2 in monoculture resulted in increasesof S. lineatus biomasses. This study showed that polyculture using S. lineatus is able to reduce organicwastes and nutrient release by consumption uneaten feed and retention input nutrients in biomass thatcontribute to limit the impact of the pond ecosystem eutrophication.Results of stable isotope analyses showed that the used pellet feed was not a major carbon source, butwas an important nitrogen source for both L. stylirostris and S. lineatus. Natural biota, includingsediment organic matter and particulate organic matter, was a main carbon source and represented asa secondary nitrogen source for both species.It may be concluded that S. lineatus is a suitable candidate for commercial culture in bothmonoculture and polyculture with L. stylirostris in earthen pond. Polyculture should be a properapproach that could partly contribute to sustainable development of aquaculture, but needs specificresearch to optimize the trophic status of the reared species.

There are large gaps in the coverage of critical ecological processes related to the movement of individuals or genes (i.e. dispersal), which is critical for determining the spread and persistence of populations across space. In this dissertation we investigate understudied but important aspects of the dispersal process in mangroves, with as the main objective the reduction of parameter and model uncertainty. Models rarely incorporate realism and complexity at the level of emigration, transfer and immigration phases, hampering reliable predictions of dispersal patterns and long-term population dynamics under different climate change scenarios. <p><p>Mangrove ecosystems function at the edge of land and sea, often covering large intertidal areas along (sub)tropical coastal regions worldwide. Mangroves can live in these highly dynamic and demanding environmental conditions via a series of remarkable adaptations. They produce buoyant seeds and fruits (propagules) that disperse at the ocean surface (i.e. hydrochory - see cover image). <p><p>Despite their ecological and economical value, about 40 % of original mangroves have been lost worldwide during the last 50 years due to excessive exploitation and development. Deforestation, degradation and conversion to other land uses like intensive shrimp farming and agriculture have reduced and fragmented these ecosystems at an alarming rate. Climate change, probably most pronouncedly via changes in sea level, poses another important threat. / Doctorat en Sciences / info:eu-repo/semantics/nonPublished

La destruction de l'habitat, les invasions biologiques et leur interaction sont des menaces majeures pour la biodiversité. La Nouvelle-Calédonie est menacée à la fois par des feux d'origine humaine, et par des fourmis invasives : il est important de comprendre leur impact sur ce biotope unique. Pour ce faire, une approche hiérarchique intégrant différents aspects de la biodiversité (composition, structure et fonction) a été adoptée. Les fourmis ont une grande importance écologique, en particulier en milieu tropical, et leur classification en groupes fonctionnels facilite l'interprétation de leur réponse aux perturbations environnementales. Les objectifs de cette étude étaient donc d'évaluer les impacts des feux, des fourmis invasives, et de leur interaction, sur les fourmis natives de Nouvelle-Calédonie, et ce à différentes échelles spatiales (globale, régionale, locale) et temporelles (court et long terme), ainsi qu'à divers niveaux d'organisation biologique (communautés, espèces, gènes). L'étude contribue à une meilleure connaissance de la myrmécofaune calédonienne, en révélant l'absence de fourmis souterraines spécialisées, et en documentant la distribution et composition des communautés de fourmis à l'échelle de l'île, en lien avec l'habitat et les fourmis exotiques. Les mécanismes par lesquels les feux impactent les fourmis natives, y compris en association avec les fourmis invasives, sont révélés. Le feu, en créant les conditions de micro- et macrohabitat favorisées par les fourmis invasives, facilite l'invasion, qui cause ensuite d'avantage de perte de diversité, soit quelques années après un incendie ou dans le contexte de la fragmentation à long terme. L'approche hiérarchique a permis de détecter des réponses contrastées au niveau des espèces et de la génétique, liées à différents traits d'histoire de vie, en plus des réponses mesurées au niveau des communautés. Cette étude souligne l'avantage d'une approche holistique pour adresser des problèmes liés à la biodiversité. / Habitat destruction, biological invasions and their interaction are global drivers of biodiversity loss. The New Caledonian hotspot of biodiversity is threatened by both anthropogenic fires and invasive ants: it is important to understand their impacts on its biota. Because biodiversity spans several levels of organisation (from genes to communities) and relates to different attributes (compositional, structural and functional), this thesis takes a hierarchical approach to address this issue. Ants are of great ecological importance, especially in tropical biomes, and their classification into functional groups provides a global framework for analysing their response to disturbance. My aims were therefore to investigate the impacts of anthropogenic fires and invasive ants, and their interaction, on the native New Caledonian ant fauna at different spatial (global, regional, local) and temporal (short and long term) scales, and at different levels of biological organisation (community, species, genes). The study contributes to an improved knowledge of the New Caledonian ants, by revealing the lack of specialised subterranean species, and by investigating island-scale patterns of ant communities, in relation to habitat and invasion. The mechanisms by which fire impacts native ants, either as a standalone process or in association with invasion could be identified. In particular, I show that fire, by creating macro- and microhabitats favoured by invasive ants, facilitates invasion, which then causes further diversity declines, either in the short- (post-burning) or long-term (forest fragmentation). The hierarchical approach used enabled the detection of contrasting trait-derived responses at the species and genetic level, in addition to responses measured at the community level. This study highlights the advantage of a holistic approach to investigating biodiversity-related issues.

