Made available in DSpace on 2015-03-26T13:35:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2430887 bytes, checksum: 46c97cae3636842e90c00b8d31b6f16a (MD5) Previous issue date: 2009-02-09 / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais / The dramatic resurgence and emergence of epidemic dengue and dengue hemorragic fever in the last two decades neatly define a global pandemic. The dispersion of dengue viruses combines local infections of humans bited by infective mosquitoes inside a city with long-range transmissions to non-infective vectors that feed the blood of infected people arriving from other urban areas. In the present work a cellular automata model for dengue epidemic is proposed and investigated through large-scale computer simulations. The model takes into account the main features concerning the population dynamics of mosquitoes and humans and the disease transmission cycle. Furthermore, the model is defined on a scale-free network in which each node is a square lattice in order to properly describe the environment as urban centers interconnected through a national transportation system. A nonzero epidemic threshold is found and it is approached with a power law behavior by the density of infected individuals, as observed in the small-world network of Watts and Strogatz. Also, it is studied the importance of three parameters for the dengue spreading: the diffusivity of the mosquitoes, the probability of a mosquito bites humans, and the travel's probability of people between two interconnected cities. Finally, maps of infected individuals are obtained in order to caracterise the epidemic spreading. / O dramático ressurgimento e a emergência da epidemia de dengue e dengue hemorrágica nas últimas duas décadas claramente definem uma pandemia global. A dispersão do vírus da dengue combina infecções locais dos seres humanos picados por mosquitos infectados dentro de uma cidade com transmissões de longo alcance por vetores não-infecciosos que se alimentam do sangue de pessoas infectadas provenientes de outras zonas urbanas. No presente trabalho um modelo de autômatos celulares para epidemias de dengue é proposto e investigado através de siulação por computador, em larga escala. O modelo leva em conta as principais características relativas à dinâmica das populações de mosquitos e seres humanos e o ciclo de transmissão da doença. Além disso, o modelo é definido em uma rede livre de escala, em que cada nó é uma rede quadrada, a fim de descrever adequadamente o meio ambiente como os centros urbanos interligados através do sistema de transporte nacional. Um limiar epidêmico diferente de zero é encontrado e é aproximado com um comportamento tipo lei de potência pela densidade de indivíduos infectados, como observado na rede mundo-pequeno de Watts-Strogatz. Também, é estudada a importância de três parâmetros na dispersão da dengue: a difusividade do mosquito, a probabilidade do mosquito picar um ser humano, e a probabilidade de viagem de pessoas entre duas cidades conectadas. Por fim, mapas de indivíduos infectados são obtidos a fim de caracterizar a difusão da epidemia.

Submitted by TIAGO BARRETO DE ANDRADE COSTA null (tiagobac@yahoo.com.br) on 2017-07-13T22:57:26Z No. of bitstreams: 1 TESE_TIAGO COSTA_VERSÃO FINAL.pdf: 23380596 bytes, checksum: 619a0746dd076316d81d596da3513a6c (MD5) / Approved for entry into archive by Monique Sasaki (sayumi_sasaki@hotmail.com) on 2017-07-14T18:38:21Z (GMT) No. of bitstreams: 1 costa_tba_dr_prud.pdf: 23380596 bytes, checksum: 619a0746dd076316d81d596da3513a6c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-14T18:38:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 costa_tba_dr_prud.pdf: 23380596 bytes, checksum: 619a0746dd076316d81d596da3513a6c (MD5) Previous issue date: 2017-07-06 / A mortalidade por agressão no Brasil desde pelo menos o início de 1980 vem apresentando um recrudescimento linear, em paralelo ao contexto de produção das periferias urbanas. A desagregação desse fenômeno em escalas de maior detalhe, entretanto, permite-nos perceber que esse crescimento linear é na verdade o resultado de diversas dinâmicas locais, várias delas com características epidêmicas. Isto é, crescimentos abruptos fora do padrão histórico de dada localidade, portanto, crescimentos não-lineares. De acordo com a análise proposta no presente trabalho, identificamos Belém/PA enquanto um desses contextos epidêmicos de agressões letais. Tais expressões de violência naquela cidade vêm crescendo fora de sua dinâmica costumeira desde o início dos anos 2000 e a expressão geográfica desse fenômeno tem sido a difusão das mortes pelo espaço intraurbano. Dessa forma, propomos enquanto tese que tal propagação espacial da problemática, sendo uma típica expressão de difusão sobre o espaço geográfico, não se dá de forma homogênea em todas as direções a partir de um foco. Antes, segue por caminhos que oferecem condições mais favoráveis à epidemia (corredores de difusão) e evita aqueles mais desfavoráveis (barreiras à difusão). Enfim, no presente trabalho argumentamos no sentido de demonstrar essa dinâmica espaço-temporal peculiar do crescimento dos homicídios em Belém nos últimos anos, a partir de uma abordagem dos conceitos de epidemia e difusão espacial calcada em análise de dados espaciais. Ficou demonstrado, com base nessa análise, que os homicídios nessa metrópole brasileira têm alta correlação espacial, o que aponta para a necessidade dos fundamentos teóricos e metodológicos da Geografia na análise dessa problemática no contexto brasileiro. / Since at least 1980 the homicide mortality on Brazil has increased linearly at the same time of the urban slums has being shaped. However, in a larger zoom into the fenomeno, we can to see this linear growth is a result of several local dynamics, some of which are epidemic. That is, abrupt growth outside the historical pattern of a given locality, therefore, nonlinear growth. According to the analysis proposed in the present study, we identified Belém/PA as one of those epidemic contexts of lethal violence. Such expressions of violence in that city have been growing out of their usual dynamics since the early 2000s and the geographic expression of this phenomenon has been the spread of deaths through intraurban space. In this way, we propose as thesis that such spread of the problematic, as a typical expression of the diffusion on the geographical space, does not take place homogeneously in all directions from a focus. Indeed, it follows paths that offer more favorable conditions to the epidemic (diffusion channels) and avoid the more unfavorable ones (barriers to diffusion). Therefore, using a spatial data analysis approach, in the present work we argue to demonstrating this peculiar space-time dynamics of the present-day increase in the Belém’s homicides events. We do this from an approach of the concepts of epidemic and spatial diffusion based on spatial data analysis. It was demonstrated that the homicides in this Brazilian metropolis have a high spatial correlation, which points to the need of the theoretical and methodological foundations of Geography in the analysis of this problem in the Brazilian context.

Apresentamos o estudo de três modelos estocásticos governadas por equações mestras que descrevem a propagação de epidemias em uma comunidade de indivíduos; / We present a study of three stochastic models, governed by master equations, that decribe the epidemic spreding in a community of individuals;

A dinâmica de movimentação de animais em uma rede de propriedades rurais e o espalhamento de algumas doenças animais estão intrinsecamente relacionados. Assim, compreender a dinâmica do espalhamento de doenças infecciosas nestas redes é um instrumento importante no controle destas. Neste projeto, foram implementados algoritmos para gerar redes de movimentação de animais hipotéticas e reconstruiu-se a rede de movimentações de bovinos do Estado do Mato Grosso, 2007, Brasil. Foram feitas diversas simulações a fim de verificar o espalhamento de doenças agudas e crônicas nessas redes. Diferentes dinâmicas de espalhamento de doenças infecciosas foram observadas em redes com a mesma distribuição de graus e diferentes estruturas topológicas. Espera-se que os resultados das simulações matemáticas possam auxiliar nas atividades dos órgãos responsáveis pela vigilância epidemiológica e incentivar outros Estados a seguirem o exemplo do Estado do Mato Grosso, a construírem bancos de dados que possam ser analisados utilizando a metodologia de redes. / The animals\' movements in a farms network and the spread of some animal diseases are intrinsically related. Therefore, comprehending the dynamics of the spreading of infectious diseases in these networks is an important tool in controlling these diseases. In this project, we have implemented algorithms to generate hypothetical networks of animals\' movements and rebuilt the network of bovine movements from the State of Mato Grosso, 2007, Brazil. We made several simulations in order to check the spreading of acute and chronic disease in these networks. Different dynamics of infectious disease spreading were observed in networks with the same degree distribution and different topological structure. We hope that the results of the mathematical simulations may assist in the activities of agencies responsible for disease surveillance and encourage other States to follow the example of the State of Mato Grosso, to build databases that can be analyzed using the methodology of networks.