Du point de vue écologique, les efforts de tension ou de compression développés par la maturation du bois au cours de la croissance permettent à l'arbre de maintenir sa posture verticale face à la gravité. Ces efforts, appelés autocontraintes de maturation, résultent de la mise en place d'un bois particulier, le bois de réaction. Sur le plan mécanique, c'est la dissymétrie des autocontraintes entre les deux faces du tronc de l'arbre qui joue un rôle moteur dans le redressement, qui s'exprime par une courbure. Ce travail vise à développer de nouveaux outils théoriques et métrologiques pour étudier le lien entre morphologie de l'arbre et autocontraintes dans un cadre biomécanique et écologique. Une première approche vise à mettre en relation la dynamique de croissance et la compétition du peuplement avec la morphologie et la réaction de contrôle de la posture des arbres. Elle utilise des données issues d'un essai sylvicole de long terme (plantations de hêtres de différentes densités initiales laissées en croissance pendant 26 ans). L'analyse rétrospective de la production du bois de réaction sur des rondelles prélevées sur ces arbres a permis d'évaluer les différentes composantes du mouvement gravitropique au cours du temps. Une loi d'échelle, établie entre la vitesse de courbure et la circonférence des tiges, montre (i) l'effet prépondérant du diamètre de la tige dans sa capacité de réaction, et (ii) l'absence d'effet additionnel de la compétition. En fin d'expérience, l'évaluation de la morphologie des arbres a permis de confirmer le lien entre l'inclinaison et l'élancement de la tige avec les indicateurs de contraintes de croissance. D'un point de vue mécanique, la morphologie de l'arbre s'interprète (i) par la forme de sa tige (inclinaison et courbures), et (ii) par la distribution spatiale de sa biomasse, qui peuvent fournir des variables biomécaniques candidates pour élaborer des modèles de stimulus-réponse. Ainsi, un important travail méthodologique couplant la technologie LiDAR terrestre (un instrument de numérisation laser 3D très prometteur pour les mesures forestières) à des techniques de modélisation géométrique a permis d'obtenir des maquettes 3D précises de la structure ligneuse d'arbres de différentes espèces. Les maquettes ont permis de modéliser la contrainte de flexion exercée par la biomasse aérienne des arbres en vue d'une mise en relation avec les indicateurs de contraintes de croissance mesurées sur leur grume. Les résultats montrent que la contrainte de flexion est une variable très prometteuse pour évaluer le degré de réaction des arbres. La méthodologie ouvre également des perspectives originales pour le suivi temporel de la morphologie de l'arbre en lien avec son interprétation biomécanique. / From an ecological point of view, the tension or compression stresses developed by wood maturation during growth allow the tree to maintain its vertical posture against gravity. These stresses, called growth stresses, results from the formation of a particular wood called reaction wood. From a mechanical point of view, the asymmetry of growth stresses between the two opposite faces of the tree trunk causes its reorientation, characterised by a curvature. This work aims at developing new theoretical and metrological tools to assess the link between tree morphology and growth stresses in a biomechanical and ecological framework. The first approach aimed at establishing the link between growth dynamics and competition of the stand with tree morphology and reaction of posture control. It is based on data taken in a long-term forestry experiment (beech plantations of different initial planting densities that grew during 26 years). The retrospective analysis of reaction wood production on wood discs taken on the trees allowed to assess the variation of their gravitropic performance over time. The scaling law established between curvature rate and stem circumference showed (i) the leading effect of the diameter of a stem on its reactivity, and (ii) the absence of additional effects of competition. At the end of the experimentation, the assessment of the tree morphology allowed to confirm the link between stem leaning and slenderness with growth stresses indicators. From a mechanical point of view, tree morphology can be assess by (i) the shape of its stem (leaning, curvatures), and (ii) the spatial distribution of its biomass, that can provide biomechanical variables for stimulus-response models. Therefore, an important methodological work was performed, based on terrestrial LiDAR technology (a promising tool for forest measurements based on 3D laser digitisation) coupled to geometrical modelling. It allowed to obtain accurate 3D mocks-up representing the woody structure of trees of variables species. The mocks-up allowed to model the bending stress exerted by the aerial biomass of the trees with the aim of linking it to the growth stresses indicators. The results show that bending stress is a promising variable for assessing the degree of reaction of trees. The developed methodology also gives many perspectives for monitoring tree morphology over time with the aim of biomechanical interpretation.