A movimentação de animais em uma rede de fazendas e o espalhamento de algumas doenças animais estão intrinsecamente relacionados. Assim, compreender a dinâmica do espalhamento de doenças infecciosas nestas redes é um instrumento importante no controle dessas doenças. Usando as informações sobre as movimentações de bovinos no estado de Mato Grosso, Brasil, em 2007, reconstruiu-se a rede de trânsito e a rede de proximidade geográfica entre os estabelecimentos desse estado, além de redes hipotéticas seguindo os modelos de rede Molloy-Reed, Kalisky, Método A e Método B, onde simulou-se, usando diferentes configurações do modelo SLIRS, o espalhamento de doenças com parâmetros hipotéticos e reais (brucelose e febre aftosa). Além disso, simulou-se o controle do espalhamento dessas doenças considerando o controle por imunização e por restrição, com e sem rearranjo das movimentações após a restrição, selecionando os estabelecimentos a serem protegidos de forma aleatória, baseando-se no grau de movimentação dos animais e utilizando o conceito do paradoxo da amizade. Dentre os resultados, destacam-se que apesar dos padrões das curvas de prevalência nas redes hipotéticas serem semelhantes aos da rede real, os valores observados foram maiores nas redes hipotéticas, indicando que utilizá-las no planejamento de políticas de controle de doenças no lugar da rede real pode levar a um maior uso de recursos do que seria necessário. Além disso, no controle das doenças tanto com parâmetros hipotéticos quanto com parâmetros reais, nas simulações usando apenas a rede de trânsito dos animais, observou-se uma redução mais efetiva da prevalência ao se selecionar os estabelecimentos com maior grau total do que a da seleção aleatória, enquanto que nas simulações que consideraram a rede de proximidade geográfica dos estabelecimentos, a redução na prevalência das estratégias que selecionaram estabelecimentos específicos foram semelhantes aos da seleção aleatória. Sobre o efeito do rearranjo das movimentações, observou-se que este pode facilitar o espalhamento de doenças na rede, mesmo nas situações em que se aplica alguma estratégia de controle. Espera-se que os resultados das simulações matemáticas possam contribuir para a discussão do impacto relativo entre as estratégias de controle mencionadas e que futuramente possam auxiliar nas atividades dos órgãos responsáveis pela vigilância epidemiológica e no desenvolvimento de políticas de prevenção e controle de doenças em animais. / The animals’ movements in a farms network and the spread of some animal diseases are intrinsically related. Therefore, comprehending the dynamics of the spreading of infectious diseases in these networks is an important tool in controlling these diseases. Using the information about the bovine movements from the State of Mato Grosso, Brazil, in 2007, we rebuilt the network of animal movements and the geographic proximity network between the premises of this state, in addition to hypothetical networks following the network models Molloy-Reed, Kalisky, Method A and Method B, where we simulated, using different configurations of the model SLIRS, the spread of diseases with hypothetical parameters e real ones (brucellosis and foot and mouth disease). Moreover, we simulated the control of these diseases spreading, considering the control by immunization and by restriction, with and without the rearrangement of the movements after the restriction, selecting the premises to be protected randomly, based on the degree of animal’s movements and using the concept of the friendship paradox. Among the results, stands out that although the pattern of the prevalence curves in the hypothetical networks were similar to the ones in the real network, the observed values were higher in the hypothetical networks, indicating that using them in the planning of policies to control diseases in place of the real network might lead to a greater expense of resources than it would be necessary. Furthermore, in the control of the diseases both with hypothetical parameters as well as with real parameters, in the simulations using only the animal’s movements network, it was observed a more effective reduction of the prevalence when selecting the premises with the highest total degree than the random selection, while in the simulations that considered the network of geographic proximity of the premises, the reduction in the prevalence of the strategies that selected specific premises were similar to the random selection. On the effect of rearranging the movements, it was observed that it may facilitate the spread of diseases in the network even in situations where some control strategy is used. We hope that the results of the mathematical simulations may contribute to the discussion of the relative impact of the mentioned control strategies and that in the future they may assist in the activities of agencies responsible for disease surveillance and in the development of policies to prevent and control diseases in animals.

Orientadores: Jorge Alberto Achcar, Luiz Koodi Hotta / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matemática, Estatística e Computação Científica / Made available in DSpace on 2018-08-17T21:22:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Diniz_MarcioAugusto_M.pdf: 2168206 bytes, checksum: 900902dfc4c68974431fbf2286d5cca6 (MD5) Previous issue date: 2011 / Resumo: A modelagem matemática de epidemias apresenta grande relevância para a área de epidemiologia por possibilitar uma melhor compreensão do desenvolvimento da doença na população e permitir analisar o impacto de medidas de controle e erradicação. Neste contexto, os modelos compartimentais SEIR (Suscetíveis - Expostos - Infectantes - Removidos) que foram introduzidos por Kermarck e Mckendrick (1927 apud YANG, 2001, Capítulo 1) são extremamente utilizados. Esta dissertação discute o modelo SEIR encontrado em Lekone e Finkenstädt (2006) que considera a introdução das medidas de intervenção na taxa de contato entre suscetíveis e infectantes, e é aplicado aos dados parcialmente observados da epidemia de febre hemorrágica Ebola, ocorrida no Congo em 1995, através de métodos bayesianos. Em uma segunda etapa, o modelo é modificado a fim de considerar a introdução das medidas de intervenção também na taxa de remoção. A utilização da taxa de remoção não homogênea permite uma quantificação do impacto das medidas de intervenção mais próxima da realidade. Além disso, nos dois modelos considerados, uma análise da incerteza gerada pela observação parcial dos dados e uma análise de sensibilidade da escolha das distribuições a priori são realizadas a partir de simulações. E também, é apresentada uma discussão sobre erros de especificação da taxa de remoção Por fim, os dois modelos são aplicados aos dados da epidemia de febre hemorrágica Ebola e os resultados são discutidos / Abstract: Mathematical modeling of epidemics has great relevance to the area of epidemiology by enabling a better understanding of the development of the disease in the population and allow the analysis of the impact of eradication and control measures. In this context, SEIR (Susceptible-Exposed-Infectious-Removed) compartmental models that were introduced by Kermarck e Mckendrick (1927 apud YANG, 2001, Chapter 1) are extremely used. This essay discusses the SEIR model found in Lekone e Finkenstädt (2006) that considers the introduction of intervention measures in the contact rate between susceptible and infectious, and is applied to data partially observed the outbreak of Ebola hemorrhagic fever in Congo, held in 1995, by Bayesian methods. In a second step, the model is modified in order to consider the introduction of intervention measures in the removal rate. The use of time in-homogeneous removal rate allows quantification of the impact of intervention measures closer to reality. In addition, both models considered, an analysis of uncertainty generated by partial observation and a sensitivity analysis of the choice of a priori distributions are made from simulations. And also, a discussion about errors of removal rate specification. Finally, the two models are applied to the data of Ebola hemorrhagic fever epidemic and the results are discussed / Mestrado / Métodos Estatísticos / Mestre em Estatística