Au vu des atteintes écologiques générées par les paradigmes économiques dominants, ces derniers ne semblent plus tenables. Toutefois depuis quelques années, le souci écologique a commencé à se cristalliser dans de modes de consommation, de valeurs, de pratiques et d’imaginaires associés à la mesure et à la sobriété. Nous nous attachons ainsi à scruter ce changement de paradigme à travers la médiatisation des enjeux environnementaux en France. Il s’agit d’examiner la mise en mots et en discours des problématiques écologiques dans la presse écrite française, aussi bien dans son versant généraliste (journaux quotidiens nationaux) que spécialisé(magazines associatifs et écologistes). L’objectif principal de cette recherche est d’analyser et de comprendre l’émergence et la mise en place de discours et de représentations qui participent à la construction d’un nouvel imaginaire socio-culturel de référence, dit de mesure ou de sobriété. / In view of the ecological infringements generated by the economic paradigms,those do not seem any more bearable. However since a few years, the ecologicalproblems began to crystallize in modes of consumption, values, practices andimaginaries associated to measure and sobriety.We attempt to study this change of paradigm through the media coverage of theenvironmental stakes in France. Our aim it’s to exanimate the words and the speech ofthe ecological problems in the French press: national daily newspapers (non-specializedpress) and associative and ecologist magazines (specialized press).The main objective of this research is to analyze and to understand the emergenceof speeches and representations which participate in the construction of a newsociocultural imaginaries.

Les traits ornementaux sont classiquement vus comme un attribut des mâles chez les espèces animales. Cette vision est liée à un rôle considéré historiquement comme très asymétrique des sexes, avec les mâles qui entrent en compétition (sélection intra-sexuelle) pour attirer les femelles qui choisissent (sélection intersexuelle) le meilleur partenaire. Cette idée fut développée en liaison avec l’asymétrie dans la production des gamètes mâles et femelles. Les femelles, qui produisent un nombre réduit de gamètes de grosse taille, maximisent la chance de survie de leurs descendants en investissant plus dans les soins parentaux ; elles deviennent ainsi le sexe limitant et choisissent les mâles qui entrent donc en compétition pour avoir accès à la reproduction. Tout trait ornemental qui augmente le succès d’appariement sera donc avantageux pour les mâles conduisant à des traits sexuels secondaires plus développés chez ce sexe. Si les traits ornementaux sont fréquents chez les mâles, il existe également de nombreux exemples chez les femelles, notamment chez les espèces socialement monogames à soins biparentaux. C’est seulement récemment que les biologistes évolutifs ont cherché à tester les processus expliquant l’apparition et le maintien des ornements femelles. Si le rôle de la corrélation génétique dans cette évolution est incontestable, et que la sélection sociale est aussi majeure, plusieurs études empiriques ont montré un choix mâle pour les ornements femelles et des modèles théoriques ont déterminé les paramètres conduisant à l’évolution du choix mâle. Par ailleurs, les approches phylogénétiques retraçant l’évolution des ornements ont montré une forte labilité des traits femelles, avec des apparitions et disparitions de traits ornementaux plus fréquentes chez les femelles que chez les mâles. Afin de mieux comprendre la relation entre la sélection sexuelle et l’évolution des ornements femelles, cette thèse s’est construite sur ces résultats précédemment acquis et a mené plusieurs approches pour mieux préciser le rôle de la sélection sexuelle dans l’évolution et le maintien de la coloration chez les femelles. Une approche comparative à l’échelle des passereaux a testé les paramètres déterminés comme conduisant à l’évolution du choix mâle par des modèles théoriques. En accord avec les modèles théoriques, les résultats mettent en avant l’importance de l’investissement du mâle dans les soins parentaux dans l’évolution de la coloration du plumage femelle. Ils montrent également comment l’investissement initial des