Made available in DSpace on 2014-07-29T15:14:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese Alcineia Rodrigues dos Santos.pdf: 2107648 bytes, checksum: 02d1f969d2c15d06a421febc4a845a41 (MD5) Previous issue date: 2011-05-03 / The beginning of this research lies at the wish of understanding the relation among the population from the region of Seridó, the death and the dead when cholera morbus, smallpox and yellow fever‟s epidemic outbreak exterminated part of the population from that region, causing deep modifications in the funeral culture. Thus, our aim is to analyze how this epidemic impact contributed to a changing action towards people‟s funeral habits and attitudes concerning death and the dead in Seridó as from 1850. During the 18th century and the first half of the 19th century, the attitudes of the inhabitants from the Province of Rio Grande do Norte regarding life‟s finite limit were based on the familiarity between the living and the dead, which led to a relation characterized by rituals after the death and the burial inside churches. This procedure was largely used by the Catholic Christians and it allowed a close contact between the dead and the living because when the congregation was inside the church they would walk around, sit and pray on the grave. The impact of the epidemic was fundamental to change the funeral culture. The diseases were responsible for a high mortality rate and consequently the burial inside the churches turned out being unfeasible because there was no time enough to the bodies‟ decomposition. As a result, the hygienist discourse that, under European influence, struggled against the ad sanctos burial was enhanced in order to prevent from other diseases and in favor of public hygiene. Under this perspective, a secularizing process takes place in Seridó, alike other Brazilian regions such as in São Paulo and Rio de Janeiro. It is this process we want to comprehend, based on official documents produced by the Presidents of the Province and Municipal Counties, wills and parochial obituary registers, besides visual resources like ground plans, photographs and videos, so that the secularized cemeteries of the region are analyzed. / Esta pesquisa surgiu a partir do desejo de compreender a relação que a população do Seridó manteve com a morte e com os mortos no momento em que os surtos epidêmicos de cólera-morbo, varíola e febre amarela grassaram na região, provocando modificações na cultura fúnebre. Assim, nosso objetivo é analisar como o impacto dessas epidemias, que atingiram esse espaço a partir de 1850, contribuiu para a ação transformadora sobre os costumes fúnebres e as atitudes da população para com a morte e os mortos. As atitudes dos habitantes da capitania do Rio Grande do Norte quanta à finitude da vida tinham como eixo central, durante toda a extensão do século XVIII e a primeira metade do século XIX, a familiaridade entre vivos e mortos, relação definida pelos rituais efetivados no momento pós-morte e pelas inumações no interior das igrejas. Essas inumações, utilizadas pelos cristãos católicos, permitiam o contato direto entre vivos e mortos: os fiéis que frequentavam as igrejas passavam, sentavam-se e faziam suas orações sobre as sepulturas. O impacto das epidemias nas transformações na cultura funerária foi fundamental. As doenças provocavam alto índice de mortalidade, tornando inviável o enterramento no interior das igrejas, uma vez que não havia tempo suficiente para a total decomposição dos corpos. Logo, constituíram-se em um dos elementos catalisadores do discurso higienista, que há tempos lutava, sob influência europeia, contra o enterramento ad sanctos, com base na prevenção de males e a favor da higienização pública. Dentro dessa conjuntura, o Seridó, a exemplo de outras regiões brasileiras, como São Paulo e o Rio de Janeiro, iniciou o processo de secularização da morte. É esse processo que pretendemos compreender, tendo como base o uso de documentação oficial produzida pelos Presidentes de Província e os de Comarcas Municipais, testamentos e registros paroquiais de óbito, além de recursos visuais, como plantas baixas, fotografias e vídeos, para análise dos cemitérios secularizados da região.

Submitted by Geyciane Santos (geyciane_thamires@hotmail.com) on 2015-07-30T15:47:15Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Cláudia Regina Navas Pereira Loureiro.pdf: 740121 bytes, checksum: 03e59fd57e4ab2720b900d3992152b5e (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-07-30T19:52:41Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Cláudia Regina Navas Pereira Loureiro.pdf: 740121 bytes, checksum: 03e59fd57e4ab2720b900d3992152b5e (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-07-30T19:56:26Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Cláudia Regina Navas Pereira Loureiro.pdf: 740121 bytes, checksum: 03e59fd57e4ab2720b900d3992152b5e (MD5) / Made available in DSpace on 2015-07-30T19:56:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação - Cláudia Regina Navas Pereira Loureiro.pdf: 740121 bytes, checksum: 03e59fd57e4ab2720b900d3992152b5e (MD5) Previous issue date: 2012-10-08 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / This study had for objective to describe the clinical and epidemic profile of the clientele of the pediatric clinic of the João de Barros Barreto Academical Hospital in the period of August to November of 2012. The conceptual bases are of the epidemiology and of the pediatric nursing. It is a study of the observational and descriptive type, of traverse cut, with analysis the light of the descriptive statistics methods, which guide the description and the presentation in tables. The place of the research was the João de Barros Barreto Academical Hospital. In the study they were researched 97 handbooks of children interned in writing by consent of your responsible. The obtained data were tabulated through the program Microsoft Excel and the whole statistical processing took place under the support computational of the software Epi-info, being the results presented in tables and critical analysis of the results. The results: the companion's responsible and/or sex that prevailed was the feminine with 89,69% (87), and 87,6% (85) they were the mothers. With relationship to the patients' sex that you/they interned, 53,6% (52) of the internments they were children of the masculine sex; the age group between an and five years with 38,10% (37). With relationship to the pathologies found in AIHs, the prevalence of the visceral leishmania was observed, with 16,49% (16) followed by the pneumonia with 15,46% (15) and the bacterial meningitis with 11,34% (11) cases. In relation to the time of internment, it was verified that 39,77% of the children stayed interned by a period understood among seven to fourteen days. The investigation demonstrates the all it is important the knowledge of the data of the child's clinical and epidemic profile for the nursing and for the hospital administration, because to leave of those results the male nurse he/she can plan an appropriate care for child, as well as the accompaniment in the clinic, since 60,4% (58) of the children they received high for us to give continuity to the ambulatory treatment. / Este estudo teve por objetivo descrever o perfil clínico e epidemiológico da clientelada clínica pediátrica do Hospital Universitário João de Barros Barreto no período de agosto a novembro de 2012. As bases conceituais são da epidemiologia e da enfermagem pediátrica. Trata-se de um estudo do tipo observacional, descritivo, de corte transversal, com análise a luz dos métodos da estatística descritiva, os quais orientam a descrição e a apresentação em tabelas. O local da pesquisa foi o Hospital Universitário João de Barros Barreto. No estudo foram pesquisados 97 prontuários de crianças internadas mediante consentimento por escrito de seu responsável. Os dados obtidos foram tabulados através do programa Microsoft Excel e todo o processamento estatístico se realizou sob o suporte computacional do software Epi-info, sendo os resultados apresentados em tabelas e análise crítica dos resultados. Os resultados: o sexo do acompanhante e/ou responsável que predominou foi o feminino com 89,69% (87), sendo que 87,6% (85) eram as mães. Quanto ao sexo dos pacientes que internaram, 53,6% (52) das internações eram crianças do sexo masculino; a faixa etária entre um e cinco anos com 38,10% (37). Quanto às patologias encontradas nas AIHs, observou-se o predomínio da leishmaniose visceral, com 16,49% (16) seguida da pneumonia com 15,46% (15) e a meningite bacteriana com 11,34% (11) casos. Em relação ao tempo de internação, verificou-se que 39,77% das crianças permaneceram internadas por um período compreendido entre sete a quatorze dias. A investigação demonstra o quanto é relevante o conhecimento dos dados do perfil clínico e epidemiológico da criança para a enfermagem e para a gestão hospitalar, pois a partir desses resultados o enfermeiro poderá planejar um cuidado apropriado para criança, assim como o acompanhamento no ambulatório, já que 60,4% (58) das crianças receberam alta para darem continuidade ao tratamento ambulatorial.