femelles dans la reproduction limite l’évolution de la coloration femelle. Un autre axe de la thèse s’est focalisé sur la coloration chez une espèce monogame, la Mésange bleue Cyanistes caeruleus, en utilisant un vaste jeu de données à long terme avec10 ans de donnés dans quatre populations pour tester notamment(i) la force de la corrélation génétique, (ii) les liens entre indices de succès de reproduction et coloration et (iii) l’existence d’un appariement par homogamie chez cette espèce. Si les résultats principaux montrent une forte corrélation génétique et soulignent une très forte variation spatiotemporelle, l’application d’outils méta-analytiques a permis de déceler une relation entre les colorations des femelles et les indices de succès de reproduction ainsi qu’un patron faible mais positif d’appariement par homogamie pour les deux patchs étudiés (couronne et bavette). Les deux volets de la thèse représentent de nouveaux apports en faveur de l’évolution des ornements femelles. Ils soulignent la complexité associée à leur évolution et l’importance de prendre en compte la variation spatiotemporelle pour une compréhension étendue et une possibilité de généralisation. / Ornamental traits are classically associated with males in animal species. The asymmetrical view is related to sex roles, in which males are competing (intra-sexual selection) to attract females which chose the best mate (intersexual selection). This idea was developed with the concept of anisogamy, the asymmetry in the production of male and female gametes. Females producing few but large gametes maximize their offspring survival rate by investing more in parental care; they become the limiting sex and chose males which are thus competing for access to reproduction. Then, any ornamental trait increasing pairing success would become advantageous for males, leading to more developed secondary sexual traits in this sex. If ornamental traits are more frequent in males, there are also many examples with females, especially in socially monogamous species with biparental care. Evolutionary biologists have only started recently to test processes explaining the outbreak and maintenance of female ornaments. Genetic correlation is an unquestionable process involved in this evolution, and social selection is also a major process. Several empirical studies have also related male mate choice to female ornaments and theoretical models have defined key parameters driving the evolution of male mate choice. Furthermore, phylogenetical studies retracing the evolution of ornaments have showed a high lability in female traits, with more frequent gains and losses of ornamental traits in females compared to males. In order to link sexual selection to the evolution of female ornaments, this thesis was based on these previous achievements to develop different approaches to better understand the role of sexual selection in the evolution and maintenance of female colouration. Comparative methods in songbirds tested the key parameters defined by theoretical models as driving the evolution of male mate choice. In line with theoretical models, results highlight the importance of male investment in parental care in the evolution of female plumage colouration. They also show how female initial investment in reproduction limits this evolution. Another thesis axis focused on colouration in a monogamous species, the Blue tit Cyanistes caeruleus, using a large dataset across 10 years in four populations and tested in particular (i) the strength of genetic correlation, (ii) relations between proxies of reproductive success and colouration and (iii) the existence of assortative mating in this species. The main results highlight a strong genetic correlation and a wide spatiotemporal variation and the use of meta-analyses revealed correlation between female colouration and proxies of reproductive success as well as a weak but positive pattern of assortative mating on the two measured patches (crown and chest). Both sides of the thesis represent new insights in favour of the evolution of female ornaments. They also highlight the complexity associated with their evolution and the importance of considering spatiotemporal variation for extensive understanding and generalisation.