Objetivo. Desenvolvimento de uma estrutura para aplicação de simulação numérica estocástica no estudo de espalhamento de doenças em metapopulações de maneira que esta incorpore a topologia dinâmica de contatos entre as subpopulações, verificando as peculiaridades do modelo e aplicando este modelo às redes de movimentação de animais de Pernambuco para estudar o papel das feiras de animais. Método. Foi utilizado o paradigma de modelos híbridos para tratar do espalhamento de doenças nas metapopulações que, das nossas aplicações, resultou na união de duas estratégias de modelagem: Modelos Baseados no Indivíduo e o Algorítimo de Simulação Estocástica. Aplicamos os modelos híbridos em redes de movimentação de animais reais e fictícias para destacar as diferenças dos modelos híbridos com diferentes abordagens de migração (pendular e definitiva) e comparamos estes modelos com modelos clássicos de equações diferenciais. Ainda, através do pacote hybridModels, estudamos o papel das feiras de animais em cenários de epidemia de febre aftosa na rede de movimentação de animais de Pernambuco, introduzindo a doença numa feira de animais contida numa amostra da base de Guia de Trânsito Animal e calculamos a cadeia de infecção dos estabelecimentos. Resultados. Constatamos que no estudo de epidemias com o uso de modelo híbrido, a migração pendular, na média, subestima o número de animais infectados no cenário de comercialização de animais (migração defi nitiva), além de traduzir uma dinâmica de espalhamento enganosa, ignorando cenários mais complexo oferecido pela migração definitiva. Criamos o pacote hybridModels que generaliza os modelos híbridos com migração definitiva e com ele aplicamos um modelo híbrido SIR na rede de Pernambuco e verificamos que as feiras de animais de Pernambuco são potentes disseminadores de doenças transmissíveis. Conclusão. Apesar de custo computacional maior no estudo de espalhamento de doenças, a migração definitiva é o mais adequado tipo de conexão entre as subpopulações de animais de produção. Ainda, de acordo com as nossas analises, as feiras de animais estão entre os mais importantes nós na rede de movimentação de Pernambuco e devem ter lugar de destaque nas estratégias de controle e vigilância epidemiológica / Objective. Development of framework applied to stochastic numerical simulation for the study of disease spreading in metapopulations, in a way that it incorporates the dynamic topology of contacts between subpopulations, checking the framework peculiarities and applying it to the animal movement network of Pernambuco to study the role of animal markets. Method. We used hybrid models paradigm to treat disease spread in metapopulations. From our applications it has resulted in the union of two modeling strategies: Individual-based model and the Algorithm for Stochastic Simulation. We applied hybrid models in real and fictitious networks to highlight the differences between different animal movement approaches (commuting and migration) and we compared these models with classic models of differential equations. Furthermore, through the hybridModels package, we studied the role of animal markets in epidemic scenarios of Foot and Mouth Disease (FMD) in animal movement networks of Pernambuco, introducing the disease in an animal market of a sample from the Animal Transit Record of Pernambuco’s database and calculating the contact infection chain of premises. Results. We noted that in the study of epidemics using a hybrid model, commuting can underestimates the number of infected animals in the animal trade scenario (migration), and resulting in a misleading spreading dynamic by ignoring a more complex scenario that occurs with migration. We created the hybridModels package that generalizes the hybrid models with migration, applied a SIR hybrid model to the animal movement network of Pernambuco and verified that animal markets are important disease spreaders. Conclusion. Despite its higher computational cost in the study of epidemics in animal movement networks, migration is the most suitable type of connection between subpopulations. Furthermore, animal markets of Pernambuco are among the most important nodes for disease transmission and should be considered in strategies of surveillance and disease control

Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2016-03-28T11:28:50Z No. of bitstreams: 1 vanessacostaassis.pdf: 2261462 bytes, checksum: 2bbcf8fbf1a6e34788de1d872c3f5f7c (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2016-04-24T02:34:49Z (GMT) No. of bitstreams: 1 vanessacostaassis.pdf: 2261462 bytes, checksum: 2bbcf8fbf1a6e34788de1d872c3f5f7c (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-24T02:34:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 vanessacostaassis.pdf: 2261462 bytes, checksum: 2bbcf8fbf1a6e34788de1d872c3f5f7c (MD5) Previous issue date: 2013-02-04 / A dengue é uma doença viral que se apresenta como um importante problema de saúde pública mundial. Todo caso suspeito ou confirmado de dengue deve ser notificado no Sistema de Informação de Agravos de Notificação – SINAN. Os dados inseridos nesse sistema representam uma importante fonte de informação para estudos epidemiológicos e para a avaliação da qualidade do mesmo. Este estudo teve como principal objetivo analisar a qualidade das notificações de dengue informadas no SINAN, referentes à epidemia ocorrida em 2010 no município de Juiz de Fora – MG. Trata-se de um estudo epidemiológico descritivo, cujos dados foram obtidos do SINAN, disponibilizados pelo Departamento de Vigilância Epidemiológica e Ambiental de Juiz de Fora. Foram analisadas as variáveis sexo, faixa etária, dados de residência, raça/cor, escolaridade, local provável de infecção, dados laboratoriais e clínico-epidemiológicos, assim como a completitude, o encerramento oportuno dos casos registrados no Sistema, a duplicidade e a consistência dos dados. Foram notificados 9396 casos de dengue em Juiz de Fora, dos quais 62,9% foram classificados como Dengue Clássico, 0,9% como Dengue com Complicações, 0,1% como Febre Hemorrágica da Dengue, 0,04% como Síndrome do Choque da Dengue, 4,9% casos descartados, 30,8% inconclusivos, 0,3% casos ignorados/em branco, sendo que entre o total dos casos notificados 0,2% evoluíram para óbito. A maioria dos casos foi constatada em indivíduos do sexo feminino, na faixa etária de 32 a 59 anos, residentes na zona urbana, da raça branca, com ensino fundamental completo/incompleto e autóctones do município. A análise da completitude obteve classificação ruim para a maioria de seus campos, exceto para os de preenchimento obrigatório que receberam classificação excelente. Não foram encontradas notificações em duplicidade e 95,88% dos casos foram encerrados oportunamente. A análise da consistência obteve classificação excelente. As análises realizadas nesse trabalho apresentaram importantes informações para o conhecimento da epidemiologia da dengue em Juiz de Fora, consequentemente criando parâmetros para um melhor direcionamento das atividades de vigilância e controle da doença. Mostrou-se preocupante a quantidade de variáveis em branco/ignorado, apontando a necessidade de capacitação dos profissionais sobre a importância do preenchimento dos instrumentos base dos sistemas de informação. / Dengue is a viral disease that presents itself as an important public health problem worldwide. All suspected or confirmed case of dengue should be notified in the Notifiable Hazards Information System (Sistema de Informação de Agravos de Notificação – SINAN). Data included in this system represent an important source of information for epidemiological studies and for the evaluation of quality. This study aimed to analyze the quality of reports of dengue reported in SINAN, referring to the epidemic occurred in 2010 in the city of Juiz de Fora - MG. This is a descriptive epidemiological study whose data were obtained from SINAN, provided by the Environmental and Epidemiological Surveillance Department of Juiz de Fora. The analysis included the variables sex, age range, address, race/skin color, schooling, probable source of infection acquisition, laboratory and clinical and epidemiological data, as well as the completeness, timely closure of the recorded cases, duplicity and consistency of the data. Of the 9396 dengue cases notified in Juiz de Fora, 62.9% were classified as Classical Dengue, 0,9% as Dengue with Complications, 0,1% as Dengue Hemorrhagic Fever, 0.04% as Dengue Shock Syndrome, 4.9% were discarded, 30.8% inconclusive, 0.3% cases ignored / blank and 0.2% of the total of reported cases died. Most cases occurred in healthy adults aged 32 to 59 years, of the female sex, living in the urban area, of the white race, with complete/incomplete fundamental education, and autochthonous from the municipality. Completeness was poor for most fields, except for those to be compulsorily completed, which were classified as excellent. No notifications in duplicity were found, and 95.88% of the cases were timely closed. Consistency was classified as excellent. The analyzes performed in this study provided important information for understanding the epidemiology of dengue in Juiz de Fora, thus creating a better parameters for directing the activities of surveillance and disease control. It was showed a worrying amount of variables in white / ignored, pointing to the need for training of professionals about the importance of filling the information systems´s instruments based.