Petits, isolés, vulnérables, les territoires insulaires apparaissent comme les symboles des interrogations sur la soutenabilité des systèmes économiques. Cette coïncidence n’a rien de fortuite. Les expériences insulaires et coloniales occupent une place centrale dans la formation de l’économie politique, qui s’intéresse initialement tant à l’accroissement des richesses qu’à la pérennité de cette dynamique, notamment en raison des contraintes écologiques. Réciproquement, l’économie politique nourrit la formation d’un nouvel art de gouverner qui influence en profondeur les trajectoires insulaires et produit des rapports de pouvoir, qui persistent encore. Notamment à travers la notion de développement (durable) qui naturalise une lecture utilitariste de la soutenabilité. En rapprochant le paradigme de la complexité, l’économie écologique et les approches poststructuralistes, cette thèse propose d’explorer la construction de ce concept puis de le repenser dans un cadre institutionnaliste qui intègre pleinement les facteurs écologiques, symboliques et sociaux et la pluralité des formes d’organisation des économies. Elle étudie ensuite la construction et les ressorts de l’économie de plantation, à La Réunion et dans les Caraïbes, en interrogeant le paradoxe de l’ « insoutenabilité durable » : comment une économie fondée sur la destruction et incapable de satisfaire les finalités assignées en raison de ses contradictions, peut-elle se maintenir dans la longue durée ? Une troisième partie questionne la soutenabilité du projet départemental : décréter le développement, métamorphoser une colonie ruinée en une économie moderne, équilibrée, tirée par une croissance auto-entretenue. / Small, isolated and vulnerable, islands have become symbols in current debates on the sustainability of economic systems. This is no coincidence. For colonial and insular experiences have played a key role in the emergence of political economy, which, initially focused on the creation of wealth as much as on its durability. Conversely, political economy nurtured the development of a new “art of government” which has deeply influenced islands trajectories and engendered new relations of power that persist today. In particular through the concept of (sustainable) development that naturalizes a contingent, utilitarian, view of sustainability. By bringing together the paradigm of complexity, ecological economics and poststructuralist works, this thesis aims to deconstruct this concept and reframe it through an institutionalist and interdisciplinary approach that fully integrates ecological, symbolic and social factors as well as the multiplicity of economies. It then studies the formation and evolution of plantation economies, both in Reunion Island and the Caribbean, to question the paradox of “durable unsustainability”: why and how can an economy grounded on destruction and unable to satisfy the ends it was designed for, maintain itself on the long term? A third part queries the sustainability of the “departementalisation” project, i.e. decreeing development: turning a ruined colony in a modern economy, able to reach European standards through self-sustained growth. It thus emphasizes the retroactions that wiped this utopia out to give birth to an original, yet fragile, model of resilient dependence.

Cet écrit s'intéresse au rôle de l'économie politique dans les mobilisations rurales contemporaines. En mettant l'accent sur les récentes luttes pour l'eau en Turquie, contre les centrales hydroélectriques « au fil de l'eau (SHP). La recherche creuse principalement les facteurs sociétaux et économiques qui rendent possible ou empêchent l'émergence de mobilisations fortes, à travers la comparaison des réactions contre les projets SHP dans quatre localités de la région de l'est de la mer Noire - Kavak (Arhavi) et Aralik (Borcka)- et son arrière pays Tortum (villages de Pehlivanli et Bagbasi).La logique principale derrière cette comparaison croisée est de déterminer si il y a une relation entre les formes de vies rurales, principalement définies en termes de productions, marché, place dans le système économique général, migrations et viabilité des espaces, et des mobilisations politiques contre les constructions de SHP combinées avec d'autres raisons existantes pouvant mener à une agitation ou des conflits. Dans ce contexte, j'appuierai la thèse que Kavak (Arhavi) et Aralik (Borçka) sont devenus des espaces péri-urbains à travers la transformation particulière par laquelle ils sont passés. Le caractère péri-urbain a facilité le voyage des idées et des schémas de politisations urbaines dans les villes natales des citadins. Dans le cas particulier d’ Arhavi, l'effet de la ville dans la mobilisation anti-SHP est évident. Un groupe de personnes originaires d'Arhavi qui peuvent être qualifiés de nouvelle classe moyenne ont été pionniers de la résistance. Ils ont rendu possible des alliances plus larges et ont contribué au renforcement d'une résistance carnivalesque avec des rituels, une réinvention des traditions et des micro-identités. A Aralik par contre, malgré toutes les tentatives, un modèle similaire n'a pas pu être atteint. Le modèle de migration rurale-urbaine a laissé un espace socio-économique viable dans la ville de Arhavi alors que celle de Aralik a été négativement impactée par ces migrations rurales-urbaines, ce qui peut alors être considéré comme un facteur de non-viabilité. Au contraire des petits villages de l'est de la Mer Noire producteurs de petites marchandises, les vallées arides de Tortum abritent des maisons de paysans, qui pratiquent une agriculture de subsistance. Ce type d'habitat a pu continuer à être viable malgré un statut socio-économique peu élevé. Le niveau de la population rurale est resté à peu près stable jusqu'au débit des années 2000. Comme la production est dépendante de l'irrigation, les SHP posent une menace sérieuse sur les moyens d'existence et cela a violemment mobilisé une population auparavant renfermée et docile. Cependant, le discours, le cadre, l'amplitude et les techniques de mobilisation sont complètement différents de ceux des espaces péri-urbains de la Mer Noire. L'amplitude de la mobilisation est directement reliée à celle de la menace sur les moyens de subsistance de la population à Bagbasi et Pehlivanli. Quand la menace est élevée, comme à Bagbasi, la mobilisation est forte. Inversement, quand la menace est faible, comme à Pehlivanli, et qu'il existe des opportunités amenées par la compagnie construisant les SHP qui permettent d'atténuer les effets sur les ressources, une mobilisation est peu susceptible d'arriver. De cela, j'affirme que les transformations spatio-économiques des localités qui transforment de manière inégale les configurations rurales en termes d'activités de production et de consommation ont un impact sur les schémas, discours et des modes des mobilisations rurales contemporaines. De ce fait, la thèse plaide pour un besoin de théorisation des mobilisations agraires contemporaines depuis cette perspective en mettant l'accent sur les transformations des moyens d'existence, les transformations et la viabilité de l'espace, la commercialisation de la production et la différenciation entre la paysannerie. / This dissertation examines role of political economy in contemporary agrarian mobilizations. By focusing on recent water struggles in Turkey against the run-of-the-river hydropower plants (SHP’s); the research digs into the societal and economic factors that enable or inhibit the emergence of strong mobilizations through a comparison of reactions against SHP projects in four localities of Eastern Black Sea region- Kavak (Arhavi) and Aralik (Borcka)- and its hinterland Tortum (Pehlivanli and Bagbasi villages)The main logic behind the cross comparison is to find out if there is a relationship between the forms of rural livelihoods; mostly defined in terms of production, marketing, place in the general economic system, migration and viability of space; and political mobilization against SHP construction combined with the other possible reasons leading to an unrest and contention. The research revealed that prior transformation of the rural spaces affects the ways, means and discourses of the local struggles. In this context, I would argue that Kavak (Arhavi) and Aralik (Borçka) have become peri-urban spaces through the specific transformation that they have gone through. The peri-urban character eased the travel of ideas and city-based politicization patterns into the hometown. In the specificity of Arhavi, the city-effect in the anti-SHP mobilization is evident which gives a particular framing and discourse to the mobilization. A group of people that can be classified as new middle class who are from Arhavi but lived and worked in the big cities pioneered in the resistance. They enabled broader alliances and contributed to the strengthening of a carnivalesque resistance with rituals, reinvented traditions and micro-identities. However in Aralik, despite all the attempts, similar pattern could not be reached. The difference can be traced in the arguments of the viability of the space. The rural-urban migration pattern kept the town of Arhavi as a viable socio-economic space whereas; the town of Aralik has been adversely affected from the rural-urban migration that can be regarded as non-viability.Contrary to commercialized petty-commodity producing villages of Eastern Black Sea, the arid valleys of Tortum sheltered peasant households, which endure on subsistence farming. Viability of these societal settings well continued, despite the low socio-economic status. Rural population levels remained almost stable until the beginning of 2000s. Since the production is dependent on irrigation, the SHP posed a serious threat on the livelihood and this has fiercely mobilized previously closed and docile population. However, the discourse, framing and extent and techniques of mobilization is completely different from the peri-urban contexts of coastal Black Sea. The extent of mobilization is directly related to the extent of threat on the livelihood in Bagbasi and Pehlivanli. When the threat is high, as in Bagbasi, the mobilization is strong. However, when the threat is low, as in Pehlivanli, and there are opportunities provided by the company that would ease the livelihood pressures, non-mobilization is more likely.Hence, I argue that spatio-economic transformation of the localities that unevenly transform rural settings in terms of production and consumption activities have impact on the patterns, discourses and agency in the contemporary ‘rural’ mobilizations. Therefore, the dissertation advocates for a need for theorisation of contemporary agrarian mobilization from this perspective by putting the emphasis on the livelihood transformations, transformation and viability of space, commercialization of production and differentiation within the peasantry and the agency.